專利名稱:miRNA-320在制備促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡制劑中的應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)材料技術(shù)領(lǐng)域,是一種小RNA分子miRNA-320在制備促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡制劑中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
小RNA (miRNA)是一種長度大約為18 25個核苷酸的RNA小分子,自參與調(diào)控線蟲時序發(fā)育的miRNA分子lin-4與let_7被發(fā)現(xiàn)以來,至2004年初已有700多個線蟲、果蠅、人、擬南芥等真核生物miRNA被報道。目前根據(jù)國際權(quán)威miRNA數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計,人體中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)695個miRNA分子(Sanger Institute, Release 12.0)。 miRNA的特點主要表現(xiàn)為它的保守性、基因簇集現(xiàn)象和特異性表達(dá)。 miRNA通過與耙mRNA的3' -UTR堿基不完全互補配對的方式來執(zhí)行對耙mRNA的翻譯抑制功能。有報道指出,Lin-4和let-7在線蟲發(fā)育中起著時序調(diào)控的作用。這兩個基因或它們的靶基因發(fā)生突變會造成線蟲發(fā)育的形態(tài)突變。近來,在篩選果蠅生長缺陷突變株的過程中發(fā)現(xiàn)了 bantam基因座,該基因座編碼了果蠅幼蟲抑制程序性死亡和促進(jìn)細(xì)胞增殖的miRNA。 Bantam miRNA的大量表達(dá)會抑制Hid mRNA的翻譯。Hid是程序性死亡的主要啟動因子。另外有人報導(dǎo),小鼠miRNA-375的表達(dá)會抑制葡萄糖誘導(dǎo)的胰島素分泌,但是并不改變葡萄糖代謝或細(xì)胞內(nèi)Ca2+信號強度。通過RNA干擾技術(shù)將miRNA_375的靶分子Mtpn沉默,發(fā)現(xiàn)產(chǎn)生的效應(yīng)與miRNA-375的作用效果一致。 同時,小RNA與癌癥之間的關(guān)系也是目前的研究熱點之一。有人通過使用Northern blot和芯片技術(shù)對基因組進(jìn)行大規(guī)模的篩查發(fā)現(xiàn)miRNA表達(dá)與多種癌癥相關(guān),并且這些miRNA可能起到抑制腫瘤或促進(jìn)腫瘤的作用。有研究發(fā)現(xiàn)肺癌病人的let-7表達(dá)顯著降低,導(dǎo)致這些病人更差的預(yù)后,非小細(xì)胞肺癌病人的let-7表達(dá)水平越低,其預(yù)后越差,術(shù)后生存期越短。體外組織培養(yǎng)實驗表明,在人的肺癌細(xì)胞中瞬時的表達(dá)let-7可以抑制細(xì)胞的增殖,這也說明let-7在肺組織中可能是一種具有抑癌作用的miRNA[TakamizawaJ, Konishi H, Yanagisawa K, Tomida S, 0sada H, Endoh H, Harano T, Yatabe Y, NaginoM, Nimura Y, Mitsudomi T, Takahashi T. Cancer Res. 2004 64(11) :3753—3756]。另夕卜,有報道m(xù)iRNA-21在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中表達(dá)增加。這個基因在腫瘤組織中表達(dá)量比正常組織高5-100倍。反義核酸的研究發(fā)現(xiàn)這個miRNA通過抑制凋亡而并非影響細(xì)胞增殖控制細(xì)胞生長,這預(yù)示著這個miRNA具有促癌功能[Chan, J. A. , Krichevsky, A.M. , and Kosik,K. S. MicroRNA—21 is an anti即optotic factor inhuman glioblastoma cells. CancerRes. 200565 :6029-6033]。由于miRNA_21不是一個大腦特異性的miRNA,它在乳腺癌樣品中表達(dá)也有增加,因此這個miRNA可能在腫瘤發(fā)生中起到廣泛的作用。
