西葫蘆白粉病顯性抗病基因pm1的連鎖分子標(biāo)記及其應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了與西葫蘆白粉病顯性抗病基因 Pm1 的連鎖SSR分子標(biāo)記(Pm-136),屬于蔬菜分子抗病育種【技術(shù)領(lǐng)域】,涉及白粉病顯性抗病基因的連鎖SSR分子標(biāo)記及其應(yīng)用。所述的分子標(biāo)記Pm-136與抗病基因的遺傳距離為1.7 cm。利用分子標(biāo)記Pm-136可快速準(zhǔn)確的檢測(cè)抗病性狀轉(zhuǎn)育后代植株是否攜帶 Pm1 抗病基因,從而顯著提高抗病育種效率,縮短育種周期。本發(fā)明獲得的Pm-136標(biāo)記具有穩(wěn)定可靠、操作簡(jiǎn)單、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),在鑒別抗、感品種和抗病轉(zhuǎn)育單株時(shí)具有非常高的利用價(jià)值。
【專利說(shuō)明】西葫蘆白粉病顯性抗病基因 pm1的連鎖分子標(biāo)記及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及蔬菜分子抗病育種【技術(shù)領(lǐng)域】,具體為一種與西葫蘆 L )白粉病顯性抗病基因也2連鎖的SSR分子標(biāo)記,以及該標(biāo)記在檢測(cè)抗病植株中的應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 西葫蘆是全球范圍內(nèi)普遍栽植的南瓜屬重要蔬菜之一,在我國(guó)的栽培面積逐年增 力口,特別是近年來(lái)保護(hù)地設(shè)施栽培發(fā)展迅速,已成為繼黃瓜之后的第二大栽培作物。西葫蘆 生產(chǎn)對(duì)農(nóng)民增收、農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整以及豐富人民的菜籃子有著重要意義。
[0003] 白粉病是危害西葫蘆中后期生產(chǎn)的重要病害之一,植株感染白粉病后光合作用嚴(yán) 重降低,植株生長(zhǎng)緩慢,降低產(chǎn)量與品質(zhì),產(chǎn)量損失可達(dá)40%左右。西葫蘆白粉病主要由單 囊殼菌(和二抱白粉菌侵染導(dǎo)致,西 葫蘆對(duì)白粉病沒有免疫類型,高抗材料也非常少,隨著保護(hù)地西葫蘆生產(chǎn)面積的迅速增加, 在高溫高濕的環(huán)境下,白粉病的發(fā)生變的越來(lái)越為嚴(yán)重,已經(jīng)成為西葫蘆生產(chǎn)和制種的主 要障礙。盡管白粉病可采用化學(xué)防治,但由于危害西葫蘆白粉病的生理小種較多,分化快, 化學(xué)藥劑很難有效保證生產(chǎn),而且化學(xué)防治污染環(huán)境,危害消費(fèi)者健康。因此,培育和推廣 抗白粉病品種是解決這一問(wèn)題最經(jīng)濟(jì)、安全、有效的措施。但目前,傳統(tǒng)抗病育種存在抗病 基因轉(zhuǎn)育困難,抗病性狀鑒別準(zhǔn)確性差,抗病育種效率低、周期長(zhǎng)等問(wèn)題,導(dǎo)致生產(chǎn)中抗病 品種少,不能滿足生產(chǎn)需要。緊密連鎖的分子標(biāo)記可以加速抗病育種進(jìn)程、提高選擇的準(zhǔn)確 性,是分子標(biāo)記輔助選擇育種的必要條件。而與瓜類白粉病抗性連鎖的分子標(biāo)記的研究主 要集中在西瓜、甜瓜及黃瓜上,國(guó)內(nèi)外至今未見西葫蘆的相關(guān)研究報(bào)道。因此,開發(fā)與西葫 蘆白粉病抗病基因緊密連鎖的分子標(biāo)記,對(duì)于提高西葫蘆抗病育種效率,拓展抗病基因應(yīng) 用范圍,保障西葫蘆的健康生產(chǎn)具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 本發(fā)明的目的是針對(duì)現(xiàn)有西葫蘆白粉病抗病育種技術(shù)的上述不足,提供西葫蘆白 粉病顯性抗病基因的分子標(biāo)記。本發(fā)明的另一目的是提供該西葫蘆白粉病抗病基因 /^7的分子標(biāo)記應(yīng)用。
[0005] 本發(fā)明的一個(gè)目的提供西葫蘆白粉病顯性抗病基因也2的分子標(biāo)記可通過(guò)如下 技術(shù)方案實(shí)現(xiàn): 西葫蘆白粉病顯性抗病基因的連鎖SSR分子標(biāo)記,所述的分子標(biāo)記為Pm-136,其 具有分子序列表中SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2所述的DNA序列。
