專利名稱：中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法及其系統(tǒng)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及中藥心血管毒性分析相關(guān)技術(shù)領(lǐng)域，特別是中藥心血管毒性分析的 計算機(jī)操作方法及其系統(tǒng)。
背景技術(shù)：
中藥進(jìn)入世界市場是大勢所趨，中藥如果要得到國際醫(yī)藥主流社會的接受，首先 要解決的是藥物安全性的問題，心血管毒性是藥物安全性評價的重要指標(biāo)之一。然而，心血 管毒性評價實驗周期長、代價昂貴，是中藥進(jìn)入世界市場的瓶頸問題。發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的第一個發(fā)明目的，在于提供中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法，以 解決現(xiàn)有技術(shù)中，中藥心血管毒性分析時間周期過長的技術(shù)問題。
為了實現(xiàn)本發(fā)明的第一個發(fā)明目的，采用的技術(shù)方案如下 一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法，所述方法包括以下步驟 獲取中藥檢索信息的獲取步驟；根據(jù)檢索信息從數(shù)據(jù)庫中獲取中藥信息的檢索步驟； 顯示中藥信息的顯示步驟。
作為一種優(yōu)選方案，所述中藥檢索信息包括中藥名稱和/或中藥處方和/或活性 成分結(jié)構(gòu)。
作為進(jìn)一步的優(yōu)選方案，所述數(shù)據(jù)庫包括中藥數(shù)據(jù)庫和心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫。
作為更進(jìn)一步的優(yōu)選方案，所述中藥信息包括中藥的基本信息和/或文字記載 的毒性信息和/或毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
作為再進(jìn)一步的優(yōu)選方案，如果獲取的中藥檢索信息為中藥名稱，則所述檢索步 驟具體包括根據(jù)中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取中藥的基本信息、文字記載的毒性信息、活性 成分結(jié)構(gòu)；根據(jù)獲取的活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī) 則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
作為再進(jìn)一步的優(yōu)選方案，如果獲取的中藥檢索信息為中藥處方，則所述檢索步 驟具體包括根據(jù)中藥處方從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索所述中藥處方所包含的所有的中藥名稱； 根據(jù)每個中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取每個中藥的基本信息、文字記載的毒性信 息、活性成分結(jié)構(gòu)；根據(jù)獲取的活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī) 則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
作為再進(jìn)一步的優(yōu)選方案，如果獲取的中藥檢索信息為活性成分結(jié)構(gòu)，則所述檢索步驟具體包括根據(jù)活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒 性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
作為更進(jìn)一步的優(yōu)選方案，所述活性結(jié)構(gòu)比較規(guī)則為將活性成分結(jié)構(gòu)與心血管 毒性分子數(shù)據(jù)庫中的所有毒性分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行相似度計算，大于閾值的毒性分子結(jié)構(gòu)為滿足 活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒性分子結(jié)構(gòu)。
優(yōu)選地，所述閾值為75%。
所述相似度計算的具體方式如下對所需檢索的活性成分結(jié)構(gòu)的分子結(jié)構(gòu)A拆分片段，得到包含多個片段的片段組FA = Ifa1, fa2, fa3- faj，其中 為第 m 個片段；對心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中保存的第一毒性分子結(jié)構(gòu)B，拆分片段，得到包含多個片段 的片段組FB = {仇，徹，取…溈山其中^為第??！個片段; 計算相似度 S (A，B) = (FA Π FB) / (FA U FB)。
m和η可以為不同的數(shù)值，也可以相同。
本發(fā)明的第二個發(fā)明目的，在于提供一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)，以 實現(xiàn)本發(fā)明第一個發(fā)明目的所提供的一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法。
一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)，所述系統(tǒng)包括 用于獲取中藥檢索信息的獲取模塊；根據(jù)檢索信息從數(shù)據(jù)庫中獲取中藥信息的檢索模塊； 顯示中藥信息的顯示模塊；所述數(shù)據(jù)庫包括中藥數(shù)據(jù)庫和心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫，所述檢索模塊包括中藥名稱檢 索子模塊、中藥處方子模塊和活性成分結(jié)構(gòu)子模塊；中藥名稱子模塊根據(jù)中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取中藥的基本信息、文字記載的 毒性信息、活性成分結(jié)構(gòu)；中藥處方子模塊根據(jù)中藥處方從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索所述中藥處方所包含的所有的中 藥名稱；活性成分結(jié)構(gòu)子模塊根據(jù)活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成 分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
