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      基因突變序列及其在鑒定膀胱癌干細(xì)胞中的應(yīng)用的制作方法

      文檔序號:11145287閱讀:645來源:國知局
      基因突變序列及其在鑒定膀胱癌干細(xì)胞中的應(yīng)用的制造方法與工藝
      本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體的,本發(fā)明涉及一種基因突變序列、基因突變序列的用途、一種試劑盒、試劑盒的用途和一種鑒定膀胱癌干細(xì)胞的方法。
      背景技術(shù)
      :世界范圍內(nèi),膀胱癌每年有430,000個病例新增和150,300個死亡病例(Chavanetal.,2014)。膀胱癌干細(xì)胞最早在2008年被分選鑒定(Ningetal.,2009;Sheetal.,2008),當(dāng)初所采用的方法是側(cè)群細(xì)胞分選法(Side-Population,SP)。隨著研究的深入,科學(xué)家們陸續(xù)使用CD44v6(YangandChang,2008),67LR(Heetal.,2009),CD44(Chanetal.,2009),ALDH1A1(Suetal.,2010)和CD90/CK14(Volkmeretal.,2012)等分離并鑒定了膀胱癌干細(xì)胞。膀胱癌干細(xì)胞具有干性維持能力和腫瘤起始的能力,負(fù)責(zé)膀胱癌的復(fù)發(fā)和耐藥(Hoetal.,2012;Tranetal.,2010)。根據(jù)先前的報(bào)道,人的膀胱癌干細(xì)胞可能起源于正常膀胱粘膜中表達(dá)CK5和CK17的基底層細(xì)胞(Heetal.,2009)。隨后連續(xù)兩篇文章利用BBN誘導(dǎo)的方法獲得了小鼠膀胱癌模型,并發(fā)現(xiàn)了小鼠原位膀胱癌和浸潤型膀胱癌起源于正常膀胱粘膜中表達(dá)CK5和分泌蛋白shh的基底層細(xì)胞(Shinetal.,2014;VanBataviaetal.,2014);另外,VanBatavia等人還證明了乳頭狀膀胱癌起源于正常膀胱粘膜中表達(dá)CK2的中間層細(xì)胞,而鱗狀細(xì)胞膀胱癌的祖先是表達(dá)CK5的基底層干細(xì)胞(VanBataviaetal.,2014)。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:依據(jù)本發(fā)明的第一方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與表1中的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述突變的所述基因序列。所稱的基因突變序列可以為一條序列,也可以是多條序列的組合,例如,所稱的基因突變序列為存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列,再例如,所稱的基因突變序列包括存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列和存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列。表1基因核酸突變(基因組HG19)ARID1Achr1:27093001G>AATMchr11:108186754C>ACREBBPchr16:3790519C>AERCC2chr19:45867687T>CETS1chr11:128333418A>GFAT4chr4:126329890T>CGPRC5Achr12:13061979T>GLRP2chr2:170096229G>AMAP3K6chr1:27687466G>TMKL1chr22:40807506G>AMLL2chr12:49420183C>GPAWRchr12:79990409G>TPITX2chr4:111542524C>GRNF213chr17:78293189A>TSIN3Achr15:75664469C>TSTAG2chrX:123220567C>GTP53chr17:7577100T>CUSP24chr1:55638075G>AZBTB17chr1:16270382G>T表1所示的19個基因?qū)?yīng)的19個突變是未報(bào)道過的單核苷酸突變,且是經(jīng)發(fā)明人鑒定過的膀胱癌干細(xì)胞特有的。表1中的任意一個或者多個都能夠用于判定細(xì)胞是否是膀胱癌干細(xì)胞,待測細(xì)胞中的核酸序列上存在表1中的任意一個基因突變,能夠判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞。表1所示的19個膀胱癌特有突變,是發(fā)明人利用單細(xì)胞測序方法,對來自三個膀胱癌患者的四類59個單細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞測序、數(shù)據(jù)分析獲得的,并且經(jīng)過其它單細(xì)胞樣本的驗(yàn)證。來自膀胱組織或者膀胱癌組織的細(xì)胞,一般可能為分化的膀胱細(xì)胞、分化的膀胱癌細(xì)胞、膀胱干細(xì)胞或者膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,表1中的SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代與表1一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,都仍舊是本發(fā)明公開的表1中的SNP,屬于本發(fā)明范圍,比如表1中MKL1基因序列上的基因組序列上的突變chr22:40807506G>A,與其cDNA上的c.C2684T,屬于同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.S895L。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞中存在表1中的任意一個突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,而不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定具有表1中的任意一個或者表1中的至少一個突變。依據(jù)本發(fā)明的第二方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與ARID1A基因序列相比, 所述基因突變序列包括存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列還包括其它序列。存在chr1:27093001G>A突變的ARID1A基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ARID1A基因序列上是否存在chr1:27093001G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組ARID1A基因序列上的chr1:27093001G>突變,與其cDNA上的c.G2932A突變,為同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.A978T。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第三方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與ATM基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列還包括其它序列。存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ARID1A基因序列上是否存在chr1:27093001G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組ATM基因序列上的chr11:108186754C>A突變,與其cDNA上的c.C6112A突變,指代同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.H2038N。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第四方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與CREBBP基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列還包括其它序列。存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其CREBBP基因序列上是否存在chr16:3790519C>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組CREBBP基因序列上的chr16:3790519C>A突變,與其cDNA上的c.G3900T突變,指代同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.L1300F。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第五方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與ERCC2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列還包括其它序列。