專利名稱：一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合及應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)城本發(fā)明屬生物技術(shù)，主要涉及一組基因組合，用于篩選胰腺導(dǎo)管腺癌。
背景技術(shù)：
胰腺癌是預(yù)后很差的惡性腫瘤?？傮w的中位生存時(shí)間不到6個(gè)月。5年生存率只有0.4-5％。外科切除腫瘤可提高生存期，手術(shù)切除腫瘤的病人的中位生存時(shí)間可達(dá)到11-20個(gè)月，5年生存率可達(dá)到7-25％。但由于胰腺癌病人缺乏早期的臨床表現(xiàn)。病人就診時(shí)多已屬晚期。
由于胰腺癌切除和活檢的手術(shù)風(fēng)險(xiǎn)較大，所以胰腺癌臨床標(biāo)本并不容易得到，這就使得大部分胰腺癌病人得不到明確和及時(shí)的診斷，從而延誤了病人的治療。因此，如果能從胰腺癌病人的PBMC中找到腫瘤相關(guān)的基因，從而達(dá)到診斷腫瘤的目的，將很好地指導(dǎo)我們的臨床工作。
目前，CA199是最常使用的胰腺癌腫瘤標(biāo)志物。關(guān)于CA199的研究已很多。大多數(shù)研究結(jié)果認(rèn)為，CA199的敏感性在80％左右，而特異性在60-70％左右，是目前能得到的最好的胰腺癌腫瘤標(biāo)志物。CA199升高還可發(fā)生在其他消化道惡性腫瘤，如胃癌、結(jié)腸癌、膽道系統(tǒng)惡性腫瘤；也可發(fā)生在良性病變，如胰腺炎、肝炎和肝硬化等。
目前還沒(méi)有理想的來(lái)自血液的胰腺癌腫瘤標(biāo)志物，尋找更好的胰腺癌病人血液中的腫瘤標(biāo)志物，具有很高的臨床應(yīng)用價(jià)值。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合，包括10個(gè)基因L48784、X83300、AI620827、AI494291、NM_020970、BF433657、J02959、BC022313、NM_000904、NM_004994。
本發(fā)明的另一個(gè)目的是提供該基因組合在篩選胰腺導(dǎo)管腺癌中的應(yīng)用。
本發(fā)明通過(guò)檢測(cè)人類外周血單個(gè)核細(xì)胞的這組基因，可以從健康人群中篩選出胰腺癌病人，具體篩選步驟為1.按照Affymetrix基因表達(dá)譜芯片操作指南，使用AFFYMETRIXHUMAN GENOME U133 PLUS 2.0 ARRAY檢測(cè)這組基因在5名胰腺癌和5名正常人的外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)中的表達(dá)，得到基因表達(dá)的信號(hào)值；
2.5名胰腺癌病人外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)的平均信號(hào)值高于5名正常人的基因被認(rèn)為是上調(diào)表達(dá)基因；5名胰腺癌的平均信號(hào)值低于5名正常人的基因被認(rèn)為是下調(diào)表達(dá)基因；3.取上述10個(gè)外周血單個(gè)核細(xì)胞中基因表達(dá)信號(hào)值的中位值作為臨界值，以判斷受測(cè)試的PBMC的基因表達(dá)是上調(diào)還是下調(diào)表達(dá)；受測(cè)試的人的PBMC，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌PBMC中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)相符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為胰腺癌病人；如果在受測(cè)試的人的PBMC中，在10個(gè)基因中，有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)不符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為正常人。
本發(fā)明利用Affymetrix公司的基因表達(dá)譜芯片對(duì)胰腺癌病人外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC，peripheral blood mononuclear cells)的表達(dá)譜和正常人外周血單個(gè)核細(xì)胞表達(dá)譜進(jìn)行研究，篩選胰腺癌的腫瘤相關(guān)基因，為胰腺癌的臨床診斷和篩選提供新的途徑。在小樣本的實(shí)驗(yàn)中已證明本實(shí)驗(yàn)具有很高的敏感性和特異性。本發(fā)明的有益之處為(1)病人的血液是容易得到的樣本；(2)本發(fā)明的篩選方法是一種對(duì)人體無(wú)害的檢測(cè)方法；(3)小樣本高通量寡核苷酸表達(dá)譜芯片已證明這個(gè)基因組合具有很高的推測(cè)準(zhǔn)確性(100％)。
具體實(shí)施例方式
本發(fā)明通過(guò)實(shí)施例作進(jìn)一步的說(shuō)明。
實(shí)施例11.按照Affymetrix基因表達(dá)譜芯片操作指南，使用AFFYMETRIXHUMAN GENOME U133 PLUS 2.0 ARRAY檢測(cè)這組基因在5名胰腺癌和5名正常人的PBMC中的表達(dá)，得到基因表達(dá)的信號(hào)值，(參見(jiàn)表1)。
表1


