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      一種通過同源重組敲除manX的高產(chǎn)氨基葡萄糖工程菌及其構(gòu)建方法

      文檔序號(hào):526013閱讀:478來源:國知局
      專利名稱:一種通過同源重組敲除manX的高產(chǎn)氨基葡萄糖工程菌及其構(gòu)建方法
      技術(shù)領(lǐng)域
      本發(fā)明涉及一種產(chǎn)氨基葡萄糖基因工程菌及其構(gòu)建方法,屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域。
      背景技術(shù)
      氨基葡萄糖(Glucosamine, 2-amino-2-deoxy-D-glucose)是葡萄糖的一個(gè)輕基被氨基取代后的化合物。幾乎存在與所有有機(jī)體中,包括細(xì)菌、酵母、絲狀真菌、植物以及動(dòng)物體,是糖蛋白和蛋白聚糖的主要組成成分。氨基葡萄糖能特異性地作用于關(guān)節(jié)軟骨,恢復(fù)軟骨細(xì)胞正常的代謝功能,能刺激軟骨細(xì)胞產(chǎn)生具有正常多聚體結(jié)構(gòu)的蛋白多糖,抑制損傷軟骨的酶,延緩骨性關(guān)節(jié)炎的病理過程和疾病的進(jìn)展,改善關(guān)節(jié)活動(dòng),緩解疼痛。因此,臨床上多用于治療骨關(guān)節(jié)炎。此外,氨基葡萄糖還具有肝腎解毒,發(fā)揮抗炎、護(hù)肝的作用;刺激嬰兒腸道中雙歧桿菌的增生;在醫(yī)藥上作為抗菌消炎藥物,用于治療風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎和胃潰瘍疾病。在食品中,是嬰兒配方乳中添加的一種重要微量糖類成分,還是合成VB6和核黃素中間體的起始原料,此外也可用于化妝品和飼料添加劑中。甲殼素水解法是我國目前生產(chǎn)氨基葡萄糖的主要方法,甲殼素水解法轉(zhuǎn)化效率低,產(chǎn)生大量酸性廢水,因而產(chǎn)品成本高、污染嚴(yán)重。目前,國內(nèi)外對(duì)生物法生產(chǎn)氨基葡萄糖的報(bào)道較少,發(fā)酵產(chǎn)量也較低,尚未達(dá)到工業(yè)化生產(chǎn)的要求。在發(fā)酵過程中當(dāng)碳源葡萄糖濃度較低時(shí),氨基葡萄糖和N-乙酰氨基葡萄糖可以被細(xì)胞當(dāng)作碳源利用。氨基葡萄糖依靠甘露糖磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)(marmose PTS,IIMan,由manXYZ 操縱子編碼)和葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)(glucose PTS, IIg1c,由pstG基因編碼)對(duì)其進(jìn)行磷酸化后從胞外向胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn),而N-乙酰氨基葡萄糖在從胞外向胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)時(shí),依靠IIMan和乙酰氨基葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)(GlcNAc PTS, IInag,由基因nagE編碼)對(duì)其進(jìn)行磷酸化后進(jìn)行轉(zhuǎn)運(yùn)。因此,要想在胞外積累高濃度的氨基葡萄糖或N-乙酰氨基葡萄糖,就必須對(duì)其轉(zhuǎn)運(yùn)途徑進(jìn)行阻斷,減弱氨基葡萄糖或N-乙酰氨基葡萄糖從胞外到胞內(nèi)的轉(zhuǎn)運(yùn)。

      發(fā)明內(nèi)容
      本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種高產(chǎn)氨基葡萄糖基因工程菌,所述重組菌為是克隆E. coli BL21(DE3)基因組中氨基葡萄糖合成酶glmS基因和釀酒酵母 S. cerevisiae S288C基因組中氨基葡萄糖乙?;竒nal基因,同時(shí)敲除乙酰氨基葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)nagE基因和甘露糖磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)manX基因構(gòu)建而成的重組大腸桿菌。所述氨基葡萄糖合成酶的基因來源于GenBank No. CP001509. 3基因組中g(shù)lmS 片斷,氨基葡萄糖乙?;竒nal基因來源于GenBank NC_001138,大腸桿菌為E. coli K-12(ATCC25947)。將氨基葡萄糖合成酶編碼基因glmS和氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因gnal連接到載體 pET-28a(+)上。