[0006] 為實(shí)現(xiàn)上述發(fā)明目的獲得分子標(biāo)記是通過(guò)以下方案實(shí)現(xiàn)的: 所述分子標(biāo)記的獲得方法包括如下步驟: 應(yīng)用SSR-BSA技術(shù):以西葫蘆自交系BS15和BS9分別作為感病和抗病親本配制&代 分離群體,用SSR引物篩選與西葫蘆白粉病顯性抗病基因也7連鎖的分子標(biāo)記,得到共顯性 分子標(biāo)記Pm-136,該標(biāo)記與抗病基因/^7的遺傳連鎖距尚為I. 7 cM。
[0007] 本發(fā)明的另一目的是通過(guò)以下方案實(shí)現(xiàn)的。
[0008] -種所述分子標(biāo)記在對(duì)西葫蘆種質(zhì)資源白粉病抗病基因的鑒定和轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用。
[0009] 本發(fā)明的另一目的是通過(guò)以下方案實(shí)現(xiàn)的。
[0010] 一種檢測(cè)西葫蘆白粉病抗病基因的方法,用以下的一對(duì)分子標(biāo)記引物PCR擴(kuò) 增待檢測(cè)西葫蘆基因組DNA,并檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物: 分子標(biāo)記Pm-136 : 左端引物序列為SEQ ID NO. 1, 右端引物序列為SEQ ID NO. 2, 如果用引物Pm-136能夠擴(kuò)增出131 bp的擴(kuò)增片段,則標(biāo)志著待檢測(cè)西葫蘆存在白粉 病顯性抗病基因/^i。
[0011] 檢測(cè)方法的條件是:所述PCR反應(yīng)體積為15yL,其中IOXbuffer 1.5yL,2. 5 mM dNTPs 0· 3μ L,Tag 酶 0· 2μ L,10 μΜ 引物各 0· 3μ L,模版DNA 30 ng,加 CldH2O 至 15μ L ; PCR反應(yīng)的條件為DNA 95°C預(yù)變性3min后,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸30s,循 環(huán)35次,最后72°C延伸lOmin。
[0012] 本發(fā)明的另一目的是通過(guò)以下方案實(shí)現(xiàn)的。
[0013] 一種篩選抗白粉病抗病基因也2西葫蘆的方法,用所述的分子標(biāo)記對(duì)擴(kuò)增待檢西 葫蘆基因組DNA,用所述的分子標(biāo)記Pm-136能夠擴(kuò)增出131 bp的擴(kuò)增片段,則標(biāo)志該待檢 西葫蘆為存在抗病基因的抗白粉病毒病西葫蘆。
[0014] 篩選方法的條件是:所述PCR反應(yīng)體積為15 μ L,其中IOXbuffer 1. 5 μ L,2. 5 mM dNTPs 0· 3μ L,Tag 酶 0· 2μ L,10 μΜ 引物各 0· 3μ L,模版DNA 30 ng,加 CldH2O 至 15μ L ; 所述PCR反應(yīng)的條件為DNA 95°C預(yù)變性3min后,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸 30s,循環(huán)35次,最后72°C延伸lOmin。
[0015] 有益效果: 本發(fā)明在西葫蘆自交系BS9中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)白粉病顯性抗病基因也7,其優(yōu)異的抗病 表現(xiàn)在西葫蘆抗病育種中具有重要的利用價(jià)值。獲得了與抗病基因緊密連鎖的分子標(biāo)記 Pm-136。利用獲得的分子標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇,成功的將抗病基因通過(guò)雜交、回交轉(zhuǎn)育的方法 導(dǎo)入西葫蘆優(yōu)良自交系BS15中,使其獲得白粉病抗性。
[0016] 1、在西葫蘆自交系BS9中鑒定了一個(gè)白粉病顯性抗病基因也7。
[0017] 2、獲得與西葫蘆白粉病抗病基因也7緊密連鎖的共顯性分子標(biāo)記Pm-136。Pm-136 與抗病基因的遺傳距離為I. 7 cm。利用該標(biāo)記能夠通過(guò)輔助選擇鑒定將抗病基因成功導(dǎo)入 其它西葫蘆感病優(yōu)良自交系,使之獲得抗病性狀。
