基于錳過氧化物酶的工程菌及其實現(xiàn)方法
【專利摘要】一種基因工程領(lǐng)域的基于錳過氧化物酶的工程菌及其實現(xiàn)方法,以灰略紅鏈霉菌基因組DNA為模板,與含有酶切位點和聚組氨酸標(biāo)簽的引物進行PCR擴增得到編碼錳過氧化物酶的核苷酸序列;然后將擴增得到的基因序列連接到表達載體,再將獲得的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌表達菌株內(nèi),獲得錳過氧化物酶過表達重組菌株。本發(fā)明針對現(xiàn)有技術(shù)存在的由于錳過氧化物酶在生物體內(nèi)多為胞內(nèi)酶且表達量較低導(dǎo)致的應(yīng)用范圍和效果嚴(yán)重受限等不足,應(yīng)用基因工程手段實現(xiàn)其體外的大量表達合成,此外本發(fā)明通過在表達重組蛋白C端添加聚組氨酸標(biāo)簽的方法,提高蛋白活性的同時也保證了純化后錳過氧化物酶的純度;此外,本發(fā)明通過載體信號肽實現(xiàn)了目的蛋白的周質(zhì)空間表達,提高了錳過氧化物酶的活性。
CGMCC NO.5706
2012.01.09
【專利說明】基于錳過氧化物酶的工程菌及其實現(xiàn)方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及的是一種生物基因工程【技術(shù)領(lǐng)域】的基因及其工程菌株,具體是一種灰 略紅鏈霉菌的基于錳過氧化物酶的工程菌及其實現(xiàn)方法。
【背景技術(shù)】
[0002] 木質(zhì)纖維素是植物界中最為豐富的天然高分子化合物,是植物通過光合作用產(chǎn)生 的主要干物質(zhì),主要包括纖維素、半纖維素和木質(zhì)素。木質(zhì)纖維素的生物降解和解聚作用 是一個高度復(fù)雜的過程,它涉及眾多酶系的參與。木質(zhì)纖維素中的木質(zhì)素是由四種醇單體 (對香豆醇、松柏醇、5-羥基松柏醇、芥子醇)形成的一種復(fù)雜酚類聚合物。木質(zhì)素是構(gòu)成 植物細胞壁的成分之一,具有聯(lián)結(jié)強化細胞的作用。此外,木質(zhì)素也是一種含許多負電集團 的多環(huán)高分子有機物,對土壤中的高價金屬離子有較強的親和力。
[0003] 根據(jù)單體的不同,可將木質(zhì)素分為3種類型:由紫丁香基丙烷結(jié)構(gòu)單體聚合而成 的紫丁香基木質(zhì)素 (S -木質(zhì)素),由愈創(chuàng)木基丙烷結(jié)構(gòu)單體聚合而成的愈創(chuàng)木基木質(zhì)素 (G -木質(zhì)素)和由對-羥基苯基丙烷結(jié)構(gòu)單體聚合而成的對-羥基苯基木質(zhì)素 (H -木質(zhì) 素)。一般而言,木質(zhì)素在裸子植物主要存在類型為愈創(chuàng)木基木質(zhì)素(G),雙子葉植物主要 含愈創(chuàng)木基-紫丁香基木質(zhì)素 (G - S),單子葉植物則為愈創(chuàng)木基-紫丁香基-對-羥基苯 基木質(zhì)素 (G - S - H)。從植物學(xué)觀點出發(fā),木質(zhì)素就是包圍于管胞、導(dǎo)管及木纖維等纖維束 細胞及厚壁細胞外的物質(zhì);從化學(xué)觀點來看,木質(zhì)素是由高度取代的苯基丙烷單元隨機聚 合而成的高分子,它與纖維素、半纖維素一起,形成植物骨架的主要成分,在數(shù)量上僅次于 纖維素。木質(zhì)素填充于纖維素構(gòu)架中增強植物體的機械強度,利于輸導(dǎo)組織的水分運輸和 抵抗不良外界環(huán)境的侵襲。
[0004] 木質(zhì)素單體同時含有多種活性官能團,如羥基、羰基、羧基、甲基及其它側(cè)鏈結(jié)構(gòu)。 其中羥基在木質(zhì)素中存在較多,以醇羥基和酚羥基兩種形式存在,而酚羥基的多少又直接 直接影響木質(zhì)素的物理和化學(xué)結(jié)構(gòu),如能反映出木質(zhì)素的醚化和縮合程度,同時也能衡量 木質(zhì)素的溶解性能和反應(yīng)能力;在木質(zhì)素的側(cè)鏈上,有對羥基安息香酸、香草酸、紫丁香酸、 對羥基肉桂酸、阿魏酸等酯型結(jié)構(gòu)存在,這些酯型結(jié)構(gòu)存在于側(cè)鏈的α位或 Y位。在側(cè)鏈 α位除了酯型結(jié)構(gòu)外,還有醚型連接或作為聯(lián)苯結(jié)構(gòu)的碳-碳聯(lián)結(jié)。同酚羥基一樣,木質(zhì)素 的側(cè)鏈結(jié)構(gòu)也直接關(guān)系它的化學(xué)特性。
