新品種、植物品種的鑒別方法以及使水稻個(gè)體早熟的方法
【專利摘要】本發(fā)明的目的在于提供一種比原品種早熟的水稻新品種以及使水稻個(gè)體早熟的方法。本發(fā)明涉及品種權(quán)申請(qǐng)?zhí)枮榈?5587號(hào)的水稻品種越光籽6號(hào)（Koshihikari-kazusa6gou），選自由所述品種的個(gè)體及其后代個(gè)體所組成的組中的兩個(gè)個(gè)體雜交得到的后代個(gè)體，以及使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，將水稻個(gè)體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31,720,064號(hào)堿基～第31,724,043號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克（Habataki）的由該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
【專利說(shuō)明】新品種、植物品種的鑒別方法以及使水稻個(gè)體早熟的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及非基因重組法培育的新品種、該新品種的鑒別方法、以及使水稻個(gè)體早熟的方法。
【背景技術(shù)】
[0002]將屬于同一生物種，但因遺傳結(jié)構(gòu)不同而在某種性狀上與其他群體不同的群體稱為品種。也就是說(shuō)，即使是同種的植物，根據(jù)品種不同，其栽培的難易性、抗病蟲害能力、產(chǎn)量、品質(zhì)等也會(huì)不同。因此，對(duì)于農(nóng)作物，特別是水稻、麥類等主要作物，為了得到更優(yōu)良的品種，自古以來(lái)在不斷進(jìn)行品種改良，近年來(lái)，不僅種苗公司，連國(guó)家、省等官方機(jī)構(gòu)也在積極地進(jìn)行品種改良。
[0003]隨著近年來(lái)核酸分析技術(shù)等的進(jìn)步，擬南芥、水稻、小麥等各種植物的基因已被破解，公開了所得到的基因信息。利用這些公開的基因信息，廣泛進(jìn)行了基于基因重組法的導(dǎo)入外源種的基因的品種改良。例如，公開了一種Hdl基因及導(dǎo)入Hdl基因的轉(zhuǎn)基因植物的選育方法等(例如，參考專利文獻(xiàn)I。)，該Hdl基因是編碼具有增加植物感光性功能的源自植物的蛋白質(zhì)。但是，基于基因重組法的品種改良，雖然具有能夠?qū)胪ǔ２豢赡茈s交的遠(yuǎn)緣種所具有的性狀的優(yōu)點(diǎn)，但存在對(duì)于其安全性的驗(yàn)證尚不夠充分的問題。
[0004]因此，以水稻為首的食用植物，大多為通過非基因重組法而進(jìn)行培育的新品種。例如，專利文獻(xiàn)2已公開一種方法，其通過非基因重組法用源自外源的有用染色體片段置換的情況下，通過控制導(dǎo)入的源自外源品種的染色體片段置換區(qū)，不改變?cè)贩N具有的優(yōu)良性狀，選育出具有目標(biāo)性狀的新品種。同樣地，在專利文獻(xiàn)2中，記載了通過用于選育該新品種的方法，僅將含有哈巴達(dá)克的Hdl基因的區(qū)域?qū)朐焦獾乃酒贩N越光H3號(hào)(A ^ b3)。
[0005]特別是在水稻中 ，可栽培地域更加廣闊的越光備受期待。越光的口味比其他品種更好，受到消費(fèi)者的喜歡。因此種米農(nóng)戶即使在不適合栽培越光的地域也愿意栽培越光。但是，在南部地域栽培越光的情況下，出穗期過早，無(wú)法期待得到充足的產(chǎn)量。而且，由于在出穗期持續(xù)高溫，導(dǎo)致口味下降。另一方面，在北部地域栽培越光的情況下，會(huì)晚熟，即使能夠出穗，也由于低溫而使得灌漿不佳，無(wú)法收獲稻米。
[0006]現(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)
[0007]專利文獻(xiàn)
[0008]專利文獻(xiàn)1:日本專利3660967號(hào)公報(bào)
[0009]專利文獻(xiàn)2:日本專利4409610號(hào)公報(bào)

【發(fā)明內(nèi)容】

[0010]本發(fā)明要解決的技術(shù)問題
[0011]根據(jù)本發(fā)明人等的研究結(jié)果可知，越光大致僅適合栽培在從日本北緯35.5度至38.5度的范圍內(nèi)。如果是可在北緯38.5度更北的地域栽培的越光，那么在例如北海道等以往不能栽培的地域也能夠收獲越光。
[0012]本發(fā)明的目的在于提供一種在北部地域也能夠栽培的水稻新品種，以及提供一種使水稻個(gè)體早熟的方法。
[0013]解決技術(shù)問題的技術(shù)手段
[0014]本發(fā)明人等為了解決上述問題進(jìn)行了深入研究，結(jié)果發(fā)現(xiàn)通過將水稻品種哈巴達(dá)克的第3染色體上存在的特定區(qū)域的染色體片段和水稻品種哈巴達(dá)克的第6染色體上存在的特定區(qū)域的染色體片段置換到水稻品種越光上，即使在以往的區(qū)域以北的區(qū)域進(jìn)行栽培可充分地使其早熟，從而完成了本發(fā)明。
[0015]即，本發(fā)明提供下述內(nèi)容:
[0016](I)品種權(quán)申請(qǐng)?zhí)枮榈?5587號(hào)的水稻品種越光籽(力U ) 6號(hào)(Oryza sativaL.cultivar Koshihikari_kazusa6gou)；
[0017](2)—種后代個(gè)體，其是選自由上述(I)所述的品種的個(gè)體及上述(I)所述品種的個(gè)體的后代個(gè)體所組成的組中的兩個(gè)個(gè)體雜交得到的；
[0018](3)—種水稻品種的鑒別方法，該方法用于鑒別某種水稻個(gè)體是否為特定品種，其特征在于，
[0019]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，521，442號(hào)SNP(單核苷酸多態(tài)性)的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記Ml ；
[0020]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，689，690號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M2 ；
