專利名稱：Xbp1、cd138、和cs1肽的制作方法
XBP1、CD138、和 CS1 肽 關(guān)于聯(lián)邦政府資助的研究或開發(fā)的聲明本申請(qǐng)中描述的研究得到了資金No. P50-100707、P01-78378、和R01-50947的支 持，每項(xiàng)均來自(美國(guó))國(guó)立衛(wèi)生研究院。因此，政府對(duì)本發(fā)明具有某些權(quán)利。
背景技術(shù)：
多發(fā)性骨髓瘤和瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥 (Waldenstrom' smacroglobulinemia)是兩種血液學(xué)癌癥，每年在美國(guó)分別影響大約 45，000和1，500人。雖然這兩種病癥都常常使用例如單獨(dú)的或與骨髓移植組合的化療來治 療，但是罹患這些病癥之一的患者的預(yù)后通常較差。因此，迫切需要有效的治療和/或預(yù)防 方案。發(fā)明概述本公開內(nèi)容涉及免疫原性X-框蛋白1(XBP1)、CD138、和CD2子集I(CSl)衍生肽及 使用所述肽的方法。發(fā)現(xiàn)所述肽具有多種特性，包括例如升高的對(duì)HLA-A2分子的親和力、 升高的在HLA-A2的肽結(jié)合溝內(nèi)的穩(wěn)定性、及在MHC分子的環(huán)境中在細(xì)胞(例如癌細(xì)胞)的 表面上表達(dá)時(shí)誘導(dǎo)T細(xì)胞活化和增殖的能力。根據(jù)上述描述會(huì)顯然的是，所述肽(及其藥物組合物)可用于多種應(yīng)用，諸如用于 誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法、用于活化T細(xì)胞的方法、用于生成抗體的方法、及用于治療例如癌癥 (例如漿細(xì)胞癌癥，諸如多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥)的方法。此外，所 述肽可以包括在MHC分子多聚體組合物中，其可用于例如在一群細(xì)胞中檢測(cè)肽特異性T細(xì) 胞。一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種分離的肽，其由與SEQ ID N0:l-18任一至少 66 (例如至少 66，67，68，69，70，71，72，73，74，75，76，77，78，79，80，81，82，83，84，85，86， 87，88，89，90，91，92，93，94，95，96，97，98，或99) %相同的氨基酸序列組成，其中所述肽結(jié)
合主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子。所述肽可以結(jié)合主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子， 諸如MHC I類或II類分子。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種分離的肽，其由與SEQ ID N0:l-18任一至 少 66 (例如至少 66，67，68，69，70，71，72，73，74，75，76，77，78，79，80，81，82，83，84，85，86， 87，88，89，90，91，92，93，94，95，96，97，98，或99) %相同的氨基酸序列組成。所述肽可以在 與主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子結(jié)合時(shí)受到T細(xì)胞上抗原特異性T細(xì)胞受體識(shí)別。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種分離的肽，其包含由與SEQ IDNO :1_18任一 至少 66(例如至少 66，67，68，69，70，71，72，73，74，75，76，77，78，79，80，81，82，83，84，85， 86，87，88，89，90，91，92，93，94，95，96，97，98，或 99) % 相同的肽組成的第一氨基酸序列； 和與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種分離的肽，其由SEQ ID N0:l-18任一的氨基 酸序列組成，但是具有不超過四處替代。所述不超過四處替代可以是保守的或非保守的。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種分離的肽，其包含由SEQ IDNO :1_18任一組 成但是具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。所述不超過四處替代可以是保守的或非保守的。在一些實(shí)施方案中，本文中描述的任何分離的肽可以結(jié)合主要組織相容性復(fù)合物 (MHC)分子(例如MHC I類或II類分子)。所述MHC分子可以是例如HLA-A2分子。所述 MHC分子可以是例如人MHC分子。在一些實(shí)施方案中，本文中描述的任何分離的肽可以在與主要組織相容性復(fù)合物 (MHC)分子結(jié)合時(shí)受到T細(xì)胞上抗原特異性T細(xì)胞受體識(shí)別。在本文中描述的任何分離的肽的一些實(shí)施方案中，所述第二氨基酸序列可以包含 或者是靶向多肽、免疫刺激性分子、免疫球蛋白或其抗原結(jié)合片段、免疫球蛋白分子的Fc 受體結(jié)合區(qū)、或載體多肽。所述靶向多肽可以是例如將上述分離的肽靶向抗原呈遞細(xì)胞 (例如樹突細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、或B細(xì)胞)的靶向多肽。所述免疫刺激性分子可以是 例如細(xì)胞因子或T輔助者表位(T helper epitope)。所述免疫球蛋白可以是例如單鏈Fv 免疫球蛋白片段或整個(gè)免疫球蛋白分子。所述載體肽可以包含或者是KLH (匙孔i威血藍(lán)蛋 白)多肽。在一些實(shí)施方案中，本文中描述的任何分離的肽可以含有接頭序列。所述接頭序 列抗原連接第一氨基酸序列與第二氨基酸序列。所述接頭序列可以包含至少一個(gè)(例如1， 2，3，4，5，6，7，8，9，或10個(gè)或更多個(gè))蛋白酶切割位點(diǎn)或者由其組成。在本文中描述的任何分離的肽的一些實(shí)施方案中，所述第二氨基酸序列可以在所 述第一氨基酸序列的氨基端或羧基端。在一些實(shí)施方案中，本文中描述的任何分離的肽可以帶有可檢測(cè)的標(biāo)記。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為(i) 一種分離的核酸，其本文中描述的任何分離 的肽；(ii) 一種載體，其包含⑴的分離的核酸；或(iii) 一種培養(yǎng)細(xì)胞，其包含(ii)的載 體。所述載體可以可操作連接至表達(dá)控制序列。所述培養(yǎng)細(xì)胞可以是原核細(xì)胞或真核細(xì) 胞。所述培養(yǎng)細(xì)胞可以是例如真菌細(xì)胞、植物細(xì)胞、或動(dòng)物細(xì)胞(例如線蟲細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、 鳥細(xì)胞、魚細(xì)胞、或哺乳動(dòng)物細(xì)胞(例如人細(xì)胞))。所述培養(yǎng)細(xì)胞可以是免疫細(xì)胞諸如本文 中描述的任何免疫細(xì)胞。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種生產(chǎn)肽的方法。所述方法包括在允許所述肽 表達(dá)的條件下培養(yǎng)本文中描述的任何培養(yǎng)細(xì)胞的步驟。所述方法還可以包括自所述細(xì)胞或 自培養(yǎng)所述細(xì)胞的培養(yǎng)液分離所述肽的步驟。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種藥物組合物，其包含一種或多種本文中描述 的任何分離的肽和藥學(xué)可接受載體。所述組合物還可以包括例如一種或多種治療劑、診斷 劑、或預(yù)防劑、或免疫刺激劑。免疫刺激劑包括但不限于例如T輔助者表位、改變的肽配體、 佐劑、或本文中描述的任何其它免疫刺激劑。所述τ輔助者表位可以是例如PADRE序列或 通用破傷風(fēng)類毒素T輔助(TT Th)表位。所述佐劑可以選自下組弗氏完全佐劑、弗氏不完 全佐劑、明礬、Toll受體的配體、QS21、RIBI、霍亂毒素(CT)、大腸桿菌熱不穩(wěn)定毒素(LT)、 突變體CT(MCT)、和突變體大腸桿菌熱不穩(wěn)定毒素(MLT)。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種試劑盒，其包含(i) 一種或多種本文中描述 的任何分離的肽；和關(guān)于對(duì)受試者施用所述肽的用法說明；和/或(ii) 一種或多種編碼所 述分離的肽的分離的核酸、一種或多種含有所述分離的核酸的載體、或一種或多種含有所 述載體的培養(yǎng)細(xì)胞，和關(guān)于生成所述分離的肽的用法說明。