樣本分組情況胰腺癌組T1，T2，T3，T4，T5；正常人組N1，N2，N3，N4，N5，Public ID基因的公共號(hào)，T均數(shù)腫瘤樣本信號(hào)值的平均值，N均數(shù)正常對(duì)照樣本信號(hào)值的平均值，差2＝T均數(shù)-N均數(shù)，差2＞0表明基因在胰腺癌PBMC中上調(diào)表達(dá)，差2＜0說(shuō)明基因在胰腺癌PBMC中下調(diào)表達(dá)。
符合判定標(biāo)準(zhǔn)取上述10個(gè)外周血單個(gè)核細(xì)胞中基因表達(dá)信號(hào)值的中位值作為臨界值，以判斷受測(cè)試的PBMC的基因表達(dá)是上調(diào)還是下調(diào)表達(dá)；受測(cè)試的人的PBMC，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌PBMC中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)相符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為胰腺癌病人；如果在受測(cè)試的人的PBMC中，在10個(gè)基因中，有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)不符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為正常人。
2.5名胰腺癌的平均信號(hào)值高于5名正常人的基因被認(rèn)為是上調(diào)表達(dá)基因；5名胰腺癌的平均信號(hào)值低于5名正常人的基因被認(rèn)為是下調(diào)表達(dá)基因。根據(jù)上表可以看出L48784、X83300、AI620827、AI49429、NM_020970是下調(diào)表達(dá)基因；而B(niǎo)F433657、J02959、BC022313、NM_000904、NM_004994是上調(diào)表達(dá)基因。
3.取上述10個(gè)PBMC中基因表達(dá)量檢測(cè)結(jié)果的中位值作為臨界值，以判斷受測(cè)試的PBMC的基因表達(dá)是上調(diào)還是下調(diào)表達(dá)；4.按照Affymetrix基因表達(dá)譜芯片操作指南，使用AFFYMETRIXHUMAN GENOME U133 PLUS 2.0 ARRAY檢測(cè)這組基因在受測(cè)試的人的PBMC中的表達(dá)，用上述篩選標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選受測(cè)試的人的PBMC，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌PBMC中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)相符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為胰腺癌病人；如果受測(cè)試的人的PBMC，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)不符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為健康人群；本發(fā)明通過(guò)k倍交叉驗(yàn)證推測(cè)這組10個(gè)基因組成的基因組合的診斷價(jià)值(參見(jiàn)實(shí)施例2-51)k倍交叉驗(yàn)證是將樣本分成測(cè)試組和訓(xùn)練組，通過(guò)訓(xùn)練組樣本建立模型來(lái)對(duì)測(cè)試組樣本進(jìn)行推測(cè)。重復(fù)k次后，再計(jì)算k次推測(cè)正確率的平均正確率，即得此模型最后的正確率。
根據(jù)全部25種可能的排列組合，本實(shí)驗(yàn)以25組交叉驗(yàn)證的方式，將樣本分成25組，每組有8個(gè)樣本(4個(gè)癌和4個(gè)正常)當(dāng)訓(xùn)練樣本，其余2個(gè)為測(cè)試樣本。用訓(xùn)練組樣本建立篩選標(biāo)準(zhǔn)(見(jiàn)表2-51)，來(lái)推測(cè)測(cè)試組樣本是否為癌的正確率。
在表2-51中各種縮寫(xiě)的含義差1＝受測(cè)樣本-中位數(shù)的信號(hào)值，T均數(shù)腫瘤樣本信號(hào)值的平均值，N均數(shù)正常對(duì)照樣本信號(hào)值的平均值，差2＝T均數(shù)-N均數(shù)，差2＞0表明基因在胰腺癌PBMC中上調(diào)表達(dá)，差2＜0說(shuō)明基因在胰腺癌PBMC中下調(diào)表達(dá)，中位數(shù)訓(xùn)練組8個(gè)PBMC中基因表達(dá)量的信號(hào)值的中位數(shù)。
“符合”判定標(biāo)準(zhǔn)取訓(xùn)練組8個(gè)PBMC中基因表達(dá)量檢測(cè)結(jié)果的中位值作為臨界值，以判斷受測(cè)試的PBMC的基因表達(dá)是上調(diào)還是下調(diào)表達(dá)；在測(cè)試組中，受測(cè)試的人的PBMC，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌PBMC中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)相符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為胰腺癌病人；如果受測(cè)試的人的PBMC，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)不符合，就推測(cè)受測(cè)試的人為健康人群；(簡(jiǎn)而言之，差1和差2的同為負(fù)數(shù)或同為正數(shù)，則判定符合；否則，判定為不符合。)實(shí)施例2操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表2。
表2.交叉驗(yàn)證1-1


表2中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌。
實(shí)施例3操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表3。
表3.交叉驗(yàn)證1-2

表3中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人。
實(shí)施例4操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表4。
表4.交叉驗(yàn)證2-1

表4中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌。
實(shí)施例5操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表5，表5.交叉驗(yàn)證2-2

