專利名稱:一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重qf-pcr str檢測體系的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種用于21、18、13和性染色體數(shù)目異常的QF-PCR快速診斷技術(shù),特別是涉及三個(gè)用于檢測21、18、13和性染色體特異STR的多重PCR擴(kuò)增體系及其引物。
背景技術(shù):
新生兒遺傳性疾病尚沒有有效的治療方法,產(chǎn)前診斷是阻止先天缺陷新生兒出生 的最為有效的手段。染色體病是新生兒最多見的一類遺傳性疾病,以唐氏綜合癥(21三體) 和Turner綜合癥(45,X)最為多見,其次為18三體,偶見13三體,Klinefelter綜合癥及 XYY綜合癥等。目前染色體病產(chǎn)前診斷中最主要的技術(shù)手段是染色體核型分析,但由于其操 作復(fù)雜,花費(fèi)時(shí)間長(約14個(gè)工作日),不僅會(huì)錯(cuò)過臨床醫(yī)生進(jìn)行處理的最佳時(shí)機(jī),還會(huì)給 孕婦帶來沉重的精神負(fù)擔(dān)。因此,建立一種快速、準(zhǔn)確的產(chǎn)前診斷技術(shù)成為目前眾多學(xué)者研 究的重點(diǎn)。上世紀(jì)90年代后期,短串聯(lián)重復(fù)序列(small tandem repeats, STRs)被發(fā)現(xiàn)可作 為染色體特異性標(biāo)記,隨著DNA標(biāo)記技術(shù)以及檢測技術(shù)的發(fā)展,人們開始采用經(jīng)熒光標(biāo)記 的引物對染色體特異的STR進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后使用DNA自動(dòng)序列分析儀進(jìn)行片段分析,從 而檢測這些染色體特異的微衛(wèi)星重復(fù)序列。該技術(shù)自發(fā)明以來,已廣泛應(yīng)用于法醫(yī)學(xué)鑒定、 親子鑒定等方面。在歐美國家,該技術(shù)也已被應(yīng)用于針對21、18、13及XY等染色體數(shù)目異 常的快速產(chǎn)前診斷方面。市面上也已有這方面的試劑盒出售。而在中國,這方面的技術(shù)還 相對落后。雖然目前歐美已有多個(gè)實(shí)驗(yàn)室將QF-PCR技術(shù)應(yīng)用于染色體異常的常規(guī)檢測中, 但他們的QF-PCRSTR體系還存有一定的缺點(diǎn),如STR位點(diǎn)較少等,而且他們選用的STR位點(diǎn) 在中國人群中雜合率不高,因此不適用于中國人群的檢測。已有學(xué)者嘗試采用QF-PCR進(jìn)行性染色體數(shù)目異常。他們要么使用某個(gè)常染色體 STR位點(diǎn)與一個(gè)X染色體的STR位點(diǎn)進(jìn)行相對定量,但這種方法的可重復(fù)性較差;要么使用 盡量多的XY染色體STR位點(diǎn)來對性染色體的數(shù)目進(jìn)行判定,但由于性染色體STR位點(diǎn)的雜 合率均較低,以致使用較多的位點(diǎn)也無法判定某些純合個(gè)體。與傳統(tǒng)的核型分析技術(shù)相比,QF-PCR在診斷染色體數(shù)目異常方面具有快速、準(zhǔn)確、 費(fèi)用低等優(yōu)勢。該技術(shù)還可用于母血污染的判定方面,為臨床分子診斷提供質(zhì)量保證。因 此,開發(fā)一套STR位點(diǎn)足夠多,并且各STR在中國人群中的雜合率足夠高的適用于中國人群 的QF-PCR STR檢測體系,以及一套完善的性染色體異常QF-PCR STR檢測體系,均具有重要 的意義。
發(fā)明內(nèi)容
針對現(xiàn)有QF-PCR體系STR位點(diǎn)不足夠,相對定量可重復(fù)性差,選用的STR位點(diǎn)在 中國人群中雜合率較低等缺點(diǎn),本發(fā)明的目的是建立一套包含足夠多的STR位點(diǎn)、并且各 STR在中國人群中雜合率均較高的診斷21、18、13染色體數(shù)目異常的多重QF-PCR STR快速 檢測體系,以及結(jié)合相對定量和增加STR位點(diǎn)兩個(gè)方法,建立一個(gè)較完善的檢測性染色體數(shù)目異常的QF-PCR STR檢測體系,即熒光定量PCR檢測技術(shù),其操作實(shí)施步驟為(1)、首先針對各目標(biāo)染色體,選取在中國人群中雜合率較高的STR位點(diǎn)通過對已報(bào)道的中國人群各STR位點(diǎn)雜合率進(jìn)行分析,或?qū)Ω信d趣的STR位點(diǎn)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)檢測,以挑 取在中國漢族人群中雜合率足夠高的STR位點(diǎn)。(2)、對合適的STR位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物,分組進(jìn)行多重PCR,并調(diào)整反應(yīng)參數(shù)等,以建立 三個(gè)完善的多重PCR體系。(3)、對PCR引物進(jìn)行熒光標(biāo)記,QF-PCR驗(yàn)證標(biāo)記方案的可行性。(4)、QF-PCR進(jìn)行大樣本試驗(yàn),以驗(yàn)證三個(gè)多重STR檢測體系的適用性,包括各STR 位點(diǎn)的雜合率、片段分析結(jié)果是否正常(有無異常電泳行為)、各PCR產(chǎn)物大小分布會(huì)否相
互重疊等。本發(fā)明具體通過以下方案予以實(shí)現(xiàn)快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCR STR 檢測體系包含有A、B、C三組多重PCR體系,其中,A組為引物經(jīng)熒光標(biāo)記的8重PCR體系, 檢測位點(diǎn)包含性別判斷基因AMXY,6個(gè)21號染色體特異STR位點(diǎn)D21S1433、D21S1411、 D21S1414、D21S1412、D21S1445和一個(gè)位于21qll. 2的未命名的STR位點(diǎn),及1個(gè)13號染 色體特異STR位點(diǎn)D13S258 ;B組為引物經(jīng)熒光標(biāo)記的8重PCR體系,檢測位點(diǎn)包含性別 判斷基因SRY,4個(gè)18號染色體特異STR位點(diǎn)D18S535、D18S391、D18S51和D18S386,及3 個(gè)13號染色體特異STR位點(diǎn)D13S742、D13S634和D13S303 ;C組為引物經(jīng)熒光標(biāo)記的9重 PCR體系,檢測位點(diǎn)包含性別判斷基因AMXY和SRY,5個(gè)X染色體特異STR位點(diǎn)DXS1187、 DXS8377、DXS6809、DXS981 和 DXS1053,1 個(gè) 13 號染色體特異 STR 位點(diǎn)D13S305,及 1 個(gè) 21 號染色體特異STR位點(diǎn)D21S11。本發(fā)明的技術(shù)方案還包括上述靶向21號染色體特異STR位點(diǎn)D21S1412、 D21S1445和D21S11,以及一個(gè)還未經(jīng)命名的位于21 q 11. 2的新STR位點(diǎn)的PCR引物序列,靶 向18號染色體特異STR位點(diǎn),靶向13號染色體特異STR位點(diǎn)D13S742、D13S634、D13S303和 D13S305 的 PCR 引物序列,靴向 X 染色體特異 STR 位點(diǎn) DXS1187、DXS8377、DXS6809、DXS981 禾口 DXS1053的PCR引物序列。