[0005] 由于木質(zhì)素的復(fù)雜結(jié)構(gòu)、高分子量及高度疏水性,與纖維素與半纖維素相比,木 質(zhì)素的降解相對緩慢。已發(fā)現(xiàn)木質(zhì)素降解酶主要有3類:漆酶(Laccase)、錳過氧化物酶 (Manganese peroxidase)和木質(zhì)素過氧化物酶(Lignin peroxidase)。
[0006] 灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens)作為一種廣泛存在于土壤的細菌, 具有很強的木質(zhì)素降解能力并得到了研究者越來越多的關(guān)注。明確灰略紅鏈霉菌降解木質(zhì) 素的分子機制,克隆并表達關(guān)鍵木質(zhì)素降解酶,對于開發(fā)新型木質(zhì)素降解酶制劑進而實現(xiàn) 木質(zhì)素乃至木質(zhì)纖維素的快速降解具有重要意義。
[0007] 經(jīng)過對現(xiàn)有技術(shù)的檢索發(fā)現(xiàn),中國專利文獻號CN102703344A公開(公告)日 2012. 10. 03,公開了一株秸桿降解放線菌及其應(yīng)用,但該技術(shù)產(chǎn)生的錳過氧化物酶為胞內(nèi) 酶,產(chǎn)量較低因此應(yīng)用范圍受限。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0008] 本發(fā)明針對現(xiàn)有技術(shù)存在的由于錳過氧化物酶在生物體內(nèi)多為胞內(nèi)酶且表達量 較低導(dǎo)致的應(yīng)用范圍和效果嚴(yán)重受限等不足,提出一種基于錳過氧化物酶的工程菌及其實 現(xiàn)方法,能夠應(yīng)用基因工程手段實現(xiàn)其體外的大量表達合成,此外本發(fā)明通過在重組蛋白 添加聚組氨酸標(biāo)簽的方法,方便了后期蛋白的純化,可為錳過氧化物酶的規(guī)?;l(fā)酵生產(chǎn) 提供一種新的途徑。
[0009] 本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案實現(xiàn)的:
[0010] 本發(fā)明涉及一種錳過氧化物酶的工程菌,該工程菌為外源表達錳過氧化物酶的大 腸桿菌。
[0011] 所述的胞內(nèi)猛過氧化物酶具體為灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens) JSD - 1錳過氧化物酶基因 SG - MNP,其核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示,氨基酸序列如SEQ ID No. 2所示,編碼該錳過氧化物酶核苷酸序列為2226bp,共編碼741個氨基酸。
[0012] 所述的 SEQ ID NO. 1 克隆自灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens) JSD-1, 現(xiàn)保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(CGMCC),保藏編號為CGMCC No. 5706,保藏日期為2012年1月9日,保藏地址:北京市朝陽區(qū)北辰西路1號院3號中國 科學(xué)院微生物研究所郵編100101。
[0013] 所述的錳過氧化物酶編碼基因通過全基因組測序和PCR擴增的方式克隆獲得。
[0014] 本發(fā)明涉及上述工程菌的實現(xiàn)方法,以灰略紅鏈霉菌基因組DNA為模板,與含有 酶切位點和聚組氨酸(HIS 6 · Tag)標(biāo)簽的引物進行PCR擴增得到編碼錳過氧化物酶的核苷 酸序列;然后將擴增得到的基因序列連接到表達載體PET - 22b (+),再將獲得的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn) 入大腸桿菌表達菌株內(nèi),獲得錳過氧化物酶過表達重組菌株。