但至今未見關(guān)于miRNA-320應(yīng)用于制備促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡制劑的任何報道。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供mir-320促進(jìn)細(xì)胞凋亡的新用途。
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本發(fā)明為實現(xiàn)上述發(fā)明目的,驗證miRNA-320是否具有促進(jìn)細(xì)胞凋亡的功能。首先采用熒光實時定量PCR技術(shù)檢測了 26例膽管癌樣本和9例正常膽管上皮細(xì)胞樣本中miRNA-320的表達(dá)豐度情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn)所有26例膽管細(xì)胞癌樣本中miRNA-320的表達(dá)豐度值明顯低于9例正常膽管上皮細(xì)胞樣本。 在此工作的基礎(chǔ)上,本發(fā)明通過將miRNA-320轉(zhuǎn)入膽管癌細(xì)胞系(QBC-939和RBE)中,探討了過量表達(dá)miRNA-320對膽管癌細(xì)胞系(QBC-939和RBE)生物學(xué)特性的影響。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),miRNA-320在膽管癌細(xì)胞系QBC-939和RBE中的高表達(dá)能顯著促進(jìn)上述膽管癌細(xì)胞系發(fā)生凋亡。 為了探討過量表達(dá)miRNA-320促進(jìn)膽管癌細(xì)胞凋亡可能的分子機制,本發(fā)明結(jié)合國際上通用的3種miRNA靶基因預(yù)測分析軟件(Pictar, miRanda, Targetscan)對miRNA-320潛在的耙基因進(jìn)行預(yù)測,從預(yù)測得到的潛在耙基因中篩選出了可能與miRNA-320促進(jìn)細(xì)胞凋亡功能相關(guān)的候選耙基因——髓細(xì)胞白血病基因-1 (Mcl-l)。之后本發(fā)明設(shè)計了相應(yīng)的實驗來驗證Mcl-l是否是miRNA-320的靶基因。用表達(dá)miRNA-320的腺病毒感染QBC-939、RBE和HEK293細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)miRNA-320高表達(dá)會導(dǎo)致上述細(xì)胞中Mcl-l蛋白水平顯著下降,說明miRNA-320通過下調(diào)Mcl-1在上述細(xì)胞中的蛋白水平促進(jìn)細(xì)胞的凋亡,為今后設(shè)計抑制Mcl-1表達(dá)的藥物提供了一個新的靶點。
圖l.實時定量PCR檢測miRNA-320在膽管癌樣本和正常膽管上皮細(xì)胞中的表達(dá)豐度圖。 圖2.高表達(dá)miRNA-320顯著促進(jìn)RBE細(xì)胞凋亡圖。
具體實施例方式
1.制備總RNA : 將正常肝上皮細(xì)胞和膽管上皮細(xì)胞樣本,每lOOmg樣本加入lml RNA抽提液TriZol,根據(jù)Invitrogen公司提供的標(biāo)準(zhǔn)操作流程抽提總的RNA,并測定相應(yīng)的總RNA的濃度。 2. miRNA-320表達(dá)豐度的測定 使用Applied Biosyste公司的小RNA檢測試劑盒(TaqMan MicroRNAAssay HumanPanel-Early Access Kit, P/N :4365409),根據(jù)試劑盒操作手冊的標(biāo)準(zhǔn)操作流程,使用熒光實時定量PCR技術(shù)分別檢測26例膽管細(xì)胞癌樣本和9例正常膽管上皮細(xì)胞樣本中miRNA-320的表達(dá)豐度值(Ct),用miRNA-320的表達(dá)豐度值(Ct)減去18sRNA( —種作為內(nèi)參照的RNA)的表達(dá)豐度值得到標(biāo)準(zhǔn)化的表達(dá)豐度值(ACt),之后使用Excel電子表格軟件繪制如圖1所示的miRNA-320在膽管癌樣本和正常膽管上皮細(xì)胞中的表達(dá)豐度圖。
3.小RNA靶序列的預(yù)測 結(jié)合目前國際上通用的3種生物信息學(xué)分析預(yù)測軟件(miRanda、 PicTar、TargetScan)對miRNA-320的潛在耙基因進(jìn)行預(yù)測,綜合三種軟件預(yù)測得到的多種潛在耙基因,以3種軟件均預(yù)測得到的共同的潛在靶基因作為候選基因,結(jié)合上述候選基因已經(jīng)報導(dǎo)的功能從中進(jìn)一步篩選出與細(xì)胞凋亡密切相關(guān)的基因作為下一步驗證實驗的目標(biāo)。本發(fā)明中篩選得到Mcl-l作為下一步驗證實驗的候選基因。