存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ERCC2基因序列上是否存在chr19:45867687T>C突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第六方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與ETS1基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列還包括其它序列。存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ETS1基因序列上是否存在chr11:128333418A>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組ETS1基因序列上的chr11:128333418A>G突變,與其cDNA上的c.T448C突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.S150P。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第七方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與FAT4基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列還包括其它序列。存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其FAT4基因序列上是否存在chr4:126329890T>C突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第八方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與GPRC5A基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列還包括其它序列。存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其GPRC5A基因序列上是否存在chr12:13061979T>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組GPRC5A基因序列上的chr12:13061979T>G突變,與其cDNA上的c.T796G突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.W266G。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第九方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與LRP2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列還包括其它序列。存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其LRP2基因序列上是否存在chr2:170096229G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組LRP2基因序列上的chr2:170096229G>A突變,與其cDNA上的c.C4102T突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.P1368S。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌 干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與MAP3K6基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列還包括其它序列。存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其MAP3K6基因序列上是否存在chr1:27687466G>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十一方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與MKL1基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列還包括其它序列。存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其MKL1基因序列上是否存在chr22:40807506G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組MKL1基因序列上的chr22:40807506G>A突變,與其cDNA上的c.C2684T突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.S895L。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷 該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十二方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與MLL2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列還包括其它序列。存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其MLL2基因序列上是否存在chr12:49420183C>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組MLL2基因序列上的chr12:49420183C>G突變,與其cDNA上的c.G15566C突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.G5189A。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十三方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與PAWR基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列還包括其它序列。存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其PAWR基因序列上是否存在chr12:79990409G>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組PAWR基因序列上的chr12:79990409G>T突變,與其cDNA上的c.C713A突變,指代同一非同義突變,都能致 使發(fā)生多肽變異p.S238X。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十四方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與PITX2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列還包括其它序列。存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其PITX2基因序列上是否存在chr4:111542524C>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組PITX2基因序列上的chr4:111542524C>G突變,與其cDNA上的c.G207C突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.E69D。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十五方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與RNF213基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列還包括其它序列。存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其RNF213基因序列上是否存在chr17:78293189A>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明 的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十六方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與SIN3A基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列還包括其它序列。存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其SIN3A基因序列上是否存在chr15:75664469C>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組SIN3A基因序列上的chr15:75664469C>T突變,與其cDNA上的c.G2052A突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.L684L。