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      一種用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物及其應(yīng)用的制作方法

      文檔序號:11224242閱讀:845來源:國知局

      本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物及其應(yīng)用。



      背景技術(shù):

      藥物引起過敏反應(yīng)主要分為i型(速發(fā)型)、ii型(細(xì)胞毒型)、iii型(免疫復(fù)合物型)、iv型(遲發(fā)型)過敏反應(yīng)及類過敏反應(yīng)。類過敏反應(yīng)的臨床癥狀與過敏反應(yīng)類似。但其反應(yīng)機(jī)理與i型過敏反應(yīng)并不相同。當(dāng)藥物進(jìn)入體內(nèi)后,可直接導(dǎo)致肥大細(xì)胞釋放內(nèi)容物,觸發(fā)過敏反應(yīng),且臨床癥狀嚴(yán)重。過敏性休克發(fā)生于極少數(shù)接受治療劑量藥物的個體,沒有致敏過程,患者血清ige濃度也未見升高,但表現(xiàn)為典型的速發(fā)型變態(tài)反應(yīng)癥狀,因此又被稱為假藥物變態(tài)反應(yīng)。類過敏反應(yīng)與抗原特異性免疫反應(yīng)無關(guān),在初次接觸該類藥物時發(fā)生,且與劑量、注射速度有一定的相關(guān)性。作為過敏主要效應(yīng)器的肥大細(xì)胞,不僅可被特異性ige附著而活化導(dǎo)致脫顆粒,引起i型過敏,也可被炎癥因子、藥物等多種促分泌物質(zhì)直接激活導(dǎo)致細(xì)胞脫顆粒,引起臨床常見的類過敏反應(yīng),使患者出現(xiàn)皮損癥狀,即表現(xiàn)出紅斑、蕁麻疹、水腫等,嚴(yán)重者可導(dǎo)致哮喘、休克等癥狀。目前類過敏反應(yīng)產(chǎn)生的機(jī)理尚未完全認(rèn)識,可能與致敏物質(zhì)直接刺激肥大細(xì)胞釋放組胺,或直接由c5a、c3a、c4a等過敏毒素與肥大細(xì)胞特異性膜受體結(jié)合后介導(dǎo)的肥大細(xì)胞脫顆粒有關(guān)。

      類過敏反應(yīng)的臨床表現(xiàn)為局部皮膚癥狀,如頭面部、胸部及四肢的血管擴(kuò)張、紅斑、水腫、眼結(jié)膜充血;消化系統(tǒng)癥狀,如流涎、惡心、嘔吐、腹瀉、厭食;呼吸循環(huán)系統(tǒng)癥狀,如胸悶、心悸、血壓升高、呼吸困難,嚴(yán)重的可發(fā)生呼吸循環(huán)衰竭,導(dǎo)致患者休克、死亡。其癥狀特點與藥物靜脈注射的速度有關(guān),注射速度越快,組胺的釋放量越大,機(jī)體反應(yīng)越嚴(yán)重,即低劑量、低濃度,可無或僅出現(xiàn)輕微癥狀;大劑量、高濃度可誘發(fā)嚴(yán)重的藥品不良反應(yīng)。但是,機(jī)體的反應(yīng)癥狀會隨著重復(fù)給藥逐漸減弱甚至自行消退,而過敏反應(yīng)則不具有此特點。

      類過敏反應(yīng)近年來在臨床中的發(fā)生頻率不斷升高,約占急性過敏反應(yīng)的77%,在中藥注射劑引起的過敏性休克中,約3/4屬于類過敏反應(yīng),由于其臨床危害性大,日益成為醫(yī)療工作者關(guān)注的熱點。但是,目前臨床上并沒有監(jiān)控類過敏反應(yīng)的相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn),更沒有提前檢測患者發(fā)生類過敏反應(yīng)風(fēng)險的相關(guān)研究。常規(guī)的標(biāo)志物組胺、類胰蛋白酶和ige都存在各種各樣的問題,并不適用于臨床檢測類過敏反應(yīng)。



      技術(shù)實現(xiàn)要素:

      本發(fā)明的目的在于提供一種用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物及其應(yīng)用,以解決目前患者發(fā)生類過敏反應(yīng)風(fēng)險篩查技術(shù)手段欠缺的問題。

      為達(dá)到上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案來實現(xiàn):

      一種用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物,所述基因標(biāo)志物為mrgprx2受體的特征基因序列。

      所述mrgprx2受體的特征基因序列如seqidno.1所示。

      所述的用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物在制備藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查產(chǎn)品中的應(yīng)用。

