聯(lián)的、T-巧粘蛋白啟動(dòng)子領(lǐng)域的 甲基化研究報(bào)告（Br J Cancer，2004,90，1030-3,Cancer Res,2002,62(12)3383-6)。
[0029] 此外，作出了關(guān)于脂聯(lián)素(adiponectin、APN、adipoQ或apMl)與體內(nèi)脂肪及膜島素 抵抗的相關(guān)性的報(bào)告，報(bào)告中指出，關(guān)于大腸癌，體內(nèi)脂聯(lián)素的數(shù)值越低則與大腸癌的關(guān)聯(lián) 性越高（J NatlCancer Inst,2005,97,1688-94,int J Colorectal Dis,2009,24,275- 81)。
[0030] 如下面的表1所示，關(guān)于本發(fā)明所提供的SNP標(biāo)志物的NCBI的refSNP ID表示該SNP 的序列及其位置。如果是本領(lǐng)域技術(shù)人員，可利用上述號(hào)碼來(lái)容易確認(rèn)SNP的位置及序列。 與注冊(cè)到NCBI中的SNP的refSNP ID對(duì)應(yīng)的具體序列可根據(jù)持續(xù)進(jìn)行的關(guān)于基因的研究結(jié) 果而有所變更，并且運(yùn)種已變更的序列也包含在本發(fā)明的范圍內(nèi)，運(yùn)對(duì)本領(lǐng)域技術(shù)人員來(lái) 說(shuō)是顯而易見的。
[003。[表U
[0032]
[0033] 作為一例，在本發(fā)明中可預(yù)測(cè)為，Τ-巧粘蛋白基因中的W序列號(hào)l(rs3865188)表 示的序列的第27個(gè)堿基的基因型為TT的情況的大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度高于AA或AT的情況。在本 發(fā)明的具體實(shí)施例中，可確認(rèn)出rs3865188:TT基因型的危險(xiǎn)度比rs3865188:AA或 rs3865188:AT基因型群的危險(xiǎn)度高1.577倍(p = 0.0144)。
[0034] 作為另一例，在本發(fā)明中可預(yù)測(cè)為，在T-巧粘蛋白基因中的W序列號(hào)1 (rs3865 188)表示的序列的第27個(gè)堿基的基因型為TT，脂聯(lián)素基因中的序列號(hào)2 (rs2241767)的第27個(gè)堿基的基因型為AA的情況下，或在上述序列號(hào)1的第27個(gè)堿基的基因 型為TT，序列號(hào)2的第27個(gè)堿基的基因型為GA、AA的情況下，大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度高。
[0035] 在本發(fā)明的具體實(shí)施例中，可確認(rèn)出帶有rs3865188:TT和rs2241767:AA基因型的 人對(duì)大腸癌危險(xiǎn)度的易感性比帶有^3865188:44和^2241767:66基因型的人高2.458倍。 并且，帶有rs3865188:TT和rs2241767:GA、AA基因型的人對(duì)大腸癌危險(xiǎn)度的易感性比帶有 丘33865188:44和'32241767:66基因型的人高2.301倍。
[0036] 作為另一例，在本發(fā)明中可預(yù)測(cè)為，在T-巧粘蛋白基因中的W序列號(hào)1 (rs3865 188)表示的序列的第27個(gè)堿基的基因型為TT，脂聯(lián)素基因中的序列號(hào)3 (rs2241767)的第27個(gè)堿基的基因型為CC的情況下，大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度高。