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十七方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與STAG2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列還包括其它序列。存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其STAG2基因序列上是否存在chrX:123220567C>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明 的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十八方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與TP53基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列還包括其它序列。存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其TP53基因序列上是否存在chr17:7577100T>C突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組TP53基因序列上的chr17:7577100T>C突變,與其cDNA上的c.A442G突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.R148G。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第十九方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與USP24基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列還包括其它序列。存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其USP24基因序列上是否存在chr1:55638075G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱 的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第二十方面,本發(fā)明提供一種基因突變序列,與ZBTB17基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列,也可以為序列組合,即除了存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列還包括其它序列。存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ZBTB17基因序列上是否存在chr1:16270382G>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。依據(jù)本發(fā)明的第二十方面,本發(fā)明提供上述任一方面的基因突變序列在鑒定膀胱癌干細(xì)胞中的用途。表1中的19個基因?qū)?yīng)的19個突變是未報(bào)道過的單核苷酸突變,且是經(jīng)發(fā)明人鑒定過的膀胱癌干細(xì)胞特有的。表1中的任意一個或者多個都能夠用于判定細(xì)胞是否是膀胱癌干細(xì)胞,待測細(xì)胞中的核酸序列上只要存在表1中的任意一個基因突變,就能夠判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞。表1所示的19個膀胱癌特有突變,是發(fā)明人利用單細(xì)胞測序方法,對來自三個膀胱癌患者的四類59個單細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞測序、數(shù)據(jù)分析比較獲得的,并且經(jīng)過其它單細(xì)胞樣本的驗(yàn)證。需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞中存在表1中的任意一個突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,而不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定具有表1中的任意一個或者表1中的至少一個突變。依據(jù)本發(fā)明的第二十一方面,本發(fā)明提供一種試劑盒,其包括能夠檢測出上述本發(fā)明任一方面的基因突變序列的試劑。本領(lǐng)域技術(shù)人員可以理解,檢測SNP突變,可以利用SNP突變所在的位置的參考序列設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增出該位置的序列,對該序列進(jìn)行測序進(jìn)而確定 該位置的堿基;也可以利用SNP突變所在的位置的參考序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物和延伸引物,利用質(zhì)譜檢測該位置的堿基。所以,所稱的試劑包括但不限于引物、擴(kuò)增體系、測序相關(guān)試劑和/或質(zhì)譜檢測試劑。該試劑盒能夠用來檢測膀胱癌干細(xì)胞。利用該試劑盒檢測一個細(xì)胞是否是膀胱癌干細(xì)胞時,通過檢測該細(xì)胞是否存在試劑盒能檢出的任一基因突變序列來判定該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。較佳的,待測細(xì)胞來自膀胱組織或者膀胱癌組織,一般的,來自膀胱組織的細(xì)胞可能為分化的膀胱細(xì)胞、分化的膀胱癌細(xì)胞、膀胱干細(xì)胞和膀胱癌干細(xì)胞。依據(jù)本發(fā)明的第二十二方面,本發(fā)明提供一種鑒定膀胱癌干細(xì)胞的方法,該方法包括:檢測待測細(xì)胞的基因組中是否存在表1中的任意一個突變,若存在,則判定所述待測細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞。較佳的,待測細(xì)胞來自膀胱組織包括膀胱癌組織,一般的,來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞可能為分化的膀胱細(xì)胞(differentiatednormalbladdercells,DNBCs)、分化的膀胱癌細(xì)胞(differentiatedbladdercancercells,DBCCs)、膀胱干細(xì)胞(normalbladderstemcells,NBSCs)和膀胱癌干細(xì)胞(bladdercancerstemcells,BCSCs)。一個細(xì)胞中存在表1中的至少一個突變是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞中存在表1中的任意一個突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定具有表1中的任意一個或者表1中的至少一個突變。附圖說明本發(fā)明的上述和/或附加的方面和優(yōu)點(diǎn)從結(jié)合下面附圖對實(shí)施方式的描述中將變得明顯和容易理解,其中:圖1是本發(fā)明的一個實(shí)施例中的正常膀胱細(xì)胞和膀胱癌細(xì)胞的流式分選結(jié)果示意圖;圖1A顯示正常膀胱細(xì)胞和膀胱癌細(xì)胞的流式分選策略;圖1B顯示BCS2、BCS3和BCS5的流式分選結(jié)果。圖2是本發(fā)明的一個實(shí)施例中的從BCS2、BCS3和BCS5中獲得的59個單細(xì)胞DNA樣品的電泳檢測結(jié)果。圖3是本發(fā)明的一個實(shí)施例中的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的評估結(jié)果圖;圖3A顯示從BCS2、BCS3和BCS5中分離的單細(xì)胞的平均測序深度,圖3B顯示59個單細(xì)胞的測序覆蓋度。圖4是本發(fā)明的一個實(shí)施例中的BCS2、BCS3和BCS5中膀胱癌干細(xì)胞和分化的膀胱癌腫瘤細(xì)胞中特有突變和共有突變的維恩圖。圖5是本發(fā)明的一個實(shí)施例中的膀胱癌干細(xì)胞特有的19個基因突變的頻率分析結(jié)果示意圖。具體實(shí)施方式下面詳細(xì)描述本發(fā)明的實(shí)施例,所述實(shí)施例的示例在附圖中示出,其中,自始至終相同或類似的標(biāo)號表示相同或類似的元件或具有相同或類似功能的元件。下面通過參考附圖描述的實(shí)施例是示例性的,僅用于解釋本發(fā)明,而不能理解為對本發(fā)明的限制。需要說明的,本文中所使用的術(shù)語“第一”、“第二”或者“第一部分”等僅為方便描述,不能理解為指示或暗示相對重要性,也不能理解為之間有先后順序關(guān)系。在本發(fā)明的描述中,除非另有說明,“多個”的含義是兩個或兩個以上。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與表1中的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述突變的所述基因序列。所稱的基因突變序列可以為其上存在表1中的一個突變對應(yīng)的基因序列,也可以是表1中任意多個突變或者全部19個突變對應(yīng)的多條基因序列的組合。