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      新品種半滑舌鰨的分子選育方法與流程

      文檔序號(hào):12030209閱讀:450來源:國知局

      技術(shù)領(lǐng)域:

      本發(fā)明涉及一種魚類新品種的選育方法,尤其涉及一種新品種半滑舌鰨的分子選育方法。



      背景技術(shù):

      半滑舌鰨是我國海水養(yǎng)殖的主導(dǎo)魚類之一,具有個(gè)體大、生長(zhǎng)快、肉味鮮美等特點(diǎn),經(jīng)濟(jì)價(jià)值很高。目前常用的育種方法以種內(nèi)雜交和群體選育為主,由于在育種前不了解選育親本的遺傳信息,同時(shí)種內(nèi)雜交隨機(jī)性大,選育優(yōu)良品種的概率低,群體選育容易使親本近親交配,會(huì)出現(xiàn)種質(zhì)退化現(xiàn)象,以致出現(xiàn)了孵化率、出苗率降低、生長(zhǎng)速度減慢、抗逆性差等性狀退化現(xiàn)象,使半滑舌鰨經(jīng)濟(jì)性狀和生產(chǎn)性能下降。



      技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

      本發(fā)明的目的是為解決目前半滑舌鰨養(yǎng)殖和培育過程中,種內(nèi)雜交方法隨機(jī)性大,選育優(yōu)良品種的概率低,群體選育方法存在易產(chǎn)生近親交配,出現(xiàn)種質(zhì)退化,導(dǎo)致經(jīng)濟(jì)性狀和生產(chǎn)性能下降的問題,針對(duì)上述問題提供的一種新品種半滑舌鰨的選育方法。

      本發(fā)明的目的可以通過如下措施來達(dá)到:新品種半滑舌鰨的分子選育方法,其特征在于新品種半滑舌鰨按以下步驟選育:

      一、根據(jù)新品種的設(shè)計(jì)需求,挑選表型性狀符合要求的半滑舌鰨作為親本,表型性狀挑選公式為,公式中xn為親本的表型性狀測(cè)定值,為半滑舌鰨群體表型性狀的平均值,s為半滑舌鰨群體表型性狀的標(biāo)準(zhǔn)差;

      二、檢測(cè)分析親本間的遺傳組成,a.提取親本基因組dna;b.用20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物對(duì)親本基因組dna分別進(jìn)行pcr擴(kuò)增;c.將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳檢測(cè),獲得產(chǎn)物條帶圖片;d.利用凝膠圖像分析軟件,將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物電泳條帶圖片轉(zhuǎn)化成數(shù)字信息數(shù)據(jù);e.將數(shù)字信息數(shù)據(jù)導(dǎo)入遺傳分析軟件,計(jì)算獲得親本間的遺傳組成;

      三、根據(jù)遺傳組成,選擇親本間的遺傳距離0.7~1.0作為“閾值”范圍進(jìn)行配組,親本分成2個(gè)或2個(gè)以上繁殖群體;

      四、繁殖群體內(nèi)親本自由組合交配,生產(chǎn)、培育子代半滑舌鰨至性成熟;

      五、以子代半滑舌鰨為新一代親本,重復(fù)操作步驟一至四,直到達(dá)到新品種半滑舌鰨性狀的設(shè)計(jì)要求,即得到新品種半滑舌鰨。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟a中提取親本基因組dna采用常規(guī)酚-氯仿抽提的方法或者使用基因組dna純化試劑盒。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟b中每對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物的pcr擴(kuò)增反應(yīng)總體積為15l,包括10.8l反應(yīng)緩沖液、100ng親本個(gè)體基因組dna、0.6μl微衛(wèi)星標(biāo)記上下游引物、0.5utaqdna聚合酶和余量的滅菌超純水;其中反應(yīng)緩沖液含有終濃度10mmol/ltris-cl(ph8.3)、50mmol/lkcl、1.5mmol/lmgcl2、200μmol/ldntp和余量的超純水。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟b中pcr擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3分鐘;94℃變性30秒,58℃復(fù)性30秒,72℃延伸30秒,循環(huán)25次;最后72℃延伸5分鐘。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟c中pcr擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳檢測(cè)過程為:pcr擴(kuò)增產(chǎn)物先使用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳2-3小時(shí),之后將凝膠染色10分鐘,然后顯色5-10分鐘,將凝膠掃描或照相獲得產(chǎn)物條帶圖片。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的染色用染色液為0.1%硝酸銀溶液,所述的顯色用顯色液每升含有20g的naoh、0.4g的na2co3和4ml的甲醛溶液。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟b中選用的20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物的序列為:

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)上游引物:gggagtcaacaaccaaacca

      下游引物:cactcgcaaagactgaggtg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)上游引物:actgcgtccaaactgaggag

      下游引物:cattccccactcactgtcct

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)上游引物:tcctgtgggaggagaggaga

      下游引物:acacacctgcacacaccagt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)上游引物:ccatccgagaccttcagtgt

      下游引物:acctgctcctcctctgtgag

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)上游引物:acaaagctgcgttcctatcg

      下游引物:ggatcctgcctttggtttct

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)上游引物:atcgaggaggatctgtgtgg

      下游引物:gcgtgagatgcaagaaaaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)上游引物:tgcagcgcacattacctaac

      下游引物:ggcacgctgaagctttaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)上游引物:cgttgccatcacacaatttc

      下游引物:caacgtgcatcgtgtctctt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)上游引物:tgtgaagtcatgtggttctg

      下游引物:tgagttggttgtatgtcctg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)上游引物:ggctgcctacaaacctcaac

      下游引物:gaggactcagatgcacacga

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)上游引物:gtttccttcctttcattcct

      下游引物:gaaatggacgtctgtgattt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)上游引物:cacaaaattgctgcttgcat

      下游引物:aacactccaaccccaggtaa

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)上游引物:ctgccgtgatcttcacaaaa

      下游引物:tccactgggacaagaaaaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)上游引物:ctgtgaccctcctcctgct

      下游引物:ctccatgctgccagtgttt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)上游引物:aaagaggcgtgtcatcggtt

      下游引物:cccaatcgctcaagaaatcc

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)上游引物:taccacgctgccttcaaatg

      下游引物:ttcaccactgttctgctccac

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)上游引物:gacgaaggtttttgaatggtta

      下游引物:gtgaggcacaggcttttgga

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)上游引物:tccgacccacagttgtatca

      下游引物:taaacagatctgctgcagtgagt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)上游引物:tcatcagcccagttcaaagt

      下游引物:ctacctctgcttcagctgtg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)上游引物:tctttaccgagaatctccctcc

      下游引物:aaagggcctaccgaaagaat。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟d中使用的凝膠圖像分析軟件為gel-proanalyzer(version4.0)。

      為了進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的目的,所述的第二步驟的步驟e中使用的遺傳分析軟件為“基于遺傳背景的分子育種軟件1.0”。

      本發(fā)明同已有技術(shù)相比可產(chǎn)生如下積極效果:本發(fā)明解決了目前半滑舌鰨養(yǎng)殖和培育過程中,種內(nèi)雜交方法隨機(jī)性大,選育優(yōu)良品種的概率低,群體選育方法存在易產(chǎn)生近親交配,出現(xiàn)種質(zhì)退化,導(dǎo)致經(jīng)濟(jì)性狀和生產(chǎn)性能下降的問題,本發(fā)明方法在選育新品種半滑舌鰨的過程中,始終檢測(cè)各代親本的繁殖譜系,以各代親本遺傳距離0.7~1.0作為“閾值”范圍進(jìn)行配組,從而既能避免近親交配,又能按照所設(shè)定的方向選擇半滑舌鰨新品種的性狀,顯著提高其經(jīng)濟(jì)性狀和生產(chǎn)性能,增加優(yōu)良新品種的出現(xiàn)概率。

      具體實(shí)施方式:下面對(duì)本發(fā)明的具體實(shí)施方式做詳細(xì)說明:

      具體實(shí)施方式一:本實(shí)施方式新品種半滑舌鰨按以下步驟選育:一、根據(jù)新品種的設(shè)計(jì)需求,挑選表型性狀符合要求的半滑舌鰨作為親本;二、檢測(cè)分析親本間的遺傳組成;三、根據(jù)遺傳組成,選擇親本間遺傳距離0.7~1.0作為“閾值”范圍進(jìn)行配組,親本分成2個(gè)或2個(gè)以上繁殖群體;四、繁殖群體內(nèi)親本自由組合交配,生產(chǎn)、培育子代半滑舌鰨至性成熟;五、以子代半滑舌鰨為新一代親本,重復(fù)操作步驟一至四,直到達(dá)到新品種半滑舌鰨性狀的設(shè)計(jì)要求,即得到新品種半滑舌鰨。

