專利名稱:用于操作自動化樣本工作間的方法
技術(shù)領域:
本發(fā)明涉及一種用于操作自動化樣本工作間的方法和一種可操作用于處理生物樣本的自動化樣本工作間。
背景技術(shù):
在分析實驗室(具體地,臨床實驗室)中,對生物樣本執(zhí)行大量分析,以確定患者的生理狀態(tài)。市場上的當前預分析標品處理器能夠制備多個生物樣本,例如血液、尿液、腦脊液、唾液等。典型地,生物流體樣本被包含在開口或封蓋的樣本管中。在可以對生物樣本執(zhí)行化學或生物分析之前,可能必須對患者的樣本執(zhí)行多個不同預分析處理步驟。這些處理步驟可以包括離心法、封蓋、開蓋、重新封蓋和/或等分(aliquotation)步驟。所述處理步驟還可以包括將化學制品或緩沖劑添加至樣本,濃縮樣本,培育樣本,等等。數(shù)目不斷增加的這些“預分析”步驟和過程由自動化預分析樣本工作間(也被稱作“自動化預分析系統(tǒng)”) 自動執(zhí)行。典型地,在試驗單(test order)中指定要對生物樣本執(zhí)行的分析試驗的種類。問題在于樣本的物理運送和處理可能不總是與特定分析試驗向所述生物樣本的分配同步。例如,在不清楚應對血液樣本執(zhí)行哪種種類的生物和/或化學分析(也被稱作“分析試驗”)的時刻,可以從患者抽取血液樣本,將其收集在樣本管中,并手動或自動運送至自動化樣本工作間。內(nèi)科醫(yī)生可能必須在他可以決定應對患者的血液樣本執(zhí)行哪種種類的分析試驗之前對患者進行附加檢查。在內(nèi)科醫(yī)生進行所述附加檢查時,患者的血液樣本可能已經(jīng)到達自動化樣本工作間,從而給自動化樣本工作間留下對該樣本做什么的疑問。根據(jù)一些實驗室設置,與一堆基于紙的試驗單一起接收到多個樣本。在所述情形中,可以延遲向樣本的電子試驗單的分配,這是由于在可以針對特定樣本請求電子試驗單之前需要將基于紙的試驗單上的數(shù)據(jù)手動輸入到實驗室的軟件中。只要未接收到針對生物樣本的試驗單,大多數(shù)現(xiàn)有技術(shù)自動化樣本工作間就不可操作用于針對特定分析制備所述樣本。失去了寶貴的時間,這是由于所述自動化工作間根本不能夠處理所述生物樣本或者僅能夠承載未將試驗單分配給緩沖站的樣本。一些現(xiàn)有技術(shù)自動化樣本工作間不請求試驗單,而是確定生物樣本的樣本管的類型并專門基于其管類型來處理所述樣本。例如,在US 6599476 BI中描述的自動化樣本工作間利用圖像分析來確定樣本容器類型,以將容器分發(fā)給不同區(qū)域或支架。該方案的缺點在于關于管類型的信息單獨通常不足以確定針對特定分析試驗制備特定生物樣本所必需的所有處理步驟。此外,所述系統(tǒng)是不靈活的,這是由于在實驗室中,可以存在比管類型更多得多的處理工作流程和對應的試驗單??傊F(xiàn)有技術(shù)自動化樣本工作間完全基于試驗單并且從而完全根據(jù)試驗單的接收,或者僅基于管類型的確定。在后一種情況下,所述工作間不靈活并通常不能夠針對特定分析試驗充分預處理生物樣本。W02007018897A2描述了一種用于在實驗室工作間系統(tǒng)中自動處理化學和凝結(jié)試驗的方法,從而對適配離心法協(xié)議的任務進行自動化。在自動化臨床工作間系統(tǒng)的輸入站處對患者樣本進行分類,并根據(jù)其預分析離心法需求以不同方式處理所述患者樣本。US200050037502A1描述了一種用于自動操作對多個患者樣本進行化驗的樣本工作間的方法。該工作間將要進行的化驗與化驗定義規(guī)則集合進行比較。在具有容器標識標記(例如,指示患者身份且可選地還指示要完成的化驗過程的條形碼)的容器中提供樣本。US5865718A描述了一種用于操作一個或多個離心機從而使用協(xié)議記錄數(shù)據(jù)庫的方法。在EP 0902290 A2和EP 0795754 A2中描述了用于自動分析儀的另外的樣本處理系統(tǒng)。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的實施例的目的是提供一種改進的自動化樣本工作間,其可操作用于處理一個或多個生物樣本,即使在未接收到針對所述樣本的試驗單的情況下,從而避免延遲并加速樣本處理。 該目的由獨立權(quán)利要求的特征解決。在從屬權(quán)利要求中給出了優(yōu)選實施例。如這里使用的表述“自動化樣本工作間”涵蓋了包括可操作用于對一個或多個生物樣本自動執(zhí)行一個或多個處理步驟的一個或多個實驗室設備或“工作間一單元”的任何實驗室工作間。表述“處理步驟”從而指代物理執(zhí)行的處理步驟,例如離心法、等分等等。“自動化樣本工作間”覆蓋了預分析樣本工作間、后分析樣本工作間以及還有分析工作間。具體地,自動化樣本工作間覆蓋了預分析樣本工作間。自動化樣本工作間的實驗室設備形成功能單元,即,共同控制這些實驗室設備以對樣本執(zhí)行一系列處理步驟。所述實驗室設備可能但不必必須形成物理單元。相應地,工作間的實驗室設備可以形成一個整體塊,或者可以是由運送單元(例如,輸送機)連接的物理上分離的實驗室設備的集合?!邦A分析樣本工作間”包括用于對一個或多個生物樣本執(zhí)行一個或多個預分析處理步驟從而針對一個或多個隨后分析試驗制備樣本的一個或多個實驗室設備。例如,預分析處理步驟可以是離心法步驟,封蓋、開蓋或重新封蓋步驟、等分步驟、將緩沖劑添加至樣本的步驟等。如這里使用的表述“分析系統(tǒng)”涵蓋了任何單或多模塊化實驗室設備,其包括可操作用于對一個或多個生物樣本執(zhí)行分析試驗的一個或多個實驗室設備或操作單元。如這里使用的表述“后分析樣本工作間”涵蓋了任何自動化樣本工作間,其可操作用于自動處理和/或存儲一個或多個生物樣本。后分析處理步驟可以包括重新封蓋步驟、從分析系統(tǒng)卸載樣本的步驟、或者將所述樣本運送至存儲單元或運送至用于收集生物廢物的單元的步驟。工作間可以由運送單元(輸送機和/或機器人臂)連接。備選地,手動地將樣本從一個工作間運送至另一工作間,或者工作間直接彼此連接。術(shù)語“生物樣本”涵蓋了已從人或任何其他生物體得到的任何種類的組織或體液。具體地,生物樣本可以是全血、血清、血漿、尿液、腦脊液或唾液樣本或者其任何衍生物。被分析物是要分析的樣本的成分,例如各種大小的分子、離子、蛋白質(zhì)、代謝物等。在被分析物上采集的信息可以用于評估藥物的施用對生物體或特定組織的影響或者進行診斷。這里,對生物樣本內(nèi)的被分析物及其濃度的確定還被稱作“臨床化學”。血液樣本的細胞成分的特征被稱為“臨床血液學”。用于評估個體的凝塊機制的實驗室分析被稱作“凝結(jié)分析”。
分析或“分析試驗”是表征生物樣本的參數(shù)(例如,其不透明度、顏色或密度,或者樣本的被分析物的存在或濃度)的實驗室過程。對血漿或血清樣本而不是全血液樣本進行例行分析,這是由于血液的細胞成分與一些分析試驗發(fā)生干擾。此外,血清和血漿可以被凍結(jié)或冷卻,并且因此可以被存儲數(shù)天或數(shù)周以供稍后分析。因此,通常在預分析樣本工作間中使全血液樣本離心,以便在存儲或分析所述樣本之前獲得血漿或血清樣本。如這里使用的“試驗單”涵蓋了指示要對特定生物樣本執(zhí)行的一個或多個分析試驗的任何數(shù)據(jù)對象。例如,試驗單可以是關系數(shù)據(jù)庫中的文件或條目。例如,如果試驗單包括要對特定樣本執(zhí)行的分析試驗的標識符或者與該標識符相關聯(lián)地存儲,則該試驗單可以指示分析試驗。術(shù)語“樣本管”指代用于運送、存儲和/或處理生物樣本的任何單獨容器。具體地,所述術(shù)語指代一件實驗室玻璃或塑料器皿但不限于此,可選地,包括在其上端處具有蓋 并通常具有圓的U形底部。樣本管(例如,用于收集血液的樣本管)通常包括對樣本的處理有影響的附加物質(zhì)(例如凝塊活化劑或抗凝劑物質(zhì))。因此,典型地,不同的管類型適于特定分析(例如,臨床化學分析、血液學分析或凝結(jié)分析)的預分析和分析需求。樣本管類型的混合可以使(血液)樣本不可用于分析。