專利名稱：用于處理大量生物微陣列的系統(tǒng)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
用于處理大量生物微陣列的系統(tǒng) 技術(shù)領(lǐng)域本發(fā)明總體上涉及生物微陣列技術(shù)。更具體地說(shuō)，本發(fā)明提供用于處理大量生物微陣列的系統(tǒng)和方法。僅舉例而言，可將本發(fā)明描述為應(yīng)用于96-栓釘(peg)儀 器，但應(yīng)該理解的是本發(fā)明具有更廣闊的應(yīng)用范圍。
背景技術(shù)：
生物微陣列往往包含用于從核酸樣品中提取序列信息的核酸探針。核酸樣品 在允許雜交的特定條件下與核酸探針接觸。然后處理生物微陣列并掃描以測(cè)定核酸 樣品與哪些探針雜交?；谶@種測(cè)定，提供比較雜交和非雜交的模式獲得序列信息。 例如，序列信息可用于核酸測(cè)序、或診斷性歸選遺傳疾病或是否存在特定病原體或 病原體的菌株。生物微陣列在掃描前往往用流體系統(tǒng)進(jìn)行處理。例如，該流體系統(tǒng)包括能洗 滌和對(duì)微陣列染色的流體站。隨著微陣列設(shè)計(jì)的進(jìn)步，經(jīng)常需要改進(jìn)流體系統(tǒng)以提 高自動(dòng)化并降低成本。因此，非常需要提高處理微陣列的技術(shù)。發(fā)明內(nèi)容本發(fā)明總體上涉及生物微陣列技術(shù)。更具體地說(shuō)，本發(fā)明提供用于處理大量 生物微陣列的系統(tǒng)和方法。僅舉例而言，可將本發(fā)明描述為應(yīng)用于96-栓釘儀器， 但應(yīng)該理解的是本發(fā)明具有更廣闊的應(yīng)用范圍。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，處理生物傳感器的系統(tǒng)包括裝配支持流體部件 的支持部件。該流體部件包括至少一個(gè)第一容器和一個(gè)第二容器。第一容器可容納 第一體積的第一流體，第二容器可容納第二體積的第二流體。此外，系統(tǒng)包括裝配在第一傳感器和第二傳感器上進(jìn)行雜交過(guò)程的雜交部件。另外，系統(tǒng)包括裝配直接
或間接地將第一傳感器從雜交部件移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸的 傳送部件。傳送部件也還裝配為直接或間接地將第二傳感器從雜交部件移入第二容 器并與第二體積的第二流體接觸。傳送部件裝配為基本上同時(shí)移動(dòng)第一傳感器和第 二傳感器。根據(jù)本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案，處理生物傳感器的系統(tǒng)包括裝配支持流體部件的支持部件。流體部件包括至少一個(gè)第一容器和一個(gè)第二容器。第一容器可容納 第一體積的第一流體，第二容器可容納第二體積的第二流體。此外，系統(tǒng)包括裝配在第一傳感器和第二傳感器上，基于至少與預(yù)定溫度相關(guān)的信息進(jìn)行雜交過(guò)程的雜 交部件。另外，系統(tǒng)包括具有夾鉗和至少一個(gè)馬達(dá)的傳送部件。支持部件包括支持 至少第一容器和第二容器的抽屜，第一容器和第二容器相對(duì)于抽屜基本上是靜止 的。夾鉗可基本上同時(shí)夾住第一傳感器和第二傳感器并基本上同時(shí)放開第一傳感器 和第二傳感器。所述至少一個(gè)馬達(dá)裝配為將夾住的第一傳感器移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸，將夾住的第二傳感器移入第二容器并與第二體積的第二流 體接觸并可基本上同時(shí)移動(dòng)第一傳感器和第二傳感器。根據(jù)本發(fā)明還有的實(shí)施方案，處理生物傳感器方法包括將第一傳感器和第二 傳感器轉(zhuǎn)移入處理生物傳感器的系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括至少一個(gè)傳送部件、 一個(gè)雜交部 件和一個(gè)流體部件。傳送部件包括一個(gè)夾鉗，流體部件包括第一容器和第二容器。 第一容器可容納第一體積的第一流體，第二容器可容納第二體積的第二流體。此外， 該方法包括在轉(zhuǎn)移第一傳感器和第二傳感器之后，通過(guò)雜交部件在至少第一傳感器 和第二傳感器上進(jìn)行雜交過(guò)程。另外，該方法包括在雜交過(guò)程之后，直接或間接地 將第一傳感器從雜交部件移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸。該方法也包 括在雜交過(guò)程之后，直接或間接地將第二傳感器從雜交部件移入第二容器并與第二 體積的第二流體接觸。至少由夾鉗移動(dòng)第一傳感器和移動(dòng)第二傳感器并且基本上同 時(shí)移動(dòng)第一傳感器和移動(dòng)第二傳感器。使用本發(fā)明比常規(guī)技術(shù)可獲得許多益處。本發(fā)明的某些實(shí)施方案提供自動(dòng)化 的流體和雜交系統(tǒng)。例如，該系統(tǒng)包括雜交爐組件并在雜交爐組件和該系統(tǒng)的其它 部件之間提供自動(dòng)傳送。在另一個(gè)實(shí)施方案中，該系統(tǒng)提供與掃描系統(tǒng)之間自動(dòng)的 來(lái)回傳送。本發(fā)明的一些實(shí)施方案提供可進(jìn)行雜交、洗滌和染色的整合及自動(dòng)處理 的系統(tǒng)。此外，聯(lián)合掃描系統(tǒng)后，該系統(tǒng)也能進(jìn)行整合及自動(dòng)的掃描處理。本發(fā)明
的某些實(shí)施方案可提高雜交和流體系統(tǒng)的處理量。例如，可平行處理多個(gè)生物傳感 器(如微陣列)。本發(fā)明的一些實(shí)施方案可降低雜交和流體系統(tǒng)以及掃描系統(tǒng)的體 積。本發(fā)明的某些實(shí)施方案可減少在一個(gè)或多個(gè)生物傳感器上進(jìn)行的不同處理之間 的交叉污染。例如，在某個(gè)給定的處理中，不同的傳感器在不同的孔中洗滌、染色 和/或存放。在另一個(gè)例子中，用于不同的處理的給定傳感器分別在不同的孔中洗 滌、染色和存放。在又一個(gè)例子中，每個(gè)孔用于最多一次處理的最多一個(gè)傳感器， 例如微陣列。取決于實(shí)施方案可獲得一種或多種這些益處。參考以下詳細(xì)描述和附圖可完 全理解本發(fā)明的這些益處和各種其它目標(biāo)、特征和優(yōu)點(diǎn)。


圖1-2顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的處理生物傳感器的簡(jiǎn)化系統(tǒng)； 圖3(A)和(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn)化 的熱板組件；圖4(A)和(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn)化 的夾鉗組件；圖5(A)和(B)顯示了本發(fā)明另一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn) 化的夾鉗組件；圖6(A)和(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn)化 的抽屜組件；圖7(A)、(B)和(C)顯示了本發(fā)明另一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng) 中至少一個(gè)簡(jiǎn)化的抽屜組件；圖8顯示了用于本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn)化的孔板；圖9是本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的系統(tǒng)中簡(jiǎn)化的傳感器組件；圖10顯示了通過(guò)本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的系統(tǒng)來(lái)處理生物傳感器的簡(jiǎn)化流體方法；圖ll(A)和(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn) 化的爐組件；
圖12顯示本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)中簡(jiǎn)化的松開夾 鉗站(unclamping station);圖13顯示本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)的簡(jiǎn)化構(gòu)造；圖14顯示本發(fā)明另一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)的簡(jiǎn)化構(gòu)造；圖15(A)和(B)顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)一 起使用的簡(jiǎn)化掃描系統(tǒng)；圖16顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)一起使用的 掃描系統(tǒng)的簡(jiǎn)化內(nèi)部結(jié)構(gòu)；圖17(AHG)顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)一起 使用的掃描系統(tǒng)的簡(jiǎn)化部件；圖18顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)一起使用的 掃描系統(tǒng)的簡(jiǎn)化光學(xué)模塊；圖19顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)一起使用的 掃描系統(tǒng)的簡(jiǎn)化尖端/傾斜(tip/tilt)組件；圖20顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)一起使用的 掃描系統(tǒng)的簡(jiǎn)化電子構(gòu)造；圖21(A)、 (B)和(C)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的簡(jiǎn)化 系統(tǒng)和掃描系統(tǒng)。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明總體上涉及生物微陣列技術(shù)。更具體地說(shuō)，本發(fā)明提供用于處理大量 生物微陣列的系統(tǒng)和方法。僅舉例而言，可將本發(fā)明描述為應(yīng)用于96-栓釘儀器， 但應(yīng)該理解的是本發(fā)明具有更廣闊的應(yīng)用范圍。I. ~""般描述本發(fā)明引用了某些專利、申請(qǐng)和其它參考文獻(xiàn)。當(dāng)下文引用或重復(fù)專利、申 請(qǐng)或其它參考文獻(xiàn)時(shí)，應(yīng)該理解的是出于所有目的以及所述的主張這些文獻(xiàn)全文納 入作為參考。除非另有明確指出，本說(shuō)明書使用的單數(shù)形式"一"、"一個(gè)"和"該"包 括其復(fù)數(shù)形式。例如，術(shù)語(yǔ)"一種試劑"包括包括許多試劑及它們的混合物。
個(gè)體不限于人類，也可是其它生物體，包括(但不限于)哺乳動(dòng)物、植物、細(xì)菌 或來(lái)源于以上的細(xì)胞。通過(guò)本說(shuō)明書，本發(fā)明的各方面以范圍形式(mngeformat)提供。應(yīng)該理解的是， 以范圍形式的描述僅是為方便和簡(jiǎn)潔起見，不應(yīng)理解為是對(duì)本發(fā)明范圍的強(qiáng)硬限 制。因此，對(duì)范圍的描述應(yīng)認(rèn)為是特異性地公開了所有可能的亞范圍以及該范圍內(nèi) 的個(gè)別數(shù)值。例如，對(duì)范圍的描述，如l-6應(yīng)理解為是特異性地公開了諸如1-3、 1-4、 1-5、 2-4、 2-6、 3-6等亞范圍以及該范圍內(nèi)的個(gè)別數(shù)值，例如1、 2、 3、 4、 5 和6。無(wú)論范圍的寬度這均適用。除非另有指出，實(shí)踐本發(fā)明可采用常規(guī)技術(shù)和有機(jī)化學(xué)的描述、聚合物技術(shù)、 分子生物學(xué)(包括重組技術(shù))、細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫學(xué)，這些技術(shù)是本領(lǐng)域 技術(shù)人員已知的。這種常規(guī)技術(shù)包括聚合物陣列合成、雜交、連接和使用標(biāo)記檢測(cè) 雜交。參考本文以下實(shí)施例對(duì)合適技術(shù)進(jìn)行了特定的描述。然而其它等效的常規(guī)方 法也當(dāng)然可用。這種常規(guī)技術(shù)和描述見標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)，例如《基因組分析實(shí) 驗(yàn)室手冊(cè)叢書》(Ge"/me爿/w/^&: ^丄a6orato^ Ma"wa/ (I-IV巻)；《抗體使用實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》(C/j/"g^"http://6o^: X La6oA^o^Ma"wa/);《細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》 (Ce〃 ^丄a6oratoo;Ma"wa/);《PCR引物實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》(尸C7 j丄a6orato^y Ma"wa/)和《分子克隆實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》(Mo/ecw/arC/owe.