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      一種雜交鵝掌楸LhRGL1基因及其應(yīng)用_2

      文檔序號:9466873閱讀:來源:國知局
      切碎后置于1.5mL離心管中。稱量凝膠重量,將該重量作為一個凝膠體積(如100 mg=100 μ L)。向離心管中加入3個凝膠體積的Buffer DE-A,混勻后置于75°C加熱儀上加熱,每2-3 min間斷混合一次,直至凝膠完全融化(時間大約為6-8min)。向離心管中加0.5個Buffer DE-A體積的Buffer DE-B,混合均勾;將混合液轉(zhuǎn)移到DNA制備管(置于2mL離心管)中,12000Xg離心I min,棄濾液。將制備管放回2mL離心管,加500 μ I Buffer Wl,12000Xg離心30 s,棄濾液。將制備管放回2mL離心管,加700 yL Buffer W2,12000Xg離心30 s,棄濾液。以同樣方法再用700 yL Buffer W2洗滌一次,12000Xg離心I Hiin0將制備管放回2mL離心管中,12000X g離心I min。將制備管置于干凈的1.5mL離心管中,在制備膜中央加25-30 μ L Eluent去離子水,室溫下,靜置I min。12000Xg離心I min,洗脫DNA。取2 μ L回收純化后的產(chǎn)物,使用1%瓊脂糖進行凝膠電泳檢測。
      [0021]4)目的片段與載體連接
      克隆載體為TaKaRa公司的pMD19_T Vector(D102A),進行連接反應(yīng),連接體系(10 μ L):5yL Solut1n I,IyL pMD19_T Vector,4yL PCR 純化產(chǎn)物(50 ng)。輕輕吸打混勻后,使用離心機低速離心,水浴鍋中16 °C連接過夜。
      [0022]5)大腸桿菌超級感受態(tài)細胞的制備
      取置于-80°C超低溫冰箱中保存的JM109菌株,用接種環(huán)取少量,在不含抗生素的LB培養(yǎng)基上進行劃線,37°C培養(yǎng)箱內(nèi)倒置培養(yǎng)12-16 ho參考分子克隆實驗指南,采用Inoue方法制備大腸桿菌JM109超級感受態(tài)細胞,保存于_80°C,備用。
      [0023]6)連接產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化
      從超低溫冰箱中取出感受態(tài)細胞JM109菌株,置于冰上融化。吸取5 μ L的過夜連接產(chǎn)物加入到100 μ L感受態(tài)細胞中;將離心管置于冰上冰浴30 min ;42°C水浴鍋中水浴,熱激90 S,期間不要搖動;后立即置于冰上冰浴2 min;在超凈臺中加入800 μ L無抗生素的液體培養(yǎng)基,370C、180 rpm搖Ih復(fù)蘇;4000 rpm離心3 min,吸去800 μ L上清;將沉淀的菌體重懸,涂于LB平板(Amp的濃度為100 mg/L),37°C培養(yǎng)過夜。
      [0024]7)重組質(zhì)粒的篩選及驗證
      挑取在含有抗生素(Amp)的LB固體培養(yǎng)基上過夜生長的單菌落,接種到含有同樣抗生素的750 μ L的LB液體培養(yǎng)基中。250 rpm, 37 °C過夜培養(yǎng)。
      [0025]PCR 擴增體系為:2 μ L 10XPCR Buffer, 1.2 yL MgCl2 (25 mM),0.4yL dNTP (10mM),I μ L M13-F/R,2 μ L 菌液,0.2 μ L rTaq,ddH20 補充到 20 μ L。
      [0026]PCR程序為:94°C5 min ;94°C 30 s,55°C 30 s,72°C I min40 s,36 cycles ;72°C 7min ;4°C forever。
      [0027]吸取ΙΟμ?的PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測分析。驗證后,將條帶大小正確的菌液樣品委托上海英駿公司測序,測序引物為通用引物M13F/R。測序結(jié)果在NCBI上進行比對分析。
      [0028]根據(jù)對測序結(jié)果的分析,最終確定克隆得到I個雜交鵝掌楸基因,命名為基因,其核苷酸序列如SEQ ID N0.1所示,基因,片段長度為1610 bp,含有
      ATG起始密碼子和TAA終止密碼子,其中ORF全長為1572 bp,編碼524個氨基酸的蛋白質(zhì),該蛋白氨基酸序列如SEQ ID N0.2所示。
      [0029]實施例2
      研究結(jié)果表明和在雜交鵝掌楸中各個組織器官中均發(fā)揮重要作用。但是兩個基因在莖中的表達量最高,說明莖的生長發(fā)育中GA信號途徑活躍,DELLA蛋白在莖的伸長生長中起著重要的調(diào)控作用。
      [0030]本實施例所用的植物材料為擬南芥thaliana) Col (Columbia)野生型種子,由德國Thomas Laux教授惠贈。
      [0031]本實施例所用的大腸桿菌菌株為A coli JM109 ;農(nóng)桿菌菌株為GV3101和EHA105,分別用于轉(zhuǎn)化擬南芥;試驗中所用植物表達載體為PBI121。所有菌株購自相關(guān)生物公司。
      [0032]I) LhRGLI基因的pB1121載體的構(gòu)建
      將實施例1獲得的基因的ORF全長序列與植物表達載體PBI121進行連接,構(gòu)建的載體如圖1。