在一些實(shí)施方案中，所述試劑盒還可以包括例如一種或多種藥學(xué)可接受載體、一 種或多種免疫刺激劑、或一種或多種治療劑、診斷劑、或預(yù)防劑。所述一種或多種免疫刺激 劑可以選自下組T輔助者表位、改變的肽配體、和佐劑。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種制品，其包含容器；和裝在所述容器內(nèi)的組 合物，其中所述組合物包含用于在哺乳動(dòng)物中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的活性組分，其中所述活性組 分包含一種或多種本文中描述的任何分離的肽。所述容器可以有標(biāo)簽指明所述組合物用于 在哺乳動(dòng)物中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答。所述標(biāo)簽可以進(jìn)一步指明所述組合物要施用于具有、懷疑具 有、或有風(fēng)險(xiǎn)發(fā)生多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物。所述制品還 可以包括關(guān)于對(duì)所述哺乳動(dòng)物施用所述組合物的用法說明。所述組合物可以是例如在溶液 中、為干燥的、或凍干的。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于在受試者中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法，該方 法包括對(duì)受試者投遞一種或多種(例如1,2, 3,4, 5,6, 7,8,9,10，11，12，13，14，15，16，17， 或18種)本文中描述的任何分離的肽的步驟。所述方法還可以包括在對(duì)所述受試者投遞 所述一種或多種肽后確定所述受試者中是否發(fā)生免疫應(yīng)答的步驟?？梢詫⑺鲆环N或多種 肽作為藥物組合物對(duì)所述受試者投遞。所述受試者可以是例如哺乳動(dòng)物(例如人)或本文 中描述的任何其它受試者。所述受試者可以具有、懷疑具有、有風(fēng)險(xiǎn)發(fā)生多發(fā)性骨髓瘤或瓦 爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥、或處于多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥好轉(zhuǎn)期 (remission)0在一些實(shí)施方案中，所述方法可以包括確定所述受試者的多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登 斯特倫氏巨球蛋白血癥的一個(gè)或多個(gè)漿細(xì)胞是否表達(dá)XBP1、⑶138、或CS1。在一些實(shí)施方案中，所述方法可以包括對(duì)所述受試者施用一種或多種化療 劑、一種或多種形式的電離輻射、或一種或多種免疫治療劑。所述一種或多種形式的 電離輻射可以是例如伽馬輻照、X輻照、或貝塔輻照。所述一種或多種化療劑可以選 自下組順鉬(cisplatin)、卡鉬(carboplatin)、丙卡巴胼(procarbazine)、雙氯乙 基甲胺(mechlorethamine)、環(huán)憐酉先胺(cyclophosphamide)、喜樹喊(camptothecin)、 阿霉素(adriamycin)、異環(huán)磷酰胺(ifosfamide)、美法侖(melphalan)、苯丁酸 氮芥(chlorambucil)、白消安(bisulfan)、亞硝基脲(nitrosurea)、放線菌素 D (dactinomycin)、柔紅霄素(daunorubicin)、多柔比星(doxorubicin)、博來霄素 (bleomycin)、普卡霄素(plicomycin)、絲裂霄素(mitomycin)、依托泊昔(etoposide)、 verampil、鬼曰毒素(podophyllotoxin)、泰素(taxol)、反鉬(transplatinum)、5-氟 尿嘧啶(5-f lurouracil)、長(zhǎng)春新堿(vincristin)、長(zhǎng)春堿(vinblastin)、甲氨蝶呤 (methotrexate)、和上述任一的類似物。所述方法還可以包括對(duì)所述受試者施用一種或多 種免疫刺激劑。在一些實(shí)施方案中，所述投遞包括對(duì)所述受試者施用所述一種或多種肽。在一些 實(shí)施方案中，所述投遞包括對(duì)所述受試者施用一種或多種核酸，其每一種包含編碼所述一 種或多種肽的核苷酸序列，所述核苷酸序列可操作連接至表達(dá)控制序列。所述核酸可以在 經(jīng)所述核酸轉(zhuǎn)染且表達(dá)所述一種或多種肽的重組細(xì)胞中。所述重組細(xì)胞可以是通過轉(zhuǎn)染自 所述受試者獲得的細(xì)胞得到的經(jīng)轉(zhuǎn)染細(xì)胞或其后代。所述重組細(xì)胞可以是抗原呈遞細(xì)胞， 諸如但不限于樹突細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、或B細(xì)胞。
在上文描述的任何方法的一些實(shí)施方案中，所述投遞包括使所述一種或多種肽 接觸細(xì)胞；并在使所述一種或多種肽接觸所述細(xì)胞后，對(duì)所述受試者投遞所述細(xì)胞。所述 細(xì)胞可以是例如抗原呈遞細(xì)胞，諸如本文中描述的任何抗原呈遞細(xì)胞。所述細(xì)胞可以是例 如自所述受試者獲得的細(xì)胞或其后代。在一些實(shí)施方案中，所述細(xì)胞可以是自與所述受試 者同一物種的另一受試者獲得的細(xì)胞或其后代。所述另一受試者可以表達(dá)至少一種與所述 受試者共同的MHC分子。所述至少一種MHC分子可以是例如MHC I類分子，諸如HLA-A2分 子。在一些實(shí)施方案中，所述方法還可以包括在對(duì)所述受試者施用所述一種或多種肽 前，自所述受試者獲得包含一個(gè)或多個(gè)造血干細(xì)胞的一群細(xì)胞。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于治療多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨 球蛋白血癥的方法。所述方法包括對(duì)受試者施用一種或多種(例如1，2，3，4，5，6，7，8，9， 10，11，12，13，14，15，16，17，或18種)本文中描述的任何肽的步驟，其中所述受試者具有或 有風(fēng)險(xiǎn)發(fā)生多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于為需要治療的哺乳動(dòng)物選擇療法的方 法。所述方法包括下述步驟確定哺乳動(dòng)物中的癌癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞是否表達(dá)XBP1， 其中所述癌癥是多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥；并若一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表 達(dá)XBP1，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) —種分離的肽， 其由與SEQ ID NO :1-10任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)—種分離的肽，其由SEQ IDNO 1-10任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替代；(c) 一種分離的肽，其包含⑴ 由SEQ ID NO :1-10任一組成，具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨 基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d) —種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO 1-10 任一至少66%相同的氨基酸序列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源 的第二氨基酸序列。所述方法還可以包括在確定所述癌癥的一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞表達(dá)XBPl后， 對(duì)所述受試者投遞所述選定的一種或多種肽的步驟。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于為具有癌癥的哺乳動(dòng)物選擇療法的方 法。所述方法包括下述步驟確定哺乳動(dòng)物中的癌癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞是否表達(dá)CD138， 其中所述癌癥是多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥；并若一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表 達(dá)CD138，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) —種分離的 肽，其由與SEQ ID N0:ll-14任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b) —種分離的肽，其 由SEQ IDNO :11_14任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替代；和(c) 一種分離的肽，其 包含(i)由SEQ ID NO :11-14任一組成，具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和(ii) 與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d) —種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :11-14任一至少66%相同的氨基酸序列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸 序列異源的第二氨基酸序列。