本發(fā)明涉及油菜田間管理領(lǐng)域,更特別地,涉及一種利用近紅外光譜檢測油菜莖稈纖維素含量的方法。
背景技術(shù):
油菜在我國油料作物生產(chǎn)中占據(jù)主導(dǎo)地位。近年來,我國油菜品質(zhì)得到明顯改善,生產(chǎn)模式也由原始的人工種植模式逐漸向機(jī)械化生產(chǎn)模式轉(zhuǎn)化,大大提高了油菜生產(chǎn)效益。然而,在實(shí)際生產(chǎn)中,倒伏成為制約機(jī)械化生產(chǎn)模式推行的主要因素。倒伏不僅導(dǎo)致油菜減產(chǎn),極大地影響油菜品質(zhì),還使機(jī)械化收割作業(yè)難以進(jìn)行,導(dǎo)致油菜生產(chǎn)效益受到嚴(yán)重影響。因此,選育優(yōu)良種質(zhì)資源、探究輕簡化栽培管理措施及油菜機(jī)械化栽培對于油菜高產(chǎn)和穩(wěn)產(chǎn)起著至關(guān)重要的作用。
油菜倒伏受莖稈組成成分影響顯著。纖維素是莖稈重要的結(jié)構(gòu)成分,以微纖絲形態(tài)構(gòu)建了植物細(xì)胞壁基本骨架,同時(shí)促進(jìn)細(xì)胞縱向拉長,其纖絲網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)增強(qiáng)了莖稈的機(jī)械強(qiáng)度,莖稈中纖維素含量的高低與莖稈機(jī)械組織的發(fā)達(dá)程度密切相關(guān)。大豆莖稈中纖維素合成及代謝過程試驗(yàn)表明,增加莖稈中纖維素含量可顯著增強(qiáng)莖稈的抗倒性,莖稈中纖維素含量減少,大豆莖稈抗折力減弱,倒伏易發(fā)生;在對小麥、水稻、玉米等作物的研究中也發(fā)現(xiàn)莖稈中纖維素含量越高的作物其抗倒性越強(qiáng);對大麥莖稈抗倒性研究發(fā)現(xiàn),其莖稈抗折力與莖稈纖維素含量的相關(guān)性高達(dá)0.93;對抗倒性差異較大的9個(gè)品種油菜的莖稈特性做關(guān)聯(lián)分析表明,莖稈中纖維素含量與其抗倒性呈正相關(guān)。因此,為研究其高產(chǎn)、高效、抗倒栽培機(jī)理,往往需要測定油菜莖稈中纖維素含量指標(biāo)。傳統(tǒng)纖維素含量指標(biāo)測定是通過化學(xué)分析方法得到。但這種方法費(fèi)時(shí)、費(fèi)力、費(fèi)錢,且操作步驟多,誤差控制比較困難。
薛俊杰(2016)將玉米秸稈粉碎后再采集近紅外光譜,用一階導(dǎo)數(shù)法處理可溶性糖光譜,用多元散射校正法和一階導(dǎo)數(shù)法組合預(yù)處理酸性洗滌纖維的光譜,分別得到可溶性糖和酸性洗滌纖維與近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系。然而,這種方法需要對秸稈進(jìn)行粉碎等處理步驟,而不同的樣品粉碎效果存在差異,由此會(huì)影響到光譜與物質(zhì)含量的對應(yīng)關(guān)系的構(gòu)建。
因此,需要一種更簡單更精確的方法來測定油菜莖稈纖維素含量指標(biāo)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
為解決以上問題,本發(fā)明提供了一種利用近紅外光譜檢測油菜莖稈纖維素含量的方法,其特征在于,包括以下步驟:
s1:建立油菜莖稈纖維素含量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系;
s2:測量待檢測的油菜莖稈切面上的近紅外光譜;
s3:根據(jù)s2得到的所述待檢測的油菜莖稈切面上的近紅外光譜以及s1得到的油菜莖稈纖維素含量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系,計(jì)算待檢測的油菜莖稈中的纖維素含量。
通過本發(fā)明的方法,可利用近紅外光譜儀檢測油菜莖稈切面上的近紅外光譜,并根據(jù)油菜莖稈纖維素含量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系,計(jì)算待檢測油菜莖稈中纖維素含量,與傳統(tǒng)使用化學(xué)分析法不同,在建立了對應(yīng)關(guān)系后,該方法無需再進(jìn)行復(fù)雜的化學(xué)實(shí)驗(yàn)操作,可實(shí)現(xiàn)高通量檢測。
在一個(gè)具體實(shí)施方案中,s1包括以下步驟:
s11:采集多個(gè)與待測油菜同品種的油菜莖稈樣品;
s12:測量所述多個(gè)油菜莖稈樣品的近紅外光譜;
