本發(fā)明屬于生物醫(yī)藥領(lǐng)域,具體地說,本發(fā)明涉及與甲狀腺結(jié)節(jié)相關(guān)的基因體細(xì)胞特異性突變位點(diǎn)及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
:甲狀腺結(jié)節(jié)是臨床最常見的一種甲狀腺疾病,觸診可以的發(fā)現(xiàn)的甲狀腺結(jié)節(jié)的患病率在美國成年人群中約為4-7%。而應(yīng)用敏感的甲狀腺b檢查,在65歲以上人群中,甲狀腺結(jié)節(jié)的患病率高達(dá)50%以上。我國2010年由中華醫(yī)學(xué)會內(nèi)分泌協(xié)會滕衛(wèi)平教授牽頭進(jìn)行的全國十城市15,181居民的甲狀腺疾病流行病學(xué)調(diào)查的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),我國人群中甲狀腺結(jié)節(jié)的患病率高達(dá)18.6%,因此推測我們國家的甲狀腺結(jié)節(jié)的患者高達(dá)2億人。大多數(shù)甲狀腺結(jié)節(jié)是良性的,可以采取保守治療,但有5-10%的甲狀腺結(jié)節(jié)是惡性的,需要早期手術(shù)治療,才能獲得良好的預(yù)后。因此,一個(gè)甲狀腺??频尼t(yī)生,面對的巨大挑戰(zhàn)就是如何鑒別病人的甲狀腺結(jié)節(jié)的良性和惡性,只有這樣,才能使病人獲得及時(shí)合理的治療。如果大量的不需要手術(shù)的甲狀腺良性結(jié)節(jié),不適當(dāng)?shù)亟o予手術(shù)治療,這樣大的人群患病率,將會產(chǎn)生巨大的醫(yī)保負(fù)擔(dān);反之,如果不能從大量的良性結(jié)節(jié)中識別鑒定真正的惡性腫瘤,將延緩對這些病人的治療,危及患者的生命健康。目前臨床上常用的甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別的手段主要有甲狀腺b超、核素掃描及甲狀腺結(jié)節(jié)細(xì)針穿刺病理活檢(fine-needleaspirationbiopsy,fnab)。其中,甲狀腺細(xì)針穿刺細(xì)胞學(xué)活檢是目前甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的金標(biāo)準(zhǔn)。根據(jù)美國國家癌癥研究所2008年的甲狀腺細(xì)針穿刺病理學(xué)的專題會議的指南,目前將甲狀腺結(jié)節(jié)穿刺細(xì)胞學(xué)診斷分成以下幾類:1.因穿刺甲狀腺細(xì)胞數(shù)量不足,無法診斷;2.良性結(jié)節(jié);3.病理細(xì)胞學(xué)無法確診的結(jié)節(jié);4.惡性甲狀腺結(jié)節(jié)四類。近年來,隨著b超引導(dǎo)下進(jìn)行細(xì)針穿刺的廣泛應(yīng)用,那種因穿刺獲得的細(xì)胞數(shù)量不足,無法診斷的病人的比例明顯減少,從以前的高達(dá)15%,降到目前的7%以下。在細(xì)針穿刺獲得足夠的甲狀腺濾泡細(xì)胞后,大多數(shù)的甲狀腺結(jié)節(jié)的良惡性均能通過細(xì)胞病理學(xué)的診斷方法獲得正確的診斷。但即使目前國際上最好的甲狀腺細(xì)胞病理診斷的實(shí)驗(yàn)室,也有20-40%穿刺成功的甲狀腺結(jié)節(jié)不能確定其良惡性,即病理學(xué)無法確診的結(jié)節(jié)。因此,在病人進(jìn)行甲狀腺穿刺病理活檢時(shí),因穿刺失敗和病理不能判斷良惡性從而無法給患者進(jìn)行正確診斷的比例高達(dá)30-50%,受各中心的甲狀腺病理診斷醫(yī)師和穿刺醫(yī)師的技術(shù)水平影響較大。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的在于提供一種甲狀腺癌發(fā)病的致病基因突變位點(diǎn)及其應(yīng)用。本發(fā)明的第一方面,提供了選自下組(i)中的一個(gè)或多個(gè)基因突變位點(diǎn)和/或其檢測試劑的用途,用于制備試劑或試劑盒,所述試劑或試劑盒用于鑒別甲狀腺結(jié)節(jié)的良惡性,所述組(i)包括以下基因突變位點(diǎn):gnas基因:nm_001077490:exon1:c.t1019c;nras基因:nm_002524:exon3:c.t284c;tshr基因:nm_000369:exon10:c.a2098g。在另一優(yōu)選例中,所述組(i)還包括以下基因突變位點(diǎn):chek2基因:nm_145862:exon11:c.a1250g。在另一優(yōu)選例中,所述組(i)還包括以下基因突變位點(diǎn):pik3ca基因:nm_006218:exon12:c.1818位缺失c。在另一優(yōu)選例中,所述組(i)還包括以下基因突變位點(diǎn):gnas基因:nm_016592:exon1:c.c205a、nm_016592:exon1:c.c216t。在另一優(yōu)選例中,所述組(i)還包括以下基因突變位點(diǎn):tshr基因:nm_000369:exon10:c.a2252g。在另一優(yōu)選例中,所述組(i)還包括以下基因突變位點(diǎn):braf基因:nm_004333:exon15:c.t1799a。在另一優(yōu)選例中,被檢測對象包括:人或非人哺乳動物(如家畜、家禽、實(shí)驗(yàn)動物等)。在另一優(yōu)選例中,所述的試劑包括引物、探針、芯片、或抗體。在另一優(yōu)選例中,所述的試劑盒含有一種或多種選自下組的試劑:(a)用于基因檢測的特異性引物;(b)用于基因檢測的特異性探針;(c)用于基因檢測的芯片;(d)用于檢測突變的基因所對應(yīng)的氨基酸突變的特異性抗體。在另一優(yōu)選例中,所述試劑或試劑盒用于實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測。在另一優(yōu)選例中,所述實(shí)時(shí)熒光定量pcr中,退火溫度為60-67℃之間,pcr擴(kuò)增產(chǎn)物長度為80-300bp。在另一優(yōu)選例中,所述實(shí)時(shí)熒光定量pcr中,熒光探針退火溫度為60-70℃之間。在另一優(yōu)選例中,所述探針的雙末端進(jìn)行化學(xué)基團(tuán)的修飾,5'端修飾有熒光激發(fā)基團(tuán),3端修飾有熒光淬滅基團(tuán)。在另一優(yōu)選例中,所述檢測為輔助性檢測。