表5中不符合率為7/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例6操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表6。
表6.交叉驗(yàn)證3-1


表6中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例7操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表7。
表7.交叉驗(yàn)證3-2

表7中符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例8操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表8，表8.交叉驗(yàn)證4-1


表8中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌。
實(shí)施例9操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表9，表9.交叉驗(yàn)證4-2

表9中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例10操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表10，表10.交叉驗(yàn)證5-1

表10中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例11操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表11，表11.交叉驗(yàn)證5-2


表11中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例12操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表12，表12.交叉驗(yàn)證6-1

表12中符合率為8/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌。
實(shí)施例13操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表13，表13交叉驗(yàn)證6-2


表13中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例14操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表14，表14.交叉驗(yàn)證7-1

表14中符合率為8/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例15操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表15，表15.交叉驗(yàn)證7-2


表15中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例16操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表16，表16交叉驗(yàn)證8-1

表16中符合率為8/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例17操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表17，表17.交叉驗(yàn)證8-2

表17中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例18操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表18，表18.交叉驗(yàn)證9-1

表18中符合率為8/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例19操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表19，表19交叉驗(yàn)證9-2

表19中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例20操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表20，表20.交叉驗(yàn)證10-1


表20中符合率為8/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例21操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表21，表21.交叉驗(yàn)證10-2

表21中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例22操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表22。
表22.交叉驗(yàn)證11-1


表22中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例23操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表23。
表23.交叉驗(yàn)證11-2

表23中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例24操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表24。
表24交叉驗(yàn)證12-1

表24中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例25操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表25。
表25交叉驗(yàn)證12-2


表25中不符合率為7/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例26操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表26。
表26.交叉驗(yàn)證13-1

表26中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例27操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表27。
表27.交叉驗(yàn)證13-2


表27中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例28操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表28。
表28交叉驗(yàn)證14-1

表28中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例29操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表29。
表29.交叉驗(yàn)證14-2

表29中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例30操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表30。
表30交叉驗(yàn)證15-1


表30中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例31操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表31。
表31.交叉驗(yàn)證15-2

表31中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例32操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表32。
表32交叉驗(yàn)證16-1


表32中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例33操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表33。
表33交叉驗(yàn)證16-2

表33中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例34操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表34。
表34.交叉驗(yàn)證17-1


表34中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例35操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表35。
表35.交叉驗(yàn)證17-2

表35中符合率為7/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例36操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表36。
表36.交叉驗(yàn)證18-1

表36中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例37操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表37。
表37交叉驗(yàn)證18-2


表37中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例38操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表38。
表38.交叉驗(yàn)證19-1

表38中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例39操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表39。
表39.交叉驗(yàn)證19-2


表39中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例40操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表40。
表40.交叉驗(yàn)證20-1

表40中符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例41操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表41。
表41.交叉驗(yàn)證20-2

表41中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例42操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表42。
表42.交叉驗(yàn)證21-1


表42中符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例43操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表43。
表43.交叉驗(yàn)證21-2

表43中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例44操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表44。
表44.交叉驗(yàn)證22-1


表44中符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例45操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表45。
表45.交叉驗(yàn)證22-2

表45中不符合率為7/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例46操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表46。
表46.交叉驗(yàn)證23-1

表46中符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例47操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表47。
表47.交叉驗(yàn)證23-2


表47中不符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例48操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表48。
表48.交叉驗(yàn)證24-1

表48中符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例49操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表49。
表49.交叉驗(yàn)證24-2


表49中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
實(shí)施例50操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表50。
表50.交叉驗(yàn)證25-1

表50中符合率為9/10。推測(cè)受測(cè)樣本為胰腺癌病人的PBMC。
實(shí)施例51操作參照實(shí)施例1，結(jié)果參見(jiàn)表51。
表51.交叉驗(yàn)證25-2