本發(fā)明的技術(shù)方案還包括所述A組的STR多態(tài)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物大小范圍在大部 分個(gè)體不重疊,但D21S1433與21qll. 2的PCR產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重 疊,D13S258與D21S1411的PCR產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,這兩對位點(diǎn) 的不同標(biāo)記可使PCR產(chǎn)物峰區(qū)分開。所述B組的STR多態(tài)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物大小范圍在大部分個(gè)體不重疊,D18S386與 D13S742的PCR產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,D13S634與D13S303的PCR 產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,這兩對位點(diǎn)的不同標(biāo)記可使PCR產(chǎn)物峰區(qū)分 開。所述C組的STR多態(tài)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物大小范圍在大部分個(gè)體不重疊,而非多態(tài)的 SRY及多態(tài)的DXS981與組內(nèi)其他位點(diǎn)的不同標(biāo)記可使結(jié)果分析更方便。進(jìn)一步地,上述A 組的 PCR 體系各引物AMXY、D21S1433、D21S1411、D13S258、 D21S1414、D21S1412、D21S1445 和 21qll. 2,在 PCR 反應(yīng)液中的終濃度分別為 0. 1,0. 2,0. 2、 0.3,0. 4,0. 4,0. 1和0. 35 μ Μ,該濃度組合使該組各位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物熒光信號強(qiáng)度均在合適 范圍。B 組的 PCR 體系各引物D18S535、D18S391、SRY、D18S51、D18S386、D13S742、D13S634和D13S303,在PCR反應(yīng)液中的終濃度分別為0. 2、0. 2、0. 2、0. 1、0. 4、0. 5、0. 4和0. 4 μ M,該 濃度組合使該組各位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物熒光信號強(qiáng)度均在合適范圍。C組的PCR體系各引物 AMXY, DXSl 187、DXS8377、SRY、DXS6809、DXS981、DXS1053、D13S305 和 D21S11,在 PCR 反應(yīng) 液中的終濃度分別為0. 1,0. 15,0. 15,0. 2,0. 2,0. 3,0. 2、0. 3和0. 5 μ Μ,該濃度組合使該組
各位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物熒光信號強(qiáng)度均在合適范圍。
本發(fā)明最終選取的位點(diǎn)有21號染色體STR位點(diǎn)7個(gè),18號染色體4個(gè),13號染 色體5個(gè),X染色體特異STR 5個(gè),以及性別特異基因AMXY和Y染色體特異基因SRY。最終 建立的三個(gè)多重PCR體系(A、B、C組)的組分及引物序列等分別見表1、表2和表3。表1.A組多重PCR體系的STR位點(diǎn)、引物信息及引物用量 *該位點(diǎn)是位于21qll. 2的還未經(jīng)命名的新STR位點(diǎn)。表2. B組多重PCR體系的STR位點(diǎn)、引物信息及引物用量 使用本發(fā)明STR檢測體系擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物可用ABI3100、ABI3130等全自動(dòng)序列分 析儀進(jìn)行片段分析。各STR位點(diǎn)PCR產(chǎn)物的條帶數(shù)目異常或峰面積比例異常反映了相應(yīng)染 色體三體或三體嵌合的存在。A組和B組多重PCR體系結(jié)合使用即可快速有效地檢測產(chǎn)前 診斷中最常見的21、18和13號常染色體數(shù)目異常。本發(fā)明中C組多重PCR體系的AMXY可 與D13S305、D21S11進(jìn)行相對定量,結(jié)合SRY及其余5個(gè)XY染色體STR位點(diǎn),單獨(dú)使用就可 以進(jìn)行Turner綜合癥等性染色體異常疾病的檢測,可用于常規(guī)的產(chǎn)前診斷中,也可用于性 染色體異常疑似病例的臨床檢測中。目前已使用該發(fā)明進(jìn)行了 2250例產(chǎn)前診斷標(biāo)本以及27例成人Turner疑似病例 的檢測,成功檢出唐氏綜合癥48例,13三體18例,18三體11例,Turner綜合癥35例(產(chǎn) 前8例和27例成人),69,XXX 1例,69,XXY2例,47,XXX 1例,47,XXY 1例,提示其他類型 性染色體異常3例。與常規(guī)核型分析結(jié)果比較,該QF-PCR快速診斷體系對21、18和13三體的陽性檢出率為100%,與核型分析結(jié)果的一致率達(dá)100%。QF-PCR對性染色體異常核型的檢出率為98%,與核型分析結(jié)果的一致率達(dá)98. 2%。整套STR檢測體系對染色體數(shù)目 異常的假陽性率0%,假陰性率低于0. 2%。本發(fā)明已成功為臨床產(chǎn)前地中海貧血分子診斷 提供母血污染鑒定122例,證實(shí)存在母血污染3例,為產(chǎn)前診斷提供了質(zhì)量保證。本發(fā)明適 用于各種產(chǎn)前診斷標(biāo)本的檢測,包括羊水、絨毛、臍血等,完成一套檢測只需60-180ng DNA。 該發(fā)明用于產(chǎn)前診斷不僅能大大縮短診斷時(shí)間,為臨床醫(yī)生及時(shí)處理爭取了寶貴時(shí)間并減 輕了孕婦等待結(jié)果所承受的心理負(fù)擔(dān),還能降低成本,是一個(gè)經(jīng)濟(jì)實(shí)用并可靠的產(chǎn)前診斷 新方法。
圖1為一正常男性的QF-PCR結(jié)果AMXY為1 1雙峰,SRY有產(chǎn)物峰且X染色體 STR位點(diǎn)均為單峰,顯示為男性;其余各STR位點(diǎn)為單峰或面積1 1的雙峰,顯示該樣本正常。圖2為一正常女性的QF-PCR結(jié)果AMXY為單峰(AMX)且SRY無產(chǎn)物峰,X染色體 STR位點(diǎn)為單峰或面積1 1的雙峰,顯示為女性;其余各STR位點(diǎn)為單峰或面積1 1的 雙峰,顯示該樣本正常。圖3為一 21三體的QF-PCR結(jié)果21號染色體的STR位點(diǎn)全為面積2 1或1 2 的雙峰、或1 1 1三峰,其余染色體STR位點(diǎn)為正常峰型,顯示該樣本為21三體核型。圖4為一 18三體的QF-PCR結(jié)果18號染色體的STR位點(diǎn)為單峰、面積2 1或 1 2的雙峰、或1 1 1三峰,其余染色體STR位點(diǎn)為正常峰型,顯示該樣本為18三體核型。圖5為一 13三體的QF-PCR結(jié)果13號染色體的STR位點(diǎn)為單峰、面積2 1或 1 2的雙峰、或1 1 1三峰,其余染色體STR位點(diǎn)為正常峰型,顯示該樣本為13三體核型。圖6為一 45,X的QF-PCR結(jié)果-X染色體的STR位點(diǎn)均為單峰,無AMY和SRY的檢 測峰,且AMX的總面積是D21S11總面積的1/2。
