用于導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的方法和設(shè)備的制作方法
【專利摘要】本公開內(nèi)容涉及用于導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的方法和設(shè)備。一種用于在顯微成像中導(dǎo)航圖像的方法，所述方法包括：減少樣本的原始圖像序列的維數(shù)以用于使用全對(duì)焦圖像進(jìn)行導(dǎo)航，并且將用于導(dǎo)航原始圖像序列和全對(duì)焦圖像的用戶界面提供給用戶。
【專利說(shuō)明】用于導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的方法和設(shè)備
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明的實(shí)施例大體上涉及管理數(shù)字顯微圖像，更具體地，涉及一種用于導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的方法和設(shè)備。
【背景技術(shù)】
[0002]在數(shù)字顯微術(shù)中，整個(gè)載片圖像(whole-slide image)通常米取Z疊層(Z-stack)的形式(所述Z疊層是圖像的集合)，每個(gè)圖像以不同的焦深拍攝。數(shù)字顯微術(shù)利用虛擬載片系統(tǒng)，所述虛擬載片系統(tǒng)具有創(chuàng)建整個(gè)玻璃載片的數(shù)字圖像文件的自動(dòng)化數(shù)字載片掃描器。數(shù)字圖像文件被稱為整個(gè)載片圖像，在一些實(shí)施例中，所述整個(gè)載片圖像具有大約100，000像素X 100，000像素的空間分辨率。因此，Z疊層通常為大型數(shù)據(jù)集。由于Z疊層的大小大，所以Z疊層的導(dǎo)航變得繁瑣和費(fèi)時(shí)。對(duì)于高倍率，捕捉樣本的幾個(gè)切片的圖像對(duì)于確保樣本的對(duì)焦捕捉可能是必要的。例如，可能需要32個(gè)至64個(gè)圖像。瀏覽和分析示例性大小為100，000X100, 000X64個(gè)像素的3D數(shù)據(jù)集對(duì)于操作者變?yōu)榉爆嵉娜蝿?wù)。
[0003]因而，需要一種用于導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的方法和設(shè)備。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004]一種用于在顯微術(shù)中導(dǎo)航堆疊的圖像的設(shè)備和/或方法基本上如與附圖中的至少一個(gè)結(jié)合所示和/或描述的那樣、如權(quán)利要求中更完整地闡述的那樣。
[0005]從以下描述和附圖中，本公開內(nèi)容的各種優(yōu)點(diǎn)、方面和新穎特征以及本公開內(nèi)容的示出的實(shí)施例的細(xì)節(jié)將被更充分地理解。
【專利附圖】

【附圖說(shuō)明】
[0006]為了本發(fā)明的以上陳述特征可被詳細(xì)地理解，可參照實(shí)施例對(duì)以上簡(jiǎn)要總結(jié)的本發(fā)明進(jìn)行更具體地描述，這些實(shí)施例中的一些在附圖中示出。然而，要指出，附圖僅僅示出了本發(fā)明的典型實(shí)施例，因此并不被認(rèn)為是本發(fā)明的范圍的限制，因?yàn)楸景l(fā)明可認(rèn)可其他同樣有效的實(shí)施例。
[0007]圖1描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用于使用數(shù)字顯微鏡來(lái)導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的設(shè)備的框圖；
[0008]圖2描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的示例性Z疊層；
[0009]圖3描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的圖2的數(shù)字圖像的五個(gè)單個(gè)切片；
[0010]圖4描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用于為當(dāng)前正被查看的內(nèi)容提供上下文的概覽窗口的例子；
[0011]圖5描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的關(guān)于圖2和圖3中所示的快照的全對(duì)焦圖像(all-focus image)的例子；
