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      一種用于檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的試劑盒的制作方法

      文檔序號(hào):12250046閱讀:492來(lái)源:國(guó)知局
      一種用于檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的試劑盒的制作方法與工藝

      本發(fā)明涉及分子生物學(xué)領(lǐng)域,特別是涉及一種用于檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的通用試劑盒及其應(yīng)用。



      背景技術(shù):

      新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV),屬副黏病毒科、禽腮腺炎病毒屬(Rubulavirus)。NDV只有一個(gè)血清型,病毒粒子呈多形性,直徑約為100~250nm,有囊膜的病毒粒子一般呈圓形,但常因囊膜破損而形態(tài)不規(guī)則。NDV為單股、負(fù)鏈、不分節(jié)段的RNA,全長(zhǎng)約15.2kb。在NDV基因組上依次排列著NP、P、M、F、HN和L基因,分別編碼核衣殼蛋白(NP)、磷蛋白(P)、基質(zhì)蛋白(M)、融合蛋白(F)、血凝素-神經(jīng)氨酸酶(HN)和大分子蛋白(L),其中F、HN蛋白與NDV的致病性密切相關(guān)。F蛋白具有使病毒囊膜與宿主細(xì)胞融合,進(jìn)而病毒核酸進(jìn)入宿主細(xì)胞作用。核苷酸序列分析表明,F(xiàn)蛋白基因編碼一個(gè)由553個(gè)氨基酸組成的多肽。F蛋白首先以非活性前體F0(68KD)的形式存在,此時(shí)無(wú)融合活性,當(dāng)其經(jīng)高爾基體運(yùn)輸時(shí)被裂解為由二硫鍵連接的F1(55.OKD)+F2(12.5KD)后,才使得病毒具有感染力,可以看出F蛋白與NDV的致病性密切相關(guān)。

      傳統(tǒng)的NDV檢測(cè)方法主要有血凝和血凝抑制(HI)試驗(yàn),酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)和病原分離。確診通常需要接種雞胚進(jìn)行病毒分離,有時(shí)還需要進(jìn)行病毒毒力測(cè)定以及動(dòng)物回歸實(shí)驗(yàn)等。病毒分離方法,對(duì)采集病料的時(shí)機(jī)和病料的新鮮程度要求較高,且檢測(cè)周期往往要幾周以上,具有明顯的局限性。

      生物技術(shù)的飛速發(fā)展極大地推動(dòng)了生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展,疾病的診斷、病原的檢測(cè)已從細(xì)胞水平進(jìn)入分子水平。NDV分子結(jié)構(gòu)與致病性關(guān)系研究的日益深入為副粘病毒的診斷技術(shù)研究奠定了基礎(chǔ)。根據(jù)不同致病性毒株存在的分子結(jié)構(gòu)差異,相繼建立了特異、快速的分子診斷技術(shù),包括單克隆抗體技術(shù)、核酸探針技術(shù)、限制性核酸內(nèi)切酶分析、基因片段的體外擴(kuò)增技術(shù)和寡核苷酸指紋圖譜技術(shù)等。這些技術(shù)不僅應(yīng)用于NDV的檢測(cè)、鑒定和特性研究及致病性的檢測(cè),還可以追蹤病毒的來(lái)源及流行情況。

      聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種體外擴(kuò)增特異性基因片段的技術(shù),在疾病的檢測(cè)方面有著廣闊的應(yīng)用前景,現(xiàn)已被廣泛應(yīng)用。反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)能夠選擇性地將NDV基因組的一個(gè)特異性短片段放大10萬(wàn)倍以上,極大地增強(qiáng)了檢測(cè)的敏感性。1991年Jestin首次發(fā)展了NDV的RT-PCR檢測(cè)方法,擴(kuò)增F蛋白基因的238bp的目的片段。Veronique(1991)等用RT-PCR方法擴(kuò)增出約275bp的F基因產(chǎn)物并繪制酶切圖譜,證明這些病毒株都具有NDV的共同抗原表位。Seal等(1995)用PCR擴(kuò)增M基因和F基因裂解位點(diǎn)編碼片段,通過(guò)對(duì)病毒分子進(jìn)行同源進(jìn)化分析,并預(yù)測(cè)了每株病毒的致病性。Kant(1998)利用4條引物配成三對(duì),分別對(duì)通過(guò)組織勻漿提取的NDV-RNA進(jìn)行RT-PCR,結(jié)果擴(kuò)增出362bp、254bp、254bp的三個(gè)目的片段。該方法不需要接種雞胚,24h之內(nèi)便可出結(jié)果,為NDV診斷提供了技術(shù)手段。大量研究結(jié)果證明,設(shè)計(jì)特異性引物對(duì)NDV進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增不失為一種快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)方法。