具體實(shí)施例方式下面將結(jié)合具體實(shí)施例作進(jìn)一步闡述,這些實(shí)施例僅為說明本發(fā)明而列舉,并非 用于限制本發(fā)明的保護(hù)范圍。實(shí)施例一本發(fā)明的檢測方法產(chǎn)前診斷標(biāo)本包括羊水、絨毛、胎血等。全血樣本需要A⑶抗凝,羊水標(biāo)本需 3000rpm離心收集細(xì)胞,絨毛浸泡于生理鹽水中。各種標(biāo)本于4°C保存,48小時(shí)內(nèi)提取DNA。 DNA的提取使用試劑盒進(jìn)行,例如QIAamp DNA Mini kit (QiaGen),并嚴(yán)格按照說明書操作。 最后DNA產(chǎn)物用雙蒸水溶解,N. D1000V3. 7 DNA測定儀上測定濃度和純度,調(diào)整DNA濃度至 10-50ng/ μ L。0D260/280比值介于1. 6-2. 1之間為合格DNA樣本。PCR 反應(yīng)DNA 聚合酶使用 Takara Taq Hot Start Version, PCR 反應(yīng)采用 25 μ L 體系,DNA模板量為15-70ng。每份DNA樣本進(jìn)行A、B、C三組反應(yīng)(見表1、表2和表3)。 A 組 PCR 循環(huán)參數(shù)如下:95°C 5min, (95°C 30s, 57°C 40s, 72°C 60s) X 25cycles, 72°C IOmin ;B 組和 C 組 PCR 循環(huán)參數(shù)如下95°C 5min, (95 °C 30s, 60 °C 40s, 72 °C 60s) X25cycles, 72°C IOmin0 反應(yīng)在 Biometra Tprofessional PCR 儀上進(jìn)行。片段分析PCR產(chǎn)物各 1 μ L,加 0. 2 μ L Genescan 500HD [ROX] size standard 和 9 μ L變性劑HiDi,充分混勻。95°C變性2min,迅速放入冰水混合物中冷卻3min。變性好的 待測PCR產(chǎn)物于ABI 3130x1序列分析儀上進(jìn)行片段分析,主要參數(shù)設(shè)置為Run module HIDFragmentAnalysis36_P0P4,Dye set :G5。收集的熒光信號使用 GeneMapper 軟件進(jìn)行分 析。片段分析結(jié)果判定1.等位基因峰熒光信號強(qiáng)度應(yīng)介于500-8000之間,低于或高于此范圍均應(yīng)重做 PCR反應(yīng)。2.等位基因峰2個(gè),且峰面積比小于1.4或者大于0.8(約為1 1),為正常峰型;
等位基因峰3個(gè),或者等位基因峰2個(gè)并且峰面積比大于1.6或小于0.65(約為2 1或 1 2),為異常峰型。3.發(fā)現(xiàn)異常峰型,應(yīng)常規(guī)重復(fù)QF-PCR —次,以保證結(jié)果的可靠性。4.每一個(gè)染色體至少2個(gè)STR位點(diǎn)為異常峰型,才能診斷此樣本為相應(yīng)染色體異常。5.如發(fā)現(xiàn)等位基因峰面積比介于正常與異常之間,則建議對此STR進(jìn)行單管PCR 反應(yīng)。實(shí)施例二 一個(gè)健康男性的QF-PCR檢測參照圖1所示,應(yīng)用實(shí)施例一的方法,對一個(gè)經(jīng)核型分析證實(shí)為正常核型的健康 成年男性的外周血樣本200 μ L提取DNA,共獲得45 μ L濃度23. 5ng/ μ L的DNA,0D260/280 比值1. 82,為合格DNA樣本。各取2 μ LDNA進(jìn)行A、B、C三組PCR反應(yīng)及片段分析。GeneMapper 軟件對收集到的熒光數(shù)據(jù)分析結(jié)果見表4 表4GeneMapper軟件對一名健康男性的QF-PCR熒光信號的數(shù)據(jù)分析結(jié)果 該樣本的所有等位基因峰熒光信號強(qiáng)度均介于500-8000之間,熒光信號強(qiáng)度適 合進(jìn)行核型判斷;性別判定基因AMXY顯示1 1(AMX AMY)雙峰,男性特異基因SRY有 擴(kuò)增峰,因此該樣本有等量的X和Y染色體;所有21、18和13號染色體特異STR位點(diǎn)的等 位基因峰為單峰或1 1雙峰,因此該樣本的21、18和13號染色體為正常的二倍體;所有 X染色體特異STR位點(diǎn)為單峰,并且AMXY的峰面積總和與D21S11峰面積總和的比值約為 1 1,因此該樣本含1個(gè)X和1個(gè)Y染色體;綜合上述分析,該樣本為21、18、13和性染色 體均為正常二倍體的男性。實(shí)施例三一個(gè)健康女性的QF-PCR檢測
參照圖2所示,應(yīng)用實(shí)施例一的方法,對一個(gè)經(jīng)核型分析證實(shí)為正常核型的健康 成年女性的外周血樣本200 μ L提取DNA,共獲得45 μ L濃度26ng/ μ L的DNA,0D260/280比 值1. 91,為合格DNA樣本。各取2 μ L DNA進(jìn)行A、B、C三組PCR反應(yīng)及片段分析。GeneMapper 軟件對收集到的熒光數(shù)據(jù)分析結(jié)果見表5 表SGeneMapper軟件對一名健康女性的QF-PCR熒光信號的數(shù)據(jù)分析結(jié)果 *由于DXS1053位點(diǎn)PCR擴(kuò)增片段中間有“CA”兩堿基簡單重復(fù),導(dǎo)致PCR過程容 易出現(xiàn)滑移,因此產(chǎn)物雙峰比值不嚴(yán)格接近1 1(<1.6)仍屬正常。該樣本的所有等位基因峰熒光信號強(qiáng)度均介于500-8000之間,熒光信號強(qiáng)度適 合進(jìn)行核型判斷;性別判定基因AMXY顯示1個(gè)單峰(AMX),男性特異基因SRY無擴(kuò)增峰,因 此該樣本只有X染色體;所有21、18和13號染色體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰為單峰或 1 1雙峰,因此該樣本的21、18和13號染色體為正常的二倍體;所有X染色體特異STR位 點(diǎn)為單峰或1 1雙峰,并且AMX的峰面積與D21S11峰面積總和的比值約為1 1,因此該 樣本含2個(gè)X染色體;綜合上述分析,該樣本為21、18、13和性染色體均為正常二倍體的女性。實(shí)施例四一個(gè)唐氏高風(fēng)險(xiǎn)胎兒臍血標(biāo)本的QF-PCR檢測參照圖3所示,應(yīng)用實(shí)施例一的方法,對一個(gè)唐氏篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒的臍血樣本 200 μ L提取DNA,共獲得100 μ L濃度18ng/ μ L的DNA,0D260/280比值1. 89,為合格DNA樣 本。各取3μ L DNA進(jìn)行A、B、C三組PCR反應(yīng)及片段分析。GeneMapper軟件對收集到的熒 光數(shù)據(jù)分析結(jié)果見表6:表eGeneMapper軟件對一名唐氏高風(fēng)險(xiǎn)胎兒的QF-PCR熒光信號的數(shù)據(jù)分析結(jié)果 該樣本的所有等位基因峰熒光信號強(qiáng)度均介于500-8000之間,熒光信號強(qiáng)度適 合進(jìn)行核型判斷;性別判定基因AMXY顯示1 1(AMX AMY)雙峰,男性特異基因SRY有 擴(kuò)增峰,因此該樣本有等量的X和Y染色體;所有21號染色體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰 為單峰、異常的1 2或2 1的雙峰、或異常的1 1 1三峰,異常峰超過2個(gè),因此該 樣本的21號染色體為3體;所有18和13號染色體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰為單峰或 1 1雙峰,因此該樣本的18和13號染色體為正常的二倍體;所有X染色體特異STR位點(diǎn) 為單峰,并且AMXY的峰面積總和與D21S11峰面積總和2/3的比值約為1 1,因此該樣本 含1個(gè)X和1個(gè)Y染色體;綜合上述分析,該樣本為男性21三體。