為了防止收集和處理樣本時的錯誤,根據(jù)固定和統(tǒng)一顏色方案來對許多管制造商的樣本蓋進行編碼。附加地或備選地,一些樣本管類型由特定的管尺寸、蓋尺寸和/或管顏色表征。管的尺寸包括例如其高度、其大小和/或另外的特征形狀性質(zhì)。表述“管類型”指代可由至少一個共享性質(zhì)表征的樣本管的類別,由此,所述共享性質(zhì)可以由實驗室設備自動檢測,并且從而可以被用于將第一管類型的樣本管的集合與另一管類型進行區(qū)別。在附錄中的表I中給出了目前使用的典型的管類型的一些示例。表I列出了樣本管類型集合I至VII。一些管類型被設計為承載可用于多個不同分析試驗的生物樣本。這種管類型的示例是血清管。然而,對于一個單一的分析試驗,管類型還可以是特定的。血漿是血液中缺少血細胞的液體成分。血漿是通過以下操作來制備的旋轉(zhuǎn)離心機中的包含抗凝劑物質(zhì)的全血液樣本,直到在管的底部處血漿與血細胞分離為止。血漿樣本是要從其制備血漿的血液樣本。血清樣本通常用于臨床化學或免疫學分析。血清是不具有纖維蛋白原或其他凝血因子的血漿。血清通常用于廣泛的多種分析(例如,用于檢測抗體的分析、用于臨床化學分析的分析、用于血型檢定的分析、或者用于法醫(yī)實驗室中的DNA分析的分析)。因此,血清樣本是要在執(zhí)行所述分析之一之前從其制備血清的血液樣本。凝結(jié)樣本管是用于收集要在凝結(jié)試驗中使用的血液的樣本管。“STAT樣本”是需要非常緊急地處理和分析的生物樣本,這是由于分析結(jié)果可能對患者來說有決定生命的重要性。以下將同義地使用表述“分類”和“分組”,以便指代基于由特定組的所有樣本共享的特征來對生物樣本進行分組,以便至少在稍后處理步驟期間以相同方式處理組中的所有樣本。在一方面,本發(fā)明涉及一種用于操作用來處理一個或多個生物樣本的自動化樣本工作間的方法,該工作間包括樣本輸入站,所述方法包括
-通過所述樣本輸入站來接收所述一個或多個生物樣本,每個樣本被包含在樣本管中,每個樣本管具有管類型;
-在針對至少一個生物樣本接收到試驗單的情況下,對工作間進行操作以自動對所述至少一個生物樣本執(zhí)行一個或多個第一處理步驟;以及
-在未接收到所述試驗單的情況下,根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來確定一個或多個第二處理步驟,并對所述至少一個生物樣本執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟。根據(jù)實施例,如果接收到試驗單,則在接收到一個或多個樣本時執(zhí)行評估。例如,一個或多個樣本的接收可以發(fā)起執(zhí)行對所述樣本的試驗單的第一請求。所述特征是有利的,這是由于所述特征允許即使在未接收到試驗單的情況下也對至少一個生物樣本執(zhí)行至少一些處理步驟。因此,避免了延遲,并且樣本處理工作流程可以由工作間更高效地執(zhí)行。以下,將描述兩個用例情形,以闡明現(xiàn)有技術(shù)樣本工作間與本發(fā)明的實施例之間的不同。本發(fā)明的實施例所提供的優(yōu)勢具體在于避免了在已經(jīng)接收到尚未將試驗單分配給其的生物樣本的現(xiàn)有技術(shù)的基于試驗單的樣本工作間中出現(xiàn)的延遲。 兩個用例情形
情形I :現(xiàn)有技術(shù)樣本工作間
a)在將生物樣本加載至現(xiàn)有技術(shù)的基于試驗單的樣本工作間中并且所述工作間可操作用于接收針對所述生物樣本的試驗單的情況下,工作間根據(jù)接收到的試驗單來確定要對接收到的生物樣本執(zhí)行的一個或多個處理步驟。b)在將生物樣本加載至自動化樣本工作間中并且所述工作間不能夠接收到針對所述樣本的試驗單的情況下,所述現(xiàn)有技術(shù)樣本工作間不可操作用于處理該樣本,這是由于沒有關于如何針對一個或多個分析試驗制備所述樣本的信息可用。因此,必須手動或自動將樣本承載至緩沖站或存儲單元。將樣本保存在所述緩沖站或存儲單元中,直到對應的試驗單可用為止。失去了寶貴的時間,并占用了緩沖/存儲容量。此外,工作間的操作者可能擔負決定對尚未分配任何試驗單的樣本做什么的任務。情形11 :根據(jù)本發(fā)明的實施例的樣本工作間
a)自動化樣本工作間通過其樣本輸入站來接收至少一個生物樣本,并成功請求或以其他方式接收針對所述樣本的試驗單。在接收到針對所述生物樣本試驗單的情況下,自動化樣本工作間對樣本執(zhí)行第一處理步驟,如試驗單所指示的那樣。例如,如果接收到的生物樣本是已分配用于執(zhí)行葡萄糖水平分析的試驗單的全血液樣本,則自動化樣本工作間將樣本傳送至離心機,發(fā)起根據(jù)適合于所指示的分析試驗的離心法程序的對樣本的離心,并將經(jīng)過離心的生物樣本轉(zhuǎn)發(fā)至一個或多個分析設備,如接收到的試驗單所指示的那樣。b)在未接收到針對所述生物樣本的試驗單的情況下,自動化樣本工作間根據(jù)接收到的生物樣本的管類型來執(zhí)行一個或多個第二處理步驟。盡管現(xiàn)有技術(shù)的基于試驗單的樣本工作間在未接收到試驗單的情況下不能夠處理生物樣本,或者僅能夠執(zhí)行一些靜態(tài)預定義的處理步驟(例如,將所述樣本轉(zhuǎn)發(fā)至緩沖站),但是本發(fā)明的實施例允許根據(jù)樣本的動態(tài)確定的管類型來對所述樣本執(zhí)行一個或多個復雜的處理步驟。從而,根據(jù)本發(fā)明的實施例的自動化樣本工作間可操作用于甚至在試驗單在該時刻不可用于樣本的情況下也根據(jù)樣本的管類型來靈活處理該樣本。使用管類型以便確定至少一些處理步驟是有利的,這是由于即使在尚未接收到試驗單的情況下,每當生物樣本被加載至樣本工作間中時,關于管類型的信息自動可用。例如,如果樣本工作間接收到包含在血清管中的全血液樣本,則樣本工作間能夠執(zhí)行開蓋或重新封蓋步驟以及用于從全血制備血清的離心步驟。這里,已經(jīng)根據(jù)樣本的管類型而確定的處理步驟也被稱作“第二處理步驟”。盡管針對特定分析試驗制備樣本所必需的一些處理步驟可能不可從管類型單獨推斷出,但是在試驗單不可用的情況下根據(jù)管類型確定一個或多個第二處理步驟保證了 即使在未接收到試驗單的情況下,在由工作間接收到生物樣本之后立即執(zhí)行必要的處理步驟。用于凝結(jié)試驗的預處理血液樣本
為了給出實際使用本發(fā)明的實施例的具體示例,將描述通過根據(jù)本發(fā)明的實施例的自動化樣本工作間對凝結(jié)樣本的處理在針對患者的至少一個生物樣本接收到針對“凝結(jié)試驗”的試驗單(例如,響應于第一請求)的情況下,對所述樣本執(zhí)行一個或多個第一處理步驟,如試驗單所指示的那樣。第一處理步驟是針對隨后凝結(jié)分析制備樣本的預分析樣本處理步驟。第一處理步驟包括將離心機編程為執(zhí)行3000 g的離心步驟持續(xù)10分鐘;對所述樣本執(zhí)行所述離心步驟;通過開蓋站來對樣本進行開蓋;通過等分站來對所述樣本進行等 分。然后,可以自動將樣本等分試樣運送至適當?shù)姆治鱿到y(tǒng)或輸出緩沖器,可以手動地從那里將所述樣本傳送至分析系統(tǒng)以執(zhí)行凝結(jié)試驗。在響應于第一請求而未接收到試驗單的情況下,工作間不用如現(xiàn)有技術(shù)系統(tǒng)中的情況那樣必須中止處理樣本直到接收到試驗單為止。相反,工作間的輸入站內(nèi)的管類型檢測單元可操作用于動態(tài)確定管類型。然后,根據(jù)管類型來確定一個或多個第二處理步驟。在將管類型識別為凝結(jié)樣本管的情況下(根據(jù)附錄中的表I的針對凝結(jié)試驗的類型VI),相應地指定離心法程序,并且還在不存在試驗單的情況下根據(jù)所述程序來對樣本進行離心。該示例中的第二處理步驟是盡可能地基于由管類型提供的信息針對隨后凝結(jié)分析制備樣本的預分析樣本處理步驟。第二處理步驟包括將離心機編程為執(zhí)行3000 g的離心步驟持續(xù)10分鐘;對所述樣本執(zhí)行所述離心步驟;然后,將樣本轉(zhuǎn)發(fā)至緩沖站。在緩沖站中,存儲樣本,直到用于確定并執(zhí)行突出(outstanding)的處理步驟(例如等分步驟)的針對凝結(jié)樣本的試驗單可用為止。在同時(meanwhile)接收到試驗單(例如,響應于第二請求以及在執(zhí)行離心步驟時)的情況下,可以省略將樣本運送至緩沖站的步驟,并且可以執(zhí)行尚未實施的由同時接收到的試驗單指示的突出的處理步驟。在該示例中,所述處理步驟是將樣本轉(zhuǎn)發(fā)至用于等分所述樣本的等分站;自動將樣本等分試樣運送至適當?shù)姆治鱿到y(tǒng)或輸出緩沖器,可以手動地從那里將所述樣本傳送至分析系統(tǒng)以執(zhí)行凝結(jié)試驗。用于臨床分析的預處理血液樣本