表51中不符合率為10/10。推測(cè)受測(cè)樣本為正常人的PBMC。
本發(fā)明涉及的序列<110>浙江大學(xué)<120>一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合及應(yīng)用<160>10<170>Patent In Version 2.1<210>1<211>220<213>人<400>1L487841 gaatcagaga tcattgattt cttcctgggg gcctctctca aggatgaggt tttgaagatt61 atgccagtgc agaagcagac ccgtgccggc cagcgcacca ggttcaaggt acccggctgt121 cctgggaggg ggctgcgctg ggcttgccgg gactctctcg gctctgcata gttgcacttg181 gcttcacccg tgtgactttc gtaacgggga gagagagaaa<210>2<211>1295<213>人<400>2X833001 gtgaaagagc aggttctgct tctttggtgt agtcctgaag cttcctaaga aacttcacat61 caggtgatgg ataggagcaa ccctgtaaaa ccagccttag actatttttc aaacaggctg121 gtgaattacc agatctccgt caagtgcagt aaccagttca agttggaagt gtgtcttttg181 aatgcagaaa acaaagtcgt ggacaaccag gctgggaccc agggccagct gaaggtgctg241 ggtgccaacc tctggtggcc gtacctgatg cacgaacacc ccgcctacct gtactcgtgg301 gaggatggtg attgctcaca ccaaagcctt ggacccctcc cagcctgtga cctttgtgac361 caactccacc tacgcagcag acaagggggc tctgtatgtg gatgtgatcc gtgtgaacgg421 ctactactct tggtatcgca actacgggca cctggagttg attcagctgc agctggccgc481 ccagtttgag aattggtgta agacatcaca atcccattat tcagagcgcg tatggagtgg541 aaacgcttgt agggtttcac caggtaagcg gtgttgaact ttctgcttgt gtattctctc601 tgggcagaga tgccacttgc ctcccccacc atgccatctc tgaagaatat tacagaccat661 tttggagcat ggtgaataag aaattttcac cttaggagtt cagttgaata gtcattttta721 tatttgtgac tgcaagtcac tcttaggggc tgtacttcct tagtactggt agcattatta781 tccaatggac ttttatagct ttcattaggt tttcttttgt ttttgttctt taaagaacgt841 tttacttatc ttagtatttc atttttcatc tatattatga ggcagtaaga gtcttctgtt
901 tttccaaagt tgagactgct ttatatttat ttcgtattgt ctacagctgt agtgttcaat961 acattagcca ctagccacat gtggttattt aaataagata aaataaaaat tggccgggcg1021 tggtgggtca cgccggtaat cccagcactt tgggaggccg aggcgggcag atcattaggt1081 caggagatcg agaccatcct tactaagacg gtgaaccccc atctctatta aaaatacaaa1141 aaattagccg ggcgtggtgg cgggcgcctg cagtcccagc tactcaggag gctgaggcag1201 gagaatggcg tgaacctggg aggcagagtt tgcagtgagc cgagatggcg ccactgcact1261 ccagcctggg gacagagcga gactccatct caaaa<210>3<211>776<213>人<400>3AI6208271 ttacacttgt tagatcttta ttcattatag attctccaat gatttgcaat ggttgtagcg61 ttactgaaga ctttgtgaca atcattacat tagtcaagtt tccctacacc atgaactgcc121 tgatggtgaa taagtgttga ctgcttgcta aaggctttgc cacactcatt acacttgtaa181 ggtttctctc cagtgtgaag tccagtatgt tgtttcaggt gtgaatcact cccaaaagtc241 ttgtcacaaa ccttacattt gtatggtttc tttccaggat gaattctcct atgtctttta301 aggtgtgatt tgcgactgaa aactttgtca catgtttcac atttgtaaag tttctcccca361 gcatgaattc tatgatgaag tgaaagttgt gattgttgat taaaagcctt cccacattca421 ttacacttgt aaggtttctc tgcagtgtga attctgggat gtcttgccag gtatgaatta481 cgcacgaaag ccttgtcaca accgtacatt tgtaagattt ctctccagta tgaagtctac541 natggtgaac caagggatgg cttggggact gaagtccttg cacactcatt acacttgtaa601 gtttctcaac cactatgagn ctacgatgga aaggaagatg acccttggac tgaggcttgg661 ttgactcatt taactggaag gttctaacac tatgaactct gaatggctgc aagatgacct721 aagaacgagc ttgctgacta atacacttga agtctttccc ttgaaaacta atggtg<210>4<211>447<213>人<400>4AI4942911 ttttttttaa gaaaattcag taattctcca ttgaacatct actacatatc caactctgtg61 ctaaggtatg ctgtggaaaa gtcaaggaag aatgtatgag acacatccct gcactcccag121 gagtttataa tttcggagga gatgcaaacg tggacccatt ttaatgtaac aaaagataca