本發(fā)明的第二方面,提供了一種試劑盒,所述試劑盒包括選自下組的一個(gè)或多個(gè)基因突變位點(diǎn)的檢測試劑:gnas基因:nm_001077490:exon1:c.t1019c;nras基因:nm_002524:exon3:c.t284c;tshr基因:nm_000369:exon10:c.a2098g。在另一優(yōu)選例中,所述試劑盒還包括以下基因突變位點(diǎn)的檢測試劑:chek2基因:nm_145862:exon11:c.a1250g。在另一優(yōu)選例中,所述試劑盒還包括以下基因突變位點(diǎn)的檢測試劑:pik3ca基因:nm_006218:exon12:c.1818位缺失c。在另一優(yōu)選例中,所述試劑盒還包括選自下組的一個(gè)或多個(gè)基因突變位點(diǎn)的檢測試劑:gnas基因:nm_016592:exon1:c.c205a、nm_016592:exon1:c.c216t。在另一優(yōu)選例中,所述試劑盒還包括以下基因突變位點(diǎn)的檢測試劑:tshr基因:nm_000369:exon10:c.a2252g。在另一優(yōu)選例中,所述試劑盒還包括選自下組的一個(gè)或多個(gè)基因突變位點(diǎn)的檢測試劑:braf基因:nm_004333:exon15:c.t1799a、nm_004333:exon11:c.g1338a、nm_004333:exon15:c.a1801g;chek2基因:nm_145862:exon10:c.c1024t;nras基因:nm_002524:exon3:c.c181a、nm_002524:exon3:c.a182g;akt1基因:nm_001014431:exon3:c.g49a;ppm1d基因:nm_003620:exon1:c.c262t;pten基因:nm_000314:exon5:c.c328t;ret基因:nm_020630:exon11:c.t1888c、nm_020630:exon16:c.t2753c;tp53基因:nm_001126115:exon3:c.c265t、nm_000546:exon8:c.g814t。在另一優(yōu)選例中,所述試劑盒還包括選自下組的一個(gè)或多個(gè)融合基因的檢測試劑:etv6-ntrk3融合基因:etv6{enst00000396373}:r.1_737_ntrk3{enst00000394480}:r.1719_19984;ncoa4-ret融合基因:ncoa4{enst00000452682}:r.1_1014_ret{enst00000355710}:r.2369_5659;ccdc6-ret融合基因:ccdc6{enst00000263102}:r.1_535_ret{enst00000355710}:r.2369_5659。在另一優(yōu)選例中,所述的檢測試劑為:(a)用于基因檢測的特異性引物;(b)用于基因檢測的特異性探針;(c)用于基因檢測的芯片;(d)用于檢測突變的基因所對應(yīng)的氨基酸突變的特異性抗體。本發(fā)明的第三方面,提供了一種體外檢測樣品是否存在基因突變的方法,包括步驟:(a)用特異性引物擴(kuò)增樣品的多核苷酸,得到擴(kuò)增產(chǎn)物;和(b)檢測擴(kuò)增產(chǎn)物中是否存在以下一個(gè)或多個(gè)基因突變:gnas基因:nm_001077490:exon1:c.t1019c、nm_016592:exon1:c.c205a、nm_016592:exon1:c.c216t;nras基因:nm_002524:exon3:c.t284c;tshr基因:nm_000369:exon10:c.a2098g、nm_000369:exon10:c.a2252g。在另一優(yōu)選例中,所述檢測為非診斷性的。在另一優(yōu)選例中,所述步驟(b)中還包括檢測擴(kuò)增產(chǎn)物中是否存在以下基因突變:chek2基因:nm_145862:exon11:c.a1250g。在另一優(yōu)選例中,所述步驟(b)中還包括檢測擴(kuò)增產(chǎn)物中是否存在以下基因突變:pik3ca基因:nm_006218:exon12:c.1818位缺失c。如果具有一個(gè)或多個(gè)基因位點(diǎn),則說明該甲狀腺結(jié)節(jié)為惡性。在另一優(yōu)選例中,所述樣本來自于人。本發(fā)明的第五方面,提供了一種分離的基因多核苷酸序列,所述的多核苷酸序列為衍生自選自下組的基因的片段:nras基因、gnas基因、pik3ca基因、chek2基因、和tshr基因,且所述的核苷酸序列分別具有選自下組的基因突變位點(diǎn):nras基因:nm_002524:exon3:c.t284c;gnas基因:nm_001077490:exon1:c.t1019c、nm_016592:exon1:c.c205a、nm_016592:exon1:c.c216t;pik3ca基因:nm_006218:exon12:c.1818位缺失c;chek2基因:nm_145862:exon11:c.a1250g;tshr基因:nm_000369:exon10:c.a2098g、nm_000369:exon10:c.a2252g。在另一優(yōu)選例中,所述多核苷酸序列長度為30-1000bp;優(yōu)選為50-500bp。本發(fā)明還提供了多核苷酸序列的用途,所述的序列可用作陽性對照(標(biāo)準(zhǔn)品)。本發(fā)明的第六方面,提供了選自下組的一個(gè)或多個(gè)或全部基因和/或其檢測試劑的用途,用于制備試劑或試劑盒,所述試劑或試劑盒用于鑒別甲狀腺結(jié)節(jié)的良惡性:akt1基因、braf基因、chek2基因、gnas基因、nras基因、pik3ca基因、ppm1d基因、pten基因、ret基因、tp53基因、tshr基因、etv6-ntrk3融合基因、ncoa4-ret融合基因、和ccdc6-ret融合基因。應(yīng)理解,在本發(fā)明范圍內(nèi)中,本發(fā)明的上述各技術(shù)特征和在下文(如實(shí)施例)中具體描述的各技術(shù)特征之間都可以互相組合,從而構(gòu)成新的或優(yōu)選的技術(shù)方案。限于篇幅,在此不再一一累述。具體實(shí)施方式本發(fā)明人通過廣泛而深入的研究,意外地獲得一組與甲狀腺癌致病基因的突變位點(diǎn),實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本發(fā)明提供的基因突變位點(diǎn)能夠作為鑒別甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的標(biāo)志物。