s13:測量所述油菜莖稈樣品中的纖維素含量;
s14:根據(jù)s12和s13的結(jié)果建立所述油菜莖稈的纖維素含量與近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系。使用相同的品種的油菜莖稈樣品來建立對應(yīng)關(guān)系可使預(yù)測結(jié)果更準(zhǔn)確。
在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,s12中對每個(gè)油菜莖稈樣品采集7個(gè)切面的近紅外光譜,所述油菜莖稈樣品的近紅外光譜由所述7個(gè)切面的近紅外光譜平均得到,所述7個(gè)切面分別為所述油菜莖稈樣品的兩端橫切面,從所述油菜莖稈樣品上不同部位橫切兩次得到的兩個(gè)新鮮橫切面,以及從所述油菜莖稈樣品的三個(gè)區(qū)段取的三個(gè)縱切面。
在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,用于建立所述對應(yīng)關(guān)系的近紅外光譜的波段為7101.7cm-1-5449.8cm-1和4601.3cm-1-4246.5cm-1。
在一個(gè)實(shí)施方案中,用于建立所述對應(yīng)關(guān)系的近紅外光譜不進(jìn)行預(yù)處理,或者進(jìn)行了以下預(yù)處理方法中的任一種或幾種組合的預(yù)處理:一階導(dǎo)數(shù)法、矢量歸一化法、減去一條直線法、多元散射校正法、消除常數(shù)偏移量法、最小-最大歸一化法、msc法、二階導(dǎo)數(shù)法。
在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,用于建立所述對應(yīng)關(guān)系的近紅外光譜不進(jìn)行預(yù)處理。切面近紅外光譜與纖維素含量對應(yīng)關(guān)系模型的構(gòu)建中,不對光譜預(yù)處理得到的模型比使用常用的預(yù)處理方法得到的模型更佳,采取最原始的光譜有利于模型建立。在本發(fā)明中,獲得光譜信息的油菜莖稈是完整的。在進(jìn)行掃描時(shí),由于樣品池的大小是恒定的,而油菜莖稈直徑粗細(xì)各不相同,在樣品池上方加蓋鍍金積分球,防止自然光進(jìn)入樣品池中干擾結(jié)果。
在一個(gè)具體實(shí)施方案中,s14中油菜莖稈纖維素含量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系為通過偏最小二乘法建立的預(yù)測模型。
在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,在建立所述預(yù)測模型過程中,主成分?jǐn)?shù)為6、7、8、9或10。
在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,所述多個(gè)油菜莖稈樣品被分成校正集和驗(yàn)證集,并且校正集與驗(yàn)證集的數(shù)量比為2.5-4:1。
在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中,s2中對待測油菜莖稈7個(gè)切面的采集近紅外光譜,所述油菜莖稈樣品的近紅外光譜由所述7個(gè)切面的近紅外光譜平均得到,所述7個(gè)切面分別為所述油菜莖稈樣品的兩端橫切面,從所述油菜莖稈樣品上不同部位橫切兩次得到的兩個(gè)新橫切面,以及從所述油菜莖稈樣品的三個(gè)區(qū)段取的三個(gè)縱切面。
附圖說明
圖1為油菜莖稈樣品纖維素含量正態(tài)分布圖;
圖2為150個(gè)樣品預(yù)測值與實(shí)測值的相關(guān)性;
圖3為150個(gè)樣品預(yù)測殘差與實(shí)測值的關(guān)系;
圖4為剔除30個(gè)異常樣品后的120個(gè)樣品預(yù)測值與實(shí)測值的相關(guān)性;
圖5為剔除30個(gè)異常樣品后的120個(gè)樣品預(yù)測殘差與實(shí)測值的關(guān)系;
圖6為主成分對相關(guān)系數(shù)的影響;
圖7為主成分對rmsecv的影響。
具體實(shí)施方式
以下結(jié)合實(shí)例對本發(fā)明的原理和特征進(jìn)行描述,所舉實(shí)例只用于解釋本發(fā)明,并非用于限定本發(fā)明的范圍。
構(gòu)建油菜近紅外光譜及莖稈纖維素含量關(guān)系所用試驗(yàn)材料通過如下試驗(yàn)獲得。
1.試驗(yàn)地點(diǎn)及供試材料