181 ctgtgttaac agccaaaatg gaggcctgta cagagtactg gggcaacctg gaaatctggt241 tttaggatac actgcattca aagcaatttg cttttttctt caacatttct tgagcacctg301 ttatgtgcaa agcaaggagt caggtgcctt tctggaaaac gaaataaaca cggcactgtc361 tctgtttaca actgcccatt taacaaacat ttcttgaaca tctactacat gtgatgcatt421 gagctcaacc ttaggaattg cagatgg<210>5<211>2418<213>人<400>5NM_0209701 gtgcagaaag caccgtcttt tactagaaga agacaataaa atgttggtca atgaactgaa61 tcattcgaaa gaaaaagaat gccaatatga aaaagagaaa gcagaaagag aagtagctgt121 gagacagctt caacaaaaac gagatgatgt cttaaacaaa ggatcagcaa caaaagctct181 gctggatgct tcatcgcgtc actgcaccta tttagaaaat gggatgcagg attcaaggaa241 gaaattagac cagatgagaa gtcaatttca agaaatacag gatcaactta cagctactat301 aagatgtact aaggagatgg atggcgacac acaaaagctt gaagtagaac atgtgatgat361 gagaaaaatt attaaaaaac aggatgacca aattgagcgg cttgagaaaa tcctgcagca421 ttcaagtttg atgctgcagg tgtttgagag ctagatgaag atatggacat ttctggaatt481 aagagccccc tctacattga gcacaagaca gtgacgaatc cacattcttc agccagaaag541 tcacctctga gagccaaatg tctgactata gaaaggagag tcaaagaatg ataacgacat601 ctcaggaaaa ttgtgaaaat aatcagcagc cggatgtgga taaccctttc aaatttctcc661 tggggcctcc aaccaccccc actggtgttc tcctgctgac agtgatttca attttttctg721 ggctggagct ccctgatgga ggggcaggcc accatctttg ctgtttttgc aacttagcca781 cttcagcctt cagtctttgg agtgtccaag gagaccaggg ggtgatgtgg accctcagca841 tagcacagct gctctataaa gatgaggcca gactgctttt ttgagcactt tcccaatgcc901 attcctcctc actgggcaaa acctccaaac tggggtctcc agccacctcc tacaggtgtg961 tttgggccag caacaagttc attcatacct ccctagggca aagcttccaa agggagcggt1021 aggctgccat ctttgctgtt tcacaggctt cactgatgat aactccaggt actggaaaat1081 ctgaggctac tagagactgg agcgggccct gggcatactg cagcagccct atggaaaagt1141 ggccagactg ttacctgggt tcccattcct atatcttctc actaggcaag tcttgcaggc1201 ctgggcctct acctaacccc ccctaccaga actgttgagc cagtagcaac tcagccactc1261 cctggagaga gcctccaggg gcaactgaaa gcctctctgc cactgcttct gcagtggaac1321 tgtccttgct accctcagac tgatgaagga gctaacaccc ttatctacac cttcaacaag1381 ctttaattga ccaaagccca tctctcatgg gttctacaca ctccccactg ctcatgacag
1441 ggaacccctg gattggcccc cacagcacga attctccatc ctgattgctg attgcagtaa1501 acagttgctg tattctccag gggtggtgga actctgagga gacaaacaaa agacccttgg1561 ctacaaccac tactaatgtc ccttcctctt ctgcctcaaa gttaggaaag aaatataaac1621 actgagattg ccccagagct gcagtgggca gcctaggagt gccaagccat gacctacagc1681 cagcactcaa gggggagaga agcacatttt cagatcattg agagggaaca tggctgcaac1741 tgtaaggaaa cataggggag ccacatgacc aagcaagagt ctaccaactg accagtaagc1801 ccaagtgcca cctactggat cacatcccaa agcttcagca tcaaaaatac cctactaata1861 tactcccctc tgaaaccaga aatgagaagt cagcttcaaa taaagaccct gcacaaagcc1921 tcagcctggt gaaaacatcc gaaaataagt ctacggactg tactcaatct acactgcaat1981 taaaggaaaa cccataggtg gaaatgagaa gaaaccaatg caagaactcc agtaactcaa2041 atggcctctg tgtcatatgt ccttctaaca accacaccag ttctccaaca agagttctta2101 acctggatga actgtctgga attacataaa tataattcag aatatggata ggaaaaaaaa2161 tcatcaagac tcaggagaat ggcaaaaccc aatccaagga aaataagaat aacagtaaag2221 tgttacagga gctgaaggat aaagtagctg gtataataaa aaagaaccta accgatctga2281 aagcgccgaa gaacacaata caagaattcc acaatgcaat cacaagtatt aacagcagaa2341 aaaaaaacct gaggaacgaa tctcagaact tgaagattgg ttctctaaaa taagatggac2401 aaaaaaaaaa aaaaaaaa<210>6<211>549<213>人<400>6BF4336571 ttttttgttt tcccttgact ttatttatct tcataagtca caaaatgtga gtgcagagat61 aaatgtctgt gtgcatgtgc cctgagcaca cagggtggca taactcggca cactcataat121 gacacagccg ttcacccagc cacagatagt gacagggcac acatggcgac acccacatgt181 acggagataa atctccccca ccatgacatg ggtagacaga aaacacgccg cagtatactc241 tagtatgttt acacaaacag ggagacaggc ccgtgcaatg catgtcacca acacccacac301 tcagagtgac atctgctgga ggtgctcaga cacagccacc caccgtgaca tgccgagact361 cacatatgtc acatgacaca ggcatgcatg ccacattcac tgtgactctc agtcctattc421 attcatcacc tttctgggag atacactgaa atgtccaccc tttgcaaaat gcacacacac481 gcgcacgcac acacgcacac acacgaacac acgcgcacac acgcacacac acgcacgcag541 gtgtacaca<210>7
