本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體涉及野生型IDH2基因作為靶標(biāo)在制備非小細(xì)胞肺癌治療藥物中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
隨著經(jīng)濟(jì)社會的發(fā)展與疾病譜的改變,我國肺癌等腫瘤的發(fā)病率明顯上升。根據(jù)中國腫瘤登記年報(2012),我國全國腫瘤登記地區(qū)惡性腫瘤發(fā)病第一位的是肺癌。其發(fā)病率為53.57/10萬,人口標(biāo)化后為25.34/10萬,五年生存率只有10%-15%。肺癌分為小細(xì)胞肺癌和非小細(xì)胞肺癌。在我國,約80%的肺癌被診斷為非小細(xì)胞肺癌。
異檸檬酸脫氫酶2(isocitrate dehydrogenase 2,IDH2)是細(xì)胞代謝途徑中參與三羧酸循環(huán)的酶,位于染色體15q26.1,亞細(xì)胞定位于線粒體基質(zhì)。其生理功能是正向催化異檸檬酸氧化產(chǎn)生α-酮戊二酸,同時還原NADP+產(chǎn)生NADPH。其逆向反應(yīng)催化α-酮戊二酸產(chǎn)生異檸檬酸,并消耗NADPH產(chǎn)生NADP+。
近來,在WHO二期和三期膠質(zhì)瘤中發(fā)現(xiàn)大于70%的IDH1/2突變,IDH1R132和IDH2R140/172突變位點(diǎn)也在其它腫瘤中被發(fā)現(xiàn),如急性粒細(xì)胞白血病、甲狀腺癌、軟骨肉瘤、肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌、前列腺癌、急性B淋巴細(xì)胞白血病、副神經(jīng)節(jié)瘤、結(jié)直腸癌和黑色素瘤等腫瘤。IDH1/2突變后獲得了新的功能,即催化a-酮戊二酸產(chǎn)生致癌代謝物2羥基戊二酸(2-HG)。IDH1/2突變一方面消耗a-酮戊二酸,另一方面產(chǎn)生2羥基戊二酸,最終抑制以a-酮戊二酸為底物反應(yīng)的一系列脫雙氧酶的活性,從而增強(qiáng)細(xì)胞代謝,抑制細(xì)胞膠原蛋白形成和細(xì)胞分化。目前,突變型IDH2靶向藥物已進(jìn)入I期臨床實(shí)驗(yàn)階段,IDH2口服選擇性抑制劑AG-221在擴(kuò)展I期研究發(fā)現(xiàn),158名晚期血液腫瘤患者中63名病情緩解(40%),76%的患者療效持續(xù)超過6個月,部分患者超過15個月。
野生型IDH2的序列已公開,genebank編號為NG_023302.1。研究表明野生型IDH2也在腫瘤細(xì)胞增殖和死亡中具有重要功能。IDH2基因敲除小鼠體內(nèi)的黑色素瘤細(xì)胞移植瘤形成受到明顯抑制,腫瘤血管生成標(biāo)志物明顯減少。IDH2逆向反應(yīng)可以在低氧條件通過谷氨酰胺代謝經(jīng)過a-酮戊二酸產(chǎn)生檸檬酸,從而促進(jìn)膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖和增加細(xì)胞活力。乳腺癌細(xì)胞Myc基因驅(qū)動逆向IDH1/2反應(yīng)產(chǎn)生2羥基戊二酸,抑制細(xì)胞凋亡。目前野生型和突變型IDH2在肺癌中的研究尚未有文獻(xiàn)報道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的發(fā)明人研究表明IDH2信使RNA在肺癌組織中高表達(dá),提示IDH2可能是肺癌的治療靶標(biāo)。發(fā)明人在非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞H460和A549過表達(dá)及敲減IDH2,使用MTS、細(xì)胞計數(shù)和流式細(xì)胞術(shù)手段檢測IDH2對于非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞生長、增殖和死亡等生物學(xué)行為的影響。進(jìn)一步接種免疫缺陷小鼠,觀察IDH2對裸鼠移植瘤生長的作用。發(fā)現(xiàn)IDH2能夠促進(jìn)肺癌細(xì)胞增殖和肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤生長,抑制細(xì)胞死亡。敲減IDH2可以有效抑制細(xì)胞增殖和肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤生長,增加細(xì)胞死亡。IDH2過表達(dá)降低細(xì)胞內(nèi)α-酮戊二酸(α-KG)含量,采用添加α-酮戊二酸的方式可以抑制非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞的增殖,IDH2過表達(dá)也增加了細(xì)胞內(nèi)的2-羥基戊二酸的含量,可能抑制細(xì)胞死亡。即,本發(fā)明提出野生型IDH2可作為非小細(xì)胞肺癌的潛在治療靶標(biāo)。野生型IDH2基因可作為靶標(biāo)用于制備非小細(xì)胞肺癌治療藥物、用于制備抑制非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖的藥物、用于制備誘導(dǎo)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞死亡的藥物。