[0012]圖6描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用于使用數(shù)字顯微鏡來(lái)在顯微術(shù)中導(dǎo)航圖像的方法的流程圖；[0013]圖7描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第一表現(xiàn)形式(manifestation)的例子；
[0014]圖8描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第二表現(xiàn)形式的例子；
[0015]圖9描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第三表現(xiàn)形式的例子；
[0016]圖10描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第四表現(xiàn)形式的例子；
[0017]圖11描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第五表現(xiàn)形式的例子；和
[0018]圖12描繪根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第六表現(xiàn)形式的例子。
【具體實(shí)施方式】
[0019]本發(fā)明的實(shí)施例針對(duì)基本上如與附圖中的至少一個(gè)結(jié)合所示和/或描述的、如權(quán)利要求中更完整地闡述的、用于在顯微成像中導(dǎo)航圖像的設(shè)備和/或方法。根據(jù)實(shí)施例，用于在顯微成像中導(dǎo)航圖像的方法包括:使用樣本的全對(duì)焦圖像從而減少正被導(dǎo)航的數(shù)據(jù)的維數(shù)，以及使用快照到聚焦特征(snap to focus feature),所述快照到聚焦特征通過(guò)從原始載片的Z疊層示出最相關(guān)圖像來(lái)達(dá)到聚焦于樣本的用戶指定部分。
[0020]圖1描繪了根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用于使用數(shù)字顯微鏡102來(lái)導(dǎo)航堆疊的顯微圖像的設(shè)備100的框圖。設(shè)備100包括數(shù)字顯微鏡102和計(jì)算裝置104。
[0021]數(shù)字顯微鏡102在不同深度處捕捉樣本的數(shù)字圖像，以創(chuàng)建圖像序列，即，圖像的Z疊層。為了說(shuō)明的目的，數(shù)字圖像序列用以下表達(dá)式表示:I(X，y，z)，其中，(x，y)是空間索弓I，X=O至X -1, y=0至Y -1, Z是深度索弓I, Z=O至Z -1 [表達(dá)式A]。
[0022]在某些實(shí)施例中，數(shù)字顯微鏡102通過(guò)I/O接口 112與計(jì)算裝置104耦合。在其他實(shí)施例中，圖像疊層可由顯微鏡102創(chuàng)建，并且例如經(jīng)由記憶棒、光盤、網(wǎng)絡(luò)連接等等被間接地傳送到計(jì)算裝置104。
[0023]計(jì)算裝置104包括中央處理單元(或CPU)106、支持電路108、存儲(chǔ)器110和I/O接口 112。CPU106可包括便于數(shù)據(jù)處理和存儲(chǔ)的一個(gè)或多個(gè)市售的微處理器或微控制器。各種支持電路108便于CPU106的操作，并且包括一個(gè)或多個(gè)時(shí)鐘電路、電源、高速緩存、輸入/輸出電路等等。存儲(chǔ)器110包括只讀存儲(chǔ)器(ROM)、隨機(jī)存取存儲(chǔ)器(RAM)、盤驅(qū)動(dòng)器儲(chǔ)存器、光學(xué)儲(chǔ)存器、可移動(dòng)儲(chǔ)存器等等中的至少一個(gè)。
[0024]存儲(chǔ)器110包括操作系統(tǒng)(OS) 114和圖像導(dǎo)航模塊116。圖像導(dǎo)航模塊116包括全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器118和用戶界面120。在某些實(shí)施例中，用戶界面120可被呈現(xiàn)到與I/O接口 112耦合的外部顯示器。
[0025]全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器118產(chǎn)生全對(duì)焦圖像。如本文中所使用的，術(shù)語(yǔ)“全對(duì)焦圖像”是指載片上的樣本的圖像序列的Z疊層從三維到兩維的減少，以使得結(jié)果包含對(duì)焦的整個(gè)樣本。根據(jù)一個(gè)實(shí)施例，如共同轉(zhuǎn)讓的美國(guó)專利申請(qǐng)代理人案號(hào)#201003513.01中所述的，通過(guò)根據(jù)特定測(cè)量對(duì)每個(gè)圖像進(jìn)行加權(quán)并相應(yīng)地組合加權(quán)的圖像來(lái)形成全對(duì)焦圖像，該申請(qǐng)的全部?jī)?nèi)容特此通過(guò)引用并入。全對(duì)焦圖像是Z疊層中的在每個(gè)焦深處對(duì)焦的圖像的部分的合成。