-J丄fl6wfltoo;Ma"wa/)(所有 均來(lái)自冷泉港實(shí)驗(yàn)室出版社)，Stryer， L， (1995)《生物化學(xué)》(jS/oc/^w/W^)(第 四版)Freeman, New York; Gfl仏《寡核苷酸合成 一種實(shí)用方法》(0%o"wc/eo"cfe 爭(zhēng)/tei,爿Pmc/Zcfl/^/^oflc/O 1984， IRL Press, London; Nelson禾卩Cox(2000)， Lehninger，《生物化學(xué)原理》(/V/"c^ /es 第三版，W.H.Rreeman Pub，New York, NY和Berg等，(2000)《生物化學(xué)》(Biochemistry)，第五版，W.H.Rreeman Pub， New York, NY，所有文獻(xiàn)均出于所有目的全文納入本文作為參考。本發(fā)明可利用固體基材，包括在一些優(yōu)選實(shí)施方案中的陣列。應(yīng)用于聚合物(包 括蛋白質(zhì))陣列合成方法和技術(shù)描述于美國(guó)系列號(hào)09/536,841; WO 00/58516;美國(guó) 專利號(hào)5,143,854; 5,242,974; 5，252，743; 5，324，633; 5,384,261; 5,405,783; 5,424,186; 5,451,683; 5,482,867; 5,491,074; 5,527,681; 5,550,215; 5,571,639; 5,578,832; 5,593,839; 5,599,695; 5,624,711; 5,631,734; 5,795,716; 5,831,070; 5,837,832; 5,856,101; 5,858,659; 5,936,324; 5,968,740; 5,974,164; 5,981,185; 5,981,956;li6,025，601; 6,033,860; 6，040,193; 6，090，555; 6,136,269; 6,269,846禾口 6,428,752; PCT申請(qǐng)?zhí)朠CT/US99/00730(國(guó)際公開號(hào)WO 99/36760)和PCT/US01/04285(國(guó)際公 開號(hào)WO 01/58593);這些均出于所有目的全文納入本文作為參考。在某些實(shí)施方案中描述合成技術(shù)的專利包括美國(guó)專利號(hào)5，412，087; 6,147,205; 6,262,216; 6,310,189; 5,889,165和5,959,098。許多上述專利中描述了核酸陣列，但相同技術(shù)應(yīng)用于多肽陣列。用于本發(fā)明 的核酸陣列包括可購(gòu)自Affymetrix(Santa Clara， CA)商品名為GeneChip⑧的那些。 陣列的例子見affymetrix.com網(wǎng)址。本發(fā)明也考慮了連接于固體基材上的聚合物的許多用途。這些用途包括基因 表達(dá)檢測(cè)、序型分析、文庫(kù)篩選、基因分型和診斷?；虮磉_(dá)檢測(cè)和序型分析方法 見美國(guó)專利號(hào)5，800，992; 6，013，449; 6,020,135; 6,033,860; 6,040,138; 6,177,248 和6,309,822?；蚍中图捌溆猛靖爬ㄓ诿绹?guó)系列號(hào)15 10/442,021; 10/013，598(美 國(guó)專利申請(qǐng)公開20030036069)和美國(guó)專利號(hào)5,856,092; 6,300,063; 5,858,659; 6,284,460; 6，361，947; 6，368，799和6,333,179。其它用途見美國(guó)專利號(hào)5，871，928; 5,902,723; 6,045,996; 5,541,061和6，197，506。在某些優(yōu)選的實(shí)施方案中，本發(fā)明也考慮了樣品的制備方法。在基因分型之 前或與之同時(shí)，基因組樣品可經(jīng)各種機(jī)理擴(kuò)增，其中一些利用PCR。參見，例如 《PCR技術(shù)DNA擴(kuò)增的原理和應(yīng)用》(尸C兄'尸n'"c^ /^ 々 / //cfl"o" /or ￡WJ ^w/ /折ca"o")(H.A.Erlich編，Rreeman Press, NY， NY 1992);《PCR方案方法 和應(yīng)用指南》(尸C7 尸mtoco/s:爿to Afe/Zze^ am/(Innis等編， Academic Press, San Diego， CA， 19卯)；Mattila等，Wwc/e/c爿c/c^ 19,4967 (1991); Eckert等，尸O M"/zecfc ^^//ca"o" ， 1 ， 17( 1991);《PCR》(McPherson等編， IRL Press, Oxford)和美國(guó)專利號(hào)4,683,202; 4,683,195; 4，800，159; 4,965,188和 5,333,675;每篇均出于所有目的全文納入本文作為參考。樣品可在陣列上擴(kuò)增。參 見，例如納入本文作為參考的美國(guó)專利號(hào)6,300,070和美國(guó)系列號(hào)09/513,300。其它合適的擴(kuò)增方法包括連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(LCR)(例如，Wu和Wallace, Ge"ow/c 4， 560(1989)， Landegern等，Sc/e"ce 241， 1077(1988)和Barringer等， G療89:117(1990))，轉(zhuǎn)錄擴(kuò)增(Kwoh等，尸wc.淑"c。(i.Sc/. USA 86， 1173(1989) 和W088/薩5)，自動(dòng)維持序列擴(kuò)增(Guatelli等，尸rac.淑」c^c/. USA， 87， 1874(1990)和WO90/06995)，靶多核苷酸序列的選擇性擴(kuò)增(美國(guó)專利號(hào)6,410,276)， 共有序列引發(fā)的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(CP-PCR)(美國(guó)專利號(hào)4，437，975)，任意引發(fā)的聚合 酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(AP-PCR)(美國(guó)專利號(hào)5,413,909; 5,861，245)和基于核酸的序列擴(kuò)增 (NABSA)。(參見，美國(guó)專利號(hào)5,409,818; 5，554，517和6,063,603，每篇均納入本 文作為參考)。其它可用的擴(kuò)增方法描述于美國(guó)專利號(hào)5,242,794; 5,494,810; 4,988,617和美國(guó)系列號(hào)09/854,317，每篇納入本文作為參考。樣品制備的其它方法和用于降低核酸樣品復(fù)雜性的技術(shù)描述于Dong等， mseflrc/z 11 ， 1418(2001)，美國(guó)專利號(hào)6,361,947; 6,391,592和美國(guó)系列號(hào) 09/916/135; 09/920，491(美國(guó)專利申請(qǐng)公開20030096235); 09/910,292(美國(guó)專利申 請(qǐng)公開20030082543)和10/013,598。本領(lǐng)域已良好地開發(fā)了用于多核苷酸雜交測(cè)定的方法。雜交測(cè)定方法和條件 取決于應(yīng)用并按照已知的常規(guī)結(jié)合方法來(lái)選擇，包括描述于以下的Maniatis等， 《分子克隆實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》(Mo/ecw/ar c/o"e/"g: ^丄fl60ratoA7 Ma"waZ)，(第二版， 冷泉港，N.Y.， 1989); Berger和Kimmel，《酶學(xué)方法》(M"/u cfe/" ￡ z_ymo/ogy)， 152巻，《分子克隆技術(shù)指南》(Gw/a e to Mo/ecw/ar C/o"/"g rec/z"z々we) (Academic Press, Inc., San Diego, CA， 1987); Young和Davism，80:1194(1983)。 進(jìn)行反復(fù)和受控雜交反應(yīng)的方法和設(shè)備描述于美國(guó)專利號(hào)5,871,928; 5,874,219; 6,045,996; 6,386,749; 6,391,623;每篇納入本文作為參考。在某些優(yōu)選的實(shí)施方案中，本發(fā)明也考慮了配體之間雜交的信號(hào)檢測(cè)。參見， 例如美國(guó)專利號(hào)5,143,854; 5,578,832; 5,631,734; 5,834,758; 5,936,324; 5,981,956; 6,025,601; 6,141,096; 6,185,030; 6,201,639; 6,218,803和6，225，625;美國(guó)系列號(hào) 10/389,194和PCT申請(qǐng)PCT/US99/06097(公開為W099/47964),每篇也出于所有目 的全文納入本文作為參考。用于信號(hào)檢測(cè)和強(qiáng)度數(shù)據(jù)處理的方法與設(shè)備公開于，例如美國(guó)專利號(hào) 5,143,854; 5,547,839; 5,578,832; 5,631,734; 5,800,992; 5,834,758; 5,856,092; 5,902,723; 5,936,324; 5,981,956; 6,025,601; 6,090,555; 6,141,096; 6,185,030; 6,201,639; 6,218,803和6，225，625;美國(guó)系列號(hào)10/389,194; 60/493,495和PCT申 請(qǐng) 也可利用常規(guī)的生物方法、軟件和系統(tǒng)來(lái)實(shí)踐本發(fā)明。本發(fā)明的計(jì)算機(jī)軟件 產(chǎn)品通常包括具有計(jì)算機(jī)可執(zhí)行指令的計(jì)算機(jī)可讀媒體，所述的指令用于進(jìn)行本發(fā)明方法的邏輯步驟。合適的計(jì)算機(jī)可讀媒體包括軟盤、CD-ROM/DVD/DVD-ROM、 硬盤驅(qū)動(dòng)器、閃存、ROM/RAM、磁帶等。計(jì)算機(jī)可執(zhí)行指令可以合適的計(jì)算機(jī)語(yǔ) 言或幾種語(yǔ)言的組合來(lái)書寫?；A(chǔ)計(jì)算機(jī)生物學(xué)方法描述于，例如Setubal和 Meidanis等，《計(jì)算生物學(xué)方法概論》(/"^oofwc"ow to Cow;wto"'o"a/說(shuō)o/ogy M"W力，(PWS Publishing Company, Boston, 1997); Salzberg, Searles， Kasif編， 《分子生物學(xué)計(jì)算方法》(Cow/ wtof/o"a/ Af"/zocfe /" Afo/ecw/"r Rashidi禾口Buehler，《生物信息學(xué)基礎(chǔ)生物科學(xué)和醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用》(5/0/"/omz加b Bay/c: j/7p//ca"o"/" S"'ewce ot c/A/ecfcfwe)， (CRC Press, London, 2000)與Ouelette和Bzevanis，《生物信息學(xué)基因和蛋白質(zhì)分析的實(shí)用指南》(Bioinformatics: A Practical Guide for Analysis of Gene and Protein), (Wiley & Sons, Inc，第二版，2001)。 參見，美國(guó)專利號(hào)6,420,108。本發(fā)明也可使用用于各種目的的各種計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品和軟件，例如探針設(shè)計(jì)、 數(shù)據(jù)管理、分析和儀器操作。參見，美國(guó)專利號(hào)5,593,839; 5,795,716; 5,733,729; 5,974,164; 6，066，454; 6,090,555; 6,185,561; 6,188,783; 6，223，127; 6,229,911和 6，308，170。此外，本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案可包括通過(guò)網(wǎng)絡(luò)提供遺傳信息的方法，所述網(wǎng) 絡(luò)例如是因特網(wǎng)，如以下美國(guó)系列號(hào)所述10/197,621; 10/063,559(美國(guó)公開號(hào) 20020183936); 10/065,856; 10/065,868; 10/328,818; 10/328,872; 10/423,403和 60/482,389。II.定義"陣列"是可通過(guò)合成或生物合成方法制備而有意建立的分子庫(kù)。陣列中的 分子可相同或互不相同。陣列可采用各種形式，例如可溶性分子文庫(kù)；連接于樹脂 珠的化合物文庫(kù)；硅芯片或其它固體支持物。核酸文庫(kù)或陣列是可通過(guò)合成或生物 合成方法制備而有意建立的核酸庫(kù)并可以各種形式(例如可溶性分子文庫(kù)；連接于 樹脂珠的化合物文庫(kù)；硅芯片或其它固體支持物)來(lái)篩選生物活性。此外，術(shù)語(yǔ)"陣 歹U"可包括通過(guò)將基本上任何長(zhǎng)度的核酸(例如，長(zhǎng)l-約100個(gè)核苷酸單體)點(diǎn)在基 材上制備的核酸文庫(kù)。本文使用的術(shù)語(yǔ)"核酸"指任何長(zhǎng)度的核糖核苷酸、脫氧核