例如,所稱的基因突變序列為存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列、為存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列、為存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列、為存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列、為存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列、為存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列、為存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列、為存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列、為存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列、為存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列、為存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列、為存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列、為存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列、為存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列、為存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列、為存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列、為存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列、為存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列或者為存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列。所稱的基因突變序列也可以為上述任意兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個、十八個或者全部十九個帶相應(yīng)突變的基因序列的組合。例如,所稱的基因突變序列為存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列和存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列的組合,或者所稱的基因突變序列為存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列和存在其它任意一個或多個突變的基因序列的組合。再例如,所稱的基因突變序列包括存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列和存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列,任選的,還包括一個或多個其它帶有相應(yīng)突變的基因序列。表1所示的19個基因?qū)?yīng)的19個突變是發(fā)明人新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的單核苷酸突 變,且是經(jīng)發(fā)明人鑒定過的膀胱癌干細(xì)胞特有的。表1中的任意一個或者多個都能夠用于判定細(xì)胞是否是膀胱癌干細(xì)胞,待測細(xì)胞中的核酸序列上存在表1中的任意一個基因突變,能夠判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞。表1所示的19個膀胱癌特有突變,是發(fā)明人利用單細(xì)胞測序方法,對來自三個膀胱癌患者的四類59個單細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞測序、數(shù)據(jù)分析獲得的,并且經(jīng)過其它單細(xì)胞樣本的驗(yàn)證。來自膀胱組織或者膀胱癌組織的細(xì)胞,一般可能為分化的膀胱細(xì)胞、分化的膀胱癌細(xì)胞、膀胱干細(xì)胞或者膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,表1中的SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代與表1一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,都仍舊是本發(fā)明公開的表1中的SNP,屬于本發(fā)明范圍,比如表1中MKL1基因序列上的基因組序列上的突變chr22:40807506G>A,與其cDNA上的c.C2684T,屬于同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.S895L。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞中存在表1中的任意一個突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,而不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定具有表1中的任意一個或者表1中的至少一個突變。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與ARID1A基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列。存在chr1:27093001G>A突變的ARID1A基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ARID1A基因序列上是否存在chr1:27093001G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組ARID1A基因序列上的chr1:27093001G>突變,與其cDNA上的c.G2932A突變,為同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.A978T。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列, 也可以為序列組合,即所稱基因突變序列除了包括存在chr1:27093001G>A的ARID1A基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr1:27093001G>A以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列還包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr1:27093001G>A以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與ATM基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列。存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ARID1A基因序列上是否存在chr1:27093001G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組ATM基因序列上的chr11:108186754C>A突變,與其cDNA上的c.C6112A突變,指代同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.H2038N。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列,也可以為序列組合,即所稱的基因突變序列除了包括存在chr11:108186754C>A的ATM基因序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr11:108186754C>A以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變對應(yīng)的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr11:108186754C>A以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與CREBBP基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列。存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其CREBBP基因序列上是否存在chr16:3790519C>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組CREBBP基因序列上的chr16:3790519C>A突變,與其cDNA上的c.G3900T突變,指代同一突變,都能致使發(fā)生多肽突變p.L1300F。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr16:3790519C>A的CREBBP基因序列,也可以為序列組合,即所稱的基因突變序列除了包括存在chr16:3790519C>的CREBBP基因序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr16:3790519C>A以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr16:3790519C>A以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與ERCC2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列。