[0026]在操作中，計(jì)算裝置104實(shí)施圖像導(dǎo)航模塊116。圖像導(dǎo)航模塊116便于使用數(shù)字顯微鏡102捕捉的樣本的顯微圖像的導(dǎo)航。圖像導(dǎo)航模塊116允許根據(jù)用戶的需要鏈接回到原始圖像序列。[0027]圖2描繪了數(shù)字顯微鏡102產(chǎn)生的示例性Z疊層200。Z疊層中的每個(gè)圖像在樣本中的不同深度處聚焦。數(shù)字顯微鏡102在不同焦深處捕捉樣本的數(shù)字圖像，以創(chuàng)建圖像序列。因而，在樣本的整個(gè)深度上遞增焦深，以在數(shù)字圖像中的至少一個(gè)中捕捉對(duì)焦的整個(gè)樣本。在Z疊層中，除了空間維度X和Y之外，數(shù)字圖像序列還沿著與深度對(duì)應(yīng)的Z維度堆疊。
[0028]圖3描繪了根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的來(lái)自圖2的Z疊層的五個(gè)單個(gè)圖像。圖3示出了具有不同對(duì)焦區(qū)域的每個(gè)圖像。隨著用戶使數(shù)字顯微鏡102聚焦，來(lái)自Z疊層200的不同圖像被示出給用戶，所述不同圖像表示樣本中的特定焦深和在該深度處對(duì)焦的樣本部分。
[0029]圖4描繪了根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用于為當(dāng)前正被查看的內(nèi)容提供上下文的概覽窗口 402的例子。
[0030]由全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器118產(chǎn)生的全對(duì)焦圖像表示Z疊層中存在的全部對(duì)焦信息而沒有散焦模糊。視圖402示出了被縮小以示出全部樣本內(nèi)容的整個(gè)載片視圖。根據(jù)一個(gè)實(shí)施例，視圖402的被選擇部分404由用戶界面120的用戶確定。被選擇部分404在視圖406中被示為被選擇部分的放大視圖。
[0031]圖5描繪了根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的關(guān)于圖4中所示的404中的視圖的全對(duì)焦圖像500的例子。全對(duì)焦圖像500由如圖1所示的圖像導(dǎo)航模塊116的全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器118產(chǎn)生。
[0032]圖6描繪了根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的、如由圖1的CPU106執(zhí)行的圖像導(dǎo)航模塊116所進(jìn)行的、用于導(dǎo)航顯微圖像的方法600的流程圖。該方法從步驟602開始，并前進(jìn)到步驟604。
[0033]在步驟604，方法600將用戶界面提供給用戶來(lái)選擇由形成Z疊層的圖像集組成的全對(duì)焦圖像的一部分。如上所述，數(shù)字顯微鏡102生成兩維(2D)圖像序列，每個(gè)2D圖像具有X和Y分量。2D圖像序列被收集，并且每個(gè)2D圖像被分配“Z”維度，從而形成在數(shù)字顯微鏡102中被查看的樣本的3D表示(又被稱為Z疊層)。如相關(guān)的共同轉(zhuǎn)讓的、美國(guó)專利申請(qǐng)代理人案號(hào)#201003513.01中所述的，圖5中所示的全對(duì)焦圖像500表示混合在一起的Z置層。
[0034]在步驟606，方法600顯示來(lái)自Z疊層的在全對(duì)焦圖像的被選擇部分處對(duì)焦的圖像。在某些實(shí)施例中，圖像導(dǎo)航模塊116便于由全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器118產(chǎn)生的全對(duì)焦圖像在I/O接口 112上的用于直接瀏覽的表現(xiàn)(或呈現(xiàn))。在某些使用情況場(chǎng)景下，如果用戶在所表現(xiàn)的全對(duì)焦圖像或概覽圖像(其是包含樣本的整個(gè)載片的所捕捉的圖像)中找到感興趣區(qū)域，則圖像導(dǎo)航模塊116的用戶界面120允許切換到原始Z疊層的與該感興趣區(qū)域相關(guān)聯(lián)的視圖。