試驗(yàn)在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)試驗(yàn)基地進(jìn)行。供試品種為甘藍(lán)型油菜雜交種華油雜62、灃油520,甘藍(lán)型油菜常規(guī)品種華航901、華雙5號(hào),及由150個(gè)株系構(gòu)成的dh群體,由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)提供。
2.試驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.1不同油菜品種不同肥料用量試驗(yàn)獲得不同特征的油菜莖稈
采用四因素裂區(qū)試驗(yàn)設(shè)計(jì),3次重復(fù),以4個(gè)油菜品種(灃油520,華航901,華雙5號(hào))為主區(qū);以施肥種類(氮、磷、鉀)為主裂區(qū);以氮(純氮為0kg/hm2、180kg/hm2、360kg/hm2)、磷(p2o5用量為0kg/hm2、120kg/hm2、240kg/hm2)和鉀(k2o用量為0kg/hm2、150kg/hm2、300kg/hm2)為副裂區(qū),108個(gè)氮磷鉀處理,田間管理方式按照常規(guī)。
2.2利用氮肥及密度裂區(qū)試驗(yàn)獲得不同特征的油菜莖稈
以華油雜62位試驗(yàn)材料,采用裂區(qū)設(shè)計(jì),以120kg/hm2、240kg/hm2、360kg/hm2三個(gè)氮肥為主區(qū),以15×104株hm-2,30×104株hm-2,45×104株hm-2三個(gè)密度為副區(qū),3次重復(fù)。分別于2013年9月21日、2014年9月25日播種。以含氮量為46.7%的尿素為氮源,氮肥按基肥∶苗肥∶薹肥為6∶2∶2施用。磷肥(p2o5)和鉀肥(k2o)用量均為150kg/hm2。其他管理同常規(guī)。
2.3利用油菜dh群體株系獲得不同特征的油菜莖稈
兩親本和dh群體株系于2014年9月28日播種,次年五月份收獲。采取完全隨機(jī)排列,3次重復(fù)。基肥施用(15-15-15)復(fù)合肥750kg/hm2,苗期時(shí)追施尿素75kg/hm2,硼砂用量7.5kg/hm2,田間管理方式按照常規(guī)。
3.試驗(yàn)樣品的采集與收藏
于成熟期進(jìn)行取樣,于105℃殺青,80℃烘至恒重,干燥保存。
4.油菜莖稈的近紅外光譜采集
近紅外光譜儀為德國布魯克儀器公司生產(chǎn)的brukerft-nir(vector33n型)傅里葉近紅外光譜儀,配有有pbs檢測器、石英旋轉(zhuǎn)樣品杯、鍍金積分球、opus分析軟件、波數(shù)為12000cm-1—4000cm-1。根據(jù)儀器性能及掃描油菜產(chǎn)品常用參數(shù)(呂麗娜等2004;丁小霞等2004)設(shè)定近紅外光譜的掃描參數(shù):分辨率:8cm-1;樣品掃描次數(shù):64scans;背景掃描次數(shù):64scans;數(shù)據(jù)保存范圍:12000cm-1—4000cm-1,光譜類型:aborbance;光源:tungsten(nir);分束器:石英(quartz);狹縫:1.4mm;檢測通道:external3;檢測器:pbs;-3350;0.9;掃描速度:6:10.0khz;光譜數(shù)據(jù)點(diǎn)數(shù):1960。每次掃描前將近紅外光譜預(yù)熱20min以上,再在室溫下進(jìn)行掃描,每次樣品杯放在同一檢測位置,將油菜莖稈的高度剪為剛好放在樣品杯里,上方用鍍金積分球覆蓋,防漏光,每個(gè)油菜莖桿掃描7個(gè)切面得到7條光譜,確保掃描信息完整,所述7個(gè)切面分別為所述油菜莖稈樣品的兩端橫切面,從所述油菜莖稈樣品上不同部位橫切兩次得到的兩個(gè)新橫切面,以及從所述油菜莖稈樣品的三個(gè)區(qū)段取的三個(gè)縱切面。
5.油菜莖桿纖維素含量測定
纖維素含量的直接測定方法按照peiy等2006年的提供的方法,根據(jù)wuz等2013年改進(jìn)得到。
6.油菜莖稈纖維素含量的近紅外光譜定量分析
6.1化學(xué)法實(shí)測纖維素含量的結(jié)果
采用化學(xué)分析方法測定200個(gè)樣品纖維素含量,進(jìn)行初步統(tǒng)計(jì),結(jié)果如表1,200個(gè)樣品纖維素含量范圍為9.693%-38.267%。同時(shí)從圖1中可以看出,纖維素含量分布符合正態(tài)分布,數(shù)據(jù)具有代表性。