      技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

      本發(fā)明的第一個(gè)目的在于提供特異性引物用于檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒。

      本發(fā)明的第二個(gè)目的在于提供檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的試劑盒。

      本發(fā)明以NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中NDV-La Sota株(GenBank登錄號(hào)為JF950510)基因組序列作為參考,上游引物在4988nt-5006nt之間,下游引物在5428nt-5448nt之間。在眾多備選的引物中,經(jīng)過(guò)多次篩選,比對(duì)試驗(yàn),以排除引物與其他物種序列可能存在的非特異性匹配,最終獲得優(yōu)化后的引物對(duì)。

      本發(fā)明提供的優(yōu)選的特異性引物對(duì),其序列為:

      上游引物為5’-GCCAACATCCT(C/T)CGGCT(C/T)A-3’(SEQ ID NO.1);以及下游引物為5’-TAGGTGGCACGCATATTATTT-3’(SEQ ID NO.2)。

      提取樣本總RNA并進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄(RT)合成cDNA后,利用上述引物進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR),采用下列反應(yīng)程序:起始變性94℃5min,30個(gè)循環(huán)(94℃45s,54℃45s,72℃30s),最后經(jīng)過(guò)72℃10min延伸,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳分析,利用紫外凝膠成像儀檢測(cè)目的條帶,如果擴(kuò)增出目的條帶則證明為NDV陽(yáng)性,否則為陰性。

      本發(fā)明提供了上述特異性引物對(duì)在制備檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒試劑盒中的應(yīng)用。

      含有SEQ ID NO.1-2所示特異性引物對(duì)的檢測(cè)試劑屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

      含有SEQ ID NO.1-2所示特異性引物對(duì)的試劑盒屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

      進(jìn)一步地,本發(fā)明的試劑盒其PCR階段的工作程序?yàn)椋?4℃5min;94℃45s,54℃45s,72℃30s,30個(gè)循環(huán);72℃10min。

      本發(fā)明的上述試劑盒是對(duì)待測(cè)樣本進(jìn)行RT-PCR檢測(cè)后,擴(kuò)增產(chǎn)物若有461bp大小的條帶,則待測(cè)樣本中含有雞新城疫病毒。

      本發(fā)明還提供了一種檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的非診斷目的方法,包括以下步驟:

      (1)提取待測(cè)樣本的總RNA,反轉(zhuǎn)錄,得到cDNA;

      (2)利用SEQ ID NO.1-2所示特異性引物對(duì)對(duì)步驟(1)的cDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果判斷待測(cè)樣本中是否有雞新城疫病毒。

      其中,步驟(2)中陽(yáng)性樣本擴(kuò)增的目的片段為461bp。

      本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)在于,1)擴(kuò)增的目的片段位于NDV F蛋白的保守區(qū),長(zhǎng)度為461bp,敏感性好、操作方便、對(duì)不同基因型的NDV均有較好檢出(通用性);2)將NDV病毒樣本cDNA進(jìn)行10倍系列稀釋后,發(fā)現(xiàn)進(jìn)行10000倍稀釋后利用本方法仍能檢測(cè)到NDV特異性條帶,表明該方法具有較高的靈敏度;3)該方法對(duì)其它常見(jiàn)禽病病原,如禽流感病毒、傳染性支氣管炎病毒、傳染性法氏囊病毒、禽呼腸孤病毒、禽腺病毒和禽傳染性喉氣管炎病毒的檢測(cè)結(jié)果皆為陰性,沒(méi)有交叉反應(yīng),表明該方法亦具有良好的特異性;4)本發(fā)明方法適用于養(yǎng)禽生產(chǎn)中進(jìn)行NDV的檢測(cè),具有高特異性、高靈敏度、高效率、低成本的特點(diǎn),可在6h內(nèi)對(duì)臨床病料進(jìn)行快速鑒別診斷,克服了傳統(tǒng)檢測(cè)方法耗時(shí)較長(zhǎng)的缺點(diǎn)。此方法適合大批量臨床樣本的分析與檢測(cè),對(duì)NDV的早期快速診斷和分子流行病學(xué)調(diào)查研究提供技術(shù)手段。

