基于圖割的肺4d?ct多相位腫瘤聯(lián)合分割方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了基于圖割的肺4D?CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法,該分割方法包括步驟:(1)讀取肺4D?CT圖像,該圖像由多幅不同相位的肺3D?CT圖像組成;(2)標記初始相位3D?CT圖像上目標種子點和背景種子點,初始相位3D?CT圖像是指多幅不同相位的肺3D?CT圖像中第一幅3D?CT圖像;(3)利用步驟(2)得到的目標種子點和背景種子點,獲得腫瘤分割結(jié)果。該方法不僅分割準確性高,而且自動化程度高。
【專利說明】
基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法
技術(shù)領(lǐng)域
[0001] 本發(fā)明涉及醫(yī)學圖像處理技術(shù)領(lǐng)域,具體是指一基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤 聯(lián)合分割方法,其中利用了肺4D-CT相位之間的信息。
【背景技術(shù)】
[0002] 4D-CT在傳統(tǒng)3D-CT的基礎(chǔ)上加入了時間軸,動態(tài)采集患者呼吸時的CT圖像,而后 通過圖像重建和重新排序得到患者在不同呼吸相位的3D-CT圖像。4D-CT不僅能夠明顯消除 呼吸運動偽影,而且能夠真實準確地反映肺隨呼吸運動的變化規(guī)律,為實現(xiàn)個體化精確放 療奠定了有力基礎(chǔ)。
[0003] 精確放療的關(guān)鍵在于靶區(qū)的準確定位,靶區(qū)的精度會直接影響最終的放療結(jié)果, 確定靶區(qū)可以采用圖像分割技術(shù)。然而,目前肺4D-CT腫瘤分割存在著兩大主要問題:其一, 4D-CT生成的圖像數(shù)量巨大,通常有1000到2000張,甚至更多,如果僅靠放療科醫(yī)生手工分 割每幅圖像中的腫瘤來獲得靶區(qū),顯然費時費力,也不現(xiàn)實;其二,肺腫瘤經(jīng)常與周圍肺壁、 膈肌、血管等正常器官組織發(fā)生黏連,若采用區(qū)域生長、邊緣提取等自動分割技術(shù),誤分割 的概率很大,直接影響靶區(qū)精度。因此,研究出一種自動化程度高,分割準確,魯棒性強的肺 腫瘤分割算法十分必要。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 本發(fā)明的目的在于提供一種基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法,該方 法不僅分割準確性高,而且自動化程度高。
[0005] 本發(fā)明的目的可通過下述技術(shù)措施來實現(xiàn):基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合 分割方法,其特征在于,該分割方法包括以下步驟:
[0006] (1)讀取肺4D-CT圖像,該圖像由多幅不同相位的肺3D-CT圖像組成;
[0007] (2)標記初始相位3D-CT圖像上目標種子點和背景種子點,初始相位3D-CT圖像是 指多幅不同相位的肺3D-CT圖像中第一幅3D-CT圖像;
[0008] (3)利用步驟(2)得到的目標種子點和背景種子點,獲得腫瘤分割結(jié)果。
[0009] 本發(fā)明中,所述步驟(3)采用結(jié)合肺4D-CT相位間信息的圖割算法分割腫瘤,具體 包括:
[0010] (3.1)將步驟⑵得到的目標種子點記作0,背景種子點記作B;
[0011] (3.2)將肺4D-CT圖像映射成網(wǎng)絡(luò)圖,圖像中的像素點對應(yīng)圖中的節(jié)點,并添加兩 個額外的頂點,一個為源點S,一個為匯點T,圖像中相鄰像素點p和q之間的關(guān)系對應(yīng)圖中節(jié) 點之間的邊;
[0012] (3.3)給圖中每一條邊賦予權(quán)值,設(shè)定權(quán)值的原則為:像素間的差異越小則權(quán)值越 大,像素間差異越大則權(quán)值越小,具體如下:
[0013] 若戶萑0 運0W S,則p和q之間的邊權(quán)值記為B{P,q};若p G P,/?運0 ,則 P和s之間的邊權(quán)值記為λ · Rp( 〃bkg〃);若p e 〇,則p和s之間的邊權(quán)值記為K;若p e B,則p和s 之間的邊權(quán)值記為O;若P e P,P隹O u S,則P和t之間的邊權(quán)值記為λ · Rp(〃〇bj〃);若P G ο, 則p和t之間的邊權(quán)值記為O;若p e B,則p和t之間的邊權(quán)值記為K;
[0014] 其中:
[0015]
[0016]
[0017]
[0018]
[0019]
[0020]
[0021]
[0022]
[0023]
[0024]
[0025]
[0026] (3.5)求解得到ε的最小值,對應(yīng)于肺4D-CT圖像的最終腫瘤分割結(jié)果。
[0027] 和現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:
[0028] (1)本發(fā)明的分割通過式(5)利用了肺4D-CT圖像相位之間的信息,提高了分割精 度;
[0029] (2)本發(fā)明提出的方法只需醫(yī)生在初始相位上選取目標種子點和背景種子點,即 可獲得同一呼吸周期內(nèi)所有相位的腫瘤分割結(jié)果,達到了多相位腫瘤聯(lián)合分割的目的,提 高了算法的自動化程度。
【附圖說明】
[0030] 下面結(jié)合附圖和【具體實施方式】對本發(fā)明做進一步的詳細說明。
[0031] 圖1是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例一的框架圖; [0032]圖2是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例一中醫(yī)生選取 的目標種子點和背景種子點;
[0033]圖3是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例一中傳統(tǒng)圖割 算法和本發(fā)明分割結(jié)果的對比圖;從上至下分別為:冠狀面;矢狀面;橫斷面;從左至右分別 為:原始肺4D-CT圖像;本發(fā)明的分割結(jié)果;傳統(tǒng)圖割算法的分割結(jié)果;其中原始肺4D-CT圖 像中的輪廓線為醫(yī)生手工勾畫的結(jié)果,即金標準;
[0034]圖4是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例一中各相位傳 統(tǒng)圖割算法和本發(fā)明分割結(jié)果的ASSD對比圖;
[0035]圖5是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例一中各相位傳 統(tǒng)圖割算法和本發(fā)明分割結(jié)果的DSC對比圖;
[0036]圖6是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例二中醫(yī)生選取 的目標種子點和背景種子點;
[0037]圖7是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例二中傳統(tǒng)圖割 算法和本發(fā)明分割結(jié)果的對比圖;從上至下分別為:冠狀面;矢狀面;橫斷面;從左至右分別 為:原始肺4D-CT圖像;本發(fā)明的分割結(jié)果;傳統(tǒng)圖割算法的分割結(jié)果;其中原始肺4D-CT圖 像中的輪廓線為醫(yī)生手工勾畫的結(jié)果,即金標準;
[0038]圖8是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例二中各相位傳 統(tǒng)圖割算法和本發(fā)明分割結(jié)果的ASSD對比圖;
[0039] 圖9是本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法實施例二中各相位傳 統(tǒng)圖割算法和本發(fā)明分割結(jié)果的DSC對比圖。
【具體實施方式】
[0040] 實施例一
[0041] 本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法的實施例一,結(jié)合一套公共 可用的肺4D-CT數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集包含10個相位圖像,如圖1所示,該分割方法的具體步驟如 下:
[0042] (1)讀取肺4D-CT圖像,該圖像由10個不同相位的肺3D-CT圖像組成,各相位3D圖像 大小為320 X 224 X 86像素;
[0043] (2)標記初始相位3D-CT圖像上目標種子點和背景種子點,如圖2所示;
[0044] (3)利用步驟(2)得到的目標種子點和背景種子點,獲得腫瘤分割結(jié)果。
[0045] 本發(fā)明中,所述步驟(2)中目標種子點和背景種子點由放療科醫(yī)生手動選取,如圖 所示。
[0046] 本發(fā)明中,所述步驟(3)具體采用結(jié)合肺4D-CT相位間信息的圖割算法分割腫瘤。 [0047]上述步驟(3)具體包括:
[0048] (3.1)將步驟(2)得到的目標種子點記作0,背景種子點記作B;
[0049] (3.2)將肺4D-CT圖像映射成網(wǎng)絡(luò)圖,圖像中的像素點對應(yīng)圖中的節(jié)點,并添加兩 個額外的頂點,一個為源點S,一個為匯點T,圖像中相鄰像素點p和q之間的關(guān)系對應(yīng)圖中節(jié) 點之間的邊。
[0050] (3.3)給圖中每一條邊賦予權(quán)值,設(shè)定權(quán)值的原則為:像素間的差異越小則權(quán)值越 大,像素間差異越大則權(quán)值越小,具體如下:
[0051 ] 若/?矣〇 U 5且g在0 W F ,則p和q之間的邊權(quán)值記為B{P,q}。若p e P,尸O U B,則p 和s之間的邊權(quán)值記為λ · Rp(〃bkg〃);若p e 〇,則p和s之間的邊權(quán)值記為K;若p e B,則p和s 之間的邊權(quán)值記為0。若pep,i?在,則p和t之間的邊權(quán)值記為λ · Rp(〃〇bj〃);若ρ£〇, 貝IJp和t之間的邊權(quán)值記為0;若p e B,則p和t之間的邊權(quán)值記為K。
[0052]其中:
[0053]
[0054]
[0055]
[0056]
[0057]
[0058]
[0059]
[0060]
[0061]
[0062]
[0063] (3.5)求解得到ε的最小值,對應(yīng)于肺4D-CT圖像的最終腫瘤分割結(jié)果。
[0064] 分割結(jié)果如圖3所示,對比利用原始圖割算法分割出的結(jié)果圖和利用本發(fā)明方法 分割出的結(jié)果圖。本發(fā)明的方法能夠準確地分割出腫瘤。
[0065] 除了視覺效果以外,本實例也通過量化指標客觀評價本發(fā)明的有效性。以醫(yī)生手 工分割的結(jié)果作為評價本發(fā)明實驗結(jié)果的金標準。分別采用對稱位置的平均表面距離 (Average Symmetric Surface Distance,ASSD)和Dice相似系數(shù)(Dice Similarity Coefficient,DSC)去量化評價分割結(jié)果。
[0066] ASSD定義如下:
[0067]
[0068] 式中a和b分別代表分割結(jié)果與金標準的邊緣像素,dist(a,b)代表a和b的距離,Na 和Nb是分割結(jié)果A與金標準B中邊緣像素的個數(shù)。ASSD表征了兩個集合之間的不相似程度, 因此ASSD越小則代表分割越精確。
[0069] 利用式(9)計算原始圖割算法分割結(jié)果和利用本發(fā)明方法分割結(jié)果與金標準之間 的ASSD,如圖4所示,可見,本發(fā)明的方法較原始圖割算法,ASSD減小。
[0070] Dice相似系數(shù)用來度量兩個集合之間的相似性,定義如下:
[0071]
[0072] 田上式口」知,Uiceffi似糸數(shù)介和IZI日」,值趣X,說明分割結(jié)果與標準越接近。
[0073]利用式(10)計算原始圖割算法分割結(jié)果和利用本發(fā)明方法分割結(jié)果的Dice相似 系數(shù),如圖5所示,可見,本發(fā)明的方法較原始圖割算法,Dice相似系數(shù)提高。
[0074] 實施例二
[0075]本發(fā)明基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法的實施例二結(jié)合另一組具有 6個相位的肺4D-CT數(shù)據(jù),其具體步驟如下:
[0076] (1)讀取肺4D-CT圖像,該圖像由6個不同相位的肺3D-CT圖像組成,各相位3D圖像 大小為350 X 210 X 100像素;
[0077] (2)標記初始相位3D-CT圖像上目標種子點和背景種子點,如圖6所示;
[0078] (3)利用步驟(2)得到的目標種子點和背景種子點,獲得腫瘤分割結(jié)果。
[0079] 本發(fā)明中,所述步驟(2)中目標種子點和背景種子點由放療科醫(yī)生手動選取,如圖 所示。
[0080] 本發(fā)明中,所述步驟(3)具體采用結(jié)合肺4D-CT相位間信息的圖割算法分割腫瘤, 其具體過程均與實例一相同,不再贅述。
[0081] 分割結(jié)果如圖7所示,對比利用原始圖割算法分割出的結(jié)果圖和利用本發(fā)明方法 分割出的結(jié)果圖。本發(fā)明的方法能夠準確地分割出腫瘤。
[0082] 除了視覺效果以外,本實例也通過量化指標客觀評價本發(fā)明的有效性。以醫(yī)生手 工分割的結(jié)果作為評價本發(fā)明實驗結(jié)果的金標準。利用式(9)和(10)計算利用本發(fā)明方法 分割結(jié)果的ASSD和Dice相似系數(shù)。如圖8、圖9所示,可見與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明不僅能夠 提高自動化程度,還能夠準確地分割出腫瘤。
[0083] 本發(fā)明的上述實施例并不是對本發(fā)明保護范圍的限定,本發(fā)明的實施方式不限于 此,凡此種種根據(jù)本發(fā)明的上述內(nèi)容,按照本領(lǐng)域的普通技術(shù)知識和慣用手段,在不脫離本 發(fā)明上述基本技術(shù)思想前提下,對本發(fā)明上述結(jié)構(gòu)做出的其它多種形式的修改、替換或變 更,均應(yīng)落在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。
【主權(quán)項】
1. 基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法,其特征在于,該分割方法包括以下步 驟: (1) 讀取肺4D-CT圖像,該圖像由多幅不同相位的肺3D-CT圖像組成; (2) 標記初始相位3D-CT圖像上目標種子點和背景種子點,初始相位3D-CT圖像是指多 幅不同相位的肺3D-CT圖像中第一幅3D-CT圖像; (3) 利用步驟(2)得到的目標種子點和背景種子點,獲得腫瘤分割結(jié)果。2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于圖割的肺4D-CT多相位腫瘤聯(lián)合分割方法,其特征在于: 所述步驟(3)采用結(jié)合肺4D-CT相位間信息的圖割算法分割腫瘤,具體包括: (3.1) 將步驟(2)得到的目標種子點記作0,背景種子點記作B; (3.2) 將肺4D-CT圖像映射成網(wǎng)絡(luò)圖,圖像中的像素點對應(yīng)圖中的節(jié)點,并添加兩個額 外的頂點,一個為源點S,一個為匯點T,圖像中相鄰像素點p和q之間的關(guān)系對應(yīng)圖中節(jié)點之 間的邊; (3.3) 給圖中每一條邊賦予權(quán)值,設(shè)定權(quán)值的原則為:像素間的差異越小則權(quán)值越大, 像素間差異越大則權(quán)值越小,具體如下: 若/?.茫0^.5且分鐸0。/)),貝1^和9之間的邊權(quán)值記為叫1),(1};若1)£?,尸¥〇」/?貝1^和 8 之間的邊權(quán)值記為λ · RP(〃bkg〃);若p e 〇,則!)和8之間的邊權(quán)值記為K;若p eB,則p和s之間 的邊權(quán)值記為0;若pep, i 0_u__5,貝ijp和t之間的邊權(quán)值記為λ · Rp(〃〇bj〃);若pe〇,則p和 t之間的邊權(quán)值記為0;若p e B,則p和t之間的邊權(quán)值記為K; 其中:P和P'分別表示不同相位同一位置的像素點; (3.4) 定義能量函數(shù):(3.5) 求解得到ε的最小值,對應(yīng)于肺4D-CT圖像的最終腫瘤分割結(jié)果。
【文檔編號】G06T7/00GK106056610SQ201610388369
【公開日】2016年10月26日
【申請日】2016年6月2日
【發(fā)明人】張煜, 申正文
【申請人】南方醫(yī)科大學