專利名稱：Lxr活化的標(biāo)記物的制作方法
肝-X-受體(LXR)是核激素受體，其調(diào)節(jié)參與膽固醇和脂質(zhì)代謝和膽汁酸合成的基因的表達(dá)。LXRs與動脈粥樣硬化、血脂異常和糖尿病等多種疾病有關(guān)。最近數(shù)據(jù)表明其在炎癥中起作用。已經(jīng)表明幾種基因受到LXR調(diào)節(jié)，所述基因包括ABCA1(Costet，P.，等人，Sterol-dependenttransactivation of the ABC1 promoter by the liver X receptor/retinoid Xreceptor.J Biol Chem，2000.275(36)28240-5頁；Schwartz，K.，R.M.Lawn，和D.P.Wade，ABC1 gene expression and ApoA-I-mediatedcholesterol efflux are regulated by LXR.Biochem Biophys Res Commun，2000.274(3)794-802頁)；WO 02/070011公開ABCA-1可以作為PPAR激活的替代標(biāo)記物；ABCG1(Kennedy，M.A.，等人，Characterization of thehuman ABCG1 Gene；LXR activates an internal promoter that producesa novel transcript encoding an alternative form of the protein.J Biol Chem，2001.1010頁.)；ApoCl(Stulnig，T.M.，等人，Novel roles of liver Xreceptors exposed by gene expression profiling in liver and adipose tissue.Mol Pharmacol，2002.62(6)1299-305頁)；ApoE(Laffitte，B.A.，等人，LXRs control lipid-inducible expression of the apolipoprotein Egene inmacrophages and adipocytes.Proc Natl Acad Sci USA，2001.98(2)507-12頁)；FAS(Joseph，S.B.，等人，Direct and indirect mechanisms forregulation of fatty acid synthase gene expression by LXRs.J Biol Chem，2002.1414頁)；LDLR(Stulnig，T.M.，等人，Novel roles of liver Xreceptors exposed by gene expression profiling in liver and adipose tissue.Mol Pharmacol，2002.62(6)1299-305頁)；NR1H3(Laffitte，B.A.，等人，Autoregulation of the Human Liver X Receptor alpha Promoter.Mol CellBiol，2001.21(22)7558-68頁)；SREBPF1(DeBose-Boyd，R.A.，等人，Expression of sterol regulatory element-binding protein lc(SREBP-1c)mRNA in rat hepatoma cells requires endogenous LXR ligands.Proc Natl Acad Sci USA，2001.98(4)1477-82頁)。US2004/0023276也是重要的，其公開了LXR配體誘導(dǎo)的基因和蛋白質(zhì)。
本發(fā)明涉及LXR激活的替代標(biāo)記物、診斷與LXR激活有關(guān)的疾病的方法、監(jiān)視患有與LXR激活有關(guān)的患者治療的方法以及鑒定調(diào)節(jié)LXR激活的化合物的方法。
本發(fā)明提供了用于檢測或監(jiān)視LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物，其包含選自表2和/或表3所列出的核酸的至少一種核酸。本文所用術(shù)語“調(diào)節(jié)”涉及LXR的轉(zhuǎn)錄活性的激活或抑制。因此，所述核酸可以用作LXR活性調(diào)節(jié)的替代標(biāo)記物。
本文所用術(shù)語“標(biāo)記物”指一種核酸或多肽或一組多種核酸或多肽。
優(yōu)選地，所述核酸是表2中所列出的核酸。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的至少一種核酸。在另一種優(yōu)選的實施方案中，所述核酸是表2中所列出的除了SeqID No.3、4、5和20之外的核酸。在另一種更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的至少一種核酸。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、12、或21的至少一種核酸。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1或21的至少一種核酸。在另一實施方案中，標(biāo)記物更優(yōu)選地包含選自Seq ID No.20、22或26的核酸，更優(yōu)選選自Seq ID No.22或26的核酸的至少一種核酸，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸。
在另一種優(yōu)選實施方案中，標(biāo)記物包含表3中所列出的至少一種核酸。更優(yōu)選地，所述至少一種核酸選自Seq ID No.16、17和23到25的核酸。在最優(yōu)選的實施方案中，所述至少一種核酸選自Seq ID No.16或24。
本發(fā)明還涉及用于診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含選自表2和/或表3中所列出的核酸的一種或多種核酸。從而，所述核酸可以作為LXR活性調(diào)節(jié)的替代標(biāo)記物。
優(yōu)選地，所述核酸是表2中所列出的核酸。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的至少一種核酸。在另一種優(yōu)選的實施方案中，所述核酸是表2中所列出的除了SeqID No.3、4、5和20之外的核酸。在另一種更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的至少一種核酸。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、12或21的至少一種核酸。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1或21的至少一種核酸。在另一實施方案中，標(biāo)記物更優(yōu)選地包含選自Seq ID No.20、22或26的核酸，更優(yōu)選選自Seq ID No.22或26的核酸的至少一種核酸，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸。
在另一優(yōu)選實施方案中，所述至少一種核酸選自表3中所列出的核酸的至少一種核酸。更優(yōu)選地，所述至少一種核酸選自Seq ID No.16、17和23到25的核酸。最優(yōu)選地，所述至少一種核酸選自Seq ID No.16和/或24。
本發(fā)明還涉及診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸的至少一種核酸和選自表2中所列出的核酸的至少一種核酸。優(yōu)選地，所述標(biāo)記物包含表3中所列出的一種核酸和表2中所列出的一種核酸。
表2和/或表3中所列出的核酸編碼的多肽也可以用作標(biāo)記物。從而，本發(fā)明還提供了檢測或監(jiān)視LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物，其包含選自表2和/或表3中所列出的核酸編碼的多肽的一種或多種多肽。
優(yōu)選地，所述多肽選自表2中所列出的核酸編碼的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸編碼的多肽的至少一種多肽。在另一種優(yōu)選的實施方案中，所述多肽為表2中所列出的除了Seq ID No.3、4、5和20之外的核酸編碼的多肽。在另一種更優(yōu)選的實施方案中，所述標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸編碼的多肽的至少一種多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，所述標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、12、或21的核酸編碼的至少一種多肽。在最優(yōu)選的實施方案中，所述標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1或21的核酸編碼的至少一種多肽。在另一實施方案中，標(biāo)記物更優(yōu)選地包含選自Seq ID No.20、22或26的核酸編碼的多肽的至少一種多肽，更優(yōu)選選自Seq ID No.22或26的核酸編碼的多肽的至少一種多肽，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸編碼的多肽。
在另一優(yōu)選實施方案中，所述多肽選自表3中所列出的核酸編碼的多肽。更優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16、17和23到25的核酸編碼的多肽。最優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16和/或24的核酸編碼的多肽。
在另一實施方案中，本發(fā)明提供了用于檢測或監(jiān)視LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物，其包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽中的至少一種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的一種或多種多肽。優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的一種多肽和表2中所列出的核酸編碼的多肽的一種多肽。更優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的兩種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的兩種多肽。更進(jìn)一步優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的三種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的三種多肽。最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的四種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的四種多肽。
進(jìn)一步，本發(fā)明還提供了用于診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，該標(biāo)記物包含選自表2和/或表3中列出的核酸編碼的多肽的一種或多種。
優(yōu)選地，所述多肽選自表2中列出的核酸編碼的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸編碼的多肽中的至少一種多肽。在另一優(yōu)選實施方案中，所述多肽為表2中所列出的除了Seq ID No.3、4、5和20之外的核酸編碼的多肽。在另一更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含至少一種選自Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸編碼的多肽中的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含選自Seq ID No.1、12或21的核酸編碼的多肽的至少一種多肽。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含至少一種Seq ID No.1或21的核酸編碼的多肽。在另一實施方案中，標(biāo)記物更優(yōu)選地包含至少一種選自Seq ID No.20、22或26的核酸編碼的多肽中的多肽，更優(yōu)選地包含至少一種選自Seq ID No.22或26的核酸編碼的多肽中的多肽，最優(yōu)選地包含SeqID No.26的核酸編碼的多肽。
在另一優(yōu)選的實施方案中，所述多肽選自表3中所列出的核酸編碼的多肽。更優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16、17、23到25的核酸編碼的多肽。最優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16和/或24的核酸編碼的多肽。
本發(fā)明還涉及診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，其包含選自表3中列出的核酸編碼的多肽的至少一種多肽和選自表2中列出的核酸編碼的多肽的一種或多種多肽。優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的一種多肽和表2中所列出的核酸編碼的多肽的一種多肽。更優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的至少兩種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的至少兩種多肽。更進(jìn)一步優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的至少三種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的至少三種多肽。最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含選自表3中所列出的核酸編碼的多肽的至少四種多肽和選自表2中所列出的核酸編碼的多肽的至少四種多肽。
上文所述的組成新標(biāo)記物的核酸和多肽可用于幾種方法中的。本文提供了用于篩選調(diào)節(jié)LXR活性的化合物的方法，其包括將所述化合物與宿主接觸，以及測定選自表2和/或表3中所列的核酸的的至少一種核酸的表達(dá)。
