約5fM、約6fM、約7fM、約8fM、 約 9fM、約 10fM、約 20fM、約 30fM、約 40fM、約 50fM、約 60fM、約 70fM、約 80fM、約 90fM、約 100fM、約 200fM、約 300fM、約 400fM、約 500fM、約 600fM、約 700fM、約 800fM、約 900fM、約 1 皮摩爾(pM)、約 2pM、約 3pM、約 4pM、約 5pM、約 6pM、約 7pM、約 8pM、約 9pM、約 10pM、約 20pM、 約 30pM、約 40pM、約 50pM、約 60pM、約 7pM、約 80pM、約 90pM、約 100pM、約 200pM、約 300pM、約 400pM、約 500pM、約 600pM、約 700pM、約 800pM、約 900pM、約 1 納摩爾(nM)、約 2nM、約 3nM、 約 4nM、約 5nM、約 6nM、約 7nM、約 8nM、約 9nM、約 10nM、約 20nM、約 30nM、約 40nM、約 50nm、約 60nM、約 70nM、約 80nM、約 90nM、約 100nM、約 200nM、約 300nM、約 400nM、約 500nM、約 600nM、 約 700nM、約 800nM、約 900nM、約 1 yM、約 2 yM、約 3 yM、約 4 yM、約 5 yM、約 6 yM、約 7 yM、 約 8 y M、約 9 y M、約 10 y M、約 20 y M、約 30 y M、約 40 y M、約 50 y M、約 60 y M、約 70 y M、約 80 yM、約90 yM或約100 yM的解離常數(shù)與陣列中的多種肽結(jié)合。
[0102] 分子可以以至少lfM、至少2fM、至少3fM、至少4fM、至少5fM、至少6fM、至少7fM、 至少8fM、至少9fM、至少10fM、至少20fM、至少30fM、至少40fM、至少50fM、至少60fM、至少 70fM、至少80fM、至少90fM、至少100fM、至少200fM、至少300fM、至少400fM、至少500fM、至 少600fM、至少700fM、至少800fM、至少900fM、至少1皮摩爾(pM)、至少2pM、至少3pM、至少 4pM、至少5pM、至少6pM、至少7pM、至少8pM、至少9pM、至少10pM、至少20pM、至少30pM、至 少40pM、至少50pM、至少60pM、至少7pM、至少80pM、至少90pM、至少100pM、至少200pM、至少 300pM、至少400pM、至少500pM、至少600pM、至少700pM、至少800pM、至少900pM、至少1納 摩爾(nM)、至少2nM、至少3nM、至少4nM、至少5nM、至少6nM、至少7nM、至少8nM、至少9nM、 至少10nM、至少20nM、至少30nM、至少40nM、至少50nm、至少60nM、至少70nM、至少80nM、 至少90nM、至少100nM、至少200nM、至少300nM、至少400nM、至少500nM、至少600nM、至少 700nM、至少800nM、至少900nM、至少1 y M、至少2 y M、至少3 y M、至少4 y M、至少5 y M、至少 6 yM、至少7 yM、至少8 yM、至少9 yM、至少10 yM、至少20 yM、至少30 yM、至少40 yM、至 少50 y M、至少60 y M、至少70 y M、至少80 y M、至少90 y M或約100 y M的解離常數(shù)與陣列 中的多個(gè)肽結(jié)合。