      附圖說(shuō)明

      圖1是最佳擴(kuò)增引物篩選電泳結(jié)果。點(diǎn)樣順序?yàn)镸:Marker II;1:引物1(461bp);2:引物2(442bp);3:引物3(566bp);4:引物4(499bp);5:引物5(554bp)。

      圖2是RT-PCR反應(yīng)最佳退火溫度篩選電泳結(jié)果。點(diǎn)樣順序?yàn)镸:Marker II;1:52℃;2:53℃;3:54℃;4:55℃;5:56℃。

      圖3是RT-PCR反應(yīng)最佳循環(huán)數(shù)篩選電泳結(jié)果。點(diǎn)樣順序?yàn)镸:Marker II;1:27循環(huán);2:28循環(huán);3:29循環(huán);4:30循環(huán);5:31循環(huán);6:32循環(huán)。

      圖4是根據(jù)新城疫F基因繪制遺傳進(jìn)化樹(shù),●顯示用于本方法通用性檢測(cè)的不同基因型毒株。

      圖5是對(duì)不同基因型雞新城疫病毒進(jìn)行檢測(cè)的電泳結(jié)果。加樣順序?yàn)镸:DNA Maker II;P:陽(yáng)性對(duì)照;N:陰性對(duì)照;1:BJ14(基因VI型);2:La Sota(基因II型);3:aSG10(基因VII型);4:F48E8(基因IX型)。

      圖6是對(duì)該引物檢測(cè)雞新城疫病毒的靈敏度電泳結(jié)果。加樣順序?yàn)镸:DNA maker II;P:陽(yáng)性對(duì)照;N:陰性對(duì)照;1:cDNA稀釋10倍;2:cDNA稀釋102倍;3:cDNA稀釋103倍;4:cDNA稀釋104倍;5:cDNA稀釋105倍。

      圖7為采用現(xiàn)有技術(shù)的引物進(jìn)行RT-PCR通用性檢測(cè)結(jié)果,樣品順序:M:Marker II;P:陽(yáng)性對(duì)照;N:陰性對(duì)照;1:PPMV-1(基因VI型);2:La Sota(基因II);3:aSG10(基因VII型);4:F48E8(基因IX)。

      圖8為采用現(xiàn)有技術(shù)的引物進(jìn)行RT-PCR敏感性檢測(cè)結(jié)果,樣品順序:M:Marker II;P:陽(yáng)性對(duì)照;N:陰性對(duì)照;1:cDNA稀釋10倍;2:cDNA稀釋102倍;3:cDNA稀釋103倍;4:cDNA稀釋104倍;5:cDNA稀釋105倍。

      圖9是對(duì)其它常見(jiàn)禽病病原進(jìn)行檢測(cè)的電泳結(jié)果。其中M:DNA Maker II;P:陽(yáng)性對(duì)照;N:陰性對(duì)照;1:H5亞型禽流感病毒;2:H7亞型禽流感病毒;3:H9亞型禽流感病毒;4:傳染性支氣管炎病毒(IBV);5:傳染性法氏囊病毒(IBDV);6:禽呼腸孤病毒(REOV);7:禽腺病毒(FAdV);8:傳染性喉氣管炎病毒(ILTV)。

      具體實(shí)施方式

      以下實(shí)施例進(jìn)一步說(shuō)明本發(fā)明的內(nèi)容,但不應(yīng)理解為對(duì)本發(fā)明的限制。在不背離本發(fā)明精神和實(shí)質(zhì)的情況下,對(duì)本發(fā)明方法、步驟或條件所作的修改或替換,均屬于本發(fā)明的范圍。

      若未特別指明,實(shí)施例中所用的技術(shù)手段為本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的常規(guī)手段。