根據(jù)實施例,工作間可操作用于針對多種不同臨床試驗對血清管中包含的全血液樣本進行自動預處理。所述樣本需要利用2000 g的離心力和5分鐘的離心時間而被離心,以用于從全血制備血清(相同離心法參數(shù)還用于制備血漿樣本)。在自動化樣本工作間可操作用于接收針對所述血液樣本的試驗單(例如,對執(zhí)行用于確定葡萄糖水平的試驗的請求)的情況下,樣本工作間執(zhí)行一個或多個第一處理步驟。這些第一處理步驟包括利用2000 g的離心力對樣本進行離心持續(xù)5分鐘;以及執(zhí)行制備樣本所必需的附加預處理步驟,以確定其葡萄糖濃度。在未接收到試驗單的情況下,根據(jù)樣本管類型(根據(jù)附錄中的表I的管類型I和II,血清樣本)來至少自動執(zhí)行離心步驟和例如一些開蓋和/或重新封蓋步驟。
用于血液學試驗的預處理血液樣本
根據(jù)實施例,工作間可操作用于對在類型111樣本管中收集的EDTA血液樣本進行自動預處理。在所述樣本管中收集的血液可以用于檢查血細胞(例如,其形狀和每容積單位的數(shù)目)。對于所述種類的分析(也被稱作血液學試驗),離心法可以使所述分析的執(zhí)行不可能。因此,必須禁止對所述樣本的離心。因此,要對所述種類的樣本執(zhí)行的第一或第二處理步驟可以包括各種開蓋和/或重新封蓋步驟,但不包括任何離心步驟。預處理STAT樣本
此外,上述樣本工作間可能可操作用于對比常規(guī)樣本具有更高優(yōu)先級的STAT樣本進行自動預處理。在針對至少一個所接收的生物樣本接收 到試驗單的情況下,根據(jù)接收到的試驗單來確定其STAT狀態(tài)(即,其作為STAT樣本或作為ROUTINE (常規(guī))樣本的分類)。此夕卜,對所述樣本執(zhí)行一個或多個第一處理步驟,如試驗單所指示。在未接收到試驗單的情況下,根據(jù)已接收到所述至少一個生物樣本的樣本輸入站的輸入位置來確定所述生物樣本的STAT狀態(tài)。在將該樣本分類為STAT樣本的情況下,利用比常規(guī)樣本更高的優(yōu)先級來處理所述樣本。這是有利的,因為在通過樣本工作間接收到STAT樣本的情況下,可以將STAT樣本標識為STAT樣本,并且即使在尚未針對所述樣本接收到試驗單的情況下,也可以根據(jù)已經(jīng)接收到樣本的輸入站、利用最高優(yōu)先級來立即處理這些STAT樣本。操作根據(jù)本發(fā)明的實施例的樣本工作間是有利的,這是由于即使在自動化樣本工作間未針對所述樣本接收到試驗單的情況下,也通過自動化樣本工作間來執(zhí)行至少一些“第二”處理步驟。根據(jù)實施例,可以基于推送或拖拉方案來接收針對至少一個生物樣本的試驗單。例如,一旦針對特定生物樣本指定了經(jīng)由推送方案接收到的試驗單,就可以將所述試驗單從LIS或另一件實驗室軟件提交至自動化樣本工作間。以下,表述“接收試驗單”涵蓋了用于接收針對生物樣本的試驗單的任何基于推送或拖拉的方案。根據(jù)一些基于拖拉方案的實施例,自動化樣本工作間嘗試通過執(zhí)行第一請求來接收針對至少一個生物樣本的試驗單。根據(jù)實施例,執(zhí)行第一請求可以包括經(jīng)由網(wǎng)絡將針對試驗單的電子請求提交至中間件或LIS (例如,Web服務請求、遠程過程呼叫等)。所述第一請求還可以包括對計算機可讀存儲介質(zhì)執(zhí)行讀取操作,以便確定是否已經(jīng)將針對所述接收到的生物樣本的試驗單存儲到所述存儲介質(zhì)。試驗單指示一個或多個第一處理步驟。表述“指示”意味著試驗單自身可以包括指令,例如,用于對生物樣本執(zhí)行一個或多個第一處理步驟的計算機可解釋指令。附加地或備選地,試驗單可以包括要對樣本執(zhí)行的一個或多個分析試驗和/或預分析和/或后分析處理步驟的一個或多個標識符。試驗單還可以指示覆蓋預分析、分析和/或后分析樣本處理步驟的復雜樣本處理工作流程。用于觸發(fā)自動化樣本工作間的一個或多個實驗室設備以對生物樣本執(zhí)行物理處理步驟的詳細計算機可解釋指令可以是試驗單自身的一部分,或者可以與所述試驗單中包含的一個或多個標識符相關聯(lián)地存儲在其他地方。根據(jù)一些實施例,自動化樣本工作間包括以下這樣的實驗室設備,所述實驗室設備用于執(zhí)行在從包括預分析處理步驟、分析處理步驟和后分析處理步驟的組以任何組合選擇的一個或多個處理步驟。根據(jù)一些實施例,自動化樣本工作間是預分析樣本工作間,并且每個試驗單指定要對至少一個生物樣本執(zhí)行的至少一個分析試驗。從而,例如,所述一個或多個第一處理步驟可以由所述至少一個分析試驗指示。根據(jù)一些實施例,請求針對特定生物樣本的試驗單包括讀取生物樣本的標簽,以便確定通過所述標簽而編碼的樣本標識符,并提交對針對所述樣本的試驗單的請求,其中所述請求包括所述樣本標識符。根據(jù)實施例,自動化樣本工作間包括一個或多個實驗室設備。所述方法還包括以下步驟
-訪問多個第一程序,每個第一程序是計算機可解釋指令的集合,每個程序指定由一個或多個實驗室設備之一能夠?qū)χ辽僖粋€生物樣本執(zhí)行的一個或多個候選處理步驟; -其中,在接收到被分配給所述至少一個生物樣本的試驗單的情況下,根據(jù)所述接收到的試驗單來從多個第一程序選擇一個或多個第二程序,所述一個或多個第二程序指定一個或多個第一處理步驟;
-其中,在未接收到所述試驗單的情況下,根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來從多個第一程序選擇一個或多個第二程序,所述一個或多個第二程序指定一個或多個第二處理步驟。根據(jù)一些實施例,根據(jù)接收到的試驗單或根據(jù)管類型從多個第一程序選擇一個或多個第二程序是通過提供其中已存儲多個第一程序的計算機可讀存儲介質(zhì)來實現(xiàn)的,其中,一個或多個第一程序是相應地與一個或多個試驗單標識符相關聯(lián)地存儲的。此外,一個或多個第一程序是相應地與一個或多個管類型標識符相關聯(lián)地存儲的。從而,每個第一程序包括指定如何對樣本物理地進行處理步驟(例如,如何將樣本運送至特定離心機或者如何對樣本執(zhí)行離心步驟)的計算機可解釋指令。這是有利的,因為該實施方式允許利用映射靈活地將一個或多個處理步驟分配給特定樣本管標識符和/或特定試驗單。所述映射可以是例如利用關系數(shù)據(jù)庫的關聯(lián)表來實現(xiàn)的,其中,每個程序被映射至試驗單的一個或多個標識符和/或管類型的一個或多個標識符。因此,自動化樣本工作間的操作者可操作用于通過編輯關系數(shù)據(jù)庫的表來簡單地改變工作流程定義。該實施方式還允許在未接收到試驗單的情況下靈活地對可基于動態(tài)確定的樣本類型而執(zhí)行的非常復雜的工作流程進行編程。根據(jù)一些實施例,在針對樣本接收到試驗單的情況下執(zhí)行一個或多個第一處理步驟的步驟可以包括接收分析試驗或單個樣本處理步驟的標識符,其中,所述標識符包含在接收到的試驗單中。然后,從計算機可讀介質(zhì)讀取已經(jīng)與接收到的試驗單標識符相關聯(lián)地存儲的一個或多個計算機可解釋指令。所述一個或多個接收到的計算機實施指令指定樣本工作間要對生物樣本執(zhí)行的一個或多個第一處理步驟。根據(jù)實施例,根據(jù)管類型執(zhí)行一個或多個第二處理步驟的步驟可以包括確定樣本管類型;評估樣本管類型,以用于獲得管類型標識符并從數(shù)據(jù)存儲介質(zhì)讀取計算機可解釋指令,其中,所述指令與一個或多個管類型標識符相關聯(lián)地存儲至所述存儲介質(zhì),并且,其中僅讀取已分配所獲得的管類型標識符的那些指令。根據(jù)實施例,自動化樣本工作間嘗試通過執(zhí)行第一請求來接收針對所述至少一個生物樣本的試驗單。根據(jù)一些實施例,通過由工作間或其組件之一(例如,其樣本輸入站)接收至少一個生物樣本來觸發(fā)對第一請求的執(zhí)行。例如,樣本輸入站向頂(儀器管理器)模塊通知接收到已經(jīng)分配特定樣本ID的樣本,并且IM模塊在第一請求中請求針對所述樣本的試驗單。根據(jù)其他實施例,自動執(zhí)行用于接收試驗單的至少一個第二請求。在從包括以下各項的組選擇的時刻執(zhí)行至少一個第二請求