實(shí)施例五一個(gè)產(chǎn)前篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒羊水標(biāo)本的QF-PCR檢測參照圖4所示,應(yīng)用實(shí)施例一的方法,對一個(gè)唐氏篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒的羊水樣本 1. 2mL 提取 DNA,共獲得 45 μ L 濃度 17. 5ng/ μ L 的 DNA,0D260/280 比值 1. 95,為合格 DNA 樣 本。各取3μ L DNA進(jìn)行A、B、C三組PCR反應(yīng)及片段分析。GeneMapper軟件對收集到的熒 光數(shù)據(jù)分析結(jié)果見表7 表7GeneMapper軟件對一名健康女性的QF-PCR熒光信號的數(shù)據(jù)分析結(jié)果 該樣本的所有等位基因峰熒光信號強(qiáng)度均介于500-8000之間,熒光信號強(qiáng)度適
合進(jìn)行核型判斷;性別判定基因AMXY顯示1 1(AMX AMY)雙峰,男性特異基因SRY有擴(kuò)
增峰,因此該樣本有等量的X和Y染色體;所有21和13號染色體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰為單峰或1 1雙峰,因此該樣本的21和13號染色體為正常的二倍體;所有18號染色 體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰為單峰、異常的1 2雙峰或異常的1 1 1三峰,異常峰 有2個(gè),因此該樣本的18號染色體為3體;所有X染色體特異STR位點(diǎn)為單峰,并且AMXY 的峰面積總和與D21S11峰面積總和的比值約為1 1,因此該樣本含1個(gè)X和1個(gè)Y染色 體;綜合上述分析,該樣本為男性18三體。實(shí)施例六一個(gè)產(chǎn)前篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒絨毛標(biāo)本的QF-PCR檢測 參照圖5所示,應(yīng)用實(shí)施例一的方法,對一個(gè)唐氏篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒的絨毛樣本1根 提取DNA,共獲得45 μ L濃度24ng/ μ L的DNA,0D260/280比值1. 83,為合格DNA樣本。各 取2yL DNA進(jìn)行A、B、C三組PCR反應(yīng)及片段分析。GeneMapper軟件對收集到的熒光數(shù)據(jù) 分析結(jié)果見表8:表SGeneMapper軟件對一份高風(fēng)險(xiǎn)胎兒絨毛標(biāo)本的QF-PCR熒光信號的數(shù)據(jù)分析
結(jié)果 該樣本的所有等位基因峰熒光信號強(qiáng)度均介于500-8000之間,熒光信號強(qiáng)度適 合進(jìn)行核型判斷;性別判定基因AMXY顯示1個(gè)單峰(AMX),男性特異基因SRY無擴(kuò)增峰,因 此該樣本只有X染色體;所有21和18號染色體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰為單峰或1 1 雙峰,因此該樣本的21和18號染色體為正常的二倍體;所有13號染色體特異STR位點(diǎn)的 等位基因峰為單峰、異常的1 2或2 1的雙峰、或異常的1 1 1三峰,異常峰超過 2個(gè),因此該樣本的13號染色體為3體;所有X染色體特異STR位點(diǎn)為單峰或1 1雙峰, 并且AMX的峰面積與D21S11峰面積總和的比值約為1 1,因此該樣本含2個(gè)X染色體; 綜合上述分析,該樣本為女性13三體。實(shí)施例七一個(gè)產(chǎn)前篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒羊水標(biāo)本的QF-PCR檢測參照圖6所示,應(yīng)用實(shí)施例一的方法,對一個(gè)唐氏篩查高風(fēng)險(xiǎn)胎兒的羊水樣本 1. 2mL提取DNA,共獲得45 μ L濃度16ng/ μ L的DNA,0D260/280比值1. 79,為合格DNA樣 本。各取3 μ L DNA進(jìn)行A、B、C三組PCR反應(yīng)及片段分析。GeneMapper軟件對收集到的熒 光數(shù)據(jù)分析結(jié)果見表7 表9GeneMapper軟件對一名健康女性的QF-PCR熒光信號的數(shù)據(jù)分析結(jié)果 該樣本的所有等位基因峰熒光信號強(qiáng)度均介于500-8000之間,熒光信號強(qiáng)度適 合進(jìn)行核型判斷;性別判定基因AMXY顯示1個(gè)單峰(AMX),男性特異基因SRY無擴(kuò)增峰,因 此該樣本只有X染色體;所有21、18和13號染色體特異STR位點(diǎn)的等位基因峰為單峰或 1 1雙峰,因此該樣本的21、18和13號染色體為正常的二倍體;所有X染色體特異STR位 點(diǎn)均為單峰,并且AMX的峰面積只有D21S11峰面積總和的1/2,因此該樣本只含1個(gè)X染色 體;綜合上述分析,該樣本為45,X Turner綜合癥核型。SEQUENCE LISTING<110>廣州市婦女兒童醫(yī)療中心
<120> 一個(gè)快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCR STR檢測體系<160>22<170>PatentIn version 3. 5<210>1<211>106<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>non-polymorphism<222>(1). . (106)<223>X-linked, used for sex determination<400>1ccctgggctc tgtaaagaat agtgtgttga ttctttatcc cagatgtttc tcaagtggtc 60ctgattttac agttcctacc accagcttcc cagtttaagc tctgat106<210>2<211>112<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><22l>non-polymorphism<222>(1). . (112)<223>Y-linked, used for sex determination<400>2ccctgggctc tgtaaagaat agtgggtgga ttcttcatcc caaataaagt ggtttctcaa 60gtggtcccaa ttttacagtt cctaccatca gcttcccagt ttaagctctg at112<210>3<211>155<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(22). . (84)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 22, polymorphic, with’ gata' as a repeat unit.<400>3caccccttta tacttggctg tgatagatag atagatagat agatagatag atagatagat 60agatgataga tagatagata gatagacaga cagatagata gagggataga tggatggtag 120agtactatta taaggaattg gctcatgtga ttctg155<210>4
