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      高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記肽及其用圖_2

      文檔序號(hào):8908693閱讀:來(lái)源:國(guó)知局
      可。(B)優(yōu)選由序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基中缺失、附加、置 換或插入1個(gè)或多個(gè)氨基酸而得的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多 肽。
      [0023] (C)只要是包含與序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基有90%以 上同源性的氨基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽即可。(C)優(yōu)選由與序列號(hào) 1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基有90%以上同源性的氨基酸序列構(gòu)成,能夠 用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽。
      [0024] (B)中,1個(gè)或者多個(gè)的氨基酸殘基的突變,可以存在于氨基酸序列中的1個(gè)區(qū)域 中,也可以存在于多個(gè)不同的區(qū)域中。術(shù)語(yǔ)"1個(gè)或多個(gè)"表示不較大地?fù)p害標(biāo)記肽的功能 或特性的范圍。"1個(gè)或多個(gè)"是指例如"1個(gè)~14個(gè)"、"1個(gè)~10個(gè)"、"1個(gè)~7個(gè)"、"1 個(gè)~5個(gè)"、" 1個(gè)~3個(gè)"、" 1個(gè)或2個(gè)"或" 1個(gè)"。
      [0025] 氨基酸序列中允許突變(例如,缺失、附加、置換或插入)的氨基酸殘基的位置對(duì) 于本領(lǐng)域技術(shù)人員是顯而易見(jiàn)的。具體地,本領(lǐng)域技術(shù)人員,1)與具有同種活性的多個(gè)蛋白 質(zhì)的氨基酸序列(例如序列號(hào)1所示的氨基酸序列以及其他的高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記肽的 氨基酸序列)比較,2)明確相對(duì)保守區(qū)域(保存領(lǐng)域)和相對(duì)非保守區(qū)域(保 存$札TUU領(lǐng)域),接著3)由相對(duì)保守區(qū)域和相對(duì)非保守區(qū)域可以分別預(yù)測(cè)對(duì)功能能 夠發(fā)揮重要作用的區(qū)域和對(duì)功能不能發(fā)揮重要作用的區(qū)域,因此可以確認(rèn)結(jié)構(gòu)和功能的相 關(guān)性。因此,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以推斷高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的氨基酸序列中能允許突變 的氨基酸殘基的位置。
      [0026] 氨基酸殘基的置換可以是保守性置換。在本說(shuō)明書(shū)中使用的情況下,術(shù)語(yǔ)"保守性 置換"是指用具有類(lèi)似側(cè)鏈的氨基酸殘基置換規(guī)定的氨基酸殘基。具有類(lèi)似的側(cè)鏈的氨基 酸殘基的家族是本領(lǐng)域眾所周知的,例如可列舉具有堿性側(cè)鏈的氨基酸(例如,賴(lài)氨酸、精 氨酸、組氨酸)、具有酸性側(cè)鏈的氨基酸(例如,天冬氨酸、谷氨酸)、具有不帶電荷的極性側(cè) 鏈的氨基酸(例如,天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、具有非極性 側(cè)鏈的氨基酸(例如,甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、蛋氨 酸、色氨酸)、具有0位支鏈的氨基酸(例如,蘇氨酸、纈氨酸、異亮氨酸)、具有芳香族側(cè)鏈 的氨基酸(例如,酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、組氨酸)、具有含羥基(例如,醇性、酚性)側(cè)鏈 的氨基酸(例如,絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸)、以及具有含硫側(cè)鏈的氨基酸(例如半胱氨酸、蛋 氨酸)。優(yōu)選氨基酸的保守性置換可以是天冬氨酸和谷氨酸間的置換、精氨酸和賴(lài)氨酸和組 氨酸間的置換、色氨酸和苯丙氨酸間的置換、苯丙氨酸和纈氨酸間的置換、亮氨酸和異亮氨 酸和丙氨酸間的置換、以及甘氨酸和丙氨酸間的置換。
      [0027] 在本發(fā)明中使用的情況下,術(shù)語(yǔ)"同源性"可舉例相同性、類(lèi)似性。術(shù)語(yǔ)"90%以 上"是指例如"91%以上"、"92%以上"、"93%以上"、"94%以上",優(yōu)選"95%以上",特別優(yōu) 選"98 %以上",更優(yōu)選"99 %以上"。
      [0028] 氨基酸序列的同源性(例如,相同性、類(lèi)似性)可以通過(guò)在軟件CLUSTALW的多 序列比對(duì)分析(MultipleSequenceAlignmentbyCLUSTALW) (http://www.genome.jp/tools/clustalw/)中輸入氨基酸序列算出。此外,可以使用根據(jù)Karlin以及Altschul的 BLAST(《美國(guó)科學(xué)院院刊》(Proc.Natl.Acad.Sci.USA),90, 5873 (1993)),根據(jù)Pearson的 FASTA(《酶學(xué)方法》(MethodsEnZymol.),183,63(1990))等的算法決定?;贐LAST,開(kāi)發(fā) 出了BLASTP、BLASTN等的程序(參見(jiàn)http://www.ncbi.nlm.nih.gov),因此可以在默認(rèn)設(shè) 定下使用這些程序,計(jì)算氨基酸序列的同源性。