優(yōu)選地，所述核酸是表2中所列出的核酸。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含至少一種選自Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸。在另一種優(yōu)選的實施方案中，所述核酸是表2中所列出的除了Seq IDNo.3、4、5和20之外的核酸。在另一更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含至少一種選自Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含至少一種選自Seq ID No.1、12或21的核酸。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1或21至少一種的核酸。在另一實施方案中，標(biāo)記物更優(yōu)選地包含至少一種選自Seq ID No.20、22或26的核酸，更優(yōu)選地包含選自Seq ID No.22或26的核酸的至少一種核酸，最優(yōu)選地標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸。
在上文所述方法的實施方案中，選自上文所述核酸中的至少一種核酸的表達(dá)與對照中的至少一種核酸比較。對照可以是未處理的宿主，其可以是處理前的同一宿主或不同的宿主，和/或為歸一化到預(yù)處理水平而經(jīng)過適當(dāng)處理時間后的同一宿主。在上文所述方法的更優(yōu)選實施方案中，調(diào)節(jié)LXR活性的化合物是拮抗劑或激動劑。
在另一更優(yōu)選的實施方案中，所述至少一種核酸是選自表3中所列出的核酸。更優(yōu)選地，所述至少一種核酸選自Seq ID No.16、17和23到25的核酸。最優(yōu)選地，所述至少一種核酸選自Seq ID No.16和/或24。
測定所述核酸表達(dá)的方法有幾種。諸如RNA印跡和通過光密度測定法定量條帶的方法是本領(lǐng)域眾所周知的并可以使用的，盡管它們不夠準(zhǔn)確。其他方法包括利用基因芯片、微陣列分析、點印跡或不同的定量PCR方法。優(yōu)選地，使用Taqman或?qū)崟r定量PCR。在優(yōu)選的實施方案中，通過Taqman定量PCR，使用表1中所列的正向引物、反向引物和探針測定選自Seq ID No.16到26的至少一種核酸的表達(dá)水平。在更優(yōu)選的實施方案中通過Taqman定量PCR測定選自Seq ID No.20、21、22和26的至少一種核酸，的表達(dá)水平。在最優(yōu)選的實施方案中，測定選自Seq ID No.20、21、22和26的至少一種核酸的引物和探針是Seq ID No.39到41的引物和探針(用于測定Seq ID No.20的核酸的表達(dá)水平)、或是Seq ID No.42到44的引物和探針(用于測定Seq ID No.21的核酸的表達(dá)水平)、或是SeqID No.45到47的引物和探針(用于測定Seq ID No.22的核酸的表達(dá)水平)、或是Seq ID No.57到59的引物和探針(用于測定Seq ID No.26的核酸的表達(dá)水平)。
如下進(jìn)行TaqMan定量PCR使用三種寡核苷酸正向引物、反向引物和探針。它們對靶標(biāo)都是特異的并能結(jié)合靶標(biāo)。TaqMan測定使用探針技術(shù)，其利用酶的5′→3′-核酸酶活性，這種酶是最常用的Taq聚合酶。測定效率很大程度上取決于5′→3′-核酸酶活性，在這點上，選擇適合的聚合酶時應(yīng)當(dāng)仔細(xì)。實際上，市場上出售的一些聚合酶似乎并不適合實時RT-PCR，盡管生產(chǎn)廠家聲稱它們具有5′-核酸外切酶活性。探針是一種寡核苷酸，其在5′端有報道染料，在3′端有猝滅劑染料。熒光報道染料共價連接到5′端并且可以是FAM(6-羧基熒光素)、TET(四氯-6-羧基熒光素)、JOE(2，7-二甲氧基-4，5-二氯-6-羧基熒光素)、HEX(六氯-6-羧基熒光素)或是VIC。報道染料被通過連接臂結(jié)合到3’端的TAMRA(6-羧基四甲基羅丹明)猝滅。DABCYL(4-(48-二甲基氨基苯基偶氮)苯甲酸)也能作為猝滅劑染料，但是它更廣泛應(yīng)用于分子信標(biāo)探針。在TaqMan探針中使用DABCYL的優(yōu)點是，與TAMRA相比，它減少了自身熒光。當(dāng)探針完整時，由于猝滅劑染料和報道染料接近，猝滅劑染料吸收報道染料的熒光。猝滅劑和熒光團(tuán)之間的接近允許FRET，而且不發(fā)生熒光發(fā)射。通過Tap聚合酶的5′-核酸外切梅活性，探針被水解，并且報道染料與猝滅劑分離，導(dǎo)致熒光發(fā)生的增強。在PCR擴增期間，如果存在目的靶標(biāo)，探針與靶標(biāo)特異退火。Taq聚合酶切割探針，并導(dǎo)致熒光發(fā)射增強。一輪接一輪測量到熒光發(fā)射的增強，這是擴增過程的直接結(jié)果。(Giulietti，A.等，An Overview of eal-TimeQuantitative PCRApplications to Quantify Cytokine Gene Expression.Methods 25，386-401(2001))。
本發(fā)明提供的另一種方法是篩選調(diào)節(jié)LXR活性的化合物的方法，其包括將所述化合物與宿主接觸，并測量選自表2和/或表3中列出的核酸編碼的多肽的至少一種多肽的表達(dá)。優(yōu)選地，所述多肽選自表2中列出的核酸編碼的多肽。在一種更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含表2中所列的除了Seq ID No.3到5和20之外的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一種更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、12或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在另一實施方案中，標(biāo)記物更優(yōu)選地包含Seq ID No.20、22或26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸或是由它編碼的多肽。
在另一優(yōu)選的實施方案中，所述多肽選自表3中所列的核酸編碼的多肽。更優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16、17、23到25的核酸編碼的多肽。最優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16和/或24的核酸編碼的多肽。
上文所述方法的另一實施方案中，至少一種多肽的表達(dá)與對照中所述至少一種多肽的表達(dá)相比較。對照可以是未處理的宿主，或是用載體處理的宿主。載體可以是其中溶解或再懸浮化合物的溶劑。上文所述方法的更優(yōu)選的實施方案中，調(diào)節(jié)PXL活性的化合物是拮抗劑或激動劑。
本發(fā)明還提供了監(jiān)測患有與LXR活性失調(diào)有關(guān)的患者的治療的方法，其包括步驟從使用LXR調(diào)節(jié)劑治療的患者分離的單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞或全血提純mRNA或蛋白質(zhì)，并測定至少一種表2和/或表3中列出的核酸或由所述核酸編碼的多肽的表達(dá)。
優(yōu)選地，所述多肽由表2中列出的核酸編碼。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一種優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含表2中所列的除了Seq ID No.3到5和20之外的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一種更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、12或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在另一實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.20、22或26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸或是由其編碼的多肽。
在另一優(yōu)選的實施方案中，所述多肽選自表3中所列核酸編碼的多肽。更優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16、17和23到25的核酸編碼的多肽。最優(yōu)選地，所述多肽選自Seq ID No.16和/或24的核酸編碼的多肽。
對照可以是未被處理的宿主，其可以是處理前的同一宿主或不同的宿主，和/或為歸一化到預(yù)處理水平而經(jīng)過適當(dāng)處理時間后的同一宿主。
本發(fā)明還提供了診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的方法，其包括步驟從全血或純化的單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞中提取mRNA或蛋白質(zhì)，并測定至少一種由表2和/或表3中的至少一種核酸或所述核酸編碼的至少一種多肽的表達(dá)。
優(yōu)選地，所述多肽由表2中列出的核酸編碼。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一種優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含表2中所列的除了Seq ID No.3到5和20之外的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一種更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、12或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在另一實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.20、22或26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸或是由編碼的多肽。
在另一優(yōu)選的實施方案中，所述至少一種核酸或多肽選自表3所列的核酸或由其編碼的多肽。更優(yōu)選地，所述至少一種核酸或多肽選自Seq IDNo.16、17、23到25的核酸或由其編碼的多肽。最優(yōu)選地，所述至少一種核酸或多肽選自Seq ID No.16和/或24的核酸或由其編碼的多肽。
對照可以是未被處理的宿主，其可以是處理前的同一宿主或不同的宿主，和/或為歸一化到預(yù)處理水平而經(jīng)過適當(dāng)處理時間后的同一宿主。
對于上文所述的方法和標(biāo)記物，本發(fā)明表2和/或表3中所列的一種或多種核酸或由其編碼的一種或多種多肽的用途，用作LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物。優(yōu)選地，所述多肽由表2中列出的核酸編碼。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一種優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含表2中所列的除了Seq ID No.3到5和20之外的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在另一更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽。在更優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1、12或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在最優(yōu)選的實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.1或21的核酸或由這些核酸編碼的多肽。在另一實施方案中，標(biāo)記物包含Seq ID No.20、22或26的核酸或是由這些核酸編碼的多肽，最優(yōu)選地，標(biāo)記物包含Seq ID No.26的核酸或是由其編碼的多肽。
在另一優(yōu)選的實施方案中，所述至少一種核酸或多肽選自表3中所列的核酸或者其編碼的多肽。更優(yōu)選地，所述至少一種核酸或多肽選自Seq IDNo.16、17和23到25的核酸或由其編碼的多肽。最優(yōu)選地，所述至少一種核酸或多肽選自Seq ID No.16和/或24的核酸或由其編碼的多肽。
本發(fā)明還涉及通過上文所述方法鑒定出的化合物，以及通過上文所述方法鑒定出的化合物的用途，用于制備治療與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的藥物。
實施例參考下面的幾實施例對本發(fā)明發(fā)明進(jìn)行闡明，但這些不能被認(rèn)為對本發(fā)明的限制。
細(xì)胞培養(yǎng)和RNA制備骨髓性單核白血病細(xì)胞系(THP1；ATCC TID-202)在包含酚紅的RPMI1640培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng)，該培養(yǎng)基中含有2g/l葡萄糖，2mM谷氨酰胺，10％胎牛血清FBS(v/v)(Gibco)，1％青霉素-鏈霉素P/S(v/v)(Gibco)，50μM 2-巰基乙醇(Rio-Rad)和1％100mM丙酮酸鈉(v/v)(Gibco)。細(xì)胞在37℃和5.2％CO2的條件下孵育。為了進(jìn)行實驗處理，細(xì)胞以1×106/ml的密度接種在6孔板中含有100nM13-乙酸12-肉豆蔻佛波醇(PMA)的培養(yǎng)基中培養(yǎng)72小時以使它們完全分化為貼壁巨噬細(xì)胞。然后，培養(yǎng)基用含有PMA與載體(DMSO)或受試化合物的培養(yǎng)基代替，6或24小時后收獲。根據(jù)廠家的方案，使用TriZol試劑(Life Technologies)或RNeasy mini試劑盒(Qiagen)分離總RNA。為了去除污染性DNA，樣品使用無RNA酶的脫氧核糖核酸酶(GibCo)處理。
通過DNA芯片測量基因表達(dá)使用SuperScript Choice Gene Chip試劑盒(Life Technologies)和Gibco的試劑合成出第一和第二條鏈cDNA。該雙鏈cDNA包含摻入的T7RNA聚合酶結(jié)合位點，使用苯酚氯仿異戊醇(Life Technologies)的混合物萃取純化所述雙鏈cDNA。通過Phase Lock Gel(Eppendorf)分離有機相和水相并根據(jù)生產(chǎn)廠商的方案通過沉淀回收雙鏈cDNA，然后將其重懸浮于水中。