      本發(fā)明還提供了一種構(gòu)建高產(chǎn)氨基葡萄糖基因工程菌的方法,用限制性內(nèi)切酶 Sac I和Hind III對(duì)glmS基因片斷和pET48a(+)進(jìn)行酶切,并通過連接反應(yīng)將glmS基因片斷插入質(zhì)粒pET48a(+)的Me I和Hind III位點(diǎn)之間;用限制性內(nèi)切酶Not I和 Xho I對(duì)gnal基因片斷和pET18a(+)進(jìn)行酶切,并通過連接反應(yīng)將gnal基因片斷插入質(zhì)粒pET48a(+)的Not I和Xho I位點(diǎn)之間得到重組質(zhì)粒pET18a(+)-glmS_gnal。敲除 E.coli ATCC 25947基因組中nagE和manX基因片段,得到nagE和manX基因失活的菌株 E. coli-AnagE-AmanX,再將攜帶有 glmS 和 gnal 基因片段的質(zhì)粒 pET18a (+)-glmS-gnal 轉(zhuǎn)化大腸桿菌 Ε· coli-AnagE-AmanX 中得至Ij重組菌 E. coli-glmS-gnal-Δ nagE-Δ manX。所述重組菌培養(yǎng)環(huán)境條件培養(yǎng)時(shí)間為12h,溫度37°C,搖床轉(zhuǎn)速200rpm,待OD6tltl達(dá)到0. 6時(shí),按照10%濃度加入乳糖(使發(fā)酵液中終濃度為5g/L)誘導(dǎo)glmS和gnal基因的表達(dá)。 所述重組菌培養(yǎng)基組成為種子培養(yǎng)基蛋白胨12g,酵母膏Mg,甘油細(xì)1,按照50μ g/ml加入卡那霉素,pH 自然。;發(fā)酵培養(yǎng)基蛋白胨12g,酵母膏Mg,葡萄糖10g,按照50 μ g/ml加入卡那霉素, PH自然。本發(fā)明采用基因工程菌發(fā)酵生產(chǎn)氨基葡萄糖,具有發(fā)酵時(shí)間短,生產(chǎn)強(qiáng)度高,生產(chǎn)成本低,對(duì)環(huán)境污染小,無過敏反應(yīng)等優(yōu)點(diǎn)。生產(chǎn)得到的氨基葡萄糖可以廣泛用于醫(yī)藥、食品等領(lǐng)域。
      具體實(shí)施例方式1.重組質(zhì)粒 pET18a(+)-glmS_gnal 的構(gòu)建用于擴(kuò)增glmS基因的引物上游5,-CGA GCT CAT GTG TGG AAT TGT TGG C-3,(下劃線序列表示限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)Me I)下游5’-CCC AAG CTTTTA CTC AAC CGT AAC CGA-3,(下劃線序列表示限制性酶切位點(diǎn)Hind III)。氨基葡萄糖合成酶基因glmS是利用E. coli BL21 (DE3)基因組(GenBank No. CP001509. 3)作為模版進(jìn)行PCR得到的。用限制性內(nèi)切酶Sac I和Hind III對(duì)glmS基因片斷和pET48a(+)進(jìn)行酶切,并通過連接反應(yīng)將glmS基因片斷插入質(zhì)粒pET48a(+)的 Sac I和Hind III位點(diǎn)之間,得到重組質(zhì)粒pET48a(+)-glmS。用于擴(kuò)增gnal基因的引物上游5,-AAGGAGATAAGAATGCGGCCGCATGAGCTTAC-3,(下劃線序列表示限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)Not I)下游5,-CCGCTCGAGCTATTTTCTAATTTGCATTTCCACG-3'(下劃線序列表示限制性酶切位點(diǎn)》ιο I)。氨基葡萄糖乙酰化酶基因gnal是利用釀酒酵母S. cerevisiae基因組(GenBankNCJK) 1138)作為模版進(jìn)行PCR得到的。用限制性內(nèi)切酶Not I和Xho I對(duì) gnal基因片斷和pET18a(+)-glmS進(jìn)行酶切,并通過連接反應(yīng)將gnal基因片斷插入質(zhì)粒pET-28a (+) -glmS 的 Not I 和 Xho I 位點(diǎn)之間,得到重組質(zhì)粒 pET_28a (+) -glmS-gnal。