[0103] 來自生物樣品的抗體與肽微陣列結(jié)合的動(dòng)態(tài)范圍可被描述為檢測(cè)到的結(jié)合信號(hào) 的最大值與最小值之間的比值。結(jié)合信號(hào)可以是,例如,利用第二抗體檢測(cè)到的熒光信號(hào)。 傳統(tǒng)測(cè)定受限于結(jié)合的預(yù)定的且狹窄的動(dòng)態(tài)范圍。本發(fā)明的方法和陣列可檢測(cè)寬動(dòng)態(tài)范圍 的抗體與本發(fā)明陣列中的肽的結(jié)合。在一些實(shí)施方案中,可在對(duì)數(shù)尺度上檢測(cè)寬動(dòng)態(tài)范圍 的抗體結(jié)合。在一些實(shí)施方案中,本發(fā)明的方法和陣列允許使用最高21og的動(dòng)態(tài)范圍、最 高31og的動(dòng)態(tài)范圍、最高41og的動(dòng)態(tài)范圍或最高51og的動(dòng)態(tài)范圍來檢測(cè)多種抗體與陣列 的結(jié)合模式。
[0104] 陣列中的分子組成可決定分子與陣列的結(jié)合親合力。在健康狀況的預(yù)防、治療、診 斷或監(jiān)測(cè)中使用的陣列中可存在多種不同的分子。生物分子的非限制性實(shí)例包括氨基酸、 肽、肽模擬物、蛋白質(zhì)、重組蛋白質(zhì)抗體(單克隆或多克隆的)、抗體片段、抗原、表位、碳水 化合物、脂質(zhì)、脂肪酸、酶、天然產(chǎn)物、核酸(包括DNA、RNA、核苷、核苷酸、其結(jié)構(gòu)類似物或組 合)、營(yíng)養(yǎng)物、受體和維生素。在一些實(shí)施方案中,陣列中的分子為模擬表位,即模擬表位的 結(jié)構(gòu)并能夠結(jié)合由表位引發(fā)的抗體的分子。在一些實(shí)施方案中,陣列中的分子為互補(bǔ)位或 互補(bǔ)位模擬物,包含與抗原表位結(jié)合的抗體(或T細(xì)胞受體)的可變區(qū)中的位點(diǎn)。在一些 實(shí)施方案中,本發(fā)明的陣列是包含隨機(jī)肽序列的肽陣列。
[0105] 肽陣列中的氨基酸內(nèi)距離為肽微陣列中的每個(gè)肽之間的距離。氨基酸內(nèi)距離可有 助于脫靶結(jié)合和/或分子與陣列的結(jié)合親合力。氨基酸內(nèi)差異可以是約0. 5nm、約lnm、約 lnm、l. lnm、約 L 2nm、約 L 3nm、約 L 4nm、約 L 5nm、約 L 6nm、約 L 7nm、約 L 8nm、約 L 9nm、 約 2nm、約 2. lnm、約 2. 2nm、約 2. 3nm、約 2. 4nm、約 2. 5nm、約 2. 6nm、約 2. 7nm、約 2. 8nm、 約 2. 9nm、約 3nm、約 3. lnm、約 3. 2nm、約 3. 3nm、約 3. 4nm、約 3. 5nm、約 3. 6nm、約 3. 7nm、 約 3. 8nm、約 3. 9nm、約 4nm、約 4. lnm、約 4. 2nm、約 4. 3nm、約 4. 4nm、約 4. 5nm、約 4. 6nm、 約 4. 7nm、約 4. 8nm、約 4. 9nm、約 5nm、約 5. lnm、約 5. 2nm、約 5. 3nm、約 5. 4nm、約 5. 5nm、約 5. 6nm、約5. 7nm、約5. 8nm、約5. 9nm和/或約6nm。在一些實(shí)施方案中,氨基酸內(nèi)距離小于 6納米(nm)。
[0106] 氨基酸內(nèi)差異可以是至少0? 5nm、至少lnm、至少lnm、至少1. lnm、至少1. 2nm、至少 1. 3nm、至少 1. 4nm、至少 1. 5nm、至少 1. 6nm、至少 1. 7nm、至少 1. 8nm、至少 1. 9nm、至少 2nm、 至少2. lnm、至少2. 2nm、至少2. 3nm、至少2. 4nm、至少2. 5nm、至少2. 6nm、至少2. 7nm、至少 2. 8nm、至少 2. 9nm、至少 3nm、至少 3. lnm、至少 3. 2nm、至少 3. 3nm、至少 3. 4nm、至少 3. 5nm、 至少3. 6nm、至少3. 7nm、至少3. 8nm、至少3. 9nm、至少4nm、至少4. lnm、至少4. 2nm、至少 4. 3nm、至少 4. 4nm、至少 4. 5nm、至少 4. 6nm、至少 4. 7nm、至少 4. 8nm、至少 4. 9nm、至少 5nm、 至少5. lnm、至少5. 2nm、至少5. 3nm、至少5. 4nm、至少5. 5nm、至少5. 6nm、至少5. 7nm、至少 5. 8nm 或至少 5. 9nm。