<211>205<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(32). . (177)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 22, polymorphic, with,gaaa,as a repeat unit.<400>4ggagctgaag aacctgccta gaaaaataag agaaagaaag agagaaagag agagagagaa 60gaaagcaaga agaagaaaga aaaaggaaag aaaaagaaag aaagaaagaa agaaagaaag 120aaagaaagaa agaaagaaag aaagaaagaa aagaaaagaa aagaaaagag tagaaaggag 180ggcaggaagg aagaggggag gagac205<210>5<211>271<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(94). . (151)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 13, polymorphic, with,agat,as a repeat unit.<400>5acctgccaaa ttttaccagg aggagaggga ctacccagac agagcaagca attcagtaaa 60tacacggagt cattcttaaa atagacagat agaagataga tgatagatga tgatagatag 120atagagagat gatagatgat gatagataga tagagagatg atagatggat ggatagatag 180atagatagat agatagatag atagatagat agatagatga tagatagaga tagatataga 240atatcttatt ggtttattcc ctctctctgt c271<210>6<211>298<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><22l>polymorphism<222>(146). . (238)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome22, polymorphic, with,taga,as a repeat unit.<400>6atgatgaatg catagatgga tgggtggatg gatggatgga tggatggatg gatggatgga 60
tggatgaatg gatacataga tgaatggatg gatagatagt atataaatgg atggatggat 120agatacacag taggtaggta ggtagtagat agatagatag atagatagat agatagatag 180atagatagat aaacaggata gatagataga tagatagata gatagataga tagatagata 240aacaggatga atatttagaa ggctgggagt gggcagaaag cctggaagga eacacatt298<210>7
<211>346<212>DNA〈213〉人(Homo sapiens)〈220〉<221>polymorphism〈222〉(185) · . (322)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 22, polymorphic, with,gata/gaca' as a repeat unit.<400>7aaattagtgt ctggcaccca gtaaaaaatt actagccata aacactgaga agggagaaac 60actgtaaggt tttatataat gtatgaagtg gtatgatata acttgaaatt aaactgtgat 120atattaaaga tgttgtatta gtcaatgttc tccagagaca gactaatagg aggtagatag 180actggataga tagacgatag atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag 240atatggatag atagatgata gatagataga tatagataga tagacagaca gacagacaga 300
cagacagata gatagataga tagaaggcaa ttcacttggg gaattg346
<210>8<211>479<212>DNA〈213〉人(Homo sapiens)〈220〉<221>polymorphism〈222〉(174) · . (436)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 22, polymorphic, with, tatc, as a repeat unit,not perfect repeat.<400>8cggacgctgg ctaagcccca tcgccttatc tttattttgt gagaagcaaa ctgtggggtt 60tggttgcaag agaagatctt actagggacc agttgcaggg tgtattaatc aggggtttcc 120agagaaacag aactaatagg atctatctgc ctgtcatctc tctctctctc tcctatctat 180ctatctatct atctatcatc tatctatcta tcatctatct atctatctat ctatctatct 240atctatcatc taatctatca tctatctatc tattcatcat ctatttatca actatcatct 300ctcatctatc aactatttgt ttgccatcta ttatctatct atcatctatt tatctattaa 360tcatctattt attaactatc aatctatcat ctgtcatcca tcaactattt atctgtctat 420ccattctcta tctatctgtc tctctgtctg tcaatcagtc agtcaatcca tcgccagaa 479<210>9
<211>133