      下列實(shí)施例中常規(guī)的實(shí)驗(yàn)方法,參見(jiàn)Sambrook等編寫(xiě)的分子克隆。儀器的使用參照儀器操作說(shuō)明。LEGEND MICRO 17R低溫臺(tái)式離心機(jī),為T(mén)hermo公司產(chǎn)品;VS-1渦旋振蕩器購(gòu)自鼎昊源科技有限公司;TL-2010S組織研磨震蕩器購(gòu)自鼎昊源科技有限公司。反轉(zhuǎn)錄酶(Reverse Transcriptase)200U/μl(Promega)、核酸酶抑制劑(Rnase Inhibitor)50U/μl(Takara)、5倍體積的反應(yīng)緩沖液(5×Reaction Buffer)、dNTP混合物2.5mM和隨機(jī)引物(Random Primer)500μg/ml(Promega),購(gòu)自北京愛(ài)普銳晟科技有限公司;DEPC處理水,購(gòu)自北京明豪至遠(yuǎn)有限公司。Marker II DNA Ladder購(gòu)自中科瑞泰(北京)生物科技有限公司。Veriti 96-Well Thermal Cycler PCR擴(kuò)增儀為Applied Biosystems公司產(chǎn)品,購(gòu)自北京誠(chéng)茂興業(yè)科技發(fā)展有限公司;MINI-Smart小型臺(tái)式離心機(jī)為HERO公司產(chǎn)品;HW·SYII-KP3型電熱恒溫水槽購(gòu)自北京長(zhǎng)風(fēng)儀器儀表公司。

      本發(fā)明實(shí)施例中選用的生物材料如下:禽流感病毒、傳染性法氏囊病毒、禽傳染性支氣管炎病毒、禽呼腸孤病毒、禽腺病毒和禽傳染性喉氣管炎病毒,新城疫病毒BJ14(基因VI型)、La Sota(基因II型)、aSG10(基因VII型)、F48E8(基因IX型)均由中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院保藏和提供。

      實(shí)施例1用于檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的特異性引物的設(shè)計(jì)

      NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中NDV-La Sota株(GenBank登錄號(hào)為JF950510)基因組序列作為參考,設(shè)計(jì)特異性引物。在眾多備選的引物中(表1所示),經(jīng)過(guò)多次篩選,比對(duì)試驗(yàn),以排除引物與其他物種序列可能存在的非特異性匹配,經(jīng)反復(fù)篩選和驗(yàn)證,最終獲得優(yōu)化后的引物對(duì),各引物擴(kuò)增電泳結(jié)果如圖1所示。選擇擴(kuò)增目的條帶最亮,無(wú)非特異性雜帶的引物對(duì)1為最佳引物,上游引物在登錄號(hào)為JF950510序列的4988nt-5006nt之間,下游引物在5428nt-5448nt之間。

      表1用于檢測(cè)不同基因型NDV備選引物序列

      本發(fā)明提供的優(yōu)選特異性引物對(duì),其序列為:上游引物:5’-GCCAACATCCT(C/T)CGGCT(C/T)A-3’(SEQ ID NO.1);以及下游引物:5’-TAGGTGGCACGCATATTATTT-3’(SEQ ID NO.2)。

      實(shí)施例2檢測(cè)新城疫病毒的RT-PCR檢測(cè)方法最佳退火溫度的摸索

      1、檢測(cè)樣品的預(yù)處理

      (1)組織樣品處理:取100mg臟器組織樣品加入0.5ml滅菌生理鹽水并用研磨器進(jìn)行研磨混懸,組織懸液3000rpm離心30min后取上清用于檢測(cè)分析。

      (2)泄殖腔或口咽拭子樣品處理:將拭子樣品加入0.5ml滅菌生理鹽水并用渦旋振蕩器振蕩混懸,樣品懸液3000rpm離心30min后取上清用于檢測(cè)。

      2、樣品總RNA的提取

      參照Trizol RNA提取試劑盒(Invitrogen)說(shuō)明書(shū)進(jìn)行提取。

      3、反轉(zhuǎn)錄為cDNA

      在0.2ml離心管內(nèi)加入下列成分:RNA溶液4μl,隨機(jī)引物1μl,輕輕混勻,70℃水浴5min,冰浴2min,然后依次加入下列成分:5×反應(yīng)緩沖液 4μl,dNTP混合物2μl,核酸酶抑制劑 1μl,反轉(zhuǎn)錄酶0.5μl,DEPC處理水7.5μl,輕輕混勻,37℃作用1h,得到樣本cDNA。

      4、PCR檢測(cè)

      利用實(shí)施例1最終確定的引物對(duì)進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR),設(shè)計(jì)不同的退火溫度梯度(52℃、53℃、54℃、55℃和56℃)對(duì)NDV進(jìn)行RT-PCR。在0.2ml離心管中加入下列成分:

      輕輕混勻后,以不同退火溫度分別進(jìn)行如下反應(yīng):起始變性94℃5min,94℃45s,(52℃、53℃、54℃、55℃和56℃)45s,72℃30s,進(jìn)行30個(gè)循環(huán),循環(huán)結(jié)束72℃延伸10min,PCR反應(yīng)結(jié)束后,用1×TAE電泳緩沖液制備1%瓊脂糖凝膠并按照參考比例混入熒光染料Gelsafe,取7μl PCR產(chǎn)物加入凝膠孔中,選擇合適的電壓(4V/cm-10V/cm)進(jìn)行電泳,電泳時(shí)間為20-30min,電泳結(jié)束后將凝膠塊置于紫外凝膠成像儀上觀察并拍照,根據(jù)電泳結(jié)果確定樣品中能否擴(kuò)增出目的條帶,如果擴(kuò)增出目的條帶長(zhǎng)度為461bp則證明待測(cè)樣品為NDV檢測(cè)陽(yáng)性,否則為檢測(cè)陰性。

      電泳結(jié)果如圖2所示,54℃為擴(kuò)增目的條帶最亮,結(jié)合退火溫度過(guò)高不利于引物與模板結(jié)合,所以選擇該溫度為最佳溫度。

      實(shí)施例3檢測(cè)新城疫病毒的RT-PCR檢測(cè)方法最佳循環(huán)數(shù)摸索

      檢測(cè)樣品的預(yù)處理、樣品總RNA的提取、反轉(zhuǎn)錄為cDNA參見(jiàn)實(shí)施例2對(duì)應(yīng)的方法。利用實(shí)施例1和2確定的條件,設(shè)計(jì)6個(gè)不同的循環(huán)數(shù)(27、28、29、30、31和32)對(duì)NDV進(jìn)行RT-PCR。

      在0.2ml離心管中加入成分參見(jiàn)實(shí)施例2。輕輕混勻后,以不同循環(huán)數(shù)分別進(jìn)行如下反應(yīng):起始變性94℃5min,94℃45s,54℃45s,72℃30s,進(jìn)行不同的循環(huán)數(shù)(27、28、29、30、31和32),循環(huán)結(jié)束72℃延伸10min。

      PCR反應(yīng)結(jié)束后,用1×TAE電泳緩沖液制備1%瓊脂糖凝膠并按照參考比例混入熒光染料Gelsafe。取7μl PCR產(chǎn)物加入凝膠孔中,選擇合適的電壓(4V/cm-10V/cm)進(jìn)行電泳,電泳時(shí)間為20-30分鐘,電泳結(jié)束后將凝膠塊置于凝膠成像儀上觀察并拍照,根據(jù)電泳結(jié)果確定樣品中能否擴(kuò)增出目的條帶461bp,如果擴(kuò)增出目的條帶則證明為雞新城疫病毒檢測(cè)陽(yáng)性,否則為雞新城疫病毒檢測(cè)陰性。電泳結(jié)果如圖3所示,30個(gè)循環(huán)數(shù)擴(kuò)增目的條帶與更多循環(huán)數(shù)亮度相似,且沒(méi)有非特異性雜帶,能節(jié)省時(shí)間、提高檢測(cè)效率,因此選擇其為最佳循環(huán)數(shù)。

      實(shí)施例4檢測(cè)不同基因型雞新城疫病毒的RT-PCR檢測(cè)方法的建立

      檢測(cè)樣品的預(yù)處理、樣品總RNA的提取、反轉(zhuǎn)錄為cDNA參見(jiàn)實(shí)施例2對(duì)應(yīng)的方法。

      在0.2ml離心管中加入成分參見(jiàn)實(shí)施例2。輕輕混勻后,以不同循環(huán)數(shù)分別進(jìn)行如下反應(yīng):起始變性94℃5min,94℃45s,54℃45s,72℃30s,進(jìn)行30個(gè)循環(huán),循環(huán)結(jié)束72℃延伸10min。

      PCR反應(yīng)結(jié)束后,用1×TAE電泳緩沖液制備1%瓊脂糖凝膠并按照參考比例混入熒光染料Gelsafe。取7μl PCR產(chǎn)物加入凝膠孔中,選擇合適的電壓(4V/cm-10V/cm)進(jìn)行電泳,電泳時(shí)間為20-30分鐘,電泳結(jié)束后將凝膠塊置于凝膠成像儀上觀察并拍照,根據(jù)電泳結(jié)果確定樣品中能否擴(kuò)增出目的條帶461bp,如果擴(kuò)增出目的條帶則證明為雞新城疫病毒檢測(cè)陽(yáng)性,否則為雞新城疫病毒檢測(cè)陰性。