[0107] 氨基酸內(nèi)差異可以是不大于0? 5nm、不大于lnm、不大于lnm、不大于1. lnm、不 大于1. 2nm、不大于1. 3nm、不大于1. 4nm、不大于1. 5nm、不大于1. 6nm、不大于1. 7nm、不 大于1. 8nm、不大于1. 9nm、不大于2nm、不大于2. lnm、不大于2. 2nm、不大于2. 3nm、不大 于2. 4nm、不超過2. 5nm、不大于2. 6nm、不大于2. 7nm、不大于2. 8nm、不大于2. 9nm、不大 于3nm、不大于3. lnm、不大于3. 2nm、不大于3. 3nm、不大于3. 4nm、不大于3. 5nm、不大 于3. 6nm、不大于3. 7nm、不大于3. 8nm、不大于3. 9nm、不大于4nm、不大于4. lnm、不大 于4. 2nm、不大于4. 3nm、不大于4. 4nm、不大于4. 5nm、不大于4. 6nm、不大于4. 7nm、不大 于4. 8nm、不大于4. 9nm、不大于5nm、不大于5. lnm、不大于5. 2nm、不大于5. 3nm、不大于 5. 4nm、不大于5. 5nm、不大于5. 6nm、不大于5. 7nm、不大于5. 8nm、不大于5. 9nm和/或不大 于6nm。在一些實(shí)施方案中,氨基酸內(nèi)距離不大于6納米(nm)。
[0108] 氨基酸內(nèi)差異的范圍可以是0. 5nm至lnm、0. 5nm至2nm、0. 5nm至3nm、0. 5nm至 3nm、0. 5nm 至 4nm、0. 5nm 至 5nm、0. 5nm 至 6nm、lnm 至 2nm、lnm 至 3nm、lnm 至 4nm、lnm 至 5nm、lnm 至 6nm、2nm 至 3nm、2nm 至 4nm、2nm 至 5nm、2nm 至 6nm、3nm 至 4nm、3nm 至 5nm、3nm 至 6nm、4nm 至 5nm、4nm 至 6nm 和 / 或 5nm 至 6nm〇
[0109] 肽陣列可以在表面上包含多種不同的肽模式。肽陣列可包含,例如,不同的多個(gè)肽 和/或分子的單份、一式兩份、一式三份、一式四份、一式五份、一式六份、一式七份、一式八 份、一式九份和/或一式十份重復(fù)。在一些實(shí)施方案中,將多個(gè)不同的肽重復(fù)地點(diǎn)印在肽陣 列表面上。肽陣列可以,例如,包含均勻地分布在陣列上的多個(gè)肽。肽陣列可以,例如,包含 非均勻地分布在陣列上的多個(gè)肽。
[0110] 可將肽"點(diǎn)印"于肽陣列中。肽斑點(diǎn)(P印tide spot)可具有各種幾何形狀,例如, 肽斑點(diǎn)可以是圓形、正方形、矩形和/或三角形。肽斑點(diǎn)可具有多種直徑。肽斑點(diǎn)直徑的 非限制性實(shí)例為約3 y m至約8 y m、約3至約10mm、約5至約10mm、約10 y m至約20 y m、約 30 y m、約 40 y m、約 50 y m、約 60 y m、約 70 y m、約 80 y m、約 90 y m、約 100 y m、約 110 y m、 約 120 y m、約 130 y m、約 140 y m、約 150 y m、約 160 y m、約 170 y m、約 180 y m、約 190 y m、約 200 ym、約 210 ym、約 220 ym、約 230 ym、約 240 ym 和 / 或約 250 ym。