[0021]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，208, 924號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M3 ；
[0022]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，298，686號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為G，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記M4;
[0023]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，363，157號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M5 ；
[0024]通過該水稻個(gè)體的基因組分析，將選自由上述DNA標(biāo)記Ml?M5所組成的組中的一種以上的DNA標(biāo)記進(jìn)行分型；
[0025]當(dāng)?shù)玫降姆中徒Y(jié)果與水稻品種越光籽6號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-kazusa6gou)或水稻品種越光 H5 號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-eich5gou)的結(jié)果一致時(shí),鑒定該水稻個(gè)體為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種越光H5號(hào)；
[0026](4) 一種水稻品種的鑒別方法，該方法用于鑒別某種水稻個(gè)體是否為特定品種，其特征在于，
[0027]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第8，757，818號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記Ml ；
[0028]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第8，940, 503號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M2 ；
[0029]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第9，325，062號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M3 ；[0030]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第9，533，057號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為G，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記M4;
[0031]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第9，777，196號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M5 ；
[0032]通過該水稻個(gè)體的基因組分析，將選自由上述DNA標(biāo)記Ml?M5所組成的組中的一種以上的DNA標(biāo)記進(jìn)行分型；
[0033]當(dāng)?shù)玫降姆中徒Y(jié)果與水稻品種越光籽6號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-kazusa6gou)或水稻品種越光 H3 號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-eich3gou)的結(jié)果一致時(shí),鑒定該水稻個(gè)體為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種越光H3號(hào)；
[0034](5) 一種使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，將水稻個(gè)體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，720，064號(hào)堿基?第31，724，043號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段；
[0035](6)根據(jù)上述(5)所述的使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，691號(hào)堿基?第31，720，064號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且該染色體片段的下游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，724，043號(hào)堿基?第32，298，685號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域；
[0036](7) 一種使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，將水稻個(gè)體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，690號(hào)堿基?第32，298，686號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段；
[0037](8)根據(jù)上述(7)所 述的使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，521，443號(hào)堿基?第31，689，690號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且該染色體片段的下游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，298，686號(hào)堿基?第32，363，156號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域；