[0035]根據(jù)一個(gè)實(shí)施例，結(jié)合全對(duì)焦圖像與原始Z疊層之間的調(diào)換，用戶界面120僅將全對(duì)焦圖像的視圖提供給用戶以用于最初瀏覽。在替代實(shí)施例中，用戶界面120將分屏視圖提供給用戶，在分屏視圖中，屏幕的一部分示出全對(duì)焦圖像的窗口，屏幕的另一部分示出原始Z疊層的窗口。分屏視圖的這兩個(gè)窗口可重疊或不重疊。原始Z疊層的窗口可持續(xù)存在，或者它可僅在被用戶指示時(shí)才可見。在又一實(shí)施例中，原始Z疊層的窗口可持續(xù)存在，或者它可僅在被用戶指示時(shí)才可見。[0036]在某些實(shí)施例中，用戶界面120允許用戶識(shí)別全對(duì)焦圖像和原始Z疊層中的至少一個(gè)中的點(diǎn)(X，y)或者圍繞點(diǎn)(X，y)的區(qū)域。當(dāng)點(diǎn)(X，y)或者圍繞點(diǎn)(x, y)的區(qū)域被識(shí)別時(shí)，在用戶界面120上呈現(xiàn)的Z疊層視圖中，顯示的圖像允許切換到在點(diǎn)(x，y)或者圍繞點(diǎn)(x, y)的區(qū)域處對(duì)焦最多的圖像。通過(guò)下述方式來(lái)知道圖像在特定點(diǎn)處對(duì)焦最多，即，確定Z疊層之中的哪個(gè)圖像被標(biāo)記為了在該位置處聚焦。如果點(diǎn)(x，y)具有多于一個(gè)唯一聚焦深度，則圖像導(dǎo)航模塊116便于將來(lái)自原始Z疊層數(shù)據(jù)的多個(gè)切片表現(xiàn)給用戶。
[0037]根據(jù)一個(gè)實(shí)施例，圖像導(dǎo)航模塊116的用戶界面120允許隨著用戶選擇區(qū)域而遍歷不同的對(duì)焦圖像循環(huán)。在其他實(shí)施例中，圖像導(dǎo)航模塊116便于將不同意義分配給不同輸入選擇方法。例如，鼠標(biāo)左按鈕點(diǎn)擊事件觸發(fā)最多對(duì)焦切片的選擇，而右按鈕點(diǎn)擊事件觸發(fā)第二多對(duì)焦切片的選擇。在以上所有情況下，通過(guò)任何手段(比如，鍵盤、鼠標(biāo)、觸控板、軌跡球、觸摸屏、控制器手柄、基于手勢(shì)的用戶接口等等)來(lái)控制瀏覽。在以上所有情況下，圖像導(dǎo)航模塊116的用戶界面120呈現(xiàn)概覽窗口來(lái)指示主窗口的上下文。
[0038]在涉及全對(duì)焦圖像和Z疊層數(shù)據(jù)兩者的顯示的某些實(shí)施例中，這兩個(gè)圖像的視點(diǎn)被同步，即，用于全對(duì)焦圖像顯示的顯示器示出與用于Z疊層數(shù)據(jù)的顯示器所示出的空間區(qū)域相同的空間區(qū)域。
[0039]在某些實(shí)施例中，用戶界面120允許用戶瀏覽全對(duì)焦圖像，并且確保所有細(xì)節(jié)(t匕如，對(duì)焦內(nèi)容)對(duì)于用戶同時(shí)可見。用戶界面120允許用戶在兩個(gè)空間維度上瀏覽，而沒有附加的瀏覽第三深度維度的復(fù)雜性。用戶界面120允許用戶找到感興趣的對(duì)象或區(qū)域以及訪問和查看原始Z疊層數(shù)據(jù)(如果需要的話)。方法600前進(jìn)到步驟608，并且結(jié)束。
[0040]在圖7-12中，公開了用戶界面120的不同表現(xiàn)形式的幾個(gè)例子，但是用戶界面120不限于所描繪的表現(xiàn)形式。
[0041]圖7是根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第一表現(xiàn)形式700的例子。如圖7所示，全對(duì)焦圖像的單個(gè)窗口可見。用戶界面120允許瀏覽全對(duì)焦圖像，并且當(dāng)被用戶指示時(shí)，全對(duì)焦圖像的窗口被切換到原始Z疊層數(shù)據(jù)。用戶界面120的第一表現(xiàn)形式允許用戶快速地找到樣本中感興趣的區(qū)域(即，區(qū))，其后可手動(dòng)地調(diào)整細(xì)焦點(diǎn)。
[0042]圖8是根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第二表現(xiàn)形式800的例子。如圖8所示，全對(duì)焦圖像802和Z疊層804都被同時(shí)示出在同一屏幕800上。屏幕800通過(guò)包括一對(duì)窗口的矩形框指示，該對(duì)窗口中的一個(gè)用于全對(duì)焦圖像802，另一個(gè)用于Z疊層804。這對(duì)窗口的視圖被同步，以使得即使當(dāng)圖像被空間地瀏覽時(shí)，相同內(nèi)容在這對(duì)窗口中也是可見的。
[0043]圖9是根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第三表現(xiàn)形式900的例子。如圖9所示，全對(duì)焦圖像902和Z疊層904被示出在采用多顯示環(huán)境的分開的屏幕上。屏幕用一對(duì)矩形框指示。左矩形框包括用于全對(duì)焦圖像902的窗口，而右矩形框包括用于Z疊層904的窗口。這對(duì)窗口的視圖被同步，以使得當(dāng)圖像被空間地瀏覽時(shí)，相同內(nèi)容在兩個(gè)窗口中可見。
