專利名稱：HIV感染疾病進展分子標志物miR-31的制作方法
技術領域：
本發(fā)明涉及HIV感染預后診斷領域，具體來說涉及一種HIV感染疾病進展分子標志物miR-31，其可應用于在HIV感染早期進行預后評估，以給患者及時有效地隨訪、治療等干預措施，以延長生存時間，提高生存質量。
背景技術：
microRNA (miRNA)是近年來的研究熱點,它是一種廣泛存在于真核生物中的單鏈小分子RNA，不具編碼功能，但它能夠結合于基因序列的側翼區(qū)域阻遏或抑制靶mRNA的翻譯，具有高度的保守性、時序性和組織特異性，目前在腫瘤、血液病、病毒感染等多種疾病的臨床診斷、治療及預后評價等領域發(fā)揮了重要作用。 艾滋病是一個世界性的重大傳染病，嚴重威脅人們的健康和影響經(jīng)濟社會的發(fā)展。HIV感染后，疾病進展速度不同，一般經(jīng)8-10年進入艾滋病期，稱為“典型進展者”。但10%的感染者，在感染三年甚至一年內⑶4+T細胞顯著下降至350個/微升以下，稱為“快速進展者”。如快速進展者診斷后不能定期隨訪及盡早治療，則發(fā)病率及死亡率將持續(xù)上升，且增加傳播風險。目前，我國經(jīng)性途徑HIV感染者不斷增加，男男性接觸中快速進展者比例較高，如果在HIV感染早期能對預后進行有效預測，區(qū)分快速進展者及典型進展者，個體化合理安排病人的隨訪及治療，不僅可以提高HIV感染者的生存時間及生存質量，對國家的艾滋病防治工作亦具有重要意義。目前，HIV感染疾病進展及預后評價的方式主要有以下幾種CD4+T細胞數(shù)量、病毒載量、免疫活化等其他指標。CD4+T細胞數(shù)量是HIV感染的靶細胞，可有效反映機體免疫狀態(tài)，但其檢測需要流式細胞儀，儀器及相應試劑價格昂貴，技術要求高，不適合普遍開展，且快速進展者及典型進展者在HIV感染早期，CD4+T細胞數(shù)量差異不夠顯著，不易對未來的疾病進展進行有效預測；病毒載量在HIV感染早期波動較大，且并不與臨床免疫狀態(tài)完全平行；免疫活化等指標雖有報道可預測疾病預后，但對設備要求高，需要專業(yè)人員的分析，標本最好選用新鮮標本，儲存運輸不便，難以推廣。近年來的研究表明，HIV感染和miRNA密切相關，miRNA可以通過作用于病毒本身或作用于免疫系統(tǒng)從而影響疾病進展，因此對HIV感染疾病進展的診斷也可能有相應的作用。與HIV感染相關的miRNA種類較多且作用不一，已有研究表明在HIV感染后miRNA普遍下調，miR-17/92基因簇可抑制HIV感染等。雖然已在該領域進行了一些研究，但是HIV感染早期疾病快速進展者的miRNA表達變化目前還沒有研究，在臨床和研究中，需尋找可有效預測疾病預后的miRNA標志物。

發(fā)明內容
本發(fā)明提供了一種新的HIV感染疾病進展相關的miRNA作為疾病進展的分子標志物，該 miRNA 為 miR-31，其序列為 5’-AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCU-3’ (SEQ ID NO: I)。發(fā)明人發(fā)現(xiàn)，miR-31在HIV感染早期(120天)快速進展者外周血單個核細胞中的含量相比典型進展者明顯降低，可以預測感染一年后疾病進展情況，由此可見，降低的miR-31與HIV感染疾病進展及預后密切相關。在上述發(fā)現(xiàn)的基礎上，本發(fā)明提供了 miR-31在制備診斷HIV感染疾病進展的診斷試劑中的用途。具體地,所述診斷試劑通過檢測被試者外周血單個核細胞中miR-31的含量,并與HIV感染典型進展者平均水平相比較來診斷HIV感染疾病進展，其中，miR-31在HIV感染快速進展者外周血單個核細胞中的含量相對于典型進展者顯著下降。在一個特定的實施方案中，使用定量PCR的方法來檢測被試者外周血單個核細胞中miR-31含量。本發(fā)明還提供了一種診斷HIV感染疾病進展的診斷試劑盒，其包括(I)外周血單個核細胞總RNA提取試劑，(2) RNA 加 polyA 試劑，(3) RT-PCR 試劑，·(4)定量 PCR 試劑。其中，定量PCR試劑中包括HIV感染疾病進展分子標志物miR-31的特異性正向引物，優(yōu)選地，其序列為 5’ -CAAGATGCAGGCATCG-3’ (SEQ ID NO :7)。在一個特定的實施方案中，所述外周血單個核細胞總RNA提取試劑中包括序列為5，-CAACCTCCTAGAAAGA-3’ (SEQ ID NO :2)的 External Control-1 ;所述 RNA 加 polyA 試劑中包括序列為 5’-TGAGCAACGCGAACAA-3’ (SEQ ID NO :3)的 External Control-2 ;所述RT-PCR 試劑中包括序列為 5’ -CAGTGGTATCAACGCACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVN-3’ (SEQ ID NO 4)的RT-Primer (其中，V為A或C或G，N為A或T或C或G);所述定量 PCR 試劑中包括序列分別為 5’ -CTCACACGACTCACGACAC-3’ (SEQ ID NO :5)和 5’ -CTCACACGACTCACGACACCAGTGGTATCAACGCACTC-3’ (SEQ ID NO :6)的通用反向引物 UPM-short 和UPM-long。使用本發(fā)明的HIV感染疾病進展分子標志物miR-31診斷HIV感染疾病進展具有操作簡單，安全無創(chuàng)傷，高特異性，高靈敏性以及易于大量篩查的特點。