在描述本發(fā)明之前,應(yīng)當(dāng)理解本發(fā)明不限于所述的具體方法和實(shí)驗(yàn)條件,因?yàn)檫@類方法和條件可以變動。還應(yīng)當(dāng)理解本文所用的術(shù)語其目的僅在于描述具體實(shí)施方案,并且不意圖是限制性的,本發(fā)明的范圍將僅由所附的權(quán)利要求書限制。雖然在本發(fā)明的實(shí)施或測試中可以使用與本發(fā)明中所述相似或等價(jià)的任何方法和材料,本文在此處例舉優(yōu)選的方法和材料。在本領(lǐng)域中,如何在術(shù)前對這些甲狀腺結(jié)節(jié)進(jìn)行正確的診斷,從而給病人一個(gè)合理及時(shí)的治療,一直是甲狀腺研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)展,分子診斷在甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的鑒別診斷中,逐漸受到人們的關(guān)注。結(jié)節(jié)良惡性分子鑒別診斷的理論基礎(chǔ)是基于有些甲狀腺癌的致病基因,只在癌癥病人的癌組織中發(fā)生特異性的體細(xì)胞突變或融合基因的出現(xiàn),這種突變或新融合基因在患者的正常細(xì)胞及非甲狀腺癌患者的甲狀腺組織中是不存在的。因此,這些分子標(biāo)志,在甲狀腺癌的良惡性鑒別鑒別診斷中,具有非常特異的。如人們發(fā)現(xiàn)在帶有braf基因上第600位氨基酸的val600glu突變的甲狀腺結(jié)節(jié)100%的病人是惡性結(jié)節(jié)。雖然這些基因突變在甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷中有非常好的特異性,但每一致病基因在甲狀腺癌病人中的突變頻率是不高的,因此,單靠這樣對單個(gè)基因的分子突變進(jìn)行檢測,陽性病人有重要的診斷意義,但陰性病人會漏診許多真正的甲狀腺癌患者,耽誤病人的治療。因此要解決甲狀腺癌分子診斷這一困境,需要對導(dǎo)致甲狀腺癌的多個(gè)基因同時(shí)進(jìn)行突變檢測,才能夠提高甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的特異性,降低假陰性率。但是,要想在甲狀腺結(jié)節(jié)樣本中,同時(shí)進(jìn)行多個(gè)甲狀腺癌特異性致病基因的體細(xì)胞突變和新的融合基因的檢測,需要突破以下幾個(gè)方面的科學(xué)和技術(shù)難點(diǎn),才能達(dá)到臨床應(yīng)用的目的:第一:雖然文獻(xiàn)報(bào)道大量的甲狀腺癌的致病基因突變,但在這些報(bào)道的突變基因中,哪些是真正的致病基因,哪些不是甲狀腺癌的致病,這些問題是不清楚的。其次,在目前報(bào)道的甲狀腺癌致病基因中,哪些基因的組合在甲狀腺結(jié)節(jié)鑒別診斷中陽性率高,而陰性漏診的可能性小,是目前不知道。找到這樣的一群甲狀腺癌致病基因的組合,將在甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別中非常重要的。第二:由于甲狀腺癌的致病基因的變異(突變和融合基因)均是在甲狀腺癌細(xì)胞內(nèi)的體細(xì)胞突變,因此必須通過細(xì)針穿刺獲取甲狀腺結(jié)節(jié)細(xì)胞才能進(jìn)行診斷,而細(xì)針穿刺的細(xì)胞數(shù)量很少(一般細(xì)胞數(shù)在10-200個(gè)),要想在如此少的細(xì)胞中,進(jìn)行大量基因突變和融合基因的檢測,用傳統(tǒng)的一代測序是不可能的。須采用的新的檢測技術(shù)才能,完成組合型標(biāo)志的分子診斷方法的建立。第三:由于甲狀腺癌中基因變異主要包括兩大類,一類是基因體細(xì)胞突變;另一類是腫瘤細(xì)胞中出現(xiàn)新的融合基因。傳統(tǒng)的檢測這兩類變異方法,分別依賴樣本的dna和mrna。需要采集兩次最夠量的甲狀腺結(jié)節(jié)組織。這在臨床常規(guī)診斷中執(zhí)行困難,因此,如何能利用同一次少量的活檢樣本,進(jìn)行大量這些基因變異的檢測,是組合型分子標(biāo)志走向?qū)嶋H應(yīng)用的瓶頸。因此,本發(fā)明主要是針對上述3個(gè)甲狀腺結(jié)節(jié)分子診斷的瓶頸來進(jìn)行的,主要具有以下的獨(dú)創(chuàng)性:首先,選擇目前發(fā)現(xiàn)的19個(gè)甲狀腺乳頭狀癌的致病基因、8個(gè)不同的融合基因,以及未分化癌和差分化癌中常見tp53、ctnnb1基因和甲狀腺髓樣癌中的ret基因,作為分子標(biāo)志,通過對這些變異區(qū)段的cdna的靶向擴(kuò)增,結(jié)合二代測序技術(shù),在甲狀腺癌和甲狀腺瘤或正常甲狀腺組織中,進(jìn)行基因突變和融合基因檢測,發(fā)現(xiàn)這一群組合型分子標(biāo)志,在中國甲狀腺癌人群中總的陽性率高達(dá)81%,是一群具有很好診斷價(jià)值的分子標(biāo)志物。其中最常見突變的11個(gè)核心基因和8個(gè)不同的融合基因的組合,可以使診斷的陽性率高達(dá)93%以上。其次,基于fludigam公司的靶基因多重pcr擴(kuò)增芯片技術(shù),開發(fā)了一套特異性的組合的多重靶基因擴(kuò)增的技術(shù),解決了在微量樣本中,同時(shí)進(jìn)行多個(gè)基因的靶向擴(kuò)增的方法;同時(shí)對多重pcr引物,通過二代測序技術(shù),從而明確每一個(gè)樣本中,每一個(gè)基因特定基因的突變或新的融合基因是否存在。解決在微量樣本中,同時(shí)對多個(gè)基因變異的檢測的技術(shù)瓶頸。另外,本發(fā)明選擇mrna作為進(jìn)行靶基因擴(kuò)增的對象進(jìn)行組合型分子標(biāo)志的基因變異檢測的樣本,實(shí)現(xiàn)了在同一個(gè)樣本即對基因突變進(jìn)行檢測,又對融合基因進(jìn)行檢測的目的,是該發(fā)明在臨床應(yīng)用成為可能。同時(shí),以mrna為模板進(jìn)行基因變異的檢測,有可以評價(jià)穿刺樣本的質(zhì)量,對診斷的可靠性進(jìn)行客觀的評價(jià)??梢詰?yīng)用多種分子標(biāo)志物的組合對甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性進(jìn)行鑒別,如應(yīng)用brafv600e,ras和ret/ptc1,ret/ptc3,以及pax8/ppar融合基因等作為分子標(biāo)志,可以明顯增加甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的能力。