粱、小米、燕麥、黑麥、黑小麥、蕎麥、非洲小米(fonio)及藜麥)、梨果類果實(例如蘋果、 梨)、核果(例如咖啡、棗、芒果、橄欖、椰子、油棕、開心果、杏仁、杏、櫻桃、西洋李子、油桃、 桃子及李子)、藤(例如食用葡萄、釀酒葡萄)、麻類作物(例如麻、棉)、觀賞植物。在一 些實施方案中,該植物可以為住宅/家內(nèi)植物、溫室植物、農(nóng)業(yè)植物或園藝植物。如上文所 指出的,在一些實施方案中,該植物可以為硬木,諸如合歡、桉樹、角樹、櫸木、紅木、胡桃木、 橡木、柊樹、柳、胡桃木、樺木、板栗、楊樹、梢木、楓樹、梧桐、銀杏、棕櫚樹和楓香。在一些實 施方案中,該植物可以為針葉樹,諸如柏樹、道格拉斯冷杉、樅、紅杉、鐵杉、雪松、刺柏、落葉 松、松樹、紅木、云杉及紅豆杉。在一些實施方案中,該植物可以為產(chǎn)果實的木本植物,諸如 蘋果、李子、梨、香蕉、橙、獼猴桃、檸檬、櫻桃、葡萄、木瓜、花生及無花果。在一些實施方案 中,該植物可以為木本植物,諸如棉、竹及橡膠植物。在一些實施方案中,該植物可以為農(nóng) 業(yè)、造林和/或觀賞用植物,即,常用于園藝(例如在公園、花園中和在陽臺上)的植物。在 大量觀賞植物中可舉出的一些例子有草皮、天竺葵(geranium)、天竺葵(pelargonia)、矮 牽牛、秋海棠及燈籠海棠。術(shù)語"植物"亦意欲包括任何植物繁殖體。
[0029] 術(shù)語"植物"一般包括已由一次或多次育種、誘變和基因工程修改的植物?;蚬?程是指使用重組DNA技術(shù)。重組DNA技術(shù)允許不能很容易地經(jīng)由在自然環(huán)境下交叉育種、 基因突變或自然重組獲得的修改。在一些實施方案中,由基因工程獲得的植物可以為轉(zhuǎn)基 因植物。
[0030] 如本文所使用的術(shù)語"植物部分"是指植物的任何部分,包括但不限于幼苗、根、 莖、種子、托葉、葉、花瓣、花、胚珠、荀、枝條、葉柄、節(jié)間、樹皮、木材、±夬莖、軟毛、分蘗、根 莖、藻體、葉片、花粉、雄蕊、小孢子、果實和種子。生長在本領(lǐng)域所使用的典型介質(zhì)(諸如土 壤)中的植物的兩種主要部分通常被稱為"地上"部分(亦常被稱為"新枝")及"地下"部 分(亦常被稱為"根")。
[0031] 在根據(jù)本發(fā)明的方法中,該組合物可被施用于長在生長植物所使用的任何類型的 介質(zhì)(例如土壤、蛭石、碎紙板及水)中的任何植物或任何植物的任何部分,或施用于架空 種植的植物或植物部分,諸如蘭花或鹿角蕨上。例如,該組合物可通過噴灑、噴霧、蒸發(fā)、撒、 撣、澆水、噴、灑或澆注進行施用。如上文已經(jīng)指出,施用程序可在感興趣的植物放置的任何 所需地點進行,諸如農(nóng)業(yè)、園藝、森林、農(nóng)園、果園、苗圃、有機種植的作物、草皮及城市環(huán)境。
[0032] 本發(fā)明提供使用包含枯草芽孢桿菌和/或短小芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌和/或短 小芽孢桿菌的發(fā)酵產(chǎn)物、或枯草芽孢桿菌和/或短小芽孢桿菌的無細胞提取物的組合物來 提高植物的鹽脅迫抗性的方法??莶菅挎邨U菌及短小芽孢桿菌為革蘭氏陽性土壤細菌,其 經(jīng)常在植物根圍中被找到。如同許多細菌菌種,枯草芽孢桿菌可以表現(xiàn)出兩種不同的增長 模式,自由游動、浮游增長模式及無梗生物膜模式(其中細胞聚集體分泌一種細胞外基質(zhì) 以彼此黏附和/或黏附在表面上)。細菌(諸如枯草芽孢桿菌)用來建立生物膜的途徑極 其多樣,在不同物種之內(nèi)和之間及在不同的環(huán)境條件下變化頗大。最近,由枯草芽孢桿菌、 短小芽孢桿菌及相關(guān)菌種的特定菌株形成的生物膜已被確認可能有助于控制由植物病原 體引起的感染。
[0033] 包含枯草芽孢桿菌和/或短小芽孢桿菌的組合物可為液體、漿液、可濕性粉末、顆 粒,可流動性形式,無論是干燥或含水的,或在合適介質(zhì)中的微囊包封形式。
[0034] 枯草芽孢桿菌及短小芽孢桿菌可以孢子(其為休眠狀態(tài))形式、營養(yǎng)細胞(其為 生長狀態(tài))形式、過渡態(tài)細胞(其為從生長階段到孢子形成階段的過渡期)、或所有這些細 胞類型的組合存在于本發(fā)明所使用的組合物中。在一些實施方案中,各自組合物主要包括 孢子(包括基本上由孢子組成及由孢子組成)。在其它實施方案中,該組合物包括孢子及 在形成孢子前于發(fā)酵期間細胞所產(chǎn)生的代謝物。