[0015] 所述的含有酶切位點和聚組氨酸(HIS6 · Tag)標(biāo)簽的引物,即含有Msc I和EcoR I酶切位點引物,具體包括:
[0016] MNP - Msc I - F:GATGGCCATGACCGAGAACCATGACGCGAT
[0017] MNP - EcoR I - R:GGAATTCTCAATGATGATGATGATGATGGACGAGGTCGAACCGGTCGA
[0018] 所述的PCR擴增的條件為:98°C預(yù)變性3min ;98°C變性10s,68°C延伸45s ;30個 循環(huán)后68°C終延伸3min。
[0019] 所述的大腸桿菌表達菌株為Transetta(DE3)大腸桿菌。
[0020] 本發(fā)明涉及一種錳過氧化物酶的工程菌的應(yīng)用,將其用于錳過氧化物酶的體外高 效表達,并用于降解木質(zhì)纖維素。 技術(shù)效果
[0021] 現(xiàn)有錳過氧化物酶在灰略紅鏈霉菌內(nèi)為胞內(nèi)酶且表達量很低,因此嚴(yán)重限制了其 使用范圍和效果;與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明提供了一種全新的錳過氧化物酶基因序列;通 過構(gòu)建外源表達載體,實現(xiàn)了錳過氧化物酶的外源高效表達,在重組蛋白C端添加聚組氨 酸標(biāo)簽(HIS 6· Tag)的方法并結(jié)合高濃度咪唑洗脫液,提高了蛋白洗脫的效率及純度、保證 蛋白生物學(xué)活性的同時也方便后續(xù)蛋白的純化;此外,本發(fā)明通過載體信號肽實現(xiàn)了目的 蛋白的周質(zhì)空間表達,保證了錳過氧化物酶在如高溫及堿性的特殊條件下具有更穩(wěn)定的酶 學(xué)特性。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0022] 圖1為灰略紅鏈霉菌錳過氧化物酶(MNP)信號肽預(yù)測圖。
[0023] 圖2為灰略紅鏈霉菌錳過氧化物酶(MNP)在不同碳源誘導(dǎo)下表達量示意圖。
[0024] 圖3為灰略紅鏈霉菌錳過氧化物酶(MNP) 3D空間模型示意圖。
[0025] 圖4為重組錳過氧化物酶(HIS6 · Tag)體外表達SDS - PAGE驗證圖。
[0026] 圖5為重組猛過氧化物酶(HIS6 · Tag)體外表達Western Blot驗證圖。
[0027] 圖6為重組錳過氧化物酶(HIS6 · Tag)在不同pH下酶活性示意圖。
[0028] 圖7為重組錳過氧化物酶(HIS6 · Tag)在不同溫度下酶活性示意圖。
[0029] 圖8為重組錳過氧化物酶(HIS6 · Tag)在不同金屬離子下酶活性示意圖。
[0030] 圖9為重組錳過氧化物酶(HIS6 · Tag)在不同酶活性抑制劑下酶活性示意圖。
【具體實施方式】
[0031] 下面對本發(fā)明的實施例作詳細說明,本實施例在以本發(fā)明技術(shù)方案為前提下進行 實施,給出了詳細的實施方式和具體的操作過程,但本發(fā)明的保護范圍不限于下述的實施 例。 實施例1
[0032] 本實施例包括以下步驟:
[0033] 步驟1)灰略紅鏈霉菌的分離及培養(yǎng)
[0034] 灰略紅鏈霉菌分離自上海市浦江鎮(zhèn)收集的腐爛秸桿,保藏編號為CGMCC No. 5706。 將該菌種接種于LB液體培養(yǎng)基,32 °C培養(yǎng)48h。
[0035] 上述LB液體培養(yǎng)基組分為:蛋白胨10. Og/L,酵母提取物5. Og/L,NaCl 10. Og/L, pH6. 8 - 7. 2。在液體培養(yǎng)基中加入15. 0 - 20. 0g/L瓊脂即得LB固體培養(yǎng)基。
[0036] 步驟2)灰略紅鏈霉菌基因組DNA提取
[0037] 收集2. OmL菌液,12000rpm離心2min。棄上清,收集菌體沉淀,加入180yL溶菌酶 (20mg/mL)和20yL EDTA溶液(0.5M,pH 8.0),37°C處理45min,加入4yL RNase A(100mg/ mL),震蕩混勻15s,室溫放置5min,隨后按照細菌DNA提取試劑盒(TIANGEN)操作說明完成 剩余操作,得到高純度基因組DNA。通過0. 8%瓊脂糖凝膠電泳確定基因組DNA質(zhì)量,確保 無明顯RNA條帶,基因組條帶清洗、完整、無降解、無污染。