      本實(shí)施方式可根據(jù)具體需要進(jìn)行設(shè)計(jì),如選擇培育生長(zhǎng)速度快、體重、體厚、不可量化的表型性狀進(jìn)行挑選。

      具體實(shí)施方式二:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式一的不同點(diǎn)是:步驟一中表型性狀挑選公式為,公式中xn為親本的表型性狀測(cè)定值,為半滑舌鰨群體表型性狀的平均值,s為半滑舌鰨群體表型性狀的標(biāo)準(zhǔn)差,2倍s表示選擇強(qiáng)度中等,本實(shí)施方式保留小于表型性狀平均值+2倍標(biāo)準(zhǔn)差和大于表型性狀平均值-2倍標(biāo)準(zhǔn)差的半滑舌鰨個(gè)體。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式一相同。

      具體實(shí)施方式三:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式一的不同點(diǎn)是:步驟二中檢測(cè)分析親本間的遺傳組成:a.提取親本基因組dna;b.用20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物對(duì)親本基因組dna分別進(jìn)行pcr擴(kuò)增;c.將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳檢測(cè),獲得產(chǎn)物條帶圖片;d.利用凝膠圖像分析軟件,將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物電泳條帶圖片轉(zhuǎn)化成數(shù)字信息數(shù)據(jù);e.將數(shù)字信息數(shù)據(jù)導(dǎo)入遺傳分析軟件,計(jì)算獲得親本間遺傳信息。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式一相同。

      本實(shí)施方式中要對(duì)被檢測(cè)分析遺傳組成的親本個(gè)體進(jìn)行標(biāo)記,可采用外部標(biāo)記如掛牌標(biāo)記、內(nèi)部標(biāo)記如pit射頻標(biāo)記或分池飼養(yǎng)等方法。

      具體實(shí)施方式四:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟a中提取親本基因組dna可以采用常規(guī)酚-氯仿抽提的方法或者使用基因組dna純化試劑盒。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同。

      具體實(shí)施方式五:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟b中每對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物的pcr擴(kuò)增反應(yīng)總體積為15l,包括10.8l反應(yīng)緩沖液、100ng親本個(gè)體基因組dna、0.6μl微衛(wèi)星標(biāo)記上下游引物、0.5utaqdna聚合酶和余量的滅菌超純水;其中反應(yīng)緩沖液由終濃度10mmol/ltris-cl(ph8.3)、50mmol/lkcl、1.5mmol/lmgcl2、200μmol/ldntp和余量的超純水組成。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同。

      具體實(shí)施方式六:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟b中pcr擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3分鐘;94℃變性30秒,58℃復(fù)性30秒,72℃延伸30秒,循環(huán)25次;最后72℃延伸5分鐘。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同。

      具體實(shí)施方式七:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟c中pcr擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠電泳檢測(cè)過程包括,產(chǎn)物先使用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳2-3小時(shí),之后將凝膠染色10分鐘,然后顯色5-10分鐘,將凝膠掃描或照相獲得產(chǎn)物條帶圖片。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同。

      具體實(shí)施方式八:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式七的不同點(diǎn)是:步驟c中染色用染色液為0.1%硝酸銀溶液,所述的顯色用顯色液每升含有20g的naoh、0.4g的na2co3和4ml的甲醛溶液。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式七相同。

      具體實(shí)施方式九:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟b中選用的20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物的序列如下,其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同:

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)上游引物:gggagtcaacaaccaaacca

      下游引物:cactcgcaaagactgaggtg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)上游引物:actgcgtccaaactgaggag

      下游引物:cattccccactcactgtcct

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)上游引物:tcctgtgggaggagaggaga

      下游引物:acacacctgcacacaccagt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)上游引物:ccatccgagaccttcagtgt

      下游引物:acctgctcctcctctgtgag

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)上游引物:acaaagctgcgttcctatcg

      下游引物:ggatcctgcctttggtttct

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)上游引物:atcgaggaggatctgtgtgg

      下游引物:gcgtgagatgcaagaaaaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)上游引物:tgcagcgcacattacctaac

      下游引物:ggcacgctgaagctttaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)上游引物:cgttgccatcacacaatttc

      下游引物:caacgtgcatcgtgtctctt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)上游引物:tgtgaagtcatgtggttctg

      下游引物:tgagttggttgtatgtcctg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)上游引物:ggctgcctacaaacctcaac

      下游引物:gaggactcagatgcacacga

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)上游引物:gtttccttcctttcattcct

      下游引物:gaaatggacgtctgtgattt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)上游引物:cacaaaattgctgcttgcat

      下游引物:aacactccaaccccaggtaa

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)上游引物:ctgccgtgatcttcacaaaa

      下游引物:tccactgggacaagaaaaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)上游引物:ctgtgaccctcctcctgct

      下游引物:ctccatgctgccagtgttt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)上游引物:aaagaggcgtgtcatcggtt

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      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)上游引物:taccacgctgccttcaaatg

      下游引物:ttcaccactgttctgctccac

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)上游引物:gacgaaggtttttgaatggtta

      下游引物:gtgaggcacaggcttttgga

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)上游引物:tccgacccacagttgtatca

      下游引物:taaacagatctgctgcagtgagt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)上游引物:tcatcagcccagttcaaagt

      下游引物:ctacctctgcttcagctgtg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)上游引物:tctttaccgagaatctccctcc

      下游引物:aaagggcctaccgaaagaat

      具體實(shí)施方式十:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟d中使用的凝膠圖像分析軟件為gel-proanalyzer(version4.0)。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同。

      具體實(shí)施方式十一:本實(shí)施方式與具體實(shí)施方式三的不同點(diǎn)是:步驟e中使用的遺傳分析軟件為“基于遺傳背景的分子育種軟件1.0”。其他步驟及參數(shù)與實(shí)施方式三相同。

      具體實(shí)施方式十二:本實(shí)施方式半滑舌鰨新品種按以下步驟選育:

      步驟一,根據(jù)生長(zhǎng)速度快、體重大的新品種設(shè)計(jì)要求,對(duì)海陽市黃海水產(chǎn)有限公司的3000尾半滑舌鰨親魚進(jìn)行表型性狀挑選,挑選公式為,公式中xn為親本的表型性狀測(cè)定值,為半滑舌鰨群體表型性狀的平均值,s為半滑舌鰨群體表型性狀的標(biāo)準(zhǔn)差,2倍s表示選擇強(qiáng)度中等,本實(shí)施方式保留小于表型性狀平均值+2倍標(biāo)準(zhǔn)差和大于表型性狀平均值-2倍標(biāo)準(zhǔn)差的半滑舌鰨個(gè)體作為親本。

      步驟二,檢測(cè)分析親本間的遺傳組成:

      a.提取親本基因組dna

      對(duì)被檢測(cè)分析遺傳信息的親本個(gè)體進(jìn)行標(biāo)記,并對(duì)應(yīng)個(gè)體編號(hào)剪取0.5cm×0.5cm大小的尾鰭(約0.05g),置于4℃保溫盒內(nèi)備用,用于提取基因組dna;使用基因組dna純化試劑盒(takara,codeno.9765)提取親本基因組dna。

      b.用20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物對(duì)親本基因組dna分別進(jìn)行pcr擴(kuò)增

      每對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物的pcr擴(kuò)增反應(yīng)總體積為15l,包括10.8l反應(yīng)緩沖液、100ng親本個(gè)體基因組dna、0.6μl微衛(wèi)星標(biāo)記上下游引物、0.5utaqdna聚合酶和余量的滅菌超純水;其中反應(yīng)緩沖液由終濃度10mmol/ltris-cl(ph8.3)、50mmol/lkcl、1.5mmol/lmgcl2、200μmol/ldntp和余量的超純水組成。pcr擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性3分鐘;94℃變性30秒,58℃復(fù)性30秒,72℃延伸30秒,循環(huán)25次;最后72℃延伸5分鐘。選用的20對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記引物的序列如下:

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)上游引物:gggagtcaacaaccaaacca

      下游引物:cactcgcaaagactgaggtg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)上游引物:actgcgtccaaactgaggag

      下游引物:cattccccactcactgtcct

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)上游引物:tcctgtgggaggagaggaga

      下游引物:acacacctgcacacaccagt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)上游引物:ccatccgagaccttcagtgt