[0038](9) 一種水稻品種，該水稻品種是通過上述(5)?(8)中任意一項(xiàng)所述的使水稻個(gè)體早熟的方法培育得到的；
[0039](10) 一種后代個(gè)體，其是選自由上述(9)所述品種的個(gè)體與上述(9)所述品種的個(gè)體的后代個(gè)體所組成的組中的兩個(gè)個(gè)體雜交得到的；
[0040](11) 一種水稻的栽培方法，其特征在于，在北緯38.5度以北，栽培選自由下述水稻個(gè)體所組成的組中的一種以上，所述水稻個(gè)體為將水稻個(gè)體的第6染色體中的與水稻品種日本晴的第6染色體中包含第8，940，503號(hào)堿基?第9，533，057號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)、水稻品種越光H3號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克的由該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段而成的水稻個(gè)體、水稻品種越光籽6號(hào)的水稻個(gè)體或水稻品種越光H3號(hào)的水稻個(gè)體。
[0041]發(fā)明效果
[0042]本發(fā)明的新品種水稻品種越光籽6號(hào)，比越光更早熟，且能夠在北緯38.5度以北的地域栽培，并可收獲稻米。另外，水稻品種越光籽6號(hào)是一種品質(zhì)、產(chǎn)量等收獲期以外的特性幾乎與水稻品種越光相同的新品種。
[0043]另外，通過本發(fā)明的水稻品種的鑒別方法，能夠鑒別水稻品種越光籽6號(hào)。
[0044]另外，通過本發(fā)明的使水稻個(gè)體早熟的方法，能夠使水稻個(gè)體比原品種更早熟。
【專利附圖】

【附圖說(shuō)明】
[0045]圖1是表示原品種的染色體G上的目標(biāo)區(qū)域T、置換后的源自外源品種的染色體片段L及DNA標(biāo)記Ml?M5的圖。
[0046]圖2是示意性地表示越光及越光H5號(hào)的基因組的圖。
[0047]圖3是表示在千葉縣調(diào)查越光及越光H5號(hào)的出穗期的結(jié)果的圖。
[0048]圖4是表示在北海道調(diào)查越光及越光H5號(hào)的出穗期的結(jié)果的圖。
[0049]圖5是示意性地表示越光H3號(hào)的基因組的圖。
[0050]圖6是表示在千葉縣調(diào)查越光及越光H3號(hào)的出穗期的結(jié)果的圖。
[0051]圖7是表示在北海道調(diào)查越光及越光H3號(hào)的出穗期的結(jié)果的圖。
[0052]圖8是示意性地表示越光籽6號(hào)的基因組的圖。
[0053]圖9是同時(shí)表示在千葉縣調(diào)查越光籽6號(hào)的出穗期的結(jié)果和越光、越光H5號(hào)及越光H3號(hào)的結(jié)果的圖。
[0054]圖10是同時(shí)表示在北海道調(diào)查越光籽6號(hào)的出穗期的結(jié)果和越光、越光H5號(hào)及越光H3號(hào)的結(jié)果的圖。
【具體實(shí)施方式】
[0055]本發(fā)明中，所謂染色體片段置換系是指僅將原品種染色體的一部分置換成源自外源品種的染色體片段的體系。這里，外源品種為原品種以外的品種即可，沒有特別限定，可以是與原品種同種的植物品種，也可以是與原品種不同種的植物品種，還可以是動(dòng)物等除植物以外的品種。這里，本發(fā)明中所謂品種是指，屬于同種植物，但由于基因結(jié)構(gòu)不同而在某種性狀上明顯區(qū)別于同種內(nèi)的其他品種的群體。
[0056]在本發(fā)明中，DNA標(biāo)記只要能識(shí)別出源自原品種的染色體與源自外源品種的染色體，能檢測(cè)出染色體上的DNA序列差異即可，沒有特別限制，可以使用在基因分析領(lǐng)域中常用的DNA標(biāo)記。作為該DNA標(biāo)記，例如可以是能檢測(cè)出SNP (Single NucleotidePolymorphism,單核苷酸多態(tài)性)、SSR (Simple Sequence Repeats,簡(jiǎn)單重復(fù)序列)的不同重復(fù)數(shù)等的基因多態(tài)性的標(biāo)記，也可以是RFLP (Restriction Fragment LengthPolymorphism,限制酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性)標(biāo)記。這里,使用這些DNA標(biāo)記對(duì)源自原品種的等位基因與源自外源品種的等位基因進(jìn)行識(shí)別時(shí)，可以通過常規(guī)方法進(jìn)行。例如，以從各個(gè)體中提取的DNA為模型，使用能與特定的SNP或SSR進(jìn)行特異性雜交的弓I物等進(jìn)行PCR，然后，使用電泳方法等檢測(cè)有無(wú)PCR產(chǎn)物，從而能夠識(shí)別各多態(tài)性。并且，將從各個(gè)體中提取的DNA經(jīng)限制酶處理后，用電泳方法等檢測(cè)DNA片段的圖案，同樣能夠識(shí)別各多態(tài)性。這里，能與特定的SNP或SSR進(jìn)行特異性雜交的引物等可以根據(jù)SNP或SSR的堿基序列，采用通用的引物設(shè)計(jì)工具等，以常規(guī)方法來(lái)設(shè)計(jì)。此外，可以使用在本【技術(shù)領(lǐng)域】中已知的任意方法合成設(shè)計(jì)出的引物等。
[0057]這些DNA標(biāo)記可以適當(dāng)使用公知的DNA標(biāo)記。此外，也可以為新制備的DNA標(biāo)記。作為公知的DNA標(biāo)記，例如，關(guān)于水稻，可以使用國(guó)際公開第2003/070934號(hào)小冊(cè)子等中公開的 SNP 標(biāo)記，由水稻基因組(Rice Genome Research Program) (RGP:http://rgp.dna.affrc.g0.jp/publicdata.Html)公開的 DNA 標(biāo)記。
