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      熒光生物傳感器,其制備方法及其用途與流程

      文檔序號:12267769閱讀:2054來源:國知局
      熒光生物傳感器,其制備方法及其用途與流程

      本發(fā)明涉及熒光傳感器制備技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及熒光生物傳感器,其制備方法及其用途。



      背景技術(shù):

      在過去的幾十年,生物分子模板的熒光無機金屬納米顆粒具有獲得了大量的關(guān)注,在這些生物大分子中,DNA因其獨特的納米結(jié)構(gòu),優(yōu)良的可編程特性,包括雜環(huán)氮原子的豐富功能基團,氨基組和磷酸基團,它可以與特定的金屬離子結(jié)合,并提供金屬納米粒子的成核位點,成為了最佳的候選者。在過去的十年中,DNA為模板不同的熒光金屬納米顆粒已經(jīng)得到了深入的關(guān)注,如金納米粒子和銀納米粒子。最近幾年,一種新的熒光納米材料–DNA模板的銅納米粒子類(DNA-Cu NPs)作為熒光光探針,因其具有良好的生物相容性、成本低,易于制備,毒性低,優(yōu)異的熒光性能等優(yōu)點,已經(jīng)逐漸的應(yīng)用在構(gòu)建熒光生物傳感上。

      聚胸腺嘧啶單鏈(poly T)為模板的制備發(fā)熒光的Cu NPs最早由王課題組最早發(fā)現(xiàn)。隨后利用poly T為模板的作為發(fā)熒光的Cu NPs探針,運用在生物傳感器上檢測各種不同的生物物質(zhì)不斷被報道。與此同時增強Cu NPs的熒光效率成為關(guān)注的課題。盡管不久前,盧的小組設(shè)計了一種由多聚T環(huán)和一個隨機的雙鏈序列DNA序列為莖新型發(fā)夾DNA結(jié)構(gòu),作為Cu NPs形成的模板,以此來提高其熒光效率。但是我們?nèi)匀徊恢朗裁礌顟B(tài)下的聚T構(gòu)象可以直接影響Cu NPs的熒光信號。因此,基于聚T單鏈DNA模板,設(shè)計可控和高效的熒光Cu NPs仍然是一個挑戰(zhàn)。



      技術(shù)實現(xiàn)要素:

      針對以上現(xiàn)有技術(shù)問題,本發(fā)明的目的在于提供一種基于poly T為基礎(chǔ)的新型的“糖果”(CS)構(gòu)型的DNA結(jié)構(gòu),可以增強Cu NPs的熒光效率,并運用此構(gòu)造設(shè)計了一種無標記的熒光恢復(fù)的生物傳感器用于檢測特殊序列的DNA片段(目標DNA)。根據(jù)不同濃度的目標DNA,構(gòu)建線性關(guān)系,實現(xiàn)了對目標DNA基因靈敏性、特異性的檢測。具體技術(shù)方案如下:

      熒光生物傳感器的制備方法,包括如下步驟:

      (1)DNA用緩沖溶液稀釋到并儲存;

      (2)發(fā)夾DNA包括HP1,HP2,HP3和HP4使用前加熱,冷卻到室溫,使之形成發(fā)夾結(jié)構(gòu);

      (3)發(fā)夾HP1和目標DNA在緩沖溶液中混合,然后在反應(yīng)的溶液中加入exo III,溶液中的DNA位點被exo III切割完成后,使exo III失活;

      (4)釋放出DNAzyme,釋放的DNAzyme與HP3和HP2雜交,加入Zn2+溶液,Zn2+切割發(fā)夾DNA上的rA位點。

      進一步包括如下步驟:

      (5)S1和S2被釋放與HP4雜交;

      (6)點亮Cu NPs。

      進一步地,步驟(1)中,所有的DNA全部用10mMMOPS(3-(N-嗎啉基)丙磺酸)PH=7.6的緩沖溶液,稀釋到100μM,儲存在4℃中至少24小時后可用。

      進一步地,步驟(2)中,HP1,HP2,HP3和HP4使用前加熱到90℃,10分鐘,避免聚集,然后保持恒定搖速2h,讓其慢慢冷卻到室溫,使之形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。

      進一步地,步驟(3)中,包括如下步驟:

      (3-1)在切割酶(exo III)輔助的目標放大體系中:1μM的發(fā)夾HP1和目標DNA在緩沖溶液中,室溫下混合30分鐘;

      (3-2)在反應(yīng)的溶液中加入12U exo III,加熱到37℃,35分鐘;

      (3-3)溶液中的DNA位點被exo III切割完成;