2.nagE基因的敲除根據(jù)Ε. coli JW0665_1(該菌購自麻省理工學(xué)院,其nagE基因已經(jīng)被kan插入失活)基因組序列設(shè)計(jì)上游引物5,-TACGAGAAGCCAGAGAAGACGC-3,下游引物5,-GGTGTTCAGCAAATTTAATACGG-3,該菌株信息詳見:http //cgsc. biology, yale. edu/Mutation. php ? ID = 101996擴(kuò)增該菌nagE基因座及上下游約SOObp片段,將該片段轉(zhuǎn)化含有質(zhì)粒pKD46的 E. coliK-12,利用Red同源重組技術(shù)敲除E. coli K-12基因組nagE基因片段,再轉(zhuǎn)化質(zhì)粒 PCP20,去除kan片段后得到nagE基因失活菌株E. coli-AnagE。3.manX基因的敲除根據(jù)E. coli JW1806_1(該菌購自麻省理工學(xué)院,其manX基因已經(jīng)被kan插入失活)基因組序列設(shè)計(jì)上游引物5,-CGAGAACAACAAGCGTGAGTAGC-3,下游引物5,-CAGAGAAGAAACGTGGATCCAGGAA-3,該菌株信息詳見:http //cgsc. biology, yale. edu/Mutation. php ? ID = 101756擴(kuò)增該菌manX基因座及上下游約500bp片段,將該片段轉(zhuǎn)化含有質(zhì)粒pKD46的 E. coli-Δ nagE,利用Red同源重組技術(shù)敲除E. coli-glms-gnal- Δ nagE基因組manX基因片段,再轉(zhuǎn)化質(zhì)粒PCP20,去除kan片段后得到manX基因失活的菌株E. coli - Δ nagE- Δ manX04.重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化將重組質(zhì)粒pET18a(+)-glmS-gnal 轉(zhuǎn)化 Ε. coli-Δ nagE-Δ manX,得到重組大腸桿菌 E. coli-glmS-gnal- Δ nagE- Δ manX。5.發(fā)酵用LB斜面培養(yǎng)基培養(yǎng)大腸桿菌E. coli-glmS-gnal-Δ nagE,培養(yǎng)1 后用接種環(huán)取1環(huán)接入裝有20mL種子培養(yǎng)基的250mL的三角瓶中進(jìn)行種子培養(yǎng)。種子培養(yǎng)基為種子培養(yǎng)基蛋白胨12g,酵母膏Mg,甘油細(xì)1,按照50yg/ml加入卡那霉素,pH自然。培養(yǎng)時(shí)間為12h,溫度37°C,搖床轉(zhuǎn)速200rpm。再以5%的接種量接入裝有100ml發(fā)酵培養(yǎng)基的500ml的三角瓶中進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng)。 發(fā)酵培養(yǎng)基蛋白胨12g,酵母膏Mg,葡萄糖10g,同時(shí)按照50μ g/ml加入卡那霉素,pH自然。培養(yǎng)時(shí)間為12h,溫度37°C,搖床轉(zhuǎn)速200rpm,待OD600達(dá)到0. 6時(shí),按照10%濃度加入乳糖誘導(dǎo)glmS和gnal基因的表達(dá)。發(fā)酵結(jié)束后發(fā)酵液中氨基葡萄糖濃度可以達(dá)到70g/L。6.氨基葡萄糖和乙酰氨基葡萄糖的檢測(cè)方法;氨基葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制準(zhǔn)確稱取氨基葡萄糖0.010(^,加入20.01111蒸餾水, 配制成0. 5000g/l的氨基葡萄糖溶液,然后分別稀釋成濃度為0. 2500g/l,0. 1250g/l, 0. 0625g/l,0. 0313g/l的溶液。分別取相應(yīng)濃度氨基葡萄糖溶液0. 5mL于玻璃塞試管中,加入乙酰丙酮試劑1.0ml,90°C水浴處理lh,冷卻至室溫,慢慢加入96% (ν/ν)乙醇 10. OmL (勿攪動(dòng)),然后加入DMAB試劑1. OmL,混合均勻。因反應(yīng)體系由堿性變?yōu)樗嵝裕枳⒁庥写罅慷趸細(xì)怏w產(chǎn)生?;旌虾笫覝胤胖肐h穩(wěn)定,530nm比色,以試樣濃度為橫坐標(biāo), OD值為縱坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。氨基葡萄糖的檢測(cè)取發(fā)酵液5. Oml加入5mL離心管中,8000rpm離心8min,取0. 5mL于玻璃塞試管中,加入乙酰丙酮試劑1. 