[0035] 在一些實施方案中,枯草芽孢桿菌為枯草芽孢桿菌株QST713??莶菅挎邨U菌株 QST713為可用于控制植物疾?。ò莶 ⒑谛遣?、灰霉病及數(shù)種類型的霉?。┑奶烊划a(chǎn)生 的廣布細菌。美國和歐洲監(jiān)管部門已將枯草芽孢桿菌QST713歸類為對人體或環(huán)境無不良 影響。該細菌(枯草桿菌)普遍存在于土壤中,并已在全世界的各種棲息地中被發(fā)現(xiàn)。已 知枯草芽孢桿的QST713菌株可拮抗許多植物真菌病原。
[0036] 野生型枯草芽孢桿菌QST713、其突變體、其上清液和其脂肽代謝物,以及使用 它們來控制植物病原體和昆蟲的方法被充分描述于美國專利號6, 060, 051 ;6, 103, 228 ; 6, 291,426 ;6, 417, 163 ;及6, 638, 910中;各篇的全部教導(dǎo)內(nèi)容以引用方式被具體且全部 納入本文中。在這些美國專利中,該菌株被稱為AQ713(其與QST713同義)。本專利說 明書中當(dāng)提及存在于SERENADE?產(chǎn)品中、被以NRRL登錄號B21661保藏、或在仿真 制造SERENADE?產(chǎn)品的條件下的生物反應(yīng)器中制備QST713時是指枯草芽孢桿菌QST713(又名AQ713)。
[0037] 在1998年提交美國專利申請?zhí)?9/074, 870 (其對應(yīng)于上述專利)時,該菌株根據(jù) 典型、生理、生化及形態(tài)學(xué)方法被命名為枯草芽孢桿菌。芽孢桿菌種的分類學(xué)從那時起已逐 步發(fā)展,尤其是鑒于遺傳學(xué)和測序技術(shù)的進步,因而物種的命名很大程度上是基于DNA序 列,而非1998年所使用的方法。在比對來自解淀粉芽孢桿菌FZB42、枯草芽孢桿菌168和 QST713的蛋白質(zhì)序列后,在解淀粉芽孢桿菌FZB42中發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)中約有95%與QST713 中發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)具有85%或更高的同一性;而在枯草芽孢桿菌168中只有35%與QST713 中的蛋白質(zhì)具有85%或更高的同一性。然而,即使是較大程度地依賴遺傳學(xué),在反映過去 15年對芽孢桿菌分類學(xué)的演化理解的相關(guān)科學(xué)文獻和規(guī)范性文件中仍然有分類模糊性。例 如,以枯草芽孢桿菌株FZB24(其如同F(xiàn)ZB42般與QST713密切相關(guān))為基礎(chǔ)的農(nóng)藥產(chǎn)品在 美國環(huán)保局的文件中被歸類為枯草桿菌解淀粉變種。由于命名學(xué)中的這些復(fù)雜性,此特殊 芽孢桿菌種根據(jù)該文件被不同地命名為枯草芽孢桿菌、解淀粉芽孢桿菌及枯草芽孢桿菌 解淀粉變種。因此,我們保留枯草芽孢桿菌QST713的命名,而非將其改變成目前僅根據(jù)序 列比較及推斷的分類學(xué)所預(yù)期的解淀粉芽孢桿菌。
[0038] 枯草芽孢桿菌株QST713已根據(jù)國際承認用于專利程序的微生物保存布達佩 斯條約的規(guī)定在1997年3月7日保藏在NRRL,登錄號為B21661。NRRL為農(nóng)業(yè)研究 服務(wù)培養(yǎng)物保藏中心的縮寫,為用于保藏為國際承認用于專利程序的微生物保存布達 佩斯條約下的微生物菌株的國際保存單位,地址為61604美國伊利諾伊州皮奧里亞市 北大學(xué)街1815號,美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究服務(wù),全國農(nóng)業(yè)利用研究中心??莶菅挎邨U菌 株QST713的合適配方(formulation)可從美國北卡羅萊納州BayerCropScienceLP 的市售商品SERENADE?、SERENADE?aso、SERENADE?soil及 SERENADE·max取得。