      (3-4)將反應(yīng)溶液加熱到85℃,時間為15分鐘,使exo III失活。

      進一步地,步驟(4)中,釋放出DNAzyme(1),釋放的DNAzyme會與HP3和HP2雜交,加入1nM的Zn2+溶液,Zn2+切割發(fā)夾DNA上的rA位點,時間40分鐘。

      進一步地,步驟(5)中,S1和S2將被釋放與HP4雜交,形成雙通“糖果”結(jié)構(gòu)形成;和/或,步驟(6)中,加入16μL,100mM的抗化學酸鈉和8μL,10mΜ的硫酸銅,點亮Cu NPs,終體積是260μL。

      進一步地,步驟(1)之前還包括如下步驟:CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的制備:

      a.1DNA和2DNA用10mM MOPS緩沖溶液相互混合在離心管A里,各自的終濃度分別是500Nm;

      b.將混合溶液放在室溫下,20分鐘;

      c.DNA用10mM MOPS緩沖溶液稀釋在離心管B里,終濃度分別是1μM;

      d.在離心管A和B中均加入16μL100mM的抗壞血酸和8μL 10mΜ的CuSO4,終體積均為260μL。

      熒光生物傳感器,采用上述制備方法制備得到。

      上述熒光生物傳感器的用途,作為熒光探針用于檢測目標DNA。

      與目前現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了一種新型的“糖果”(CS)造型的DNA結(jié)構(gòu),相較于傳統(tǒng)的聚胸腺嘧啶單鏈(poly T)為模板的制備發(fā)熒光的銅納米粒子(Cu NPs),該方法增強了Cu NPs的熒光信號?;诖耸聦崳覀冊O(shè)計了一種新型的無標記的熒光恢復(fù)的生物傳感器,該傳感器利用了雙循環(huán)自動放大手段,能夠特異性的檢測一段特殊序列的DNA。

      提供基于聚胸腺嘧啶單鏈(poly T)DNA為基礎(chǔ)的“糖果”(CS)DNA結(jié)構(gòu),相較于傳統(tǒng)的poly T為模板的制備Cu NPs,CS DNA制備的Cu NPs的熒光信號明顯增強。可應(yīng)用于目標DNA的檢測。本發(fā)明公開了一種熒光生物傳感器的制備方法及其應(yīng)用,基于CS DNA結(jié)構(gòu),我們設(shè)計了一種新型的無標記的熒光恢復(fù)的生物傳感器,該傳感器利用了外切酶(exo III)和金屬離子切割的雙循環(huán)自動放大手段,特異性的檢測特殊序列的DNA。該傳感器具有很好的靈敏度,而且具有高的選擇性,價格低廉和操作簡單的特點。

      附圖說明

      圖1A為實施例1制備CS DNA的Cu NPs與攜帶poly T為模板的Cu NPs的熒光對比示意圖;

      圖1B為基于CS DNA可以增強Cu NPs的熒光的現(xiàn)象設(shè)計的檢測目標DNA的生物傳感器;

      圖2A為CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的熒光激發(fā)和發(fā)射光譜圖;

      圖2B1為CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的高分辨透射電鏡;

      圖2B2為各自的粒子大小分部統(tǒng)計數(shù);

      圖2C為CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的紫外吸收光譜圖;

      圖2D為CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的圓二色譜圖;

      圖2E為CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的的凝膠電泳;

      圖3A為對CS DNA Cu NPs頭尾DNA互補的堿基配對數(shù)對熒光強度的影響的研究;

      圖3B對CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs在不同PH的緩沖溶液中熒光強度的研究;

      圖3C對CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs在不同溫度培養(yǎng)下的熒光強度的研究;

      圖4A為基于CS DNA Cu NPs設(shè)計的傳感器的可行性圖;

      圖4B為該傳感器對目標DNA的檢測的線性原圖;

      圖4C為該傳感器對目標DNA的檢測的線性方程圖;

      圖5為熒光強度圖。

      具體實施方式

      下面根據(jù)附圖對本發(fā)明進行詳細描述,其為本發(fā)明多種實施方式中的一種優(yōu)選實施例。

      在一個優(yōu)選實施例中,熒光生物傳感器的制備方法,包括以下步驟:

      (1)、將1DNA溶液和2DNA溶液雜交形成CS DNA與3DNA(攜帶poly T),分別加入硫酸銅和抗化學酸以此點亮Cu NPs,將兩者的熒光強度進行對比;