存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ERCC2基因序列上是否存在chr19:45867687T>C突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7 位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列,也可以為序列組合,即所稱基因突變序列除了包括存在chr19:45867687T>C的ERCC2基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr19:45867687T>C以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr19:45867687T>C以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與ETS1基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列。存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ETS1基因序列上是否存在chr11:128333418A>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組ETS1基因序列上的chr11:128333418A>G突變,與其cDNA上的c.T448C突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.S150P。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列,也可以為序列組合,即所稱基因突變序列除了包括存在chr11:128333418A>G的ETS1基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、 九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr11:128333418A>G以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr11:128333418A>G以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與FAT4基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列。存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其FAT4基因序列上是否存在chr4:126329890T>C突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列,也可以為序列組合,即該基因突變序列除了包括存在chr4:126329890T>C的FAT4基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr4:126329890T>C以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr4:126329890T>C以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與GPRC5A基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列。存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過 檢測其GPRC5A基因序列上是否存在chr12:13061979T>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組GPRC5A基因序列上的chr12:13061979T>G突變,與其cDNA上的c.T796G突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.W266G。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列,也可以為序列組合,即該基因突變序列除了包括存在chr12:13061979T>G的GPRC5A基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr12:13061979T>G以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr12:13061979T>G以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與LRP2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列。存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其LRP2基因序列上是否存在chr2:170096229G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組LRP2基因序列上的chr2:170096229G>A突變,與其cDNA上的c.C4102T突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.P1368S。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌 干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列,也可以為序列組合,即所稱基因突變序列除了存在chr2:170096229G>A的LRP2基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr2:170096229G>A以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr2:170096229G>A以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與MAP3K6基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列。存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其MAP3K6基因序列上是否存在chr1:27687466G>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列,也可以為序列組合,即該基因突變序列除了存在chr1:27687466G>T的MAP3K6基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr1:27687466G>T以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr1:27687466G>T以外的任意多個 突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與MKL1基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列。存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其MKL1基因序列上是否存在chr22:40807506G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組MKL1基因序列上的chr22:40807506G>A突變,與其cDNA上的c.C2684T突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.S895L。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列,也可以為序列組合,即該基因突變序列除了包括存在chr22:40807506G>A的MKL1基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,30.權(quán)利要求29的基因突變序列,其特征在于,與表1中的chr22:40807506G>A以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr22:40807506G>A以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與MLL2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列。存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其MLL2基因序列上是否存在chr12:49420183C>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP 位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組MLL2基因序列上的chr12:49420183C>G突變,與其cDNA上的c.G15566C突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.G5189A。