稻飛虱翅中總rna高效提取的方法
【技術(shù)領域】
[0001] 本發(fā)明涉及農(nóng)業(yè)生物技術(shù)領域,尤其涉及一種稻飛虱翅中總RNA高效提取的方 法。
【背景技術(shù)】
[0002] 褐飛虱(NilaparvataIugens)、灰飛虱(Laodelphaxstriatellus)和白背飛虱 (Sogatellafurcifera)同屬于半翅目(Hemiptera)、飛風科(Delphacidae),是目前亞洲 水稻上的重要害蟲。它的危害不僅能以成蟲和若蟲群集刺吸水稻韌皮部篩管汁液,影響水 稻生長發(fā)育,同時也是多種病毒病害傳播的媒介昆蟲。水稻南方黑條矮縮發(fā)病輕重就與帶 毒白背飛虱的迀入量有關(guān)。稻飛虱成蟲個體可分為長翅型與短翅型,其它昆蟲種類翅的分 化現(xiàn)象也很普遍?,F(xiàn)有的研究表明,昆蟲翅型的分化受多種因子的影響。目前已確定外界 環(huán)境條件與遺傳因子共同決定了昆蟲的翅型。因此飛虱翅中與翅型相對表達量有差異的相 關(guān)基因?qū)ρ芯匡w虱翅型分化具有重要的意義。
[0003] 欲對RNA進行研究,首先要從組織中提取得到高質(zhì)量的RNA。但RNA與DNA不同, 極容易發(fā)生降解,RNA降解將對后續(xù)研究的真實性及可靠性產(chǎn)生極大的影像。引起RNA降 解的主要因素是RNA酶。RNA酶有2種來源,一種是外源性的,一種是內(nèi)源性的。因此在采 集用于RNA提取的樣品時,重點就在于如何防止外源性RNA酶污染及抑制內(nèi)源性RNA酶活 性上。外源性RNA酶可以通過DEPC等RNA酶抑制劑處理實驗用品以及嚴格的實驗操作和 試驗環(huán)境的控制來加以排除。而內(nèi)源性RNA酶卻很難去除,只能通過液氮或干冰制造低溫 或者組織樣品保護液浸泡的方法來進行抑制。但對于某些組織來說,這樣的處理很難達到 預期效果,比如飛虱翅翼組織。
[0004] 由于飛虱翅質(zhì)地透明、纖薄,使用傳統(tǒng)液氮凍存后不方便研磨,且翅翼角質(zhì)化程度 高,使用樣品提取液無法快速滲透到組織內(nèi)部,起不到抑制RNA酶的效果。這些都是影響翅 總RNA提取量及質(zhì)量的重要因素,這些問題都阻礙了對翅中基因RNA水平表達研究的進展。 本發(fā)明就是為了解決以上難題而提供了一種從樣品收集開始,包括樣品分離、液滲透浸入, 到總RNA的高效提取的方法。
[0005]目前尚未見有飛虱翅中總RNA高效提取的報道。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0006] 發(fā)明目的:為了克服現(xiàn)有技術(shù)中存在的不能有效高效提取稻飛虱翅中總RNA的問 題,本發(fā)明提出了一種能夠獲得高質(zhì)量RNA,且不被外源或內(nèi)源RNA酶降解到最低限度,能 最大限度地保持被提取的總RNA的純度,以利于后續(xù)試驗的利用的稻飛虱翅中總RNA高效 提取的方法。
[0007] 技術(shù)方案:為了解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明所采用的技術(shù)方案為:稻飛虱翅中總 RNA高效提取的方法,包括以下步驟:
[0008]a)實驗用具及耗材滅菌及RNA酶滅活處理:用0. 1 %DEPC水溶液浸泡實驗器材和 槍頭24h以上,部分耗材利用滅菌鍋高溫高壓濕熱滅菌處理,玻璃棒及石英砂等利用干燥 箱200°C干熱滅菌處理2h以上;工作臺面用RNA酶清除劑擦拭干凈;解剖針置于無水乙醇 中浸泡后用酒精燈進行灼燒滅活處理;
[0009]b)稻飛虱翅的分離:將稻飛虱成蟲利用無RNA酶水漂洗數(shù)次后,放入離心管中迅 速置于液氮罐中數(shù)十秒,使其迅速死亡,用滅菌后的解剖針迅速解離出稻飛虱翅部,避免殘 留翅根部肌肉組織帶入,裝入已加入300yLTrizol試劑的離心管中,并放置在冰上,收集 到長翅60頭以上,短翅120頭以上的稻飛虱翅翼后,將離心管置于-40°C保存24h;
[0010] C)總RNA的提?。?br>[0011] cl)在室溫下解凍步驟b得到的樣品,待樣品處于熔融狀態(tài)時利用高溫滅菌后的 玻璃棒沿著管壁研磨翅翼,待研磨難以進行時加入200目規(guī)格0.Olg石英砂助研磨,使翅脈 中內(nèi)容物充分釋放,研磨完畢再加入700yLTrizol試劑,混勻靜置2min;
[0012] c2)加入200yL氯仿,劇烈振蕩后室溫靜置;