所述方法還可以包括在確定所述癌癥的一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞表達(dá) CD138后，對(duì)所述受試者投遞所述一種或多種肽的步驟。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于為需要治療的哺乳動(dòng)物選擇療法的方 法。所述方法包括確定哺乳動(dòng)物中的癌癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞是否表達(dá)CS1，其中所述癌 癥是多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥；并若一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CS1，則 選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) —種分離的肽，其由與SEQID NO 15-18任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b) —種分離的肽，其由SEQ ID NO 15-18任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替代；(c) 一種分離的肽，其包含(i)由 SEQID NO :15-18任一組成，具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸 序列異源的第二氨基酸序列；和(d) —種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :15-18任 一至少66%相同的氨基酸序列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的 第二氨基酸序列。所述方法還可以包括在確定所述癌癥的一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞表達(dá)CSl后，對(duì) 所述受試者投遞所述選定的一種或多種肽的步驟。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于為具有多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏 巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物選擇治療劑的方法。所述方法包括下述步驟，若哺乳動(dòng)物的多發(fā) 性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)XBP1，則選擇一種或多 種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) —種分離的肽，其由與SEQ ID NO=I-IO 任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b) —種分離的肽，其由SEQ ID NO :1-10任一的氨 基酸序列組成，具有不超過四處替代；和(c) 一種分離的肽，其包含⑴由SEQ ID NO 1-10 任一組成，具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二 氨基酸序列；和(d) 一種分離的肽，其包含⑴由與SEQ ID NO 1-10任一至少66%相同 的氨基酸序列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于為具有多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏 巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物選擇治療劑的方法，該方法包括下述步驟，若哺乳動(dòng)物的多發(fā)性 骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CD138，則選擇一種或多 種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) —種分離的肽，其由與SEQ ID NO 11-14 任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b) —種分離的肽，其由SEQ ID NO :11-14任一的 氨基酸序列組成，具有不超過四處替代；和(c) 一種分離的肽，其包含(i)由SEQ IDNO 11-14任一組成，具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源 的第二氨基酸序列；和(d) —種分離的肽，其包含(i)由與SEQID NO :11-14任一至少66% 相同的氨基酸序列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸 序列。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于為具有多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏 巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物選擇治療劑的方法，該方法包括下述步驟，若哺乳動(dòng)物的多發(fā)性 骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CS1，則選擇一種或多種 選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) —種分離的肽，其由與SEQ ID NO :15-18任 一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b) —種分離的肽，其由SEQ ID NO :15-18任一的氨基 酸序列組成，具有不超過四處替代；和(c) 一種分離的肽，其包含⑴由SEQ ID NO :15-18 任一組成，具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二 氨基酸序列；和⑷一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ IDNO 15-18任一至少66%相同 的氨基酸序列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。在上文任何方法的一些實(shí)施方案中，所述受試者或哺乳動(dòng)物可以是接受過針對(duì)多 發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的療法，而且對(duì)所述療法沒有響應(yīng)的受試者或 哺乳動(dòng)物。另一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種用于在哺乳動(dòng)物中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法。所述方法包括對(duì)受試者施用經(jīng)一種或多種(例如1,2, 3,4, 5,6, 7,8,9,10，11，12，13，14，15， 16，17，或18種)本文中描述的任何肽接觸的免疫細(xì)胞或其后代的步驟。所述方法可以包 括使所述免疫細(xì)胞接觸所述一種或多種肽。所述免疫細(xì)胞可以是例如T細(xì)胞。所述T細(xì)胞 可以在抗原呈遞細(xì)胞存在下經(jīng)所述一種或多種肽接觸。在一些實(shí)施方案中，所述方法還可以包括在接觸前獲得所述免疫細(xì)胞的步驟。所 述免疫細(xì)胞可以是自所述受試者或自所述受試者同一物種的另一受試者獲得的。在一些實(shí)施方案中(例如在所述細(xì)胞是自另一受試者獲得的實(shí)施方案中)，所述 免疫細(xì)胞表達(dá)至少一種與所述受試者共同的MHC分子。所述至少一種MHC分子可以是例如 MHC I類分子，諸如HLA-A2分子。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種組合物，其包含(i) 一種或多種本文中描述 的任何肽和(ii)主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子多聚體，其中所述多聚體包含兩個(gè)或更 多個(gè)(例如2，3，4，5，6，7，8，9，或10或更多個(gè))MHC分子之肽結(jié)合區(qū)。