IDH2在肺癌組織中表達(dá)上調(diào),野生型IDH2促進(jìn)肺癌細(xì)胞增殖和肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤生長,抑制細(xì)胞死亡。敲減野生型IDH2可以有效抑制細(xì)胞增殖和肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤生長,增加細(xì)胞死亡。IDH2過表達(dá)降低細(xì)胞內(nèi)α-酮戊二酸含量,采用添加α-酮戊二酸的方式可以抑制非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞的增殖,IDH2過表達(dá)也增加了細(xì)胞內(nèi)的2-羥基戊二酸的含量,可能抑制細(xì)胞死亡。本發(fā)明為臨床肺癌的治療提供了靶標(biāo)基因IDH2,為相關(guān)藥物靶點(diǎn)的研究提供了理論依據(jù)。
附圖說明
圖1為實(shí)施例1實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖:圖1顯示了IDH2在肺癌組織與癌旁組織中的信使RNA表達(dá);
圖2、3、4、5為實(shí)施例2實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖:
圖2a顯示了H460及A549細(xì)胞IDH2熱點(diǎn)突變序列測序與NCBI數(shù)據(jù)庫的比對結(jié)果;
圖2b顯示了IDH2過表達(dá)細(xì)胞IDH2蛋白含量的western檢測結(jié)果,圖2c顯示了IDH2敲減細(xì)胞IDH2蛋白含量的western檢測結(jié)果;
圖3a顯示了IDH2過表達(dá)細(xì)胞增殖活性的檢測結(jié)果;圖3b顯示了IDH2敲減細(xì)胞增殖活性的檢測結(jié)果;
圖4a顯示了IDH2過表達(dá)細(xì)胞增殖數(shù)目的檢測結(jié)果;圖4b顯示了IDH2敲減細(xì)胞增殖數(shù)目的檢測結(jié)果;圖4c顯示了IDH2過表達(dá)細(xì)胞α-酮戊二酸含量;圖4d顯示了IDH2敲減細(xì)胞α-酮戊二酸含量;如圖4e顯示了在過表達(dá)IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的細(xì)胞培養(yǎng)過程中添加α-酮戊二酸,抑制了細(xì)胞的增殖;
圖5a顯示了IDH2過表達(dá)細(xì)胞死亡比例的檢測結(jié)果;圖5b顯示了IDH2敲減細(xì)胞死亡比 例的檢測結(jié)果;圖5c顯示了IDH2過表達(dá)的肺癌細(xì)胞的2-HG含量;
圖6為實(shí)施例3實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖:
圖6a顯示了IDH2過表達(dá)后,肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤體積的變化;圖6b顯示了IDH2過表達(dá)后,肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤重量的變化;
圖6c顯示了IDH2敲減后,肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤體積的變化;圖6d顯示了IDH2敲減后,肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤重量的變化。
具體實(shí)施方式
實(shí)施例1.IDH2信使RNA表達(dá)在肺癌組織中增加
目前多個數(shù)據(jù)庫包含大量腫瘤臨床樣本數(shù)據(jù),如美國癌癥“登月計劃”近期已公布1.2萬名癌癥患者的原始數(shù)據(jù),供研究者分析。為分析IDH2在肺癌組織與癌旁組織的表達(dá)差異,申請人調(diào)取臨床樣本數(shù)據(jù)庫中IDH2肺癌組織與癌旁組織的信使RNA表達(dá),進(jìn)行分析統(tǒng)計。