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列,也可以為序列組合,即所稱基因突變序列除了包括存在chr12:49420183C>G的MLL2基因序列,還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr12:49420183C>G以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr12:49420183C>G以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與PAWR基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列。存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其PAWR基因序列上是否存在chr12:79990409G>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組PAWR基因序列上的chr12:79990409G>T突變,與其cDNA上的c.C713A突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.S238X。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列,也 可以為序列組合,即除了包括存在chr12:79990409G>T的PAWR基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr12:79990409G>T以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr12:79990409G>T以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與PITX2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列。存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其PITX2基因序列上是否存在chr4:111542524C>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組PITX2基因序列上的chr4:111542524C>G突變,與其cDNA上的c.G207C突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.E69D。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列,也可以為序列組合,即包括除了存在chr4:111542524C>G的PITX2基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr4:111542524C>G以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr4:111542524C>G以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與RNF213基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列。存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列是新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其RNF213基因序列上是否存在chr17:78293189A>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列,也可以為序列組合,即除了包括存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr17:78293189A>T以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr17:78293189A>T以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與SIN3A基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列。存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其SIN3A基因序列上是否存在chr15:75664469C>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位 點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組SIN3A基因序列上的chr15:75664469C>T突變,與其cDNA上的c.G2052A突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.L684L。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列,也可以為序列組合,即除了包括存在chr15:75664469C>T的SIN3A基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr15:75664469C>T以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr15:75664469C>T以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與STAG2基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列。存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其STAG2基因序列上是否存在chrX:123220567C>G突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr17:78293189A>T的RNF213基因序列,也可以為序列組合,即除了包括存在chrX:123220567C>G的STAG2基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突 變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chrX:123220567C>G以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chrX:123220567C>G以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與TP53基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列。存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其TP53基因序列上是否存在chr17:7577100T>C突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍,基因組TP53基因序列上的chr17:7577100T>C突變,與其cDNA上的c.A442G突變,指代同一非同義突變,都能致使發(fā)生多肽變異p.R148G。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列,也可以為序列組合,即除了包括存在chr17:7577100T>C的TP53基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr17:7577100T>C以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr17:7577100T>C以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與USP24基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列。存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其 USP24基因序列上是否存在chr1:55638075G>A突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列,也可以為序列組合,即除了包括存在chr1:55638075G>A的USP24基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr1:55638075G>A以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr1:55638075G>A以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例公開的基因突變序列,與ZBTB17基因序列相比,所述基因突變序列包括存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列。存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列是新發(fā)現(xiàn)的未報(bào)道過的突變序列,該突變序列是膀胱癌干細(xì)胞特有的,可以用來鑒定一個細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。