在一些實(shí)施方案中， 每一個(gè)肽結(jié)合區(qū)有(i)結(jié)合它。在一些實(shí)施方案中，每一個(gè)肽結(jié)合區(qū)有(i)非共價(jià)或共價(jià) 結(jié)合它。所述MHC分子多聚體可以包含兩個(gè)或更多個(gè)(例如2，3，4，5，6，7，8，9，或10或更 多個(gè))整個(gè)MHC分子。所述MHC分子多聚體可以包含人MHC分子。所述MHC分子多聚體可 以包含MHC I類分子，諸如HLA-A2分子。在一些實(shí)施方案中，所述組合物可以包含至少兩種或更多種(例如2，3，4，5，6，7， 8，9，或10或更多種)所述肽。在一些實(shí)施方案中，所述兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)可以來自相同MHC分子。在一些 實(shí)施方案中，所述兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)來自不同MHC分子MHC分子。在一些實(shí)施方案中， 所述兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)可以是至少兩個(gè)(例如2，3，4，5，6，7，8，9，或10更多個(gè))來自 相同MHC分子的區(qū)和至少一個(gè)(例如1，2，3，4，5，6，7，8，9，或10或更多個(gè))來自不同MHC 分子的區(qū)的混合物。在一些實(shí)施方案中，所述MHC分子多聚體能夠結(jié)合所述一種或多種肽中的至少一 種。在一些實(shí)施方案中，所述組合物可以帶有可檢測(cè)的標(biāo)記。例如，一種或多種所述肽 和/或一種或多種所述肽結(jié)合區(qū)可以帶有可檢測(cè)的標(biāo)記。在一些實(shí)施方案中，所述一種或 多種MHC分子多聚體中至少一種或所述一種或多種肽中至少一種是可操作標(biāo)記的。又一方面，本公開內(nèi)容的特征為一種試劑盒，其包含一種組合物，該組合物包含 一種或多種主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子多聚體，其中每個(gè)多聚體包含MHC分子的兩 個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)；和一種或多種本文中描述的任何肽。所述試劑盒還可以包括關(guān)于 使所述組合物接觸細(xì)胞的用法說明、關(guān)于可檢測(cè)標(biāo)記所述一種或多種MHC分子多聚體之一 或所述一種或多種肽之一的用法說明；一種或多種可檢測(cè)標(biāo)記物；和/或關(guān)于檢測(cè)所述一 種或多種可檢測(cè)標(biāo)記物中至少一種的用法說明。所述一種或多種可檢測(cè)標(biāo)記物可以選自下 組發(fā)光標(biāo)記物、熒光標(biāo)記物、放射性標(biāo)記物、和酶標(biāo)記物。除非另有定義，本文中使用的所有技術(shù)和科學(xué)術(shù)語具有與本發(fā)明所屬領(lǐng)域普通技 術(shù)人員普通理解相同的含義。若有沖突，以本文件(包括定義)為準(zhǔn)。下文描述了優(yōu)選的 方法和材料，盡管與本文中描述的方法和材料相似或等同的方法和材料也可以用于實(shí)施或 檢驗(yàn)本發(fā)明。通過述及完整收錄本文中提到的所有出版物、專利申請(qǐng)和其它參考文獻(xiàn)。本文中公開的材料、方法、和實(shí)施例只是例示性的，而非意圖限制。根據(jù)上述描述、根據(jù)附圖及根據(jù)權(quán)利要求，本發(fā)明的其它特征和優(yōu)點(diǎn)(例如用于 在受試者中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法)會(huì)是顯而易見的。附圖簡(jiǎn)述

圖1是一幅柱狀圖，描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的XBPl肽對(duì)人T2細(xì)胞表面上HLA-A2 分子的親和力。Y軸代表均值熒光強(qiáng)度，而X軸代表測(cè)定法中篩選的各種肽 XBPl11H25 (LLREKTHGL (SEQ ID NO 1) ；XBP1#1 肽)，XBP1W4_192 (NISPWILAV (SEQ ID NO 2)； XBPl#2 肽)，XBPl189^197 (ILAVLTLQI (SEQ IDNO 3) ；XBP1#3 肽)，XBPl192^200 (ILAVLTLQI (SEQ ID NO 4) ；XBP1#4 肽)，XBP1110_118 (KLLLENQLL (SEQ ID NO 5) ；XBP1#5 肽)，禾口 XBPl93^101 (RMSELEQQV (SEQ ID NO 27) ；XBP1#6 肽)。還評(píng)估了 流感病毒蛋白基質(zhì)肽 58_66(GILGFVFTL(SEQ ID NO 24))作為對(duì)照。圖2是一幅柱狀圖，其描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的XBPl肽(XBP1184_192(NISPWILAV(XBP12N ； SEQ ID NO :2))和 YISPWILAV(XBP12M ;SEQ IDNO :6))在人 T2 細(xì)胞表面上 HLA-A2 分子溝內(nèi) 的穩(wěn)定性。還評(píng)估了流感病毒蛋白基質(zhì)肽58-66 (GILGFVFTL(SEQ ID NO :24))作為對(duì)照。Y軸 代表均值熒光強(qiáng)度，而X軸代表測(cè)量肽穩(wěn)定性的時(shí)間間隔。圖3是一幅柱狀圖，其描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的XBPl肽對(duì)人T2細(xì)胞表面上HLA-A2 分子的親和力。Y軸代表均值熒光強(qiáng)度，而X軸代表測(cè)定法中篩選的各種肽天然 XBPl196-204 (GILDNLDPV(SEQ ID NO :7) ；XBPlSP#lp)禾Π ΧΒΡ1367_375 (ELFPQLISV(SEQ ID NO: 9) ；XBPlSP#3p) ο 還評(píng)估了流感病毒蛋白基質(zhì)肽58_66(GILGFVFTL(SEQ ID NO :24) ；"Inf. v. p.，，))作為對(duì)照。圖4是一幅柱狀圖，其描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的XBPl肽(XBP1 SP IN(GILDNLDPV ；SEQ ID NO 7) ；XPBlSP 3N(ELFPQLISV ；SEQ ID NO 9)禾口XBPlSP 3M(YLFPQLISV SEQ ID NO :10))在 人T2細(xì)胞表面上HLA-A2分子溝內(nèi)的穩(wěn)定性。Y軸代表均值熒光強(qiáng)度，而X軸代表測(cè)量肽穩(wěn) 定性的時(shí)間間隔。圖5是一系列一維熒光流式細(xì)胞術(shù)(FFC)柱狀圖，其描繪一群混合的人淋巴細(xì)胞 中⑶4+和⑶8+T淋巴細(xì)胞的百分比。細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞(CTL)群或是不刺激(unstim)， 或是用XBPl2M(XBP12M-CTL)或XBP-1S3M(上文)之一刺激。還評(píng)估了流感病毒蛋白基質(zhì) Ι 58_66(GILGFVFTL(SEQ ID NO 24) ；"Inf. ν· ρ· ”)作為對(duì)照。每幅柱狀圖的Y軸指示細(xì)胞 數(shù)，而X軸代表結(jié)合細(xì)胞表面CD4抗原(左欄)或CD8抗原(右欄)的熒光團(tuán)標(biāo)記的特異 性抗體的熒光強(qiáng)度。標(biāo)示了門內(nèi)細(xì)胞的所示百分比。圖6是一系列二維FFC柱狀圖，其描繪一群淋巴細(xì)胞中用XBPl肽ΧΒΡ12Μ或 ΧΒΡ13Μ刺激后⑶69+/⑶45R0+或⑶45RA+/CCR7+細(xì)胞的百分比。每幅點(diǎn)圖的Y軸指示結(jié)合 細(xì)胞表面CD69抗原(左欄)或CD45RA抗原(右欄)的熒光團(tuán)標(biāo)記的特異性抗體的熒光強(qiáng) 度，而每幅點(diǎn)圖的X軸指示結(jié)合細(xì)胞表面CD45R0抗原(左欄)或CCR7抗原(右欄)的熒 光團(tuán)標(biāo)記的特異性抗體的熒光強(qiáng)度。標(biāo)示了點(diǎn)圖右上象限中的細(xì)胞的所示百分比。圖7是一幅柱狀圖，其描繪來自與多發(fā)性骨髓瘤(MM)McCAR細(xì)胞和匪IS細(xì)胞和急 性髓性白血病(AML)ML-2細(xì)胞一起共培養(yǎng)的XBPl-CTL (XBP12M-CTL和XBPlSP 3M-CTL)的 IFN- y (干擾素-γ )釋放。Y軸代表以pg/mL為單位的自含CTL的細(xì)胞釋放的IFN- γ量。圖8是一系列二維FFC柱狀圖，其描繪與匪或AML細(xì)胞一起共培養(yǎng)后XBPl-CTL (XBP12M-CTL和XBPl-SP 3M CTL)的增殖。Y軸代表群體中每種細(xì)胞的數(shù)目，而X 軸代表細(xì)胞中羧基熒光素琥珀酰亞氨基酯(CFSE)的量。圖9和10是一對(duì)線圖，其描繪通過鈣熒光素(calcein)釋放測(cè)定法測(cè)定的 XBPl-CTL依賴性癌細(xì)胞裂解。