-在已執(zhí)行第一請求后的預定義時間段之后。例如,可以在已提交第一請求之后5分鐘提交第二請求;
-在已執(zhí)行第一請求之后并且在執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之一時。例如,自動化樣本工作間可以根據(jù)管類型來執(zhí)行作為第二處理步驟的一部分的離心步驟。在執(zhí)行離心時,自動化樣本工作間可以提交對接收針對所述離心樣本的試驗單的一個或多個第二請求。這是有利的,因為不是根據(jù)試驗單以便針對特定分析制備生物樣本所必需的所有樣本處理步驟都可以根據(jù)管類型而確定為“第二處理步驟”。為了還確定那些“試驗單專用”處 理步驟,有益的是,開始立即執(zhí)行第二處理步驟以及通過提交一個或多個第二請求來嘗試并行地接收對所有突出的處理步驟的指示;
-在已執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之一之后,其中,根據(jù)一些實施例的一個或多個第二處理步驟包括在已完成所有其他第二處理步驟之后將至少一個生物樣本運送至緩沖站的步驟。在已執(zhí)行所有其他第二處理步驟之后將至少一個生物樣本運送至緩沖站的這種特征是有利的,這是由于該步驟保證了樣本不會阻止對其他樣本的處理并在已完成執(zhí)行一個或多個第二處理步驟后試驗單仍不可用的情況下在適當存儲條件下存儲所述樣本。例如,可以將溫度敏感樣本傳送至冷卻的緩沖站,從而保證一旦通過樣本工作間接收到試驗單,樣本稍后仍可以用于化學分析。根據(jù)一些實施例,一個或多個第二處理步驟包括一個最終步驟在已執(zhí)行所有其他第二處理步驟之后,將至少一個生物樣本傳送至存儲單元。根據(jù)所述實施例中的一些,如果在執(zhí)行第二處理步驟之一時,響應于第二請求之一而接收到試驗單,則不執(zhí)行所述最終運送步驟。這是有利的,因為其避免了執(zhí)行不必要的運送步驟(去往和來自樣本存儲單元)。根據(jù)實施例,在未響應于第一請求接收到試驗單的情況下,僅提交一個或多個第二請求。根據(jù)實施例,自動化樣本工作間包括至少一個離心機。在接收到試驗單的情況下,所執(zhí)行的一個或多個第一處理步驟包括至少一個離心步驟,其中,所述離心步驟由所述至少一個離心機執(zhí)行,如由所述試驗單所指示。在未接收到試驗單的情況下,所執(zhí)行的一個或多個第二處理步驟還包括所述至少一個離心步驟。在這種情況下,所述離心步驟是根據(jù)樣本的所確定的管類型來確定的。這是有利的,因為離心步驟可以花費相當大量的時間并且通常是工作流程的時間限制步驟。因此,在試驗單不可用的情況下根據(jù)管類型執(zhí)行離心步驟有助于避免瓶頸。在許多情況下,可以完全避免由向樣本的試驗單的延遲分配造成的延遲,這是由于在無法在工作間的樣本輸入站接收到樣本的時刻接收到試驗單的情況下,可以根據(jù)管類型來開始離心步驟。由于離心步驟可能花費5至20分鐘,因此存在在執(zhí)行所述離心步驟期間或之后響應于一個或多個第二請求之一接收到試驗單的好機會。根據(jù)其他實施例,自動化樣本工作間包括至少一個等分站。在接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第一處理步驟包括由至少一個等分站要對所述至少一個生物樣本執(zhí)行的至少一個等分步驟。在未接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第二處理步驟不包括所述至少一個等分步驟。這是有利的,因為典型地,等分生物樣本的步驟依賴于要被執(zhí)行的分析試驗,并且因此通常不能單獨基于關于管類型的信息而執(zhí)行。僅在接收到試驗單的情況下執(zhí)行等分樣本的步驟是有利的,這是由于其確保了僅執(zhí)行其必要性可以從管類型安全推斷出的那些處理步驟。根據(jù)其他實施例,自動化樣本工作間包括至少一個開蓋和/或重新封蓋站。在接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第一處理步驟包括由至少一個開蓋和/或重新封蓋站要對所述至少一個生物樣本執(zhí)行的至少一個開蓋和/或重新封蓋步驟。在未接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第二處理步驟包括所述至少一個開蓋和/或重新封蓋步驟。這是有利的,因為對樣本進行封蓋、開蓋和重新封蓋可以是多種不同工作流程設置中的必要預分析過程。第一以及第二處理步驟可以包括按照工作流程內(nèi)的特定狀態(tài)中所需的順序的一個或多個開蓋和/或重新封蓋步驟。在未接收到試驗單并且根據(jù)樣本管來處理樣本的情況下,用于執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之一的工作間實驗室設備的順序可以與用于執(zhí)行一個或多個第一處理步驟的工作間實驗室設備的順序和/或類型不同。一些處理步驟可能需要對樣本進行封蓋,其他 處理步驟可能需要對樣本進行開蓋。根據(jù)本發(fā)明的實施例,第一處理步驟以及一個或多個第二處理步驟包括一個或多個封蓋和/或開蓋處理步驟,其中,所述封蓋和/或開蓋處理步驟布置在第一和/或第二處理步驟內(nèi),如執(zhí)行所述第一和/或第二處理步驟的工作間實驗室設備所需的那樣。根據(jù)其他實施例,一個或多個第二處理步驟是一個或多個第一處理步驟的子集。在未在樣本工作間接收到一個或多個生物樣本的時刻接收到試驗單的情況下(例如,如果未響應于第一請求而接收到試驗單),執(zhí)行一個或多個第二處理步驟。在已執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之后,自動化樣本工作間執(zhí)行其他步驟,所述其他步驟包括在已完成執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之后,接收試驗單(例如,所述試驗單可以是響應于第二處理步驟而接收的);確定一個或多個突出的處理步驟,所述一個或多個突出的處理步驟包括未包含在已經(jīng)執(zhí)行的一個或多個第二處理步驟中的所有第一處理步驟;以及在已執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之后通過自動化樣本工作間來執(zhí)行所述一個或多個突出的處理步驟。換言之,在已執(zhí)行第二處理步驟之后以及在已經(jīng)在稍后時刻接收到試驗單(例如,響應于第二請求)之后,根據(jù)管類型,執(zhí)行尚未作為第二處理步驟而已經(jīng)執(zhí)行的由試驗單指示的所有那些處理步驟。這是有利的,因為其確保了通過執(zhí)行一個或多個突出的處理步驟,最終執(zhí)行針對在所述樣本的試驗單中請求的特定分析試驗制備樣本所必需的所有處理步驟。