使用T7試劑盒(Ambion)和含有生物素的核糖核苷酸(Enzo-LOXOGmbH)通過體外轉(zhuǎn)錄(IVT)將雙鏈cDNA轉(zhuǎn)化成生物素標(biāo)記的cRNA。用RNAeasy旋轉(zhuǎn)柱(Qiagen)從未摻入的核糖核苷酸純化IVT-物質(zhì)。清洗過后，單鏈生物素標(biāo)記的cRNA在pH8.1的500mM乙酸鈣和150mM醋酸鎂中95℃下被化學(xué)水解35分鐘生成更小的片段。通過在冰上急劇冷卻樣品終止反應(yīng)。
探針與含有代表～12,000個基因的HGU95AV2 A基因芯片微陣列(GeneChip Microarray)(Affymetrix)雜交。使用GeneChip FliudicsStation(Affymetrix)進(jìn)行所有洗滌、雜交、檢測和信號擴增步驟。使用GeneArray掃描儀從雜交的GeneArray收集熒光強度數(shù)據(jù)。包含熒光強度信息的原始文件通過Affymetrix Microarray Suite(MAS)軟件轉(zhuǎn)化成數(shù)據(jù)文件。通過Roche Affymetrix Chip Experimetal Analysis(RACE-A)軟件鑒定差別表達(dá)的基因。經(jīng)過載體處理的孔和經(jīng)過試驗化合物處理的孔(每組n＝4)之間的差異通過斯氏t-檢驗評價，并表達(dá)為相對對照的改變倍數(shù)。
通過Taqman定量PCR測定基因表達(dá)通過Taqman定量RT-PCR在ABI PRISM 7700序列檢測系統(tǒng)(Applied Biosystems))上測定基因表達(dá)水平。使用Superscript II RT試劑盒(Life Technologies)將總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。使用的引物/探針序列如表1所列。通過PrimerSelect軟件(Perkin Elmer)設(shè)計引物。經(jīng)過載體處理的孔和經(jīng)過試驗化合物處理的孔(每組n＝4)之間的差異通過斯氏t-檢驗評價并表達(dá)為相對對照的改變倍數(shù)。根據(jù)(Giulietti，A.，等，AnOverview of real-Time Quantitative PCRApplications to QuantifyCytokine Gene Expression.Methods 25，386-401(2001))所描述的進(jìn)行Taqman定量PCR。
實施例1是與RXR異二聚化的核受體并且已表明調(diào)節(jié)幾種目標(biāo)基因如ABCA1、ABCG1、SREBF1、FASN、LPL和CYP7A的表達(dá)[1-9]。為了鑒定可以在患者身上測定以評價治療方案的功效的替代基因，用選擇性LXR配體處理THP1巨噬細(xì)胞。在200nM時，T0901317[10]是選擇性LXR激動劑(對于人LXRα和第二LXRβ，分別為EC5O＝30nM和10nM)?；虮磉_(dá)的改變通過Gene Chip Microarray分析來評價。LXR激動劑T0901317表現(xiàn)出對ABCA1、ABCG1、APOC1、APOE、ASM3A、C3F、CDC42EP4、CXCR4、FASN、LDLR、NR1H3、SREBF1、VLDLR、FADS1、FADS2、CYB561、IL15、PPFIA2、SERPINI1、KIAA0763、PPIC、LASS1、NFATC4、NR4A3、PRODH2、PRKCI(表2)的強烈誘導(dǎo)。從而，所有這些基因都是LXR調(diào)節(jié)的替代標(biāo)記物，而且它們的活性可以使用Gene ChipMicroarray技術(shù)測定。
實施例2為了評價測定替代標(biāo)記物基因的備選方法，如上述用T0901317處理THP1巨噬細(xì)胞。對ABCA1、ABCG1、APOC1、APOE、ASM3A、CDC42EP4、CXCR4、FASN、LDLR、NR1H3、VLDLR通過Taqman定量PCR測量基因表達(dá)的變化。選擇性LXR激動劑導(dǎo)致這些標(biāo)記物基因的每一種的表達(dá)的穩(wěn)定而顯著的增加。綜合分析這些結(jié)果，可以看出，通過多種方法測定替代標(biāo)記物基因的mRNA表達(dá)可以有效用于評價LXR治療方案的治療功效。
表I研究中所用Taqman引物和探針列表所有序列均按5′到3′方向描繪。Taqman探針用5′-FAM和3′-TAMRA標(biāo)記物并通過HPLC提取。
A.
B.
表II通過Gene Chip Microarray測定LXR活化的替代標(biāo)記物基因通過Gene Chip Microarray分析測量的使用LXR激動劑劑T0901317處理的THP1巨噬細(xì)胞內(nèi)mRNA水平的改變倍數(shù)，所有值都是mRNA的改變倍數(shù)并且代表4種處理的和4種對照方法的不同。處理時間是6或24小時。*顯著p＜0.05；**極顯著p＜0.01。
表III通過Gene Chip Microarray分析測量的使用LXR激動劑劑T0901317處理的THP1巨噬細(xì)胞內(nèi)mRNA水平的改變倍數(shù)，所有值都是mRNA的改變倍數(shù)并且代表4種處理的和4種對照方法的不同。處理時間是6或24小時。*顯著p＜0.05；**極顯著p＜0.01。
表4通過Taqman定量RT-PCR評價LXR活化的替代標(biāo)記物基因通過Taqman定量RT-PCR測量的使用LXR激動劑劑T0901317處理的THP1巨噬細(xì)胞內(nèi)mRNA水平的改變倍數(shù)，所有值都是mRNA的改變倍數(shù)并且代表4種處理的和4種對照方法的不同。處理時間是6或24小時。*顯著p＜0.05；**極顯著p＜0.01。
序列表<110>弗·哈夫曼-拉羅切有限公司<120>LXR活化的標(biāo)記物<130>Case_21735<160>59<170>PatentIn版本3.1<210>1<211>2058<212>DNA<213>人(Homo sapiens)<220>
<221>與nessy(果蠅)相似的人假定蛋白質(zhì)(C3F)<222>(1)..(2058)<223>Unigene ID Hs.300423基因的代表性cDNA序列(NM_005768.3，到2003年3月24日為止)<400>1ggcacgaggg ttaccccttt gctttgtttt atcggcatta ccttttctac aaggagacct60acctcatcca cctcttccat acctttacag gcctctcaat tgcttatttt aactttggaa 120accagctcta ccactccctg ctgtgtattg tgcttcagtt cctcatcctt cgactaatgg 180gccgcaccat cactgccgtc ctcactacct tttgcttcca gatggcctac cttctggctg 240
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<221>人固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子1(SREBF1)<222>(1)..(4154)
<223>Unigene ID Hs.Hs.166的基因的代表性cDNA序列(NM_004176.2，到2003年3月24日為止)<400>2taacgaggaa cttttcgccg gcgccgggcc gcctctgagg ccagggcagg acacgaacgc 60gcggagcggc ggcggcgact gagagccggg gccgcggcgg cgctccctag gaagggccgt120acgaggcggc gggcccggcg ggcctcccgg aggaggcggc tgcgccatgg acgagccacc180cttcagcgag gcggctttgg agcaggcgct gggcgagccg tgcgatctgg acgcggcgct240gctgaccgac atcgaagaca tgcttcagct tatcaacaac caagacagtg acttccctgg300cctatttgac ccaccctatg ctgggagtgg ggcagggggc acagaccctg ccagccccga360taccagctcc ccaggcagct tgtctccacc tcctgccaca ttgagctcct ctcttgaagc420cttcctgagc gggccgcagg cagcgccctc acccctgtcc cctccccagc ctgcacccac480tccattgaag atgtacccgt ccatgcccgc tttctcccct gggcctggta tcaaggaaga540gtcagtgcca ctgagcatcc tgcagacccc caccccacag cccctgccag gggccctcct600gccacagagc ttcccagccc cagccccacc gcagttcagc tccacccctg tgttaggcta660ccccagccct ccgggaggct tctctacagg aagccctccc gggaacaccc agcagccgct720gcctggcctg ccactggctt ccccgccagg ggtcccgccc gtctccttgc acacccaggt780ccagagtgtg gtcccccagc agctactgac agtcacagct gcccccacgg cagcccctgt840aacgaccact gtgacctcgc agatccagca ggtcccggtc ctgctgcagc cccacttcat900caaggcagac tcgctgcttc tgacagccat gaagacagac ggagccactg tgaaggcggc960aggtctcagt cccctggtct ctggcaccac tgtgcagaca gggcctttgc cgaccctggt 1020
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<221>人脂肪酸去飽和酶1(FADS1)
<222>(1)..(4213)<223>Unigene ID Hs.132898的基因的代表性cDNA序列(NM_013402.3，到2003年3月24日為止)<400>3tccactcctg gagcccgcgg accccgagca cgcgcctgac agcccctgct ggcccggcgc 60gcggcgtcgc caggccagct atggcccccg acccggtggc cgccgagacc gcggctcagg120gacctacccc gcgctacttc acctgggacg aggtggccca gcgctcaggg tgcgaggagc180ggtggctagt gatcgaccgt aaggtgtaca acatcagcga gttcacccgc cggcatccag240ggggctcccg ggtcatcagc cactacgccg ggcaggatgc cacggatccc tttgtggcct300tccacatcaa caagggcctt gtgaagaagt atatgaactc tctcctgatt ggagaactgt360ctccagagca gcccagcttt gagcccacca agaataaaga gctgacagat gagttccggg420agctgcgggc cacagtggag cggatggggc tcatgaaggc caaccatgtc ttcttcctgc480tgtacctgct gcacatcttg ctgctggatg gtgcagcctg gctcaccctt tgggtctttg540ggacgtcctt tttgcccttc ctcctctgtg cggtgctgct cagtgcagtt caggcccagg600ctggctggct gcagcatgac tttgggcacc tgtcggtctt cagcacctca aagtggaacc660atctgctaca tcattttgtg attggccacc tgaagggggc ccccgccagt tggtggaacc720acatgcactt ccagcaccat gccaagccca actgcttccg caaagaccca gacatcaaca780tgcatccctt cttctttgcc ttggggaaga tcctctctgt ggagcttggg aaacagaaga840aaaaatatat gccgtacaac caccagcaca aatacttctt cctaattggg cccccagcct900tgctgcctct ctacttccag tggtatattt tctattttgt tatccagcga aagaagtggg960
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<220>
<221>人脂肪酸去飽和酶2(FADS2)<222>(1)..(3149)<223>Unigene ID Hs.184641的基因的代表性cDNA序列(NM_004265.2，到2003年3月24日為止)<400>4agggggcgcg gtgggaggag taggagaaga caaaagccga aagcgaagag ggcccgggct 60gcacacaccg gctgggaggc agccgtctgt gcagcgagca gccggcgcgg ggaggccgca120gtgcacgggg cgtcacagtc ggcaggcagc atggggaagg gagggaacca gggcgagggg180gccgccgagc gcgaggtgtc ggtgcccacc ttcagctggg aggagattca gaagcataac240ctgcgcaccg acaggtggct ggtcattgac cgcaaggttt acaacatcac caaatggtcc300atccagcacc cggggggcca gcgggtcatc gggcactacg ctggagaaga tgcaacggat360gccttccgcg ccttccaccc tgacctggaa ttcgtgggca agttcttgaa acccctgctg420attggtgaac tggccccgga ggagcccagc caggaccacg gcaagaactc aaagatcact480gaggacttcc gggccctgag gaagacggct gaggacatga acctgttcaa gaccaaccac540gtgttcttcc tcctcctcct ggcccacatc atcgccctgg agagcattgc atggttcact600gtcttttact ttggcaatgg ctggattcct accctcatca cggcctttgt ccttgctacc660tctcaggccc aagctggatg gctgcaacat gattatggcc acctgtctgt ctacagaaaa720cccaagtgga accaccttgt ccacaaattc gtcattggcc acttaaaggg tgcctctgcc780aactggtgga atcatcgcca cttccagcac cacgccaagc ctaacatctt ccacaaggat840