[0038] 步驟3)灰略紅鏈霉菌基因組測序
[0039] 確定全基因組鳥槍法(WGS)策略,采用第二代測序技術(shù),構(gòu)建不同插入片段長度 的文庫,采用Illumina Miseq(2X250bp)平臺進行測序。收集測序的原始數(shù)據(jù),對帶接頭、 低質(zhì)量的數(shù)據(jù)進行過濾,隨后采用Newbler version 2. 8對去除接頭的測序數(shù)據(jù)進行從頭 拼接,構(gòu)建contigs及scaffolds,最后使用GapCloser程序進行缺口填補得到鏈霉菌基因 組草圖。
[0040] 步驟4)蛋白編碼基因功能預(yù)測
[0041] 采用Glimmer 3. 0軟件對全基因組序列進行基因預(yù)測?;蝾A(yù)測模型選取自我訓(xùn) 練基因預(yù)測模型,即提取拼裝序列中最長的序列,以該序列作為基因預(yù)測模型訓(xùn)練的序列。 然后以該序列構(gòu)建的基因預(yù)測模型,對所有序列進行基因預(yù)測,設(shè)定開放閱讀框的長度為 llObp,其余參數(shù)為Glimmer 3. 0的默認設(shè)置。
[0042] 步驟5)錳過氧化物酶膜定位預(yù)測
[0043] 采用SignalP 4. 1分別對錳過氧化物酶氨基酸序列進行信號肽模擬預(yù)測,如圖1 所示。結(jié)果表明錳過氧化物酶不存在明顯的信號肽序列,推測該酶為胞內(nèi)酶。
[0044] 步驟6)灰略紅鏈霉菌總RNA的提取
[0045] 將鏈霉菌JSD -1接種于以水稻秸桿(纖維素、木聚糖、果膠、木質(zhì)素或葡萄糖)為 唯一碳源的無機鹽培養(yǎng)基,32°C、150rpm條件下培養(yǎng)72h。離心收集菌體沉淀,并按細菌總 RNA提取試劑盒要求(TIANGEN)提取高純度的鏈霉菌總RNA。
[0046] 上述無機鹽培養(yǎng)基組分為:KN032. Og/L,KH2P041. Og/L,NaCl 0. 5g/L,MgS04 · 7H20 0. 5g/L,CaCl2 · 2H200. lg/L,F(xiàn)eS04 · 7H20 0. 01g/L,水稻秸桿(纖維素、木聚糖、果膠、木質(zhì) 素或葡萄糖)10. 〇g/L。
[0047] 步驟7)灰略紅鏈霉菌錳過氧化物酶表達水平測定
[0048] 根據(jù)錳過氧化物酶基因序列,通過DNAMAN 6. 0軟件設(shè)計特異性PCR引物,引物序 列如下:
[0049] MNP - F :CAAGCAGTGGGTCGCCAAGA
[0050] MNP - R :CCAGGTCGGTGGTGAGCAT
[0051] 同樣的,根據(jù)16S rRNA的特異性序列設(shè)計引物,并作為內(nèi)參基因,引物序列如下:
[0052] 16S rRNA - F :CGTATTCACCGCAGCAATGC
[0053] 16S rRNA - R :GCGAGGTGGAGCGAATCTCA
[0054] 以鏈霉菌總RNA模板進行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA文庫,并按照熒光定量PCR試劑盒 (TaKaRa)要求進行相關(guān)操作。設(shè)置三個重復(fù),待實驗完成收集處理數(shù)據(jù),分析在不同碳源誘 導(dǎo)作用下,錳過氧化物酶的表達量(圖2)。結(jié)果表明,當(dāng)以水稻秸桿(主要成分為木質(zhì)纖維 素)與木質(zhì)素為碳源進行誘導(dǎo)時,該錳過氧化物酶的表達量顯著上調(diào),證明該酶參與木質(zhì) 素的代謝過程。
[0055] 上述的熒光定量PCR的反應(yīng)條件為:95°C預(yù)變性30s ;95°C變性10s,60°C退火 30s,72°C延伸15s,共40個循環(huán)。
[0056] 步驟8)錳過氧化物酶3D空間模型預(yù)測
