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      一種基于自適應(yīng)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)增廣的醫(yī)學(xué)影像域泛化分割方法

      文檔序號(hào):39608439發(fā)布日期:2024-10-11 13:17閱讀:103來源:國知局
      一種基于自適應(yīng)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)增廣的醫(yī)學(xué)影像域泛化分割方法

      本發(fā)明屬于醫(yī)學(xué)影像處理,特別是涉及一種基于自適應(yīng)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)增廣的醫(yī)學(xué)影像域泛化分割方法。


      背景技術(shù):

      1、深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)是一種基于數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方法,它在近年來得到了快速的發(fā)展,為了提取樣本特征、減少過擬合、優(yōu)化模型泛化性能,增加數(shù)據(jù)集多樣性是至關(guān)重要的。在醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域,圖像分割是一項(xiàng)關(guān)鍵任務(wù),用于定位和分離感興趣的結(jié)構(gòu)或病變。然而由于不同的成像設(shè)備、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、采集協(xié)議、病人群體等因素,醫(yī)學(xué)影像之間存在著顯著的領(lǐng)域差異,這導(dǎo)致了一個(gè)挑戰(zhàn)性的問題:如何讓一個(gè)在某個(gè)數(shù)據(jù)域(如某個(gè)醫(yī)院或模態(tài))上訓(xùn)練的分割模型,能夠在另一個(gè)數(shù)據(jù)域(如另一個(gè)醫(yī)院或模態(tài))上保持良好的泛化性能。

      2、醫(yī)學(xué)影像通常包含復(fù)雜的組織結(jié)構(gòu)和病理信息,且數(shù)據(jù)集的標(biāo)注和驗(yàn)證往往需要專業(yè)的醫(yī)學(xué)知識(shí)和經(jīng)驗(yàn),因此獲取成本和難度較高。此外,由于醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)涉及患者的個(gè)人隱私和敏感信息,在數(shù)據(jù)收集中受到嚴(yán)格的法律保護(hù),導(dǎo)致數(shù)據(jù)集規(guī)模有限。而醫(yī)學(xué)影像樣本之間的巨大差異及空間獨(dú)特性決定了自然圖像采用的增廣策略無法直接轉(zhuǎn)移到醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,使得面向醫(yī)學(xué)影像域泛化分割的自動(dòng)數(shù)據(jù)增廣技術(shù)成為當(dāng)前的一大研究熱點(diǎn)和難點(diǎn)。

      3、數(shù)據(jù)增廣是一種擴(kuò)充數(shù)據(jù)規(guī)模的常用技術(shù),它在深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用,有效地解決了訓(xùn)練樣本不足的問題。傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)增廣方法通常是手工設(shè)計(jì)的,通過對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行隨機(jī)變換,生成新的數(shù)據(jù)樣本來擴(kuò)充數(shù)據(jù)集。但是這種方法需要根據(jù)不同的數(shù)據(jù)域和任務(wù)手動(dòng)調(diào)整和優(yōu)化參數(shù),不僅耗費(fèi)人力和時(shí)間,且難以覆蓋所有可能的領(lǐng)域差異。因此,如何針對醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集的特點(diǎn)開發(fā)一種自動(dòng)數(shù)據(jù)增廣技術(shù),自動(dòng)地生成適合不同數(shù)據(jù)域和任務(wù)的數(shù)據(jù)增廣策略以提高模型的泛化性能和魯棒性,是一個(gè)具有研究價(jià)值和實(shí)際意義的問題。


      技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

      1、針對以上技術(shù)問題,本發(fā)明提供一種基于自適應(yīng)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)增廣的醫(yī)學(xué)影像域泛化分割方法。

      2、本發(fā)明解決其技術(shù)問題采用的技術(shù)方案是:

      3、一種基于自適應(yīng)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)增廣的醫(yī)學(xué)影像域泛化分割方法,所述方法包括以下步驟:

      4、s100:構(gòu)建不同源域醫(yī)學(xué)影像樣本庫,并按不同源域劃分?jǐn)?shù)據(jù)集;

      5、s200:針對醫(yī)學(xué)影像的特點(diǎn)構(gòu)建數(shù)據(jù)增廣策略搜索模型并初始化參數(shù);

      6、s300:利用伯努利分布和范疇分布分別對數(shù)據(jù)增廣策略搜索模型的兩個(gè)搜索空間的增廣操作和子策略進(jìn)行采樣,得到采樣子策略;

      7、s400:將獲取的采樣子策略應(yīng)用到數(shù)據(jù)集上進(jìn)行增廣,搭建分割模型和域預(yù)測器,將增廣后的數(shù)據(jù)集輸入到分割模型中進(jìn)行訓(xùn)練,通過域預(yù)測器進(jìn)行預(yù)測;