cccgatgtga acatgctgca cgtgtttgtt ctgggcgaat ggcagcccat cgagtacggc 900aagaagaagc tgaaatacct gccctacaat caccagcacg aatacttctt cctgattggg 960ccgccgctgc tcatccccat gtatttccag taccagatca tcatgaccat gatcgtccat1020aagaactggg tggacctggc ctgggccgtc agctactaca tccggttctt catcacctac1080atccctttct acggcatcct gggagccctc cttttcctca acttcatcag gttcctggag1140agccactggt ttgtgtgggt cacacagatg aatcacatcg tcatggagat tgaccaggag1200gcctaccgtg actggttcag tagccagctg acagccacct gcaacgtgga gcagtccttc1260ttcaacgact ggttcagtgg acaccttaac ttccagattg agcaccacct cttccccacc1320atgccccggc acaacttaca caagatcgcc ccgctggtga agtctctatg tgccaagcat1380ggcattgaat accaggagaa gccgctactg agggccctgc tggacatcat caggtccctg1440aagaagtctg ggaagctgtg gctggacgcc taccttcaca aatgaagcca cagcccccgg1500gacaccgtgg ggaaggggtg caggtggggt gatggccaga ggaatgatgg gcttttgttc1560tgaggggtgt ccgagaggct ggtgtatgca ctgctcacgg accccatgtt ggatctttct1620ccctttctcc tctccttttt ctcttcacat ctcccccata gcaccctgcc ctcatgggac1680ctgccctccc tcagccgtca gccatcagcc atggccctcc cagtgcctcc tagccccttc1740ttccaaggag cagagaggtg gccaccgggg gtggctctgt cctacctcca ctctctgccc1800ctaaagatgg gaggagacca gcggtccatg ggtctggcct gtgagtctcc ccttgcagcc1860tggtcactag gcatcacccc cgctttggtt cttcagatgc tcttggggtt cataggggca1920ggtcctagtc gggcagggcc cctgaccctc ccggcctggc ttcactctcc ctgacggctg1980ccattggtcc accctttcat agagaggcct gctttgttac aaagctcggg tctccctcct2040
gcagctcggt taagtacccg aggcctctct taagatgtcc agggccccag gcccgcgggc2100acagccagcc caaaccttgg gccctggaag agtcctccac cccatcacta gagtgctctg2160accctgggct ttcacgggcc ccattccacc gcctccccaa cttgagcctg tgaccttggg2220accaaagggg gagtccctcg tctcttgtga ctcagcagag gcagtggcca cgttcaggga2280ggggccggct ggcctggagg ctcagcccac cctccagctt ttcctcaggg tgtcctgagg2340tccaagattc tggagcaatc tgacccttct ccaaaggctc tgttatcagc tgggcagtgc2400cagccaatcc ctggccattt ggccccaggg gacgtgggcc ctgcaggctg caggagggca2460ctggagctgg gaggtctcgt cccagccctc cccatctcgg ggctgctgtg tggacggcgc2520tgcctcaggc actctcctgt ctgaacctgc ccttactgtg tttaacctgt tgctccagga2580tgcattctga taggaggggg cggcagggct gggccttgtg acaatctgcc tttcaccaca2640tggccttgcc tcggtggccc tgactgtcag ggagggccag ggaggcagag cgggagggag2700tctcaggagg aggctgccct gaggggctgg ggagggggta cctcatgagg accagggtgg2760agctgagaag aggaggaggt gggggctgga ggtgctggta gctgagggga cgggcaagtg2820agaggggagg gagggaagtc ctgggaggat cctgagctgc tgttgcagtc taacccacta2880atcagttctt agattcaggg gaagggcagg caccaacaac tcagaatggg ggctttcggg2940gagggcgcct agtcccccca gctctaagca gccaggaggg acctgcatct aagcatctgg3000gttgccatgg caatggcatg ccccccagct actgtatgcc cccgaccccc gcagaggcag3060aatgaaccca tagggagctg atcgtaatgt ttatcatgtt acttccccac ccctacattt3120tttgaaataa aataaggaat tttattctc 3149
<210>5<211>2194<212>DNA<213>人<220>
<221>人，類似于細(xì)胞色素b-561，克隆MGC2190<222>(1)..(2194)<223>Unigene ID Hs.3555264的基因的代表性cDNA序列(BC002976.1，到2003年3月24日為止)<400>5cctcgtgccg agcgacccgg gcaagcgacc cgggcgcggc gcggggaggc tgaagggacg 60ctcgggtagg caagcgtttg cctcagcatg gagggcgggg cctcggcagc cacccccaca120gcactgcctt actacgtggc cttctcccag ctgctgggcc tgaccttggt ggccatgacc180ggcgcgtggc tcgggctgta ccgaggcggc attgcctggg agagcgacct gcagttcaac240gcgcaccccc tctgcatggt cataggcctg atcttcctgc agggaaatgc cctgctggtt300taccgtgtct tcaggaacga agctaaacgc accaccaagg tcctgcacgg gctgctgcac360atctttgcgc tcgtcatcgc cctggttggc ttggtggcgg tgttcgacta ccacaggaag420aagggctacg ctgacctgta cagcctacac agctggtgcg ggatccttgt ctttgtcctg480tactttgtgc agtggctggt gggcttcagc ttcttcctgt tccccggagc ttcattctcc540ctgcggagcc gctaccgccc acagcacatc ttctttggtg ctaccatctt cctcctttcc600
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ttctccttat ctgctgccca tctttccagg aagtcaggat ggagtcagaa caactacagt1860catcccccgt ggtgtctgca catcactcca gccccataaa gagtgtcatg ttagctgagt1920caccatttgg cttcggcctg gaaatagtgt gattagaaca ctgatcgtgt gcgaggccag1980gagatcaaga ccatcctgac taacaaacac agtgaaaccc cgtctctact aaaaatacaa2040aaaaattagc caggcgtggt ggtgggcgcc tgtagtccca gctacttggg aggctgaggc2100aggagaatgg tgtgaacccg ggagatggcg cttgcagtga gctgagattg cactccagcc2160tgggcgacag gctcaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa2194<210>6<211>1496<212>DNA<213>人<220>
<221>人白介素15(IL15)，轉(zhuǎn)錄變體3<222>(1)..(1496)<223>Unigene ID Hs.168132的基因的代表性cDNA序列(NM_000585.2，到2003年3月24日為止)<400>6gactccgggt ggcaggcgcc cgggggaatc ccagctgact cgctcactgc cttcgaagtc60cggcgccccc cgggagggaa ctgggtggcc gcaccctccc ggctgcggtg gctgtcgccc 120
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<221>人LIP相關(guān)蛋白-α2mRNA，PPFIA2<222>(1)..(4060)<223>
<400>7gattccggga ggcaagtgag gagagaagat gctgtagcgt cctcaccggc tgccagcagg60gaaatggtcc aggagtgctg ggtgtgagcc tcccttctcc tcaagccgga gactgcggtt 120gtcattgatc aattgaagaa gcaaggaccc gaaatcacag acattagcaa tgatgtgtga 180agtgatgccc acgattaatg aggacacccc aatgagccaa agggggtccc aaagcagtgg 240ctcggactca gactcccatt ttgagcagct gatggtgaat atgctagatg aaagggatcg 300tcttctagac acccttcggg agacccagga aagcctctca cttgcccagc aaagacttca 360ggatgtcatc tatgaccgag actcactcca gagacagctc aattcagccc tgccacagga 420
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aagaagacga gcagtgaaaa cctttgtgaa aactgaattc 4060<210>8<211>1559<212>DNA<213>人<220>
<221>人絲氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制劑，進(jìn)化枝Ineuroserpin)，成員1(SERPINI1)<222>(1)..(1559)<223>Unigene ID Hs.78589的基因的代表性cDNA序列(NM_005025.1，到2003年3月24日為止)<400>8gcggagcaca gtccgccgag cacaagctcc agcatcccgt caggggttgc aggtgtgtgg60gaggcttgaa actgttacaa tatggctttc cttggactct tctctttgct ggttctgcaa 120agtatggcta caggggccac tttccctgag gaagccattg ctgacttgtc agtgaatatg 180tataatcgtc ttagagccac tggtgaagat gaaaatattc tcttctctcc attgagtatt 240gctcttgcaa tgggaatgat ggaacttggg gcccaaggat ctacccagaa agaaatccgc 300cactcaatgg gatatgacag cctaaaaaat ggtgaagaat tttctttctt gaaggagttt 360tcaaacatgg taactgctaa agagagccaa tatgtgatga aaattgccaa ttccttgttt 420gtgcaaaatg gatttcatgt caatgaggag tttttgcaaa tgatgaaaaa atattttaat 480
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<211>4148<212>DNA<213>人<220>
<221>KIAA0763蛋白質(zhì)的人mRNA<222>(1)..(4148)<223>Unigene ID Hs.4764的基因的代表性cDNA序列(AB018306.1，到2003年3月24日為止)<400>9gacctccatc ctgcgcaagc aggctgagga ggaggccatc aagcgctcac gctcactctc60cgagagctat gagctctcct cggacctgca ggacaagtag gtggagatgc tagaacgaaa 120gtatgggggg cgcctggtaa cccgccatgc ggcccgcacc atccagacgg cgtttcgcca 180gtaccagatg aacaagaact tcgagcgctt gcgcagctcc atgtcagaga accgcatgtc 240acgccggatt gtgctgtcca acatgaggat gcagttctcc tttgaggggc ctgagaaagt 300gcacagctcc tacttcgagg ggaagcaggt ctcagtgact aacgacggct cccagctggg 360agccctggtg tcccctgagt gtggtgacct cagcgagccc accaccctca agtctccggc 420cccctccagt gactttgcgg acgccatcac cgagctggag gacgccttct ctaggcaagt 480gaaatcactg gccgagtcca tcgacgatgc cctcaactgc cgcagcctgc acactgagga 540ggcaccggcc ctggatgcgg cgcgggcccg ggacaccgaa ccccagacag ccctgcacgg 600catggaccac cgcaaactgg acgagatgac ggcctcgtac agtgatgtca ccctgtacat 660