[0058]這里，各品種的基因彳目息等，例如可以在國(guó)際喊基序列數(shù)據(jù)庫(kù)NCBI (Nationalcenter for Biotechnology Information)和 DDBJ (DNA Data Bank of Japan,日本 DNA數(shù)據(jù)庫(kù))等中獲得。特別是水稻各品種的基因信息，可以在KOME (Knowledge-based OryzaMolecular biological Encyclopedia,水稻的生物分子數(shù)據(jù)庫(kù),http://cdna01.dna.affrc.g0.jp/cDNA/)等中獲得。
[0059]本發(fā)明以及本申請(qǐng)說(shuō)明書中的“水稻品種日本晴的染色體的第X號(hào)的堿基第Y號(hào)的堿基的區(qū)域”，是根據(jù)RGB中公開的水稻品種日本晴的基因組DNA的堿基序列(版本4 ；IRGSP-build4-06/04/21)而決定的區(qū)域。
[0060]此外，本發(fā)明以及本申請(qǐng)說(shuō)明書中的“與水稻品種日本晴的染色體的第X號(hào)堿基?第Y號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域”，是指水稻個(gè)體的染色體中與水稻品種日本晴的染色體中的該區(qū)域同源性高的區(qū)域，可以通過對(duì)水稻品種日本晴的公知的基因組DNA和該水稻個(gè)體的基因組DNA的堿基序列進(jìn)行對(duì)位排列使同源性達(dá)到最高來(lái)確定。此外，水稻品種日本晴以外的水稻個(gè)體中的“相當(dāng)于水稻品種日本晴的SNP的SNP”，是指在含有該SNP的區(qū)域中，在對(duì)水稻品種日本晴的公知的基因組DNA和該水稻個(gè)體的基因組DNA的喊基序列進(jìn)打?qū)ξ慌帕惺雇葱赃_(dá)到最高的情況下，位于與該SNP對(duì)應(yīng)的位置上的堿基。
[0061]為了培育也能夠在比以往品種的培育地區(qū)更北的地域栽培的新品種，本發(fā)明的發(fā)明人首先關(guān)于出穗期，將水稻品種哈巴達(dá)克與水稻品種越光雜交，在分離群體中進(jìn)行了 QTL(Quantitative Trait Locus,數(shù)量性狀基因座)分析。結(jié)果表明，在水稻品種哈巴達(dá)克的第3染色體長(zhǎng)臂的QTS14區(qū)(與水稻品種日本晴的第3染色體的第31，720，064號(hào)堿基?第31，724，043號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域)上，存在提前出穗期，促使早熟的QTL。因此，本發(fā)明人培育了將越光的該區(qū)域所包含的基`因置換成源自哈巴達(dá)克的基因而成的新品種?？梢酝茰y(cè)該新品種是比原品種越光更加早熟的水稻。
[0062]在通過非基因重組法進(jìn)行植物品種改良的情況下，被導(dǎo)入的源自外源品種的染色體片段過大時(shí)，存在大量導(dǎo)入目標(biāo)性狀基因以外的功能不明的其他基因的危險(xiǎn)，也存在損害原品種具有的優(yōu)良性狀的危險(xiǎn)。因此，本發(fā)明人為了控制導(dǎo)入的源自外源品種的染色體片段置換區(qū)域，不改變?cè)贩N具有的優(yōu)良性狀，選育出具有目標(biāo)性狀的新品種，通過專利文獻(xiàn)2所記載的方法進(jìn)行了新品種的培育。
[0063]專利文獻(xiàn)2所記載的新品種的培育方法，具體如下所述。首先，根據(jù)公知的水稻基因信息，設(shè)定圖1所示位置關(guān)系的5種DNA標(biāo)記。即，在包含目標(biāo)區(qū)域T的上游側(cè)末端或其上游設(shè)定DNA標(biāo)記M2，在DNA標(biāo)記M2的上游設(shè)定DNA標(biāo)記M1，在目標(biāo)區(qū)域T的下游側(cè)末端或其下游設(shè)定DNA標(biāo)記M4，在DNA標(biāo)記M4的下游設(shè)定DNA標(biāo)記M5，在目標(biāo)區(qū)域T中設(shè)定DNA標(biāo)記M3。接著，在越光染色體中，對(duì)僅包含目標(biāo)區(qū)域T的一部分置換為源自哈巴達(dá)克的染色體片段的染色體片段置換系進(jìn)行回交，根據(jù)所述5種DNA標(biāo)記Ml?M5，從所得的雜交群體中篩選令人滿意的個(gè)體。然后，對(duì)該個(gè)體進(jìn)行適當(dāng)自交或回交，同樣根據(jù)DNA標(biāo)記Ml?M5篩選令人滿意的個(gè)體，如此適當(dāng)?shù)胤磸?fù)，從而能夠得到源自哈巴達(dá)克的染色體片段所置換的區(qū)域的上游側(cè)末端位于DNA標(biāo)記Ml與M2之間，該區(qū)域的下游側(cè)末端位于DNA標(biāo)記M4與M5之間的后代個(gè)體。如圖1所示，該后代個(gè)體的DNA標(biāo)記Ml和M5與原品種是相同類型，DNA標(biāo)記M2、M3和M4與外源品種(在本發(fā)明中為哈巴達(dá)克)是相同類型。
[0064]這里，通過專利文獻(xiàn)2所記載的新品種培育方法，若DNA標(biāo)記Ml與M2之間的距離dl延長(zhǎng)，則源自外源品種的染色體片段(本申請(qǐng)中，為源自哈巴達(dá)克的染色體片段)L的上游側(cè)末端可存在的范圍擴(kuò)大，難以確定被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長(zhǎng)度。另一方面，若距離dl縮短，則源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的上游側(cè)末端可存在的范圍縮小，容易確定被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長(zhǎng)度。同樣地，若DNA標(biāo)記M4與M5之間的距離d3延長(zhǎng)，則源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的下游側(cè)末端可存在的范圍擴(kuò)大，難以確定被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長(zhǎng)度，若距離d3縮短，則源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的下游側(cè)末端可存在的范圍縮小，容易確定被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長(zhǎng)度。