      [0033]2)質(zhì)粒的提取:采用堿裂解法中量提取質(zhì)粒。所用試劑為-Solut1n 1:50 mM葡萄糖,25 mM Tris-Cl, 10 mM EDTA,ρΗ8.0,高壓滅菌 15 min,4°C保存。Solut1n I1:1ONNaO H 2mL,0.1%SDS 10mL,88mL H20,配制成 100mL,現(xiàn)用現(xiàn)配。Solut1n II1:5mol/L 醋酸鉀 60mL,醋酸 11.5mL,ddH20 28.5mL,配制成 10mL, 4°C保存,用前冰浴(K+為 3 mol/L,AC為 5 mol/L)。
      [0034]質(zhì)粒提取的步驟為:取過夜培養(yǎng)的1mL菌液,12000 rpm、2 min離心,收集菌體;倒掉上清液,盡可能去掉培養(yǎng)基;將菌體重懸于400 μ? Solut1n I中,劇烈震蕩,盡可能打散4Ρ 800μ? Solut1n II,快速顛倒離心管(2mL大小的離心管),將混合后的內(nèi)容物置于冰上;加入6(Κ)μ? Solut1n III,輕輕反復(fù)顛倒數(shù)次,使細菌裂解物分散后置于冰上3_5min -A°C, 14000 rpm離心5 min,取2 X 850μ?上清到兩只潔凈離心管中;加入等體積酸氯仿(可用氯仿代替),劇烈震蕩混合水相和有機相,14000 rpm離心2 min,取上層水相到另外一只干凈的離心管中(大約SOOPL);室溫下加等體積氯仿:異丙醇,劇烈震蕩混合均勻,室溫放置2 min ;在室溫下最大轉(zhuǎn)速14000 rmp離心5 min,收集沉淀;小心去除上清,將離心管倒置于紙上,流干液體,盡量除去管壁上液體;加入ImL 70%乙醇,顛倒混勻數(shù)次,使沉淀在乙醇中漂浮,室溫下14000 rmp離心2 min ;去除酒精,開口使液體完全揮發(fā);用30μ?含有RnaseA (20 μδ/μ?)的水進行溶解,4°C保存。
      [0035]3)特異酶切位點的添加
      以目的基因與克隆載體PMD19-T所構(gòu)建的陽性重組質(zhì)粒為模板,通過PCR方法在目的基因的兩側(cè)添加特異性酶切位點。雜交鵝掌楸ZA似;基因兩側(cè)添加BamHI和SacI酶切位點。PCR反應(yīng)體系、程序及所使用引物如下:
      PCR 反應(yīng)體系(20μυ:2μ? 10XPCR Buffer,1.2μ? MgCl2 (25 mM),0.4μ? dNTP (10mM), IlJ-L Forward Primer,IKL Rorward Primer,IKL 質(zhì)粒 DNA,0.2KL rTaq, 13.2? ddH20o
      [0036]PCR 反應(yīng)程序:94°C 5 min ;94°C 30 s,55-59。。30 s,72°C I min40 s,36 cycles ;72°C 7 min ;4°C forever。
      [0037]所使用的引物序列:
      LhRGLl-F+BamH1:5’-GCATCCATCTGCACATCCAAACACACCATTC-3’,
      LhRGLl-R+Sac1:5’-GAGCTCACAGCTTATTCTATTGTATCCCGAG-3’。
      [0038]將得到的PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳分離,使用AxyPr印DNA Gel Extract1nKit試劑盒進行回收純化,將回收后的產(chǎn)物與pMD19-T Simple連接,構(gòu)建含有目的基因的中間載體。
      [0039]4)雙酶切反應(yīng)
      使用相應(yīng)的內(nèi)切酶進行酶切反應(yīng),得到含有粘性末端并覆蓋整個ORF的LhRGlA麵片段。同時用同樣的酶,處理空的PBI121表達載體。酶切反應(yīng)體系:2yL 10XKbuffer, 0.5 yL BamH 1,0.5 yL Sac I,I μ g 回收產(chǎn)物/pBI121 空載體質(zhì)粒,ddH20 補充至Ij20 μ L0 37°C水浴,酶切4-6h。加入1XLoading Buffer緩沖液終止酶切反應(yīng)。酶切產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳進行分離檢測,使用AxyPr印DNA Gel Extract1n Kit(AXYGEN)的試劑盒進行回收并純化酶切產(chǎn)物,將其溶于20 μ L的ddH20中。酶切結(jié)果如圖2所示,其中,M:DL2000 Marker 山人與 pMD19_T Simple 連接后用用 BamHI 和 SacI 雙酶切。
      [0040] 5)連接反應(yīng)
      瓊脂糖凝膠電泳檢測酶切后所回收到的目的基因和載體PBI121,根據(jù)所檢測出的純度和濃度,按連接體系加入各試劑,16°C過夜連接。其中,目的片段分子數(shù):載體分子數(shù)=3:1-5:1,連接反應(yīng)體系為:2 μ L Τ4 DNA ligase buffer ( 10 X),2 μ L經(jīng)過酶切的表達載體,10 μ L 目的片段,I μ L Τ4 DNA ligase, ddH20 補充至 20 μ L。
      [0041 ] 6 )連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌
      將目的片段與載體PBI121連接后的產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌JM109超感細胞中,方法同實施例I。
      [0042]7)重組子的鑒定
      挑取平板上的單菌落接種到含有抗生素(卡那霉素)的LB液體培養(yǎng)基
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