      所述藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查產(chǎn)品包括用實時定量pcr方法篩查藥物類過敏反應(yīng)敏感人群的產(chǎn)品。

      所述用實時定量pcr方法篩查藥物類過敏反應(yīng)敏感人群的產(chǎn)品包含特異性擴(kuò)增mrgprx2受體的特征基因序列的引物。

      所述引物包括forward引物和reverse引物,其中forward引物的序列如seqidno.2所示,reverse引物的序列如seqidno.3所示。

      與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:

      本發(fā)明提供的用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物為mrgprx2受體的特征基因序列。該基因標(biāo)志物能夠用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群的篩查,能夠在制備藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查產(chǎn)品等方面得到應(yīng)用,該基因標(biāo)志物可用于患者類過敏反應(yīng)發(fā)生風(fēng)險的篩查和診斷,具有很高的敏感性和特異性,而且由于在篩查過程中采用臨床上最易采集的外周血進(jìn)行檢測,即用pcr擴(kuò)增的方法檢測外周血中mrgprx2受體特征基因序列的含量,即可評估類過敏反應(yīng)發(fā)生的風(fēng)險,使用方便,適于患者用藥前大規(guī)模人群篩查,對促進(jìn)類過敏反應(yīng)易發(fā)生人群的提前發(fā)現(xiàn),提高用藥的安全性有重要意義,具有廣闊的應(yīng)用前景。

      進(jìn)一步的,本發(fā)明提供的用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物包含seqidno.2和seqidno.3所示的外周血mrgprx2受體的特征基因序列。本發(fā)明還提供了所述基因標(biāo)志物在制備藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查產(chǎn)品中的應(yīng)用。藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查產(chǎn)品(即篩查類過敏反應(yīng)發(fā)生風(fēng)險的產(chǎn)品)包括用實時定量pcr方法篩查藥物類過敏反應(yīng)敏感人群的產(chǎn)品。而用實時定量pcr方法篩查類過敏反應(yīng)發(fā)生風(fēng)險的產(chǎn)品包含特異性擴(kuò)增外周血mrgprx2基因序列的引物,其序列如seqidno.2和seqidno.3所示。

      具體實施方式

      研究發(fā)現(xiàn):類過敏刺激物首先激活細(xì)胞膜上的g蛋白,進(jìn)而激活蛋白激酶c和ca2+通道,使內(nèi)質(zhì)網(wǎng)釋放ca2+進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。伴隨著細(xì)胞內(nèi)ca2+濃度增加,肥大細(xì)胞和嗜堿性粒細(xì)胞內(nèi)的顆粒囊泡向胞漿膜移動并釋放生物介質(zhì),從而引發(fā)類過敏反應(yīng)。類過敏刺激物所激活的g蛋白為mrgprs(mas-relatedgprotein-coupledreceptors),該受體不依賴ige,可直接介導(dǎo)肥大細(xì)胞活化,誘導(dǎo)肥大細(xì)胞脫顆粒。此類受體在各種屬、組織和器官的表達(dá)類型并不相同:其中mrgprx2在人源肥大細(xì)胞中表達(dá);該受體胞外區(qū)為感應(yīng)區(qū),特異性不高,當(dāng)胞外被脫顆粒多肽、p物質(zhì)、compound48/80、β-防御素等多種物質(zhì)激活后,胞內(nèi)區(qū)信號觸發(fā),引起肥大細(xì)胞激活,釋放組胺等顆粒物質(zhì),刺激細(xì)胞旁分泌,從而影響到周圍細(xì)胞。mrgprx2是很多小分子藥物引起類過敏、假性過敏的作用靶點。因此通過對mrgprx2基因拷貝數(shù)的分析,從而推測出mrgprx2受體在不同患者中的表達(dá)量,有助于評價患者在用藥過程中發(fā)生類過敏反應(yīng)的風(fēng)險,對臨床上指導(dǎo)用藥的安全性具有重要意義。

      本發(fā)明通過定量分析外周血總rna的基因表達(dá)狀況,比較隨機(jī)取樣患者和發(fā)生過藥物類過敏反應(yīng)患者兩組樣本中外周血mrgprx2基因的表達(dá)差異,再通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計算出mrgprx2基因在不同個體外周血中發(fā)生差異表達(dá)(基因表達(dá)量高于平均水平或低于平均水平)的基因信號,即外周血中mrgprx2特征性基因(生物標(biāo)志物)的表達(dá)信號。采用絕對定量的方法,基于外周血mrgprx2特征基因建立患者用藥發(fā)生類過敏反應(yīng)風(fēng)險預(yù)測的模型。最后,采用熒光定量rt-pcr定量檢測受檢者外周血中基因標(biāo)志物的相對表達(dá)量,利用建立的患者用藥發(fā)生類過敏反應(yīng)風(fēng)險預(yù)測模型判別受檢者是否再用藥后會發(fā)生類過敏反應(yīng)及相應(yīng)的風(fēng)險概率,指導(dǎo)臨床用藥。