0ml,90°C水浴處理lh,冷卻至室溫,慢慢加入 96% (ν/ν)乙醇10. OmL (勿攪動(dòng)),然后加入對(duì)二甲胺基苯甲醛(DMAB)試劑1. OmL,混合均勻,混合后室溫放置Ih穩(wěn)定,530nm比色,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算GlcN產(chǎn)量。乙酰氨基葡萄糖的檢測(cè)用HPLC檢測(cè),安捷倫1200,RID檢測(cè)器,C18柱,內(nèi)徑 4. 6mm,柱長250mm,流速0. 7ml/min,柱溫30°C,流動(dòng)相70%乙腈。雖然本發(fā)明已以較佳實(shí)施例公開如上,但其并非用以限定本發(fā)明,任何熟悉此技術(shù)的人,在不脫離本發(fā)明的精神和范圍內(nèi),都可做各種的改動(dòng)與修飾,因此本發(fā)明的保護(hù)范圍應(yīng)該以權(quán)利要求書所界定的為準(zhǔn)。
      權(quán)利要求
      1.一種氨基葡萄糖基因工程菌,是克隆E. coli BL21(DE!3)基因組中氨基葡萄糖合成酶glmS基因和釀酒酵母S. cerevisiae S288C基因組中氨基葡萄糖乙?;竒nal基因,同時(shí)敲除乙酰氨基葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)nagE基因和甘露糖磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)manX基因構(gòu)建而成的重組大腸桿菌。
      2.根據(jù)權(quán)利要求1所述基因工程菌,其特征在于,所述氨基葡萄糖合成酶的基因來源于GenBankNo. CP001509. 3基因組中g(shù)lmS片斷,氨基葡萄糖乙?;竒nal基因來源于 GenBank NC_001138。
      3.根據(jù)權(quán)利要求1所述基因工程菌,其特征在于,將氨基葡萄糖合成酶編碼基因glmS 和氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因gnal連接到載體pET48a(+)上。
      4.根據(jù)權(quán)利要求1所述基因工程菌,其特征在于,大腸桿菌為E.coli ATCC 25947。
      5.一種權(quán)利要求1所述基因工程菌的構(gòu)建方法,具體步驟如下1)用限制性內(nèi)切酶SacI和Hind III對(duì)glmS基因片斷和pET-28a(+)進(jìn)行酶切,并通過連接反應(yīng)將glmS基因片斷插入質(zhì)粒pET48a(+)的Mc I和Hind III位點(diǎn)之間;2)用限制性內(nèi)切酶NotI和XhoI對(duì)gnal基因片斷和pET-28a(+)進(jìn)行酶切,并通過連接反應(yīng)將gnal基因片斷插入質(zhì)粒pET48a(+)的Not I和Bio I位點(diǎn)之間得到重組質(zhì)粒 pET-28a (+)-glmS-gnal ;3)敲除重組菌Ε.coli ATCC 25947基因組中nagE和manX基因片段,得到nagE和manX 基因失活的菌株E. coli-AnagE-AmanX ;4)將質(zhì)粒pET-28a (+) -glmS-gnal 轉(zhuǎn)化 E. coli-Δ nagE- Δ manX,得到基因工程菌 E. coli-glms-gnal— ΔnagE-ΔmanX。
      全文摘要
      本發(fā)明公開了一種產(chǎn)氨基葡萄糖基因工程菌及其應(yīng)用,是將氨基葡萄糖合成酶的基因(glmS)和氨基葡萄糖乙?;富?gna1)導(dǎo)入大腸桿菌E.coli K-12,并敲除乙酰氨基葡萄糖磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)nagE和甘露糖磷酸轉(zhuǎn)移系統(tǒng)manX基因得到基因工程菌E.coli-glmS-gna1-ΔnagE-ΔmanX,該菌株用于發(fā)酵生產(chǎn)氨基葡萄糖,具有發(fā)酵時(shí)間短,生產(chǎn)強(qiáng)度高,生產(chǎn)成本低,對(duì)環(huán)境污染小,無過敏反應(yīng)等優(yōu)點(diǎn),生產(chǎn)得到的氨基葡萄糖可以廣泛用于醫(yī)藥、食品等領(lǐng)域。
      文檔編號(hào)C12N15/52GK102286420SQ20111017424
      公開日2011年12月21日 申請(qǐng)日期2011年6月27日 優(yōu)先權(quán)日2011年6月27日
      發(fā)明者何菊, 劉龍, 堵國成, 李江華, 陳堅(jiān), 陳欣 申請(qǐng)人:江南大學(xué)
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