具體實施例方式I.外周血單個核細胞中總RNA的提取抽取11名HIV感染快速進展者感染120天5ml血液，同時抽取6名HIV感染疾病典型進展者及4名正常人對照血液各5ml作為對照，密度梯度離心法收集外周血單個核細胞,用PBSlml重懸細胞，置于I. 5ml的RNase/DNase-free離心管中。使用RNA提取試劑盒(北京曠博生物技術有限公司)自外周血單個核細胞中提取總RNA,每250 μ I外周血單個核細胞中加入I μ I (20ηΜ)序列為5’-CAACCTCCTAGAAAGA-3’(SEQ ID NO :2)的External Control-1 (上海生工生物工程技術有限公司合成)來監(jiān)控外周血單個核細胞中RNA的提取質量。提取的總RNA使用Thermo NanoDrop2000c測定濃度。2.三步法定量檢測外周血單個核細胞中的miRNA(I)加 polyA 尾:i.在無RNA酶的PCR管(Axygen公司，200 μ I)中配制加polyA尾的反應液，體系為 20 μ I。每 20 μ I 體系中加入 I μ I (20ηΜ)序列為 5’ -TGAGCAACGCGAACAA-3’ (SEQ IDNO 3)的External Control-2 (上海生工生物工程技術有限公司合成)來監(jiān)控miRNA的加
尾及反轉錄質量。
權利要求
1.一種HIV感染疾病進展分子標志物miR-31，其序列如SEQ ID NO 1所示。
2.權利要求I所述HIV感染疾病進展分子標志物miR-31在制備HIV感染預后的診斷試劑中的用途。
3.權利要求2所述用途，其中，所述 診斷試劑通過檢測被試者外周血單個核細胞中miR-31的含量，并與HIV感染典型進展者平均水平相比較來判斷HIV感染疾病進展。
4.權利要求3所述用途，其中，miR-31在HIV感染快速進展者外周血單個核細胞中的含量相對于典型進展者顯著下降。
5.權利要求3所述用途，其中，使用定量PCR的方法來檢測被試者外周血單個核細胞中miR-31 含量。
6.一種診斷HIV感染疾病進展的診斷試劑盒，其包括 (1)外周血單個核細胞總RNA提取試劑，(2)RNA 加 polyA 試劑，(3)RT-PCR 試劑， (4)定量PCR試劑； 其中，定量PCR試劑中包括權利要求I所述HIV感染疾病進展標志物miR-31的特異性正向引物。
7.權利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述外周血單個核細胞總RNA提取試劑中包括序列為 SEQ ID NO 2 的 External Control-1。
8.權利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述RNA加polyA試劑中包括序列為SEQID NO:3的 External Control-2。
9.權利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述RT-PCR試劑中包括序列為SEQID NO 4的RT-Primer0
10.權利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述定量PCR試劑中包括序列分別為SEQIDNO 5和6的通用反向引物UPM-short和UPM-long。
11.權利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述HIV感染疾病進展分子標志物miR-31的特異性正向引物的序列如SEQ IDNO 7所示。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種HIV感染疾病進展分子標志物miR-31，及其在制備HIV感染疾病進展診斷試劑中的用途。HIV感染快速進展者miR-31在外周血單個核細胞中的含量比典型進展者及正常對照外周血單個核細胞中的含量低，能夠預測感染一年后疾病進展程度。本發(fā)明還提供了一種診斷HIV感染疾病進展的診斷試劑盒。使用本發(fā)明的HIV感染疾病進展分子標志物miR-31診斷疾病進展具有操作簡單，安全無創(chuàng)傷，高特異性，高靈敏性以及易于大量篩查的特點。
文檔編號C12Q1/68GK102839174SQ20121030597
公開日2012年12月26日 申請日期2012年8月24日 優(yōu)先權日2012年8月24日
發(fā)明者尚紅, 李啟靖, 張子寧, 徐俊杰, 付雅靜 申請人:中國醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院, 北京曠博生物技術有限公司