糖核苷酸或肽核酸(PNA)的聚合形式的核苷酸，所述核苷酸含有嘌呤和嘧啶堿基， 或其它天然、化學(xué)或生物化學(xué)修飾的、非天然的或衍生的核苷酸堿基。多核苷酸骨 架可含有糖和磷酸基團(tuán)，或修飾或取代的糖或磷酸基團(tuán)， 一般可在RNA或DNA 中發(fā)現(xiàn)。多核苷酸可含有修飾的核苷酸，例如甲基化核苷酸或核苷酸類似物。核苷 酸序列可為非核苷酸組分打斷。因此，術(shù)語(yǔ)核苷、核苷酸、脫氧核苷和脫氧核苷酸 一般包括如本文所述的類似物。這些類似物是與天然存在的核苷或核苷酸具有某些 相同結(jié)構(gòu)特征的分子，以致當(dāng)摻入核酸或寡核苷酸序列時(shí)，它們可在溶液中與天然 存在的核酸序列雜交。這些類似物一般通過(guò)取代和/或修飾堿基、核糖或磷酸二酯 部分而衍生自天然存在的核苷和核苷酸?？捎幸庠O(shè)計(jì)這些變化來(lái)穩(wěn)定或動(dòng)搖雜交形 成或提高與所需的互補(bǔ)核酸序列雜交的特異性。生物聚合物或生物學(xué)聚合物是指生物或化學(xué)部分的重復(fù)單元。代表性的生物 聚合物包括(但不限于)核酸、寡核苷酸、氨基酸、蛋白質(zhì)、肽、激素、寡糖、脂質(zhì)、 糖脂、脂多糖、磷脂、上述物質(zhì)的合成類似物，包括(但不限于)反向核苷酸、肽核 酸、Meta-DNA和上述物質(zhì)的組合。"生物聚合物合成"包括合成生產(chǎn)生物聚合物 (有機(jī)和無(wú)機(jī)的)。"生物單體"與生物聚合物相關(guān)，該術(shù)語(yǔ)指生物聚合物的單一的單元或非生 物聚合物一部分的單一的單元。因此，例如核苷酸是寡核苷酸生物聚合物內(nèi)的生物 單體，氨基酸是蛋白質(zhì)或肽生物聚合物的生物單體；例如親和素、生物素、抗體、 抗體片段等也是生物單體。"起始生物單體"或"起始物生物單體"指經(jīng)反應(yīng)性親 核試劑與聚合物表面共價(jià)相連的第一生物單體，或是與連接于聚合物的接頭或間隔 臂相連的第一生物單體，所述接頭或間隔臂經(jīng)反應(yīng)性親核試劑連接于聚合物。"互補(bǔ)"指核苷酸或核酸之間的雜交或堿基配對(duì)，例如雙鏈DNA分子的兩條 鏈之間或寡核苷酸引物和待測(cè)序或擴(kuò)增的單鏈核酸上的引物結(jié)合位點(diǎn)之間?；パa(bǔ)核 苷酸一般是A和T(或A和U)或C和G。當(dāng)進(jìn)行最優(yōu)對(duì)比和比較的具有合適核苷 酸插入物或缺失物的一條鏈的核苷酸與另一條鏈的核苷酸的至少約80%配對(duì)、通 常至少約90%-95%，更優(yōu)選約98-100%時(shí)，則兩條單鏈RNA或DNA分子認(rèn)為是 互補(bǔ)的。此外，當(dāng)RNA或DNA鏈在選擇性雜交條件下與其補(bǔ)體雜交時(shí)則存在互 補(bǔ)性。當(dāng)在14-25個(gè)核苷酸的延伸段上具有至少約65%互補(bǔ)、優(yōu)選至少約75%、更 優(yōu)選至少約90%時(shí)， 一般會(huì)發(fā)生選擇性雜交。參見，納入本文作為參考的M.Kanehsia
iVwc/e/d/"es. 12:203(1984)。組合合成策略組合合成策略是通過(guò)依次加入可由反應(yīng)物矩陣和切換矩陣代 表的試劑來(lái)平行合成各種聚合物序列的有序策略，其產(chǎn)物是產(chǎn)物矩陣。反應(yīng)物矩陣是待加入的構(gòu)件的1列m行矩陣。切換矩陣是1和安排在列中的m之間所有或一 子集的二元數(shù)字(優(yōu)選有序的)。"二元策略"是至少兩個(gè)連續(xù)步驟照射基材上感興 趣區(qū)域的一部分(優(yōu)選一半)的策略。在二元合成策略中，可從形成的能從有序組的 反應(yīng)物中形成所有可能的化合物。在最優(yōu)選的實(shí)施策略中，二元策略指也因式分解 (factor)前述加入步驟的合成策略。例如，所述策略可是遮掩策略的切換矩陣將以前 照射的區(qū)域一分為二，照射約以前照射區(qū)域的一半并保護(hù)剩下一半(也保護(hù)約以前 保護(hù)區(qū)域的一半并照射約以前照射區(qū)域的一半)。應(yīng)理解的是二元循環(huán)可間插以非 二元循環(huán)，那么僅部分基材可經(jīng)受二元策略。組合"遮掩"策略是使用光或其它空 間選擇性脫保護(hù)或激活劑從材料中除去保護(hù)基團(tuán)以加入其它物質(zhì)，例如氨基酸的合 成方法。有效量指足以誘導(dǎo)所需結(jié)果的量?；蚪M是生物體的染色體中所有的遺傳物質(zhì)。來(lái)源于特定生物體的染色體中 遺傳物質(zhì)的DNA是基因組DNA?；蚪M文庫(kù)是從代表生物體全部基因組的一套隨機(jī)產(chǎn)生的重疊DNA片段制 得的克隆庫(kù)。雜交條件通常包括低于約1M的鹽濃度，更常見是低于約500mM， 優(yōu)選低于約200mM。雜交溫度可低至5r，但通常高于22。C、更常見的高于30'C, 優(yōu)選高于37°C。較長(zhǎng)的片段可能需要更高的雜交溫度來(lái)進(jìn)行特異性雜交。由于其 它因素也會(huì)影響雜交的嚴(yán)謹(jǐn)性，所述因素包括互補(bǔ)鏈的堿基組成和長(zhǎng)度，存在有機(jī) 溶劑和堿基錯(cuò)配的程度，所以參數(shù)的組合比單獨(dú)任何一個(gè)絕對(duì)測(cè)量值更重要。雜交，例如等位基因特異的探針雜交一般在嚴(yán)謹(jǐn)條件下進(jìn)行。例如，條件為 鹽濃度不高于1摩爾(M)，溫度至少25'C，如750mMNaCl、 50mM磷酸鈉、5mM EDTA、 pH7.4(5 X SSPE)和約25-30的溫度。雜交通常在嚴(yán)謹(jǐn)條件下進(jìn)行，例如鹽濃度不高于1摩爾(M)和溫度至少25°C。 例如5XSSPE(750mMNaCl、 50mM磷酸鈉、5mM EDTA、 pH7.4)和25-30的溫度 是適合于等位基因特異的探針雜交的條件。就嚴(yán)謹(jǐn)條件而言，參見，例如全文納入 本文作為參考的Sambrook，F(xiàn)ritsche和Maniatis，《分子克隆實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)》(M /ecw/ar
C/om'"g JZ^6orato^yMam /)，第二版，冷泉港出版社(1989)。術(shù)語(yǔ)"雜交"指兩條單鏈多核苷酸非共價(jià)結(jié)合成穩(wěn)定的雙鏈多核苷酸；三鏈雜交在理論上也是可能的。得到的雙鏈多核苷酸(通常)是"雜交體"。本文將形成穩(wěn)定的雜交體的多核苷酸群的比例稱為"雜交程度"。雜交探針是能以堿基特異性方式結(jié)合核酸的互補(bǔ)鏈的寡核苷酸。這種探針包括如Nielsen等，&/e"ce 254， 1497-1500(1991)所述的肽核酸和其它核酸類似物和核酸模擬物。"特異性雜交"指當(dāng)序列存在于復(fù)雜的混合物(例如，總細(xì)胞的)DNA或RNA 中時(shí)， 一種分子僅與特定的核苷酸序列或多條序列在嚴(yán)謹(jǐn)條件下結(jié)合、形成雙螺旋 或雜交。分離的核酸是作為主要種類存在的本發(fā)明目標(biāo)種類(即，在摩爾基礎(chǔ)上比組合 物中任何其它單個(gè)種類更豐富)。分離的核酸優(yōu)選包含所有存在的大分子種類的至 少約50、 80或90%(在摩爾基礎(chǔ)上)。目標(biāo)種類最優(yōu)選純化至基本上均一性(常規(guī)方 法不能在組合物中檢測(cè)到污染的種類)。配體配體是為特定的受體所識(shí)別的分子。與受體結(jié)合或反應(yīng)的物質(zhì)稱為"配 體"，該術(shù)語(yǔ)僅根據(jù)其對(duì)應(yīng)的受體才明確有意義。除了討論中的物質(zhì)能結(jié)合或與受 體相互作用以外，術(shù)語(yǔ)"配體"不涉及任何特定的分子大小或其它結(jié)構(gòu)或構(gòu)象特征。 配體也可用作與受體結(jié)合的天然配體或作為激動(dòng)劑或拮抗劑的功能性類似物。本發(fā) 明可研究的配體的例子包括(但不限于)細(xì)胞膜受體的激動(dòng)劑和拮抗劑、毒素或毒 液、病毒表位、激素(例如，阿片劑、類固醇等)、激素受體、肽、酶、酶底物、底 物類似物、過(guò)渡態(tài)類似物、輔助因子、藥物、蛋白質(zhì)和抗體。連鎖不平衡或等位基 因結(jié)合指特定的等位基因或遺傳標(biāo)記擇優(yōu)與染色體位置附近的特定等位基因或遺 傳標(biāo)記結(jié)合的頻率高于意外期望的該種群中任何特定等位基因的頻率。例如，如果 基因座x具有相同頻率發(fā)生的等位基因a和b，而連鎖基因座Y具有相同頻率發(fā) 生的等位基因c和d，則期望ac組合發(fā)生的頻率為0.25。如果ac更頻繁發(fā)生，則 等位基因a和c是連鎖不平衡的。連鎖不平衡可起因于等位基因的某些組合的天然 選擇或由于等位基因被引入種群太近以至于不能與連鎖等位基因達(dá)到平衡?；旌戏N群或復(fù)雜種群指任何含有需要和不需要核酸的樣品。作為非限制性 的例子，核酸的復(fù)雜種群可是總基因組DNA、總基因組RNA或它們的組合。此外，
核酸的復(fù)雜種群中可富集給定種群但也包括其它不需要的種群。例如，核酸的復(fù)雜種群可是富集所需的信使RNA(mRNA)序列但仍含有一些不需要的核糖體RNA序 列(rRNA)的樣品。單體指可連接到一起以形成寡聚物或聚合物的分子集合的任何成員。以(多) 肽合成為例，用于本發(fā)明的單體集合包括(但不限于)，L-氨基酸、D-氨基酸或合成 的氨基酸集合。本文使用的"單體"指用于寡聚物合成的基礎(chǔ)集合的任何成員。例 如，L-氨基酸二聚體形成了用于多肽合成的400 "單體"的基礎(chǔ)集合。不同的單體 的基礎(chǔ)集合可用在聚合物合成的連續(xù)步驟中。術(shù)語(yǔ)"單體"也指化學(xué)亞單位，該化學(xué)亞單位可與不同的化學(xué)亞單位結(jié)合以 形成大于每個(gè)亞單位的化合物。本文使用的"mRNA"或"mRNA轉(zhuǎn)錄物"包括(但 不限于)前-mRNA轉(zhuǎn)錄物、轉(zhuǎn)錄物加工中間體、準(zhǔn)備翻譯的成熟mRNA、 一個(gè)或多 個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄物，或來(lái)源于mRNA轉(zhuǎn)錄物的核酸。轉(zhuǎn)錄物加工包括剪接、編輯和 降解。本文使用的"來(lái)源于mRNA轉(zhuǎn)錄物的核酸"指合成最終用作模板的mRNA 轉(zhuǎn)錄物或其亞序列的核酸。因此，逆轉(zhuǎn)錄自mRNA的cDNA、轉(zhuǎn)錄自cDNA的RNA、 擴(kuò)增自cDNA的DNA、轉(zhuǎn)錄自擴(kuò)增的DNA的RNA等均來(lái)源于mRNA轉(zhuǎn)錄物， 檢測(cè)這種衍生的產(chǎn)物是樣品中原始轉(zhuǎn)錄物的存在和/或豐富程度的征兆。因此， mRNA衍生的樣品包括(但不限于)一種或多種基因的mRNA轉(zhuǎn)錄物、逆轉(zhuǎn)錄自 mRNA的cDNA、轉(zhuǎn)錄自cDNA的cRNA、擴(kuò)增自基因的DNA、轉(zhuǎn)錄自擴(kuò)增的DNA 的RNA等。核酸文庫(kù)或陣列是可通過(guò)合成或生物合成方法制備而有意建立的核酸庫(kù)并可 以各種形式(例如可溶性分子文庫(kù)；連接于樹脂珠的寡核苷酸文庫(kù)；硅芯片或其它 固體支持物)來(lái)篩選生物活性。此外，術(shù)語(yǔ)"陣列"可包括通過(guò)將基本上任何長(zhǎng)度 的核酸(例如，長(zhǎng)1-約100個(gè)核苷酸單體)點(diǎn)在基材上制備的核酸文庫(kù)。本文使用的 術(shù)語(yǔ)"核酸"指任何長(zhǎng)度的核糖核苷酸、脫氧核糖核苷酸或肽核酸(PNA)的聚合形 式的核苷酸，所述核苷酸含有嘌呤和嘧啶堿基，或其它天然、化學(xué)或生物化學(xué)修飾 的、非天然的或衍生的核苷酸堿基。多核苷酸骨架可含有糖和磷酸基團(tuán)，或修飾或 取代的糖或磷酸基團(tuán)，這通常在RNA或DNA中發(fā)現(xiàn)。多核苷酸可含有修飾的核 苷酸，例如甲基化核苷酸或核苷酸類似物。核苷酸序列可為非核苷酸組分打斷。因 此，術(shù)語(yǔ)核苷、核苷酸、脫氧核苷和脫氧核苷酸一般包括如本文所述的類似物。這