本發(fā)明通過對中藥進(jìn)行檢索，從而使用戶知道某一味中藥可能有心血管毒性，達(dá) 到中藥心血管毒性預(yù)測的目的。通過預(yù)測中藥心血管毒性，提高心血管毒性評價實驗的目 的性，減少資源浪費，加快中藥進(jìn)入世界市場的進(jìn)程。


圖1是本發(fā)明實施例系統(tǒng)運行過程說明圖； 圖2是本發(fā)明實施例系統(tǒng)結(jié)構(gòu)示意圖；圖3是本發(fā)明實施例系統(tǒng)功能模塊圖； 圖4是本發(fā)明實施例預(yù)測方法的說明圖。
具體實施方式
下面結(jié)合附圖和具體實施例對本發(fā)明做進(jìn)一步詳細(xì)的說明。
圖1給出了這種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)運行過程說明，首先用戶檢索 使用，可以通過檢索中藥的名稱，也可以檢索處方，還可以通過結(jié)構(gòu)進(jìn)行檢索。用戶輸入的 中藥名稱自動進(jìn)入中藥數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索查詢獲取中藥的基本信息、文字記載的毒性信息、 活性成分結(jié)構(gòu)信息等；處方名稱自動進(jìn)入中藥材數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索獲取處方由哪些中藥組 成，再自動將處方中的每一味中藥進(jìn)行檢索獲取其中藥的基本信息、文字記載的毒性信息、 活性成分結(jié)構(gòu)信息等；中藥的基本信息、文字記載的毒性信息直接反饋給用戶，活性成分結(jié) 構(gòu)信息則自動進(jìn)入毒性小分子庫進(jìn)行檢索，找出哪些毒性小分子的結(jié)構(gòu)與中藥的活性成分 結(jié)構(gòu)相似，把相似的結(jié)構(gòu)列出來，同時給出描述這個毒性結(jié)構(gòu)的文字信息，再將這部分反饋 給用戶；結(jié)構(gòu)檢索則直接進(jìn)入毒性小分子數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，取得毒性分子結(jié)構(gòu)與文字描述 信息反饋給用戶，化合物結(jié)構(gòu)檢索可以進(jìn)行單分子檢索也可以上傳分子結(jié)構(gòu)庫進(jìn)行多個分 子同時檢索。
對毒性小分子庫中的分子結(jié)構(gòu)與所需檢索的活性成分結(jié)構(gòu)信息進(jìn)行相似度計算 的方式如下1.將分子結(jié)構(gòu)拆分成若干片段，按照以下公式進(jìn)行相似度計算 分子結(jié)構(gòu)A和分子結(jié)構(gòu)B，拆分片段分子結(jié)構(gòu)A的片段FA = {fai，fa2，ftv"fam}、分 子結(jié)構(gòu)B的片段FB = {溈1，溈2，溈3...溈山相似度3(八，8) = (FA Π FB) / (FA U FB)。
2.返回相似度S大于預(yù)先設(shè)定的閾值的分子結(jié)構(gòu)，優(yōu)選地選擇閾值為75%。
圖2給出了這種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)示意圖。
一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)200，所述系統(tǒng)200包括 用于獲取中藥檢索信息的獲取模塊210 ；根據(jù)檢索信息從數(shù)據(jù)庫220中獲取中藥信息的檢索模塊230 ； 顯示中藥信息的顯示模塊M0。
所述數(shù)據(jù)庫220包括中藥數(shù)據(jù)庫221和心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫222，所述檢索模塊 230包括中藥名稱檢索子模塊231、中藥處方子模塊232和活性成分結(jié)構(gòu)子模塊233 ；中藥名稱子模塊根據(jù)中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取中藥的基本信息、文字記載的 毒性信息、活性成分結(jié)構(gòu)；中藥處方子模塊根據(jù)中藥處方從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索所述中藥處方所包含的所有的中 藥名稱；活性成分結(jié)構(gòu)子模塊根據(jù)活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成 分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
圖3給出了這種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)的功能模塊。
輸入模塊用于實現(xiàn)用戶輸入的功能，可以進(jìn)行文字輸入、結(jié)構(gòu)輸入和化合物結(jié)構(gòu) 庫上傳輸入等(即所述獲取模塊210)。
顯示模塊用于實現(xiàn)系統(tǒng)查詢計算的結(jié)果顯示呈現(xiàn)的功能。既有文字信息也有結(jié)構(gòu) 信息(即所述顯示模塊對0)。
存儲模塊用于實現(xiàn)各個數(shù)據(jù)庫221及222的讀取存放功能。
信息處理模塊主要用于實現(xiàn)化合物結(jié)構(gòu)相似度計算功能。
(存儲模塊與信息處理模塊共同構(gòu)成所述檢索模塊)用戶子系統(tǒng)用于實現(xiàn)用戶的創(chuàng)建登陸解決多用戶沖突等問題的功能。
安全檢測子系統(tǒng)保障系統(tǒng)能夠按照設(shè)定的程序正常運行。
信息錄入子系進(jìn)行后臺操作，用于實現(xiàn)數(shù)據(jù)庫的更新功能。
圖4說明解釋了這種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法。即在中藥活性成分 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行檢索，將某味中藥的活性成分分子結(jié)構(gòu)送到心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行相 似度計算，將大于閾值的結(jié)構(gòu)(包括中藥活性成分結(jié)構(gòu)和心血管毒性分子結(jié)構(gòu))反饋顯示出 來，再結(jié)合其文字描述信息一并反饋給用戶，使得用戶知道到某一味中藥可能有心血管毒 性，達(dá)到中藥心血管毒性預(yù)測的目的。