例如,樣本工作間可以接收血清管內(nèi)的全血液樣本,并響應于接收到所述樣本,提交針對所述管的試驗單的第一請求。然而,未響應于第一請求而接收到試驗單。工作間可以確定接收到的生物樣本包含在血清管中,并可以根據(jù)所述動態(tài)確定的管類型來執(zhí)行一個或多個第二處理步驟。所述第二處理步驟包括用于從所述樣本制備血清的離心步驟。由于可從管類型推斷的信息沒有具體到足以允許執(zhí)行等分步驟,因此樣本工作間不能夠針對特定分析試驗對樣本進行等分。因此,如果未響應于第二請求而接收到試驗單,則工作間可以提交一個或多個第二請求并可以在已完成所述第二處理步驟之后將樣本轉(zhuǎn)發(fā)至存儲單元。然而,如果在執(zhí)行一個或多個第二處理步驟期間或之后接收到所述樣本的試驗單,則可以自動將一個或多個突出的處理步驟確定為由試驗單指示的所有第一處理步驟和已經(jīng)由工作間執(zhí)行的所有第二處理步驟的交集。在已經(jīng)確定一個或多個突出的處理步驟之后,樣本工作間執(zhí)行所述一個或多個突出的處理步驟,從而保證如在響應于第一請求而將立刻接收到試驗單的情況下它們將做的那樣實際上對至少一個生物樣本執(zhí)行所有第一處理步驟。根據(jù)實施例,作為一個或多個第一處理步驟之一或者作為一個或多個突出的處理步驟之一,執(zhí)行針對特定分析試驗對樣本進行等分的步驟。根據(jù)其他實施例,重復且自動地執(zhí)行至少一個第二請求。這是有利的,因為在工作間執(zhí)行一個或多個第二處理步驟期間和/或之后連續(xù)(例如,在預定義時間間隔之后)執(zhí)行第二請求。這保證了一旦可能就接收試驗單,從而避免不必要地將可同時接收其試驗單的樣本傳送至緩沖單元。在當執(zhí)行所有第二處理步驟時未接收到試驗單的情況下,可以將樣本運送至樣本緩沖站。根據(jù)優(yōu)選實施例,即使在已經(jīng)將樣本傳送至所述緩沖站之后,也重復執(zhí)行一個或多個第二請求。一旦響應于第二請求接收到試驗單,就從所述緩沖站卸載樣本,以對所述樣本執(zhí)行一個或多個突出的處理步驟。
根據(jù)實施例,樣本工作間包括儀器管理器(頂)模塊。所述模塊可以是硬件、固件、或軟件模塊或者其任何組合。頂模塊充當對由樣本工作間的實驗室設備執(zhí)行的處理步驟進行控制和監(jiān)視的控制實例。IM模塊可操作用于提交第一和第二請求并響應于所述第一或第二請求中的任一個接收試驗單。IM模塊可操作用于接收已經(jīng)由管類型檢測器確定的管類型。根據(jù)實施例,IM模塊可操作用于訪問在其中已存儲指定由工作間實驗室設備執(zhí)行的物理處理步驟的指令的計算機可讀存儲介質(zhì)。根據(jù)實施例,IM模塊是樣本工作間的組成部分。根據(jù)其他實施例,IM模塊是作為實驗室的中間件或LIS的部分的軟件模塊,所述中間件或LIS經(jīng)由網(wǎng)絡(例如,內(nèi)聯(lián)網(wǎng))連接至工作間。根據(jù)一些實施例,未在一個或多個樣本被加載至樣本工作間中時接收到試驗單。在工作間對樣本執(zhí)行一個或多個第二處理步驟或者已完成執(zhí)行一個或多個第二處理步驟時,自動化樣本工作間接收到試驗單。例如,所述試驗單(例如,響應于第二請求之一),樣本工作間或其組件之一(例如IM模塊)將第二處理步驟與由同時接收到的試驗單指示的第一處理步驟進行比較。在該比較返回所執(zhí)行的第二處理步驟中的一個或多個未由試驗單指示的結(jié)果的情況下,工作間自動將所述樣本檢測為錯誤處理的樣本。工作間提交指示錯誤處理的樣本的警告消息。附加地或作為提交警告的備選,將所述樣本運送至緩沖單元,以存儲或丟棄錯誤處理的生物樣本。例如,工作間的IM模塊可以自動檢測錯誤處理的樣本,并經(jīng)由網(wǎng)絡將警告消息提交至實驗室的LIS或其他軟件組件,并可以被顯示在GUI上。所述特征是有利的,這是由于其允許對其管類型未被正確識別并且從而可能已經(jīng)被錯誤處理的樣本進行檢測和揀選。這種樣本可能不再可用于分析試驗,并且,對其進行揀選有助于保證在由所述樣本工作間預處理的樣本上獲得的分析試驗結(jié)果的精度。根據(jù)其他實施例,樣本工作間確定至少一個生物樣本的管類型。執(zhí)行一個或多個第二處理步驟包括以下步驟針對所確定的管類型檢索離心法程序;以及根據(jù)所述離心法程序執(zhí)行離心步驟。離心法程序可以存儲至例如計算機可讀非易失性存儲介質(zhì)(例如電磁盤、閃存驅(qū)動器、光學驅(qū)動器等),并可以由頂模塊讀取以指定至少一個離心機的離心法程序并根據(jù)所述離心法程序來對所述樣本進行離心。根據(jù)實施例,所述計算機可讀存儲介質(zhì)可以是自動化樣本工作間、離心機或者可經(jīng)由中間件或頂模塊訪問的另一存儲介質(zhì)的組成部分。根據(jù)實施例,離心機可以是自動化樣本工作間的組成部分(例如模塊單元),或者可以是通過自動化運送單元(即,輸送機和/或機器人臂)連接至自動化樣本工作間的獨立實
驗室設備。根據(jù)其他實施例,僅在未接收到所述試驗單的情況下才執(zhí)行確定管類型的步驟。這是有利的,因為可以省略確定管類型(例如,利用攝像機或其他圖像捕獲設備)的步驟,從而節(jié)約時間。根據(jù)其他實施例,管類型由自動化樣本工作間的實驗室設備(例如,由作為輸入站的一部分的圖像檢測設備)自動確定。根據(jù)本發(fā)明的實施例,對管類型的確定可以基于對從包括下述內(nèi)容的組選擇的以下特征中的一個或多個的分析
-管的顏色;
-管蓋的顏色;
-管的尺寸(即,長度和/或直徑和/或形狀性質(zhì));
-管蓋的尺寸(長度和/或直徑和/或形狀性質(zhì));
-指示管類型的管類型標簽,例如2D或3D碼,例如條形碼或矩陣碼。例如,形狀性質(zhì)可以是表面的凹陷或提升。根據(jù)其他實施例,基于相應接收到的試驗單或管類型來接收多個生物樣本并對其進行分組在針對屬于所述多個接收到的生物樣本的每個生物樣本接收到試驗單的情況下,在執(zhí)行一個或多個第一處理步驟之前,根據(jù)其相應接收到的試驗單來對生物樣本進行分組,每個樣本組共享相同的相應接收到的試驗單。在未針對屬于所述多個生物樣本的每個生物樣本接收到試驗單的情況下,在執(zhí)行一個或多個第二處理步驟之前,根據(jù)每個相應生物樣本的管類型來對所述多個生物樣本中的生物樣本進行分組,每個樣本組中的樣本被包含在相同的相應管類型的管中。這是有利的,因為根據(jù)接收到的試驗單或管類型對樣本進行分組允許將樣本組分發(fā)給不同工作間設備并根據(jù)集體共享的試驗單來處理每個樣本組。例如,可以在一個單個步驟中對共享相同試驗單的多個樣本執(zhí)行離心步驟。相應地,在未接收到試驗單的情況下,根據(jù)共享的樣本類型對樣本進行分組和處理是有利的,因為其允許并行地對大量樣本執(zhí)行特定的第二處理步驟,從而加速整個樣本處理工作流程。在另一方面,本發(fā)明涉及一種自動化樣本工作間,包括
-樣本輸入站,用于接收至少一個生物樣本,每個生物樣本被包含在樣本管中,每個樣本管具有管類型;
-頂模塊,用于接收針對所述至少一個接收到的生物樣本的試驗單;
-管類型檢測器,用于自動確定至少一個生物樣本中的每一個的管類型;
-其中,在接收到試驗單,所述試驗單指示一個或多個第一處理步驟的情況下,自動化樣本工作間自動對至少一個生物樣本執(zhí)行所述一個或多個第一處理步驟;以及
-其中,在未接收到所述試驗單的情況下,自動化樣本工作間根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來自動確定一個或多個第二處理步驟,并對至少一個生物樣本執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟。根據(jù)實施例,通過接收到至少一個生物樣本來觸發(fā)對第一請求的執(zhí)行。根據(jù)其他實施例,自動化樣本工作間還包括-運送單元,用于運送至少一個接收到的生物樣本;