將XBP1-2M特異性CTL(圖9)或XBP1-SP-3M-CTL (圖10)與 U266癌細(xì)胞、McCaAR癌細(xì)胞、ML-2癌細(xì)胞、或匪IS癌細(xì)胞中每一種一起共培養(yǎng)，并作為自 癌細(xì)胞釋放的鈣熒光素量的函數(shù)來計(jì)算CTL的癌細(xì)胞裂解量。Y軸代表靶細(xì)胞的百分比特 異性裂解，而X軸代表CTL對(duì)癌細(xì)胞的比(效應(yīng)細(xì)胞對(duì)靶細(xì)胞比)(1 1,10 1,20 1， 或 60 1)。圖11是一幅柱狀圖，其描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的⑶138肽對(duì)人T2細(xì)胞表面上 HLA-A2分子的親和力。Y軸代表均值熒光強(qiáng)度，而X軸指示測(cè)定法中篩選的各種肽: CD138256-264(VIAGGLVGL ;CD138#lp(SEQ ID NO 11)) ；CD138260-268(GLVGLIFAV ； CD138#2p(SEQ ID NO 12)) ；CD1385-13(ALWLWLCAL ；CD138#3p(SEQ ID NO :13));和 CD1387-15(WLWLCALAL ;CD138#3p(SEQ ID NO :14))。還評(píng)估了 流感病毒蛋白基質(zhì)肽 58-66 (GILGFVFTL(SEQ ID NO :24) ；"Inf. v. p. ”)作為對(duì)照。圖12是一幅柱狀圖，其描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的⑶138#2肽在人T2細(xì)胞表面上HLA-A2 分子溝內(nèi)的穩(wěn)定性(與流感病毒蛋白基質(zhì)肽58_66(GILGFVFTL(SEQID NO :24) ；"Inf. v. p.“) 比較)。Y軸代表均值熒光強(qiáng)度，而X軸代表其中測(cè)量肽穩(wěn)定性的時(shí)間間隔。圖13是一系列一維FFC柱狀圖，其描繪群體中⑶4+和⑶8+T淋巴細(xì)胞的百分比。 CTL群或是不刺激(unstim)，或是用⑶138#2肽刺激(⑶138-CTL)。每幅柱狀圖的Y軸代表 細(xì)胞數(shù)，而X軸代表結(jié)合細(xì)胞表面CD40抗原(左欄)或CD8抗原(右欄)的熒光團(tuán)標(biāo)記的 特異性抗體的熒光強(qiáng)度。圖14是一系列二維FFC柱狀圖，其描繪一群淋巴細(xì)胞中用⑶138#2肽刺激后 CD69+/CD45R0+或CD45RA+/CCR7+細(xì)胞的百分比。CTL群或是不刺激(unstim)，或是用 CD138#2肽刺激(CD138-CTL)。每幅點(diǎn)圖的X軸(FL-I)代表結(jié)合細(xì)胞表面CD69抗原(左 欄)或CD45RA抗原(右欄)的熒光團(tuán)標(biāo)記的特異性抗體的熒光強(qiáng)度，而每幅點(diǎn)圖的Y軸 (FL-2)描繪結(jié)合細(xì)胞表面CD45R0抗原(左欄)或CCR7抗原(右欄)的熒光團(tuán)標(biāo)記的特異 性抗體的熒光強(qiáng)度。標(biāo)示了點(diǎn)圖右上象限中的細(xì)胞的所示百分比。圖15是一幅柱狀圖，其描繪與多發(fā)性骨髓瘤(MM)McCAR細(xì)胞(⑶138+/HLA-A2+)、 MMlS 細(xì)胞(CD138+/HLA-A2_)、或急性髓性白血病(AML)ML-2 細(xì)胞(CD138_/HLA-A2_) —起共 培養(yǎng)的⑶138-CTL的IFN- γ釋放。Y軸代表以pg/mL為單位的自CTL釋放的IFN- γ量， 而X軸指示用作刺激細(xì)胞的癌細(xì)胞。通過測(cè)量用腫瘤細(xì)胞系刺激過夜后對(duì)IFN-γ分泌的 誘導(dǎo)來確定⑶138-CTL的抗原特異性和HLA-A2限制。圖16是一系列一維FFC柱狀圖，其描繪與McCAR、ML_2、或匪IS癌細(xì)胞一起共培 養(yǎng)后⑶138-CTL (⑶138#2p-CTL)的增殖。Y軸代表群體中每種細(xì)胞的數(shù)目，而X軸代表細(xì)胞 中羧基熒光素琥珀酰亞氨基酯(CFSE)的量。標(biāo)示了點(diǎn)圖右上象限中細(xì)胞的所示百分比。圖17是一幅線圖，其描繪通過鈣熒光素釋放測(cè)定法測(cè)定的CD138-CTL依賴性癌 細(xì)胞裂解。將⑶138#2p特異性CTL與癌細(xì)胞似66、ML-2、或MMlS細(xì)胞中每一種一起共培 養(yǎng)，并作為自癌細(xì)胞釋放的鈣熒光素量的函數(shù)來計(jì)算CTL的癌細(xì)胞裂解量。Y軸代表靶細(xì)胞 的百分比特異性裂解，而X代表CTL對(duì)癌細(xì)胞的比(效靶比)(1 1,10 1,20 1，或60 1)。圖18A和18B是一系列二維FFC柱狀圖，其描繪通過⑶107測(cè)定法測(cè)定的 ⑶138-CTL依賴性癌細(xì)胞裂解。每幅點(diǎn)圖的X軸代表FITC偶聯(lián)的特異性結(jié)合⑶107a和 CD107b的抗體的熒光強(qiáng)度，而Y軸代表PE偶聯(lián)的特異性結(jié)合CD8的抗體的熒光強(qiáng)度。圖 18A顯示以不同比(效靶比)(5 1,1 1，或1 5) CTL對(duì)經(jīng)⑶138肽脈沖的T2細(xì)胞 或經(jīng)無關(guān)MAGE3肽脈沖的T2細(xì)胞的裂解。圖18B展示以CTL對(duì)McCAR細(xì)胞比(效應(yīng) 靶)(1 1) CTL對(duì)經(jīng)CD138肽脈沖的McCAR細(xì)胞或經(jīng)無關(guān)MAGE3肽脈沖的McCAR (CD138+/ HLA-A2+)細(xì)胞的裂解。標(biāo)示了點(diǎn)圖右上象限中的細(xì)胞的所示百分比。圖19是一幅柱狀圖，其描繪多份多發(fā)性骨髓瘤癌細(xì)胞樣品中每一份的CSlmRNA相 對(duì)表達(dá)(Y軸)。每份樣品是自具有多發(fā)性骨髓瘤的不同人患者獲得的。圖20是一幅柱狀圖，其描繪熒光團(tuán)標(biāo)記的CSl肽對(duì)人T2細(xì)胞 上HLA-A2分子的親和力。X軸代表均值熒光強(qiáng)度，而Y軸指示測(cè)定法中篩 選的各種肽CSl-Pl :CS1236-245 (LLLSLFVLGL(SEQ ID NO 15)) ；CS1-P2 CS1239-247(SLFVLGLFL(SEQ ID NO 16)) ；CS1-P3 :CS1232-240(LLVPLLLSL(SEQ IDNO 17))；和 CS1-P4 :CS19-17(TLIYILWQL(SEQ ID N0:18))。還評(píng)估了 流感病毒蛋白基質(zhì)肽 58-66 (GILGFVFTL(SEQ ID NO 24)；“流感基質(zhì) 58-66”)作為對(duì)照。圖21是一幅線圖，其描繪通過胸苷摻入測(cè)定法測(cè)定的與呈遞CS1-P2肽的人T2細(xì) 胞接觸的CS1-P2-CTL的增殖(“P2-T2” )。Y軸代表摻入正在分裂的細(xì)胞的3H-胸苷每分 鐘計(jì)數(shù)(CPM)，而X軸代表含CTL的細(xì)胞與T2細(xì)胞一起培養(yǎng)的小時(shí)數(shù)。圖22是一幅柱狀圖，其描繪來自分別與呈遞CS1-P1、CS1-P2、CS1-P3、或CS1-P4 肽的 T2 細(xì)胞一起共培養(yǎng)的 CSl-CTL 的 IFN- γ 釋放(Pl-CTL、P2-CTL、P3-CTL、和 P4-CTL)。 Y軸代表以pg/mL為單位的自CTL釋放的IFN- γ量。圖23是一幅柱狀圖，其描繪通過鈣熒光素釋放測(cè)定法測(cè)定的CSl-CTL依賴性癌細(xì) 胞裂解。將P2-CTL與癌細(xì)胞U266、McCAR、ML-2、或MMlS細(xì)胞中每一種一起共培養(yǎng)，并作為 自癌細(xì)胞釋放的鈣熒光素量的函數(shù)來計(jì)算由CSl-CTL誘導(dǎo)的癌細(xì)胞裂解量。Y軸代表百分 比細(xì)胞毒性。發(fā)明詳述本公開內(nèi)容的特征為免疫原性XBP1、⑶138、和CSl衍生肽(及其藥物組合物)，其 可用于例如在受試者中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答(例如刺激CTL應(yīng)答)或刺激抗體生成。所述肽可用 于多種應(yīng)用，諸如用于誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法、用于生成抗體的方法、及用于治療癌癥(例如 漿細(xì)胞病癥，諸如多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥)的方法。所述肽還可以 包括在MHC分子多聚體組合物中及在例如用于在一群細(xì)胞中檢測(cè)T細(xì)胞的方法中使用。下文給出了所述肽以及用于制備和使用所述肽的例示方法的詳細(xì)描述。Jt本公開內(nèi)容的特征為分離的肽，其由與表1中所示SEQ ID NO :1_18任一至少66% (例如 66 %，67 %，68 %，69 %，70 %，71 %，72 %，73 %，74 %，75 %，76 %，77 %，78 %，79 %， 80 %，81 %，82 %，83 %，84 %，85 %，86 %，87 %，88 %，89 %，或 90 % 或更多)相同的氨基酸 序列組成，或基本上由其組成。表 1.