      [0029] 作為(A),例如可列舉(A-1)~(A-9): (A-1)序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基構(gòu)成的多肽; (A-2)包含序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,且上述5個(gè)以上的氨 基酸殘基包含序列號(hào)1的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的至少一部分的多肽; (A-3)由序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基構(gòu)成,且上述5個(gè)以上的 氨基酸殘基中包含序列號(hào)1的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的至少一部分的多肽; (A-4)包含選自序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的連續(xù)5個(gè)以 上的氨基酸殘基的多肽; (A-5)由選自序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的連續(xù)5個(gè)以上 的氨基酸殘基構(gòu)成的多肽; (A-6)包含序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的多肽; (A-7)由序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位構(gòu)成的多肽; (A-8)包含序列號(hào)1的氨基酸序列的多肽;以及 (A-9)由序列號(hào)1的氨基酸序列構(gòu)成的多肽。
      [0030] 作為(B),例如可列舉(B-1)~(B-9): (B-1)由序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基中缺失、附加、置換或插 入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (B-2)是序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,且包含上述5個(gè)以上 的氨基酸殘基中包含序列號(hào)1的氨基酸殘基25位~39位的至少一部分的氨基酸序列中缺 失、附加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記 的多肽; (B-3)是序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,且由上述5個(gè)以上的氨 基酸殘基中包含序列號(hào)1的氨基酸殘基25位~39位的至少一部分的氨基酸序列中包含缺 失、附加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用 標(biāo)記的多肽; (B-4)包含選自序列號(hào)1的氨基酸序列中氨基酸殘基號(hào)25位~39位的連續(xù)5個(gè)以上 的氨基酸殘基中缺失、附加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)的氨基酸的氨基酸序列,能夠用作高 血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (B-5)由選自序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的連續(xù)5個(gè)以上 的氨基酸殘基中缺失、附加、置換或插入了 1個(gè)或多個(gè)的氨基酸的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用 作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用的多肽; (B-6)包含序列號(hào)1的氨基酸序列的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的氨基酸序列中缺失、 附加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的 多肽; (B-7)由序列號(hào)1的氨基酸序列的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的氨基酸序列中缺失、附 加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記 的多肽; (B-8)包含序列號(hào)1的氨基酸序列中缺失、附加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨 基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽;以及 (B-9)由序列號(hào)1的氨基酸序列中缺失、附加、取代或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨基酸的氨基 酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽。