      (2)、將步驟(1)制備的CS DNA用于熒光生物傳感器的設(shè)計中:發(fā)夾DNA(HP1)的尾端可以和目標DNA堿基互補配對,加入剪切酶exoIII可以特異性剪切互補配對的發(fā)夾DNA,從而釋放目標DNA和DNA模擬酶1,釋放的目標DNA可以不斷進行循環(huán)作用。在發(fā)夾DNA(HP2和HP3)的加入下,模擬酶的自由莖端可以和HP2和HP3配對形成結(jié)構(gòu)2,Zn2+的加入可以對存在HP2和HP3上的rA堿基進行切割,從而釋放出S2和S3。此體系引入發(fā)夾HP4DNA后,S2和S3的存在可以打開發(fā)夾HP4DNA,從而形成雙通的“糖果”DNA結(jié)構(gòu),最終加入硫酸銅和抗化學酸可以點亮Cu NPs。Cu NPs作為熒光探針,可制備無標記的熒光生物傳感器用于檢測目標DNA。

      步驟(1)中CS DNA Cu NPs和poly T Cu NPs的制備:首先,1DNA和2DNA用10mM MOPS緩沖溶液相互混合在離心管A里,各自的終濃度分別是500nM,將混合溶液放在室溫下,20分鐘。3DNA用10mM MOPS緩沖溶液稀釋在離心管B里,終濃度分別是1μM。然后在離心管A和B中均加入16μL100mM的抗壞血酸和8μL 10mΜ的CuSO4,終體積均為260μL。

      步驟(2)具體為:(1)所有的DNA全部用10mM MOPS(3-(N-嗎啉基)丙磺酸)PH=7.6的緩沖溶液,稀釋到100μM,儲存在4℃中至少24小時后可用。實驗過程中所用的稀釋液都為MOPS緩沖溶液。(2)HP1,HP2,HP3和HP4使用前加熱到90℃,10分鐘,避免聚集。然后保持恒定搖速2h,讓其慢慢冷卻到室溫,使之形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。(3)在切割酶(exo III)輔助的目標放大體系中:1μM的發(fā)夾HP1和目標DNA在緩沖溶液中,室溫下混合30分鐘。然后在反應(yīng)的溶液中加入12U exo III,加熱到37℃,35分鐘。溶液中的DNA位點被exo III切割完成后,將反應(yīng)溶液加熱到85℃,時間為15分鐘,使exo III失活。(4)以上的步驟完成后,釋放出DNAzyme(1),釋放的DNAzyme會與HP3和HP2雜交,加入1nM的Zn2+溶液,Zn2+切割發(fā)夾DNA上的rA位點,時間40分鐘。(5)以上的步驟完成后,S1和S2將被釋放與HP4雜交,形成雙通“糖果”結(jié)構(gòu)形成。(6)最后,加入16μL,100mM的抗化學酸鈉和8μL,10mΜ的硫酸銅,點亮Cu NPs,終體積是260μL。

      檢測目標DNA的應(yīng)用,應(yīng)用方法具體為:發(fā)現(xiàn)一種改進傳統(tǒng)的poly T為模板的新型CS DNA為模板制備Cu NPs,并利用該信號為熒光探針制備的熒光生物傳感器,不同濃度的目標DNA的加入致使熒光信號強度不同,構(gòu)建線性關(guān)系,實現(xiàn)了對熒光生物傳感器靈敏性、特異性的檢測。

      在另一個優(yōu)選實施例中,可以采用如下方案:熒光生物傳感器的制備方法,包括以下步驟:所有的DNA全部用10mMMOPS(3-(N-嗎啉基)丙磺酸)PH=7.6的緩沖溶液,稀釋到100μM,儲存在4℃中至少24小時后可用。實驗過程中所用的稀釋液都為MOPS緩沖溶液。HP1,HP2,HP3和HP4使用前加熱到90℃,10分鐘,避免聚集。然后保持恒定搖速2h,讓其慢慢冷卻到室溫,使之形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。在切割酶(exo III)輔助的目標放大體系中:1μM的發(fā)夾HP1和目標DNA在緩沖溶液中,室溫下混合30分鐘。然后在反應(yīng)的溶液中加入12U exo III,加熱到37℃,35分鐘。溶液中的DNA位點被exo III切割完成后,將反應(yīng)溶液加熱到85℃,時間為15分鐘,使exo III失活。以上的步驟完成后,釋放出DNAzyme(1),釋放的DNAzyme會與HP3和HP2雜交,加入1nM的Zn2+溶液,Zn2+切割發(fā)夾DNA上的rA位點,時間40分鐘。以上的步驟完成后,S1和S2將被釋放與HP4雜交,形成雙通“糖果”結(jié)構(gòu)形成。最后,加入16μL,100mM的抗化學酸鈉和8μL,10mΜ的硫酸銅,點亮Cu NPs,終體積是260μL。

      上面結(jié)合附圖對本發(fā)明進行了示例性描述,顯然本發(fā)明具體實現(xiàn)并不受上述方式的限制,只要采用了本發(fā)明的方法構(gòu)思和技術(shù)方案進行的各種改進,或未經(jīng)改進直接應(yīng)用于其它場合的,均在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。

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