些類似物是與天然存在的核苷或核苷酸具有某些相同結(jié)構(gòu)特征的分子，以致當(dāng)摻入 核酸或寡核苷酸序列時(shí)，它們可在溶液中與天然存在的核酸序列雜交。這些類似物 一般通過(guò)取代和/或修飾堿基、核糖或磷酸二酯部分而衍生自天然存在的核苷和核 苷酸。可設(shè)計(jì)這些變化來(lái)穩(wěn)定或動(dòng)搖雜交形成或提高與所需的互補(bǔ)核酸序列雜交的 特異性。本發(fā)明的核酸可含有嘧啶和嘌呤堿基的任何聚合物或寡聚物，分別優(yōu)選胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶與腺嘌呤和鳥嘌呤。參見，AlbertL丄ehninger，《生物化學(xué) 原理》(/V/m7^/w 793-800頁(yè)(Worth Pub， 1982)。實(shí)際上，本發(fā)明考慮了任何脫氧核糖核苷酸、核糖核苷酸或肽核酸組分與它們的任何化學(xué)變體，例 如這些堿基的甲基化、羥甲基化或糖基化形式等。這些聚合物或寡聚物在組合物中 可是異質(zhì)或均質(zhì)的，并且可從天然來(lái)源分離或經(jīng)人工或合成產(chǎn)生。此外，核酸可是 DNA或RNA或它們的混合物，并且可以單鏈或雙鏈形式永久或暫時(shí)存在，包括同 源雙鏈、異源雙鏈和雜交體狀態(tài)。"寡核苷酸"或"多核苷酸"是長(zhǎng)度范圍在至少2個(gè)、優(yōu)選至少8個(gè)、更優(yōu) 選至少20個(gè)核苷酸的核酸，或是特異性地與多核苷酸雜交的化合物。本發(fā)明的多 核苷酸包括分離自天然來(lái)源、重組產(chǎn)生或人工合成的脫氧核糖核酸(DNA)或核糖核 酸(RNA)的序列和它們的模擬物。本發(fā)明多核苷酸的其它例子可是肽核酸(PNA)。 本發(fā)明也包括有非傳統(tǒng)堿基配對(duì)的情況，例如在某些tRNA中已鑒定和假定存在于 三螺旋中的Hoogsteen堿基配對(duì)。在本申請(qǐng)中"多核苷酸"和"寡聚核苷酸"可互 換使用。探針探針是可由特定靶識(shí)別的表面固定的分子。以具有IO、 12和更多個(gè)堿 基的探針的所有可能組合的陣列為例，參見美國(guó)專利號(hào)6，582，908。本發(fā)明可研究 的探針的例子包括(但不限于)細(xì)胞膜受體的激動(dòng)劑和拮抗劑、毒素和毒液、病毒表 位、激素(例如，阿片樣肽、類固醇等)、激素受體、肽、酶、酶的底物、輔因子、 藥物、凝集素、糖、寡核苷酸、核酸、寡糖、蛋白質(zhì)和單克隆抗體。引物是能在合適條件下用作模板定向DNA合成的起始點(diǎn)的單鏈寡核苷酸，所 述條件例如緩沖液和溫度、存在四種不同的核苷三磷酸和用于聚合的試劑，如DNA 或RNA聚合酶或逆轉(zhuǎn)錄酶。在任何給定的情況中，引物的長(zhǎng)度取決于，例如引物 的用途，并且一般是15-30個(gè)核苷酸。短引物分子一般需要較冷的溫度來(lái)與模板形
成足夠穩(wěn)定的雜交復(fù)合物。引物無(wú)需反映模板的確切序列，但必須與這種模板具有 足夠的雜交互補(bǔ)性。引物位點(diǎn)是模板上與引物雜交的區(qū)域。引物對(duì)是包括與待擴(kuò)增序列的5'端雜交的5，上游引物和與互補(bǔ)的待擴(kuò)增序列的3'端的補(bǔ)體雜交的3'下游 引物的一組引物。多態(tài)性指在某個(gè)群體中發(fā)生兩種或多種遺傳確定的交替序列或等位基因。多 態(tài)性標(biāo)記或位點(diǎn)是趨異發(fā)生的基因座。優(yōu)選的標(biāo)記具有至少兩個(gè)等位基因，其中每 一個(gè)的發(fā)生頻率大于選擇的種群的1%，優(yōu)選大于10%或20%。多態(tài)性可包括一個(gè) 或多個(gè)堿基變化、插入、重復(fù)或缺失。多態(tài)性基因座可小至一個(gè)堿基對(duì)。多態(tài)性標(biāo) 記包括限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性、可變數(shù)量的串聯(lián)重復(fù)(VNTR)、超變區(qū)、小衛(wèi)星 (DNA)、 二核苷酸重復(fù)、三核苷酸重復(fù)、四核苷酸重復(fù)、簡(jiǎn)單序列重復(fù)和插入元件， 例如Alu。第一個(gè)鑒定的等位基因形式是任意設(shè)計(jì)為參考形式，另一個(gè)等位基因形 式設(shè)計(jì)為交替或變體等位基因。選擇的種群中發(fā)生頻率最高的等位基因形式有時(shí)稱 為野生型形式。雙倍體生物體的等位基因形式可是純合或雜合的。雙等位基因多態(tài) 性具有兩種形式。三等位基因多態(tài)性具有三種形式。多態(tài)性包括單核苷酸多態(tài)性 (SNP)。受體對(duì)給定的配體具有親和力的分子。受體可是天然存在或人造的分子。它們也可以其未改變的狀態(tài)或與其它種類聚集的狀態(tài)使用。受體可通過(guò)特定的結(jié)合 物質(zhì)直接或間接地、共價(jià)或非共價(jià)地與結(jié)合成員相連。本發(fā)明可用的受體的例子包 括(但不限于)抗體、細(xì)胞膜受體、與特定的抗原決定簇(例如在病毒、細(xì)胞或其它物 質(zhì)上)具有反應(yīng)性的單克隆抗體和抗血清、藥物、多核苷酸、核酸、肽、輔因子、 凝集素、糖、多糖、細(xì)胞、細(xì)胞膜和細(xì)胞器。在本領(lǐng)域受體有時(shí)指抗配體。本文使用的術(shù)語(yǔ)"受體"沒有不同的含義。兩個(gè)大分子通過(guò)分子識(shí)別形成復(fù)合物后，就形 成了 "配體受體對(duì)"。本發(fā)明研究的受體的其它例子包括(但不限于)全文納入本文作為參考的美國(guó)專利號(hào)5,143,854所示的分子。"固體支持物"、"支持物"和"基材"可互換使用并指具有剛性或半剛性 表面或多個(gè)表面的材料或材料組。雖然在一些實(shí)施方案中，需要用，例如孔、突起 的區(qū)域、針、蝕刻槽等用物理方法分開用于不同化合物的合成區(qū)域，但在許多實(shí)施 方案中，固體支持物的至少一個(gè)表面基本上是平的。根據(jù)其它實(shí)施方案，固體支持 物可采用珠子、樹脂、凝膠、微球或其它幾何構(gòu)造的形式。示范性的基材可參見美
國(guó)專禾U號(hào)5,744,305。靶對(duì)給定的探針具有親和力的分子。耙可是天然存在或人造的分子。它們 也可以其未改變的狀態(tài)或與其它種類聚集的狀態(tài)使用。耙可通過(guò)特定的結(jié)合物質(zhì)直 接或間接地、共價(jià)或非共價(jià)地與結(jié)合成員相連。本發(fā)明可用的靶的例子包括(但不 限于)抗體、細(xì)胞膜受體、與特定的抗原決定簇(例如在病毒、細(xì)胞或其它物質(zhì)上) 具有反應(yīng)性的單克隆抗體和抗血清、藥物、多核苷酸、核酸、肽、輔因子、凝集素、 糖、多糖、細(xì)胞、細(xì)胞膜和細(xì)胞器。在本領(lǐng)域靶有時(shí)指抗探針。本文使用的術(shù)語(yǔ)"靶" 沒有不同的含義。當(dāng)兩個(gè)大分子通過(guò)分子識(shí)別形成復(fù)合物后，就形成了 "探針靶配 對(duì)"。III.特定的實(shí)施方案圖1-2顯示了本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的簡(jiǎn)化系統(tǒng)。這些 示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉 許多變化、替代和改進(jìn)形式。系統(tǒng)100包括流體部件、支持部件與電子和機(jī)械部件。 雖然上文描述了使用系統(tǒng)100的一組選擇的部件，但可有許多替代、改進(jìn)和變化形 式。例如， 一些部件可擴(kuò)展和/或組合。其它部件可插入上述部件。取決于實(shí)施方 案，部件的安排可用其它替代部件來(lái)互換。例如，使用系統(tǒng)100的至少一部分，如 流體站。這些部件的其它細(xì)節(jié)見本說(shuō)明書并且在下文將更詳細(xì)。流體部件包括至少一些容器。每一個(gè)這些容器含有一種或多種用于處理至少 一個(gè)生物傳感器的流體。例如，每個(gè)容器是孔。在另一實(shí)施例中，孔分成一個(gè)或多 個(gè)板和/或一個(gè)或多個(gè)條帶。如圖l-2所示，這些孔分成至少一個(gè)或多個(gè)孔板112、 114和116。在一個(gè)實(shí)施方案中，孔板112、 114和116中的每一個(gè)含有96個(gè)孔。 在另一個(gè)實(shí)施方案中，每個(gè)孔含有一種或多種流體。在還有一個(gè)實(shí)施方案中，同一 板或不同板上的不同孔含有相同或不同的流體。還有另一個(gè)實(shí)施方案中，不同的孔 具有相同或不同的深度。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，流體部件110也包含一個(gè)或多個(gè)支架板。例如， 每個(gè)支架板包含多個(gè)以多行和多列安排的多個(gè)孔并能放置一個(gè)或多個(gè)傳感器。在一 個(gè)實(shí)施方案中，支架板用于在雜交過(guò)程之前或之后將一個(gè)或多個(gè)傳感器輸送至系統(tǒng) 100。在另一個(gè)實(shí)施方案中，支架板用于將一個(gè)或多個(gè)傳感器輸送出系統(tǒng)100。例 如，支架板是包括至少一個(gè)比色皿支架的掃描托盤。
支持部件包括至少一個(gè)面板140和抽屜組件122、 124和128。例如，抽屜組 件122、 124和128中的每一個(gè)包含一塊可在水平方向滑動(dòng)的面板。在一個(gè)實(shí)施方 案中，孔板112置于抽屜組件122的面板上，孔板114置于抽屜組件124的面板上。 例如，孔板112直接或間接地固定在抽屜組件122的面板的預(yù)定位置上。在另一個(gè) 實(shí)施方案中，孔板114的一個(gè)或多個(gè)孔與抽屜組件122的面板基本上垂直。如圖 1-2所示，根據(jù)本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案，支持部件也包括額外的抽屜組件。每一 個(gè)額外的抽屜組件包括一塊能在水平方向滑動(dòng)的面板。在一個(gè)實(shí)施方案中，孔板或 支架板置于面板上。例如，孔板或支架板直接或間接地固定于面板上的預(yù)定位置。 在另一個(gè)實(shí)施方案中，孔板或支架板的一個(gè)或多個(gè)孔基本上與面板垂直。此外，支持部件也包括熱板組件126。在一個(gè)實(shí)施方案中，熱板組件126置于 抽屜組件125的面板上。例如，熱板組件126直接或間接地固定于抽屜組件128 的面板上的預(yù)定位置。圖3(A)和3(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 中簡(jiǎn)化的熱板組件126。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。 本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。熱板組件126包括絕緣 結(jié)構(gòu)310、加熱器312、溫度計(jì)314(例如熱電偶)和傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)316。雖然上文描述了 使用熱板組件126的一組選擇的部件，但可有許多替代、改進(jìn)和變化形式。例如， 一些部件可擴(kuò)展和/或組合。其它部件可插入上述部件。取決于實(shí)施方案，部件的 安排可用其它替代部件來(lái)互換。例如，圖3(A)是簡(jiǎn)化的頂視圖，圖3(B)是簡(jiǎn)化的底視圖。這些部件的其它細(xì)節(jié)見本說(shuō)明書并且在下文將更詳細(xì)。如圖l、 2、 3(A)和3(B)所示，根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，孔板116置于傳 導(dǎo)結(jié)構(gòu)316上。例如，孔板116包括一個(gè)或多個(gè)孔，每個(gè)孔含有至少一種流體。該 流體通過(guò)傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)316加熱。流體的溫度通過(guò)熱電偶314直接或間接地監(jiān)測(cè)。響應(yīng) 于(溫度)，熱電偶314向溫度控制器發(fā)出信號(hào)。在一個(gè)實(shí)施方案中，溫度控制器也 是系統(tǒng)100的一個(gè)部件。溫度控制器根據(jù)目標(biāo)溫度處理接收的信號(hào)并調(diào)節(jié)加熱器 312的功率來(lái)實(shí)現(xiàn)流體的目標(biāo)溫度。在一個(gè)實(shí)施方案中，使用者通過(guò)溫度接口將目 標(biāo)溫度提供給系統(tǒng)100。例如，溫度接口是系統(tǒng)100的一個(gè)部件。在另一個(gè)實(shí)施方 案中，通過(guò)孔板116本身將目標(biāo)溫度提供給系統(tǒng)100。例如，孔板116攜帶由系統(tǒng) 100的條形碼(barcode)讀數(shù)儀讀數(shù)的條形碼。系統(tǒng)100可基于條形碼確定目標(biāo)溫度。 數(shù)儀，例如一種檢測(cè)器是系統(tǒng)100的一個(gè)部件。再回到圖1-2，電子和機(jī)械部件可將每一個(gè)所述的一個(gè)或多個(gè)傳感器從一個(gè)位 置移到另一個(gè)位置。在一個(gè)實(shí)施方案中，電子和機(jī)械部件用作輸送部件。在另一個(gè) 實(shí)施方案中，傳感器的移動(dòng)可在一、二或三維中進(jìn)行。在還有另一個(gè)實(shí)施方案中， 傳感器可以任何速度移動(dòng)。如圖l-2所示，電子和機(jī)械部件將每一個(gè)所述的一個(gè)或 多個(gè)傳感器從流體部件的一個(gè)孔移至另一個(gè) L。例如，每一個(gè)所述的一個(gè)或多個(gè)傳 感器從孔板112的一個(gè)孔移至孔板114的另一個(gè) L。此外，電子和機(jī)械部件將每一 個(gè)所述的一個(gè)或多個(gè)傳感器在流體部件110的對(duì)應(yīng)孔內(nèi)移動(dòng)，和/或?qū)⒚恳粋€(gè)所述 的一個(gè)或多個(gè)傳感器移入和/或移出流體部件110的對(duì)應(yīng)孔。例如，對(duì)應(yīng)的孔是孔 板112或114的孔。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，電子和機(jī)械部件包括夾鉗組件132和至少包括 馬達(dá)134和136。夾鉗組件可直接或間接地夾住或松開一個(gè)或多個(gè)傳感器。馬達(dá)134 和136的每一個(gè)可使一個(gè)或多個(gè)夾住的傳感器在兩個(gè)相對(duì)的一維方向中移動(dòng)。