      [0031] 作為(C),例如可列舉(C-1)~(C-9): (c-l)由與序列號(hào)1的氨基酸序列中連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基有90%以上同源性的 氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (C-2)是序列號(hào)1的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,且包含與上述5個(gè)以 上的氨基酸殘基中包含序列號(hào)1的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的至少一部分的氨基酸序列 有90%以上同源性的氨基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (C-3)是序列號(hào)1的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,且由與上述5個(gè)以上 的氨基酸殘基中包含序列號(hào)1的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的至少一部分的氨基酸序列有 90%以上同源性的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (C-4)包含與選自序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的連續(xù)5個(gè) 以上的氨基酸殘基有90%以上同源性的氨基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多 肽; (C-5)由與選自序列號(hào)1的氨基酸序列中的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的連續(xù)5個(gè)以 上的氨基酸殘基有90%以上同源性的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的 多肽; (C-6)包含與序列號(hào)1的氨基酸序列的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的氨基酸序列有 90%以上同源性的氨基酸序列,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (C-7)由與序列號(hào)1的氨基酸序列的氨基酸殘基號(hào)25位~39位的氨基酸序列有90% 以上同源性的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽; (C-8)包含與序列號(hào)1的氨基酸序列有90%以上同源性的氨基酸序列,能夠用作高血 糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽;以及 (C-9)由與序列號(hào)1的氨基酸序列有90%以上同源性的氨基酸序列構(gòu)成,能夠用作高 血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽。
      [0032] (1-2)關(guān)于⑶~(E) (D)~(E)中,關(guān)于序列號(hào)1的氨基酸序列,如上述項(xiàng)目(1-1)的說(shuō)明所述。
      [0033] (D)~(E)中,序列號(hào)1的氨基酸序列中具有各自突變的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè) 以上的氨基酸殘基,優(yōu)選連續(xù)7個(gè)以上的氨基酸殘基,更優(yōu)選連續(xù)10個(gè)以上的氨基酸殘基, 進(jìn)一步優(yōu)選連續(xù)12個(gè)以上的氨基酸殘基,更進(jìn)一步優(yōu)選連續(xù)14個(gè)以上的氨基酸殘基,特別 優(yōu)選連續(xù)15個(gè)以上的氨基酸殘基。沒(méi)有特別的上限規(guī)定,可以是序列號(hào)1的氨基酸序列中 具有各自突變的氨基酸序列的全長(zhǎng)(141個(gè)殘基)或超過(guò)該全長(zhǎng),例如為200個(gè)以下、100個(gè) 以下、90個(gè)以下、80個(gè)以下、70個(gè)以下、60個(gè)以下、50個(gè)以下、40個(gè)以下、30個(gè)以下、20個(gè)以 下。
      [0034] (D)中,只要是包含序列號(hào)1的氨基酸序列中缺失、附加、置換或插入了 1個(gè)或多個(gè) 氨基酸的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的 多肽即可。(D)中,優(yōu)選由序列號(hào)1的氨基酸序列中缺失、附加、置換或插入了 1個(gè)或多個(gè)氨 基酸的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基構(gòu)成,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記 的多肽。
      [0035] (E)只要包含與序列號(hào)1的氨基酸序列有90%以上同源性的氨基酸序列中的連續(xù) 5個(gè)以上的氨基酸殘基,能夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽即可。(E)優(yōu)選由與序列號(hào) 1的氨基酸序列有90%以上同源性的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基構(gòu)成,能 夠用作高血糖風(fēng)險(xiǎn)判定用標(biāo)記的多肽。
      [0036] (D)中的1個(gè)或多個(gè)的氨基酸殘基的突變,與上述項(xiàng)目(1-1)中的(B)涉及的說(shuō)明 相同。
      [0037] (E)中的同源性,與上述項(xiàng)目(1-1)中(C)涉及的說(shuō)明相同。
      [0038] 作為(A)~(E)形成的群中所含的肽,優(yōu)選由(A-2)~(A-7)、(B-2)~(B-7)和 (C-2)~(C-7)形成的群中所含的肽,更優(yōu)選(A-6)和(A-7)的肽,進(jìn)一步優(yōu)選(A-7)的肽。
      [0039] (1-3)關(guān)于(F)~⑶ (F)~(H)中,序列號(hào)2的氨基酸序列,是編碼堿性唾液脯氨酸豐富蛋白2的氨基酸序 列(全長(zhǎng)416個(gè)氨基酸),在數(shù)據(jù)庫(kù)中登記為入藏登記號(hào)P02812. 3。
      [0040] (F)~⑶中,序列號(hào)2的氨基酸序列中的連續(xù)5個(gè)以上的氨基酸殘基,優(yōu)選序列
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