這種組合性分子標(biāo)志用于甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的敏感性可以達(dá)到62%,特異性可以達(dá)到99.7%;如與病理細(xì)胞學(xué)診斷聯(lián)合應(yīng)用,可以使甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別的敏感性,從單用病理細(xì)胞學(xué)診斷的44%提高到80%。而造成這種分子標(biāo)志物診斷敏感性不高的主要原因,是目前還沒有發(fā)現(xiàn)所有的甲狀腺的致病基因,上述常見甲狀腺癌的致病基因,在甲狀腺癌患者中,不同基因間互相排斥的突變頻率大多在70%左右,因此,用目前常見的致病基因的熱點(diǎn)位點(diǎn)的組合,作為分子標(biāo)志,進(jìn)行甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的鑒別診斷具有較大的局限性。要想提高分子標(biāo)志物診斷的敏感性,首先要找到甲狀腺癌致病的基因或分子標(biāo)志。按照2008年美國癌癥研究所甲狀腺細(xì)胞學(xué)診斷標(biāo)準(zhǔn),目前將甲狀腺癌分為乳頭狀癌(目前將濾泡狀癌分在這類病理類型中,歸為變異性乳頭狀癌的一種)、差分化癌、未分化癌和甲狀腺髓樣癌四種,其中最常見的是甲狀腺乳頭狀細(xì)胞癌,約占所有甲狀腺癌的95%以上。不同的甲狀腺癌中,致病的基因可能不同,且同一個(gè)致病基因在不同類型的甲狀腺癌中的突變頻率也不同。如甲狀腺乳頭狀癌中常見的突變基因是braf基因,而差分化和未分化癌中,tp53基因是高頻的突變基因,在未分化癌中50%以上的病人攜帶tp53基因突變,但在甲狀腺乳頭狀癌中,很少發(fā)現(xiàn)有p53基因的突變。而甲狀腺髓樣癌患者中ret基因的突變是非常常見的,如在家族性髓樣癌中,該基因的突變率高達(dá)95%,在散發(fā)性甲狀腺髓樣癌中,ret基因的突變率也有40-50%。2014年發(fā)表在cell上的一篇大樣本甲狀腺乳頭狀癌的全基因組外顯子測序的研究,為應(yīng)用組合性分子標(biāo)志進(jìn)行甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的鑒別診斷提供了令人興奮的前景。他們通過對496例甲狀腺乳頭狀癌的全基因組外顯子測序,發(fā)現(xiàn)5個(gè)甲狀腺癌的致病基因,其中包括3個(gè)可能新的甲狀腺癌致病基因;并發(fā)現(xiàn)了8個(gè)基因與其它不同基因形成的各種類型的融合基因變異。在這些甲狀腺癌中,至少帶有這5個(gè)致病基因中一個(gè)以上基因突變的樣本占73.6%,發(fā)現(xiàn)帶有致病基因突變或融合基因變異中一個(gè)以上變異的樣本占89.8%。還有10%左右的甲狀腺癌中,既沒有這5個(gè)致病基因的點(diǎn)突變,也沒有發(fā)現(xiàn)的融合基因變異。他們隨后通過snp芯片等技術(shù),對這些腫瘤樣本中染色體的擴(kuò)增缺失變異進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)染色體區(qū)段的大片段擴(kuò)增和缺失(arm-level的染色體變異)在甲狀腺癌樣本中非常常見,其中22q的染色體缺失約在14.4%甲狀腺癌病人發(fā)生,而1q染色體的大片段擴(kuò)增占14.8%。如果將這些染色體arm-level水平的擴(kuò)增和缺失變異,作為分子標(biāo)志,將使帶有致病基因突變、融合基因變異或arm-level的染色體擴(kuò)增缺失三類變異中至少一種變異的病人增加到96.6%。這表明,如果我們能夠用這三類不同的變異,對甲狀腺結(jié)節(jié)進(jìn)行分子診斷的話,將可能是診斷的敏感性達(dá)到95%以上,這將是目前甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的所有手段中最可靠的診斷方法。新的分子生物學(xué)技術(shù)靶基因的多重pcr擴(kuò)增結(jié)合二代測序的出現(xiàn),使得利用甲狀腺穿刺細(xì)胞中提取的少量rna為模板,同時(shí)檢測多種基因變異成為可能,從而使組合性分子標(biāo)志的檢測變得簡單、容易操作,同時(shí)又不至于漏檢可能存在的基因突變。fluidigm公司的靶向擴(kuò)增芯片可對多種突變基因靶向擴(kuò)增并進(jìn)行二代測序建庫,一塊芯片可同時(shí)對48個(gè)樣本的450到1500對引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,滿足甲狀腺癌這些分子標(biāo)志診斷的需求。因此,本發(fā)明采用fluidigm公司的靶基因多重pcr擴(kuò)增芯片技術(shù),選擇目前發(fā)現(xiàn)19個(gè)甲狀腺乳頭狀癌的致病基因、8個(gè)不同的融合基因,以及未分化癌和差分化癌中常見tp53、ctnnb1基因和甲狀腺髓樣癌中的ret基因,作為分子標(biāo)志,通過對這些變異區(qū)段的cdna的靶向擴(kuò)增,結(jié)合二代測序技術(shù),識別甲狀腺結(jié)節(jié)中是否存在這些分子標(biāo)志的變異,從而進(jìn)行甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的鑒別診斷。最終發(fā)現(xiàn)了一批新的惡性甲狀腺結(jié)節(jié)相關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn),具體信息如表1所示。表1基因名稱突變位點(diǎn)brafnm_004333:exon15:c.t1799achek2nm_145862:exon11:c.a1250g:p.n417sgnasnm_001077490:exon1:c.t1019c:p.l340pgnasnm_016592:exon1:c.c205a:p.h69ngnasnm_016592:exon1:c.c216t:p.g72gnrasnm_002524:exon3:c.t284c:p.l95ppik3canm_006218:exon12:c.1818delc:p.y606fstshrnm_000369:exon10:c.a2098g:p.k700etshrnm_000369:exon10:c.a2252g:p.k751r表1中基因序列編號參照grch37/hg19版本。