[0044]圖10是根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第四表現(xiàn)形式1000的例子。如圖10所示，鼠標(biāo)光標(biāo)1005懸停在顯示窗口 1002中的全對(duì)焦圖像上方。區(qū)1006處的全對(duì)焦圖像上的鼠標(biāo)點(diǎn)擊事件觸發(fā)全對(duì)焦圖像中的點(diǎn)的選擇。原始Z疊層中的對(duì)于被選點(diǎn)對(duì)焦最多的圖像切片被自動(dòng)地示出在顯示窗口 1002中。用戶選擇的部分(即，區(qū)1006)是在顯示窗口 1004中被示為對(duì)焦的區(qū)1008。
[0045]圖11是根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第五表現(xiàn)形式1100的例子。如圖11所示，代替于使用全對(duì)焦圖像，在顯示窗口 1102中直接瀏覽Z疊層。感興趣區(qū)1104在顯示窗口 1102中被選擇。原始Z疊層中的對(duì)于被選點(diǎn)(在顯示1102中被描繪為區(qū)1106)對(duì)焦最多的圖像切片被自動(dòng)地示出在顯示窗口 1102中。
[0046]圖12是根據(jù)本發(fā)明的示例性實(shí)施例的用戶界面的第六表現(xiàn)形式1200的例子。顯示窗口 1202 —開始示出樣本的Z疊層圖像。當(dāng)初始位置選擇1204時(shí)，用戶界面120顯示在該位置1206處圖像的最多對(duì)焦切片。當(dāng)用戶進(jìn)一步選擇或者指示時(shí)，用戶界面120切換到在1208處具有第二多對(duì)焦切片的第二視圖。此外，鼠標(biāo)點(diǎn)擊或用戶的其他指示向用戶界面120發(fā)信號(hào)告知繼續(xù)在被選位置1208處的不同對(duì)焦切片之中或之間循環(huán)。
[0047]出于解釋的目的，參照具體實(shí)施例描述了前面的描述。然而，以上的說(shuō)明性討論并非意圖是窮舉的或者使本發(fā)明限于所公開的精確形式。鑒于以上教導(dǎo)，許多修改和變化是可能的。為了最好地解釋本公開內(nèi)容的原理及其實(shí)際應(yīng)用，選擇并描述了實(shí)施例，從而使得本領(lǐng)域的其他技術(shù)人員能夠以可能適合于所設(shè)想的具體用途的各種修改最好地利用本發(fā)明和各種實(shí)施例。
[0048]盡管前面針對(duì)本發(fā)明的實(shí)施例，但是在不脫離本發(fā)明的基本范圍的情況下，可設(shè)計(jì)本發(fā)明的其他和進(jìn)一步的實(shí)施例，本發(fā)明的范圍由所附的權(quán)利要求確定。
【權(quán)利要求】
1.一種用于在顯微成像中導(dǎo)航圖像的方法，所述方法包括: 提供用戶界面以供用戶選擇由形成Z疊層的圖像集組成的全對(duì)焦圖像的一部分；以及 顯示來(lái)自Z疊層的在全對(duì)焦圖像的被選擇部分處對(duì)焦的圖像。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，還包括:通過(guò)減少樣本的所述圖像集的維數(shù)來(lái)形成全對(duì)焦圖像。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其中，減少維數(shù)包括: 將原始圖像序列從三維減少到兩維。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其中，所述減少包括: 將原始圖像序列與不同焦深組合以形成全對(duì)焦圖像。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，提供用戶界面包括: 呈現(xiàn)全對(duì)焦圖像和原始圖像序列中的至少一個(gè)；以及 基于被選擇部分在顯示全對(duì)焦圖像與原始圖像序列之間交替。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其中，提供用戶界面進(jìn)一步包括: 使用分屏視圖在單個(gè)顯示器上不同的第一窗口和第二窗口中同時(shí)呈現(xiàn)全對(duì)焦圖像和Z置層， 使全對(duì)焦圖像的視圖和Z疊層的視圖同步，以使得改變?nèi)珜?duì)焦圖像中的感興趣區(qū)在Z疊層中創(chuàng)建對(duì)應(yīng)的變化，反之亦然。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法，其中，第一窗口和第二窗口重疊或不重疊，以及其中，Z疊層的窗口持續(xù)可見或者在用戶請(qǐng)求時(shí)可見。