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<210>10<211>1015<212>DNA<213>人<220>
<221>人肽基脯氨酰基異構(gòu)酶C(親環(huán)蛋白C)PPIC<222>(1)..(1015)<223>Unigene ID Hs.110364的基因的代表性cDNA序列(NM_000943.2，到2003年3月24日為止)<400>10ggcacgaggc ccgtcagctg tcccagagcc tgtgtcgcgc ccgtgccggt agcgcccgtg60ccggtagcgc cgctgccacc gctcaccatg ggcccgggtc ctcggctgct gctacctctc 120gtgctttgcg tggggctcgg cgcacttgtg ttttcttcgg gggccgaggg cttccgcaag 180cgaggcccct cggtgacggc caaggtcttc tttgatgtga ggattggaga caaagatgtt 240ggcagaattg tgattggcct ctttggaaaa gttgtgccca agacagtgga aaattttgtt 300gctctagcaa caggagagaa aggatatgga tataaaggaa gcaagtttca tcgtgtcatc 360aaggatttca tgattcaagg aggtgacatc accactggag atggcactgg gggtgtgagc 420atctatggtg agacatttcc agatgagaac ttcaagctga agcactatgg cattgggtgg 480gtcagcatgg ccaacgctgg gcctgacacc aatggctctc agttctttat caccttgacc 540aagcccacct ggttggacgg caaacatgtg gtgtttggaa aagtcattga tgggatgaca 600
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<221>人LAG1壽命保證同系物1<222>(1)..(2565)<223>Unigene ID Hs.348258的基因的代表性cDNA序列(NM_021267.1，到2003年3月24日為止)<400>11acgcggggcg cgcggctccg tcggctaccg cgggcgggcg caggcgacgg gcacggcggg60cgagcgggcg gtatggcggc ggcggggccc gcggcggggc cgacggggcc cgagcccatg 120
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cgggcaggga cgcgggccca acaataaatg ccgcgtggtc tgctc2565<210>12<211>2880<212>DNA<213>人<220>
<221>激活的T細(xì)胞、胞質(zhì)的、鈣依賴磷酸酶-依賴性核因子4(NFATC4)<222>(1)..(2880)<223>Unigene ID Hs.77810的基因的代表性cDNA序列(NM_004554.1，到2003年3月24日為止)<400>12gcttctggag ggaggcggca gcgacggagg agggggcttc tcagagaaag ggagggaggg60agccacccgg gtgaagatac agcagcctcc tgaactcccc cctcccaccc aggccgggac 120ctgggggctc ctgccggatc catgggggcg gccagctgcg aggatgagga gctggaattt 180aagctggtgt tcggggagga aaaggaggcc cccccgctgg gcgcgggggg attgggggaa 240gaactggact cagaggatgc cccgccatgc tgccgtctgg ccttgggaga gccccctccc 300tatggcgctg cacctatcgg tattccccga cctccacccc ctcggcctgg catgcattcg 360ccaccgccgc gaccagcccc ctcacctggc acctgggaga gccagcccgc caggtcggtg 420
aggctgggag gaccaggagg gggtgctggg ggtgctgggg gtggccgtgt tctcgagtgt480cccagcatcc gcatcacctc catctctccc acgccggagc cgccagcagc gctggaggac540aaccctgatg cctgggggga cggctctcct agagattacc ccccaccaga aggctttggg600ggctacagag aagcaggggc ccagggtggg ggggccttct tcagcccaag ccctggcagc660agcagcctgt cctcgtggag cttcttctcc gatgcctctg acgaggcagc cctgtatgca720gcctgcgacg aggtggagtc tgagctaaat gaggcggcct cccgctttgg cctgggctcc780ccgctgccct cgccccgggc ctcccctcgg ccatggaccc ccgaagatcc ctggagcctg840tatggtccaa gccccggagg ccgagggcca gaggatagct ggctactcct cagtgctcct900gggcccaccc cagcctcccc gcggcctgcc tctccatgtg gcaagcggcg ctattccagc960tcgggaaccc catcttcagc ctccccagct ctgtcccgcc gtggcagcct gggggaagag 1020gggtctgagc cacctccacc acccccattg cctctggccc gggacccggg ctcccctggt 1080ccctttgact atgtgggggc cccaccagct gagagcatcc ctcagaagac acggcggact 1140tccagcgagc aggcagtggc tctgcctcgg tctgaggagc ctgcctcatg caatgggaag 1200ctgcccttgg gagcagagga gtctgtggct cctccaggag gttcccggaa ggaggtggct 1260ggcatggact acctggcagt gccctcccca ctcgcttggt ccaaggcccg gattggggga 1320cacagcccta tcttcaggac ctctgcccta cccccactgg actggcctct gcccagccaa 1380tatgagcagc tggagctgag gatcgaggta cagcctagag cccaccaccg ggcccactat 1440gagacagaag gcagccgtgg agctgtcaaa gctgcccctg gcggtcaccc cgtagtcaag 1500ctcctaggct acagtgagaa gccactgacc ctacagatgt tcatcggcac tgcagatgaa 1560aggaacctgc ggcctcatgc cttctatcag gtgcaccgta tcacaggcaa gatggtggcc 1620
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<221>人核受體的mRNA<222>(1)..(2546)<223>Unigene ID Hs.80561的基因的代表性cDNA序列(X89894.1，到2003年3月24日為止)<400>13gagcggagtc tcctgcctcc cgccccccac ccctccagct cctgctcctc ctccgctccc60catacacaga cgcgctcaca cccgctccct cactcgcaca cacagacaca agcgcgcaca 120caggctccgc acacacactt cgctctcccg cgcgctcaca cccctcttgc cctgagccct 180tgccggtgca gcgcggcgcc gcagctggac gcccctcccg ggctcacttt gcaacgctga 240cggtgccggc agtggccgtg gaggtgggaa cagcggcggc atcctccccc ctggtcacag 300cccaagccag gacgcccgcg gaacctctcg gctgtgctct cccatgagtc gggatcgcag 360catcccccac cagccgctca ccgcctccgg gagccgctgg gcttgtacac cgcagccctt 420ccgggacagc agctgtgact cccccccagt gcagatttcg ggacagctct ctagaaactc 480
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<220>
<221>人脯氨酸脫氫酶(氧化酶)2(PRODH2)<222>(1)..(1677)<223>Unigene ID Hs.128834的基因的代表性cDNA序列(NM_021232.1，到2003年3月24日為止)<400>14tagagatggg gtctcactat gtcgcccagg gtagtctcaa actcctcggt cttggcctcc60caaagtgttg ggattacaaa cgtgagaacc gtattttcaa atgtattcaa taacactaca 120gcgtttccaa ttttaagagg aagcaattgc cacaaaatca ctgcccctgg tctgggcaag 180gggcagttgg tgaacttgct gcctccagag aaccttccct ggtgtggagg cagccaggga 240cccaggatgc tccggacctg ttacgtgctc tgttcccaag ctggtccccc ctccaggggc 300tggcagtccc tgagctttga tggcggggcc ttccacctta agggcacagg agagctgaca 360cgggccttgc tggttctccg gctgtgtgcc tggcccccac tcgtcactca cgggctgttg 420ctccaggcct ggtctcggcg actcctgggc tcccggctct caggcgcatt tctccgagca 480tccgtctatg ggcagtttgt ggctggtgag acagcagagg aggtgaaggg ctgcgtgcag 540cagctgcgga ccctcagcct ccgaccactg ctggcagtgc ccactgagga ggagccggac 600tctgctgcca agagtggtga ggcgtggtat gaggggaacc tcggtgctat gctgcggtgt 660gtggacctgt cacggggcct cctggagccc cccagcctgg ctgaggccag cctcatgcag 720ctgaaggtga cggcgctgac cagtactcgg ctctgtaagg agctagcctc gtgggtcaga 780aggccaggag cctccttgga gctgagcccc gagaggctgg ctgaagctat ggactctggg 840
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<221>人蛋白質(zhì)激酶C，1(PRKCI)<222>(1)..(2261)<223>Unigene ID Hs.1904的基因的代表性cDNA序列(NM_002740.1，到2003年3月24日為止)<400>15ccgcggttcc ggctgctccg gcgaggcgac ccttgggtcg gcgctgcggg cgaggtgggc 60aggtaggtgg gcggacggcc gcggttctcc ggcaagcgca ggcggcggag tcccccacgg120cgcccgaagc gccccccgca cccccggcct ccagcgttga ggcgggggag tgaggagatg180ccgacccaga gggacagcag caccatgtcc cacacggtcg caggcggcgg cagcggggac240cattcccacc aggtccgggt gaaagcctac taccgcgggg atatcatgat aacacatttt300gaaccttcca tctcctttga gggcctttgc aatgaggttc gagacatgtg ttcttttgac360aacgaacagc tcttcaccat gaaatggata gatgaggaag gagacccgtg tacagtatca420tctcagttgg agttagaaga agcctttaga ctttatgagc taaacaagga ttctgaactc480ttgattcatg tgttcccttg tgtaccagaa cgtcctggga tgccttgtcc aggagaagat540aaatccatct accgtagagg tgcacgccgc tggagaaagc tttattgtgc caatggccac600actttccaag ccaagcgttt caacaggcgt gctcactgtg ccatctgcac agaccgaata660tggggacttg gacgccaagg atataagtgc atcaactgca aactcttggt tcataagaag720tgccataaac tcgtcacaat tgaatgtggg cggcattctt tgccacagga accagtgatg780cccatggatc agtcatccat gcattctgac catgcacaga cagtaattcc atataatcct840tcaagtcatg agagtttgga tcaagttggt gaagaaaaag aggcaatgaa caccagggaa900
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<221>人ATP-結(jié)合盒轉(zhuǎn)運蛋白-1的mRNA(ABC-1)<222>(1)..(6880)<223>Unigene ID Hs.211562的基因的代表性cDNA序列(AJ012376.1，到2003年3月24日為止)<400>16caaacatgtc agctgttact ggaagtggcc tggcctctat ttatcttcct gatcctgatc 60tctgttcggc tgagctaccc accctatgaa caacatgaat gccattttcc aaataaagcc120atgccctctg caggaacact tccttgggtt caggggatta tctgtaatgc caacaacccc180tgtttccgtt acccgactcc tggggaggct cccggagttg ttggaaactt taacaaatcc240attgtggctc gcctgttctc agatgctcgg aggcttcttt tatacagcca gaaagacacc300agcatgaagg acatgcgcaa agttctgaga acattacagc agatcaagaa atccagctca360