      下游引物:acctgctcctcctctgtgag

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)上游引物:acaaagctgcgttcctatcg

      下游引物:ggatcctgcctttggtttct

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)上游引物:atcgaggaggatctgtgtgg

      下游引物:gcgtgagatgcaagaaaaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)上游引物:tgcagcgcacattacctaac

      下游引物:ggcacgctgaagctttaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)上游引物:cgttgccatcacacaatttc

      下游引物:caacgtgcatcgtgtctctt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)上游引物:tgtgaagtcatgtggttctg

      下游引物:tgagttggttgtatgtcctg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)上游引物:ggctgcctacaaacctcaac

      下游引物:gaggactcagatgcacacga

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)上游引物:gtttccttcctttcattcct

      下游引物:gaaatggacgtctgtgattt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)上游引物:cacaaaattgctgcttgcat

      下游引物:aacactccaaccccaggtaa

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)上游引物:ctgccgtgatcttcacaaaa

      下游引物:tccactgggacaagaaaaca

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)上游引物:ctgtgaccctcctcctgct

      下游引物:ctccatgctgccagtgttt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)上游引物:aaagaggcgtgtcatcggtt

      下游引物:cccaatcgctcaagaaatcc

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)上游引物:taccacgctgccttcaaatg

      下游引物:ttcaccactgttctgctccac

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)上游引物:gacgaaggtttttgaatggtta

      下游引物:gtgaggcacaggcttttgga

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)上游引物:tccgacccacagttgtatca

      下游引物:taaacagatctgctgcagtgagt

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)上游引物:tcatcagcccagttcaaagt

      下游引物:ctacctctgcttcagctgtg

      微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)上游引物:tctttaccgagaatctccctcc

      下游引物:aaagggcctaccgaaagaat

      c.將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳檢測(cè),獲得產(chǎn)物條帶圖片

      pcr擴(kuò)增產(chǎn)物先使用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳2-3小時(shí),之后將凝膠染色(染色液為0.1%硝酸銀溶液)10分鐘,然后顯色(顯色液每升含有20g的naoh、0.4g的na2co3和4ml的甲醛溶液)5-10分鐘,將凝膠掃描或照相獲得產(chǎn)物條帶圖片。

      d.利用凝膠圖像分析軟件,將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物電泳條帶圖片轉(zhuǎn)化成數(shù)字信息數(shù)據(jù)

      使用凝膠圖像分析軟件gel-proanalyzer(version4.0)將pcr擴(kuò)增產(chǎn)物電泳條帶圖片轉(zhuǎn)化成表格形式的數(shù)字信息數(shù)據(jù)。

      e.將數(shù)字信息數(shù)據(jù)導(dǎo)入遺傳分析軟件,計(jì)算獲得親本間遺傳組成

      使用遺傳分析軟件“基于遺傳背景的分子育種軟件1.0”進(jìn)行遺傳參數(shù)的分析和計(jì)算,獲得親本間的遺傳組成。雌性群體的有效等位基因數(shù)(ne)為1.792~5.686,平均為3.578;雄性群體ne為1.471~6.116,平均為3.508。雌性群體的觀測(cè)雜合度(ho)為0.418~0.835,平均為0.606;雄性群體為0.28~0.798,平均為0.548。雌性群體的期望雜合度(he)為0.444~0.822,平均為0.696;雄性群體為0.321~0.839,平均為0.655。雌、雄親本個(gè)體間的遺傳距離,在0.254~1.959之間,平均值為0.890。

      步驟三,根據(jù)親本間的遺傳組成,選擇親本間的遺傳距離0.7~1.0作為“閾值”范圍進(jìn)行配組,將雌雄親本分成2個(gè)或2個(gè)以上繁殖群體,即繁殖群體內(nèi)任意一對(duì)雌雄親本的個(gè)體間的遺傳距離都在0.7~1.0之間。。