8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其中，提供用戶界面進(jìn)一步包括: 在分開的顯示器上不同的第一窗口和第二窗口中同時(shí)呈現(xiàn)全對(duì)焦圖像和Z疊層；以及使全對(duì)焦圖像的視圖和Z疊層的視圖同步，以使得改變?nèi)珜?duì)焦圖像中的感興趣區(qū)在Z疊層中創(chuàng)建對(duì)應(yīng)的變化，反之亦然。
9.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其中，提供用戶界面允許同時(shí)在數(shù)字圖像的單個(gè)切片中查看和聚焦整個(gè)樣本以及在兩個(gè)維度上瀏覽數(shù)字圖像的所述單個(gè)切片。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，提供用戶界面還包括: 在全對(duì)焦圖像和原始圖像序列中的至少一個(gè)中識(shí)別點(diǎn)和圍繞所述點(diǎn)的區(qū)域中的至少一個(gè)；以及 切換到原始圖像序列中的以下圖像，該圖像相對(duì)于原始圖像序列中的其他圖像在所述點(diǎn)和圍繞所述點(diǎn)的所述區(qū)域中的所述至少一個(gè)處對(duì)焦最多。
11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的方法，其中，如果所述點(diǎn)位于樣本具有多于一個(gè)唯一聚焦深度的地方，則代替于切換到所述該圖像，在原始圖像序列的多個(gè)圖像之間發(fā)生切換。
12.一種用于在顯微成像中導(dǎo)航圖像的設(shè)備，所述設(shè)備包括: 計(jì)算裝置，所述計(jì)算裝置用于提供用戶界面以供用戶選擇由形成Z疊層的圖像集組成的全對(duì)焦圖像的一部分；以及 顯示來(lái)自Z疊層的在全對(duì)焦圖像的被選擇部分處對(duì)焦的圖像。
13.根據(jù)權(quán)利要求12所述的設(shè)備，其中，所述計(jì)算裝置進(jìn)一步通過(guò)減少樣本的所述圖像集的維數(shù)來(lái)形成全對(duì)焦圖像。
14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的設(shè)備，其中，全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器進(jìn)一步將原始圖像序列從三維減少到兩維。
15.根據(jù)權(quán)利要求14所述的設(shè)備，其中，所述全對(duì)焦圖像產(chǎn)生器進(jìn)一步包括: 將原始圖像序列與不同焦深組合以形成全對(duì)焦圖像。
16.根據(jù)權(quán)利要求12所述的設(shè)備，其中，提供用戶界面包括: 使用所述計(jì)算裝置來(lái)呈現(xiàn)全對(duì)焦圖像和原始圖像序列中的至少一個(gè)；以及 基于被選擇部分在顯示全對(duì)焦圖像與原始圖像序列之間交替。
17.根據(jù)權(quán)利要求16所述的設(shè)備，其中，提供用戶界面進(jìn)一步包括: 使用分屏視圖在單個(gè)顯示器上不同的第一窗口和第二窗口中同時(shí)呈現(xiàn)全對(duì)焦圖像和Z置層， 使全對(duì)焦圖像的視圖和Z疊層的視圖同步，以使得改變?nèi)珜?duì)焦圖像中的感興趣區(qū)在Z疊層中創(chuàng)建對(duì)應(yīng)的變化，反之亦然。
18.根據(jù)權(quán)利要求17所述的設(shè)備，其中，與所述計(jì)算裝置耦合的顯示器上的第一窗口和第二窗口重疊或不重疊，以及其中，Z疊層的窗口持續(xù)可見或者在用戶請(qǐng)求時(shí)可見。
19.根據(jù)權(quán)利要求16所述的設(shè)備，其中，提供用戶界面進(jìn)一步包括: 在分開的顯示器上不同的第一窗口和第二窗口中同時(shí)呈現(xiàn)全對(duì)焦圖像和Z疊層；以及 使全對(duì)焦圖像的視圖和Z疊層的視圖同步，以使得改變?nèi)珜?duì)焦圖像中的感興趣區(qū)在Z疊層中創(chuàng)建對(duì)應(yīng)的變化，反之亦然。
20.根據(jù)權(quán)利要求16所述的設(shè)備，其中，圖像導(dǎo)航模塊進(jìn)一步提供用戶界面以允許同時(shí)在數(shù)字圖像的單個(gè)切片中查看和聚焦整個(gè)樣本以及在兩個(gè)維度上瀏覽數(shù)字圖像的所述單個(gè)切片。
【文檔編號(hào)】G06F3/0481GK103577038SQ201310285469
【公開日】2014年2月12日 申請(qǐng)日期:2013年7月9日 優(yōu)先權(quán)日:2012年7月19日
【發(fā)明者】劉明昌, M·羅伯遜 申請(qǐng)人:索尼公司