-緩沖站;以及 -至少一個實驗室設備;
-其中,所述M模塊在第一請求中或者在第一和至少一個第二請求中自動請求針對至少一個生物樣本的試驗單;
-其中,在未響應于第一或至少一個第二請求中的任一個接收到所述至少一個生物樣本的試驗單的情況下,運送單元將所述至少一個生物樣本運送至緩沖站;
-其中,在響應于至少一個第二請求接收到所述至少一個生物樣本的試驗單的情況下,運送單元可操作用于從緩沖站卸載所述至少一個生物樣本,并將至少一個生物樣本運 送至至少一個實驗室設備,以自動對所述至少一個生物樣本執(zhí)行一個或多個突出的處理步驟,所述一個或多個突出的處理步驟是屬于一個或多個第一處理步驟但未在響應于至少一個第二請求接收到試驗單的時刻作為第二處理步驟而執(zhí)行的處理步驟。根據(jù)其他實施例,自動化樣本工作間以操作方式耦合至數(shù)據(jù)源,所述數(shù)據(jù)源已經(jīng)存儲第一和第二映射,第一映射將程序分配給試驗單,第二映射將程序分配給管類型。根據(jù)還一些其他實施例,自動化樣本工作間還包括用于對一個或多個樣本進行照明的光源,并且管類型檢測器包括用于捕獲一個或多個樣本的至少一個圖像的數(shù)字攝像機。盡管先前在血液樣本分析的上下文中描述了本發(fā)明的原理,但是所述實施例僅用于示意本發(fā)明的原理和應用。因此,應當理解,可以關于要處理的生物樣本的類型(尿液、唾液、腦脊液等)、關于自動化樣本工作間的實驗室設備要執(zhí)行的處理步驟以及關于被評估用于確定第一和第二處理步驟的試驗單和管類型進行許多修改。
以下,僅參照附圖,通過示例更詳細地解釋本發(fā)明的實施例,在附圖中
圖I是自動化樣本工作間的框 圖2是用于操作自動化樣本工作間的方法的流程 圖3示意了三種不同類型的樣本的處理;
圖4描繪了預分析樣本工作間;
圖5描繪了與兩個分析系統(tǒng)和后分析樣本工作間相結(jié)合的預分析樣本工作間;
圖6a描繪了根據(jù)接收到的試驗單對指定一個或多個第一處理步驟的計算機實施指令的選擇;以及
圖6b描繪了根據(jù)管類型對指定一個或多個第二處理步驟的計算機實施指令的選擇。
具體實施例方式圖I是根據(jù)本發(fā)明的一個實施例的樣本工作間102的框圖。自動化樣本工作間102包括樣本輸入站108 ;至少一個離心機116、117 ;處于樣本輸送機的形式的運送單兀118,其用于自動將生物樣本125至130從樣本輸入站108運送至離心機116、117之一或其他樣本處理單元119至121中的任一個(例如,等分站119或開蓋/重新封蓋站121)。運送單元還可以將生物樣本運送至樣本緩沖站120,或從所述緩沖站卸載所述樣本。根據(jù)所描繪的實施例,運送單元可操作用于在已對所述樣本執(zhí)行一個或多個預分析處理步驟之后將至少一個接收到的生物樣本轉(zhuǎn)發(fā)至一個或多個分析系統(tǒng)134、131以及還轉(zhuǎn)發(fā)至后分析樣本工作間 132。利用對所述樣本來說或?qū)钠涞玫綐颖镜奶囟ɑ颊邅碚f特定的標簽來對每個樣本加標簽。此外,樣本可能已附著用于標識管類型的管類型標簽(未示出)??梢允褂眠@種管類型標簽來代替用于確定管的類型的復雜圖像識別單元。根據(jù)所述實施例,管類型不是通過評估其顏色或尺寸來確定的,而是通過從管類型標簽讀取管類型ID來確定的。管類型由管類型檢測器110檢測,例如,所述管類型檢測器110可以是與圖像分析設備相結(jié)合的攝像機,所述圖像分析設備可操作用于通過分析例如管蓋或管的顏色和/或形狀來確定管類型。管類型檢測器110同樣可以是RFID標簽閱讀器或者2D或3D代碼閱讀器。圖I所描繪的工作間102還包括計算機可讀存儲介質(zhì)115,在該計算機可讀存儲介質(zhì)115中已存儲了可根據(jù)接收到的試驗單和/或根據(jù)樣本管的管類型122至124而選擇的計算機可解釋指令112至114。所選擇的計算機實施指令的集合相應地指定了一個或多個第一或第二處理步驟。 儀器管理器(頂)模塊111是軟件、硬件或固件模塊,根據(jù)實施例,其可以是經(jīng)由網(wǎng)絡103連接至自動化樣本工作間102的實驗室中間件或LIS 101或樣本工作間的組成部分。頂模塊可操作用于評估接收到的試驗單和檢測到的管類型,以便確定要對至少一個生物樣本執(zhí)行的第一或第二處理步驟。頂模塊還可操作用于協(xié)調(diào)和控制一個或多個實驗室設備116至121 (包括運送單元),其對生物樣本執(zhí)行一個或多個第一或第二處理步驟。根據(jù)圖1,樣本管類型122至124由樣本蓋的特定影線指示。圖2描繪了用于操作自動化樣本工作間102的方法的流程圖。在第一步驟中,自動化樣本工作間的樣本輸入站108接收一個或多個生物樣本125至130。被加載至樣本工作間中的樣本管可以包含在不同類型的樣本管中??梢愿髯缘鼗蛑鸺艿?rackwise)將樣本加載至樣本輸入站中。在已接收到至少一個生物樣本時,自動化樣本工作間嘗試202接收針對至少一個生物樣本的試驗單。該步驟可以包括通過頂模塊將第一請求提交至LIS或中間件組件。提交第一請求還可以基于對數(shù)據(jù)存儲介質(zhì)107執(zhí)行讀取操作,一旦已經(jīng)指定試驗單并將其分配給特定生物樣本,就將所述試驗單存儲至數(shù)據(jù)存儲介質(zhì)107。在判定步驟203中,IM模塊確定是否接收到所請求的試驗單。在響應于第一請求針對至少一個生物樣本接收到所請求的試驗單的情況下,樣本工作間在步驟204中自動對至少一個生物樣本執(zhí)行一個或多個第一處理步驟。該一個或多個第一處理步驟可以是通過以下操作來確定的評估接收到的試驗單,并確定針對在針對所述樣本的所述試驗單中請求的分析試驗制備生物樣本所必需的一個或多個第一處理步驟。在未接收到試驗單的情況下,在步驟205中,根據(jù)包含至少一個生物樣本的樣本管的管類型來確定一個或多個第二處理步驟。根據(jù)一些實施例,每當將樣本加載至樣本工作間中時,管類型檢測器110都會自動確定管類型。根據(jù)其他實施例,僅在步驟203中確定了未響應于第一請求接收到試驗單的情況下,所述檢測器110才確定管類型。在已確定一個或多個第二處理步驟之后,由自動化樣本工作間的一個或多個實驗室設備/單元自動對至少一個生物樣本執(zhí)行所述第二處理步驟。圖3描繪了將樣本分組為三個不同樣本組。在相應地針對樣本接收到試驗單的情況下,該分組是基于試驗單的。在未接收到試驗單的情況下,該分組是基于管類型的。在處理步驟302中,對多個接收到的生物樣本進行分組,并且運送單元118將這些組轉(zhuǎn)發(fā)至工作間的不同實驗室設備。例如,血清/尿液樣本管中包含的所有生物樣本將由以下第二處理步驟處理用于從全血獲得血清的離心機116中的離心法306 ;開蓋/重新封蓋站121中的開蓋307 ;等分站119中的等分308 ;以及第二分類步驟309,用于根據(jù)要對一個或多個樣本執(zhí)行的分析試驗312至318來對該一個或多個樣本進行分組,并用于自動將所有樣本運送至對應的分析系統(tǒng)131。利用點線邊界來描繪處理步驟308和309,這是由于僅在接收到試驗單的情況下,才可以執(zhí)行所述處理步驟,而不是僅在已知樣本的管類型的情況下才可以執(zhí)行。然而,即使在未接收到試驗單的情況下,也可以根據(jù)樣本管 來執(zhí)行步驟306和307。對應地,即使未針對所述樣本接收到試驗單,也可以對血漿管中的全血液樣本執(zhí)行步驟310和311。在步驟310中,在開蓋/重新封蓋站121中對血漿樣本304進行開蓋,并且在離心機117中對所述血漿樣本304進行離心311用于從全血獲得血漿。在另一步驟中,倘若響應于第一或第二請求接收到試驗單,該試驗單請求凝結(jié)試驗,則將樣本轉(zhuǎn)發(fā)至分析系統(tǒng)134以執(zhí)行所請求的凝結(jié)試驗319。在最終步驟中,可以將分析后的生物樣本轉(zhuǎn)發(fā)至用于存儲生物樣本以供進一步分析的檔案庫存儲器或者轉(zhuǎn)發(fā)至用于處置樣本的廢物單元321。