權(quán)利要求
1.一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟獲取中藥檢索信息的獲取步驟； 根據(jù)檢索信息從數(shù)據(jù)庫中獲取中藥信息的檢索步驟； 顯示中藥信息的顯示步驟。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的操作方法，其特征在于，所述中藥檢索信息包括中藥名稱和 /或中藥處方和/或活性成分結(jié)構(gòu)。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的操作方法，其特征在于，所述數(shù)據(jù)庫包括中藥數(shù)據(jù)庫和心血 管毒性分子數(shù)據(jù)庫。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的操作方法，其特征在于，所述中藥信息包括中藥的基本信息 和/或文字記載的毒性信息和/或毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的操作方法，其特征在于，如果獲取的中藥檢索信息為中藥名 稱，則所述檢索步驟具體包括根據(jù)中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取中藥的基本信息、文字記載的毒性信息、活性 成分結(jié)構(gòu)；根據(jù)獲取的活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī) 則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的操作方法，其特征在于，如果獲取的中藥檢索信息為中藥處 方，則所述檢索步驟具體包括根據(jù)中藥處方從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索所述中藥處方所包含的所有的中藥名稱； 根據(jù)每個中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取每個中藥的基本信息、文字記載的毒性信 息、活性成分結(jié)構(gòu)；根據(jù)獲取的活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī) 則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
7.根據(jù)權(quán)利要求4所述的操作方法，其特征在于，如果獲取的中藥檢索信息為活性成 分結(jié)構(gòu)，則所述檢索步驟具體包括根據(jù)活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒 性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
8.根據(jù)權(quán)利要求5 7任一項所述的操作方法，其特征在于，所述活性結(jié)構(gòu)比較規(guī)則 為將活性成分結(jié)構(gòu)與心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中的所有毒性分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行相似度計算，大 于閾值的毒性分子結(jié)構(gòu)為滿足活性成分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒性分子結(jié)構(gòu)。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的操作方法，其特征在于，所述相似度計算的具體方式如下 對所需檢索的活性成分結(jié)構(gòu)的分子結(jié)構(gòu)A拆分片段，得到包含多個片段的片段組FA =Ifa1, fa2, fa3- faj，其中 為第 m 個片段；對心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中保存的第一毒性分子結(jié)構(gòu)B，拆分片段，得到包含多個片段 的片段組FB = {仇，徹，取…溈山其中^為第?。€片段; 計算相似度 S (A，B) = (FA Π FB) / (FA U FB)。
10.一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)系統(tǒng)，用于實現(xiàn)權(quán)利要求1 8任一項所述的方 法，其特征在于，所述系統(tǒng)包括用于獲取中藥檢索信息的獲取模塊； 根據(jù)檢索信息從數(shù)據(jù)庫中獲取中藥信息的檢索模塊； 顯示中藥信息的顯示模塊；所述數(shù)據(jù)庫包括中藥數(shù)據(jù)庫和心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫，所述檢索模塊包括中藥名稱檢 索子模塊、中藥處方子模塊和活性成分結(jié)構(gòu)子模塊；中藥名稱子模塊根據(jù)中藥名稱從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索獲取中藥的基本信息、文字記載的 毒性信息、活性成分結(jié)構(gòu)；中藥處方子模塊根據(jù)中藥處方從中藥數(shù)據(jù)庫中檢索所述中藥處方所包含的所有的中 藥名稱；活性成分結(jié)構(gòu)子模塊根據(jù)活性成分結(jié)構(gòu)，從心血管毒性分子數(shù)據(jù)庫中選擇滿足活性成 分結(jié)構(gòu)比較規(guī)則的毒性分子結(jié)構(gòu)及其文字描述信息。
全文摘要
本發(fā)明涉及中藥心血管毒性分析相關(guān)技術(shù)領(lǐng)域，特別是中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法及其系統(tǒng)。一種中藥心血管毒性分析的計算機(jī)操作方法，所述方法包括以下步驟獲取中藥檢索信息的獲取步驟；根據(jù)檢索信息從數(shù)據(jù)庫中獲取中藥信息的檢索步驟；顯示中藥信息的顯示步驟。本發(fā)明通過對中藥進(jìn)行檢索，從而使用戶知道某一味中藥可能有心血管毒性，達(dá)到中藥心血管毒性預(yù)測的目的。通過預(yù)測中藥心血管毒性，提高心血管毒性評價實驗的目的性，減少資源浪費，加快中藥進(jìn)入世界市場的進(jìn)程。
文檔編號G06F17/30GK102043864SQ20101061505
公開日2011年5月4日 申請日期2010年12月30日 優(yōu)先權(quán)日2010年12月30日
發(fā)明者盧峰, 徐峻, 顧瓊 申請人:中山大學(xué)