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<221>人ATP-結(jié)合盒，亞家族G(WHITE)，成員1(ABCG1)，轉(zhuǎn)錄變體1<222>(1)..(2930)<223>Unigene ID Hs.10237的基因的代表性cDNA序列(NM_004915，到2003年3月24日為止)<400>17
gaattccggt ttcttcctaa aaaatgtctg atggccgctt tctcggtcgg caccgccatg 60aatgccagca gttactctgc agagatgacg gagcccaagt cggtgtgtgt ctcggtggat120gaggtggtgt ccagcaacat ggaggccact gagacggacc tgctgaatgg acatctgaaa180aaagtagata ataacctcac ggaagcccag cgcttctcct ccttgcctcg gagggcagct240gtgaacattg aattcaggga cctttcctat tcggttcctg aaggaccctg gtggaggaag300aaaggataca agaccctcct gaaaggaatt tccgggaagt tcaatagtgg tgagttggtg360gccattatgg gtccttccgg ggccgggaag tccacgctga tgaacatcct ggctggatac420agggagacgg gcatgaaggg ggccgtcctc atcaacggcc tgccccggga cctgcgctgc480ttccggaagg tgtcctgcta catcatgcag gatgacatgc tgctgccgca tctcactgtg540caggaggcca tgatggtgtc ggcacatctg aagcttcagg agaaggatga aggcagaagg600gaaatggtca aggagatact gacagcgctg ggcttgctgt cttgcgccaa cacgcggacc660gggagcctgt caggtggtca gcgcaagcgc ctggccatcg cgctggagct ggtgaacaac720cctccagtca tgttcttcga tgagcccacc agcggcctgg acagcgcctc ctgcttccag780gtggtctcgc tgatgaaagg gctcgctcaa gggggtcgct ccatcatttg caccatccac840cagcccagcg ccaaactctt cgagctgttc gaccagcttt acgtcctgag tcaaggacaa900tgtgtgtacc ggggaaaagt ctgcaatctt gtgccatatt tgagggattt gggtctgaac960tgcccaacct accacaaccc agcagatttt gtcatggagg ttgcatccgg cgagtacggt 1020gatcagaaca gtcggctggt gagagcggtt cgggagggca tgtgtgactc agaccacaag 1080agagacctcg ggggtgatgc cgaggtgaac ccttttcttt ggcaccgccc ctctgaagag 1140ataaagcaga caaaacgatt aaaggggttg agaaaggact cctcgtccat ggaaggctgc 1200
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<221>人脫脂載脂蛋白C-I(APOC1)<222>(1)..(417)<223>Unigene ID Hs.268571的基因的代表性cDNA序列(NM_001645.2，到2003年3月24日為止)<400>18
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<221>人脫脂載脂蛋白E(APOE)<222>(1)..(1156)<223>Unigene ID Hs.169401的基因的代表性cDNA序列(NM_000041.1，到2003年3月24日為止)<400>19cgcagcggag gtgaaggacg tccttcccca ggagccgact ggccaatcac aggcaggaag60atgaaggttc tgtgggctgc gttgctggtc acattcctgg caggatgcca ggccaaggtg 120
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<221>人酸性鞘磷脂酶磷酸二酯酶(ASM3A)，<222>(1)..(1768)<223>Unigene ID Hs.42945的基因的代表性cDNA序列(NM_006714.1到2003年3月24日為止)<400>20ggcacgaggc tcaggcctga cggtccgagt ggagctgcgg gacagcccga acctccaggt60cagccccgcg gccctccatg gcgctggtgc gcgcactcgt ctgctgcctg ctgactgcct 120ggcactgccg ctccggcctc gggctgcccg tggcgcccgc aggcggcagg aatcctcctc 180cggcgatagg acagttttgg catgtgactg acttacactt agaccctact taccacatca 240cagatgacca cacaaaagtg tgtgcttcat ctaaaggtgc aaatgcctcc aaccctggcc 300cttttggaga tgttctgtgt gattctccat atcaacttat tttgtcagca tttgatttta 360ttaaaaattc tggacaagaa gcatctttca tgatatggac aggggatagc ccacctcatg 420ttcctgtacc tgaactctca acagacactg ttataaatgt gatcactaat atgacaacca 480ccatccagag tctctttcca aatctccagg ttttccctgc gctgggtaat catgactatt 540ggccacagga tcaactgcct gtagtcacca gtaaagtgta caatgcagta gcaaacctct 600ggaaaccatg gctagatgaa gaagctatta gtactttaag gaaaggtggt ttttattcac 660
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<221>人Cdc42效應(yīng)蛋白4 mRNA<222>(1)..(1170)<223>Unigene ID Hs.3903的基因的代表性cDNA序列(AF099664.1)到2003年3月24日為止)<400>21actggacttg gacttcagat ctgaccccag acctgccggc tacctcggga gggcccacct60ccccgcccat ccagcaagat gccaatcctc aagcaactgg tgtccagctc ggtgcactcc 120aagcgccgtt cccgagcgga cctcacggcc gagatgatca gcgccccgct ggggactttc 180cgccacacca tgcacgttgg ccgggccgga gacgcctttg gggacacctc cttcctcaat 240agcaaggctg gcgagcccga cggcgagtcc ttggacgaac agccctcttc ttcatcttcc 300aaacgcagtc tcctgtccag gaagttccgg ggcagcaagc ggtcacagtc ggtgaccagg 360ggggagcggg agcagcgtga catgctgggc tccctgcggg actcggccct gtttgtcaag 420aatgccatgt ccctccccca gctcaatgag aaggaggccg cggagaaggg caccagtaag 480ctgcccaaga gcctgtcatc cagccccgtg aagaaggcca atgacgggga gggcggcgat 540gaggaggcgg gcacggagga ggcagtgccc cgtcggaatg gggccgcggg tccacattcc 600
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<221>人趨化因子(C-X-C基序)受體4(CXCR4)<222>(1)..(1679)<223>Unigene ID Hs.89414的基因的代表性cDNA序列(NM_003467)到2003年3月24日為止)
<400>22gtttgttggc tgcggcagca ggtagcaaag tgacgccgag ggcctgagtg ctccagtagc 60caccgcatct ggagaaccag cggttaccat ggaggggatc agtatataca cttcagataa120ctacaccgag gaaatgggct caggggacta tgactccatg aaggaaccct gtttccgtga180agaaaatgct aatttcaata aaatcttcct gcccaccatc tactccatca tcttcttaac240tggcattgtg ggcaatggat tggtcatcct ggtcatgggt taccagaaga aactgagaag300catgacggac aagtacaggc tgcacctgtc agtggccgac ctcctctttg tcatcacgct360tcccttctgg gcagttgatg ccgtggcaaa ctggtacttt gggaacttcc tatgcaaggc420agtccatgtc atctacacag tcaacctcta cagcagtgtc ctcatcctgg ccttcatcag480tctggaccgc tacctggcca tcgtccacgc caccaacagt cagaggccaa ggaagctgtt540ggctgaaaag gtggtctatg ttggcgtctg gatccctgcc ctcctgctga ctattcccga600cttcatcttt gccaacgtca gtgaggcaga tgacagatat atctgtgacc gcttctaccc660caatgacttg tgggtggttg tgttccagtt tcagcacatc atggttggcc ttatcctgcc720tggtattgtc atcctgtcct gctattgcat tatcatctcc aagctgtcac actccaaggg780ccaccagaag cgcaaggccc tcaagaccac agtcatcctc atcctggctt tcttcgcctg840ttggctgcct tactacattg ggatcagcat cgactccttc atcctcctgg aaatcatcaa900gcaagggtgt gagtttgaga acactgtgca caagtggatt tccatcaccg aggccctagc960tttcttccac tgttgtctga accccatcct ctatgctttc cttggagcca aatttaaaac 1020ctctgcccag cacgcactca cctctgtgag cagagggtcc agcctcaaga tcctctccaa 1080aggaaagcga ggtggacatt catctgtttc cactgagtct gagtcttcaa gttttcactc 1140
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<221>人脂肪酸合酶(FASN)<222>(1)..(8461)<223>Unigene ID Hs.213289的基因的代表性cDNA序列(NM_004104.3)到2003年3月24日為止)<400>23
gagggagcca gagagacggc agcggccccg gcctccctct ccgccgcgct tcagcctccc 60gctccgccgc gctccagcct cgctctccgc cgcccgcacc gccgcccgcg ccctcaccag120agcagccatg gaggaggtgg tgattgccgg catgtccggg aagctgccag agtcggagaa180cttgcaggag ttctgggaca acctcatcgg cggtgtggac atggtcacgg acgatgaccg240tcgctggaag gcggggctct acggcctgcc ccggcggtcc ggcaagctga aggacctgtc300taggtttgat gcctccttct tcggagtcca ccccaagcag gcacacacga tggaccctca360gctgcggctg ctgctggaag tcacctatga agccatcgtg gacggaggca tcaacccaga420ttcactccga ggaacacaca ctggcgtctg ggtgggcgtg agcggctctg agacctcgga480ggccctgagc cgagaccccg agacactcgt gggctacagc atggtgggct gccagcgagc540gatgatggcc aaccggctct ccttcttctt cgacttcaga gggcccagca tcgcactgga600cacagcctgc tcctccagcc tgatggccct gcagaacgcc taccaggcca tccacagcgg660gcagtgccct gccgccatcg tggggggcat caatgtcctg ctgaagccca acacctccgt720gcagttcttg aggctgggga tgctcagccc cgagggcacc tgcaaggcct tcgacacagc780ggggaatggg tactgccgct cggagggtgt ggtggccgtc ctgctgacca agaagtccct840ggcccggcgg gtgtacgcca ccatcctgaa cgccggcacc aatacagatg gcttcaagga900gcaaggcgtg accttcccct caggggatat ccaggagcag ctcatccgct cgttgtacca960gtcggccgga gtggcccctg agtcatttga atacatcgaa gcccacggca caggcaccaa 1020ggtgggcgac ccccaggagc tgaatggcat cacccgagcc ctgtgcgcca cccgccagga 1080gccgctgctc atcggctcca ccaagtccaa catggggcac ccggagccag cctcggggct 1140ggcagccctg gccaaggtgc tgctgtccct ggagcacggg ctctgggccc ccaacctgca 1200