[0065]具體地，表I所示DNA標(biāo)記Ml?M5組，即，將與水稻品種日本晴的第3染色體的第31，521，442號(hào)SNP (單核苷酸多態(tài)性)相當(dāng)?shù)腟NP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)設(shè)定為DNA標(biāo)記Ml (DNA標(biāo)記Ml-Ac (QTS14))，將與水稻品種日本晴的第3染色體的第31，689，690號(hào)SNP相當(dāng)?shù)腟NP (水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)設(shè)定為DNA標(biāo)記M2 (DNA標(biāo)記M2_Ct (QTS14))，將與水稻品種日本晴的第3染色體的第32，208，924號(hào)SNP相當(dāng)?shù)腟NP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)設(shè)定為DNA標(biāo)記M3 (DNA標(biāo)記M3-Ag (QTS14))，將與水稻品種日本晴的第3染色體的第32，298，686號(hào)SNP相當(dāng)?shù)腟NP (水稻品種越光中為G，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)設(shè)定為DNA標(biāo)記M4 (DNA標(biāo)記M4-Gc (QTS14))，將與水稻品種日本晴的第3染色體的第32，363，157號(hào)SNP相當(dāng)?shù)腟NP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)設(shè)定為DNA標(biāo)記M5 (DNA標(biāo)記M5_At(QTS14))，通過專利文獻(xiàn)2所述的培育方法選育出了新品種。從這些結(jié)果可以看出，可以選育出將水稻個(gè)體的第3染色體中包含DNA標(biāo)記M2-Ct (QTS14)至DNA標(biāo)記M4_Gc (QTS14)的區(qū)域(即，與水稻品種日本晴的第3染色體中第31，689，690號(hào)堿基?第32，298，686號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域)的區(qū)域置換為源自哈巴達(dá)克的染色體片段的新品種。在該新品種中，源自哈巴達(dá)克的染色體 片段的上游端位于比DNA標(biāo)記Ml-Ac (QTS14)更下游至DNA標(biāo)記M2-Ct (QTS14)的區(qū)域(即，與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，521，443號(hào)堿基?第31，689，690號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域)，該染色體片段的下游端位于DNA標(biāo)記M4-Gc(QTS14)至DNA標(biāo)記M5-At (QTS14)更上游的區(qū)域(即，與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，298，686號(hào)堿基?第32，363，156號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域)。
[0066][表 I]
【權(quán)利要求】
1.水稻品種越光桿6 號(hào)(Oryza sativa L.cultivar Koshihikar1-kaz usa6gou),其特征在于，其品種權(quán)申請(qǐng)?zhí)枮榈?5587號(hào)。
2.一種后代個(gè)體，其特征在于，該后代個(gè)體是選自由權(quán)利要求1所述的品種的個(gè)體及權(quán)利要求1所述的品種的個(gè)體的后代個(gè)體所組成的組中的兩個(gè)個(gè)體雜交得到的。
3.—種水稻品種鑒別方法，該方法是鑒別某種水稻個(gè)體是否為特定品種的方法，其特征在于， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，521，442號(hào)SNP即單核苷酸多態(tài)性的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記Ml ； 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，689，690號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M2 ； 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，208，924號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M3 ； 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，298，686號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為G，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記M4; 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，363，157號(hào)SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M5 ； 通過該水稻個(gè)體的基因組分析，對(duì)選自由上述DNA標(biāo)記Ml?M5所組成的組中的一種以上的DNA標(biāo)記進(jìn)行分型； 當(dāng)?shù)玫降姆中徒Y(jié)果與水稻·品種越光籽6號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-kazusa6gou)或水稻品種越光 H5 號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-eich5gou)的結(jié)果一致時(shí),鑒定該水稻個(gè)體為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種越光H5號(hào)。