權(quán)利要求
1.一種分離的肽，其由與SEQ ID NO :1-18任一至少66%相同的氨基酸序列組成，其中 所述肽結(jié)合主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子。
2.一種分離的肽，其由與SEQ ID NO :1-18任一至少66%相同的氨基酸序列組成，其中 所述肽在與主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子結(jié)合時(shí)受到T細(xì)胞上抗原特異性T細(xì)胞受體 識(shí)別。
3.一種分離的肽，其包含由與SEQ ID NO 1-18任一至少66%相同的肽組成的第一氨基酸序列；和與第一氨基 酸序列異源的第二氨基酸序列。
4.一種分離的肽，其由SEQ ID NO: 1-18任一的氨基酸序列組成，但是具有不超過四處替代。
5.一種分離的肽，其包含由SEQ ID NO 1-18任一組成但是具有不超過四處替代的第一氨基酸序列；和與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
6.權(quán)利要求4或5的分離的肽，其中所述不超過四處替代中至少一處是保守替代。
7.權(quán)利要求3-6任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述肽結(jié)合主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子。
8.權(quán)利要求1、2、或7的分離的肽，其中所述MHC分子是人MHC分子。
9.權(quán)利要求1或3-7任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述肽在與主要組織相容性復(fù)合物 (MHC)分子結(jié)合時(shí)受到T細(xì)胞上抗原特異性T細(xì)胞受體識(shí)別。
10.權(quán)利要求1、2、或7-9任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述MHC分子是MHCI類分子。
11.權(quán)利要求10的分離的肽，其中所述MHC分子是HLA-A2分子。
12.權(quán)利要求1、2、或7-9任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述MHC分子是MHCII類分子。
13.權(quán)利要求3或5-12任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列包含靶向多肽。
14.權(quán)利要求13的分離的肽，其中所述靶向多肽將所述分離的肽靶向抗原呈遞細(xì)胞。
15.權(quán)利要求14的分離的肽，其中所述抗原呈遞細(xì)胞是樹突細(xì)胞。
16.權(quán)利要求14的分離的肽，其中所述抗原呈遞細(xì)胞是巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、或B細(xì)胞。
17.權(quán)利要求3或5-12任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列包含免疫刺激性 分子。
18.權(quán)利要求17的分離的肽，其中所述免疫刺激性分子是細(xì)胞因子或T輔助者表位。
19.權(quán)利要求3或5-12任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列包含免疫球蛋白 或其抗原結(jié)合片段。
20.權(quán)利要求19的分離的肽，其中所述免疫球蛋白是單鏈Fv免疫球蛋白片段。
21.權(quán)利要求3或5-12任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列包含免疫球蛋白 分子的Fc受體結(jié)合區(qū)。
22.權(quán)利要求21的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列包含整個(gè)免疫球蛋白分子。
23.權(quán)利要求3或5-12任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列包含載體多肽。
24.權(quán)利要求23的分離的肽，其中所述載體肽包含KLH多肽。
25.權(quán)利要求3或5-24任一項(xiàng)的分離的肽，其進(jìn)一步包含接頭序列。
26.權(quán)利要求25的分離的肽，其中所述接頭序列連接所述第一氨基酸序列與所述第二氨基酸序列。
27.權(quán)利要求25或26的分離的肽，其中所述接頭序列包含至少一個(gè)蛋白酶切割位點(diǎn)。
28.權(quán)利要求25-27任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述接頭序列由至少一個(gè)蛋白酶切割位 點(diǎn)組成。
29.權(quán)利要求3或5-28任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述第二氨基酸序列在所述第一氨基 酸序列的氨基端或羧基端。
30.權(quán)利要求1-29任一項(xiàng)的分離的肽，其中所述分離的肽帶有可檢測(cè)的標(biāo)記。
31.一種分離的肽，其由SEQ ID N0:l-18任一組成。
32.—種分離的核酸，其編碼權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽。
33.一種載體，其包含權(quán)利要求32的核酸序列。
34.權(quán)利要求33的載體，其中所述核酸序列可操作連接至表達(dá)控制序列。
35.一種培養(yǎng)細(xì)胞，其包含權(quán)利要求33的載體。
36.一種培養(yǎng)細(xì)胞，其包含權(quán)利要求34的載體。
37.權(quán)利要求35或36的培養(yǎng)細(xì)胞，其中所述細(xì)胞是哺乳動(dòng)物細(xì)胞。
38.權(quán)利要求37的培養(yǎng)細(xì)胞，其中所述細(xì)胞是人細(xì)胞。
39.權(quán)利要求35-38任一項(xiàng)的培養(yǎng)細(xì)胞，其中所述細(xì)胞是免疫細(xì)胞。
40.一種生產(chǎn)肽的方法，該方法包括在允許所述肽表達(dá)的條件下培養(yǎng)權(quán)利要求36-39 任一項(xiàng)的細(xì)胞。
41.權(quán)利要求40的方法，其進(jìn)一步包括自細(xì)胞或自培養(yǎng)細(xì)胞的培養(yǎng)基分離所述肽。
42.一種藥物組合物，其包含藥學(xué)可接受的載體和一種或多種根據(jù)權(quán)利要求1-31任一 項(xiàng)的肽。
43.權(quán)利要求42的藥物組合物，其進(jìn)一步包含一種或多種免疫刺激劑。
44.權(quán)利要求43的藥物組合物，其中所述一種或多種免疫刺激劑選自下組T輔助者表 位、改變的肽配體、和佐劑。
45.權(quán)利要求44的藥物組合物，其中所述T輔助者表位是PADRE序列或通用破傷風(fēng)類 毒素T輔助(TT Th)表位。
46.權(quán)利要求44的藥物組合物，其中所述佐劑選自下組弗氏完全佐劑、弗氏不完全佐 劑、明礬、Toll受體的配體、QS21、RIBI、霍亂毒素(CT)、大腸桿菌熱不穩(wěn)定毒素(LT)、突變 體CT(MCT)、和突變體大腸桿菌熱不穩(wěn)定毒素(MLT)。
47.權(quán)利要求42-46任一項(xiàng)的藥物組合物，其進(jìn)一步包含一種或多種治療劑、診斷劑、 或預(yù)防劑。
48.一種試劑盒，其包含一種或多種根據(jù)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽；和關(guān)于對(duì)受試者施用所述肽的用法說明。
49.權(quán)利要求48的試劑盒，其進(jìn)一步包含一種或多種藥學(xué)可接受載體。
50.權(quán)利要求48或49的試劑盒，其進(jìn)一步包含一種或多種免疫刺激劑。
51.權(quán)利要求50的試劑盒，其中所述一種或多種免疫刺激劑選自下組T輔助者表位、 改變的肽配體、和佐劑。
52.權(quán)利要求48-51任一項(xiàng)的試劑盒，其進(jìn)一步包含一種或多種治療劑、診斷劑、或預(yù)防劑。
53.一種制品，其包含容器；和裝在所述容器內(nèi)的組合物，其中所述組合物包含用于在哺乳動(dòng)物中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的活性組分，其中所述活性組分 包含一種或多種根據(jù)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽，且其中所述容器有標(biāo)簽指明所述組合物 用于在哺乳動(dòng)物中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答。
54.權(quán)利要求53的制品，其中所述標(biāo)簽進(jìn)一步指明所述組合物要施用于具有、懷疑具 有、或有風(fēng)險(xiǎn)發(fā)生多發(fā)性骨髓瘤的哺乳動(dòng)物。
55.權(quán)利要求53或54的制品，其中所述標(biāo)簽進(jìn)一步指明所述組合物要施用于具有、懷 疑具有、或預(yù)防性發(fā)生瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物。
56.權(quán)利要求53-55任一項(xiàng)的制品，其進(jìn)一步包含關(guān)于對(duì)所述哺乳動(dòng)物施用所述組合 物的用法說明。
57.權(quán)利要求53-56任一項(xiàng)的制品，其中所述組合物是干燥的或凍干的。
58.一種用于在受試者中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法，該方法包括對(duì)受試者投遞一種或多種 根據(jù)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽。
59.權(quán)利要求58的方法，其進(jìn)一步包括在對(duì)所述受試者投遞所述一種或多種肽后確定 所述受試者中是否發(fā)生免疫應(yīng)答。
60.權(quán)利要求58或59的方法，其中將所述一種或多種肽作為藥物組合物對(duì)所述受試者 投遞。
61.權(quán)利要求58-60任一項(xiàng)的方法，其中所述受試者是哺乳動(dòng)物。
62.權(quán)利要求61的方法，其中所述哺乳動(dòng)物是人。