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<221>人低密度脂蛋白受體(家族性高膽固醇血癥)(LDLR)<222>(1)..(5175)<223>Unigene ID Hs.213289的基因的代表性cDNA序列(NM_000527.2)到2003年3月24日為止)<400>24gccccgagtg caatcgcggg aagccagggt ttccagctag gacacagcag gtcgtgatcc60gggtcgggac actgcctggc agaggctgcg agcatggggc cctggggctg gaaattgcgc 120tggaccgtcg ccttgctcct cgccgcggcg gggactgcag tgggcgacag atgtgaaaga 180aacgagttcc agtgccaaga cgggaaatgc atctcctaca agtgggtctg cgatggcagc 240gctgagtgcc aggatggctc tgatgagtcc caggagacgt gcttgtctgt cacctgcaaa 300tccggggact tcagctgtgg gggccgtgtc aaccgctgca ttcctcagtt ctggaggtgc 360gatggccaag tggactgcga caacggctca gacgagcaag gctgtccccc caagacgtgc 420
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gagccgagat tgcgccactg cagtccgcag tctggcctgg gcgacagagc gagactccgt4080ctcaaaaaaa acaaaacaaa aaaaaaccat gcatggtgca tcagcagccc atggcctctg4140gccaggcatg gcgaggctga ggtgggagga tggtttgagc tcaggcattt gaggctgtcg4200tgagctatga ttatgccact gctttccagc ctgggcaaca tagtaagacc ccatctctta4260aaaaatgaat ttggccagac acaggtgcct cacgcctgta atcccagcac tttgggaggc4320tgagctggat cacttgagtt caggagttgg agaccaggcc tgagcaacaa agcgagatcc4380catctctaca aaaaccaaaa agttaaaaat cagctgggta tggtggcacg tgcctgtgat4440cccagctact tgggaggctg aggcaggagg atcgcctgag cccaggaggt ggaggttgca4500gtgagccatg atcgagccac tgcactccag cctgggcaac agatgaagac cctatttcag4560aaatacaact ataaaaaaaa taaataaatc ctccagtctg gatcgtttga cgggacttca4620ggttctttct gaaatcgccg tgttactgtt gcactgatgt ccggagagac agtgacagcc4680tccgtcagac tcccgcgtga agatgtcaca agggattggc aattgtcccc agggacaaaa4740cactgtgtcc cccccagtgc agggaaccgt gataagcctt tctggtttcg gagcacgtaa4800atgcgtccct gtacagatag tggggatttt ttgttatgtt tgcactttgt atattggttg4860aaactgttat cacttatata tatatataca cacatatata taaaatctat ttatttttgc4920aaaccctggt tgctgtattt gttcagtgac tattctcggg gccctgtgta gggggttatt4980gcctctgaaa tgcctcttct ttatgtacaa agattatttg cacgaactgg actgtgtgca5040acgctttttg ggagaatgat gtccccgttg tatgtatgag tggcttctgg gagatgggtg5100tcacttttta aaccactgta tagaaggttt ttgtagcctg aatgtcttac tgtgatcaat5160taaatttctt aaatg 5175
<210>25<211>1528<212>DNA<213>人<220>
<221>人核受體亞家族1，組H，成員3(NR1H3)<222>(1)..(1528)<223>Unigene ID Hs.347353的基因的代表性cDNA序列(NM_005693.1)到2003年3月24日為止)<400>25cagtgccttg gtaatgacca gggctccaga aagagatgtc cttgtggctg ggggcccctg60tgcctgacat tcctcctgac tctgcggtgg agctgtggaa gccaggcgca caggatgcaa 120gcagccaggc ccagggaggc agcagctgca tcctcagaga ggaagccagg atgccccact 180ctgctggggg tactgcaggg gtggggctgg aggctgcaga gcccacagcc ctgctcacca 240gggcagagcc cccttcagaa cccacagaga tccgtccaca aaagcggaaa aaggggccag 300cccccaaaat gctggggaac gagctatgca gcgtgtgtgg ggacaaggcc tcgggcttcc 360actacaatgt tctgagctgc gagggctgca agggattctt ccgccgcagc gtcatcaagg 420gagcgcacta catctgccac agtggcggcc actgccccat ggacacctac atgcgtcgca 480agtgccagga gtgtcggctt cgcaaatgcc gtcaggctgg catgcgggag gagtgtgtcc 540
tgtcagaaga acagatccgc ctgaagaaac tgaagcggca agaggaggaa caggctcatg600ccacatcctt gccccccagg cgttcctcac ccccccaaat cctgccccag ctcagcccgg660aacaactggg catgatcgag aagctcgtcg ctgcccagca acagtgtaac cggcgctcct720tttctgaccg gcttcgagtc acgccttggc ccatggcacc agatccccat agccgggagg780cccgtcagca gcgctttgcc cacttcactg agctggccat cgtctctgtg caggagatag840ttgactttgc taaacagcta cccggcttcc tgcagctcag ccgggaggac cagattgccc900tgctgaagac ctctgcgatc gaggtgatgc ttctggagac atctcggagg tacaaccctg960ggagtgagag tatcaccttc ctcaaggatt tcagttataa ccgggaagac tttgccaaag 1020cagggctgca agtggaattc atcaacccca tcttcgagtt ctccagggcc atgaatgagc 1080tgcaactcaa tgatgccgag tttgccttgc tcattgctat cagcatcttc tctgcagacc 1140ggcccaacgt gcaggaccag ctccaggtgg agaggctgca gcacacatat gtggaagccc 1200tgcatgccta cgtctccatc caccatcccc atgaccgact gatgttccca cggatgctaa 1260tgaaactggt gagcctccgg accctgagca gcgtccactc agagcaagtg tttgcactgc 1320gtctgcagga caaaaagctc ccaccgctgc tctctgagat ctgggatgtg cacgaatgac 1380tgttctgtcc ccatattttc tgttttcttg gccggatggc tgaggcctgg tggctgcctc 1440ctagaagtgg aacagactga gaagggcaaa cattcctggg agctgggcaa ggagatcctc 1500ccgtggcatt aaaagagagt caaagggt 1528<210>26<211>3308
<212>DNA<213>人<220>
<221>人極低密度脂蛋白受體的mRNA<222>(1)..(3308)<223>Unigene ID Hs.73729的基因的代表性cDNA序列(D16493.1)到2003年3月24日為止)<400>26tttcggaagg gctggtaact tgttgtgcgg agcgaacggc ggcggcggcg gcaccatcca60ggcgggcacc atgggcacgt ccgcgctctg ggcgctctgg ctgctgctcg cgctgtgctg 120ggcgccccgg gagagcggcg ccaccggaac cgggagaaaa gccaaatgtg aaccctccca 180attccagtgc acaaatggtc gctgtattac gctgttgtgg aaatgtgatg gggatgaaga 240ctgtgttgac ggcagtgatg aaaagaactg tgtaaagaag acgtgtgctg aatctgactt 300cgtgtgcaac aatggccagt gtgttcccag ccgatggaag tgtgatggag atcctgactg 360cgaagatggt tcagatgaaa gcccagaaca gtgccatatg agaacatgcc gcatacatga 420aatcagctgt ggcgcccatt ctactcagtg tatcccagtg tcctggagat gtgatggtga 480aaatgattgt gacagtggag aagatgaaga aaactgtggc aatataacat gtagtcccga 540cgagttcacc tgctccagtg gccgctgcat ctccaggaac tttgtatgca atggccagga 600tgactgcagc gatggcagtg atgagctgga ctgtgccccg ccaacctgtg gcgcccatga 660gttccagtgc agcacctcct cctgcatccc catcagctgg gtatgcgacg atgatgcaga 720
ctgctccgac caatctgatg agtccctgga gcagtgtggc cgtcagccag tcatacacac780caagtgtcca gccagcgaaa tccagtgcgg ctctggcgag tgcatccata agaagtggcg840atgtgatggg gaccctgact gcaaggatgg cagtgatgag gtcaactgtc cctctcgaac900ttgccgacct gaccaatttg aatgtgagga tggcagctgc atccatggca gcaggcagtg960taatggtatc cgagactgtg tcgatggttc cgatgaagtc aactgcaaaa atgtcaatca 1020gtgcttgggc cctggaaaat tcaagtgcag aagtggagaa tgcatagata tcagcaaagt 1080atgtaaccag gagcaggact gcagggactg gagtgatgag cccctgaaag agtgtcatat 1140aaacgaatgc ttggtaaata atggtggatg ttctcatatc tgcaaagacc tagttatagg 1200ctacgagtgt gactgtgcag ctgggtttga actgatagat aggaaaacct gtggagatat 1260tgatgaatgc caaaatccag gaatctgcag tcaaatttgt atcaacttaa aaggcggtta 1320caagtgtgaa tgtagtcgtg gctatcaaat ggatcttgct actggcgtgt gcaaggcagt 1380aggcaaagag ccaagtctga tcttcactaa tcgaagagac atcaggaaga ttggcttaga 1440gaggaaagaa tatatccaac tagttgaaca gctaagaaac actgtggctc tcgatgctga 1500cattgctgcc cagaaactat tctgggccga tctaagccaa aaggctatct tcagtgcctc 1560aattgatgac aaggttggta gacatgttaa aatgatcgac aatgtctata atcctgcagc 1620cattgctgtt gattgggtgt acaagaccat ctactggact gatgcggctt ctaagactat 1680ttcagtagct accctagatg gaaccaagag gaagttcctg tttaactctg acttgcgaga 1740gcctgcctcc atagctgtgg acccactgtc tggctttgtt tactggtcag actggggtga 1800accagctaaa atagaaaaag caggaatgaa tggattcgat agacgtccac tggtgacagc 1860ggatatccag tggcctaacg gaattacact tgaccttata aaaagtcgcc tctattggct 1920