<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(38). . (110)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 18, polymorphic, with,taga' as a repeat unit.<400>9tcatgtgaca aaagccacac ccataacttt tttcctctag atagacagat agatgataga 60tagatagata gatagataga tagatagata gatagataga tagatataga ttctctttct 120ctgcattctc ate133<210>10<211>182<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(92). . (131)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 18, polymorphic, with’ taga' as a repeat unit.<400>10ctggttttcg tcttgagaag tcatgaggtg gacttaccac aggcaatgtg acttgaggaa 60gagagaaata gagagataga gatgatatac atagatagat agatagatag atagatagat 120agatagatag ataatgataa atcaggaatt taattagctg agtgactcag atgggaatag 180tg 182<210>11<211>306<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(58). . (163)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 18, polymorphic, with’ gaaa' as a repeat unit.<400>11gagccatgtt catgccactg cacttcactc tgagtgacaa attgagacct tgtctcagaa 60agaaagaaag aaagaaagaa agaaagaaag aaagaaagaa agaaagaaag aaagaaagaa 120agaaagaaaa agagagagga aagaaagaga aaaagaaaag aaatagtagc aactgttatt 180
gtaagacatc tccacacacc agagaagtta attttaattt taacatgtta agaacagaga 240gaagccaaca tgtccacctt aggctgacgg tttgtttatt tgtgttgttg ctggtagtcg 300
ggtttg306<210>12<211>365<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(57). . (215)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 18, polymorphic, with,aaag,as a repeat unit, not perfect repeat.<400>12tcaggagaat cacttggaac ccccagcctg ggcaacagag tgagatttca tctgtaaaag 60aaagaaagca agcaaaagaa agagaaagag agagaggaaa gaaggaagga aggaagg aag 120caaggaagga gaaagagaga gcgagagaaa gaaagaaaaa agaaagaaag aaaagaaaga 180aagaaagaga gagagaaaga aagaatgaaa aaagaaaaaa gaaagaaaga aagaagaaag 240aaaagaaaga aagaaagaaa gaaagaaaga aagaaagaaa gaaagaaaga aagaaagaaa 300gaaagaaaga aaaagaaaaa aaatcagagg gtgcgtagat tctacctgct tagctacttc 360atgga365<210>13<211>401<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(264). . (356)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 13, polymorphic, with,gaaa as a repeat unit.<400>13agctactcag gaggccaatg caggaggatt acttcagctc aggagtttga gtccagcctg 60gtcaacacag agagacctag tctcttaaaa aataaaaatt aagaacaaat aaaataaaaa 120tcttattcca gataactggg ctaggaatgg aaataggttg tacacccatt gtcttttaaa 180aaagagaaag aaagaaagag aaagagagaa agaaagagag aaagagagag agggaaagag 240agaaagagaa agagagagaa agagaaagaa agaaaggaaa gaaagaaaga aagaaagaaa 300gaaagaaaga aagaaagaaa gaaagaaaga aagaaagaag gaaagagaaa gagaaatgaa 360tgcaaattct ctggccccag cccagtcctc ctgaattggg a401<210>14<211>428
<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(114). . (294)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 13,polymorphic, with,gaaa,as a repeat unit.<400>14ccattgccct atctttaagt ttgctaattc tttattatat ctattcaaat ctcctttgaa 60tcctatatta tgattcttca gataggcaga ttcaatagga taaatagaca gatgaaagaa 120agaaagagag agagagaaag agagagagag aaagagagag aaagagagag aaagaaagag 180aaagaaagag agaagaaaga aagaaagaaa gaaagaaaga aagaaaggaa gaaaggaaga 240aagaaaagaa agaaagagaa aggaaggaag gaaagaagga aggaaggaaa gaaagatgac 300agatgactaa ataggggaat tggctcatat gattacagag gttgagaact ctcacaatag 360tctgcaaact ggagaaccag gaaagccagt agtgtggcaa cattcaaatc caaaaagcct 420cagcacca428<210>15<211>451<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(105). . (374)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 13, polymorphic, with,gaaa,as a repeat unit, not perfect repeat.<400>15acggcactcc agattgggtg acagagtgac atcgctcctt accccatctt ctccaaaaaa 60aaaagaaaga aagaaggaag gaaggaaggg agggagggaa ggaggaagga aagaaaggaa 120ggaaggagga aagaaagaaa gaaagaaaga aagaaagaga gagagagaaa gaaagaaagt 180aaagaaagaa agaaggaaag aaagaaagag aaagaagaaa aaagaaagaa agaaaaagag 240gaaggaagga aggaagaaaa gagaaagaga aagaaagaaa caaggaaagg aggaaagaaa 300gaaaaagaaa gaaagagaaa gaaaaaaaga aagagaagaa agaaagaaag aaagaaagaa 360agaaagaaaa gaaagaatac ataaacatag tgaggagaat ggtggttagc aaaggctggg 420aaggataaca gaaaggggga gacaaagtgg g451<210>16<211>155<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220>