[0037] 在本發(fā)明的具體實(shí)施例中，可確認(rèn)出帶有rs3865188:TT和rs3821799:CC基因型的 人對(duì)大腸癌危險(xiǎn)度的易感性比帶有^3865188:44和^3821799:口'基因型的人高3.573倍。 [003引作為另一例，在本發(fā)明中可預(yù)測(cè)為，在T-巧粘蛋白基因中的W序列號(hào)1 (rs3865 188)表示的序列的第27個(gè)堿基的基因型為TT，脂聯(lián)素基因中的序列號(hào)4 (rs3774261)的第27個(gè)堿基的基因型為GG的情況下，大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度高。
[0039] 在本發(fā)明的具體實(shí)施例中，可確認(rèn)出帶有rs3865188:TT和rs3774261:GG基因型的 人對(duì)大腸癌危險(xiǎn)度的易感性比帶有^3865188:44和^3774261:44基因型的人高4.257倍。
[0040] 作為另一例，在本發(fā)明中可預(yù)測(cè)為，在T-巧粘蛋白基因中的W序列號(hào)1 (rs3865 188)表示的序列的第27個(gè)堿基的基因型為TT，脂聯(lián)素基因中的序列號(hào)5 (rs6773957)的第27個(gè)堿基的基因型為GG的情況下，大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度高。
[0041 ] 在本發(fā)明的具體實(shí)施例中，可確認(rèn)出帶有rs3865188: TT和rs6773957: GG基因型的 人對(duì)大腸癌危險(xiǎn)度的易感性比帶有^3865188:44和^6773957:44基因型的人高3.992倍。
[0042] 本發(fā)明中，患者為大腸癌發(fā)病前的普通患者，并且可W是欲通過預(yù)測(cè)大腸癌發(fā)病 危險(xiǎn)度來(lái)管理的患者?；蛘?，可W是大腸癌已發(fā)病的患者。
[0043] 本發(fā)明中，從患者獲取到的樣本包含組織、細(xì)胞、全血、血清、血漿、唾液、咯疲、腦 脊液或尿等，并且從運(yùn)些樣本中獲取基因樣本，該基因樣本包含DNA，mRNA或由mRNA合成的 cDNA。
[0044] 本發(fā)明中的用語(yǔ)"預(yù)測(cè)"是指辨別患者有無(wú)大腸癌發(fā)病可能性、大腸癌發(fā)病可能性 是否相對(duì)較高或大腸癌是否已發(fā)病。本發(fā)明的方法可用于通過對(duì)大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度高的任 意特定患者進(jìn)行特別并適當(dāng)管理，從而延緩發(fā)病時(shí)期或使患者不發(fā)病。此外，本發(fā)明的方法 可通過早期診斷大腸癌來(lái)選擇最佳的治療方式，從而為了決定治療而在臨床上使用。
[0045] 本發(fā)明中的用語(yǔ)"多態(tài)性(polymo巧hism)"是指一個(gè)基因座（1〇州S)上存在兩種W 上的等位基因（allele)的情況，并且在多態(tài)性位點(diǎn)中，按不同的人僅單堿基不同的多態(tài)性 稱作單核巧酸多態(tài)性(single nucleotide polymor曲ism,SNP)。優(yōu)選的多態(tài)性標(biāo)志物具有 在已選擇的群體中呈現(xiàn)1%W上的發(fā)生頻率的兩種W上的等位基因，更優(yōu)選地，具有呈現(xiàn) 10%或20% W上的發(fā)生頻率的兩種W上的等位基因。
[0046] 本發(fā)明中的用語(yǔ)"等位基因（allele)"是指存在于同源染色體的同一基因座上的 一個(gè)基因的各種類型。等位基因也可W用于呈現(xiàn)多態(tài)性，例如SNP具有兩種雙等位基因 (biallele)。
[0047] 作為又一方式，本發(fā)明提供一種用于預(yù)測(cè)患者的大腸癌發(fā)病危險(xiǎn)度的組合物。
[0048] 上述組合物的特征在于，含有用于對(duì)從患者分離出的基因樣本，確認(rèn)T-巧粘蛋白 基因中的W序列號(hào)UNCBI refSNP ID:rs3865188)表示的序列的第27個(gè)堿基的試劑。