例 如，馬達(dá)134可使一個(gè)或多個(gè)傳感器沿著與抽屜組件122或124的面板垂直的Z 軸移動(dòng)。在另一個(gè)實(shí)施例中，馬達(dá)136可使一個(gè)或多個(gè)夾住的傳感器沿著與抽屜組 件122或124的面板平行的X軸移動(dòng)。此外，電子和機(jī)械部件包括第三馬達(dá)。例 如，第三馬達(dá)可使一個(gè)或多個(gè)夾住的傳感器在沿著如圖1-2所示的Y軸的兩個(gè)相 對(duì)方向中移動(dòng)。圖4(A)和4(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 中簡(jiǎn)化的夾鉗組件132。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。 本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。夾鉗組件132包括傳感 器410、馬達(dá)420、凸輪430、架子和小齒輪440、彈簧450、臂狀體460和462、 指狀組件470和472。雖然上文描述了使用夾鉗組件132的一組選擇的部件，但可 有許多替代、改進(jìn)和變化形式。例如， 一些部件可擴(kuò)展和/或組合。其它部件可插 入上述部件。取決于實(shí)施方案，部件的安排可用其它替代部件來(lái)互換。這些部件的 其它細(xì)節(jié)見本說(shuō)明書并且在下文將更詳細(xì)。指狀組件470和472中的每一個(gè)包括一個(gè)或多個(gè)指狀體，例如兩個(gè)指狀體。 當(dāng)指狀體處于關(guān)閉位置時(shí)，可直接或間接地夾住所述的一個(gè)或多個(gè)傳感器190。當(dāng) 指狀體處于打開位置時(shí)，可直接 或間接地松開所述的一個(gè)或多個(gè)傳感器l卯。如圖 4(A)和4(B)所示，指狀組件470和472分別連接于臂狀體460和462。指狀體470 和472在關(guān)閉位置和打開位置之間的移動(dòng)由馬達(dá)420驅(qū)動(dòng)。馬達(dá)420可至少通過(guò)凸 輪430與臂狀體460和462向指狀體施加力。在一個(gè)實(shí)施方案中，臂狀體460延伸 超過(guò)用于連接指狀組件470的部分，臂狀體462延伸超過(guò)用于連接指狀組件472 的部分。例如，臂狀體460包括節(jié)段480，臂狀體462包括節(jié)段482。在另一個(gè)實(shí) 施例中，傳感器410包括局部和極限(home and limit)傳感器。圖5(A)和5(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 中簡(jiǎn)化的夾鉗組件132。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。 本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。夾鉗組件132包括兩個(gè) 臂狀體560和562。兩個(gè)臂狀體560和562分別連接于指狀組件570和572。指狀 組件570包括兩個(gè)指狀體590和592，指狀組件572也包括兩個(gè)指狀體。當(dāng)指狀體 處于關(guān)閉位置時(shí)，可直接或間接地夾住所述的一個(gè)或多個(gè)傳感器。當(dāng)指狀體處于打 開位置時(shí)，可直接或間接地松開所述的一個(gè)或多個(gè)傳感器。在一個(gè)實(shí)施方案中，臂 狀體560延伸超過(guò)用于連接指狀組件570的部分，臂狀體562延伸超過(guò)用于連接指 狀組件572的部分。例如，臂狀體560包括節(jié)段580，臂狀體562包括節(jié)段582。再回到圖1-2,如上所述，電子和機(jī)械部件包括夾鉗組件132、馬達(dá)134和136 與第三馬達(dá)。夾鉗組件132可直接或間接地夾住或松開一個(gè)或多個(gè)傳感器。每個(gè)馬 達(dá)可使一個(gè)或多個(gè)夾住的傳感器在至少一個(gè)一維方向中移動(dòng)。此外，第三馬達(dá)也可 使用夾鉗組件132來(lái)使抽屜組件在兩個(gè)相對(duì)的方向中滑動(dòng)。例如，所述抽屜組件是 抽屜組件122或124。在另一個(gè)實(shí)施例中，所述兩個(gè)相對(duì)的方向是水平方向。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，除了夾鉗組件132和某些馬達(dá)之外，所述電子 和機(jī)械部件包括其它部件。例如，電子和機(jī)械部件包括至少一個(gè)高壓電源和一個(gè)低 壓電源。在一個(gè)實(shí)施方案中，電源為例如馬達(dá)提供預(yù)定值和/或在預(yù)定范圍內(nèi)的電 壓。在另一個(gè)實(shí)施方案中，電源從外部電源接收115伏AC的功率。圖6(A)和6(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 中簡(jiǎn)化的抽屜組件122或124。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的 范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。所述抽屜組件包 括面板610、伸縮式線形支座620、防濺擋板630和板偏置零件640。如圖6(A)和6(B)所示，面板610包括用于支撐支持一個(gè)或多個(gè)孔板的一個(gè)或
多個(gè)槽。例如，孔板650占據(jù)一個(gè)槽，另一個(gè)空著。在一個(gè)實(shí)施方案中，板650 至少部分被用于一個(gè)或多個(gè)傳感器的板覆蓋。在另一個(gè)實(shí)施方案中，孔板650至少 部分未被用于一個(gè)或多個(gè)傳感器的板覆蓋。抽屜組件122或124的移動(dòng)由馬達(dá)，例 如夾鉗組件132的第三馬達(dá)通過(guò)夾鉗組件132的至少一個(gè)臂狀體驅(qū)動(dòng)。例如，所述 的至少一個(gè)臂狀體包括臂狀體460和/或臂狀體462。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述的 至少一個(gè)臂狀體包括包括臂狀體560和/或臂狀體562。圖7(A)、 (B)和(C)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng) 100中簡(jiǎn)化的抽屜組件122或124。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要 求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。所述抽屜組 件包括至少一塊面板710，該面板包括槽712和714。例如，槽712和714均空著。抽屜組件122或124的移動(dòng)，例如推進(jìn)或拉出，由馬達(dá)，例如夾鉗組件132 的第三馬達(dá)通過(guò)臂狀體720和722驅(qū)動(dòng)。例如，臂狀體720和722是臂狀體460 和462。在另一個(gè)實(shí)施例中，臂狀體720和722是臂狀體560和562。如圖7(B和 7(C)所示，根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，抽屜組件122或124從面板730和740之 間的關(guān)閉位置推至面板730和740之間的打開位置。例如，面板730是圖1所示的 面板140。在另一個(gè)實(shí)施例中，面板740是系統(tǒng)100的部件，但未示于圖l。根據(jù) 另一個(gè)實(shí)施方案，抽屜組件122或124從打開位置拉至關(guān)閉位置。根據(jù)又一個(gè)實(shí)施 方案，抽屜組件128移動(dòng)，例如推進(jìn)或拉出，由馬達(dá)，例如夾鉗組件132的第三馬 達(dá)通過(guò)其兩個(gè)臂狀體驅(qū)動(dòng)。圖8顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100中簡(jiǎn)化的 孔板。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù) 人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式?？装?00包括多個(gè)容器，例如96個(gè)孔。 在一個(gè)實(shí)施方案中，多個(gè)容器排列成多行和多列。在另一個(gè)實(shí)施方案中，每個(gè)孔含 有一種或多種流體。例如，每個(gè)孔中一種或多種流體的體積等于或小于3ml或5ml。 在一個(gè)實(shí)施方案中，用于低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌或染色的一種或多種流體的體積是約1.9ml， 用于高嚴(yán)謹(jǐn)洗滌是約3.7ml。在另一個(gè)實(shí)施方案中，不同的孔具有相同或不同的深 度。例如，孔板800用作孔板112、 114和域116。如上所述和這里要進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)的，根據(jù)本發(fā)明的某些實(shí)施方案，系統(tǒng)100可 用于處理生物傳感器。例如，生物傳感器可是各種類型。參見2004年4月16曰提
交的美國(guó)專利申請(qǐng)系列號(hào)10/826,577和2005年10月4日提交的11/243,621，每篇 均納入本文作為參考。在另一個(gè)實(shí)施例中，所述一個(gè)或多個(gè)生物傳感器的每個(gè)均是 生物微陣列。在一個(gè)實(shí)施方案中，生物微陣列具有一個(gè)傳感器長(zhǎng)度、 一個(gè)傳感器寬 度和一個(gè)傳感器厚度。例如，傳感器長(zhǎng)度等于或短于10mm、傳感器寬度等于或狹 于10mm，傳感器厚度等于或薄于100(Him。在另一個(gè)實(shí)施例中，傳感器長(zhǎng)度等于 約6.3mm，傳感器寬度等于約6.3mm、傳感器厚度等于約700|_im。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，所述一個(gè)或多個(gè)生物傳感器的每一個(gè)連接于支 持部件。例如，所述支持部件是栓釘。圖9顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案的可由系統(tǒng) IOO處理的簡(jiǎn)化傳感器組件。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范 圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。如圖9所示，傳感 器組件900包括多個(gè)生物微陣列、多個(gè)栓釘和一個(gè)基礎(chǔ)部件。所述多個(gè)生物微陣列 分別連接于多個(gè)栓釘，而多個(gè)栓釘由基礎(chǔ)部件連接。例如，所述多個(gè)栓釘包括96 個(gè)栓釘，所述多個(gè)生物微陣列包括96個(gè)微陣列。在另一個(gè)實(shí)施例中，所述多個(gè)微 陣列由系統(tǒng)100 —起操作。圖IO顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案由系統(tǒng)IOO進(jìn)行處理生物傳感器的簡(jiǎn)化流體 方法。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù) 人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。方法1000包括低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌過(guò)程1010、高 嚴(yán)謹(jǐn)洗滌過(guò)程1020、鏈霉抗生物素蛋白藻紅蛋白(SAPE)染色過(guò)程1030、低嚴(yán)謹(jǐn)洗 滌過(guò)程1040、抗體(AB)染色過(guò)程1050、低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌過(guò)程1060、SAPE染色過(guò)程1070、 低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌過(guò)程1080。雖然上文描述了使用過(guò)程的選擇順序，但可有許多替代、 改進(jìn)和變化形式。例如， 一些過(guò)程可擴(kuò)展和/或組合。其它過(guò)程可插入上述過(guò)程中。 取決于實(shí)施方案，過(guò)程的特定順序可用其它替代的過(guò)程來(lái)互換。這些過(guò)程的其它細(xì) 節(jié)見本說(shuō)明書并且在下文將更詳細(xì)。每個(gè)低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌過(guò)程1010、 1040和1060中，所述一個(gè)或多個(gè)傳感器中的每 個(gè)于室溫在多個(gè)孔中洗滌。例如，所述的多個(gè)孔包括兩個(gè)孔。在另一個(gè)實(shí)施例中， 所述的多個(gè)孔包括4個(gè)孔。就每個(gè)孔而言，對(duì)應(yīng)的傳感器與流體在孔中混合多次， 例如在夾鉗組件132的控制下。例如，所述的多次包括3分鐘內(nèi)的23次。在另一 個(gè)實(shí)施例中，所述的多次包括2分鐘內(nèi)的36次。高嚴(yán)謹(jǐn)洗滌過(guò)程1020中，所述一個(gè)或多個(gè)傳感器中的每個(gè)至少在一個(gè)孔中洗