不對EDTA樣本305進行離心,而是由運送單元118將EDTA樣本305集體轉(zhuǎn)發(fā)至輸出緩沖器??梢允謩踊蜃詣拥貜乃鲚敵鼍彌_器轉(zhuǎn)發(fā)EDTA樣本以用于執(zhí)行血液學試驗320。圖4描繪了包括多個處理實驗室設備或“單元”401至409的預分析自動化樣本工作間410。每個單元負責對一個或多個生物樣本執(zhí)行一個或多個預分析處理步驟。每個單元通過充當運送單元的輸送機連接至至少一個其他單元。預分析自動化工作間的模塊化架構(gòu)是有利的,因為其允許根據(jù)特定實驗室的具體需要將單元自由組合。樣本工作間410直接或經(jīng)由網(wǎng)絡連接至計算機系統(tǒng)414。用戶可操作用于創(chuàng)建試驗單并將其分配給樣本工作間應經(jīng)由所述計算機系統(tǒng)414的圖形用戶界面(⑶I)處理的一個或多個樣本。此外,⑶I可以向用戶提供指示要對特定樣本執(zhí)行和/或已對特定樣本執(zhí)行的處理步驟的動態(tài)更新的狀態(tài)信息。單元401是樣本輸入站,其可操作用于緩沖已被加載至所述輸入站中的多個生物樣本。其包括條形碼閱讀器,用于通過讀取和評估附著至每個生物樣本的條形碼來標識生物樣本。根據(jù)一些實施例,樣本輸入站還包括用于基于所分配的試驗單或基于樣本的輸入位置來確定接收到的樣本的STAT狀態(tài)的裝置(根據(jù)本發(fā)明的一些實施例,樣本輸入站包括用于STAT樣本和ROUTINE樣本的不同入口點),從而允許利用最高優(yōu)先級來處理STAT樣本。樣本輸入站還包括用于確定管的類型(例如,基于圖像分析)的管類型檢測器108。管類型檢測器可以是與可操作用于執(zhí)行圖像分析以確定管類型的軟件模塊相結(jié)合的攝像機。根據(jù)一些實施例,所述圖像分析模塊還可以是頂模塊的一部分。光源提供了對樣本的充分照明。單元402包括離心機,該離心機可以是根據(jù)試驗單或者在沒有試驗單可用的情況下根據(jù)接收到的生物樣本的管類型來編程的??梢酝ㄟ^將自動化樣本工作間410的所有單元彼此連接的運送單元自動將一個或多個生物樣本加載至離心機并從離心機卸載所述一個或多個生物樣本。單兀403是可對多種管類型(例如,Hemogard、Venosafe、Monovette、Kabe和Kima)的管進行開蓋的開蓋模塊。單元404是等分器模塊,其可操作用于針對多種不同分析儀系統(tǒng)對生物樣本進行等分。單元405是樣本分類器模塊,其可操作用于根據(jù)其分配的試驗單和/或根據(jù)樣本包含于其中的管類型來對多個樣本進行分組。然后,運送單元將分類后的樣本組轉(zhuǎn)發(fā)至不同的分析系統(tǒng)和/或后分析樣本工作間。單元406包括條形碼標簽器,該條形碼標簽器可操作用于利用計算機可讀和/或人類可讀數(shù)據(jù)來對生物樣本加標簽。單元408是重新封蓋模塊,其可操作用于對多個不同管類型進行封蓋和/或重新封蓋。單元409是輸出樣本緩沖器,其可操作用于緩沖已被處理且準備好用于存儲和/或處置的多個樣本。圖5描繪了預分析自動化樣本工作間410、兩個分析系統(tǒng)411、412和一個后分析樣本工作間413的組合。這些分析系統(tǒng)是分別包括一系列分析單元Al至A5和A1、A2、A3、A7、A8的多模塊分析系統(tǒng)。每個分析單元Al至AS可操作用于對一個或多個生物樣本執(zhí)行 特定集合的分析試驗。在已分析一個或多個分析單元Al至A8中的至少一個生物樣本的一個或多個等分試樣之后,可以將樣本轉(zhuǎn)發(fā)至后分析樣本工作間以供長期存儲或處置。后分析樣本工作間413包括三個后分析實驗室設備POl至P03,例如,這三個后分析實驗室設備POl至P03可以是冷卻的存儲單元(例如冰箱或冷凍裝置)、廢物單元等。預分析樣本工作間410、分析系統(tǒng)411、412和后分析樣本工作間413經(jīng)由運送單元118 (例如輸送機帶)彼此連接。圖6a和6b描繪了其中已存儲多個程序Pl至Pll的計算機可讀存儲介質(zhì)115。每個程序是指定由自動化樣本工作間410的一個特定實驗室設備401、……、409可物理地對一個或多個生物樣本執(zhí)行的特定處理步驟的計算機可解釋指令的集合。存儲介質(zhì)115還包括第一映射603,該第一映射603將每個程序P1、……、Pll映射至一個或多個試驗單01、……、0n。存儲介質(zhì)還包括第二映射604,該第二映射604將每個程序P1、……、Pll映射至一個或多個管類型Tl、……、Tm。符號n和m分別表示大于I的整數(shù)。在如圖6a所描繪的那樣由自動化樣本工作間針對特定生物樣本接收到試驗單01104的情況下,IM模塊根據(jù)接收到的試驗單01來選擇一個或多個程序P2、P3、P5至P7、P9,從而指定一個或多個第一處理步驟。在自動化樣本工作間未針對特定生物樣本接收到試驗單01 104的情況下,IM模塊根據(jù)所述生物樣本的管類型122 T4來選擇一個或多個程序P2、P3、P5、P7,從而指定一個或多個第二處理步驟。在圖6b中描繪了后一種情況。頂模塊控制并監(jiān)視由自動化樣本工作間對一個或多個第一或第二處理步驟的執(zhí)行。附錄 表I :管類型
權(quán)利要求
1.一種用于操作用來處理一個或多個生物樣本(125-130)的自動化樣本工作間(102、410,301)的方法,該工作間包括樣本輸入站(108、401),所述方法包括 -通過所述樣本輸入站來接收(201)所述一個或多個生物樣本,每個樣本被包含在樣本管中,每個樣本管具有管類型(122-124); -在針對所述生物樣本中的至少一個接收到試驗單(104),所述試驗單指示一個或多個第一處理步驟的情況下,對所述自動化樣本工作間進行操作(204)以自動對所述至少一個生物樣本執(zhí)行所述一個或多個第一處理步驟;以及 -在未接收到所述試驗單的情況下,根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來確定(205) —個或多個第二處理步驟,并對所述至少一個生物樣本執(zhí)行(206)所述一個或多個第二處理步驟。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法,其中,所述自動化樣本工作間包括一個或多個實驗室設備(116-117、119、121、402-409 ),所述方法還包括以下步驟 -訪問多個第一程序(P1-P9),每個第一程序是計算機可解釋指令的集合,每個程序指定所述一個或多個實驗室設備之一能夠?qū)λ鲋辽僖粋€生物樣本執(zhí)行的一個或多個候選處理步驟; -其中,在接收到被分配給所述至少一個生物樣本的試驗單的情況下,根據(jù)所述接收到的試驗單從多個第一程序選擇一個或多個第二程序,所述一個或多個第二程序指定所述一個或多個第一處理步驟; -其中,在未接收到所述試驗單的情況下,根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來選擇所述一個或多個第二程序,所述一個或多個第二程序指定所述一個或多個第二處理步驟。
3.根據(jù)權(quán)利要求I至2中任一項所述的方法,其中,自動執(zhí)行一個第一請求或所述第一請求以及用于接收試驗單的至少一個第二請求,所述至少一個第二請求是在從包括以下各項的組選擇的時刻執(zhí)行的 -在已執(zhí)行第一請求后的預定義時間段之后; -在已執(zhí)行第一請求之后以及在執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟之一時;以及 -在已執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟之一之后,其中,所述一個或多個第二處理步驟包括處理步驟,其用于在已完成執(zhí)行所有其他第二處理步驟之后將所述至少一個生物樣本運送至緩沖站(120)。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其中,對所述第一請求的執(zhí)行是通過接收到所述至少一個生物樣本來觸發(fā)的。