<211>1910<213>人<400>7J029591 gggcgctgtg ctgtgtgatc ccccagagcc atgcccgaga tagtggatac ctgttcgttg61 gcctctccgg cttccgtctg ccggaccaag cacctgcacc tgcgctgcag cgtcgacttt121 actcgccgga cgctgaccgg gactgctgct ctcacggtcc agtctcagga ggacaatctg181 cgcagcctgg ttttggatac aaaggacctt acaatagaaa aagtagtgat caatggacaa241 gaagtcaaat atgctcttgg agaaagacaa agttacaagg gatcgccaat ggaaatctct301 cttcctatcg ctttgagcaa aaatcaagaa attgttatag aaatttcttt tgagacctct361 ccaaaatctt ctgctctcca gtggctcact cctgaacaga cttctgggaa ggaacaccca421 tatctcttta gtcagtgcca ggccatccac tgcagagcaa tccttccttg tcaggacact481 ccttctgtga aattaaccta tactgcagag gtgtctgtcc ctaaagaact ggtggcactt541 atgagtgcta ttcgtgatgg agaaacacct gacccagaag acccaagcag gaaaatatac601 aaattcatcc aaaaagttcc aataccctgc tacctgattg ctttagttgt tggagcttta661 gaaagcaggc aaattggccc aagaactttg gtgtggtctg agaaagagca ggtggaaaag721 tctgcttatg agttttctga gactgaatct atgcttaaaa tagcagaaga tctgggagga781 ccgtatgtat ggggacagta tgacctattg gtcctgccac catccttccc ttatggtggc841 atggagaatc cttgccttac ttttgtaact cctactctac tggcaggcga caagtcactc901 tccaatgtca ttgcacatga aatatctcat agctggacag ggaatctagt gaccaacaaa961 acttgggatc acttttggtt aaatgaggga catactgtgt acttggaacg ccacatttgc1021 ggacgattgt ttggtgaaaa gttcagacat tttaatgctc tgggaggatg gggagaacta1081 cagaattcgg taaagacatt tggggagaca catcctttca ccaaacttgt ggttgatctg1141 acagatatag accctgatgt agcttattct tcagttccct atgagaaggg ctttgcttta1201 cttttttacc ttgaacaact gcttggagga ccagagattt tcctaggatt cttaaaagct1261 tatgttgaga agttttccta taagagcata actactgatg actggaagga tttcctgtat1321 tcctatttta aagataaggt tgatgttctc aatcaagttg attggaatgc ctggctctac1381 tctcctggac tgcctcccat aaagcccaat tatgatatga ctctgacaaa tgcttgtatt1441 gccttaagtc aaagatggat tactgccaaa gaagatgatt taaattcatt caatgccaca1501 gacctgaagg atctctcttc tcatcaattg aatgagtttt tagcacagac gctccagagg1561 gcacctcttc cattggggca cataaagcga atgcaagagg tgtacaactt caatgccatt1621 aacaattctg aaatacgatt cagatggctg cggctctgca ttcaatccaa gtgggaggac1681 gcaattcctt tggcgctaaa gatggcaact gaacaaggaa gaatgaagtt tacccggccc1741 ttattcaagg atcttgctgc ctttgacaaa tcccatgatc aagctgtccg aacctaccaa1801 gagcacaaag caagcatgca tcccgtgact gcaatgctgg tggggaaaga cttaaaagtg
1861 gattaaagac ctgcgtattg atgattttag agatttctct tttttaaatg<210>8<211>1154<213>人<400>8BC0223131 aatcaagaag ttggcgtgca gctgggagag ctagactaag ttggtcatga tgcagaagct61 actcaaatgc agtcggcttg tcctggctct tgccctcatc ctggttctgg aatcctcagt121 tcaaggtaag actcaggagt cttgttcccc agccatcttc tctgtaagcc ctgtggtcca181 tgcaagtcat tatattcatt ttaaggcata gaatgtataa tattgtgaga aaggaggcaa241 agaagaagga tttggggtcg ctgaaccctt taatatgagt tctgttaagt ttggtaccaa301 gaaaaattaa actctgtggc gtgtgcagtc ttgtaaactc ttacaatgat tgaaatgtgc361 tattttggga tgaaaatgtg aggtttataa attttaaaag ctcaaaaaag gaatctagaa421 