滌。在每個(gè)？L，流體處于升高的溫度中，對(duì)應(yīng)的傳感器與流體混合一段時(shí)間。例如， 升高的溫度是48'C，時(shí)間是25分鐘。在另一個(gè)實(shí)施例中，升高的溫度范圍是36-42 °C，例如41"C，時(shí)間也是25分鐘。每個(gè)SAPE染色過(guò)程1030和1070中，所述一個(gè)或多個(gè)傳感器中的每個(gè)于室 溫在至少一個(gè)孔中染色。就每個(gè)孔而言，對(duì)應(yīng)的傳感器與流體混合一段時(shí)間。例如， 所述一段時(shí)間是10分鐘。在AB染色過(guò)程1050中，所述一個(gè)或多個(gè)傳感器中的每 個(gè)于室溫在至少一個(gè)孔中染色。就每個(gè)孔而言，對(duì)應(yīng)的傳感器與流體混合一段時(shí)間。 例如，所述一段時(shí)間是10分鐘。如上所述和這里進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)的，根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，過(guò)程1010、 1020、 1030、 1040、 1050、 1060、 1070和1080均由系統(tǒng)100執(zhí)行。在過(guò)程1010之前， 所述一個(gè)或多個(gè)傳感器進(jìn)行雜交過(guò)程。例如，所述雜交過(guò)程在溫度范圍48-52'C， 例如48'C進(jìn)行16小時(shí)。過(guò)程1080之后，掃描所述一個(gè)或多個(gè)傳感器。再回到圖1-2，系統(tǒng)100也包括爐組件150和松開夾鉗站160。例如，爐組件 150用作雜交部件的至少一部分。爐組件150的某些實(shí)施方案示于圖ll(A)、 11(B) 和12。松開夾鉗站160的一些實(shí)施方案示于圖13(A)和(B)。圖U(A)和(B)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 的簡(jiǎn)化爐組件150。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng) 域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。所述爐組件包括加熱器和風(fēng) 扇1100，面板1120、 1122、 1124和1126， 一個(gè)或多個(gè)壁1130、帶狀物和滑輪1140、 滑動(dòng)門1150和傳感器1160，例如極限傳感器(limit sensor)。雖然上文描述了使用 夾鉗組件132的一組選擇的部件，但可有許多替代、改進(jìn)和變化形式。例如， 一些 部件可擴(kuò)展和/或組合。其它部件可插入上述部件。取決于實(shí)施方案，部件的安排 可用其它替代部件來(lái)互換。例如，圖ll(A)是簡(jiǎn)化的前視圖、圖ll(B)是簡(jiǎn)化的后 視圖。這些部件的其它細(xì)節(jié)見本說(shuō)明書并且在下文將更詳細(xì)。加熱器和風(fēng)扇1110可加熱空氣并使熱空氣在爐組件150內(nèi)部循環(huán)。面板1120、 1122、 1124和1126的每個(gè)可支持支架板，例如所述支架板是雜交托盤。例如，雜 交托盤由帶有一個(gè)或多個(gè)傳感器的傳感器載體夾在一起。在另一個(gè)實(shí)施例中，所述 傳感器載體是傳感器組件900。支架板和傳感器載體可由夾鉗組件132輸送入或輸 送出爐組件150。例如，滑動(dòng)門1150打開，爐組件132將三對(duì)支架板和傳感器運(yùn)
載體移入爐組件1150并將這三對(duì)分別置于面板1120、 1122和1124上。然后關(guān)閉 滑動(dòng)門并加熱爐組件。在另一個(gè)實(shí)施例中，滑動(dòng)門的移動(dòng)至少部分由帶狀物和滑輪 1140控制。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，無(wú)論支架板和傳感器載體的數(shù)量有多少 以及它們?cè)跔t組件中的位置，爐組件可提供均勻的氣流。例如，使用氣溶膠絕緣。 在另一個(gè)實(shí)施例中，使用一個(gè)或多個(gè)高效風(fēng)扇。圖12顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100的簡(jiǎn)化松 開夾鉗站160。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的 普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。如圖12所示，松開夾鉗站160 包括至少一塊面板1310和多個(gè)指狀體組件。例如，所述多個(gè)指狀體組件包括指狀 體組件1320、 1330、 1340、 1350、 1360和1370。在另一個(gè)實(shí)施例中，緊固組件1380 包括一塊支架板和一個(gè)傳感器載體。根據(jù)本發(fā)明，所述支架板是雜交托盤，所述傳 感器是載體是傳感器組件900。根據(jù)另一個(gè)實(shí)施方案，緊固組件1380包括6個(gè)手 柄，例如手柄1380、 1384、 1386等。例如，夾鉗組件132將緊固組件1380置于面板1310上。在面板1310上，所 述的6個(gè)手柄與6個(gè)指狀體組件匹配。為松開支架板和傳感器載體，所述的6個(gè)指 狀體組件有執(zhí)行器驅(qū)動(dòng)。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述執(zhí)行器是電子執(zhí)行器。在另一個(gè) 實(shí)施方案中，所述執(zhí)行器是氣動(dòng)執(zhí)行器。例如，氣動(dòng)執(zhí)行器接收來(lái)自空氣調(diào)節(jié)器的 第一壓力的空氣，空氣調(diào)節(jié)器將第二壓力的空氣轉(zhuǎn)換為第一壓力的空氣。在另一個(gè) 實(shí)施例中，所述空氣是清潔的干空氣。如圖1-2所示，爐組件150可用于進(jìn)行雜交過(guò)程。例如，將一個(gè)或多個(gè)緊固組 件輸送入爐組件150并分別置于一個(gè)或多個(gè)面板上，其中每個(gè)緊固組件包括一塊支 架板和一個(gè)傳感器載體。然后關(guān)閉滑動(dòng)門1150并在一種或多種預(yù)定的條件下進(jìn)行 雜交過(guò)程。例如，所述一種或多種條件包括溫度范圍是48-52'C，例如48t，和例 如約等于16小時(shí)的處理時(shí)間。雜交過(guò)程完成后，打開滑動(dòng)門并由夾鉗組件132將 至少一個(gè)緊固組件從爐組件150移至松開夾鉗站160。傳感器載體在松開夾鉗站160 處與支架板分開。然后，夾鉗組件132將傳感器載體輸送至另一位置以進(jìn)行方法 1000的過(guò)程1010和其它過(guò)程。如上所述和這里進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)的，圖l-8僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的 范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。例如， 一個(gè)或多
個(gè)孔板可被一個(gè)或多個(gè)孔帶所替代，其中每個(gè)孔帶包括一條單行或一條單列。在另 一個(gè)實(shí)施例中， 一個(gè)或多個(gè)支架板可為一個(gè)或多個(gè)支架帶所替代，其中每個(gè)支架帶 包括一條單行或一條單列。在又一個(gè)實(shí)施例中，系統(tǒng)100的流體部件可包括一個(gè)或多個(gè)額外的孔板和/或一個(gè)或多個(gè)額外的支架板。如圖1-2所示，根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，系統(tǒng)100的流體部件包括多個(gè)用 于存放多塊板，例如孔板和/或支架板的槽。所述的多塊板可用于進(jìn)行各種構(gòu)型思 的方法1000。在某給定時(shí)間，被傳感器載體覆蓋的多塊板的數(shù)量視不同的應(yīng)用而 變。例如槽中沒有被傳感器載體覆蓋的板。在另一個(gè)實(shí)施例中，僅有爐組件150 外的板被傳感器載體所覆蓋。在還有的另一個(gè)實(shí)施例中，爐組件150外的多塊板被 傳感器載體所覆蓋。圖13顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100的簡(jiǎn)化結(jié) 構(gòu)。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人 員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。系統(tǒng)100包括用于存放各種類型的板的槽。 例如，槽1410是爐組件，如爐組件150的一部分。包括熱板組件，例如熱板組件 126的槽1420用于高嚴(yán)謹(jǐn)洗滌。槽1430用于存放支架板，例如雜交托盤。槽1440 用作松開夾鉗站，例如松開夾鉗站160。多個(gè)槽1450用于低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌。此外，槽 1460用于SAPE染色、槽1470用于AB染色，槽1480用于其它染色。槽1490用于存放傳感器載體，例如傳感器組件900。例如，夾鉗132將傳感 器載體從槽1490移至槽1430，并且傳感器載體在槽1430處夾住支架板。在另一 個(gè)實(shí)施例中，然后夾鉗132將傳感器載體和支架板移入爐組件的槽1410的至少一 個(gè)中。槽1492用于存放支架板，例如包括至少一個(gè)比色皿支架的掃描托盤。例如， 夾鉗132將傳感器載體移至槽1492，并且傳感器載體在槽1492處放在支架板上。此外，槽1494用于和另一系統(tǒng)進(jìn)行交接。例如，夾鉗132將一個(gè)或多個(gè)傳感 器移至槽1494。在另一個(gè)實(shí)施例中， 一個(gè)或多個(gè)傳感器從槽1494移至另一系統(tǒng)。 在一個(gè)實(shí)施方案中，所述另一系統(tǒng)是掃描系統(tǒng)。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述轉(zhuǎn)移是 手動(dòng)或自動(dòng)進(jìn)行。例如，使用者將一個(gè)或多個(gè)傳感器從槽1494移走。在另一個(gè)實(shí) 施例中， 一個(gè)或多個(gè)傳感器通過(guò)機(jī)械臂或加樣托盤從槽1494移走。在還又一個(gè)實(shí) 施例中， 一個(gè)或多個(gè)傳感器手動(dòng)或自動(dòng)從另一系統(tǒng)移至槽1494。在一個(gè)實(shí)施方案 中，所述另一系統(tǒng)是掃描系統(tǒng)。在另一個(gè)實(shí)施方案中，夾鉗132直接或間接地將一
個(gè)或多個(gè)傳感器從槽1494移至槽1492。此外，槽1496是用于額外處理的備用槽。圖14顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100的簡(jiǎn)化結(jié) 構(gòu)。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人 員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。系統(tǒng)100包括用于存放各種類型的板的槽。 例如，槽1510是爐組件，如爐組件150的一部分。包括熱板組件，例如熱板組件 126的槽1520用于高嚴(yán)謹(jǐn)洗漆。槽1530用于存放夾住傳感器載體的支架板。例如， 所述支架板是雜交托盤。在另一個(gè)實(shí)施例中，傳感器載體是傳感器組件900。此外， 槽1540用作松開夾鉗站，例如松開夾鉗站160。多個(gè)槽1550用于低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌。此 外，槽1560用于SAPE染色、槽1570用于AB染色，槽1580用于其它染色。槽 1592用于存放支架板，例如包括至少一個(gè)比色皿支架的掃描托盤。此外，槽1594用于和另一系統(tǒng)進(jìn)行交接。例如，夾鉗132將一個(gè)或多個(gè)傳感 器移至槽1494。在另一個(gè)實(shí)施例中， 一個(gè)或多個(gè)傳感器從槽1494移至另一系統(tǒng)。 在一個(gè)實(shí)施方案中，所述轉(zhuǎn)移是手動(dòng)或自動(dòng)進(jìn)行。例如，使用者將一個(gè)或多個(gè)傳感 器從槽1494移走。在另一個(gè)實(shí)施方案中， 一個(gè)或多個(gè)傳感器通過(guò)機(jī)械臂或加樣托 盤從槽1494移走。在又一個(gè)實(shí)施例中，所述另一系統(tǒng)是掃描系統(tǒng)。此外，槽1596 是用于額外處理的備用槽。如圖1-2和13-14所示，夾鉗組件132將一個(gè)或多個(gè)緊固組件輸送入爐組件 150并分別置于一個(gè)或多個(gè)面板上，其中每個(gè)緊固組件包括一塊支架板和一個(gè)傳感 器載體。然后關(guān)閉滑動(dòng)門1150并在一種或多種預(yù)定的條件下進(jìn)行雜交過(guò)程。雜交 過(guò)程完成后，打開滑動(dòng)門并由夾鉗組件132將至少一個(gè)緊固組件從爐組件150移至 松開夾鉗站160。傳感器載體在松開夾鉗站160處與支架板分開。然后，夾鉗組件 132將傳感器載體輸送至另一位置以進(jìn)行方法1000的過(guò)程1010和其它過(guò)程。