tgattctaag ttgcacatgt tatccagcgt ggacttgaat ggccaagatc gtaggatagt1980actaaagtct ctggagttcc tagctcatcc tcttgcacta acaatatttg aggatcgtgt2040ctactggata gatggggaaa atgaagcagt ctatggtgcc aataaattca ctggatcaga2100gctagccact ctagtcaaca acctgaatga tgcccaagac atcattgtct atcatgaact2160tgtacagcca tcaggtaaaa attggtgtga agaagacatg gagaatggag gatgtgaata2220cctatgcctg ccagcaccac agattaatga tcactctcca aaatatacct gttcctgtcc2280cagtgggtac aatgtagagg aaaatggccg agactgtcaa agtactgcaa ctactgtgac2340ttacagtgag acaaaagata cgaacacaac agaaatttca gcaactagtg gactagttcc2400tggagggatc aatgtgacca cagcagtatc agaggtcagt gttcccccaa aagggacttc2460tgccgcatgg gccattcttc ctctcttgct cttagtgatg gcagcagtag gtggctactt2520gatgtggcgg aattggcaac acaagaacat gaaaagcatg aactttgaca atcctgtgta2580cttgaaaacc actgaagagg acctctccat agacattggt agacacagtg cttctgttgg2640acacacgtac ccagcaatat cagttgtaag cacagatgat gatctagctt gacttctgtg2700acaaatgttg acctttgagg tctaaacaaa taataccccc gtcggaatgg aaccgagcca2760gcagctgaag tctctttttc ttcctctcgg ctggaagaac atcaagatac ctttgcgtgg2820atcaagcttg tgtacttgac cgtttttata ttacttttgt aaatattctt gtccacattc2880tacttcagct ttggatgtgg ttaccgagta tctgtaaccc ttgaatttct agacagtatt2940gccacctctg gccaaatatg cactttccct agaaagccat attccagcag tgaaacttgt3000gctatagtgt ataccacctg tacatacatt gtataggcca tctgtaaata tcccagagaa3060caatcactat tcttaagcac tttgaaaata tttctatgta aattattgta aactttttca3120
atggttggga caatggcaat aggacaaaac gggttactaa gatgaaattg ccaaaaaaat3180ttataaacta attttgtacg tatgaatgat atctttgacc tcaatggagg tttgcaaaga3240ctgagtgttc aaactactgt acattttttt tcaagtgcta aaaaattaaa ccaagcagct3300taaccatg 3308<210>27<211>18<212>DNA<213>人<220>
<221>ABCA1正向引物<222>(1)..(18)<223>
<400>27aacccaccac aggcatgg 18<210>28<211>22<212>DNA
<213>人<220>
<221>ABCA1反向引物<222>(1)..(22)<223>
<400>28acacttaggg cacaattcca ca 22<210>29<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>ABCA1探針<222>(1)..(19)<223>
<400>29tcccaaagcc cggcggttc 19
<210>30<211>21<212>DNA<213>人<220>
<221>ABCG1正向引物<222>(1)..(21)<223>
<400>30ccctccagtc atgttcttcg a 21<210>31<211>18<212>DNA<213>人<220>
<221>ABCG1反向引物<222>(1)..(18)<223>
<400>31atgatggagc gaccccct 18<210>32<211>21<212>DNA<213>人<220>
<221>ABCG1探針<222>(1)..(21)<223>
<400>32ccctccagtc atgttcttcg a 21<210>33<211>20<212>DNA<213>人<220>
<221>APOC1正向引物<222>(1)..(20)<223>
<400>33catgaggctc ttcctgtcgc20<210>34<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>APOC1反向引物<222>(1)..(19)<223>
<400>34tgggccttcc aagacgatc 19<210>35<211>23
<212>DNA<213>人<220>
<221>APOC1探針<222>(1)..(23)<223>
<400>35cccggtcctg gtggtggttc tgt23<210>36<211>20<212>DNA<213>人<220>
<221>APOE正向引物<222>(1)..(20)<223>
<400>36cgttgctggt cacattcctg20
<210>37<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>APOE反向引物<222>(1)..(19)<223>
<400>37gctctgtctc caccgcttg 19<210>38<211>22<212>DNA<213>人<220>
<221>APOE探針<222>(1)..(22)
<223>
<400>38caggatgcca ggccaaggtg ga 22<210>39<211>25<212>DNA<213>人<220>
<221>ASM3A正向引物<222>(1)..(25)<223>
<400>39gaatctaaag ggagagtcca tctgg 25<210>40<211>20<212>DNA<213>人
<220>
<221>ASM3A反向引物<222>(1)..(20)<223>
<400>40tccggctgca aatcttcaat20<210>41<211>31<212>DNA<213>人<220>
<221>ASM3A探針<222>(1)..(31)<223>
<400>41agctggagta tatcctgacc cagacctacg a 31<210>42
<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>CDC42EP正向引物<222>(1)..(19)<223>
<400>42tcgggtatga gcccctgag 19<210>43<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>CDC42EP反向引物<222>(1)..(19)<223>
<400>43
ggaggtgggt caggctgtt19<210>44<211>28<212>DNA<213>人<220>
<221>CDC42EP探針<222>(1)..(28)<223>
<400>44ttgactgccg gttatttttc tgtcctgg 28<210>45<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>CXCR4正向引物
<222>(1)..(19)<223>
<400>45gcaggacctg tggccaagt19<210>46<211>21<212>DNA<213>人<220>
<221>CXCR4反向引物<222>(1)..(21)<223>
<400>46cgctctggaa tgttcagttc c 21<210>47<211>37<212>DNA
<213>人<220>
<221>CXCR4探針<222>(1)..(37)<223>
<400>47ttagttgctg tatgtctcgt ggtaggactg tagaaaa 37<210>48<211>21<212>DNA<213>人<220>
<221>FASN正向引物<222>(1)..(21)<223>
<400>48ttgcattgct ggtagagacc c21
<210>49<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>FASN反向引物<222>(1)..(19)<223>
<400>49cacacgctgc ctgaggagt 19<210>50<211>21<212>DNA<213>人<220>
<221>FASN探針<222>(1)..(21)
<223>
<400>50caggcctgtc caccctgcca a 21<210>51<211>20<212>DNA<213>人<220>
<221>LDLR正向引物<222>(1)..(20)<223>
<400>51ccccagggac aaaacactgt20<210>52<211>20<212>DNA<213>人
<220>
<221>LDLR反向引物<222>(1)..(20)<223>
<400>52gctccgaaac cagaaaggct20<210>53<211>20<212>DNA<213>人<220>
<221>LDLR探針<222>(1)..(20)<223>
<400>53ccccccagtg cagggaaccg20<210>54
<211>19<212>DNA<213>人<220>
<221>NR1H3正向引物<222>(1)..(13)<223>
<400>54tgtaaccggc gctcctttt 19<210>55<211>15<212>DNA<213>人<220>
<221>NR1H3反向引物<222>(1)..(15)<223>
<400>55
tggtgccatg ggcca 15<210>56<211>21<212>DNA<213>人<220>
<221>NR1H3探針<222>(1)..(21)<223>
<400>56tgaccggctt cgagtcacgc c 21<210>57<211>20<212>DNA<213>人<220>
<221>VLDLR正向引物
<222>(1)..(20)<223>
<400>57caaataatac ccccgtcgga20<210>58<211>20<212>DNA<213>人<220>
<221>VLDLR反向引物<222>(1)..(20)<223>
<400>58ccagccgaga ggaagaaaaa20<210>59<211>27<212>DNA
<213>人<220>
<221>VLDLR探針<222>(1)..(27)<223>
<400>59tggtaaccga gccagcagct gaagtct2權(quán)利要求
1.用于檢測或監(jiān)視LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含表2和/或表3中所列的一種或多種核酸。
2.用于診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含表2和/或表3中所列的一種或多種核酸。
3.用于診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含表3中所列的一種核酸和表2中所列的一種或多種核酸。
4.用于檢測或監(jiān)視LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含表2和/或表3中所列的核酸編碼的一種或多種多肽。
5.用于診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的標(biāo)記物，所述標(biāo)記物包含表2和/或表3中所列的一種或多種核酸。
6.用于篩選調(diào)節(jié)LXR活性的化合物的方法，其包括步驟將所述化合物與宿主接觸，并測量表2和/或表3中所列的至少一種核酸的表達(dá)。
7.權(quán)利要求10的方法，其中表2和/或表3中所列至少一種核酸的表達(dá)與對照進(jìn)行比較。
8.用于篩選調(diào)節(jié)LXR活性的化合物的方法，其包括步驟將所述化合物與宿主接觸，并測量表2和/或表3中所列的核酸編碼的至少一種多肽的表達(dá)。
9.權(quán)利要求8的方法，其中所述一種或多種核酸選自Seq ID No.1、6、7、12、14、21、22和26。
10.權(quán)利要求9的方法，其中所述一種或多種核酸選自Seq ID No.1和/或21。
11.權(quán)利要求8的方法，其中所述一種或多種核酸選自Seq ID No.1、4到7、12、14、20到22和26。
12.權(quán)利要求8-11任意一項的方法，其中調(diào)節(jié)LXR活性的化合物是激動劑或拮抗劑。
13.監(jiān)視患有與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的患者的治療的方法，其包括步驟從用LXR活性調(diào)節(jié)劑治療的患者分離的單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞或全血提純mRNA或蛋白質(zhì)，和測定表2和/或表3中所列的至少一種核酸或所述至少一種核酸編碼的至少一種多肽的表達(dá)。
14.權(quán)利要求13的方法，其中表2和/或表3中所列的至少一種核酸或其編碼的至少一種蛋白質(zhì)的表達(dá)與對照進(jìn)行比較。
15.用于診斷與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的方法，其包括步驟從全血或者提純的單核細(xì)胞/巨噬細(xì)胞中提取mRNA，并測定表2和/或表3中所列的至少一種核酸或一種核酸編碼的至少一種多肽的表達(dá)。
16.權(quán)利要求15的方法，其中表2和/或表3中所列的至少一種核酸或其編碼的至少一種蛋白質(zhì)的表達(dá)與對照進(jìn)行比較。
17.表2和/或表3中所列的一種或多種核酸或所述核酸編碼的一種或多種多肽的用途，用作LXR調(diào)節(jié)的標(biāo)記物。
18.化合物，其通過根據(jù)權(quán)利要求8-12任意一項的方法鑒定。
19.通過根據(jù)權(quán)利要求8-12任意一項的方法鑒定的化合物的用途，用于制備治療與LXR活性失調(diào)有關(guān)的疾病的藥物。
全文摘要
本發(fā)明涉及LXR活化的替代標(biāo)記物，還涉及診斷與LXR活化有關(guān)的疾病的方法、監(jiān)視患有與LXR活化有關(guān)的疾病的患者的治療的方法，和鑒定調(diào)節(jié)LXR活性的化合物的方法。
文檔編號C12N15/11GK1791683SQ200480013607
公開日2006年6月21日 申請日期2004年5月14日 優(yōu)先權(quán)日2003年5月21日
發(fā)明者M·B·賴特 申請人:弗·哈夫曼-拉羅切有限公司