實(shí)驗(yàn)方法:
通過查詢oncomine數(shù)據(jù)庫中IDH2表達(dá)數(shù)據(jù)。采用t-test函數(shù)分析表達(dá)數(shù)據(jù),繪制IDH2表達(dá)差異數(shù)據(jù),并進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
IDH2在數(shù)據(jù)庫多個芯片數(shù)據(jù)中在肺癌組織中相對癌旁組織均高表達(dá),沒有低表達(dá)的樣本。其中樣本數(shù)目最多的實(shí)驗(yàn)組如圖1所示,IDH2在肺癌組織中高表達(dá),且具有統(tǒng)計學(xué)差異(P=2.8E-13)。
實(shí)施例2.IDH2促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖,抑制細(xì)胞死亡。
本部分以非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞H460和A549為母細(xì)胞,以慢病毒導(dǎo)入的方式構(gòu)建了H460和A549過表達(dá)及敲減野生型IDH2的細(xì)胞模型。檢測IDH2過表達(dá)及敲減后非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖和死亡的改變。
1.H460和A549過表達(dá)及敲減野生型IDH2的細(xì)胞模型構(gòu)建
我們首先對H460和A549細(xì)胞的IDH2熱點(diǎn)突變區(qū)域進(jìn)行測序,確認(rèn)細(xì)胞模型中IDH2為野生型。為研究IDH2對細(xì)胞增殖與死亡的作用,采用慢病毒導(dǎo)入的方式構(gòu)建了H460和A549過表達(dá)及敲減野生型IDH2的細(xì)胞模型。
實(shí)驗(yàn)方法:
H460和A549細(xì)胞細(xì)胞經(jīng)過RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄制備cDNA后,PCR擴(kuò)增IDH2熱點(diǎn)區(qū)域序列,送華大基因進(jìn)行測序,最后與NCBI數(shù)據(jù)庫中野生型IDH2序列進(jìn)行比對。
過表達(dá)、敲減細(xì)胞的母細(xì)胞復(fù)蘇,培養(yǎng)后,將待感染的細(xì)胞接種于培養(yǎng)皿后,待細(xì)胞生長至80%-90%的融合度時棄培基。慢病毒溶液按1:3與新鮮培養(yǎng)基混合后加入培養(yǎng)皿中,同時加入終濃度為1ug/ml的polybrene促進(jìn)病毒感染。24小時后消化細(xì)胞,加入終濃度為1ug/ml的puromycine篩選細(xì)胞,設(shè)置對照組。約72小時后,對照組細(xì)胞大量死亡,實(shí)驗(yàn)組中殘留的細(xì)胞為病毒感染成功的細(xì)胞。通過Western檢測IDH2蛋白表達(dá)確定細(xì)胞模型是否構(gòu)建成功。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:如圖2a所示,H460與A549細(xì)胞中IDH2熱點(diǎn)突變序列與數(shù)據(jù)庫中野生型序列462個堿基100%相同,證明H460與A549細(xì)胞IDH2為野生型。如圖2b所示,過表達(dá)野生型IDH2細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2相對其對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV,IDH2的蛋白含量增加。如圖2c所示,IDH2野生型敲減細(xì)胞H460-sh1、H460-sh2和A549-sh1、A549-sh2相對其對照細(xì)胞H460-shcon和A549-shcon,IDH2的蛋白含量降低。證明IDH2過表達(dá)及敲減細(xì)胞構(gòu)建成功。
2.IDH2促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖活性
MTS是四唑鹽(MTT)比色試驗(yàn)改良方法,是常用于檢測細(xì)胞增殖活性的方法?;罴?xì)胞線粒體中的琥珀酸脫氫酶能使外源性的MTS還原為可溶性的藍(lán)紫色甲臢結(jié)晶物-Formazan,而無活性的細(xì)胞無此功能,用酶標(biāo)儀測定其在490nm波長的吸收值,可間接反映細(xì)胞增殖活性,該方法已廣泛應(yīng)用于大規(guī)模的抗腫瘤藥物篩選。
實(shí)驗(yàn)方法:
使用已構(gòu)建的肺癌細(xì)胞模型,收集對數(shù)期細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞懸液濃度,每孔加入100μl細(xì)胞懸液(設(shè)置3個以上的復(fù)孔),使待測細(xì)胞調(diào)密度1000-10000孔,置于5%CO2,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)72小時,各樣品孔加MTS溶液20μl,生化培養(yǎng)箱內(nèi)孵育1.5小時。在酶標(biāo)儀490nm波長處測定各孔的吸光值并繪制生長關(guān)系曲線。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
如圖3a所示,過表達(dá)IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2增殖活性相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV增加。如圖3b所示,敲減IDH2的肺癌細(xì)胞H460-sh1、H460-sh2和A549-sh1、A549-sh2相對其對照細(xì)胞H460-shcon和A549-shcon增殖活性降低。
3.IDH2增加非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖數(shù)目
細(xì)胞損傷或死亡時,臺盼藍(lán)可穿透變性的細(xì)胞膜,與解體的DNA結(jié)合,使其著色。而活細(xì)胞能阻止染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。故可以鑒別死細(xì)胞與活細(xì)胞。嚴(yán)格來說,臺盼藍(lán)染色檢測的是細(xì)胞膜的完整性,通常認(rèn)為細(xì)胞膜喪失完整性,即可認(rèn)為細(xì)胞已經(jīng)死亡。
IDH2突變蛋白降低細(xì)胞內(nèi)α-酮戊二酸的含量,為確定野生型IDH2消耗α-酮戊二酸, 從而促進(jìn)細(xì)胞存活與增殖。我們采用biovision公司的α-酮戊二酸含量檢測試劑盒(K677-100),對野生型IDH2過表達(dá)及敲減細(xì)胞內(nèi)α-酮戊二酸含量進(jìn)行檢測。并采用外源添加可以進(jìn)入細(xì)胞利用的α-酮戊二酸類似物辛基化α-酮戊二酸,驗(yàn)證α-酮戊二酸對細(xì)胞增殖的作用。
實(shí)驗(yàn)方法:
用Hanks液配制0.1%臺盼藍(lán)溶液;用0.5%胰蛋白酶和0.2%EDTA 1:1混合液來消化培養(yǎng)的貼壁細(xì)胞;再加入適量細(xì)胞培養(yǎng)基液終止消化,Hanks液漂洗3次后制成細(xì)胞懸液;將待染色細(xì)胞稀釋至所需濃度(方法及濃度范圍與細(xì)胞計數(shù)相同);每0.1ml細(xì)胞懸液約加新鮮配制的染液一小滴,室溫下染3—5min;染色過的細(xì)胞材料,取一滴細(xì)胞懸液置血球計數(shù)板,加蓋玻片后放高倍鏡下觀察并計數(shù);死亡的細(xì)胞著淺藍(lán)色并膨大,無光澤?;罴?xì)胞不著色并保持正常形態(tài),有光澤。
構(gòu)建的野生型IDH2過表達(dá)及敲減H460和A549模型細(xì)胞接種于6孔板,12小時后添加1mM辛基化α-酮戊二酸(cayman),使用血球計數(shù)板不同時間點(diǎn)檢測細(xì)胞數(shù)目變化,并進(jìn)行統(tǒng)計分析。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
如圖4a所示,過表達(dá)野生型IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的細(xì)胞數(shù)目相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV增加。如圖4b所示,敲減IDH2的肺癌細(xì)胞H460-sh1、H460-sh2和A549-sh1、A549-sh2相對其對照細(xì)胞H460-shcon和A549-shcon細(xì)胞數(shù)目降低。
如圖4c所示,過表達(dá)IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的細(xì)胞內(nèi)α-酮戊二酸含量相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV增加,如圖4d所示,敲減IDH2的肺癌細(xì)胞H460-sh1、H460-sh2和A549-sh1、A549-sh2相對其對照細(xì)胞H460-shcon和A549-shcon細(xì)胞內(nèi)α-酮戊二酸含量降低。