在每一個(gè)用于低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌的過(guò)程1010、 1040和1060中，夾鉗組件132將傳 感器載體移至用于低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌的槽。在該槽內(nèi)，所述傳感器載體的一個(gè)或多個(gè)傳感 器的每一個(gè)在同一槽中孔板的孔中洗滌。然后，傳感器載體輸送至用于低嚴(yán)謹(jǐn)洗滌 的一個(gè)或多個(gè)額外的槽中。在用于高嚴(yán)謹(jǐn)洗滌的過(guò)程1020中，夾鉗組件132將傳感器載體移至熱板組件 126。例如，傳感器載體置于和傳導(dǎo)結(jié)構(gòu)316上的孔板接觸。在孔板上的每個(gè)孔中， 流體處于升高的溫度，對(duì)應(yīng)的傳感器與流體混合一段時(shí)間。 在用于SAPE染色的過(guò)程1030和1070中，夾鉗組件132將傳感器載體移至 用于SAPE染色的槽中。所述一個(gè)或多個(gè)傳感器中的每一個(gè)于室溫至少在一個(gè)孔中 染色。就每個(gè)孔而言，對(duì)應(yīng)的傳感器與流體混合一段時(shí)間。在用于AB染色的過(guò)程 1050中，夾鉗組件132將傳感器載體移至用于AB染色的槽中。所述一個(gè)或多個(gè) 傳感器中的每一個(gè)于室溫至少在一個(gè)孔中染色。就每個(gè)孔而言，對(duì)應(yīng)的傳感器與流 體混合一段時(shí)間。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，所述一個(gè)或多個(gè)傳感器移入、在其中移動(dòng)和/或 移出系統(tǒng)100受來(lái)自處理系統(tǒng)的由電子和機(jī)械部件所接收的指令控制。例如，所述 處理系統(tǒng)在系統(tǒng)100的外部。在另一個(gè)實(shí)施例中，所述處理系統(tǒng)是系統(tǒng)100的部件。 在一個(gè)實(shí)施方案中，所述處理系統(tǒng)包括計(jì)算機(jī)或處理器。例如，所述計(jì)算機(jī)或處理 器由代碼所指導(dǎo)。在另一個(gè)實(shí)施例中，所述計(jì)算機(jī)或處理器由計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品中計(jì) 算機(jī)可讀媒體包含的指令所指導(dǎo)。如上所述和這里要進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)的，根據(jù)本發(fā)明的某些實(shí)施方案，系統(tǒng)100可 用于處理隨時(shí)可掃描的生物傳感器，例如在過(guò)程1080之后。在一個(gè)實(shí)施方案中， 掃描處理過(guò)的生物傳感器的掃描儀可是各種類型的。例如，Axon制造的掃描儀。 或者，參見2005年1月27日提交的美國(guó)臨時(shí)申請(qǐng)系列號(hào)60/648,309和2005年4 月22日提交的60/673,969，每篇均納入本文作為參考。在又一個(gè)實(shí)施方案中，用 于掃描處理過(guò)的生物傳感器的掃描儀是如圖15(A)和(B)、圖16、圖17(A)-(G)和圖 18-20所示的掃描儀1600。圖15(A)和(B)顯示了與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng) IOO—起使用的簡(jiǎn)化掃描系統(tǒng)。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的 范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。掃描系統(tǒng)1600 包括加樣托盤1610。加樣托盤1610可延伸以接受孔板1620上的傳感器載體1630， 例如掃描托盤上的傳感器組件900。圖16顯示了可與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 —起 使用的掃描系統(tǒng)1600的簡(jiǎn)化內(nèi)部結(jié)構(gòu)。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán) 利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。圖17(A)-(G)顯示了可與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng) IOO—起使用的掃描系統(tǒng)1600的簡(jiǎn)化部件。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限
制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。如 圖17(A)-(G)所示，掃描系統(tǒng)1600包括內(nèi)構(gòu)架、XYZ臺(tái)、尖端/傾斜組件、光學(xué)模 塊、加樣托盤、電源、LED和其它部件。例如，圖17(A)顯示了內(nèi)構(gòu)架。在另一個(gè) 實(shí)施例中，圖17(B)顯示了內(nèi)構(gòu)架和XYZ臺(tái)。在又一個(gè)實(shí)施例中，圖17(C)顯示了 內(nèi)構(gòu)架、XYZ臺(tái)和尖端/傾斜組件。在還有一個(gè)實(shí)施例中，圖17(D)顯示了內(nèi)構(gòu)架、 XYZ臺(tái)、尖端/傾斜組件和光學(xué)模塊。在又一個(gè)實(shí)施例中，圖17(E)顯示了內(nèi)構(gòu)架、 XYZ臺(tái)、尖端/傾斜組件、光學(xué)模塊和未延伸的加樣托盤。在又一個(gè)實(shí)施例中，圖 17(F)顯示了內(nèi)構(gòu)架、XYZ臺(tái)、尖端/傾斜組件、光學(xué)模塊和延伸的加樣托盤。在又 一個(gè)實(shí)施例中，圖17(G)顯示了內(nèi)構(gòu)架、XYZ臺(tái)、尖端/傾斜組件、光學(xué)模塊、延 伸的加樣托盤、電源、LED和其它部件。圖18顯示了可與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 —起 使用的掃描系統(tǒng)1600的簡(jiǎn)化光學(xué)模塊。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán) 利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。例如， CCD照相機(jī)是Hamamatsu C8484-05G，具有CCD陣列大小是1024X 1344(6.5|im 像素)和12-位數(shù)字輸出。輸出特性包括讀噪聲12e-RMS和暗電流^-/像素/秒。此 外，CCD照相機(jī)具有約16000/12等于1300的動(dòng)態(tài)范圍。在另一個(gè)實(shí)施例中，光學(xué)設(shè)計(jì)包括以下特性'尼康10x， NA=0.40 FOV~lmmX 1.3mm，圖像像素大小二lpm ，激發(fā)LED 530nm+/-15nm .激發(fā)帶通濾波器470-550nm 3W激發(fā)LED.聚焦照明LED 5^nm+/-15nm *發(fā)射帶通濾波器570-610nm圖19顯示了可與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 —起 使用的掃描系統(tǒng)1600的簡(jiǎn)化尖端/傾斜組件。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限 制權(quán)利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。圖20顯示了可與本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的系統(tǒng)100 —起 使用的掃描系統(tǒng)1600的簡(jiǎn)化電子構(gòu)造。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)
利要求的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。如上所述和這里要進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)的，圖1-8和11-20僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制 權(quán)利要求,的范圍。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。例如， 圖21(A)、 (B)和(C)顯示了本發(fā)明一個(gè)實(shí)施方案中用于處理生物傳感器的具有掃描 系統(tǒng)的簡(jiǎn)化系統(tǒng)100。這些示意圖僅是例子，而不應(yīng)過(guò)分限制權(quán)利要求的范圍。本 領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可知曉許多變化、替代和改進(jìn)形式。系統(tǒng)100包括由機(jī)器人臂， 例如圖21(A)所示的纏繞臂2210或如圖21(A)所示的ORCA臂2220控制的夾鉗組 件。系統(tǒng)100可與掃描系統(tǒng)2200(例如掃描系統(tǒng)1600)—起裝配以形成整合系統(tǒng)。 如圖21(C)所示，如果系統(tǒng)100和掃描系統(tǒng)2200互相連接，系統(tǒng)100可自動(dòng)傳送 且掃描系統(tǒng)2200可自動(dòng)接收的孔板上的傳感器載體，例如掃描托盤上的傳感器組 件900。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案，處理生物傳感器的系統(tǒng)包括裝配支持流體部件 的支持部件。該流體部件包括至少一個(gè)第一容器和一個(gè)第二容器。第一容器可容納 第一體積的第一流體，第二容器可容納第二體積的第二流體。此外，系統(tǒng)包括裝配在第一傳感器和第二傳感器上進(jìn)行雜交過(guò)程的雜交部件。另外，系統(tǒng)包括裝配直接 或間接地將第一傳感器從雜交部件移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸的 傳送部件。傳送部件也還裝配為直接或間接地將第二傳感器從雜交部件移入第二容 器并與第二體積的第二流體接觸。傳送部件還裝配為基本上可同時(shí)移動(dòng)第一傳感器 和第二傳感器。例如，該系統(tǒng)可根據(jù)系統(tǒng)100實(shí)施。根據(jù)本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案，處理生物傳感器的系統(tǒng)包括裝配支持流體部 件的支持部件。流體部件包括至少一個(gè)第一容器和一個(gè)第二容器。第一容器可容納 第一體積的第一流體，第二容器可容納第二體積的第二流體。此外，系統(tǒng)包括裝配 為在第一傳感器和第二傳感器上，基于至少和預(yù)定溫度相關(guān)的信息進(jìn)行雜交過(guò)程的 雜交部件。另外，系統(tǒng)包括具有夾鉗和至少一個(gè)馬達(dá)的傳送部件。支持部件包括支 持至少第一容器和第二容器的抽屜，第一容器和第二容器相對(duì)于抽屜基本上是靜止 的。夾鉗可基本上同時(shí)夾住第一傳感器和第二傳感器并基本上同時(shí)松開第一傳感器 和第二傳感器。所述至少一個(gè)馬達(dá)裝配為將夾住的第一傳感器移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸，將夾住的第二傳感器移入第二容器并與第二體積的第二流 體接觸并可基本上同時(shí)移動(dòng)第一傳感器和第二傳感器。例如，該系統(tǒng)可根據(jù)系統(tǒng) 100實(shí)施。根據(jù)本發(fā)明還有的實(shí)施方案，處理生物傳感器的方法包括將第一傳感器和第 二傳感器轉(zhuǎn)移入處理生物傳感器的系統(tǒng)。該系統(tǒng)包括至少一個(gè)傳送部件、 一個(gè)雜交 部件和一個(gè)流體部件。傳送部件包括一個(gè)夾鉗,流體部件包括第一容器和第二容器。 第一容器容納第一體積的第一流體，第二容器容納第二體積的第二流體。此外，該 方法包括在轉(zhuǎn)移第一傳感器和第二傳感器之后，通過(guò)雜交部件在至少第一傳感器和 第二傳感器上進(jìn)行雜交過(guò)程。另外，該方法包括在雜交過(guò)程之后，直接或間接地將 第一傳感器從雜交部件移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸。該方法也包括 在雜交過(guò)程之后，直接或間接地將第二傳感器從雜交部件移入第二容器并與第二體 積的第二流體接觸。移動(dòng)第一傳感器和移動(dòng)第二傳感器至少由夾鉗進(jìn)行，移動(dòng)第一傳感器和移動(dòng)第二傳感器基本上同時(shí)進(jìn)行。例如，該系統(tǒng)可根據(jù)系統(tǒng)ioo實(shí)施。 本發(fā)明有許多優(yōu)點(diǎn)。本發(fā)明的某些實(shí)施方案提供自動(dòng)化的流體和雜交系統(tǒng)。 例如，該系統(tǒng)包括雜交爐組件并提供在雜交爐組件和該系統(tǒng)的其它部件之間自動(dòng)輸 送。在另一個(gè)實(shí)施方案中，該系統(tǒng)提供與掃描系統(tǒng)之間自動(dòng)地來(lái)回傳送。本發(fā)明的 一些實(shí)施方案提供了能進(jìn)行雜交、洗滌和染色的整合及自動(dòng)處理的系統(tǒng)。此外，聯(lián) 合掃描系統(tǒng)后，該系統(tǒng)也能進(jìn)行整合及自動(dòng)的掃描處理。本發(fā)明的某些實(shí)施方案可 提高雜交和流體系統(tǒng)的處理量。例如，可平行處理多個(gè)生物傳感器(如微陣列)。本 發(fā)明的一些實(shí)施方案可降低雜交和流體系統(tǒng)以及掃描系統(tǒng)的體積。本發(fā)明的某些實(shí) 施方案可減少在一個(gè)或多個(gè)生物傳感器上進(jìn)行的不同處理之間的交叉污染。例如， 在某個(gè)給定的處理中，不同的傳感器在不同的孔中洗滌、染色和/或儲(chǔ)存。在另一 個(gè)例子中，用于不同的處理的某給定傳感器分別在不同的孔中洗滌、染色和存放。 在又一個(gè)例子中，每個(gè)孔最多用于一次處理的最多一個(gè)傳感器，例如微陣列。雖然已描述了本發(fā)明的某些實(shí)施方案，本領(lǐng)域的技術(shù)人員應(yīng)該理解的是有與 所述實(shí)施方案等效的其它實(shí)施方案。因此，應(yīng)該理解的是本發(fā)明不受具體闡述的實(shí) 施方案的限制，而僅受限于附加的權(quán)利要求的范圍。