5.根據(jù)權(quán)利要求I至4中任一項所述的方法, -其中,所述自動化樣本工作間包括至少一個離心機(115、117、402); -在接收到試驗單的情況下,所執(zhí)行的一個或多個第一處理步驟包括由所述至少一個離心機要執(zhí)行的至少一個離心步驟;以及 -在未接收到試驗單的情況下,所執(zhí)行的一個或多個第二處理步驟還包括所述至少一個離心步驟。
6.根據(jù)權(quán)利要求I至5中任一項所述的方法, -其中,所述自動化樣本工作間包括至少一個等分站(119、404);-其中,在接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第一處理步驟包括由所述至少一個等分站要對所述至少一個生物樣本執(zhí)行的至少一個等分步驟;以及 -其中,在未接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第二處理步驟不包括所述至少一個等分步驟。
7.根據(jù)權(quán)利要求I至6中任一項所述的方法, -其中,所述自動化樣本工作間包括至少一個開蓋和/或重新封蓋站(121、403、408); -其中,在接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第一處理步驟包括由所述至少一個開蓋和/或重新封蓋站要對所述至少一個生物樣本執(zhí)行的至少一個開蓋和/或重新封蓋步驟;以及 -其中,在未接收到試驗單的情況下,一個或多個所執(zhí)行的第二處理步驟包括所述至少一個開蓋和/或重新封蓋步驟。
8.根據(jù)權(quán)利要求4至7中任一項所述的方法, -其中,所述一個或多個第二處理步驟是所述一個或多個第一處理步驟的子集; -其中,未在樣本工作間接收到一個或多個樣本時接收到試驗單,并且,其中樣本工作間已完成執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟; -其中,所述方法還包括以下步驟在已完成執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟之后接收試驗單;確定一個或多個突出的處理步驟,所述一個或多個突出的處理步驟包括還未作為第二處理步驟而已經(jīng)執(zhí)行的所有第一處理步驟;通過所述自動化樣本工作間來執(zhí)行所述一個或多個突出的處理步驟。
9.根據(jù)權(quán)利要求4至8中任一項所述的自動化樣本工作間, -其中,未在樣本工作間接收到一個或多個樣本時接收到試驗單; -其中,所述方法還包括以下步驟在樣本工作間執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟或已完成執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟時,接收試驗單;將第二處理步驟與由接收到的試驗單指示的第一處理步驟進行比較;在所述比較返回所執(zhí)行的第二處理步驟中的一個或多個未由試驗單指示的結(jié)果的情況下,自動將所述至少一個樣本檢測為錯誤處理的樣本;提交指示錯誤處理的樣本的警告消息和/或?qū)⑺鲥e誤處理的樣本運送至緩沖單元以存儲或丟棄所述樣本。
10.根據(jù)權(quán)利要求4至9中任一項所述的方法,其中,重復地執(zhí)行所述至少一個第二請求。
11.根據(jù)權(quán)利要求I至10中任一項所述的方法,還包括確定所述至少一個生物樣本的管類型的步驟,其中,執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟包括以下步驟針對所確定的管類型檢索離心法程序;以及根據(jù)所述離心法程序執(zhí)行離心步驟。
12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法,其中,確定管類型的步驟僅在未接收到所述試驗單的情況下執(zhí)行。
13.根據(jù)權(quán)利要求I至12中任一項所述的方法,其中,至少一個接收到的生物樣本包括多個生物樣本,-其中,在針對所述多個生物樣本中的每個樣本接收到試驗單的情況下,在執(zhí)行所述一個或多個第一處理步驟之前,根據(jù)其相應接收到的試驗單來對所述多個生物樣本中的生物樣本進行分組,每個樣本組共享相同的相應接收到的試驗單;以及 -其中,在未針對所述多個生物樣本中的每一個接收到試驗單的情況下,在執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟之前,根據(jù)每個相應生物樣本的管類型來對所述多個生物樣本中的生物樣本進行分組,每個樣本組共享相同的相應管類型。
14.一種自動化樣本工作間(102、410、301),包括 -樣本輸入站,用于接收(201)至少一個生物樣本(125-130),每個生物樣本被包含在樣本管(122-124)中,每個樣本管具有管類型; -頂模塊(111),用于接收針對所述至少一個接收到的生物樣本的試驗單(104); -管類型檢測器(110),用于自動確定所述至少一個生物樣本中的每一個的管類型(122-124); -其中,在接收到試驗單,所述試驗單指示一個或多個第一處理步驟的情況下,所述自動化樣本工作間自動對所述至少一個生物樣本執(zhí)行所述一個或多個第一處理步驟;以及-其中,在未接收到所述試驗單的情況下,所述自動化樣本工作間根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來自動確定一個或多個第二處理步驟,并對所述至少一個生物樣本執(zhí)行所述一個或多個第二處理步驟。
15.根據(jù)權(quán)利要求14所述的自動化樣本工作間,還包括 -一個或多個實驗室設備(116-117、119、121、402-409); -緩沖站(120); -運送單元(118),用于運送所述至少一個接收到的生物樣本; -其中,所述M模塊在第一請求中或者在第一和至少一個第二請求中自動請求針對所述至少一個生物樣本的試驗單; -其中,在未響應于第一或至少一個第二請求接收到所述至少一個生物樣本的試驗單的情況下,運送單元將所述至少一個生物樣本運送至所述緩沖站; -其中,在響應于至少一個第二請求接收到所述至少一個生物樣本的試驗單的情況下,運送單元可操作用于從所述緩沖站卸載所述至少一個生物樣本,并將所述至少一個生物樣本運送至所述至少一個實驗室設備,用于自動對所述至少一個生物樣本執(zhí)行一個或多個突出的處理步驟,所述一個或多個突出的處理步驟是屬于所述一個或多個第一處理步驟但未在響應于至少一個第二請求而接收到試驗單時作為第二處理步驟而執(zhí)行的處理步驟。
全文摘要
本發(fā)明涉及用于操作自動化樣本工作間的方法。一種用于操作用來處理一個或多個生物樣本(125-130)的自動化樣本工作間(102、410、301)的方法,所述方法包括-接收(201)所述一個或多個生物樣本,每個樣本被包含在樣本管中,每個樣本管具有管類型(122-124);-在針對所述生物樣本中的至少一個接收到試驗單(104)、所述試驗單指示一個或多個第一處理步驟的情況下,對工作間進行操作(204)以自動執(zhí)行所述一個或多個第一處理步驟;以及-在未接收到所述試驗單的情況下,根據(jù)包含所述至少一個生物樣本的樣本管的管類型來確定(205)一個或多個第二處理步驟,并執(zhí)行(206)所述一個或多個第二處理步驟。
文檔編號G01N35/00GK102759630SQ20121012747
公開日2012年10月31日 申請日期2012年4月27日 優(yōu)先權(quán)日2011年4月29日
發(fā)明者A.克納費爾, F.富雷爾, J.赫希勒 申請人:霍夫曼-拉羅奇有限公司