<221>polymorphism<222>(39). . (113)
<223>X_linked short tandem repeat (STR), polymorphic, with' tatc,as arepeat unit.<400>16tggagaaagt cactgaacag aggagttgca acccagaata tctatctatc tatctattta 60tctatctatc tatctatcta tctatctatc tatctatcta tcatctatct atcgattgag 120agagatggct tttcattgag tagctgaaag gtgcc155<210>17<211>225<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(30). . (203)<223>X_linked short tandem repeat (STR), polymorphic, with' gaa,as arepeat unit.<400>17ccacttcatg gcttaccaca gagagaggag aagaaggaga aggaggagaa ggagaagaag 60aagaagaaga agaagaagaa gaagaagaag aagaagaaga agaagaagaa gaagaagaag 120aagaagaaga agaagaagaa gaggaagagg aagaggaaga ggaagaggaa gaggaagaag 180aagaggaaga agaagaagaa gaagacaggg aacgaaggag caaaa225<210>18<211>248<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><22l>non-polymorphism<222>(1). . (248)<223>Y_linked, used for male sex determination<400>18agtaaaggca acgtccagga tagagtgaag cgacccatga acgcattcat cgtgtggtct 60cgcgatcaga ggcgcaagat ggctctagag aatcccagaa tgcgaaactc agagatcagc 120aagcagctgg gataccagtg gaaaatgctt actgaagccg aaaaatggcc attcttccag 180gaggcacaga aattacaggc catgcacaga gagaaatacc cgaattataa gtatcgacct 240cgtcggaa248<210>19<211>279<212>DNA
<213> 人(Homo sapiens)
<220><221>polymorphism<222>(80). . (232)<223>X_linked short tandem repeat (STR), polymorphic, with' gata,as arepeat unit.<220><221>polymorphism<222>(99). . (233)<223>polymorphic, with,atag,as a repeat unit.<400>19ggaggaccat gtttcactgg aatataaaat gtctggagaa tccaattttg ctttaggctg 60atgtgaggaa gagatagagg atagatagat agatagatag atagatagat agatagatag 120atagatagat agatgataga taatagatag atagatagat agatgataga tagataatag 180atgatagata gatagatata gatagataga tagatagata gatagataga tagcccaaat 240tcctacataa tctagtcatg ccctcagtat tcctgagct279<210>20<211>321<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(175). . (229)<223>X_linked short tandem repeat (STR), polymorphic, with' tatc,as arepeat unit.<400>20catggttctc cttgtggcct tccttaaatg gaaaaacaag gtaacaaagg ggaaacctct 60ggttccagag gaaaagaagt agacatactt ctcgtttcct cctgcaaaat acagctaaaa 120acttggaatg atatacatct atatctgtat agagaactat ctatttatct tttatatcta 180tctatctatc tatctatcta tctatctatc tatctatcta tcatctatct gactctgaaa 240agtggagaga agaaggcaga ccagctaaga aacacaggac tcaaggaaca atatggtggt 300gacttccttg ggtgctggag a321<210>21<211>396<212>DNA<213> 人(Homo sapiens)<220><221>polymorphism<222>(99). . (314)
<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 13, polymorphic, with,tttc,as a repeat unit,not perfect repeat.<400>21gccacctcga aatcctaggc ttgagtaatc ctcccacctc agcctcccaa gtagttgaga 60ttacaagcat gcaacaccat gcatgtgtgc tctttcgctt tctttctttc tttctttctt 120
tctttctttc tttctttctt tctttctttc tttctttctt tctctttctt tttctttctt 180tctttttctt tccttctttc tttctttctc tttctttttc tttctttctt tcttt ttctt 240tccttccttc tttctttttc ttccttcctt cctttcttcc ttctttcctt cctttctttt 300tctttctttc tttccttcct tccttccttc catccttctt tccttccttc ctccctccct 360ctgtcccttc cttccttcca ttcattcgta acgaca396<210>22<211>485<212>DNA〈213〉人(Homo sapiens)〈220〉<221>polymorphism〈222〉(167) · . (313)<223>short tandem repeat (STR) on chromosome 22, polymorphic, with' tcta as a repeat unit.<400>22tggcctcaaa ctgaaggtta cactatcagc ttccgttgtt ctaagggctt cagacttgga 60cagccacact gccagcttcc ctgattcttc agcttgtaga tggtctgtta tgggactttt 120ctcagtctcc ataaatatgt gagtcaattc cccaagtgaa ttgccttcta tctatctatc 180tatctgtctg tctgtctgtc tgtctgtcta tctatctata tctatctatc tatcatctat 240ctatccatat ctatctatct atctatctat ctatctatct atctatctat ctatcgtcta 300tctatccagt ctatctacct cctattagtc tgtctctgga gaacattgac taatacaaca 360tctttaatat atcacagttt aatttcaagt tatatcatac cacttcatac attatataaa 420accttacagt gtttctccct tctcagtgtt tatggctagt aattttttac tgggtgccag 480acact48權(quán)利要求