[0111] 肽陣列可包含許多不同的肽。在一些實(shí)施方案中,肽陣列包含約10個(gè)肽;約50個(gè) 肽;約100個(gè)肽;約200個(gè)肽;約300個(gè)肽;約400個(gè)肽;約500個(gè)肽;約750個(gè)肽;約1000 個(gè)肽;約1250個(gè)肽;約1500個(gè)肽;約1750個(gè)肽;約2, 000個(gè)肽;約2, 250個(gè)肽;約2, 500個(gè) 肽;約2, 750個(gè)肽;約3, 000個(gè)肽;約3, 250個(gè)肽;約3, 500個(gè)肽;約3, 750個(gè)肽;約4, 000 個(gè)肽;約4, 250個(gè)肽;約4, 500個(gè)肽;約4, 750個(gè)肽;約5, 000個(gè)肽;約5, 250個(gè)肽;約5, 500 個(gè)肽;約5, 750個(gè)肽;約6, 000個(gè)肽;約6, 250個(gè)肽;約6, 500個(gè)肽;約7, 500個(gè)肽;約7, 725 個(gè)肽;8, 000個(gè)肽;約8, 250個(gè)肽;約8, 500個(gè)肽;約8, 750個(gè)肽;約9, 000個(gè)肽;約9, 250 個(gè)肽;約10, 〇〇〇個(gè)肽;約10, 250個(gè)肽;約10, 500個(gè)肽;約10, 750個(gè)肽;約11,000個(gè)肽;約 11,250個(gè)肽;約11,500個(gè)肽;約11,750個(gè)肽;約12, 000個(gè)肽;約12, 250個(gè)肽;約12, 500 個(gè)肽;約12, 750個(gè)肽;約13, 000個(gè)肽;約13, 250個(gè)肽;約13, 500個(gè)肽;約13, 750個(gè)肽;約 14, 000個(gè)肽;約14, 250個(gè)肽;約14, 500個(gè)肽;約14, 750個(gè)肽;約15, 000個(gè)肽;約15, 250 個(gè)肽;約15, 500個(gè)肽;約15, 750個(gè)肽;約16, 000個(gè)肽;約16, 250個(gè)肽;約16, 500個(gè)肽;約 16, 750個(gè)肽;約17, 000個(gè)肽;約17, 250個(gè)肽;約17, 500個(gè)肽;約17, 750個(gè)肽;約18, 000 個(gè)肽;約18, 250個(gè)肽;約18, 500個(gè)肽;約18, 750個(gè)肽;約19, 000個(gè)肽;約19, 250個(gè)肽;約 19, 500個(gè)肽;約19, 750個(gè)肽;約20, 000個(gè)肽;約20, 250個(gè)肽;約20, 500個(gè)肽;約20, 750 個(gè)肽;約21,000個(gè)肽;約21,250個(gè)肽;約21,500個(gè)肽;約21,750個(gè)肽;約22, 000個(gè)肽;約 22, 250個(gè)肽;約22, 500個(gè)肽;約22, 750個(gè)肽;約23, 000個(gè)肽;約23, 250個(gè)肽;約23, 500 個(gè)肽;約23, 750個(gè)肽;約24, 000個(gè)肽;約24, 250個(gè)肽;約24, 500個(gè)肽;約24, 750個(gè)肽;約 25, 000個(gè)肽;約25, 250個(gè)肽;約25, 500個(gè)肽;約25, 750個(gè)肽;和/或約30, 000個(gè)肽。
