本發(fā)明屬于環(huán)境安全監(jiān)測(cè)領(lǐng)域,具體涉及一種能快速篩選砷離子核酸適配體的方法以及在砷離子檢測(cè)中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
砷是一種有毒重金屬,對(duì)于動(dòng)植物有強(qiáng)烈的毒害作用,在土壤、和水中可不斷累積,造成嚴(yán)重污染。對(duì)于重金屬的檢測(cè),當(dāng)前已經(jīng)發(fā)展了多種檢測(cè)手段,如原子吸收光譜法、熒光法、電化學(xué)法、生物傳感器法等方法。目前砷的檢測(cè)方法有化學(xué)法與儀器法,化學(xué)法包括砷斑法、銀鹽法,由于化學(xué)法方法繁瑣、靈敏度不高,不適應(yīng)現(xiàn)代發(fā)展的需要;儀器法雖有較高的準(zhǔn)確性,但其所需儀器昂貴,且需要專業(yè)人員的操作,很難滿足現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)的需要。
核酸適配體是一種對(duì)靶標(biāo)分子具有高度特異性結(jié)合能力的功能核酸片段,已被廣泛應(yīng)用于重金屬、毒素分子等多種物質(zhì)的檢測(cè)。指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(selex)技術(shù)是篩選核酸適配體的一種主流技術(shù)。目前國(guó)際上基于該技術(shù)篩選了一條具有高度親和力的as3+適配體,然而篩選所需的核酸文庫(kù)巨大,篩選過(guò)程繁瑣,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,對(duì)操作人員有嚴(yán)格的技術(shù)要求。而所篩選的as3+適配體序列包含100個(gè)核苷酸,核苷酸鏈過(guò)長(zhǎng),合成成本較高,也影響載體表面的固定化,限制其在砷檢測(cè)中的應(yīng)用。因此,有必要發(fā)展一種簡(jiǎn)單快速的適配體篩選方法,對(duì)砷離子的適配體進(jìn)行進(jìn)一步的篩選和優(yōu)化。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明為了解決上述問(wèn)題,目的在于提供一種簡(jiǎn)便、快速的適配體篩選方法,對(duì)砷離子的核酸適配體進(jìn)行快速優(yōu)化,以克服現(xiàn)有適配體篩選技術(shù)耗時(shí)長(zhǎng)、技術(shù)要求高的不足。
一種基于金納米粒子的比色法反應(yīng)體系,用于篩選最適合檢測(cè)砷離子的核酸適配體序列,其特征在于,包括:核酸序列;納米金溶液;以及氯化鈉溶液,其中,核酸序列為
as-40:ttacagaacaaccaacgtcgctccgggtacttcttcatcg,
as-40-2:ttacagaacaaccaacccgggtacttcttcatcg,
as-40-4:tagggagataccagc,
as-40-6:ttacagaacaaccggtacttcttcatcg。
本發(fā)明提供的篩選砷離子適配體的比色反應(yīng)體系,還可以具有這樣的特征,其特征在于:其中,核酸序列的濃度為0.01~1.00μmol/l。
本發(fā)明提供的篩選砷離子適配體的比色反應(yīng)體系,還可以具有這樣的特征,其特征在于:其中,納米金溶液的濃度為10~20nmol/l。
本發(fā)明提供的篩選砷離子適配體的比色反應(yīng)體系,還可以具有這樣的特征,其特征在于:其中,氯化鈉溶液的濃度為0.1~0.9mol/l。
本發(fā)明提供的比色法檢測(cè)砷離子的核酸序列反應(yīng)體系,還可以具有這樣的特征,其特征在于:其中,核酸序列為5’-ttacagaacaaccaacgtcgctccgggtacttcttcatcg-3’。
本發(fā)明提供的一種具有上述技術(shù)特征的篩選砷離子適配體的比色方法及利用所篩選適配體進(jìn)行砷離子濃度檢測(cè)的方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟一,在向納米金溶液中加入待篩選的核酸適配體溶液后混勻;
步驟二,將步驟一所得到的混合溶液和已知濃度的亞砷酸鈉溶液混勻,并孵育一段時(shí)間后得到混合溶液;
步驟三,將步驟二中的混合溶液和特定濃度的氯化鈉溶液混勻,室溫反應(yīng)5min,觀察樣品的顏色變化,拍照記錄,并測(cè)定混合后的溶液對(duì)特定波長(zhǎng)可見(jiàn)光的吸光度比值,得到砷離子濃度-吸光度比值標(biāo)準(zhǔn)曲線;
步驟四,將另外待篩選的核酸適配體溶液替換步驟二中的適配體溶液,重復(fù)步驟一、二、三,得到該適配體反應(yīng)體系中的顏色變化照片以及對(duì)應(yīng)的砷離子濃度-吸光度比值標(biāo)準(zhǔn)曲線;
步驟五,比較四種適配體反應(yīng)體系的顏色變化以及砷離子濃度-吸光度比值標(biāo)準(zhǔn)曲線,可獲得最適合檢測(cè)砷離子的適配體。
步驟六,將未知濃度的砷離子溶液替換步驟二中已知濃度的亞砷酸鈉溶液,重復(fù)步驟一、二、三,得到其在特定波長(zhǎng)可見(jiàn)光的吸光度比值,根據(jù)該適配體體系的砷離子濃度-吸光度比值標(biāo)準(zhǔn)曲線,可獲得待測(cè)溶液中的砷離子濃度。
本發(fā)明提供的適配體篩選方法,還可以具有這樣的特征,其特征在于:其中,步驟二和步驟三中混合的時(shí)間為5min,溫度為室溫25℃。
