本發(fā)明涉及一種熱穩(wěn)定性提高的β-淀粉酶突變體,屬于基因工程和酶工程技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
β-淀粉酶又稱(chēng)為麥芽糖苷酶、糖原淀粉酶,其系統(tǒng)名為α-1,4-葡聚糖-4-麥芽糖水解酶(α-1,4-dglucanmaltohydrolase),e.c.編號(hào)為3.2.1.2.作用于淀粉時(shí),從其非還原性末端順次切下麥芽糖,水解產(chǎn)物是β-麥芽糖、β-極限糊精及非常少量的β-葡萄糖。β-淀粉酶具有相當(dāng)大的工業(yè)應(yīng)用價(jià)值,長(zhǎng)期以來(lái)植物來(lái)源的大麥β-淀粉酶一直被廣泛用于多個(gè)領(lǐng)域。例如,在啤酒發(fā)酵業(yè)中部分代替大麥芽用于啤酒的生產(chǎn),在食品業(yè)中用于水解淀粉制造麥芽糖漿和飴糖等。自1974年higashihara等人首次確定巨大芽孢桿菌(bacillusmegaterium)胞外淀粉酶含有β-淀粉酶以來(lái),相繼發(fā)現(xiàn)了幾種能夠產(chǎn)生該酶的微生物,這些菌株大都屬于細(xì)菌,如蠟狀芽孢桿菌(bacilluscereus)、多粘芽孢桿菌(bacilluspolymyxa)、環(huán)狀芽孢桿菌(bacilluscirculans)、高溫放線菌(thermeoactinomycessp.)和熱硫梭菌(clostridiumthermosulfurogenes)等。與植物β-淀粉酶相比,微生物來(lái)源的β-淀粉酶具有便于大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn)的優(yōu)點(diǎn),因此篩選尋找理想的微生物β-淀粉酶源成為淀粉酶研究應(yīng)用領(lǐng)域的一個(gè)重要目標(biāo)。
定向進(jìn)化屬于蛋白質(zhì)的非理性設(shè)計(jì),不需要事先了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、催化機(jī)制、保守序列等因素,而是通過(guò)模擬自然進(jìn)化機(jī)制來(lái)為酶基因創(chuàng)造體外進(jìn)化的條件,進(jìn)而對(duì)目的蛋白進(jìn)行分子改造,并定向篩選研究進(jìn)化酶的酶學(xué)性質(zhì)。易錯(cuò)pcr技術(shù)是目前應(yīng)用最廣泛的定向進(jìn)化方法之一,具有操作方便、快速、高效的優(yōu)點(diǎn)。對(duì)于微生物來(lái)源β-淀粉酶的研究,目前主要是圍繞不同宿主的克隆表達(dá)、酶學(xué)定性,而針對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)的分子改造顯得較少,在定向進(jìn)化研究其熱穩(wěn)定性方面,尚未見(jiàn)相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道。
發(fā)明人在前期的研究中從菜地土壤中成功的篩選到了一株高產(chǎn)β-淀粉酶的彎曲芽孢桿菌(bacillusflexus)cctcc2015368的菌株,并將該菌株的β-淀粉酶基因序列克隆出來(lái),成功的在大腸桿菌(escherichiacoli)宿主中表達(dá)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種熱穩(wěn)定性提高的β-淀粉酶突變體。
所述熱穩(wěn)定性提高的β-淀粉酶突變體,是對(duì)親本彎曲芽孢桿菌(bacillusflexus)cctcc2015368β-淀粉酶進(jìn)行定向進(jìn)化,通過(guò)分子進(jìn)化的手段之一易錯(cuò)pcr技術(shù),獲得β-淀粉酶突變體。親本β-淀粉酶氨基酸序列如seqidno:1所示。采用“原始氨基酸-替換位置-突變后氨基酸”來(lái)表示β-淀粉酶突變體,β-淀粉酶突變體為thr461tyr/asp506asn/asp519lys,氨基酸序列為seqidno:2。
用于表達(dá)所述的β-淀粉酶突變體的表達(dá)載體為pet24a(+);
用于所述的表達(dá)載體轉(zhuǎn)化的微生物宿主為大腸桿菌(escherichiacoli)。
與親本彎曲芽孢桿菌β-淀粉酶相比(55℃下的半衰期t50為18.0min),所述β-淀粉酶突變體在55℃下的半衰期t50提高了3倍,達(dá)到54min。本發(fā)明的有益效果:運(yùn)用了分子生物學(xué)的方法對(duì)親本彎曲芽孢桿菌β-淀粉酶進(jìn)行了定向進(jìn)化研究,通過(guò)易錯(cuò)pcr技術(shù)獲得了β-淀粉酶突變體,與親本彎曲芽孢桿菌β-淀粉酶相比(55℃下的半衰期t50為18.0min),β-淀粉酶突變體在55℃下的半衰期t50提高了3倍,達(dá)到54min。
附圖說(shuō)明
圖1:野生型β-淀粉酶與突變體bea-10的最適溫度比較;
圖2:野生型β-淀粉酶與突變體bea-10在55℃下的熱穩(wěn)定性比較。
具體實(shí)施方式
實(shí)例中涉及到的培養(yǎng)基及試劑配方如下:
lb液體培養(yǎng)基:酵母粉5.0g/l,胰蛋白胨10.0g/l,nacl10.0g/l。
lb固體培養(yǎng)基:在lb液體培養(yǎng)基的基礎(chǔ)配方上,添加1.0%-2.0%(m/v)的瓊脂。
tb培養(yǎng)基:酵母粉24.0g/l,甘油5.0g/l,胰蛋白胨12.0g/l,k2hpo4·3h2o16.43g/l,kh2po42.31g/l。
sob培養(yǎng)基:胰蛋白胨20.0g/l,酵母粉5.0g/l,mgcl20.952g/l,nacl0.5g/l,kcl0.186g/l。
lb瓊脂淀粉板:在lb液體培養(yǎng)基的基礎(chǔ)上添加可溶性淀粉1g/l,用于突變體的初步篩選。
實(shí)施例1:基于易錯(cuò)pcr技術(shù)構(gòu)建β-淀粉酶突變體文庫(kù)
運(yùn)用易錯(cuò)pcr技術(shù)向彎曲芽孢桿菌β-淀粉酶基因中引入核苷酸突變。易錯(cuò)pcr的反應(yīng)條件如下:
其中上游引物f和下游引物r的序列分別為:
f:(5′-aaccatggcggtaaatggacagtcgtt-3′);
r:(5′-aactcgagttaccaattattcgtatacgttg-3′)。
pcr擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃4min;98℃10s,53℃10s,72℃1min40s,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,并于4℃下保溫。
易錯(cuò)pcr產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠試劑盒膠回收,目的基因與載體pmd-18t連接轉(zhuǎn)化jm109,克隆培養(yǎng)后,用限制酶ncoi和xhoi將目的基因片段回收與經(jīng)過(guò)ncoi和xhoi雙酶切消化后的表達(dá)載體pet24a(+)相連,轉(zhuǎn)化至e.colijm109感受態(tài)細(xì)胞。涂布lb抗性平板(kan),37℃培養(yǎng)8-10個(gè)小時(shí),將轉(zhuǎn)化子全部轉(zhuǎn)移至lb液體培養(yǎng)基中培養(yǎng),并抽提重組突變體質(zhì)粒。
將重組突變體質(zhì)粒轉(zhuǎn)化e.colibl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞。在lb平板上(kan)培養(yǎng)獲取β-淀粉酶突變體文庫(kù)。
實(shí)施例2:熱穩(wěn)定性提高的β-淀粉酶突變體的篩選
以pet24a(+)表達(dá)親本β-淀粉酶的大腸桿菌作為對(duì)照菌。
lb瓊脂淀粉板初篩:重組菌e.colibl21(de3)/pet24a(+)-bfa于tb發(fā)酵培養(yǎng)基中誘導(dǎo)表達(dá)48h,離心獲得胞外上清,利用高通量篩選系統(tǒng)將96空板中每一個(gè)突變體的發(fā)酵液一一轉(zhuǎn)移到lb瓊脂淀粉板上。37℃下過(guò)夜培養(yǎng)8h左右,用碘液(0.03%w/v)涂布瓊脂淀粉板,觀察透明圈,選取比對(duì)照明顯大的透明圈所對(duì)應(yīng)的突變菌株。
96孔板dns法定量篩選:挑選透明圈比對(duì)照高的突變菌株,用排槍快速將發(fā)酵上清轉(zhuǎn)移到pcr管中(轉(zhuǎn)移前用1:1的磷酸緩沖液與發(fā)酵液混合),在55℃的金屬浴上保溫40min,采用dns法測(cè)定保溫前與保溫后的酶活,在540nm處下測(cè)定吸光值并記錄數(shù)據(jù),通過(guò)計(jì)算殘留酶活力從而選出熱穩(wěn)定性有提高的突變株。
實(shí)施例3:酶活分析方法
一個(gè)β-淀粉酶酶活單位(1u)定義(u/ml):1ml酶液在ph7.0,溫度55℃,1h水解可溶性淀粉生產(chǎn)1mg麥芽糖所需的酶量稱(chēng)為一個(gè)酶活力單位。
測(cè)定方法:準(zhǔn)確吸取0.5ml2%可溶性淀粉溶液,置于15ml比色管中,加0.4ml50mmph7.0磷酸鹽緩沖溶液,搖勻,于55℃水浴預(yù)熱5min,準(zhǔn)確加入100μl酶液,立即計(jì)時(shí),搖勻,于55℃水浴準(zhǔn)確保溫酶解反應(yīng)10min,立即加入dns1ml,搖勻,并煮沸5min,冰水中冷卻。以同樣條件下用緩沖液代替酶液的反應(yīng)體系作為對(duì)照,上述反應(yīng)體系加10ml蒸餾水,混勻,1cm比色皿,540nm波長(zhǎng)下測(cè)吸光度。
實(shí)施例3:β-淀粉酶突變體的純化
將發(fā)酵上清液于4℃,12000rpm離心10min除去細(xì)胞。將上清液置于磁力攪拌器中并緩緩加入45%固體硫酸銨鹽,于4℃過(guò)夜鹽析。然后4℃,12000rpm離心20min。取沉淀物用適量ph7.0,50mm磷酸-檸檬酸緩沖液溶解,通過(guò)0.4μm透析膜過(guò)濾透析后得到濃縮酶樣品。經(jīng)過(guò)凝膠層析柱純化后得到電泳純的β-淀粉酶。
實(shí)施例4:β-淀粉酶突變體的最適溫度和熱穩(wěn)定性
酶分子熱穩(wěn)性的提高可以用半衰期(t50)來(lái)體現(xiàn)。即酶分子的活力降低到初始活力一半時(shí)所需要的時(shí)間。酶的半衰期時(shí)間越長(zhǎng),則酶的熱穩(wěn)定性越高。反之,它的熱穩(wěn)定就比較差。
以ph7.0的檸檬酸-磷酸氫二鈉(50mm)為緩沖液,在30-70℃溫度范圍測(cè)定野生型β-淀粉酶及突變體bfa-10(即thr461tyr/asp506asn/asp519lys)的最適溫度。突變體和野生型β-淀粉酶的最適溫度和熱穩(wěn)定性見(jiàn)圖1和圖2。
從圖1可以得知,野生型和突變體bfa-10β-淀粉酶的最適溫度均為55℃;在30-55℃的溫度范圍內(nèi),β-淀粉酶的相對(duì)活力沒(méi)有明顯的變化;值得注意的是,當(dāng)溫度升高到60℃和65℃時(shí),突變體bfa-10能夠保留最初酶活的75%和44%,而野生型僅保留其酶活的37%和23%。在最適溫度55℃的條件下,測(cè)定不同時(shí)間點(diǎn)殘留酶活來(lái)確定突變體bfa-10的熱穩(wěn)定性,并與野生型相比較(圖2);從圖2可知,突變體bfa-10在55℃下的半衰期為54min,而野生型的半衰期只有18min。
雖然本發(fā)明已以較佳實(shí)施例公開(kāi)如上,但其并非用以限定本發(fā)明,任何熟悉此技術(shù)的人,在不脫離本發(fā)明的精神和范圍內(nèi),都可做各種的改動(dòng)與修飾,因此本發(fā)明的保護(hù)范圍應(yīng)該以權(quán)利要求書(shū)所界定的為準(zhǔn)。
sequencelisting
<110>江南大學(xué)
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