特別是對來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞,通過檢測其ZBTB17基因序列上是否存在chr1:16270382G>T突變,能準(zhǔn)確判斷該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,該SNP突變的表示方式是根據(jù)HGVS命名法標(biāo)注該位點(diǎn)在參考基因組DNA(gDNA,HG19版本)上的位置來顯示的,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠知道,一個SNP位點(diǎn)還可以有其它表示方式,例如以GenBankSNP數(shù)據(jù)庫的命名方法——以rs加7位阿拉伯?dāng)?shù)字來表示一個SNP,例如以該SNP在參考cDNA上的位置來標(biāo)注指代一樣的SNP位點(diǎn)或SNP組合,仍屬于本發(fā)明公開的范圍。還需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞的核酸序列上存在該突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定存在該突變序列。該基因突變序列可以是一條序列——存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列,也可以為序列組合,即除了包括存在chr1:16270382G>T的ZBTB17基因序列,該基因突變序列還包括帶有表1中其它的任意一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個、九個、十個、十一個、十二個、十三個、十四個、十五個、十六個、十七個或者十八個突變對應(yīng)的一條或多條基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,與表1中的chr1:16270382G>T以外的任意一個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括存在所述任意一個突變的所述基因序列。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中,分別與表1中的chr1:16270382G>T以外的任意多個突變所在的基因序列相比,所述基因突變序列包括分別存在所述多個突變的所述基因序列。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例,提供了上述任一實(shí)施例中的基因突變序列在鑒定膀胱癌干細(xì)胞中的用途。表1中的19個基因?qū)?yīng)的19個突變是發(fā)明人新發(fā)現(xiàn)的、未見報(bào)道過的單核苷酸突變,且是經(jīng)發(fā)明人鑒定過的膀胱癌干細(xì)胞特有的。表1中的任意一個或者多個都能夠用于判定細(xì)胞是否是膀胱癌干細(xì)胞,待測細(xì)胞中的核酸序列上只要存在表1中的任意一個基因突變,就能夠判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞。表1所示的19個膀胱癌特有突變,是發(fā)明人利用單細(xì)胞測序方法,對來自三個膀胱癌患者的四類59個單細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞測序、數(shù)據(jù)分析比較獲得的,并且經(jīng)過其它單細(xì)胞樣本的驗(yàn)證。需要說明的是,一個細(xì)胞中存在所稱的基因突變序列是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞中存在表1中的任意一個突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,而不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定具有表1中的任意一個或者表1中的至少一個突變。因?yàn)楸?中的19個突變是基于比較這四類細(xì)胞,排除其它三類細(xì)胞中存在的突變,而確定下來的、只發(fā)現(xiàn)存在膀胱癌干細(xì)胞的,即膀胱癌干細(xì)胞特有,所以較佳的,待測細(xì)胞來自膀胱組織或者膀胱癌組織,一般的,膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞一般包括四類:分化的膀胱細(xì)胞、分化的膀胱癌細(xì)胞、膀胱干細(xì)胞和膀胱癌干細(xì)胞,。依據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例,提供一種包括能夠檢測出上述本發(fā)明任一實(shí)施例的基因突變序列的試劑的試劑盒。本領(lǐng)域技術(shù)人員可以理解,檢測SNP突變,可以利用SNP突變所在的位置的參考序列設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增出該位置的序列,對該序列進(jìn)行測序進(jìn)而確定該位置的堿基;也可以利用SNP突變所在的位置的參考序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物和延伸引物,利用質(zhì)譜檢測該位置的堿基。所以,所稱的試劑包括但不限于引物、擴(kuò)增體系、測序相關(guān)試劑和/或質(zhì)譜檢測試劑。該試劑盒能夠用來檢測膀胱癌干細(xì)胞。利用該試劑盒檢測一個細(xì)胞是否是膀胱癌干細(xì)胞時,通過檢測該細(xì)胞是否存在試劑盒能檢出的任一基因突變序列來判定該細(xì)胞是否為膀胱癌干細(xì)胞。因?yàn)楸?中的19個突變是基于比較膀胱/膀胱癌組織中的四類細(xì) 胞,排除大量的其它三類細(xì)胞中存在的突變,而確定下來的、只可能存在于膀胱癌干細(xì)胞的,所以較佳的,待測細(xì)胞來自膀胱組織和/或膀胱癌組織,一般的,來自膀胱/膀胱癌組織的細(xì)胞可能為分化的膀胱細(xì)胞、分化的膀胱癌細(xì)胞、膀胱干細(xì)胞和膀胱癌干細(xì)胞。依據(jù)本發(fā)明的一個實(shí)施例公開的鑒定膀胱癌干細(xì)胞的方法,該方法包括:檢測待測細(xì)胞的基因組中是否存在表1中的任意一個突變,若存在,則判定所述待測細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞。因?yàn)楸?中的19個突變是基于比較膀胱/膀胱癌組織中的四類細(xì)胞,排除大量的其它三類細(xì)胞中存在的突變,而確定下來的、只可能存在于膀胱癌干細(xì)胞的,所以較佳的,待測細(xì)胞來自膀胱組織,一般的,來自膀胱組織的細(xì)胞可能為分化的膀胱細(xì)胞、分化的膀胱癌細(xì)胞、膀胱干細(xì)胞和膀胱癌干細(xì)胞。需要說明的是,一個細(xì)胞中存在表1中的至少一個突變是判斷該細(xì)胞是膀胱癌干細(xì)胞的必要非充分條件,即待測細(xì)胞中存在表1中的任意一個突變序列,則判定該細(xì)胞為膀胱癌干細(xì)胞,反之,不能推定膀胱癌干細(xì)胞一定具有表1中的任意一個或者表1中的至少一個突變。以下結(jié)合具體實(shí)施例對本發(fā)明的基因突變序列和檢測膀胱癌干細(xì)胞的方法進(jìn)行詳細(xì)的描述。除另有交待,以下實(shí)施例中涉及的未特別交待的試劑、序列(接頭、標(biāo)簽和引物)、軟件及儀器,都是常規(guī)市售產(chǎn)品或者開源的。實(shí)施例一1.組織樣本處理獲得單細(xì)胞樣本膀胱組織或者膀胱癌組織樣本獲自深圳市第二人民醫(yī)院。原代的膀胱癌組織和正常的膀胱組織取自膀胱全切的膀胱癌患者,獲得新鮮的組織經(jīng)過無菌剪碎和膠原酶消化,過濾獲得單細(xì)胞懸液。利用CD31、CD45、CD44和Pan-CK抗體,對三例膀胱癌患者的膀胱癌組織和正常的膀胱組織進(jìn)行染色標(biāo)記。然后通過流式分選的方法,分選出正常膀胱干細(xì)胞(normalbladderstemcells,NBSCs,pan-CK+CD44+),分化的膀胱細(xì)胞(differentiatednormalbladdercells,DNBCs,pan-CK+CD44-),膀胱癌干細(xì)胞(bladdercancerstemcells,BCSCs,CD31-CD45-CD44+)和分化的膀胱癌細(xì)胞(differentiatedbladdercancercells,DBCCs,CD31-CD45-CD44-)四類不同的細(xì)胞,圖1顯示正常膀胱細(xì)胞和膀胱癌細(xì)胞的流式分選結(jié)果。圖1A顯示正常膀胱細(xì)胞和膀胱癌細(xì)胞的流式分選策略:正常膀胱干細(xì)胞(normalbladderstemcells,NBSCs,pan-CK+CD44+),分化的膀胱細(xì)胞(differentiatednormalbladdercells,DNBCs,pan-CK+CD44-),膀胱癌干細(xì)胞(bladdercancerstemcells,BCSCs,CD31-CD45-CD44+)和分化的膀胱癌細(xì)胞(differentiatedbladdercancercells,DBCCs, CD31-CD45-CD44-)。CD31為內(nèi)皮細(xì)胞標(biāo)志物,CD45為造血譜系細(xì)胞標(biāo)志物,CD44為干細(xì)胞標(biāo)志物,pan-CK為上皮細(xì)胞標(biāo)志物;圖1B顯示膀胱癌全切的患者BCS2,BCS3和BCS5的流式分選結(jié)果。2.單細(xì)胞的基因組提取和鑒定為了在單細(xì)胞水平獲得不同類型細(xì)胞的基因背景和它們之間的進(jìn)化關(guān)系,我們對分選的細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞化,并通過多重置換擴(kuò)增(MDA:multipledisplacementamplification)的方法對單細(xì)胞的基因組進(jìn)行了DNA的提取和擴(kuò)增。