      步驟四,繁殖群體內(nèi)親本自由組合交配,生產(chǎn)、培育子代半滑舌鰨至性成熟。

      步驟五,以子代半滑舌鰨為新一代親本,重復(fù)操作步驟一至四,直到子代半滑舌鰨群體成為生長(zhǎng)速度快、體重大的新品種半滑舌鰨。

      本實(shí)施方式得到1個(gè)新品種半滑舌鰨。

      將海陽市黃海水產(chǎn)有限公司的另外300尾半滑舌鰨作為對(duì)照組,與本實(shí)施方式獲得的1個(gè)新品種半滑舌鰨進(jìn)行對(duì)比,在養(yǎng)殖條件相同的情況下,本實(shí)施方式獲得的1個(gè)新品種半滑舌鰨的生長(zhǎng)速度比對(duì)照組平均快26.23%,本實(shí)施方式獲得的1個(gè)新品種半滑舌鰨的體重比對(duì)照組平均重27.43%。

      序列表

      <110>海陽市黃海水產(chǎn)有限公司

      中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所

      <120>新品種半滑舌鰨的分子選育方法

      <160>40

      <210>1

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)的上游引物

      <400>1

      gggagtcaacaaccaaacca20

      <210>2

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)的下游引物

      <400>2

      cactcgcaaagactgaggtg20

      <210>3

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)的上游引物

      <400>3

      actgcgtccaaactgaggag20

      <210>4

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)的下游引物

      <400>4

      cattccccactcactgtcct20

      <210>5

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)的上游引物

      <400>5

      tcctgtgggaggagaggaga20

      <210>6

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)的下游引物

      <400>6

      acacacctgcacacaccagt20

      <210>7

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)的上游引物

      <400>7

      ccatccgagaccttcagtgt20

      <210>8

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)的下游引物

      <400>8

      acctgctcctcctctgtgag20

      <210>9

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)的上游引物

      <400>9

      acaaagctgcgttcctatcg20

      <210>10

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)的下游引物

      <400>10

      ggatcctgcctttggtttct20

      <210>11

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)的上游引物

      <400>11

      atcgaggaggatctgtgtgg20

      <210>12

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)的下游引物

      <400>12

      gcgtgagatgcaagaaaaca20

      <210>13

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)的上游引物

      <400>13

      tgcagcgcacattacctaac20

      <210>14

      <211>19

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)的下游引物

      <400>14

      ggcacgctgaagctttaca19

      <210>15

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)的上游引物

      <400>15

      cgttgccatcacacaatttc20

      <210>16

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)的下游引物

      <400>16

      caacgtgcatcgtgtctctt20

      <210>17

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)的上游引物

      <400>17

      tgtgaagtcatgtggttctg20

      <210>18

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)的下游引物

      <400>18

      tgagttggttgtatgtcctg20

      <210>19

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)的上游引物

      <400>19

      ggctgcctacaaacctcaac20

      <210>20

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)的下游引物

      <400>20

      gaggactcagatgcacacga20

      <210>21

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)的上游引物

      <400>21

      gtttccttcctttcattcct20

      <210>22

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)的下游引物

      <400>22

      gaaatggacgtctgtgattt20

      <210>23

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)的上游引物

      <400>23

      cacaaaattgctgcttgcat20

      <210>24

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)的下游引物

      <400>24

      aacactccaaccccaggtaa20

      <210>25

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)的上游引物

      <400>25

      ctgccgtgatcttcacaaaa20

      <210>26

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)的下游引物

      <400>26

      tccactgggacaagaaaaca20

      <210>27

      <211>19

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)的上游引物

      <400>27

      ctgtgaccctcctcctgct19

      <210>28

      <211>19

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)的下游引物

      <400>28

      ctccatgctgccagtgttt19

      <210>29

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)的上游引物

      <400>29

      aaagaggcgtgtcatcggtt20

      <210>30

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)的下游引物

      <400>30

      cccaatcgctcaagaaatcc20

      <210>31

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)的上游引物

      <400>31

      taccacgctgccttcaaatg20

      <210>32

      <211>21

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)的下游引物

      <400>32

      ttcaccactgttctgctccac21

      <210>33

      <211>22

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)的上游引物

      <400>33

      gacgaaggtttttgaatggtta22

      <210>34

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)的下游引物

      <400>34

      gtgaggcacaggcttttgga20

      <210>35

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)的上游引物

      <400>35

      tccgacccacagttgtatca20

      <210>36

      <211>23

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)的下游引物

      <400>36

      taaacagatctgctgcagtgagt23

      <210>37

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)的上游引物

      <400>37

      tcatcagcccagttcaaagt20

      <210>38

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)的下游引物

      <400>38

      ctacctctgcttcagctgtg20

      <210>39

      <211>22

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)的上游引物

      <400>39

      tctttaccgagaatctccctcc22