[0018] 3、鑒定方便。分子標(biāo)記具有擴(kuò)增穩(wěn)定、檢測(cè)方便、快速準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn)。用標(biāo)記Pm-136 檢測(cè)西葫蘆抗病基因&i,可以確定抗病基因是否存在以及存在狀態(tài),并預(yù)測(cè)植株對(duì)白粉病 的抗性,加快該抗病基因的利用。
[0019] 4、本發(fā)明提出了利用西葫蘆白粉病抗病種質(zhì)資源BS9中抗病基因的方法:利用分 子標(biāo)記篩選,通過(guò)雜交與回交轉(zhuǎn)育將抗病基因?qū)胛骱J優(yōu)良的感病自交系中,利用該方 法成功將抗病基因?qū)胛骱J優(yōu)良自交系BS15,使其獲得了白粉病抗性。
【專利附圖】
【附圖說(shuō)明】
[0020] 圖1為分子標(biāo)記Pm-136與西葫蘆抗病基因/^7的遺傳連鎖圖,左邊為標(biāo)記間的圖 距; 圖2為分子標(biāo)記擴(kuò)增帶型; Pm-136擴(kuò)增帶型,其中Pl為感病親本BS15, P2為抗病親本BS9, Fl為雜交一代;1-23 為以BS15為輪回親本的回交單株;M :Trans DNA markerll,箭頭所指為131 bp特異擴(kuò)增 條帶。
【具體實(shí)施方式】
[0021] 實(shí)施例1 西葫蘆白粉病顯性抗病基因的連鎖SSR分子標(biāo)記,所述的分子標(biāo)記為Pm-136,其具 有序列表中SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2所述的DNA序列。
[0022] 所述的西葫蘆白粉病顯性抗病基因也2的連鎖SSR分子標(biāo)記的獲得方法,、包括 如下步驟: 應(yīng)用SSR-BSA技術(shù):以西葫蘆自交系BS15和BS9分別作為感病和抗病親本配制&代 分離群體,用SSR引物篩選與西葫蘆白粉病顯性抗病基因也7連鎖的分子標(biāo)記,得到共顯性 分子標(biāo)記Pm-136,該標(biāo)記與抗病基因/^7的遺傳連鎖距尚為I. 7 cm。
[0023] 所述的分子標(biāo)記在對(duì)西葫蘆種質(zhì)資源白粉病抗病基因的鑒定和轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用。
[0024] -種檢測(cè)西葫蘆白粉病抗病基因也2的方法,包括以下步驟: 用以下的一對(duì)分子標(biāo)記引物PCR擴(kuò)增待檢測(cè)西葫蘆基因組DNA,并檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物: 分子標(biāo)記Pm-136 : 左端引物序列為SEQ ID NO. 1, 右端引物序列為SEQ ID NO. 2, 用所述分子標(biāo)記Pm-136能夠擴(kuò)增出131 bp的擴(kuò)增片段,則標(biāo)志著待檢測(cè)西葫蘆存在 白粉病顯性抗病基因/^i。
[0025] 進(jìn)一步的,所述 PCR 反應(yīng)體積為 15 μ L,其中 IOXbuffer 1.5 μ L,2.5 mM dNTPs 0· 3 μ L,Tag 酶 0.2 μ L,10 μ M 引物各 0.3 μ L,模版 DNA 30 ng,加 CldH2O 至 15 μ L。所述 PCR 反應(yīng)的條件為DNA 95°C預(yù)變性3min后,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸30s,循環(huán) 35次,最后72°C延伸lOmin。
[0026] -種篩選抗白粉病抗病基因也2西葫蘆的方法,用所述的分子標(biāo)記對(duì)擴(kuò)增待檢西 葫蘆基因組DNA,用所述的分子標(biāo)記Pm-136能夠擴(kuò)增出131 bp的擴(kuò)增片段,則標(biāo)志該待檢 西葫蘆為存在抗病基因的抗白粉病毒病西葫蘆。
[0027] 進(jìn)一步的,所述 PCR 反應(yīng)體積為 15 μ L,其中 IOXbuffer 1.5 μ L,2. 5 mM dNTPs 0· 3 μ L,Tag 酶 0.2 μ L,10 μ M 引物各 0.3 μ L,模版 DNA 30 ng,加 CldH2O 至 15 μ L。所述 PCR 反應(yīng)的條件為DNA 95°C預(yù)變性3min后,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸30s,循環(huán) 35次,最后72°C延伸10min。
[0028] 實(shí)施例2 本實(shí)施例具體描述了所述的與西葫蘆白粉病顯性抗病基因的連鎖SSR分子標(biāo)記的 獲得方法,包括以下步驟: (一)西葫蘆自交系BS15與BS9 F2代的創(chuàng)建與表型鑒定: (1)西葫蘆自交系BS15 (母本)與BS9 (父本)進(jìn)行雜交得到雜種F1,F(xiàn)1自交產(chǎn)生F2 代群體。