表1200個(gè)樣品纖維素含量的實(shí)測結(jié)果統(tǒng)計(jì)
6.2異常樣品的剔除
將200個(gè)光譜信息分為兩個(gè)部分,分別為驗(yàn)證集和校正集,為避免分為校正集和驗(yàn)證集的偏差,將樣品含量從小到大依次排列,每四個(gè)為一組,在四個(gè)樣品中隨機(jī)選取一個(gè)數(shù)值作為驗(yàn)證集、剩余三個(gè)作為校正驗(yàn),保證樣本劃分的合理性。本例中,校正集樣品為150個(gè),驗(yàn)證集樣品為50個(gè),比例約為3:1。數(shù)據(jù)見表2。
表2200個(gè)樣品的校正集與驗(yàn)證集的劃分
樣品剔除前,如圖2和3所示,當(dāng)主成分?jǐn)?shù)為5時(shí),相關(guān)系數(shù)r為0.917,內(nèi)部交叉驗(yàn)證均方差rmsecv為2.310%,模型預(yù)測精度較好,預(yù)測殘差約為6.000%。
為了避免異常樣品存在對于實(shí)驗(yàn)結(jié)果影響,采用基于預(yù)測濃度殘差的方法來剔除樣品,每剔除一次數(shù)據(jù),進(jìn)行一次留一法交叉驗(yàn)證,若相關(guān)系數(shù)增大,內(nèi)部交叉驗(yàn)證均方差減小,則剔除樣品(夏俊芳,2007)?;谏鲜鲈瓌t,剔除出30個(gè)樣本數(shù)據(jù)后,剩余120個(gè)樣品采用偏最小二乘法建立模型。結(jié)果如圖4和5所示,主成分?jǐn)?shù)為5時(shí),相關(guān)系數(shù)提高到0.945,內(nèi)部交叉驗(yàn)證均方差減少到1.880%,預(yù)測模型精度提高,預(yù)測殘差減小到5.000%。
6.3光譜預(yù)處理的評估
分別采用消除常數(shù)偏移量、減去一條直線等10種方法對剔除異常樣本后的光譜進(jìn)行預(yù)處理。結(jié)果見表3。
表3預(yù)處理方法對預(yù)測模型的影響
據(jù)表3,不進(jìn)行預(yù)處理得到的模型相關(guān)系數(shù)最大,為0.945,內(nèi)部驗(yàn)證均方差最小,為1.880%。在建立纖維素含量模型時(shí),最好不對光譜進(jìn)行預(yù)處理。
6.4光譜波段的優(yōu)化
建立模型時(shí),將光譜波段優(yōu)化,可減少運(yùn)算量,提取更準(zhǔn)確光譜信息。利用無預(yù)處理和偏最小二乘法建立模型,把光譜分為45個(gè)波段,確定適宜波段。結(jié)果如表4。
表4不同光譜波段對rmsecv的影響
分為45個(gè)不同波段后,不同波段有不同的rmsecv值,最佳波段為7101.7cm-1-5449.8cm-1,4601.3cm-1-4246.5cm-1,它所對應(yīng)的rmsecv值最小,為1.880%。
6.5主成分的優(yōu)化
用無光譜預(yù)處理的方法和光譜波段為7101.7cm-1-5449.8cm-1,4601.3cm-1-4246.5cm-1范圍,以相關(guān)系數(shù)r最大和內(nèi)部交叉驗(yàn)證均方差rmsecv最小的標(biāo)準(zhǔn)來確定最佳主成分,連續(xù)選取1到10十個(gè)數(shù),偏最小二乘法建立模型,模型預(yù)測結(jié)果如圖6和7所示,在主成分?jǐn)?shù)取6時(shí)相關(guān)系數(shù)最大為0.945,內(nèi)部交叉驗(yàn)證均方差最小為1.880%,效果最佳。
綜上,油菜莖稈纖維素含量近紅外光譜建立,最佳光譜處理方法是無光譜預(yù)處理,光譜波段在7101.7cm-1-5449.8cm-1和4601.3cm-1-4246.5cm-1,主成分?jǐn)?shù)是6時(shí),建立模型相關(guān)系數(shù)r最大為0.945,內(nèi)部交叉驗(yàn)證均方差rmsecv最小為1.880%。
6.6校正模型的驗(yàn)證
將驗(yàn)證集中50個(gè)樣品光譜圖導(dǎo)入所建立的模型中,結(jié)果見表5。
表5模型驗(yàn)證結(jié)果
由表中可以看出,殘差有正有負(fù),經(jīng)過計(jì)算,驗(yàn)證集相關(guān)系數(shù)r為0.863,rmsep為2.660%,總體而言,效果一般,但基本能滿足預(yù)測要求。
以上所述僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所作的任何修改、等同替換、改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。