      8、s500:基于預(yù)設(shè)的損失函數(shù),利用交替微分和熵正則化最優(yōu)傳輸理論對增廣策略搜索模型進(jìn)行優(yōu)化,利用最小化交叉熵?fù)p失對域預(yù)測器進(jìn)行優(yōu)化,將滿足三重聯(lián)合優(yōu)化的策略作為最優(yōu)增廣策略;

      9、s600:將優(yōu)化后的最優(yōu)增廣策略應(yīng)用到分割模型中獲得最終的醫(yī)學(xué)影像分割結(jié)果。

      10、優(yōu)選地,s200包括:

      11、s210:搜索空間構(gòu)建:選擇albumentations數(shù)據(jù)增廣庫構(gòu)造像素級(jí)增強(qiáng)空間ks和空間級(jí)增強(qiáng)空間kp,2個(gè)搜索空間分別包含10個(gè)增廣操作,像素級(jí)增強(qiáng)空間包括亮度調(diào)節(jié)、對比度增強(qiáng)、自適應(yīng)對比度變換、色調(diào)變換、銳化、高斯模糊、高斯噪聲、均衡化、顏色變化、曝光,空間級(jí)增強(qiáng)空間包括旋轉(zhuǎn)、水平翻轉(zhuǎn)、垂直翻轉(zhuǎn)、縮放、水平平移、垂直平移、水平剪裁、垂直剪裁、隨機(jī)剪裁、cutout;

      12、s220:參數(shù)初始化:假設(shè)是否應(yīng)用該操作的概率值為p,應(yīng)用該操作的幅值為h,則對于一張輸入圖片x,增廣操作后的公式如(1)所示:

      13、

      14、其中o(x;h)表示輸入圖片x采取幅值為h的增廣操作;

      15、每個(gè)子策略s可用以下公式表示:

      16、

      17、搜索空間由兩個(gè)策略子空間組成,1個(gè)策略包含n個(gè)子策略,1個(gè)子策略s包含2i個(gè)先后被應(yīng)用的增廣操作,實(shí)驗(yàn)時(shí)需要在ks和kp兩個(gè)策略子空間中各采樣i個(gè)操作。為了提高搜索效率,將每個(gè)操作的大小設(shè)置在一個(gè)連續(xù)的范圍內(nèi),并將其離散成l個(gè)均勻間隔,將搜索空間擴(kuò)充到(10×l)n×2i種可能性。

      18、優(yōu)選地,s300包括:

      19、s310:增廣操作采樣:利用伯努利分布對增廣操作進(jìn)行采樣,公式如下:

      20、o(x;h)=b0(x;h)+(1-b)x???(3)

      21、s320:子策略采樣:利用范疇分布對子策略進(jìn)行采樣,公式如下:

      22、

      23、其中,b是一個(gè)伯努利參數(shù),b~bernoulli(β),n=1,…n,πn是該子策略被應(yīng)用的概率值,c作為一個(gè)中間變量服從基于π的范疇分布,αn表示第n個(gè)子策略被應(yīng)用的概率,δ為數(shù)據(jù)增廣策略搜索空間;

      24、s330:操作采樣看作是服從參數(shù)β的伯努利分布,子策略采樣看作是服從參數(shù)π的范疇分布,并利用softmax函數(shù)選取每個(gè)子策略被采樣的概率值α,然后對α歸一化處理,將α最高的子策略概率值設(shè)置為1,其余設(shè)置為0,最后將重新設(shè)置后的α值進(jìn)行子策略綜合,選取出最終的子策略組合,公式(5)可表示為:

      25、

      26、其中s(x)為輸入圖片應(yīng)用的子策略,cn=one_hot(argmaxn(αn)),cn為one_hot向量計(jì)算得到的值,one_hot為一種編碼,用于將分類變量、轉(zhuǎn)換為向量形式。

      27、優(yōu)選地,s500包括:

      28、s510:自動(dòng)數(shù)據(jù)增廣問題的優(yōu)化目標(biāo)是找到適應(yīng)數(shù)據(jù)集的最優(yōu)策略參數(shù),分割模型采用deeplabv3分割模型,主干網(wǎng)絡(luò)為mobilenetv2,每訓(xùn)練一個(gè)epoch,計(jì)算對應(yīng)的驗(yàn)證損失lval,進(jìn)一步計(jì)算出移動(dòng)平均損失la;

      29、s520:當(dāng)移動(dòng)平均損失最小時(shí),記錄下對應(yīng)時(shí)刻的策略參數(shù)和分割模型的權(quán)值,引入解耦交替微分的迭代算法對優(yōu)化層進(jìn)行隱式微分,利用交替方向乘子法的思路,將原始問題轉(zhuǎn)化為一個(gè)等價(jià)的增廣拉格朗日問題,計(jì)算出前向傳播的解的同時(shí)計(jì)算反向傳播的網(wǎng)絡(luò)梯度;