      <210>40

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)的下游引物

      <400>40

      aaagggcctaccgaaagaat20

      序列表

      <110>海陽市黃海水產(chǎn)有限公司

      中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所

      <120>新品種半滑舌鰨的分子選育方法

      <160>40

      <210>1

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)的上游引物

      <400>1

      gggagtcaacaaccaaacca20

      <210>2

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(1)的下游引物

      <400>2

      cactcgcaaagactgaggtg20

      <210>3

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)的上游引物

      <400>3

      actgcgtccaaactgaggag20

      <210>4

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(2)的下游引物

      <400>4

      cattccccactcactgtcct20

      <210>5

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)的上游引物

      <400>5

      tcctgtgggaggagaggaga20

      <210>6

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(3)的下游引物

      <400>6

      acacacctgcacacaccagt20

      <210>7

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)的上游引物

      <400>7

      ccatccgagaccttcagtgt20

      <210>8

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(4)的下游引物

      <400>8

      acctgctcctcctctgtgag20

      <210>9

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)的上游引物

      <400>9

      acaaagctgcgttcctatcg20

      <210>10

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(5)的下游引物

      <400>10

      ggatcctgcctttggtttct20

      <210>11

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)的上游引物

      <400>11

      atcgaggaggatctgtgtgg20

      <210>12

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(6)的下游引物

      <400>12

      gcgtgagatgcaagaaaaca20

      <210>13

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)的上游引物

      <400>13

      tgcagcgcacattacctaac20

      <210>14

      <211>19

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(7)的下游引物

      <400>14

      ggcacgctgaagctttaca19

      <210>15

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)的上游引物

      <400>15

      cgttgccatcacacaatttc20

      <210>16

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(8)的下游引物

      <400>16

      caacgtgcatcgtgtctctt20

      <210>17

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)的上游引物

      <400>17

      tgtgaagtcatgtggttctg20

      <210>18

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(9)的下游引物

      <400>18

      tgagttggttgtatgtcctg20

      <210>19

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)的上游引物

      <400>19

      ggctgcctacaaacctcaac20

      <210>20

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(10)的下游引物

      <400>20

      gaggactcagatgcacacga20

      <210>21

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)的上游引物

      <400>21

      gtttccttcctttcattcct20

      <210>22

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(11)的下游引物

      <400>22

      gaaatggacgtctgtgattt20

      <210>23

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)的上游引物

      <400>23

      cacaaaattgctgcttgcat20

      <210>24

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(12)的下游引物

      <400>24

      aacactccaaccccaggtaa20

      <210>25

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)的上游引物

      <400>25

      ctgccgtgatcttcacaaaa20

      <210>26

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(13)的下游引物

      <400>26

      tccactgggacaagaaaaca20

      <210>27

      <211>19

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)的上游引物

      <400>27

      ctgtgaccctcctcctgct19

      <210>28

      <211>19

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(14)的下游引物

      <400>28

      ctccatgctgccagtgttt19

      <210>29

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)的上游引物

      <400>29

      aaagaggcgtgtcatcggtt20

      <210>30

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(15)的下游引物

      <400>30

      cccaatcgctcaagaaatcc20

      <210>31

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)的上游引物

      <400>31

      taccacgctgccttcaaatg20

      <210>32

      <211>21

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(16)的下游引物

      <400>32

      ttcaccactgttctgctccac21

      <210>33

      <211>22

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)的上游引物

      <400>33

      gacgaaggtttttgaatggtta22

      <210>34

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(17)的下游引物

      <400>34

      gtgaggcacaggcttttgga20

      <210>35

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)的上游引物

      <400>35

      tccgacccacagttgtatca20

      <210>36

      <211>23

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(18)的下游引物

      <400>36

      taaacagatctgctgcagtgagt23

      <210>37

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)的上游引物

      <400>37

      tcatcagcccagttcaaagt20

      <210>38

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(19)的下游引物

      <400>38

      ctacctctgcttcagctgtg20

      <210>39

      <211>22

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)的上游引物

      <400>39

      tctttaccgagaatctccctcc22

      <210>40

      <211>20

      <212>dna

      <213>人工序列

      <220>

      <223>微衛(wèi)星標(biāo)記引物(20)的下游引物

      <400>40

      aaagggcctaccgaaagaat20

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