63.權(quán)利要求58-63任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括確定所述受試者是否具有多發(fā)性骨 髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥。
64.權(quán)利要求58-63任一項(xiàng)的方法，其中所述受試者具有或懷疑具有多發(fā)性骨髓瘤或 瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥。
65.權(quán)利要求58-64任一項(xiàng)的方法，其中所述受試者處于多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特 倫氏巨球蛋白血癥的好轉(zhuǎn)期。
66.權(quán)利要求64或65的方法，其進(jìn)一步包括確定所述受試者的多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登 斯特倫氏巨球蛋白血癥的一個(gè)或多個(gè)漿細(xì)胞是否表達(dá)XBP1、⑶138、或CS1。
67.權(quán)利要求58-66任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括對(duì)所述受試者施用一種或多種化療 劑、一種或多種形式的電離輻射、或一種或多種免疫治療劑。
68.權(quán)利要求67的方法，其中所述一種或多種形式的電離輻射是伽馬輻照、X輻照、或 貝塔輻照。
69.權(quán)利要求67的方法，其中所述一種或多種化療劑選自下組順鉬、卡鉬、丙卡巴 胼、雙氯乙基甲胺、環(huán)磷酰胺、喜樹堿、阿霉素、異環(huán)磷酰胺、美法侖、苯丁酸氮芥、白消安、 亞硝基脲、放線菌素D、柔紅霉素、多柔比星、博來霉素、普卡霉素、絲裂霉素、依托泊苷、 verampil、鬼白毒素、他莫昔芬、泰素、反鉬、5-氟尿嘧啶、長(zhǎng)春新堿、長(zhǎng)春堿、甲氨蝶呤、和上 述任一的類似物。
70.權(quán)利要求58-69任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括對(duì)所述受試者施用一種或多種免疫 刺激劑。
71.權(quán)利要求58-70任一項(xiàng)的方法，其中所述投遞包括對(duì)所述受試者施用所述一種或 多種肽。
72.權(quán)利要求58-70任一項(xiàng)的方法，其中所述投遞包括對(duì)所述受試者施用一種或多種 核酸，其每一種包含編碼所述一種或多種肽的核苷酸序列，所述核苷酸序列可操作連接至 表達(dá)控制序列。
73.權(quán)利要求72的方法，其中所述核酸在經(jīng)所述核酸轉(zhuǎn)染且表達(dá)所述一種或多種肽的 重組細(xì)胞中。
74.權(quán)利要求73的方法，其中所述重組細(xì)胞是通過轉(zhuǎn)染自所述受試者獲得的細(xì)胞得到 的經(jīng)轉(zhuǎn)染細(xì)胞或其后代。
75.權(quán)利要求73或74的方法，其中所述重組細(xì)胞是抗原呈遞細(xì)胞。
76.權(quán)利要求75的方法，其中所述抗原呈遞細(xì)胞是樹突細(xì)胞。
77.權(quán)利要求76的方法，其中所述抗原呈遞細(xì)胞是巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、或B細(xì)胞。
78.權(quán)利要求58-77任一項(xiàng)的方法，其中所述投遞包括使所述一種或多種肽接觸細(xì) 胞；并在使所述一種或多種肽接觸所述細(xì)胞后，對(duì)所述受試者投遞所述細(xì)胞。
79.權(quán)利要求78的方法，其中所述細(xì)胞是抗原呈遞細(xì)胞。
80.權(quán)利要求79的方法，其中所述抗原呈遞細(xì)胞是樹突細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、單核細(xì)胞、或B 細(xì)胞。
81.權(quán)利要求78-80任一項(xiàng)的方法，其中所述細(xì)胞是自所述受試者獲得的細(xì)胞或其后代。
82.權(quán)利要求78-80任一項(xiàng)的方法，其中所述細(xì)胞是自與所述受試者同一物種的另一 受試者獲得的細(xì)胞或其后代。
83.權(quán)利要求82的方法，其中所述另一受試者表達(dá)至少一種與所述受試者共同的MHC 分子。
84.權(quán)利要求83的方法，其中所述至少一種MHC分子是MHCI類分子。
85.權(quán)利要求84的方法，其中所述MHCI類分子是HLA-A2分子。
86.權(quán)利要求58-85任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括在對(duì)所述受試者施用所述一種或多 種肽前，自所述受試者獲得包含一個(gè)或多個(gè)造血干細(xì)胞的一群細(xì)胞。
87.一種用于治療多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的方法，該方法包括 對(duì)受試者施用一種或多種根據(jù)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽，其中所述受試者具有或有風(fēng)險(xiǎn) 發(fā)生多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥。
88.一種用于為需要治療的哺乳動(dòng)物選擇療法的方法，該方法包括確定哺乳動(dòng)物中 的癌癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞是否表達(dá)XBP1，其中所述癌癥是多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥；并若一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)XBPl，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的 治療劑(a)一種分離的肽，其由與SEQ ID NO 1-10任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)—種分離的肽，其由SEQ ID NO :1-10任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替代；(c)一種分離的肽，其包含(i)由SEQ ID NO :1-10任一組成，具有不超過四處替代的 第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d)一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :1-10任一至少66%相同的氨基酸序 列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
89.權(quán)利要求88的方法，其進(jìn)一步包括在確定所述癌癥的一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞表達(dá)XBPl 后，對(duì)所述受試者投遞所述選定的一種或多種肽。
90.一種用于為具有癌癥的哺乳動(dòng)物選擇療法的方法，該方法包括確定哺乳動(dòng)物中的癌癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞是否表達(dá)CD138，其中所述癌癥是多發(fā)性 骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥；并若一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CD138，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物 的治療劑(a)一種分離的肽，其由與SEQ ID NO :11-14任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)一種分離的肽，其由SEQ ID NO :11-14任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替 代；和(c)一種分離的肽，其包含(i)由SEQ ID N0:ll-14任一組成，具有不超過四處替代的 第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d)一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :11-14任一至少66%相同的氨基酸序 列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
91.權(quán)利要求90的方法，其進(jìn)一步包括在確定所述癌癥的一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞表達(dá)CD138 后，對(duì)所述受試者投遞所述一種或多種肽。
92.一種用于為需要治療的哺乳動(dòng)物選擇療法的方法，該方法包括確定哺乳動(dòng)物中的癌癥的一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞是否表達(dá)CS1，其中所述癌癥是多發(fā)性骨 髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥；并若一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CS1，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的 治療劑(a)一種分離的肽，其由與SEQ ID NO :15_18任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)一種分離的肽，其由SEQ ID NO :15-18任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替代；(c)一種分離的肽，其包含(i)由SEQ ID N0:15-18任一組成，具有不超過四處替代的 第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d)一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :15-18任一至少66%相同的氨基酸序 列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
93.權(quán)利要求92的方法，其進(jìn)一步包括在確定所述癌癥的一個(gè)或多個(gè)細(xì)胞表達(dá)CSl后， 對(duì)所述受試者投遞所述選定的一種或多種肽。