[0057] 運用PHYRE 2在線程序?qū)﹀i過氧化物酶3D空間模型進行預(yù)測,結(jié)果如圖3所示。 結(jié)果表明該錳過氧化物酶與PDB數(shù)據(jù)庫中已知空間結(jié)構(gòu)的蛋白模型的最高覆蓋度與相似 度分別可達97 %和61 %,預(yù)測結(jié)果具有100 %可信度。通過氣3D空間建構(gòu)可以推測其C端 (紅色)裸露在外面,適合連接融合標(biāo)簽以方便蛋白的后期純化。
[0058] 步驟9)錳過氧化物酶表達載體構(gòu)建
[0059] 根據(jù)錳過氧化物酶基因序列,設(shè)計含有酶切位點的引物,序列如下:
[0060] MNP - Msc I - F:GATGGCCATGACCGAGAACCATGACGCGAT
[0061] MNP - EcoR I - R:GGAATTCTCAATGATGATGATGATGATGGACGAGGTCGAACCGGTCGA
[0062] 以灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens)基因組DNA為模板,用含有Msc I和EcoR I酶切位點引物進行PCR擴增獲得錳過氧化物酶基因序列,使用DNA A -Tailing Kit加 A后連接到T-Vector PMD? 19-T(TaKaRa),并將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入DH5a大腸桿菌內(nèi)。 挑選陽性克隆,搖菌提取質(zhì)粒測序。Msc I和EcoR I進行雙酶切(37°C),回收錳過氧化物 酶DNA片段MNP。用相同內(nèi)切酶酶切表達載體pET - 22b (+)并回收載體DNA片段。將MNP 與載體片段混合,T4DNA Ligase(TaKaRa)過夜連接(16°C),將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入DH5a大腸桿 菌感受態(tài)細胞內(nèi),通過抗性平板及菌落PCR篩選含有目的基因的表達載體的陽性克隆。挑 取陽性克隆接種于含有氨芐青霉素(100 μ g/mL)的LB液體培養(yǎng)基中,180rpm、37°C培養(yǎng)16 小時后提取質(zhì)粒。
[0063] 上述PCR擴增條件為:98°C預(yù)變性3min ;98°C變性10s,68°C延伸45s ;30個循環(huán) 后68°C終延伸3min。
[0064] 步驟10)錳過氧化物酶過表達轉(zhuǎn)基因菌株的構(gòu)建
[0065] 將上述猛過氧化物酶表達載體轉(zhuǎn)入Transetta(DE3)大腸桿菌,在含有氨節(jié)青霉 素(100 μ g/mL)和氯霉素(34 μ g/mL)的LB固體培養(yǎng)基上篩選,獲得錳過氧化物酶過表達 菌株。
[0066] 上述的Transetta(DE3)具有以下特征:該菌株具有氯霉素(Canf),且含有大腸桿 菌缺乏的6種稀有密碼子(AGA、AGG、AGA、CUA、CCC、GGA)對應(yīng)的tRNA,可有效提高外源基 因,尤其是真核生物及鏈霉菌等高GC含量生物基因在原核系統(tǒng)中的表達水平。
[0067] 步驟11)重組錳過氧化物酶體外過表達
[0068] 挑取陽性克隆于含有氨芐青霉素(100 μ g/mL)和氯霉素(34 μ g/mL)的LB液體培 養(yǎng)基中,在32°C震蕩培養(yǎng),當(dāng)0D6(KI達到0. 8 -1. 0時,加入IPTG和MnS04溶液使其在發(fā)酵液 中的濃度達到100 μ M,25°C繼續(xù)培養(yǎng)16小時進行誘導(dǎo)表達。誘導(dǎo)表達培養(yǎng)好的發(fā)酵液離 心收集菌體,利用破胞緩沖液洗滌菌體一次,再利用1/10發(fā)酵液體積的磷酸鹽緩沖液緩沖 液重懸菌體后在冰浴條件下利用超聲波破胞至菌液澄清,13000rpm/min離心15min收集上 清,上清液即為錳過氧化物酶的粗酶液。
[0069] 重組菌誘導(dǎo)表達錳過氧化物酶的SDS - PAGE驗證
[0070] 制備 12% SDS -PAGE 膠,將粗酶液與 5XSDS -PAGE Loading Buffer 比例混合,與 沸水浴5min,每個點樣孔上樣20 μ L,在160V電壓下電泳60 - 70min,直至溴酚藍指示條帶 完全跑出膠。停止電泳,用考馬斯亮藍R - 250溶液染色20min,然后用脫色液進行洗滌,直 至背景色完全脫去,條帶清晰可見(如圖4)。
