本發(fā)明屬于基因工程,涉及一種調(diào)控蘿卜花青素合成的轉(zhuǎn)錄因子rsrap2-12,具體涉及rsrap2-12基因在調(diào)控蘿卜花青素合成中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、蘿卜(raphanus?sativus?l.)是十字花科蘿卜屬中重要根菜類蔬菜作物,而花青素賦予植物豐富的顏色和抗氧化活性,對人體健康有益。富含花青素的蘿卜品種因其顏色鮮艷、營養(yǎng)價值高而深受消費者歡迎。花青素是一種水溶性黃酮化合物,存在于植物各個部位,給植物帶來豐富的色彩(chaves-silva?et?al.,2018;alappat?andalappat,2020),同時具有多種益處,如抗氧化、抗心血管疾病、抗癌癥、促進新陳代謝、保護視力、控制血糖、抗肥胖和炎癥、延緩衰老等,也被認為是對人體有益的天然保健成分(zhang?et?al.,2023;nomi?et?al.,2019)。目前自然界中已發(fā)現(xiàn)650多種花色苷,不同種類的花色苷所呈現(xiàn)的顏色也略有差異,其中三種花青素,分別是矢車菊素、天竺葵素和飛燕草素,是植物中最為重要的色素之一(naing?et?al.,2018),天竺葵色素和其衍生物呈現(xiàn)紅色或橙色,而矢車菊色素及其衍生物主要表現(xiàn)為磚紅或洋紫色。另外,飛燕草色素及其衍生物呈現(xiàn)藍色或紫色(liu?et?al.,2018b;liu?et?al.,2018c)。此外,花青素參與許多生物過程,如植物的環(huán)境脅迫反應(yīng),病原菌和昆蟲的脅迫反應(yīng)。
2、植物中花青素的生物合成是類黃酮合成通路中的一個重要分支,在高等植物中較為保守,其過程涉及多個復(fù)雜的酶促反應(yīng)。植物中的花青素生物合成受到各種轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控,如myb、wd40、wrky、erf、bhlh、bbx和bzip家族成員(gonzalez?et?al.,2008;jaakolaet?al.,2010)。結(jié)構(gòu)基因的表達受轉(zhuǎn)錄因子和環(huán)境因子的共同控制,最重要的也是被研究最多三類轉(zhuǎn)錄因子家族分別是myb、bhlh和wd40,這些轉(zhuǎn)錄因子可以單獨調(diào)控結(jié)構(gòu)基因或者相互結(jié)合組成mbw復(fù)合體共同調(diào)控結(jié)構(gòu)基因,從而調(diào)控花青素生物合成(hichri?et?al.,2011;宋建輝等,2021;petroni?et?al.,2011;xu?et?al.,2015)。
3、在擬南芥中rap2-12是一個乙烯應(yīng)答因子型轉(zhuǎn)錄因子,編碼erf/ap2轉(zhuǎn)錄因子家族(rap2.12)的erf(乙烯反應(yīng)因子)亞家族b-2的成員。該蛋白質(zhì)包含一個ap2結(jié)構(gòu)域。轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)基因的表達來影響花青素的生物合成(d'amelia?et?al.,2014;劉等人,2016)。近年來,有研究顯示了rap2家族基因在花青素合成中的調(diào)控作用,在海棠葉片和蘋果果實中瞬時過表達rap2-4會增加葉片和果實中花青素的含量(li?et?al.,2020)。rap2-7和rap2-7是乙烯反應(yīng)性轉(zhuǎn)錄因子受mir172b的調(diào)控從而調(diào)節(jié)花青素的生物合成(hinzetal.,2010)。rap2.10(與ap2.10相關(guān);tr18328|c0_g1)和bbx28(tr1858|c0_g1)與ans、chi、f3h和f3′h的表達高度相關(guān),表明rap2.10可能是參與甜櫻桃花青素生物合成的候選轉(zhuǎn)錄因子(guo?et?al.,2020)。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明意在提供一種rsrap2-12基因在調(diào)控蘿卜花青素合成中的應(yīng)用,以加快蘿卜的育種進程,快速培育高含量花青素的蘿卜品種,為選育高含量花青素的蘿卜新品種以及改良蘿卜品質(zhì)提供有利的技術(shù)。
2、本發(fā)明提供了一種調(diào)控蘿卜花青素合成的轉(zhuǎn)錄因子rsrap2-12基因,,所述rsrap2-12基因的核苷酸序列如seq?id?no.1。
3、本發(fā)明還提供了上述rsrap2-12基因的編碼蛋白,所述編碼蛋白的氨基酸序列如seq?id?no.2。
4、本發(fā)明還提供了一種擴增上述rsrap2-12基因的引物對,包括核苷酸序列如seqid?no.3所示的正向引物和核苷酸序列如seq?id?no.4所示反向引物。
5、本發(fā)明還提供了上述rsrap2-12基因或上述rsrap2-12基因的編碼蛋白在調(diào)控蘿卜花青素合成的應(yīng)用。
6、本發(fā)明還提供了一種提高蘿卜葉片花青素含量的方法,所述方法為構(gòu)建過表達載體將rsrap2-12基因瞬時過表達在蘿卜葉片上。
7、進一步,所述方法包括如下步驟:
8、s11、通過pcr擴增rsrap2-12基因
9、所述擴增引物對為權(quán)利要求3所述的擴增引物對;
10、s12、構(gòu)建重組過表達載體
11、將步驟s11擴增的rsrap2-12基因采用同源重組的方式與植物過表達載體1008連接,將重組載體轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌gv3101,抗性篩選后獲得陽性菌株;