[0013]c3)將上述混合物離心后獲得水相、蛋白相和氯仿相,取水相,加入與水相等體積 的異丙醇溶液,輕輕顛倒混勻后室溫下靜置IOmin;
[0014]c4)將步驟c3)中得到的混合物繼續(xù)離心后棄掉液體,保留管底微量白色固體;
[0015]c5)配制75%乙醇溶液:吸取無水乙醇750yL于一個新的無RNA酶離心管中,再 加入0. 1 %DEPC處理水250yL,顛倒搖勻,放置冰上冷卻;
[0016] c6)將ImL75%乙醇溶液加入步驟c4)得到的含有沉淀物的離心管中,劇烈振蕩, 使白色沉淀物懸浮在乙醇溶液中;
[0017] c7)重復以上步驟c4)_c6),再進行兩次洗滌;
[0018]c8)小心棄掉離心管中上清液,用濾紙吸干離心管壁液體,將離心管放在超凈工作 臺中通風吹干,加入20yL無RNA酶水,用Nanodrop核酸定量儀測定濃度,分裝置于-70°C 超低溫冰箱備用,同時利用瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA完整性。
[0019] 更進一步的,所述步驟b)中稻飛虱用吸管吸取放入離心管中。
[0020] 更進一步的,所述步驟Cl)中解凍前采用低溫高速離心機-4°C進行預冷處理后再 置于室溫下解凍。
[0021] 更進一步的,所述步驟C2)中劇烈振蕩時間為15s,室溫靜置5min;
[0022] 更進一步的,所述步驟c3)中離心條件為12000g4°C離心15分鐘。
[0023] 更進一步的,所述步驟c3)中吸取水相體積為400yL。
[0024] 更進一步的,所述步驟c4)中離心條件為12000g4°C離心15分鐘。
[0025] 更進一步的,所述步驟c4)中石永紅移液器以及濾紙吸取管壁及官底殘余液體。
[0026] 更進一步的,所述步驟c8)中取2yL進行瓊脂糖凝膠電泳檢測,IyL進行濃度測 定。
[0027] 有益效果:本發(fā)明提供的一種稻飛虱翅中總RNA高效提取的方法,與傳統(tǒng)利用 Trizol提取RNA相比具有以下優(yōu)點:方法簡單方便,只需要在步驟中加入冷凍貯存及石英 砂助研磨,就能高效的提取出飛虱翅翼中總RNA,提取的翅中總RNA,不被外源或內(nèi)源RNA酶 降解到最低限度,能最大限度地保持被提取的總RNA的純度,以利于后續(xù)試驗的利用;獲得 的翅中總RNA純度高、完整度好,濃度滿足多種實驗需求,可用于反轉(zhuǎn)錄cDNA、PCR、qPCR等 下游操作等分子生物學的操作應用,實用價值顯著。
【附圖說明】
[0028] 圖1為本發(fā)明實施例獲得的產(chǎn)物在瓊脂糖電泳后得到的條帶。
[0029] 圖2為本發(fā)明實施例獲得的產(chǎn)物通過逆轉(zhuǎn)錄及通過PCR擴增褐飛虱翅中wingless 基因的結(jié)果。
【具體實施方式】
[0030] 下面結(jié)合實施例對本發(fā)明作進一步的詳細說明:
[0031] 1)試驗步驟:
[0032] 選取褐飛虱作為試驗對象。
[0033] a)實驗用具及耗材滅菌及RNA酶滅活處理:用0. 1 %DEPC水溶液浸泡實驗器材和 槍頭24h以上,部分耗材利用滅菌鍋高溫高壓濕熱滅菌處理,玻璃棒及石英砂等利用干燥 箱200°C干熱滅菌處理2h以上;工作臺面用RNA酶清除劑擦拭干凈;解剖針置于無水乙醇 中浸泡后用酒精燈進行灼燒滅活處理;
[0034] b)褐飛虱翅的分離:用吸管吸取一定數(shù)量的褐飛虱放入離心管中迅速置于液氮 罐中數(shù)十秒,使其迅速死亡,利用無RNA酶水漂洗兩次后用滅菌后的解剖針迅速解離出稻 飛虱翅部,避免殘留翅根部肌肉組織帶入,利用解剖針挑取翅翼裝入已加入300yLTrizol 試劑的離心管中,并放置在冰上,減少RNA分解,收集到長翅60頭以上,短翅120頭以上的 稻飛虱翅翼后,將離心管置于_40°C保存24h;
[0035] c)總RNA的提?。?br>[0036] cl)打開低溫高速離心機-4°C進行預冷處理,在室溫下超凈臺中解凍步驟b得到 的樣品,待樣品處于熔融狀態(tài)時利用高溫滅菌后的玻璃棒沿著管壁研磨翅翼,待研磨難以 進行時加入200目規(guī)格0.Olg石英砂助研磨,使翅脈中內(nèi)容物充分釋放,研磨完畢再加入 700yLTrizol試劑,混勻靜置2min;
[0037] c2)加入200yL氯仿,劇烈振蕩15s后室溫靜置5min;
[0038] c3)將上述混合物12000g4°C離心15min,上清液轉(zhuǎn)移新的離心管中,加入與上清 液等體積的異丙醇溶液,輕輕顛倒混勻后室溫下靜置IOmin;