[0071] 所述的12% SDS - PAGE是由濃縮膠與分離膠構(gòu)成的,其組分分別為:
[0072] 分離膠:蒸餾水 1. 6mL,30%丙烯酰胺溶液 2. OmL,1. 5M Tris -HC1 (pH 8. 8) 1. 3mL, 10% 過硫酸銨(APS)0. 05mL,10% SDS 溶液 0· 05mL,TEMED 0· 002mL ;
[0073] 濃縮膠:蒸餾水 0· 68mL,30 % 丙烯酰胺溶液 0· 17mL,1. 0M Tris - HC1 (pH 6. 8)0. 13mL,10%過硫酸銨(APS)0. OlmL,10% SDS 溶液 0· OlmL,TEMED 0· OOlmL ;
[0074] 所述的 5XSDS - PAGE Loading Buffer 組分為:1M Tris - HC1 (pH 6. 8) 1. 25mL, SDS 0· 5g,溴酚藍25mg,甘油2. 5mL,去離子水定容至5mL。小份分裝(500 μ L)后與室溫保 存,使用前每小份加入β -巰基乙醇25 μ L。
[0075] 所述的考馬斯亮藍R - 250溶液組分為:考馬斯亮藍R - 2501g,異丙醇250mL,冰醋 酸100mL,去離子水650mL。
[0076] 所述的脫色液組分為:冰醋酸100mL,無水乙醇50mL,去離子水850mL。
[0077] 重組菌誘導(dǎo)表達猛氧化物酶的Western Blot驗證
[0078] Western Blot詳細步驟如下:
[0079] 按順序組裝轉(zhuǎn)膜裝置:正電極、海綿、三張濾紙、PVDF膜、SDS - PAGE膠、三張濾紙、 海綿和負電極。其中PVDF膜使用前先用甲醇泡lOmin,濾紙用電轉(zhuǎn)液浸泡。將裝好的轉(zhuǎn)膜 裝置放入電轉(zhuǎn)槽,4°C 100V轉(zhuǎn)60 - 70min。
[0080] 所述的SDS - PAGE膠是指:實施例12中已完成電泳、未染色的膠塊;所述電轉(zhuǎn)液 的組分為:甘氨酸2. 9g/L,Tris5. 8g/L,SDS 0. 37g,甲醇200mL,去離子水800mL,配好之后 4°C預(yù)冷。
[0081] 封閉:將轉(zhuǎn)好的PVDF膜置于封閉液中,并置于水平振蕩器上室溫封閉lh。
[0082] 所述封閉液組分為:5. 0g脫脂奶粉溶解于100mL TBST緩沖液;所述的TBST緩沖 液組分為:NaCl 8. 8g,1M Tris - HC1 (pH 8. 0) 20mL,吐溫-200. 5mL,去離子水 980mL。
[0083] 一抗雜交:將封閉完的PVDF膜轉(zhuǎn)入一抗溶液中,置于滾動搖床37°C、150rpm孵育 lh〇
[0084] 所述的一抗溶液組分為:將抗His -兔多克隆抗體以1 :5000溶在封閉液中。
[0085] 洗膜:將一抗孵育完的PVDF膜轉(zhuǎn)入TBST緩沖液中,在搖床上震蕩清洗3次,每次 l〇min ;之后再在TBS緩沖液中清洗1次,10min。
[0086] 所述TBS緩沖液是指不含吐溫-20組分的TBST緩沖液。
[0087] 二抗雜交:將沖洗干凈的PVDF膜放入二抗溶液中,置于滾動搖床37°C、150rpm孵 育lh。
[0088] 所述的二抗溶液組分為:將羊抗兔IgG - HRP以1 :5000溶在封閉液中。
[0089] 洗膜:同前。
[0090] 染色:將染色液均勻涂抹于PVDF膜上,靜置lmin。通保鮮膜包好PVDF膜,置于X -光片盒中,并用透明膠帶固定。
[0091] 所述的染色液組分是將EasySee Western Blot Kit(TRANSGEN)中 500μ L溶液A、 500 μ L溶液Β與1 μ L溶液C混合。
[0092] 顯影:于暗室中壓片洗膜顯影,結(jié)果如圖5。
[0093] 重組錳過氧化物酶在不同條件下生物學(xué)活性測定
[0094] 錳過氧化物酶活性是以愈創(chuàng)木酚為底物,在錳過氧化物酶和Mn2+作用下,愈創(chuàng)木 酚被氧化成四鄰甲氧基連酚,分光光度法測定有色產(chǎn)物四鄰甲氧基連酚的形成。反應(yīng)條件 為:琥珀酸鈉緩沖液或乳酸鈉緩沖液,pH 4. 0 - 4. 5,0. 2mM MnS04,0. ImM H202,0. 4mM愈創(chuàng)木 酚,測定波長為465nm。