      利用上述方法分別對(duì)不同基因型(圖4所示)NDV進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果均有較好的檢出,如圖5所示,表明本方法具有良好的通用性。

      實(shí)施例5檢測(cè)雞新城疫病毒的RT-PCR檢測(cè)方法的敏感性檢測(cè)

      按照實(shí)施例4建立的方法進(jìn)行。將cDNA溶液進(jìn)行10倍系列稀釋?zhuān)♂尪葹?0、102、103、104和105倍,分別以稀釋后的模板進(jìn)行PCR反應(yīng)。94℃預(yù)變性5min,94℃45s,54℃45s,72℃30s,進(jìn)行30個(gè)循環(huán),循環(huán)結(jié)束72℃延伸10min。

      PCR反應(yīng)結(jié)束后,用1×TAE電泳緩沖液制備1%瓊脂糖凝膠并按照參考比例混入熒光染料Gelsafe。取7μl PCR產(chǎn)物加入凝膠孔中,選擇合適的電壓(4V/cm-10V/cm)進(jìn)行電泳,電泳時(shí)間為20-30分鐘,電泳結(jié)束后將凝膠塊置于凝膠成像儀上觀察并拍照,根據(jù)電泳結(jié)果確定樣品中能否擴(kuò)增出目的條帶461bp,如果擴(kuò)增出目的條帶則證明為雞新城疫病毒檢測(cè)陽(yáng)性,否則為雞新城疫病毒檢測(cè)陰性。

      利用上述方法分別對(duì)雞新城疫病毒進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示對(duì)反轉(zhuǎn)錄的雞新城疫病毒cDNA稀釋104倍后,仍能檢測(cè)到病毒DNA,如圖6所示,表明本方法具有良好的敏感性。

      與現(xiàn)有技術(shù)雞新城疫病毒檢測(cè)方法的通用性、靈敏度比較

      國(guó)標(biāo)GB/T 16550-2008的新城疫診斷技術(shù)推薦使用的引物序列:ND-535-F:ATGGGCYCCAGAYCTTCTAC,ND-535-R:CTGCCACTGCTAGTTGTGATAATCC。發(fā)明人采用上述引物對(duì)NDV進(jìn)行了檢測(cè),結(jié)果見(jiàn)圖7。圖7中1-4為不同基因型NDV毒株。與本發(fā)明實(shí)施例1確定的最佳引物相比,該文獻(xiàn)所用引物通用性差,未擴(kuò)增出PPMV-1(基因VI型)的目的片段。靈敏度結(jié)果見(jiàn)圖8,上述文獻(xiàn)推薦的引物僅能檢測(cè)到稀釋103倍后的NDV cDNA,因此,其敏感性遠(yuǎn)不如本發(fā)明方法的敏感性(104倍)。

      實(shí)施例6檢測(cè)雞新城疫病毒的RT-PCR檢測(cè)方法對(duì)禽常見(jiàn)病病原的特異性檢測(cè)

      利用實(shí)施例4建立方法對(duì)其它常見(jiàn)的禽病病原:禽流感病毒、禽傳染性支氣管炎病毒、傳染性法氏囊病毒、禽呼腸孤病毒、禽腺病毒和禽傳染性喉氣管炎病毒進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果如圖9所示,結(jié)果顯示,除陽(yáng)性對(duì)照外,其他實(shí)驗(yàn)對(duì)象皆為陰性,表明本方法在檢測(cè)禽類(lèi)常見(jiàn)的其他病原體過(guò)程中,實(shí)施例4建立的方法針對(duì)不同基因型NDV具有良好的特異性。

      雖然,上文中已經(jīng)用一般性說(shuō)明及具體實(shí)施方案對(duì)本發(fā)明作了詳盡的描述,但在本發(fā)明基礎(chǔ)上,可以對(duì)之作一些修改或改進(jìn),這對(duì)本領(lǐng)域技術(shù)人員而言是顯而易見(jiàn)的。因此,在不偏離本發(fā)明精神的基礎(chǔ)上所做的這些修改或改進(jìn),均屬于本發(fā)明要求保護(hù)的范圍。

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