[0049] 作為一例，優(yōu)選地，本發(fā)明的組合物中所含有的試劑包含由十個(gè)W上的連續(xù)堿基 組成的多核巧酸或其互補(bǔ)多核巧酸，其中，該十個(gè)W上的連續(xù)堿基包含T-巧粘蛋白基因中 的W序列號(hào)UNCBI refSNP ID:rs3865188)表示的序列的第27個(gè)堿基。
[0050] 此外，上述組合物可進(jìn)一步包含用于對(duì)從患者分離出的基因樣本，確認(rèn)選自由脂 聯(lián)素基因中的W序列號(hào)2(NCBI refSNP ID:rs2241767)表示的序列的第27個(gè)堿基、脂聯(lián)素 基因中的W序列號(hào)3(NCBI refSNP ID:rs3821799)表示的序列的第27個(gè)堿基、脂聯(lián)素基因 中的W序列號(hào)4(NCBI refSNP ID:rs3774261)表示的序列的第27個(gè)堿基和脂聯(lián)素基因中的 W序列號(hào)5(NCBI refSNP ID:rs6773957)表示的序列的第27個(gè)堿基組成的組中的一個(gè)W上 的堿基的試劑。
[0051] 作為一例，上述組合物中所包含的試劑進(jìn)一步可包含由十個(gè)W上的連續(xù)堿基組成 的多核巧酸或其互補(bǔ)多核巧酸，其中，該十個(gè)W上的連續(xù)堿基包含選自由脂聯(lián)素基因中的 W序列號(hào)2(NCBI refSNP ID:rs2241767)表示的序列的第27個(gè)堿基、脂聯(lián)素基因中的W序 列號(hào)3(NCBI refSNP ID:rs3821799)表示的序列的第27個(gè)堿基、脂聯(lián)素基因中的W序列號(hào)4 (NCBI refSNP ID:rs3774261)表示的序列的第27個(gè)堿基和脂聯(lián)素基因中的W序列號(hào)5 (NCBI refSNP ID:rs6773957)表示的序列的第27個(gè)堿基組成的組中的一個(gè)W上堿基。
[0052] 因此，作為本發(fā)明的一方式，提供上述多核巧酸。
[0053] 本發(fā)明的上述多核巧酸或其互補(bǔ)多核巧酸可由十個(gè)W上的連續(xù)堿基組成，優(yōu)選地 可由10至100個(gè)連續(xù)堿基組成，更優(yōu)選地可由20至60個(gè)連續(xù)堿基組成，進(jìn)一步更優(yōu)選地可由 40至60個(gè)連續(xù)堿基組成。
[0054] 本發(fā)明的上述多核巧酸或其互補(bǔ)多核巧酸為多態(tài)性序列（polymorphic sequence)。多態(tài)性序列(polymorphiC sequenc)是指在核巧酸序列中包含有呈現(xiàn)單堿基多 態(tài)性的多態(tài)性位點(diǎn)(polymor曲ic site)的序列。多態(tài)性位點(diǎn)(polymorphic site)是指在多 膚性序列中發(fā)生單堿基多態(tài)的位點(diǎn)。在本發(fā)明中，上述多核巧酸可W是DNA或RNA。
[0055] 作為另一例，優(yōu)選地，本發(fā)明的組合物中所含有的試劑包含與上述多核巧酸或其 互補(bǔ)多核巧酸進(jìn)行特異性雜交的多核巧酸。
[0056] 因此，本發(fā)明將與上述多核巧酸或其互補(bǔ)多核巧酸進(jìn)行特異性雜交的多核巧酸作 為一方式來(lái)提供。
[0057] 本發(fā)明中，與上述多核巧酸或其互補(bǔ)多核巧酸進(jìn)行特異性雜交的多核巧酸為等位 基因特異性(allele-specific)多核巧酸。
[005引等位基因特異性多核巧酸表示對(duì)各等位基因進(jìn)行特異性雜交。即，是指W能夠特 異性區(qū)別多態(tài)性序列中存在的多態(tài)性位點(diǎn)的堿基的方式進(jìn)行雜交。在此，雜交一般可在嚴(yán) 格條件下執(zhí)行，例如一般可在1MW下的堿濃度和25°CW上的溫度下執(zhí)行。
[0059]