[0039] SERENADE?,產(chǎn)品(美國EPA登記編號69592-12)包含專利枯草芽孢桿 菌株(菌株QST713)及許多協(xié)同工作以破壞疾病病原體并提供優(yōu)越的抗菌活性的不同 脂肽。SERENADE?產(chǎn)品用于保護植物(諸如蔬菜、果實、堅果和藤蔓作物)以對 抗諸如火疫?。‵ireBlight)、灰霉?。˙otrytis)、酸腐?。⊿ourRot)、銹?。≧ust)、菌 核?。⊿clerotinia)、白粉病(PowderyMildew)、細菌性斑點(BacterialSpot)和白霉 (WhiteMold)等疾病。SERENADE?產(chǎn)品可以液體或干燥配方的形式取得,其可以 葉面和/或土壤處理劑施用。SERENADE?/"品的美國epa主標(biāo)簽的復(fù)印件(包括 SERENADE? aso、SERENADE?max及SERENADE? soil)可透過全國農(nóng) 藥信息檢索系統(tǒng)(NPIRSv)的USEPA/0PP農(nóng)藥產(chǎn)品標(biāo)簽系統(tǒng)(PPLS)公開取得。
[0040] SERENADE愈AS0(水性懸浮液-有機)含有1.34%作為活性成分的干燥 QST713及98. 66 %其它成分。SERENADE?AS0經(jīng)配制以含有最少IX109cfu/克 的QST713,而QST713 的最大量已經(jīng)測定為 3.3X101Qcfu/克。SERENADE?AS0 的替代商品名包括SERENADE?BI0FUNGICIDE、SERENADESOIL?及SERENADE C5ARDEN?DISEASE。進一步信息請參閱2010年1月4日的SERENADE?AS0及 SERENADESOIL?的美國EPA主標(biāo)簽,各篇的全部內(nèi)容以引用方式被并入本文。
[0041] SERENADE?MAX含有14. 6%作為活性成分的干燥QST713及85. 4%的其它 成分。SERENADE?MAX經(jīng)配制以含有最少7. 3X109cfu/克的QST713,而QST713的 最大量已經(jīng)測定為7. 9XlO^fu/克。進一步信息請參閱SERENADE·MAX的美國EPA 主標(biāo)簽,其全部內(nèi)容以引用方式被并入本文。
[0042] 如國際專利申請?zhí)朩02012/087980中的詳細說明,枯草芽孢桿菌QST713的培養(yǎng) 實際上為野生型細胞與非常低比例的被命名為"砂紙細胞"(根據(jù)其菌落形態(tài))的變異細 胞類型的混合物。因此,在SERENADE?產(chǎn)品中發(fā)現(xiàn)的QST713或在生長在生物反應(yīng) 器中的QST713細胞中發(fā)現(xiàn)的QST713系由野生型細胞及這些砂紙細胞以相同于或類似于 SERENADE?產(chǎn)品中所發(fā)現(xiàn)的比率混合群組成。這些砂紙細胞在營養(yǎng)瓊脂上形成形態(tài) 及生理上看來高度壓實、疏水、平坦、干燥且非常"易碎"并且很難從瓊脂去除的菌落。細胞 黏附性可以定性方式觀察或可由結(jié)晶紫染色測量。除了在營養(yǎng)瓊脂上的這種獨特菌落形 態(tài)外,砂紙細胞在表面(諸如根)上形成致密、緊實的生物膜(或更強健的生物膜)。根據(jù) 上述公開內(nèi)容,描述于國際專利出版物W02012/087980中的枯草芽孢桿菌株AQ30002(又名 QST30002)或AQ30004(又名QST30004)(被以登錄號NRRL B-50421和NRRL B-50455保藏) 或具有枯草芽孢桿菌株AQ30002(又名QST30002)或AQ30004(又名QST30004)的所有生理 和形態(tài)特征的這些枯草芽孢桿菌株的突變體亦可用于本發(fā)明的方法中,無論是單獨或與其 他枯草芽孢桿菌株(諸如枯草芽孢桿菌QST713)的混合物。
[0043] "野生型"是指物種天然發(fā)生時和/或物種以先前已被命名為"野生型"的已知分 離形式發(fā)生時的典型形式的表型。本文所承認的"野生型(wildtype)"的同義詞包括"野 生型(wildtype)"、野生型(wild-type)"、" + "及"wt"。相對于由非標(biāo)準(zhǔn)、"突變體"或"變 異體"等位基因所產(chǎn)生的產(chǎn)物,野生型通常被概念化為在一或多個基因位點的特定基因的 標(biāo)準(zhǔn)、"正常"等位基因的產(chǎn)物。一般而言,以及本文所使用的,特殊芽孢桿菌株或分離物 的最普遍的等位基因(即,具有最高的基因頻率者)為該被視為野生型的等位基因。本文 所使用的"QST713野生型"或"QST713野生型swrA+"及其同義詞(