[0029] (2)F2代群體單株種植于溫室營(yíng)養(yǎng)缽內(nèi),外罩防蟲網(wǎng),子葉完全展開后接種白粉病 菌孢子,接種15天后進(jìn)行抗病性狀調(diào)查。鑒定結(jié)果見表1。
[0030]
【權(quán)利要求】
1. 西葫蘆白粉病顯性抗病基因也2的連鎖SSR分子標(biāo)記,其特征在于,所述的分子標(biāo)記 為Pm-136,其具有序列表中SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2所述的DNA序列。
2. -種如權(quán)利要求1所述的西葫蘆白粉病顯性抗病基因也2的連鎖SSR分子標(biāo)記的 獲得方法,其特征在于,包括如下步驟: 應(yīng)用SSR-BSA技術(shù):以西葫蘆自交系BS15和BS9分別作為感病和抗病親本配制&代 分離群體,用SSR引物篩選與西葫蘆白粉病顯性抗病基因也7連鎖的分子標(biāo)記,得到共顯性 分子標(biāo)記Pm-136,該標(biāo)記與抗病基因/^7的遺傳連鎖距尚為1. 7 cm。
3. -種如權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記在對(duì)西葫蘆種質(zhì)資源白粉病抗病基因的鑒定和 轉(zhuǎn)移中的應(yīng)用。
4. 一種檢測(cè)西葫蘆白粉病抗病基因的方法,其特征在于, 用以下的一對(duì)分子標(biāo)記引物PCR擴(kuò)增待檢測(cè)西葫蘆基因組DNA,并檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物: 分子標(biāo)記Pm_136 : 左端引物序列為SEQ ID NO. 1, 右端引物序列為SEQ ID NO. 2, 用所述分子標(biāo)記Pm-136能夠擴(kuò)增出131 bp的擴(kuò)增片段,則標(biāo)志著待檢測(cè)西葫蘆存在 白粉病顯性抗病基因/^i。
5. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測(cè)西葫蘆白粉病抗病基因的方法,其特征在于,所述 PCR 反應(yīng)體積為 15iiL,其中 lOXbuffer 1.5iiL,2.5 mM dNTPs 0.3iiL,Tag 酶 0.2iiL, 1〇1^引物各0.3111,模版0嫩3〇1^,加(1(11120至1 5111。
6. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測(cè)西葫蘆白粉病抗病基因的方法,其特征在于,所述 PCR反應(yīng)的條件為DNA 95°C預(yù)變性3min后,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸30s,循 環(huán)35次,最后72°C延伸lOmin。
7. -種篩選抗白粉病抗病基因西葫蘆的方法,其特征在于,用權(quán)利要求1所述的分 子標(biāo)記對(duì)擴(kuò)增待檢西葫蘆基因組DNA,用所述的分子標(biāo)記Pm-136能夠擴(kuò)增出131 bp的擴(kuò)增 片段,則標(biāo)志該待檢西葫蘆為存在抗病基因的抗白粉病毒病西葫蘆。
8. 根據(jù)權(quán)利要求7所述的篩選抗白粉病抗病基因西葫蘆的方法,其特征在于,所述 PCR 反應(yīng)體積為 15iiL,其中 lOXbuffer 1.5iiL,2.5 mM dNTPs 0.3iiL,Tag 酶 0.2iiL,10 1^引物各0.31^,模版0嫩30叩,加(1(11120至15111。
9. 根據(jù)權(quán)利要求7所述的篩選抗白粉病抗病基因西葫蘆的方法,其特征在于,所述 PCR反應(yīng)的條件為DNA 95°C預(yù)變性3min后,94°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸30s,循 環(huán)35次,最后72°C延伸lOmin。
【文檔編號(hào)】C12Q1/68GK104498484SQ201410717699
【公開日】2015年4月8日 申請(qǐng)日期:2014年12月1日 優(yōu)先權(quán)日:2014年12月1日
【發(fā)明者】李海真, 張國(guó)裕, 張帆, 賈長(zhǎng)才, 姜立綱 申請(qǐng)人:北京市農(nóng)林科學(xué)院