aatgactcct gtgcctgttg catggaggag atggcacctt tgactgttgg ggggtgtctg481 cctaccccta agtgtctaca tcagccccaa gttttagtgc gctgtgacgg tgtcattgtt541 attttaacac tgggagacgt tatattccaa ttggggtgaa tctgactgtg tgtattttct601 tttctttttt tttttttaaa gataaacttg gttcttactg aaaactcaat tatggttaga661 catagttcat gtaaaacctc tcagatttta aagagaaggc caaataattt ggtatttgtg721 ctcttgctca gagaagcatc atattcggaa atatcttcct aggtttatct accatttagt781 gttgtttagt cagactgaaa caacttaaaa cctgtaatga ctaagacaat gaaaatgata841 ggcttgtaag aaaaatacaa tttgttattc tttggcaaat aaggaatcat gtctaaataa901 gacggaggtc atggcttgat agagagatgg ctgaacctat agtagaaaaa cactaggttc961 cgccaaatgg taagggaaat gttgagtcac aatgacacac atgtcctaga tttgtttcgt1021 caaagcgact tttggttgtc atgatcttac ttccggtgga ggttgcagtg agctgagatc1081 atgccattgc actccaggct aggcaacaga gtgcaactcc gtcccaaaaa aaaaaaaaaa1141 aaaaaaaaaa aaaa<210>9<211>976<213>人<400>9NM_0009041 cccggaacct ggcgcaactc ctagagcggt ccttggggag acgcgggtcc cagtcctgcg
61 gctcctactg gggagtgcgc tggtcggaag attgctggac tcgctgaaga gagactacgc121 aggaaagccc cagccaccca tcaaatcaga gagaaggaat ccaccttctt acgctatggc181 aggtaagaaa gtactcattg tctatgcaca ccaggaaccc aagtctttca acggatcctt241 gaagaatgtg gctgtagatg aactgagcag gcagggctgc accgtcacag tgtctgattt301 gtatgccatg aactttgagc cgagggccac agacaaagat atcactggta ctctttctaa361 tcctgaggtt ttcaattatg gagtggaaac ccacgaagcc tacaagcaaa ggtctctggc421 tagcgacatc actgatgagc agaaaaaggt tcgggaggct gacctagtga tatttcagtt481 cccgctgtac tggttcagcg tgccggccat cctgaagggc tggatggata gggtgctgtg541 ccagggcttt gcctttgaca tcccaggatt ctacgattcc ggtttgctcc agggtaaact601 agcgctcctt tccgtaacca cgggaggcac ggccgagatg tacacgaaga caggagtcaa661 tggagattct cgatacttcc tgtggccact ccagcatggc acattacact tctgtggatt721 taaagtcctt gcccctcaga tcagctttgc tcctgaaatt gcatccgaag aagaaagaaa781 ggggatggtg gctgcgtggt cccagaggct gcagaccatc tggaaggaag agcccatccc841 ctgcacagcc cactggcact tcgggcaata actctgtggc acgtgggcat cacgtaagca901 gcacactagg aggcccaggc gcaggcaaag agaagatggt gctgtcatga aataaaatta961 caacatagct acctgg<210>10<211>2387<213>人<400>10NM_0049941 agacacctct gccctcacca tgagcctctg gcagcccctg gtcctggtgc tcctggtgct61 gggctgctgc tttgctgccc ccagacagcg ccagtccacc cttgtgctct tccctggaga121 cctgagaacc aatctcaccg acaggcagct ggcagaggaa tacctgtacc gctatggtta181 cactcgggtg gcagagatgc gtggagagtc gaaatctctg gggcctgcgc tgctgcttct241 ccagaagcaa ctgtccctgc ccgagaccgg tgagctggat agcgccacgc tgaaggccat301 gcgaacccca cggtgcgggg tcccagacct gggcagattc caaacctttg agggcgacct361 caagtggcac caccacaaca tcacctattg gatccaaaac tactcggaag acttgccgcg421 ggcggtgatt gacgacgcct ttgcccgcgc cttcgcactg tggagcgcgg tgacgccgct481 caccttcact cgcgtgtaca gccgggacgc agacatcgtc atccagtttg gtgtcgcgga541 gcacggagac gggtatccct tcgacgggaa ggacgggctc ctggcacacg cctttcctcc601 tggccccggc attcagggag acgcccattt cgacgatgac gagttgtggt ccctgggcaa661 gggcgtcgtg gttccaactc ggtttggaaa cgcagatggc gcggcctgcc acttcccctt721 catcttcgag ggccgctcct actctgcctg caccaccgac ggtcgctccg acggcttgcc