經(jīng)過PCR鑒定,共獲得了59個合格的單細(xì)胞DNA樣品,如表2和圖2所示。表2顯示原代膀胱癌BCS2,BCS3和BCS5中獲得的59個單細(xì)胞DNA樣品。圖2顯示原代膀胱癌BCS2,BCS3和BCS5中獲得的59個單細(xì)胞DNA樣品的電泳檢測結(jié)果,這些樣本的DNA樣品均通過了管家基因的質(zhì)量檢測,合格的DNA樣品需要擴(kuò)增出至少6個管家基因。表23.單細(xì)胞DNA樣品的外顯子測序?qū)ι鲜?9個合格的單細(xì)胞DNA樣品,進(jìn)行了建庫和外顯子測序。在外顯子區(qū)域的的平均測序深度有43×,平均覆蓋度有95.21%,如圖3所示。圖3顯示單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的評估結(jié)果,圖3A顯示原代膀胱癌BCS2,BCS3和BCS5中分離的單細(xì)胞的平均測序深度(Depth,×),圖3B顯示59個單細(xì)胞的測序覆蓋度(Coverage,%)。4.膀胱癌單細(xì)胞測序的突變分析首先,對測序的數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析(Houetal.,2012;Xuetal.,2012)。在獲得了可靠的單個核苷酸的變異數(shù)據(jù)庫后,保留了那些在正常細(xì)胞中相同基因型、并且在兩個以上腫瘤細(xì)胞中相同的突變。如此,在三個樣本中分別獲得了757、499和166這樣的個體突變。過濾掉上述突變位點(diǎn)中與單個核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(TheSingleNucleotidePolymorphismdatabase,dbSNP)相同的位點(diǎn)以及同義突變的位點(diǎn),在三個樣本中分別篩選到147、253和6個非同義突變的基因,在所有的突變中,隨機(jī)挑選了200基因做技術(shù)驗(yàn)證,通過大量的Sanger測序驗(yàn)證,測序的準(zhǔn)確率是97.22%(1188/1222)。然后,分析膀胱干細(xì)胞和分化膀胱腫瘤細(xì)胞相同的突變和互斥的突變基因,結(jié)果如圖4所示。圖4的維恩圖同時也能說明膀胱癌干細(xì)胞中基因突變的數(shù)量更多。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),來自BCS2和BCS3的膀胱癌干細(xì)胞共有的遺傳突變基因包括BRF1,ETS1,LTBP3和USH2A;BCS2和BCS5的膀胱癌干細(xì)胞共有MUC2和RGS9BP基因突變;來自BCS2和BCS5的分化膀胱腫瘤細(xì)胞共有的突變基因是LAMA5。然而,我們并沒有發(fā)現(xiàn)三例不同膀胱癌患者的膀胱癌干細(xì)胞和分化膀胱腫瘤細(xì)胞共有的遺傳突變,這可能是腫瘤的異質(zhì)性和病理分期分級的不同所導(dǎo)致。為了找到那些能夠決定干細(xì)胞形成和重編程的關(guān)鍵基因突變,我們關(guān)注了那些在膀胱癌干細(xì)胞中的特有突變,尤其是那些具有轉(zhuǎn)錄調(diào)控,染色質(zhì)重塑調(diào)節(jié)和細(xì)胞自我更新/細(xì)胞發(fā)育調(diào)節(jié)的關(guān)鍵基因。從滿足以上功能的基因中,驗(yàn)證篩選到19個膀胱癌干細(xì)胞特有突變,如表1所示。19個膀胱癌特有突變所在的基因?yàn)椋篊REBBP,ETS1,GPRC5A,MKL1,MLL2,PAWR,PITX2,STAG2,RNF213,USP24,ARID1A,ATM,ERCC2,FAT4,LRP2,SIN3A,TP53,MAP3K6和ZBTB17。對以上19個膀胱癌干細(xì)胞特有的突變基因進(jìn)行了突變頻率分析,突變頻率小于50%的為MAP3K6,RNF213,USP24和ZBTB17四個基因,余下15個突變基因的特有突變的突變頻率不小于50%,如圖5所示。圖5顯示膀胱癌干細(xì)胞特有19個基因突變的頻率分析,19個基因按照字母表的順序在橫坐標(biāo)依次排開,縱坐標(biāo)顯示每個基因的體突變頻率,圓的大小代表發(fā)生基因突變的細(xì)胞數(shù)目的相對多寡。實(shí)施例二為了驗(yàn)證上述發(fā)現(xiàn)確定的表1中的19個突變基因可以用于鑒定區(qū)分出膀胱癌干細(xì)胞,發(fā)明人收集了另外45例膀胱癌組織樣本和100例正常膀胱組織樣本,按照實(shí)施例一的方法分離鑒定得249個膀胱癌干細(xì)胞、782個正常膀胱干細(xì)胞、750個分化的正常膀胱細(xì)胞和278個分化的膀胱癌細(xì)胞單細(xì)胞樣本。檢測各類細(xì)胞基因組存在上述表1所列的19個突變基因的情況,統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示:782個正常膀胱干細(xì)胞中有1個細(xì)胞的基因組檢測存在表1中的突變FAT4基因chr4:126329890T>C,750個分化的正常膀胱細(xì)胞的基因組均為被檢測到19個突變基因中的任何一個,278個分化的膀胱癌細(xì)胞中有兩個細(xì)胞的基因組各存在表1中的一個不同突變基因,而249個膀胱癌干細(xì)胞中有206個的基因組被檢測到存在表1中的1個或多個突變基因。實(shí)施例三為了進(jìn)一步驗(yàn)證上述發(fā)現(xiàn)確定的19個突變基因中的ARID1A,GPRC5A和MLL2突變基因可以用來檢測鑒定膀胱癌干細(xì)胞,發(fā)明人收集分離了另外51例膀胱癌樣本,對其進(jìn)行了膀胱癌干細(xì)胞的分選,從每個病例樣本分離鑒定共獲得51個膀胱癌干細(xì)胞。提取每個病例 的膀胱癌干細(xì)胞的DNA,再利用檢測ARID1A,GPRC5A和MLL2三個基因的引物來確定膀胱癌干細(xì)胞中的這三個基因是否存在表1中的突變,突變檢測引物可以基于突變所在位置的參考基因序列設(shè)計(jì)合成。經(jīng)過統(tǒng)計(jì),在51例膀胱癌干細(xì)胞單細(xì)胞樣本中,有12個膀胱癌干細(xì)胞具有ARID1A(23.53%)突變,10個膀胱癌干細(xì)胞具有GPRC5A(19.61%)突變,11個膀胱癌的干細(xì)胞具有MLL2(21.57%)突變,如表3所示。表3基因(gene)突變率(Mutationrate)ARID1A12/51=23.53%GPRC5A10/51=19.61%MLL211/51=21.57%通過對每個樣本的突變情況進(jìn)行了仔細(xì)的分析,發(fā)現(xiàn)有三個樣本同時具有ARID1A和GPRC5A上的表1中的突變(3/51=5.88%);有另外三個樣本同時具有GPRC5A和MLL2上的表1中的突變(3/51=5.88%);有4四個樣本同時具有ARID1A和MLL2上的表1中的突變(4/51=7.84%);有2兩個樣本同時具有ARID1A,GPRC5A和MLL2上的表1中的突變(2/51=3.92%)。實(shí)施例四為了進(jìn)一步驗(yàn)證上述發(fā)現(xiàn)確定的19個突變基因中可以用來檢測鑒定膀胱癌干細(xì)胞,發(fā)明人收集了485例正常膀胱組織樣本和45例膀胱癌組織樣本,參照實(shí)施例一從所說的組織樣本中分離鑒定得到2051個分化的膀胱細(xì)胞、179個膀胱癌干細(xì)胞、205個分化的膀胱癌細(xì)胞和889個膀胱干細(xì)胞。利用表1中的突變所在的基因的參考序列設(shè)計(jì)合成各個突變的檢測引物,檢測上述各類單細(xì)胞樣本的基因組是否存在表1中的19個突變基因,統(tǒng)計(jì)結(jié)果。統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,在上述2051個正常膀胱細(xì)胞未檢測到表1中的19個突變基因中的任一個,205個分化的膀胱癌細(xì)胞中檢測到1個細(xì)胞的基因組存在表1所列的1個突變基因,899個膀胱干細(xì)胞中檢測到兩個細(xì)胞的基因組分別存在表1所列的不同的1個突變基因。179個膀胱癌干細(xì)胞中有148個細(xì)胞的基因組檢測到存在一個或幾個表1所列的19個突變基因,其中有35個檢測到只存在19個突變基因中的一個,113個膀胱癌干細(xì)胞檢測到存在多個表1中的突變基因,而且,在這撥膀胱癌干細(xì)胞的基因組中均未檢測到表1中的帶有USP24基因chr1:55638075G>A的USP24突變基因序列。在本說明書的描述中,參考術(shù)語“一個實(shí)施例”、“一些實(shí)施例”、“示例”、“具體示例”、 或“一些示例”等的描述意指結(jié)合該實(shí)施例或示例描述的具體特征、結(jié)構(gòu)、材料或者特點(diǎn)包含于本發(fā)明的至少一個實(shí)施例或示例中。在本說明書中,對上述術(shù)語的示意性表述不一定指的是相同的實(shí)施例或示例。而且,描述的具體特征、結(jié)構(gòu)、材料或者特點(diǎn)可以在任何的一個或多個實(shí)施例或示例中以合適的方式結(jié)合。盡管已經(jīng)示出和描述了本發(fā)明的實(shí)施例,本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員可以理解:在不脫離本發(fā)明的原理和宗旨的情況下可以對這些實(shí)施例進(jìn)行多種變化、修改、替換和變型,本發(fā)明的范圍由權(quán)利要求及其等同物限定。當(dāng)前第1頁1 2 3 
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