braf基因braf基因編碼的蛋白屬于絲氨酸/蘇氨酸激酶raf家族。在mapk/erks通路中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,參與細(xì)胞分裂、分化及分泌等。braf基因突變被認(rèn)為與多種癌癥的發(fā)生有關(guān),包括非霍奇金淋巴瘤、結(jié)直腸癌、惡性黑色素瘤、甲狀腺癌及非小細(xì)胞肺癌。另外,研究表明braf基因突變與心臉皮膚綜合征有關(guān)。第1799位發(fā)生突變的braf基因(nm_004333)的序列片段如下:cctcacagtaaaaataggtgattttggtctagctacag[t/a]gaaatctcgatggagtgggtcccatcagtttgaacagttgt(seqidno.1)在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選地實(shí)施方式中用于檢測braf基因1799位突變位點(diǎn)的引物對如下:braf-e15-fggagccttgtatatagacggseqidno.2braf-e15-rtgtatgttctaacaggcaccseqidno.3nras基因nras基因?yàn)橹掳┗?,其編碼的膜蛋白可穿梭于高爾基體與細(xì)胞膜之間。nras蛋白具有內(nèi)在的gtp酶活性,可分別被鳥嘌呤核苷酸交換因子激活及被gtp酶活化蛋白所抑制。位于nras上的點(diǎn)突變被認(rèn)為與體細(xì)胞直腸癌、濾泡型甲狀腺癌、自身免疫性淋巴增生綜合征、noonan綜合征以及白血病的發(fā)生有關(guān).第284位發(fā)生突變的nras基因(nm_002524)的序列片段如下:atagcaagtcatttgcggatattaacctc[t/c]acagggagcagattaagcgagtaaaagact(seqidno.4)在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選地實(shí)施方式中用于檢測nras基因284位突變位點(diǎn)的引物對如下:nras-e3-fcaagaaaccatatgctcaccseqidno.5nras-e3-rttggattgtgtccgttgagcseqidno.6gnas基因gnas是一個(gè)蛋白編碼基因,相關(guān)的信號通路為g蛋白偶聯(lián)受體(gpcr)信號通路及多肽配體結(jié)合受體信號通路,參與腺苷酸環(huán)化酶的激活及多種細(xì)胞反應(yīng)。該基因有多種轉(zhuǎn)錄版本。gnas基因突變與假性甲狀旁腺功能減退癥、遺傳性骨營養(yǎng)不良癥、mccune-albright綜合征、進(jìn)展性骨發(fā)育異常、多骨性纖維性結(jié)構(gòu)不良以及一些垂體腫瘤相關(guān)。第1019位發(fā)生突變的gnas基因(nm_001077490)的序列如下:gcccaacagcgccggagcttccttaacgcccac[c/a]accgctccggcgcccaggtattccctgagtcccccg(seqidno.7)在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選地實(shí)施方式中用于檢測gnas基因1019位突變位點(diǎn)的引物對如下:gnas-e1-1-fagaggccgccaccgtgttatseqidno.8gnas-e1-1-raggcctcgccatcattctcseqidno.9tshr基因tshr基因編碼的蛋白為膜蛋白,主要參與甲狀腺細(xì)胞的代謝,是促甲狀腺素的受體,可被腺苷酸環(huán)化酶激活。與tshr相關(guān)的疾病有先天性甲狀腺功能減退癥及非自身免疫性甲狀腺功能亢進(jìn)癥。第2252位發(fā)生突變的tshr基因(nm_000369)的序列片段如下:tgaactgattgaaaactcccatctaaccccaaaga[a/g]gcaaggccaaatctcagaagagtatatgcaaacggttttgtaag(seqidno.10)在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選地實(shí)施方式中用于檢測tshr基因2252位突變位點(diǎn)的引物對如下:tshr-e10-faggcaactatgttgagcgtcseqidno.11tshr-e10-rtatgccatcaccttcgccatseqidno.12chek2基因在細(xì)胞周期中調(diào)控細(xì)胞周期進(jìn)程對dna損傷與復(fù)制中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。chek2基因編碼的蛋白為細(xì)胞周期檢查調(diào)節(jié)器,被認(rèn)為是抑癌基因。此基因突變與li-fraumeni綜合征,一種攜帶tp53突變的家族性的高聚集性的癌癥表型。另外,攜帶此基因突變有發(fā)生肉瘤、乳腺癌及腦腫瘤傾向。第1250位發(fā)生突變的chek2基因(nm_145862)的序列片段如下:gaaggatcagatcaccagtggaaaataca[a/g]cttcattcctgaagtctgggcagaagtctcagagaaag(seqidno.13)在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選地實(shí)施方式中用于檢測chek2基因1250位突變位點(diǎn)的引物對如下:chek2-e11-ftcccaccacagcacatacacseqidno.14chek2-e11-rcttttcctttctctctctaccseqidno.15pik3ca基因pik3ca基因?yàn)橹掳┗颍瑢儆趐i3ks家族,負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)各種不同的細(xì)胞功能包括生存及增殖,其基因突變與宮頸癌等腫瘤的發(fā)病有關(guān)。第1818位發(fā)生突變的pik3ca基因(nm_006218)的序列如下:ctgaacaggctatggaacttctggactgtaatta[c/-]ccagatcctatggttcgaggttttgctgttcggtg(seqidno.16)在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選地實(shí)施方式中用于檢測pik3ca基因1818位突變位點(diǎn)的引物對如下:pik3ca-e12-fcacaaactagagtcacacacseqidno.17pik3ca-e12-rgcacgattcttttagatctgseqidno.18本發(fā)明的主要優(yōu)點(diǎn)在于:(1)首次揭示一組能夠作為鑒別甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的標(biāo)志物的基因多態(tài)性位點(diǎn),特異性高;(2)根據(jù)本發(fā)明的分子標(biāo)志(突變的基因位點(diǎn))組合,針對中國甲狀腺癌人群具有很好診斷價(jià)值,可以使診斷的陽性率高達(dá)90%以上。