權(quán)利要求1.一種處理大量生物微陣列的系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括裝配為支持流體部件的支持部件，所述流體部件至少包括第一容器和第二容器，該第一容器可容納第一體積的第一流體，該第二容器可容納第二體積的第二流體；裝配為在第一傳感器和第二傳感器上進(jìn)行雜交過(guò)程的雜交部件；傳送部件，該傳送部件被裝配成直接或間接地將第一傳感器從雜交部件移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸；直接或間接地將第二傳感器從雜交部件移入第二容器并與第二體積的第二流體接觸；其中該傳送部件還裝配為基本上同時(shí)移動(dòng)第一傳感器和第二傳感器。
2. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述傳送部件還裝配為自動(dòng)地移動(dòng) 第一傳感器和第二傳感器。
3. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述雜交部件包括爐。
4. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述傳送部件還裝配為 將第一傳感器移入雜交部件，所述第一傳感器與第一雜交孔相連； 將第二傳感器移入雜交部件，所述第二傳感器與第二雜交孔相連。
5. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，還包括卸卡部件。
6. 如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述卸卡部件包括松開夾鉗站。
7. 如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述傳送部件還裝配為 將第一傳感器從雜交部件移入卸卡部件，所述第一傳感器與第一雜交孔相連; 將第二傳感器雜交部件移入卸卡部件，所述第二傳感器與第二雜交孔相連。
8. 如權(quán)利要求7所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述卸卡部件裝配為使第一傳感器 與第一雜交孔分離，使第二傳感器與第二雜交孔分離。
9. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述傳送部件還裝配為 將第一傳感器移至用于掃描的第一位置； 將第二傳感器移至用于掃描的第二位置。
10. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于當(dāng)所述第一傳感器在第一容器內(nèi)并與第一體積的第一流體接觸時(shí)，第一體積 的第一流體完全保持在第一容器內(nèi)；當(dāng)所述第二傳感器在第二容器內(nèi)并與第二體積的第二流體接觸時(shí)，第二體積 的第二流體完全保持在第二容器內(nèi)。
11. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一傳感器與第一支持元件 相連。
12. 如權(quán)利要求11所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一支持元件是栓釘。
13. 如權(quán)利要求11所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第二傳感器與第二支持元件 相連。
14. 如權(quán)利要求13所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述每個(gè)第一支持元件和第二支 持元件是一塊板的一部分。
15. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于第一傳感器與傳感器的長(zhǎng)度、傳感器的寬度和傳感器的厚度相關(guān)； 傳感器的長(zhǎng)度等于或短于10mm; 傳感器的寬度等于或狹于10mm; 傳感器的厚度等于或薄于1000pm。
16. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一傳感器是生物傳感器。
17. 如權(quán)利要求16所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述生物傳感器包括微陣列。
18. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一流體的第一體積等于或 小于5ml。
19. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一流體和第二流體種類相 同或不同。
20. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一體積和第二體積的大小 相同或不同。
21. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述每個(gè)第一容器和第二容器均 是孔。
22. 如權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一容器和第二容器是多個(gè) 容器中的兩個(gè)，所述多個(gè)容器直接或間接連接于共同部件。
23. 如權(quán)利要求22所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述多個(gè)容器排列為多行和多列。
24. —種用于處理大量生物微陣列的系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括裝配為支持流體部件的支持部件，所述流體部件至少包括第一容器和第二容 器，所述第一容器可容納第一體積的第一流體，所述第二容器可容納第二體積的第 二流體；裝配為基于至少與預(yù)定溫度相關(guān)的信息在第一傳感器和第二傳感器上進(jìn)行雜 交過(guò)程的雜交部件；包括夾鉗和至少一個(gè)馬達(dá)的傳送部件； 其中支持部件包括支持所述至少第一容器和第二容器的抽屜，所述第一容器和第 二容器相對(duì)于抽屜基本上靜止；夾鉗可基本上同時(shí)夾住所述第一傳感器和第二傳感器并基本上同時(shí)松開所述 第一傳感器和第二傳感器；所述至少一個(gè)馬達(dá)裝配為將夾住的第一傳感器移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸； 將夾住的第二傳感器移入第二容器并與第二體積的第二流體接觸； 基本上同時(shí)移動(dòng)第一傳感器和第二傳感器。
25. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述系統(tǒng)包括裝配檢測(cè)與所述第 一容器和第二容器相連的指示器的檢測(cè)器，所述指示器與預(yù)定的溫度相關(guān)。
26. 如權(quán)利要求25所述的系統(tǒng)，其特征在于， 所述指示器包括條形碼； 所述檢測(cè)器包括條形碼讀數(shù)器。
27. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述夾鉗還能將所述第一容器和 第二容器放于抽屜上和將所述第一容器和第二容器從抽屜上移開，
28. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述夾鉗還能將所述抽屜從第一 位置推至第二位置和將所述抽屜從第二位置拉回第一位置。
29. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于-所述至少一個(gè)馬達(dá)能以至少6個(gè)方向移動(dòng)夾住的第一傳感器；所述6個(gè)方向中的每一個(gè)均在所述6個(gè)方向中的另一個(gè)方向?qū)γ娌⒋怪庇谒?述6個(gè)方向中的4個(gè)方向；所述6個(gè)方向中的4個(gè)方向不同于另一個(gè)方向。
30. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于-所述支持部件包括與第二溫度相關(guān)的加熱物；所述加熱物包括裝配為加熱所述第一體積的第一流體和所述第二體積的第二 流體的加熱器；所述加熱物還包括裝配測(cè)量第一溫度的溫度計(jì)。
31. 如權(quán)利要求30所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述加熱物是一塊板。
32. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述系統(tǒng)還包括裝配與加熱器和溫度計(jì)耦聯(lián)并將第二溫度升高至預(yù)定值的溫度控制器。
33. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述傳送部件與處理系統(tǒng)耦聯(lián)，所述處理系統(tǒng)裝配為向傳送部件提供夾住、松開或移動(dòng)所述第一傳感器和第二傳感 器的指令。
34. 如權(quán)利要求33所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述處理系統(tǒng)包括計(jì)算機(jī)。
35. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述系統(tǒng)裝配為處理所述第一傳感器和第二傳感器從而使所述處理過(guò)的第一傳感器和第二傳感器隨時(shí)可用于掃描。
36. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于當(dāng)所述第一傳感器在第一容器內(nèi)并與第一體積的第一流體接觸時(shí)，第一體積 的第一流體完全保持在第一容器內(nèi)；當(dāng)所述第二傳感器在第二容器內(nèi)并與第二體積的第二流體接觸時(shí)，第二體積 的第二流體完全保持在第二容器內(nèi)。
37. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一傳感器與第一支持元件 相連。
38. 如權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一支持元件是栓釘。
39. 如權(quán)利要求37所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第二傳感器與第二支持元件 相連。
40. 如權(quán)利要求38所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一支持元件和第二支持元 件各自是板的一部分。
41. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于 第一傳感器與傳感器的長(zhǎng)度、傳感器的寬度和傳感器的厚度相關(guān)； 傳感器的長(zhǎng)度等于或短于10mm; 傳感器的寬度等于或狹于10mm; 傳感器的厚度等于或薄于1000pm。
42. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一傳感器是生物傳感器。
43. 如權(quán)利要求42所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述生物傳感器包括微陣列。
44. 如權(quán)利要求24所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述第一流體的第一體積等于或 小于5ml。
專利摘要一種處理生物傳感器的系統(tǒng)和方法。所述系統(tǒng)包括裝配為支持流體部件的支持部件。所述流體部件包括至少一個(gè)第一容器和一個(gè)第二容器。第一容器可容納第一體積的第一流體，第二容器可容納第二體積的第二流體。此外，該系統(tǒng)包括裝配為在第一傳感器和第二傳感器上進(jìn)行雜交過(guò)程的雜交部件。另外，該系統(tǒng)包括裝配為直接或間接地將第一傳感器從雜交部件移入第一容器并與第一體積的第一流體接觸的傳送部件。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK201040757SQ200620100050
公開日2008年3月26日 申請(qǐng)日期2006年4月6日 優(yōu)先權(quán)日2005年4月6日
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