本發(fā)明提供的適配體篩選方法,還可以具有這樣的特征,其特征在于:其中,步驟三中的吸光度比值測(cè)定的波長(zhǎng)為650nm、520nm,吸光度比值為a650/a520。
本發(fā)明還提供具有上述的技術(shù)特征的比色法檢測(cè)砷離子的核酸序列反應(yīng)體系在檢測(cè)砷離子濃度中的應(yīng)用,其特征在于:其中,砷離子為水溶液中的正三價(jià)砷離子,其濃度為0.01-1.00mmol/l。
發(fā)明作用與效果
根據(jù)本發(fā)明所提供的篩選砷離子適配體的比色反應(yīng)體系,操作簡(jiǎn)單,輔助試劑:納米金、氯化鈉比較容易獲得,可通過(guò)裸眼判斷或者使用成本較低的分光光度計(jì)進(jìn)行測(cè)量,大大降低了適配體的篩選難度;本發(fā)明篩選獲得的適配體序列長(zhǎng)度靈活,避免了pcr擴(kuò)增引物的限制,有效縮短適配體序列長(zhǎng)度,降低適配體的合成成本,有利于固定化應(yīng)用。本發(fā)明提供的比色反應(yīng)體系還可以用于進(jìn)行砷離子的快速檢測(cè)。
附圖說(shuō)明
圖1為適配體as-40與不同濃度砷離子的反應(yīng)結(jié)果照片;
圖2為圖1的砷離子濃度-吸光度比值曲線;
圖3為適配體as-40-2與不同濃度砷離子的反應(yīng)結(jié)果照片;
圖4為圖3的砷離子濃度-吸光度比值曲線;
圖5為適配體as-40-4與不同濃度砷離子的反應(yīng)結(jié)果照片;
圖6為圖5的砷離子濃度-吸光度比值曲線;
圖7為適配體as-40-6與不同濃度砷離子的反應(yīng)結(jié)果照片;以及
圖8為圖7的砷離子濃度-吸光度比值曲線。
具體實(shí)施方式
為了使本發(fā)明實(shí)現(xiàn)的技術(shù)手段、創(chuàng)作特征、達(dá)成目的與功效易于明白了解,以下實(shí)施例結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明的砷離子核酸適配體的篩選反應(yīng)體系的具體實(shí)例作具體闡述。
實(shí)施例
本實(shí)施例所用的核酸序列是使用已知的經(jīng)典的亞磷酰胺三酯法進(jìn)行化學(xué)合成的。其序列如下所示:
as-40:ttacagaacaaccaacgtcgctccgggtacttcttcatcg,
as-40-2:ttacagaacaaccaacccgggtacttcttcatcg,
as-40-4:tagggagataccagc,
as-40-6:ttacagaacaaccggtacttcttcatcg。
1、標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)溶液的制備
稱取不同質(zhì)量的氯化鈉用雙蒸水配成不同濃度的氯化鈉溶液(0、0.1、0.3、0.5、0.7、0.9mol/l);合成的dna核酸序列(as-40、as-40-2、as-40-4、as-40-6)用雙蒸水稀釋成梯度濃度的適配體溶液(0、0.1、0.3、0.5、1μmol/l);稱取不同質(zhì)量的亞砷酸鈉用雙蒸水配成所需濃度的亞砷酸鈉溶液(0、0.01、0.05、0.1、0.5、1mmol/l)。
2、適配體as-40對(duì)不同濃度砷離子的檢測(cè)步驟
50μlaunps加入50μl濃度為0.1-1μm的適配體as-40溶液,混勻,室溫反應(yīng)5min;在其中加入50μl不同濃度的亞砷酸鈉溶液(0-1mmol/l),放置反應(yīng)5min;最后加入10μl0.7mol/l的氯化鈉溶液,使得溶液總體積為160μl,混勻,室溫放置5min。觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果顏色變化,拍照記錄結(jié)果(圖1),并使用紫外可見(jiàn)光分光光度計(jì)測(cè)量特定波長(zhǎng)的吸光度,計(jì)算波長(zhǎng)為650nm和520nm的吸光度比值a650/a520,得到砷離子濃度-吸光度比值標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖2)。
3、適配體的篩選
將其它待篩選的適配體as-40-2,as-40-4和as-40-6分別替換實(shí)施例2中的適配體as-40,所得實(shí)驗(yàn)結(jié)果依次如圖3-8所示。經(jīng)過(guò)對(duì)比,得知適配體as-40的檢測(cè)效果最佳。
4、砷離子的檢測(cè)
50μl未知濃度的砷離子溶液(在0.1–0.5mmol/l范圍內(nèi))代替實(shí)施例2中已知濃度的亞砷酸鈉溶液,所得實(shí)驗(yàn)結(jié)果與對(duì)應(yīng)適配體的標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比對(duì),得知所檢測(cè)的砷離子濃度。
實(shí)施例的作用和有益效果
根據(jù)本實(shí)施例所提供的比色法篩選砷離子適配體的反應(yīng)體系,篩選過(guò)程操作簡(jiǎn)單,篩選速度快,避免了pcr擴(kuò)增,可以篩選較短的核酸序列,降低了適配體的合成成本,擴(kuò)展了砷適配體的固定化應(yīng)用;而且輔助試劑:納米金、氯化鈉也比較容易獲得;另外本實(shí)施例提供的比色反應(yīng)體系還可以用于檢測(cè)砷離子,通過(guò)成本較低的分光光度計(jì)就可以測(cè)量,檢測(cè)成本較低,適合快速檢測(cè)。
本實(shí)施例中,砷離子為水溶液中的正三價(jià)砷離子(亞砷酸鈉),其濃度為為0.01-1.00mmol/l。