如圖4e所示,在過表達(dá)IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的細(xì)胞培養(yǎng)過程中添加α-酮戊二酸,抑制了細(xì)胞的增殖。
4.野生型IDH2抑制非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞死亡
碘化丙啶(Propidium Iodide,PI)是一種核酸染料,它不能透過完整的細(xì)胞膜,但凋亡中晚期的細(xì)胞和死細(xì)胞由于細(xì)胞膜通透性的增加,PI能夠透過細(xì)胞膜而使細(xì)胞核染紅。可以通過流式細(xì)胞術(shù)檢測PI陽性細(xì)胞的比例確定細(xì)胞的死亡比例。
2-羥基戊二酸是突變型IDH2的產(chǎn)物,在乳腺癌中IDH2逆向反應(yīng)可以產(chǎn)生2-HG并抑制細(xì)胞凋亡。我們對野生型IDH2過表達(dá)H460和A549模型細(xì)胞中2-HG含量進(jìn)行了檢測。
實(shí)驗(yàn)方法:
用不含EDTA的胰酶消化收集后,于室溫2000rpm離心5~10分鐘,收集細(xì)胞;用預(yù)冷1×PBS(4℃)重懸細(xì)胞一次,2000rpm離心5~10分鐘,洗滌細(xì)胞;加入300μL的1×Binding Buffer懸浮細(xì)胞;上機(jī)前5分鐘再加入5μL的PI染色進(jìn)行流式檢測。
2-HG含量檢測使用biovision公司的試劑盒(K213-100)進(jìn)行檢測,操作按照說明書步驟進(jìn)行。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
如圖5a所示,過表達(dá)IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的死亡細(xì)胞比例相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV降低。如圖5b所示,敲減IDH2的肺癌細(xì)胞H460-sh1、H460-sh2和A549-sh1、A549-sh2相對其對照細(xì)胞H460-shcon和A549-shcon死亡細(xì)胞比例增加。
如圖5c所示,過表達(dá)IDH2的肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的2-HG含量相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV增加。
實(shí)施例3.野生型IDH2促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞裸鼠移植瘤的生長
動物實(shí)驗(yàn),由于其更能模擬人類的生理和病理?xiàng)l件,動物實(shí)驗(yàn)獲得的結(jié)果,又稱臨床前證據(jù)。裸鼠移植瘤模型是腫瘤研究最常用的動物模型。
實(shí)驗(yàn)方法:
4周齡免疫缺陷小鼠Bclb購自中南大學(xué)動物學(xué)部,經(jīng)本室飼養(yǎng)一周后,過表達(dá)實(shí)驗(yàn)每只裸鼠注射2x106個細(xì)胞,敲減細(xì)胞成瘤每只注射1x106個細(xì)胞。所有實(shí)驗(yàn)裸鼠均在接種后第四天開始測量裸鼠體重及瘤體體積,每2-3天測量一次,對應(yīng)分組檢測到三次差異后處死小鼠,剝離瘤體,并稱量瘤體重量。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
1.野生型IDH2過表達(dá)增加非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞移植瘤體體積和重量
如圖6a所示,IDH2過表達(dá)肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的裸鼠移植瘤體積相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV增加。
如圖6b所示,IDH2過表達(dá)肺癌細(xì)胞H460-IDH2和A549-IDH2的裸鼠移植瘤重量相對對照細(xì)胞H460-EV和A549-EV增加。
2.野生型IDH2敲減降低非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞移植瘤體積和重量
如圖6c所示,敲減IDH2的肺癌細(xì)胞H460-shIDH2相對其對照細(xì)胞H460-shcon體積減少。
如圖6d所示,敲減IDH2的肺癌細(xì)胞H460-shIDH2相對對照細(xì)胞H460-shcon重量降低。