[0112] 在一些實(shí)施方案中,在健康監(jiān)測(cè)方法、治療方法、診斷方法和預(yù)防狀況的方法中使 用的肽陣列包含多于30, 000個(gè)肽。在一些實(shí)施方案中,在健康監(jiān)測(cè)方法中使用的肽陣列 包含約330, 000個(gè)肽。在一些實(shí)施方案中,該陣列包含約30, 000個(gè)肽;約35, 000個(gè)肽;約 40, 000個(gè)肽;約45, 000個(gè)肽;約50, 000個(gè)肽;約55, 000個(gè)肽;約60, 000個(gè)肽;約65, 000 個(gè)肽;約70, 000個(gè)肽;約75, 000個(gè)肽;約80, 000個(gè)肽;約85, 000個(gè)肽;約90, 000個(gè)肽; 約95, 000個(gè)肽;約100, 000個(gè)肽;約105, 000個(gè)肽;約110, 000個(gè)肽;約115, 000個(gè)肽; 約120, 000個(gè)肽;約125, 000個(gè)肽;約130, 000個(gè)肽;約135, 000個(gè)肽;約140, 000個(gè)肽; 約145, 000個(gè)肽;約150, 000個(gè)肽;約155, 000個(gè)肽;約160, 000個(gè)肽;約165, 000個(gè)肽; 約170, 000個(gè)肽;約175, 000個(gè)肽;約180, 000個(gè)肽;約185, 000個(gè)肽;約190, 000個(gè)肽; 約195, 000個(gè)肽;約200, 000個(gè)肽;約210, 000個(gè)肽;約215, 000個(gè)肽;約220, 000個(gè)肽; 約225, 000個(gè)肽;約230, 000個(gè)肽;約240, 000個(gè)肽;約245, 000個(gè)肽;約250, 000個(gè)肽; 約255, 000個(gè)肽;約260, 000個(gè)肽;約265, 000個(gè)肽;約270, 000個(gè)肽;約275, 000個(gè)肽; 約280, 000個(gè)肽;約285, 000個(gè)肽;約290, 000個(gè)肽;約295, 000個(gè)肽;約300, 000個(gè)肽; 約305, 000個(gè)肽;約310, 000個(gè)肽;約315, 000個(gè)肽;約320, 000個(gè)肽;約325, 000個(gè)肽;約 330, 000個(gè)肽;約335, 000個(gè)肽;約340, 000個(gè)肽;約345, 000個(gè)肽;和/或約350, 000個(gè) 肽。在一些實(shí)施方案中,在健康監(jiān)測(cè)方法中使用的肽陣列包含多于330, 000個(gè)肽。
[0113] 肽陣列可包含許多不同的肽。在一些實(shí)施方案中,肽陣列包含至少2, 000個(gè)肽;至 少3, 000個(gè)肽;至少4, 000個(gè)肽;至少5, 000個(gè)肽;至少6, 000個(gè)肽;至少7, 000個(gè)肽;至少 8, 000個(gè)肽;至少9, 000個(gè)肽;至少10, 000個(gè)肽;至少11,000個(gè)肽;至少12, 000個(gè)肽;至少 13, 000個(gè)肽;至少14, 000個(gè)肽;至少15, 000個(gè)肽;至少16, 000個(gè)肽;至少17, 000個(gè)肽;至 少18, 000個(gè)肽;至少19, 000個(gè)肽;至少20, 000個(gè)肽;至少21,000個(gè)肽;至少22, 000個(gè)肽; 至少23, 000個(gè)肽;至少24, 000個(gè)肽;至少25, 000個(gè)肽;至少30, 000個(gè)肽;至少40, 000個(gè) 肽;至少50, 000個(gè)肽;至少60, 000個(gè)肽;至少70, 000個(gè)肽;至少80, 000個(gè)肽;至少90, 000 個(gè)肽;至少100, 〇〇〇個(gè)肽;至少110, 〇〇〇個(gè)肽;至少120, 000個(gè)肽;至少130, 000個(gè)肽;至少 140, 000個(gè)肽;至少150, 000個(gè)肽;至少160, 000個(gè)