[0095] 采用上述方法測定在不同溫度(20°C - 80°C )、pH值(3· 0 - 12. 0)、濃度為ImM的 金屬鹽(含似+、1%2+、0&2+^11 2+、2112+、(:112+、取2+、0(12+、?6 2+)溶液及酶活性抑制劑(01'1^0丁八、 SDS、NaN3)處理下,錳過氧化物酶粗酶液的活性。測定結(jié)果表明(圖6和圖7),在pH 9. 0 和50°C下,粗酶液具有最大錳過氧化物酶活性,說明該錳過氧化物酶在高溫和堿性可以維 持較強的生物學(xué)活性。此外,該錳過氧化物酶對多種金屬離子(Na+、Mg 2+、Ca2+、Mn2+、Zn2+、 Cu2+、Fe2+)及酶活性抑制劑(DTT、EDTA、NaN3)有較強的耐受能力(圖8和圖9)。上述酶學(xué) 特性,保證了該酶具有廣泛的工業(yè)用途。
【權(quán)利要求】
1. 一種錳過氧化物酶的工程菌,其特征在于,該工程菌為外源表達錳過氧化物酶的大 腸桿菌; 所述的胞內(nèi)猛過氧化物酶具體為灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens)JSD-l 錳過氧化物酶基因 SG-MNP,其核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示,氨基酸序列如SEQ ID No. 2 所示,編碼該錳過氧化物酶核苷酸序列為2226 bp,共編碼741個氨基酸。
2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的工程菌,其特征是,所述的灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens) JSD - 1,現(xiàn)保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心 (CGMCC),保藏編號為CGMCC No. 5706,保藏日期為2012年1月9日。
3. -種根據(jù)權(quán)利要求1或2中所述的工程菌的實現(xiàn)方法,其特征在于,以灰略紅鏈霉菌 基因組DNA為模板,與含有酶切位點和聚組氨酸標(biāo)簽的引物進行PCR擴增得到編碼錳過氧 化物酶的核苷酸序列;然后將擴增得到的基因序列連接到表達載體PET - 22b (+),再將獲得 的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌表達菌株內(nèi),獲得錳過氧化物酶過表達重組菌株。
4. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征是,所述的含有酶切位點和聚組氨酸標(biāo)簽的引 物,即含有Msc I和EcoR I酶切位點引物,具體包括: MNP - Msc I - F :GATGGCCATGACCGAGAACCATGACGCGAT MNP - EcoR I - R :GGAATTCTCAATGATGATGATGATGATGGACGAGGTCGAACCGGTCGA〇
5. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征是,所述的PCR擴增的條件為:98°C預(yù)變性 3min ;98°C變性10s,68°C延伸45s ;30個循環(huán)后68°C終延伸3min。
6. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征是,所述的大腸桿菌表達菌株為 Transetta(DE3)大腸桿菌。
7. -種根據(jù)上述任一權(quán)利要求所述的錳過氧化物酶的工程菌的應(yīng)用,其特征在于,將 其用于錳過氧化物酶的體外高效表達,并用于降解木質(zhì)纖維素。
【文檔編號】C12N15/70GK104232555SQ201410462406
【公開日】2014年12月24日 申請日期:2014年9月12日 優(yōu)先權(quán)日:2014年9月12日
【發(fā)明者】周培, 馮?,|, 孫玉靜, 支月娥 申請人:上海交通大學(xué)