一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCR STR檢測體系,其特征在于包含A、B、C三組多重PCR體系,A組為引物經(jīng)熒光標(biāo)記的8重PCR體系,檢測位點(diǎn)包含性別判斷基因AMXY,6個(gè)21號染色體特異STR位點(diǎn)D21S1433、D21S1411、D21S1414、D21S1412、D21S1445和一個(gè)位于21q11.2的未命名的STR位點(diǎn),及1個(gè)13號染色體特異STR位點(diǎn)D13S258;B組為引物經(jīng)熒光標(biāo)記的8重PCR體系,檢測位點(diǎn)包含性別判斷基因SRY,4個(gè)18號染色體特異STR位點(diǎn)D18S535、D18S391、D18S51和D18S386,及3個(gè)13號染色體特異STR位點(diǎn)D13S742、D13S634和D13S303;C組為引物經(jīng)熒光標(biāo)記的9重PCR體系,檢測位點(diǎn)包含性別判斷基因AMXY和SRY,5個(gè)X染色體特異STR位點(diǎn)DXS1187、DXS8377、DXS6809、DXS981和DXS1053,1個(gè)13號染色體特異STR位點(diǎn)D13S305,及1個(gè)21號染色體特異STR位點(diǎn)D21S11。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測體系, 其特征在于靶向21號染色體特異STR位點(diǎn)D21S1412、D21S1445和D21S11,以及一個(gè)還未 經(jīng)命名的位于21qll. 2的新STR位點(diǎn)的PCR引物序列,靶向18號染色體特異STR位點(diǎn),靶 向13號染色體特異STR位點(diǎn)D13S742、D13S634、D13S303和D13S305的PCR引物序列,靶向 X 染色體特異 STR 位點(diǎn) DXS1187、DXS8377、DXS6809、DXS981 和 DXS1053 的 PCR 引物序列。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測 體系,其特征在于所述A組的STR多態(tài)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物大小范圍在大部分個(gè)體不重疊, 但D21S1433與21qll. 2的PCR產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,D13S258與 D21S1411的PCR產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,這兩對位點(diǎn)的不同標(biāo)記可使 PCR產(chǎn)物峰區(qū)分開。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測體系, 其特征在于所述B組的STR多態(tài)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物大小范圍在大部分個(gè)體不重疊,D18S386 與D13S742的PCR產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,D13S634與D13S303的PCR 產(chǎn)物等位基因峰在某些個(gè)體中可能出現(xiàn)重疊,這兩對位點(diǎn)的不同標(biāo)記可使PCR產(chǎn)物峰區(qū)分 開。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測體系, 其特征在于所述C組的STR多態(tài)位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物大小范圍在大部分個(gè)體不重疊,而非多態(tài) 的SRY及多態(tài)的DXS981與組內(nèi)其他位點(diǎn)的不同標(biāo)記可使結(jié)果分析更方便。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測體系, 其特征在于所述 A 組的 PCR 體系各引物AMXY、D21S1433、D21S1411、D13S258、D21S1414、 D21S1412、D21S1445 和 21qll. 2,在 PCR 反應(yīng)液中的終濃度分別為 0. 1,0. 2,0. 2,0. 3,0. 4、 0. 4,0. 1 和 0. 35 μ M0
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測體 系,其特征在于所述B組的PCR體系各引物D18S535、D18S391、SRY、D18S51、D18S386、 D13S742、D13S634和 D13S303,在PCR反應(yīng)液中的終濃度分別為 0. 2,0. 2,0. 2,0. 1,0. 4,0. 5、 0.4 禾Π 0.4 μ Μ。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCRSTR檢測體系, 其特征在于所述 C 組的 PCR 體系各引物AMXY、DXSl 187、DXS8377、SRY、DXS6809、DXS981、 DXS1053、D13S305 和 D21S11,在 PCR 反應(yīng)液中的終濃度分別為 0. 1,0. 15,0. 15,0. 2,0. 2、`0. 3、0·2、0· 3 和 0· 5 μ Μ。
全文摘要
本發(fā)明提供一種快速診斷染色體數(shù)目異常的多重QF-PCR STR檢測體系,其包含A、B、C三組PCR體系,A組檢測位點(diǎn)包含AMXY、D21S1433、D21S1411、D13S258、D21S1414、D21S1412、D21S1445和21q11.2;B組檢測位點(diǎn)包含D18S535、D18S391、SRY、D18S51、D18S386、D13S742、D13S634和D13S303,C組檢測位點(diǎn)包含AMXY、DXS1187、DXS8377、SRY、DXS6809、DXS981、DXS1053、D13S305和D21S11,通過此套STR位點(diǎn)足夠多、STR位點(diǎn)雜合率高的快速檢測體系,用在產(chǎn)前診斷可大為縮短診斷時(shí)間,為臨床醫(yī)生及時(shí)處理爭取寶貴時(shí)間,是一個(gè)實(shí)用性極高的產(chǎn)前診斷方法。
文檔編號C12Q1/68GK101838689SQ201010019380
公開日2010年9月22日 申請日期2010年1月14日 優(yōu)先權(quán)日2010年1月14日
發(fā)明者廖燦, 楊昕, 梁巧儀, 黃以寧 申請人:廣州市婦女兒童醫(yī)療中心