(3)在收集臨床病人樣本時(shí),只需收集甲狀腺結(jié)節(jié)穿刺細(xì)胞,抽提rna作為模板,可同時(shí)檢測基因突變及融合基因,臨床可行性較好。下面結(jié)合具體實(shí)施例,進(jìn)一步詳陳本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實(shí)施例中未注明詳細(xì)條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件如美國sambrook.j等著《分子克隆實(shí)驗(yàn)室指南》(黃培堂等譯,北京:科學(xué)出版社,2002年)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。除非另外說明,否則百分比和份數(shù)按重量計(jì)算。以下實(shí)施例中所用的實(shí)驗(yàn)材料和試劑如無特別說明均可從市售渠道獲得。方法本發(fā)明提供一種鑒別甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的靶向基因二代測序的檢測方法,并根據(jù)甲狀腺結(jié)節(jié)的分子診斷結(jié)果確定患者合適的術(shù)式及術(shù)后管理。具體地,本發(fā)明提供了一種針對甲狀腺結(jié)節(jié)鑒別診斷的靶向基因二代測序的檢測方法,包括以下步驟:步驟(1):獲得已知可能導(dǎo)致甲狀腺癌的相關(guān)基因信息;步驟(2):通過ucsc和ncbi數(shù)據(jù)庫導(dǎo)出基因序列以及編碼信息;步驟(3):使用massarrayassaydesign軟件對這些基因進(jìn)行aa芯片引物設(shè)計(jì);步驟(4):aa芯片實(shí)驗(yàn)大致步驟(可分為5步);①上樣:用排槍將96孔板里引物和模板吸到48.48accessarrayifc芯片上。②裝載:將芯片放進(jìn)pre-pcrifccontrollerax儀器里,引物和模板自動混合。③熱循環(huán):利用fc1cycler儀器進(jìn)行pcr擴(kuò)增反應(yīng)。④收獲:利用post-pcrifccontrollerax儀器進(jìn)行pcr產(chǎn)物匯集和收獲。⑤恢復(fù):用排槍將芯片模板上樣處pcr產(chǎn)物吸出。步驟(5):利用bwa,samtools和gatk軟件對測序結(jié)果進(jìn)行分析。步驟(6):所有測得的snv以及indel經(jīng)過annovar(http://annovar.openbioinformatics.org/)功能注釋和公共數(shù)據(jù)庫(exac,1000genomes,dbsnpandclinvar)過濾。步驟(7):符合①雙復(fù)孔snv,alldepth>20,vaf>0.3;②單孔snv,alldepth>1000,vaf>0.4;③雙復(fù)孔snv,單孔測的不好,復(fù)孔測的好的(alldepth>1000)標(biāo)準(zhǔn)的snv經(jīng)sanger測序進(jìn)行證實(shí)。步驟(8):符合①雙復(fù)孔indel,除去snp;②單孔indel,alldepth>25,vaf≥0.4,除去snp標(biāo)準(zhǔn)的indel經(jīng)sanger測序進(jìn)行證實(shí)。較佳地,panel中包含與甲狀腺癌發(fā)病有關(guān)的19個(gè)基因、8個(gè)融合基因及相關(guān)內(nèi)參基因,具體如下:檢測19個(gè)基因的snv:braf,hras,nras,kras,eif1ax,ppm1d,chek2,ret,ctnnb1,tp53,akt1,gnas,pik3ca,pten,tshr,cdkn2a,axin1,idh1,vhl檢測8個(gè)融合基因:ccdc6/ret,ncoa4/ret,etv6/ntrk3,strn/alk,pax8/pparg,tpm3/ntrk3,eml4/alk,prkar1a/ret甲狀腺特異基因及內(nèi)參基因:tg,tpo,gapdh,β-actin,18srrna,28srrna,tublin,rplpo(人類大核糖體蛋白),tfrc(轉(zhuǎn)鐵蛋白受體)較佳地,所述的用于accessarraytmsystem擴(kuò)增的引物設(shè)計(jì)軟件為massarrayassaydesign。較佳地,所述的靶向測序后的數(shù)據(jù)分析軟件為bwa,samtools和gatk.。較佳地,篩選snv的標(biāo)準(zhǔn)為①雙復(fù)孔snv,alldepth>20,vaf>0.3;②單孔snv,alldepth>1000,vaf>0.4;③雙復(fù)孔snv,單孔測的不好,復(fù)孔測的好的(alldepth>1000)。較佳地,篩選indel的標(biāo)準(zhǔn)為①雙復(fù)孔indel,除去snp;②單孔indel,alldepth>25,vaf≥0.4,除去snp。本發(fā)明適用于甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的明確,彌補(bǔ)了該領(lǐng)域的不足與缺失,根據(jù)可能導(dǎo)致甲狀腺癌發(fā)病的突變基因及融合基因,通過accessarraytmsystem建立組合性panel進(jìn)行靶向基因的二代測序。通過初步對123個(gè)甲狀腺癌患者的二代測序、數(shù)據(jù)分析以及sanger測序驗(yàn)證,19個(gè)基因中有11個(gè)基因測到突變,包括熱點(diǎn)突變brafv600e,nras:q61r,q61k,retm918t,pten,tshr,tp53及akt1,融合基因檢測到etv6-ntrk3,ncoa4-ret和ccdc6-ret。此次組合性分子標(biāo)志物應(yīng)用在123例甲狀腺癌患者中的診斷率極高。