781 ctggtgcagt accacggcca actacgacac cgacgaccgg tttggcttct gccccagcga841 gagactctac acccaggacg gcaatgctga tgggaaaccc tgccagtttc cattcatctt901 ccaaggccaa tcctactccg cctgcaccac ggacggtcgc tccgacggct accgctggtg961 cgccaccacc gccaactacg accgggacaa gctcttcggc ttctgcccga cccgagctga1021 ctcgacggtg atggggggca actcggcggg ggagctgtgc gtcttcccct tcactttcct1081 gggtaaggag tactcgacct gtaccagcga gggccgcgga gatgggcgcc tctggtgcgc1141 taccacctcg aactttgaca gcgacaagaa gtggggcttc tgcccggacc aaggatacag1201 tttgttcctc gtggcggcgc atgagttcgg ccacgcgctg ggcttagatc attcctcagt1261 gccggaggcg ctcatgtacc ctatgtaccg cttcactgag gggcccccct tgcataagga1321 cgacgtgaat ggcatccggc acctctatgg tcctcgccct gaacctgagc cacggcctcc1381 aaccaccacc acaccgcagc ccacggctcc cccgacggtc tgccccaccg gaccccccac1441 tgtccacccc tcagagcgcc ccacagctgg ccccacaggt cccccctcag ctggccccac1501 aggtcccccc actgctggcc cttctacggc cactactgtg cctttgagtc cggtggacga1561 tgcctgcaac gtgaacatct tcgacgccat cgcggagatt gggaaccagc tgtatttgtt1621 caaggatggg aagtactggc gattctctga gggcaggggg agccggccgc agggcccctt1681 ccttatcgcc gacaagtggc ccgcgctgcc ccgcaagctg gactcggtct ttgaggagcg1741 gctctccaag aagcttttct tcttctctgg gcgccaggtg tgggtgtaca caggcgcgtc1801 ggtgctgggc ccgaggcgtc tggacaagct gggcctggga gccgacgtgg cccaggtgac1861 cggggccctc cggagtggca gggggaagat gctgctgttc agcgggcggc gcctctggag1921 gttcgacgtg aaggcgcaga tggtggatcc ccggagcgcc agcgaggtgg accggatgtt1981 ccccggggtg cctttggaca cgcacgacgt cttccagtac cgagagaaag cctatttctg2041 ccaggaccgc ttctactggc gcgtgagttc ccggagtgag ttgaaccagg tggaccaagt2101 gggctacgtg acctatgaca tcctgcagtg ccctgaggac tagggctccc gtcctgcttt2161 ggcagtgcca tgtaaatccc cactgggacc aaccctgggg aaggagccag tttgccggat2221 acaaactggt attctgttct ggaggaaagg gaggagtgga ggtgggctgg gccctctctt2281 ctcacctttg ttttttgttg gagtgtttct aataaacttg gattctctaa cctttaaaaa2341 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaa
權(quán)利要求
1.一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合，其特征是由L48784、X83300、AI620827、AI494291、NM_020970、BF433657、J02959、BC022313、NM_000904、NM_004994十個(gè)基因組合，分別具有SEQ ID NO1～SEQ ID NO10的基因序列。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合在篩選胰腺導(dǎo)管腺癌中的應(yīng)用。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合在篩選胰腺導(dǎo)管腺癌中的應(yīng)用，通過(guò)以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)(1)建立篩選標(biāo)準(zhǔn)按照Affymetrix基因表達(dá)譜芯片操作指南，使用AFFYMETRIX HUMAN GENOME U133 PLUS 2.0 ARRAY檢測(cè)這組基因在5名胰腺癌患者和5名正常人的外周血單個(gè)核細(xì)胞中的表達(dá)，得到基因表達(dá)的信號(hào)值；(2)5名胰腺癌患者外周血單個(gè)核細(xì)胞的平均信號(hào)值高于5名正常人的基因被認(rèn)為是上調(diào)表達(dá)基因；5名胰腺癌患者的平均信號(hào)值低于5名正常人的基因被認(rèn)為是下調(diào)表達(dá)基因；(3)取上述10個(gè)外周血單個(gè)核細(xì)胞中基因表達(dá)信號(hào)值的中位值作為臨界值，以判斷受測(cè)試的外周血單個(gè)核細(xì)胞的基因表達(dá)是上調(diào)還是下調(diào)表達(dá)；受測(cè)試的人的外周血單個(gè)核細(xì)胞，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌外周血單個(gè)核細(xì)胞中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)相符合，就預(yù)測(cè)受測(cè)試的人為胰腺癌病人；如果受測(cè)試的人的外周血單個(gè)核細(xì)胞，在10個(gè)基因中有7個(gè)或7個(gè)以上的基因表達(dá)情況與這些基因在胰腺癌中上調(diào)或下調(diào)的表達(dá)趨勢(shì)不符合，就預(yù)測(cè)受測(cè)試的人為正常人。
全文摘要
本發(fā)明提供一組篩選胰腺導(dǎo)管腺癌的基因組合，包括10個(gè)基因L48784、X83300、AI620827、AI494291、NM_020970、BF433657、J02959、BC022313、NM_000904、NM_004994。本發(fā)明提供的基因組合在篩選胰腺導(dǎo)管腺癌中的應(yīng)用。本發(fā)明通過(guò)檢測(cè)人類外周血單個(gè)核細(xì)胞的這組基因，可以從健康人群中篩選出胰腺癌病人。本發(fā)明的篩選方法是一種對(duì)人體無(wú)害的檢測(cè)方法；本發(fā)明的篩選方法設(shè)計(jì)合理，為胰腺癌的臨床診斷和篩選提供新的途徑，且具有很高的敏感性和特異性。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK1904072SQ200610052679
公開(kāi)日2007年1月31日 申請(qǐng)日期2006年7月28日 優(yōu)先權(quán)日2006年7月28日
發(fā)明者吳育連, 燕海潮 申請(qǐng)人:浙江大學(xué)