4.一種水稻品種鑒別方法，該方法是鑒別某種水稻個(gè)體是否為特定品種的方法，其特征在于， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第8，757，818號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記Ml ； 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第8，940，503號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M2 ； 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第9，325，062號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M3 ； 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第9，533，057號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為G，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記M4; 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第6染色體中的第9，777，196號(hào)SNP的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M5 ； 通過該水稻個(gè)體的基因組分析，對(duì)選自由上述DNA標(biāo)記Ml?M5所組成的組中的一種以上的DNA標(biāo)記進(jìn)行分型； 當(dāng)?shù)玫降姆中徒Y(jié)果與水稻品種越光籽6號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-kazusa6gou)或水稻品種越光 H3 號(hào)(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-eich3gou)的結(jié)果一致時(shí),鑒定該水稻個(gè)體為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種越光H3號(hào)。
5.一種使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，將水稻個(gè)體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，720，064號(hào)堿基?第31，724，043號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克的由該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
6.如權(quán)利要求5所述的使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，691號(hào)堿基?第31，720，064號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且使該染色體片段的下游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，724，043號(hào)堿基?第32，298，685號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域。
7.一種使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，將水稻個(gè)體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，690號(hào)堿基?第32，298，686號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克的由該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
8.如權(quán)利要求7所述的使水稻個(gè)體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，521，443號(hào)堿基?第31，689，690號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且使該染色體片段的下游端位于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，298，686號(hào)堿基?第32，363，156號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域。
9.一種水稻品種，其特征在于，其是根據(jù)權(quán)利要求5?8中任意一項(xiàng)所述的使水稻個(gè)體早熟的方法培育得到的。
10.一種后代個(gè)體，其特征在于，其是選自由權(quán)利要求9所述品種的個(gè)體及權(quán)利要求9所述品種的個(gè)體的后代個(gè)體所組成的組中的兩個(gè)個(gè)體雜交得到的。
11.一種水稻的栽培方法，其特征在于，在北緯38.5度以北，栽培選自由將水稻個(gè)體的第6染色體中的與水稻品種日本晴的第6染色體中包含第8，940, 503號(hào)堿基?第9，533，057號(hào)堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽6號(hào)、水稻品種越光H3號(hào)或水稻品種哈巴達(dá)克的由該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段而成的水稻個(gè)體、水稻品種越光籽6號(hào)的水稻個(gè)體及水稻品種越光H3號(hào)的水稻個(gè)體所組成的組中的一種以上的水稻個(gè)體。
【文檔編號(hào)】C12N15/09GK103429073SQ201180069335
【公開日】2013年12月4日 申請(qǐng)日期:2011年3月18日 優(yōu)先權(quán)日:2011年3月18日
【發(fā)明者】林少揚(yáng) 申請(qǐng)人:本田技研工業(yè)株式會(huì)社