而且發(fā)現(xiàn)在多例患者中出現(xiàn)多個(gè)致病基因出現(xiàn)突變或同時(shí)存在驅(qū)動基因突變及融合基因的情況,說明甲狀腺癌的發(fā)病是多種基因改變累積造成的,且具有腫瘤異質(zhì)性,進(jìn)一步證實(shí)對于此類疾病進(jìn)行精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)診斷的必要性。本發(fā)明適用于臨床甲狀腺結(jié)節(jié)的良惡性鑒別診斷,可以進(jìn)行高通量檢測,并進(jìn)行臨床推廣,有助于全面選擇患者的治療方案,充分彌補(bǔ)彌補(bǔ)該領(lǐng)域的不足與缺失,十分具有實(shí)用價(jià)值。綜上所述,本項(xiàng)目的結(jié)果證實(shí)基于二代測序技術(shù)基礎(chǔ)上的組合性分子標(biāo)志物在甲狀腺結(jié)節(jié)的良惡性診斷中發(fā)揮重要作用。包涵大多數(shù)甲狀腺癌致病基因的組合性分子標(biāo)志物的靶向二代測序可提高甲狀腺惡性腫瘤的診斷率,成功的彌補(bǔ)了目前甲狀腺細(xì)胞學(xué)診斷的不足,并指導(dǎo)甲狀腺結(jié)節(jié)患者的診療得以完善,避免了非必須的診斷性手術(shù)對社會的醫(yī)療資源的浪費(fèi)及病患手術(shù)的潛在風(fēng)險(xiǎn)。同時(shí),本研究的結(jié)果為基因診斷在臨床實(shí)踐中發(fā)揮作用提供了新的思路。實(shí)施例1甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性相關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn)的篩選和鑒定樣本說明:甲狀腺細(xì)針穿刺細(xì)胞,抽提rna,反轉(zhuǎn)錄得到cdna文庫。具體實(shí)施步驟:步驟(1):根據(jù)可能的甲狀腺癌致病基因,包括突變基因及融合基因,根據(jù)ucscgenomebrowser中g(shù)rch37/hg19中的基因序列,明確基因在染色體位置、編碼、基因大小以及假基因情況等。步驟(2):根據(jù)accessarraytmsystem擴(kuò)增的要求(目標(biāo)序列大小240bp,存在重疊),設(shè)計(jì)引物,并加入標(biāo)簽序列。步驟(3):引物合成后,進(jìn)行稀釋,按accessarraytmsystem擴(kuò)增要求,配制引物混合物,分于96孔板。步驟(4):擴(kuò)增模板的制備,定量到50ng/ul(不足50ng/ul以50ng/ul記),配制模板混合物,分于96孔板。步驟(5):用排槍將96孔板里引物和模板吸到48.48accessarrayifc芯片上。步驟(6):將芯片放進(jìn)pre-pcrifccontrollerax儀器里,引物和模板自動混合,并利用fc1cycler儀器進(jìn)行pcr擴(kuò)增反應(yīng)。步驟(7):利用post-pcrifccontrollerax儀器進(jìn)行pcr產(chǎn)物匯集和收獲(注意收獲時(shí)需要更換房間操作,以防污染)步驟(8):準(zhǔn)備barcode混合物加入1:100稀釋產(chǎn)物,進(jìn)行pcr反應(yīng)。步驟(9):磁珠純化產(chǎn)物,跑膠確認(rèn)barcode加上后,準(zhǔn)備上機(jī)測序。步驟(10):nextseq500上機(jī)測序,利用bwa,samtools和gatk軟件對下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。步驟(11):所測得的snv以及indel經(jīng)過annovar(http://annovar.openbioinformatics.org/)功能注釋和公共數(shù)據(jù)庫(exac,1000genomes,dbsnpandclinvar)過濾。步驟(12):符合①雙復(fù)孔snv,alldepth>20,vaf>0.3;②單孔snv,alldepth>1000,vaf>0.4;③雙復(fù)孔snv,單孔測的不好,復(fù)孔測的好的(alldepth>1000)標(biāo)準(zhǔn)的snv經(jīng)sanger測序進(jìn)行證實(shí)。步驟(13):符合①雙復(fù)孔indel,除去snp;②單孔indel,alldepth>25,vaf≥0.4,除去snp標(biāo)準(zhǔn)的indel經(jīng)sanger測序進(jìn)行證實(shí)。本發(fā)明適用于甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性鑒別診斷的分子檢測,彌補(bǔ)了該領(lǐng)域的不足與缺失,其原理為本發(fā)明在目前已報(bào)道的甲狀腺癌發(fā)病相關(guān)致病基因中,通過massarrayassaydesign軟件設(shè)計(jì)引物,在48.48accessarrayifc上,進(jìn)行靶向基因多重pcr擴(kuò)增后,進(jìn)行二代測序分析,使針對該疾病的高通量更大覆蓋面的基因診斷成為可能。通過對123例患者的研究,發(fā)現(xiàn)19個(gè)基因中有11個(gè)基因測到突變(表2),檢測到3種融合基因(表3),包含了115種突變,診斷率高于93%。進(jìn)一步可將更多的中國人群中甲狀腺癌的驅(qū)動基因及融合基因匯聚在一個(gè)診斷panel中,可以更高效、快速地進(jìn)行大量樣本的基因檢測。本發(fā)明十分適用于中國人群甲狀腺結(jié)節(jié)患者,可彌補(bǔ)該領(lǐng)域的不足與缺失,十分具有實(shí)用價(jià)值。表2表3融合基因名稱序列信息突變患者數(shù)etv6-ntrk3etv6{enst00000396373}:r.1_737_ntrk3{enst00000394480}:r.1719_1998410ncoa4-retncoa4{enst00000452682}:r.1_1014_ret{enst00000355710}:r.2369_56593ccdc6-retccdc6{enst00000263102}:r.1_535_ret{enst00000355710}:r.2369_56592對本發(fā)明的基因突變的組織特異性進(jìn)行了分析,結(jié)果表明,本發(fā)明的各突變位點(diǎn)具有優(yōu)異的組織特異性,突變特異性的在甲狀腺癌組織中有檢出,在正常體細(xì)胞中很少有檢出,僅在1例甲狀腺腺瘤中檢測到有nras基因上的q61k的突變。