12、s13、轉(zhuǎn)化并篩選高含量花青素的蘿卜葉片
13、取步驟12獲得的陽性菌株配置浸染液,充分搖勻,采用分光光度計將od600值調(diào)至0.6~0.8,注射到蘿卜真葉中,28℃暗培養(yǎng)2天后,移至正常條件下培養(yǎng),一周左右后觀察注射部位的表型,用于篩選蘿卜新品種。
14、進一步,在步驟s11中,所述pcr擴增程序:總體積為20μl,正向引物0.5μl,反向引物0.5μl,模板dna2μl,高保真酶mix?10μl,ddh2o?7μl;
15、所述pcr反應(yīng)程序:98℃預(yù)變性30s;98℃變性10s,60℃退火5s,72℃延伸10s,循環(huán)數(shù)35;72℃延伸2min;pcr擴增產(chǎn)物4℃保存;
16、進一步,在步驟s13中,所述侵染液包含5ml?mgcl2、5ml?mes和50ul?as,滅菌水定容至100ml。
17、本發(fā)明還提供了一種降低蘿卜肉質(zhì)花青素含量的方法,所述方法為構(gòu)建vigs沉默載體使rsrap2-12基因功能喪失。
18、進一步,所述方法包括如下步驟:
19、s21、構(gòu)建蘿卜的vigs載體
20、s22、將步驟s21構(gòu)建的vigs載體轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)dh5α用于擴繁,經(jīng)藍白斑篩選后搖菌,并采用質(zhì)粒大提試劑盒提取質(zhì)粒,提取好的質(zhì)粒20℃保存;
21、s23、當(dāng)紅皮紅肉蘿卜根部膨大到直徑3cm左右開始注射第一次,將大提好的質(zhì)粒,放在室溫,融化備用,用1m無菌注射器吸取適量質(zhì)粒,注射至蘿卜肉質(zhì)根中部,每次注射多個部位,每隔一周侵染一次,侵染3次后一周切開蘿卜根部觀察表型。
22、以下為本發(fā)明方案涉及的序列:
23、rsrap2-12基因的編碼序列(seq?id?no.1):
24、atgtgtggaggagctataatctccgatttcatcccgccgccgaggtctcgcc
25、gcgtcaccagcgagtttctctggccggatctgaagaagaagaagagctcgaggaaacgctcctcgagtttcttcgatcttgacgatgagttcgaggctgacttccagggcttcaacgacgattccttcatcgactgcgatgatgcgaaaccgttcgttttcgccggggctcgtaaaccccccgccgccactgccgccgattcagcttttggcaagaaagttgctgacggagaaggtgagagatctgcaaagaggaagaggaagagccagtaccgaggtataagacaacgtccttggggaaaatgggctgctgagattcgtgatccaagggaaggttcaagagtgtggcttggaactttcaaaactgccgaggaagctgcaagagcttacgatgctgcagctcgtagaatccgtggttccaaagctaaggtgaatttcccagaggagaacccacttgccaagaaggtggctaaaccgaacccaaacccaactctggttcagaacgtggacaactcctttgacaatatatgtttcatggaggagaaacaagaagttaacagcagcaacaacaacaacaatcaatttggtaatgggtatcatcagttattcagctcagaccagggtagtaactcatttggttgttctgagtttggttggaacgatcaagctcctataactcctgagatctcttcggcgtttatcaacaacaacaactctgctctattcgccgaggaagctgatccagctaagaagctcaagtccatggatttcgagacaccttacaacaacactgaatgggattcttcacttgatttcttcaacgaagacgccgtggcgactcaggacaatggtgcaaaccctatggaactatggagcattgatgagatcgattccatgattggaggagtcttctga
26、rsrap2-12基因的蛋白質(zhì)序列(seq?id?no.2):
27、mcggaiisdfippprsrrvtseflwpdlkkkkssrkrsssffdlddefeadfqgfnddsfidcddakpfvfagarkppaataadsafgkkvadgegersakrkrksqyrgirqrpwgkwaaeirdpregsrvwlgtfktaeeaaraydaaarrirgskakvnfpeenplakkvakpnpnptlvqnvdnsfdnicfmeekqevnssnnnnnqfgngyhqlfssdqgsnsfgcsefgwndqapitpeissafinnnnsalfaeeadpakklksmdfetpynntewdssldffnedavatqdnganpmelwsideidsmiggvf
28、seq?id?no.3:
29、atgtgtggaggagctataatctccg
30、seq?id?no.4:
31、gaagactcctccaatcatggaa
32、綜上所述,本發(fā)明具有以下有益效果:
33、本發(fā)明提供的rsrap2-12基因是一種轉(zhuǎn)錄因子,通過在蘿卜中克隆rsrap2-12的編碼序列,構(gòu)建過表達載體,在蘿卜葉片中表達可以促進葉片中花青素的合成,構(gòu)建vigs沉默載體注射到紅皮紅肉蘿卜根部可以降低花青素的積累;因此,蘿卜rsrap2-12基因在蘿卜花青素合成調(diào)控中起重要作用,從蘿卜中分離并鑒定rsrap2-12基因,對于培育高花青素含量蘿卜新品種具有重要的育種意義,為培育高花青素蘿卜新品種提供了參考依據(jù)。