94.一種用于為具有多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物選擇治 療劑的方法，該方法包括若哺乳動(dòng)物的多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的一 個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)XBP1，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a) 一種分離的肽，其由與SEQ ID NO 1-10任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)一種分離的肽，其由SEQ ID NO :1-10任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替 代；和(c)一種分離的肽，其包含(i)由SEQ ID NO :1-10任一組成，具有不超過四處替代的 第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d)一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :1-10任一至少66%相同的氨基酸序 列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
95.一種用于為具有多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物選擇 治療劑的方法，該方法包括若哺乳動(dòng)物的多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的 一個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CD138，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療 劑(a)一種分離的肽，其由與SEQ ID NO :11-14任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)一種分離的肽，其由SEQ ID NO :11-14任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替 代；和(c)一種分離的肽，其包含(i)由SEQ ID N0:ll-14任一組成，具有不超過四處替代的 第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d)一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :11-14任一至少66%相同的氨基酸序 列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
96.一種用于為具有多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的哺乳動(dòng)物選擇治 療劑的方法，該方法包括若哺乳動(dòng)物的多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的一 個(gè)或多個(gè)癌細(xì)胞表達(dá)CS1，則選擇一種或多種選自下組的肽作為所述哺乳動(dòng)物的治療劑(a)一種分離的肽，其由與SEQ ID NO :15_18任一至少66%相同的氨基酸序列組成；(b)一種分離的肽，其由SEQ ID NO :15-18任一的氨基酸序列組成，具有不超過四處替 代；和(c)一種分離的肽，其包含(i)由SEQ ID N0:15-18任一組成，具有不超過四處替代的 第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列；和(d)一種分離的肽，其包含(i)由與SEQ ID NO :15-18任一至少66%相同的氨基酸序 列組成的第一氨基酸序列；和(ii)與第一氨基酸序列異源的第二氨基酸序列。
97.權(quán)利要求88-96任一項(xiàng)的方法，其中所述受試者或哺乳動(dòng)物接受過針對(duì)多發(fā)性骨 髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥的療法，而且對(duì)所述療法沒有響應(yīng)。
98.一種用于在哺乳動(dòng)物中誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法，該方法包括對(duì)受試者施用接觸過一 種或多種根據(jù)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽的免疫細(xì)胞或其后代。
99.權(quán)利要求98的方法，其中所述方法包括所述接觸。
100.權(quán)利要求98或99的方法，其中所述免疫細(xì)胞是T細(xì)胞。
101.權(quán)利要求100的方法，其中所述T細(xì)胞在抗原呈遞細(xì)胞存在下與所述一種或多種 肽接觸。
102.權(quán)利要求99-101任一項(xiàng)的方法，其進(jìn)一步包括在接觸前獲得所述免疫細(xì)胞。
103.權(quán)利要求98-102任一項(xiàng)的方法，其中所述免疫細(xì)胞是自所述受試者獲得的。
104.權(quán)利要求98-102任一項(xiàng)的方法，其中所述免疫細(xì)胞是自所述受試者同一物種的另一受試者獲得的。
105.權(quán)利要求104的方法，其中所述免疫細(xì)胞表達(dá)至少一種與所述受試者共同的MHC 分子。
106.權(quán)利要求105的方法，其中所述至少一種MHC分子是MHCI類分子。
107.權(quán)利要求106的方法，其中所述MHCI類分子是HLA-A2分子。
108.一種組合物，其包含(i)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽和(ii)主要組織相容性復(fù)合 物(MHC)分子多聚體，其中所述多聚體包含MHC分子的兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)。
109.權(quán)利要求108的組合物，其中所述MHC分子多聚體包含MHC分子的四個(gè)或五個(gè)肽 結(jié)合區(qū)。
110.權(quán)利要求108或109的組合物，其中每一個(gè)肽結(jié)合區(qū)有(i)結(jié)合它。
111.權(quán)利要求110的組合物，其中每一個(gè)肽結(jié)合區(qū)有(i)非共價(jià)結(jié)合它。
112.權(quán)利要求110的組合物，其中每一個(gè)肽結(jié)合區(qū)有(i)共價(jià)結(jié)合它。
113.權(quán)利要求108-112任一項(xiàng)的組合物，其中所述MHC分子多聚體包含兩個(gè)或更多個(gè) 整個(gè)MHC分子。
114.權(quán)利要求108-113任一項(xiàng)的組合物，其中所述MHC分子多聚體包含人MHC分子。
115.權(quán)利要求108-114任一項(xiàng)的組合物，其中所述MHC分子多聚體包含MHCI類分子。
116.權(quán)利要求115的組合物，其中所述MHCI類分子是HLA-A2分子。
117.權(quán)利要求108-116任一項(xiàng)的組合物，其中所述組合物包含至少兩種或更多種所述肽。
118.權(quán)利要求108-117任一項(xiàng)的組合物，其中所述兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)來自相同 MHC分子。
119.權(quán)利要求108-117任一項(xiàng)的組合物，其中所述兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)來自不同 MHC分子。
120.權(quán)利要求108-119任一項(xiàng)的組合物，其中所述MHC分子多聚體能夠結(jié)合所述一種 或多種肽中的至少一種。
121.權(quán)利要求108-120任一項(xiàng)的組合物，其中所述組合物帶有可檢測(cè)的標(biāo)記。
122.試劑盒，其包含組合物，該組合物包含一種或多種主要組織相容性復(fù)合物(MHC)分子多聚體，其中每個(gè)多聚體包含MHC分子 的兩個(gè)或更多個(gè)肽結(jié)合區(qū)；和一種或多種根據(jù)權(quán)利要求1-31任一項(xiàng)的肽。
123.權(quán)利要求122的試劑盒，其進(jìn)一步包含關(guān)于使所述組合物接觸細(xì)胞的用法說明。
124.權(quán)利要求122或123的試劑盒，其進(jìn)一步包含一種或多種可檢測(cè)標(biāo)記物。
125.權(quán)利要求124的試劑盒，其中所述一種或多種可檢測(cè)標(biāo)記物選自下組發(fā)光標(biāo)記 物、熒光標(biāo)記物、放射性標(biāo)記物、和酶標(biāo)記物。
126.權(quán)利要求122-125任一項(xiàng)的試劑盒，其進(jìn)一步包含關(guān)于對(duì)所述一種或多種MHC分 子多聚體之一或所述一種或多種肽之一進(jìn)行可檢測(cè)標(biāo)記的用法說明。
127.權(quán)利要求125或126的試劑盒，其進(jìn)一步包含關(guān)于檢測(cè)所述一種或多種可檢測(cè)標(biāo) 記物中至少一種的用法說明。
128.權(quán)利要求122-127任一項(xiàng)的試劑盒，其中所述一種或多種MHC分子多聚體中至少 一種或所述一種或多種肽中至少一種帶有可檢測(cè)的標(biāo)記。
全文摘要
本文公開了多個(gè)特征，包括免疫原性XBP1-、CD138-、和CS1-衍生肽(及其藥物組合物)等。所述肽可以在多種方法中使用，諸如用于誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的方法、用于生成抗體的方法、及用于治療癌癥(例如漿細(xì)胞病癥，諸如多發(fā)性骨髓瘤或瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血癥)的方法。所述肽還可以包括在MHC分子多聚體組合物中，而且還可以在例如用于在一群細(xì)胞中檢測(cè)T細(xì)胞的方法中使用。
文檔編號(hào)A61K38/00GK102112147SQ200980130349
公開日2011年6月29日 申請(qǐng)日期2009年6月1日 優(yōu)先權(quán)日2008年6月2日
發(fā)明者尼基爾.C.穆恩希, 肯尼斯.C.安德森, 裵洙恩 申請(qǐng)人:達(dá)納-法伯癌癥研究所股份有限公司