      30、s530:為了對搜索空間中產(chǎn)生的策略組合進(jìn)行選擇,最大化增強(qiáng)的新領(lǐng)域之間的多樣性,引入最優(yōu)傳輸理論,利用熵正則化平滑算法,解決非凸優(yōu)化問題;

      31、s540:將域預(yù)測器模型中的編碼器特征映射作為輸入,與gap聚合,并將所有尺度的聚合特征連接成一個(gè)向量,輸送到域解碼器模塊提取特定域的特征,得到對應(yīng)的域碼;

      32、s550:通過最小化交叉熵?fù)p失對域預(yù)測器進(jìn)行優(yōu)化;

      33、s560:重復(fù)s510至s550預(yù)設(shè)次數(shù),將滿足三重聯(lián)合優(yōu)化的策略作為最優(yōu)增廣策略。

      34、優(yōu)選地,s510中每訓(xùn)練一個(gè)epoch,計(jì)算對應(yīng)的驗(yàn)證損失lval,進(jìn)一步計(jì)算出移動(dòng)平均損失la,具體為:

      35、

      36、其中,r是一個(gè)隨機(jī)參數(shù),用于控制當(dāng)前驗(yàn)證損失的比例,r∈[0,1],lval為驗(yàn)證損失,la為移動(dòng)平均損失。

      37、優(yōu)選地,s520具體為:

      38、

      39、其中,ω1為分割模型的權(quán)值,z是一個(gè)關(guān)于ω1的輔助變量,z∈[0,1],u是一個(gè)關(guān)于ω1的對偶變量,q是對φ的一種約束定義,使用交替最小化的方法,對φ(·)進(jìn)行優(yōu)化,其中φ(·)是策略搜索模型控制器的函數(shù),得到前向傳播的解:

      40、

      41、使用隱式函數(shù)定理,分別對φ和z進(jìn)行微分,得到反向傳播的梯度,即和

      42、優(yōu)選地,s530具體為:

      43、

      44、其中m代表軟匹配矩陣,v代表余弦距離矩陣,d為sinkhorn算子計(jì)算出來的最遠(yuǎn)傳輸距離,pi和pj分別表示第i個(gè)和第j個(gè)域,inf表示尋找最優(yōu)傳輸距離使傳輸成本最小的約束,tr表示矩陣對角線元素之和,為所有滿足邊際約束條件的傳輸計(jì)劃矩陣的集合;

      45、

      46、其中,fn1和fn2是不同的最終策略組合,d是熵正則化最優(yōu)傳輸距離,ld為衡量不同域之間分布差異的損失函數(shù),k表示不同域的數(shù)據(jù)集的總和,xi和xj為實(shí)際中來自不同源域的小批量采樣。

      47、優(yōu)選地,域預(yù)測器模型包括編碼器和域解碼器模塊,域解碼器模塊包括2個(gè)全連接層fc(·)和一個(gè)域softmax層sm(·),s540中域碼計(jì)算形式表示為:

      48、

      49、這里在deeplabv3的主干網(wǎng)絡(luò)后面引入一個(gè)域自適應(yīng)動(dòng)態(tài)卷積,由一個(gè)傳統(tǒng)卷積層和一個(gè)動(dòng)態(tài)卷積層組成,傳統(tǒng)卷積層輸入特征映射通道和動(dòng)態(tài)卷積層輸出通道均為a,動(dòng)態(tài)層共有a2+a個(gè)參數(shù),通過域自適應(yīng)動(dòng)態(tài)卷積的域感知控制器φf生成域預(yù)測器權(quán)重ω2=φf(dp),θ代表每個(gè)fc的參數(shù),fe為編碼器特征映射,p為編碼器的總數(shù)。

      50、優(yōu)選地,s550具體為:

      51、lf(x,z)=-clog(f(x,ω2))???(12)

      52、maxld,s.t.ω2*=argminω2lf???(13)

      53、

      54、其中為增廣策略搜索模型的策略控制器,ω3為策略控制器的權(quán)重參數(shù),利用ld更新參數(shù)值,為梯度計(jì)算。

      55、優(yōu)選地,s560具體為:

      56、minω1,ω2maxf(la+lf+ld)???(15)

      57、假設(shè)策略搜索模型的更新次數(shù)為e,則最終搜索空間的大小為(10×l)n×2i×e,lf為域預(yù)測模型的損失函數(shù)。

      58、上述一種基于自適應(yīng)動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù)增廣的醫(yī)學(xué)影像域泛化分割方法,通過設(shè)計(jì)一個(gè)針對醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)集特點(diǎn)的搜索空間,利用一定算法自動(dòng)搜索和應(yīng)用最優(yōu)的數(shù)據(jù)變換策略,調(diào)整對應(yīng)超參數(shù),從而增加數(shù)據(jù)樣本多樣性,減少過擬合的風(fēng)險(xiǎn),提高模型對新領(lǐng)域或新場景下醫(yī)學(xué)影像分割任務(wù)的泛化性能。

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