值得注意的是,雖然甲狀腺腺瘤是良性疾病,但腺瘤的病理形態(tài)有時(shí)和甲狀腺乳頭狀癌很相似,因此單靠病理有時(shí)可能發(fā)生診斷誤差,具體結(jié)果如下表4所示:表4ta,甲狀腺腺瘤(thyroidadenoma)ng,結(jié)節(jié)性甲狀腺腫(nodulargoiter)ptc,甲狀腺乳頭狀癌(papillarythyroidcarcinoma)ftc,甲狀腺濾泡癌(follicularthyroidcarcinoma,包含在ptc中)mtc,甲狀腺髓樣癌(medullarythyroidcarcinoma)pdtc,低分化甲狀腺癌(poorlydifferentiatedthyroidcancer)atc,未分化甲狀腺癌(anaplasticthyroidcarcinoma)實(shí)施例2試劑盒的制備和效果驗(yàn)證本實(shí)施例提供了一種檢測甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性的試劑盒。本試劑盒可對上表2中的突變位點(diǎn)和上表3中的融合基因進(jìn)行基因突變檢測:試劑盒主要試劑:(1)多態(tài)位點(diǎn)擴(kuò)增引物上游引物(f)和下游引物(r)(massarrayassaydesign軟件設(shè)計(jì));(2)多態(tài)位點(diǎn)測序引物測序引物(s)(根據(jù)本領(lǐng)域常規(guī)方法設(shè)計(jì));(3)pcr主要試劑:pfu高保真酶,10×pcrbuffer,dntpmixtur,ddh2o;(4)焦磷酸測序主要試劑:70%乙醇溶液,磁珠,變性緩沖液,退火緩沖液,結(jié)合緩沖液,洗滌緩沖液,底物(asp,熒光素),酶混合溶液(dna聚合酶、熒光素酶、三磷酸腺苷硫酸化酶、三磷酸腺苷雙磷酸酶),a/t/c/g堿基。使用本實(shí)施例提供的試劑盒,對300例甲狀腺結(jié)節(jié)患者進(jìn)行檢測,具體方法參考實(shí)施例1,共檢出了176例患者攜帶本發(fā)明的基因突變,最后通過臨床常規(guī)方法確認(rèn)甲狀腺癌患者為184例,檢出率高達(dá)95%以上,具體檢測結(jié)果見表5。表5300例甲狀腺癌患者靶向基因二代測序的結(jié)果在本發(fā)明提及的所有文獻(xiàn)都在本申請中引用作為參考,就如同每一篇文獻(xiàn)被單獨(dú)引用作為參考那樣。此外應(yīng)理解,在閱讀了本發(fā)明的上述講授內(nèi)容之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以對本發(fā)明作各種改動或修改,這些等價(jià)形式同樣落于本申請所附權(quán)利要求書所限定的范圍。序列表<110>上海安甲生物科技有限公司<120>與甲狀腺癌相關(guān)的基因多態(tài)性位點(diǎn)及其應(yīng)用<130>p2017-0424<160>18<170>patentinversion3.5<210>1<211>80<212>dna<213>人<220><221>misc_feature<222>(39)..(39)<223>n=t,或a<400>1cctcacagtaaaaataggtgattttggtctagctacagngaaatctcgatggagtgggtc60ccatcagtttgaacagttgt80<210>2<211>20<212>dna<213>人工序列<400>2ggagccttgtatatagacgg20<210>3<211>20<212>dna<213>人工序列<400>3tgtatgttctaacaggcacc20<210>4<211>60<212>dna<213>人<220><221>misc_feature<222>(30)..(30)<223>n=t,或c<400>4atagcaagtcatttgcggatattaacctcnacagggagcagattaagcgagtaaaagact60<210>5<211>20<212>dna<213>人工序列<400>5caagaaaccatatgctcacc20<210>6<211>20<212>dna<213>人工序列<400>6ttggattgtgtccgttgagc20<210>7<211>69<212>dna<213>人<220><221>misc_feature<222>(34)..(34)<223>n=c,或a<400>7gcccaacagcgccggagcttccttaacgcccacaccgctccggcgcccaggtattccctg60agtcccccg69<210>8<211>20<212>dna<213>人工序列<400>8agaggccgccaccgtgttat20<210>9<211>19<212>dna<213>人工序列<400>9aggcctcgccatcattctc19<210>10<211>80<212>dna<213>人<220><221>misc_feature<222>(36)..(36)<223>n=a,或g<400>10tgaactgattgaaaactcccatctaaccccaaagangcaaggccaaatctcagaagagta60tatgcaaacggttttgtaag80<210>11<211>20<212>dna<213>人工序列<400>11aggcaactatgttgagcgtc20<210>12<211>20<212>dna<213>人工序列<400>12tatgccatcaccttcgccat20<210>13<211>68<212>dna<213>人<220><221>misc_feature<222>(30)..(30)<223>n=a,,或g<400>13gaaggatcagatcaccagtggaaaatacancttcattcctgaagtctgggcagaagtctc60agagaaag68<210>14<211>20<212>dna<213>人工序列<400>14tcccaccacagcacatacac20<210>15<211>21<212>dna<213>人工序列<400>15cttttcctttctctctctacc21<210>16<211>70<212>dna<213>人<220><221>misc_feature<222>(35)..(35)<223>n=c,或無<400>16ctgaacaggctatggaacttctggactgtaattanccagatcctatggttcgaggttttg60ctgttcggtg70<210>17<211>20<212>dna<213>人工序列<400>17cacaaactagagtcacacac20<210>18<211>20<212>dna<213>人工序列<400>18gcacgattcttttagatctg20當(dāng)前第1頁12