      下面對本發(fā)明發(fā)現(xiàn)所述用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物的具體過程進(jìn)行詳細(xì)說明。

      一、特征基因標(biāo)志物在人群中表達(dá)量基線的確定。

      具體包括以下步驟:

      1)采用paxgenetmbloodrnatube采血管收集300例經(jīng)檢查確定為沒有疾病和妊娠反應(yīng)的20-80歲健康的受檢者外周血樣本,每個樣本采集1.5-2ml外周血。

      2)采用trizol提取上述外周血樣本的總rna。

      (1)每1ml外周血標(biāo)本中加入1ml的trizol;

      (2)12000rpm/min離心10分鐘,取1ml上清至1.5mlep管中;

      (3)加入0.2ml氯仿,加蓋好后用手劇烈搖晃15秒,室溫放置2-3分鐘,然后離心4℃,12000rpm/min,15min。離心后分成三層,下面的紅色為酚-氯仿相,一個中間層,上面是無色的水相。rna只存在于水相中。水相占總trizol的60%。

      (4)將上層水相轉(zhuǎn)移到另一干凈的ep管中,加入0.5ml異丙醇,室溫靜置10min,然后離心4℃,12000rpm/min,10min。

      (5)去上清,加入0.8ml體積分?jǐn)?shù)75%的乙醇洗滌rna沉淀,離心4℃,10000rpm/min,1min,重復(fù)兩次。

      (6)去上清,加入0.8ml無水乙醇洗滌rna沉淀,離心4℃,10000rpm/min,1min。

      (7)去上清,置于真空或空氣中5-10分鐘,干燥rna沉淀。用無rnase水或0.5%sds溶液重懸rna沉淀,用槍頭反復(fù)吹打幾次,靜置10分鐘。

      (8)測濃度:取5μl儲存液加入另一個ep管中,以無rnase水作為空白對照,測od260/280值。1od=40μgrna。od260/280值在1.8-2.0視為純度很高。一般濃在1000ng/ml較準(zhǔn)。濃度太高要稀釋以后再測定。

      (9)rna鑒定:甲醛變性瓊脂糖電泳,確定抽提rna完整性和dna污染情況。

      3)用bio-tekepoch微孔板分光光度計檢測rna樣本的純度。所有rna樣本必須符合以下質(zhì)控條件:rna產(chǎn)率大于2微克,28s/18s峰的比值大于1,rin值大于7,260nm/280nm的吸光度比值大1.8。

      4)利用takara公司的primescripttmrtreagentkitwithgdnaeraser(perfectrealtime)試劑盒去除總rna中的基因組,并進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。

      5)利用標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒進(jìn)行實時熒光定量pcr檢測樣品循環(huán)數(shù),并繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,對擴(kuò)增后的樣品進(jìn)行拷貝數(shù)檢測,并利用標(biāo)準(zhǔn)曲線求得樣品的拷貝數(shù)。

      其中熒光定量pcr條件如表1所示。

      表1熒光定量pcr條件

      其中,forward引物的序列為:5'-caggacattgctgaggtgga-3';

      reverse引物的序列為:5'-agttcagcaaatcagacagacagg-3'。

      6)利用統(tǒng)計學(xué)方法,對300例樣品進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,計算95%置信區(qū)間以及正態(tài)分布情況。

      二、特征基因標(biāo)志物在過敏人群中表達(dá)量的確定。

      具體包括以下步驟:

      1)收集20-30例在臨床上確定發(fā)生類過敏反應(yīng)患者的外周血樣本,每個樣本采集1.5-2ml外周血。

      2)按照上述“一、特征基因標(biāo)志物在人群中表達(dá)量基線的確定”中的步驟,提取樣品總rna并檢測mrgprx2基因的拷貝數(shù)。

      3)利用統(tǒng)計學(xué)的方法計算過敏人群基因拷貝數(shù)的95%置信區(qū)間以及正態(tài)分布情況。

      4)利用統(tǒng)計學(xué)的方法,對比兩類人群中mrgprx2基因的拷貝數(shù),找出拷貝數(shù)的差異性。

      三、結(jié)果。

      1、對常規(guī)人群及過敏病人人群采集血樣數(shù)目分析,結(jié)果如表2所示。

      表2常規(guī)人群及過敏病人人群血樣數(shù)目分析

      2、序列表

      mrgprx2受體的特征基因序列如seq.id.no.1所示。

      引物序列如下:

      seq.id.no.2:forward引物:5'-caggacattgctgaggtgga-3';

      seq.id.no.3:reverse引物:5'-agttcagcaaatcagacagacagg-3'。

      3、嗜堿性粒細(xì)胞mrgprx2受體表達(dá)檢測

      提取全血中嗜堿性粒細(xì)胞總rna,利用rt-pcr的方法檢測mrgprx2基因表達(dá)量,結(jié)果如表3顯示,測得mrgprx2基因拷貝數(shù)約為(1.1±0.23)×104,說明mrgprx2受體在全血嗜堿性粒細(xì)胞上得到表達(dá)。

      表3嗜堿性粒細(xì)胞基因拷貝數(shù)

      此外,進(jìn)行了westernblot檢測以及全血免疫熒光檢測分析。結(jié)果如表4所示,從表4中westernblot結(jié)果可以看出,全血中的嗜堿性粒細(xì)胞能夠檢測到mrgprx2受體蛋白的表達(dá)。

      表4全血中mrgprx2受體蛋白含量westernblot檢測

      另外,免疫熒光結(jié)果顯示,利用特異性的抗體cd63能夠定位全血中嗜堿性粒細(xì)胞,進(jìn)一步利用mrgprx2受體特異性的抗體進(jìn)行標(biāo)記,明確了嗜堿性粒細(xì)胞中mrgprx2受體是確實存在的。

      4、嗜堿性粒細(xì)胞功能性分析

      利用血液中嗜堿性粒細(xì)胞ku812細(xì)胞株進(jìn)行鈣成像和組胺釋放的功能性實驗。結(jié)果顯示,mrgprx2受體特異性的激動劑,c48/80、環(huán)丙沙星、嗎啡以及阿曲庫銨均能激活兩種細(xì)胞的鈣動員,引起細(xì)胞胞內(nèi)鈣離子濃度的升高。同時,組胺釋放表明,4種激動劑均能引起ku812細(xì)胞釋放組胺,且釋放量與給藥劑量成正相關(guān)。

      以上實驗結(jié)果證明,全血中的嗜堿性粒細(xì)胞與肥大細(xì)胞在功能上具有一定的相關(guān)性,兩種細(xì)胞具有一定的同源性。因此可以對全血中嗜堿性粒細(xì)胞進(jìn)行檢測來反映肥大細(xì)胞的受體表達(dá)情況。簡單、方便、快捷的評價患者mrgprx2受體表達(dá)的差異,為臨床用藥的風(fēng)險性進(jìn)行評價。

      本發(fā)明的提供的用于患者發(fā)生類過敏反應(yīng)風(fēng)險篩查的基因標(biāo)志物,能夠用于類過敏發(fā)生反應(yīng)發(fā)生風(fēng)險篩查,并在制備篩查早期藥物類過敏反應(yīng)敏感人群的產(chǎn)品等方面得到應(yīng)用,具有敏感性高、特異性強等優(yōu)點,而且由于是以臨床上最易采集的外周血作為檢測樣本,檢測方便,適用于用藥患者及藥物類過敏反應(yīng)敏感人群的大規(guī)模人群篩查和早期診斷,應(yīng)用前景廣闊。

      以上所述,僅是本發(fā)明的較佳實施例,并非對本發(fā)明作任何限制,凡是根據(jù)本發(fā)明技術(shù)實質(zhì)對以上實施例所作的任何簡單修改、變更以及等效結(jié)構(gòu)變換,均仍屬于本發(fā)明技術(shù)方案的保護(hù)范圍內(nèi)。

      核苷酸序列表

      <110>西安交通大學(xué)

      <120>一種用于藥物類過敏反應(yīng)敏感人群篩查的基因標(biāo)志物及其應(yīng)用

      <160>3

      <210>1

      <211>6227

      <212>dna

      <213>mrgprx2

      <400>1

      gtttgccagtcccaggaaagcacttctcaactcaccaactccagtagaaagaagggtgtt60

      aaggtaagagtttgttcaagaaccatcttctttcaaaggcagttttggtttttaccttag120

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      tcttctatctaccaatattctccccttctcttcgaccattcaaatctgaaactatggaga300

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