4. miRNA-320表達(dá)載體構(gòu)建 使用下述弓l物,上游5, -ggactagttggccgacaaaacccgggaccctgatcttg-3,,下游5' _cgcaagcttacaacctcacctgcaacgcgaccagccgcc_3';以基因組DNA為模板進(jìn)行PCR反應(yīng),擴增得到長度大約為331bp的片段,將片斷回收后用限制性內(nèi)切酶SpeI和Hindlll雙酶切片斷,分別以順向(forward)和反向(reverse)兩種方式將酶切片斷連接到pCDNA3. O(Invitrogen公司)載體中構(gòu)建出能表達(dá)具有生物學(xué)活性的miRNA-320真核表達(dá)質(zhì)粒miRNA-320 (forward)和不具有生物學(xué)活性的miRNA-320真核表達(dá)質(zhì)粒miRNA-320 (reverse)。另外將酶切片斷連接到pEZ-AV載體中構(gòu)建出能表達(dá)具有生物學(xué)活性的miRNA-320腺病毒包裝質(zhì)粒(Ad-miRNA_320)。
5.細(xì)胞凋亡實驗用表達(dá)miRNA-320的腺病毒(Ad-miRNA_320)感染人膽管癌細(xì)胞系RBE,6小時后,加入濃度為25ng/ml的5-FU處理24小時后,使用Promega公司的TUNEL細(xì)胞凋亡檢測試劑盒,根據(jù)試劑盒標(biāo)準(zhǔn)操作流程,制備樣品,于熒光顯微鏡下觀察。發(fā)現(xiàn)高表達(dá)miRNA-320能顯著促進(jìn)細(xì)胞的凋亡(見圖2)
6.Mcl-l蛋白水平的檢測 使用Invitrogen公司的轉(zhuǎn)染試劑PEI,根據(jù)試劑使用說明書的流程,分別將表達(dá)miRNA-320的質(zhì)粒miRNA-320 (forward)和miRNA-320 (reverse)瞬時轉(zhuǎn)染入QBC939、 RBE、HEK293細(xì)胞中,48小時后收集樣品。變性樣品進(jìn)行SDS-PAGE蛋白電泳,通過電轉(zhuǎn)儀將蛋白轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜(Schleicherand Schcell公司),5%脫脂奶粉封閉lh,TBST洗三次,每次5min ;5% BSA稀釋抗Mcl-l的一抗,孵育2h, TBST洗三次,每次5min ;5 %脫脂奶粉稀釋二抗,孵育lh, TBST洗三次,每次5-10min ;化學(xué)發(fā)光法(ECL)顯影檢測Mcl-l的蛋白水平。發(fā)現(xiàn)高表達(dá)具有生物學(xué)活性的miRNA-320真核表達(dá)質(zhì)粒miRNA-320 (forward)能顯著下調(diào)細(xì)胞中Mcl-l的蛋白水平,而高表達(dá)不具有生物學(xué)活性的miRNA-320真核表達(dá)質(zhì)粒miRNA-320 (reverse)不能下調(diào)細(xì)胞中Mcl-l的蛋白水平,進(jìn)一步證明miRNA-320能夠特異的下調(diào)Mcl-l的蛋白水平(見圖3)。
權(quán)利要求
miRNA-320在制備促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡制劑中的應(yīng)用。
全文摘要
本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)材料技術(shù)領(lǐng)域,是一種小RNA分子miRNA-320在制備促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡制劑中的應(yīng)用。經(jīng)實驗miRNA-320通過作用于靶基因髓細(xì)胞白血病基因-1(Mcl-1),使該基因不能夠表達(dá)相應(yīng)的蛋白,從而抑制癌細(xì)胞的生長,使腫瘤細(xì)胞凋亡。因此可將miRNA-320用于制備促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡的制劑。
文檔編號A61K48/00GK101745120SQ20081020361
公開日2010年6月23日 申請日期2008年11月28日 優(yōu)先權(quán)日2008年11月28日
發(fā)明者李亮, 楊文 , 王紅陽, 胡良, 陳磊 申請人:中國人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué)