基于木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌及其實(shí)現(xiàn)方法
【專利摘要】一種基因工程領(lǐng)域的基于木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌及其實(shí)現(xiàn)方法,以灰略紅鏈霉菌基因組DNA為模板,與含有酶切位點(diǎn)和谷胱甘肽標(biāo)簽的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到編碼木質(zhì)素過氧化物酶的核苷酸序列;然后將擴(kuò)增得到的基因序列連接到表達(dá)載體,再將獲得的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌表達(dá)菌株內(nèi),獲得木質(zhì)素過氧化物酶過表達(dá)重組菌株。本發(fā)明通過構(gòu)建外源表達(dá)載體,優(yōu)化蛋白誘導(dǎo)表達(dá)的條件和融合標(biāo)簽等方法,實(shí)現(xiàn)了木質(zhì)素過氧化物酶的胞外過表達(dá)。
CGMCC NO.5706
2012.01.09
【專利說明】基于木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌及其實(shí)現(xiàn)方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及的是一種生物基因工程【技術(shù)領(lǐng)域】的基因及其工程菌株,具體是一種灰 略紅鏈霉菌的基于木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌及其實(shí)現(xiàn)方法。
【背景技術(shù)】
[0002] 木質(zhì)素是由四種醇單體(對香豆醇、松柏醇、5 -羥基松柏醇、芥子醇)形成的一種 復(fù)雜酚類聚合物。木質(zhì)素是構(gòu)成植物細(xì)胞壁的成分之一,具有聯(lián)結(jié)強(qiáng)化細(xì)胞的作用。此外, 木質(zhì)素也是一種含許多負(fù)電集團(tuán)的多環(huán)高分子有機(jī)物,對土壤中的高價(jià)金屬離子有較強(qiáng)的 親和力。
[0003] 根據(jù)單體的不同,可將木質(zhì)素分為3種類型:由紫丁香基丙烷結(jié)構(gòu)單體聚合而成 的紫丁香基木質(zhì)素 (S -木質(zhì)素),由愈創(chuàng)木基丙烷結(jié)構(gòu)單體聚合而成的愈創(chuàng)木基木質(zhì)素 (G -木質(zhì)素)和由對-羥基苯基丙烷結(jié)構(gòu)單體聚合而成的對-羥基苯基木質(zhì)素 (H -木質(zhì) 素)。一般而言,木質(zhì)素在裸子植物主要存在類型為愈創(chuàng)木基木質(zhì)素(G),雙子葉植物主要 含愈創(chuàng)木基-紫丁香基木質(zhì)素 (G - S),單子葉植物則為愈創(chuàng)木基-紫丁香基-對-羥基苯 基木質(zhì)素 (G - S - H)。從植物學(xué)觀點(diǎn)出發(fā),木質(zhì)素就是包圍于管胞、導(dǎo)管及木纖維等纖維束 細(xì)胞及厚壁細(xì)胞外的物質(zhì);從化學(xué)觀點(diǎn)來看,木質(zhì)素是由高度取代的苯基丙烷單元隨機(jī)聚 合而成的高分子,它與纖維素、半纖維素一起,形成植物骨架的主要成分,在數(shù)量上僅次于 纖維素。木質(zhì)素填充于纖維素構(gòu)架中增強(qiáng)植物體的機(jī)械強(qiáng)度,利于輸導(dǎo)組織的水分運(yùn)輸和 抵抗不良外界環(huán)境的侵襲。
[0004] 木質(zhì)素單體同時(shí)含有多種活性官能團(tuán),如羥基、羰基、羧基、甲基及其它側(cè)鏈結(jié)構(gòu)。 其中羥基在木質(zhì)素中存在較多,以醇羥基和酚羥基兩種形式存在,而酚羥基的多少又直接 直接影響木質(zhì)素的物理和化學(xué)結(jié)構(gòu),如能反映出木質(zhì)素的醚化和縮合程度,同時(shí)也能衡量 木質(zhì)素的溶解性能和反應(yīng)能力;在木質(zhì)素的側(cè)鏈上,有對羥基安息香酸、香草酸、紫丁香酸、 對羥基肉桂酸、阿魏酸等酯型結(jié)構(gòu)存在,這些酯型結(jié)構(gòu)存在于側(cè)鏈的α位或 Y位。在側(cè)鏈 α位除了酯型結(jié)構(gòu)外,還有醚型連接或作為聯(lián)苯結(jié)構(gòu)的碳-碳聯(lián)結(jié)。同酚羥基一樣,木質(zhì)素 的側(cè)鏈結(jié)構(gòu)也直接關(guān)系它的化學(xué)特性。
[0005] 由于木質(zhì)素的復(fù)雜結(jié)構(gòu)、高分子量及高度疏水性,與纖維素與半纖維素相比,木質(zhì) 素的降解相對緩慢。已發(fā)現(xiàn)木質(zhì)素降解酶主要有3類:漆酶(Laccase)、木質(zhì)素過氧化物酶 (Manganese peroxidase)和木質(zhì)素過氧化物酶(Lignin peroxidase)。
[0006] 灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens)作為一種廣泛存在于土壤的細(xì)菌, 具有很強(qiáng)的木質(zhì)素降解能力并得到了研究者越來越多的關(guān)注。明確灰略紅鏈霉菌降解木質(zhì) 素的分子機(jī)制,克隆并表達(dá)關(guān)鍵木質(zhì)素降解酶,對于開發(fā)新型木質(zhì)素降解酶制劑進(jìn)而實(shí)現(xiàn) 木質(zhì)素乃至木質(zhì)纖維素的快速降解具有重要意義。
[0007] 經(jīng)過對現(xiàn)有技術(shù)的檢索發(fā)現(xiàn):中國專利文獻(xiàn)號CN103205403A公開(公告)日 2013.07. 17,公開了一種生產(chǎn)降解木質(zhì)素酶的方法。該技術(shù)首先分別從微生物中克隆木質(zhì) 素過氧化物酶,錳過氧化物酶和漆酶基因;構(gòu)建含上述三種基因表達(dá)框架的畢赤酵母表達(dá) 載體和釀酒酵母表達(dá)載體,并將載體轉(zhuǎn)化相應(yīng)的宿主菌而獲得工程菌。分別發(fā)酵畢赤酵母 工程菌和釀酒酵母工程菌生產(chǎn)重組木質(zhì)素過氧化物酶,錳過氧化物酶和漆酶。但該技術(shù)中 的木質(zhì)素過氧化物酶克隆自白腐真菌,真菌來源木質(zhì)素過氧化酶對環(huán)境因素敏感,在高溫 和高pH下難以維持較高的生物學(xué)穩(wěn)定性。
[0008] 中國專利文獻(xiàn)號CN102703344A公開(公告)日2012. 10. 03,公開了一株秸桿降解 放線菌及其應(yīng)用,但該技術(shù)中涉及的木質(zhì)素過氧化物酶在灰略紅鏈霉菌內(nèi)為表達(dá)酶,為誘 導(dǎo)酶且表達(dá)量較低,難以滿足生產(chǎn)需求。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0009] 本發(fā)明針對現(xiàn)有技術(shù)存在的由于木質(zhì)素過氧化物酶在生物體內(nèi)多為胞內(nèi)酶且表 達(dá)量較低導(dǎo)致的應(yīng)用范圍和效果嚴(yán)重受限等不足,提出一種基于木質(zhì)素過氧化物酶的工程 菌及其實(shí)現(xiàn)方法,通過構(gòu)建外源表達(dá)載體,優(yōu)化蛋白誘導(dǎo)表達(dá)的條件和融合標(biāo)簽等方法,實(shí) 現(xiàn)了木質(zhì)素過氧化物酶的胞外過表達(dá)。
[0010] 本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的:
[0011] 本發(fā)明涉及一種木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌,該工程菌為外源表達(dá)木質(zhì)素過氧化 物酶的大腸桿菌。
[0012] 所述的胞內(nèi)木質(zhì)素過氧化物酶具體為灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens)JSD - 1木質(zhì)素過氧化物酶基因 SG - LIP,其核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所 示,氨基酸序列如SEQ ID No. 2所示,編碼該木質(zhì)素過氧化物酶核苷酸序列為1278bp,共編 碼425個(gè)氨基酸。
[0013] 所述的 SEQ ID NO. 1 克隆自灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens) JSD-1, 現(xiàn)保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心(CGMCC),保藏編號為CGMCC No. 5706,保藏日期為2012年1月9日,保藏地址:北京市朝陽區(qū)北辰西路1號院3號中國 科學(xué)院微生物研究所郵編100101。
[0014] 所述的木質(zhì)素過氧化物酶編碼基因通過全基因組測序和PCR擴(kuò)增的方式克隆獲 得。
[0015] 本發(fā)明涉及上述工程菌的實(shí)現(xiàn)方法,以灰略紅鏈霉菌基因組DNA為模板,與含有 酶切位點(diǎn)和谷胱甘肽的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到編碼木質(zhì)素過氧化物酶的核苷酸序列;然后 將擴(kuò)增得到的基因序列連接到表達(dá)載體PET - 41a(+),再將獲得的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌 表達(dá)菌株內(nèi),獲得木質(zhì)素過氧化物酶過表達(dá)重組菌株。
[0016] 所述的含有酶切位點(diǎn)和谷胱甘肽標(biāo)簽的引物,即含有Spe I和EcoR I酶切位點(diǎn)引 物,具體包括:
[0017] Lip - Spe I - F:GACTAGTATGGCTGACCCTTCCCTGTCGCA
[0018] Lip - EcoR I - R:GGAATTCTCACCCCTCCAGCAGCGCCTGAC
[0019] 所述的PCR擴(kuò)增的條件為:98°C預(yù)變性3min ;98°C變性10s,68°C延伸45s ;30個(gè) 循環(huán)后68°C終延伸3min。
[0020] 所述的大腸桿菌表達(dá)菌株為Transetta(DE3)大腸桿菌。
[0021] 本發(fā)明涉及一種木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌的應(yīng)用,將其用于木質(zhì)素過氧化物酶 的體外高效表達(dá),并用于木質(zhì)素過氧化物酶的規(guī)?;l(fā)酵生產(chǎn)。 技術(shù)效果
[0022] 與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明克服現(xiàn)有技術(shù)中的木質(zhì)素過氧化物酶在生物體內(nèi)多為胞 內(nèi)酶且表達(dá)量較低,導(dǎo)致應(yīng)用范圍和效果嚴(yán)重受限等不足,應(yīng)用基因工程手段實(shí)現(xiàn)其體外 的大量表達(dá)與合成。此外,本發(fā)明通過在重組蛋白N端添加谷胱甘肽標(biāo)簽的方法,在顯著提 高表達(dá)量的同時(shí)也方便了蛋白后期的純化,為木質(zhì)素過氧化物酶的規(guī)模化發(fā)酵生產(chǎn)提供一 種新的方向。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0023] 圖1為灰略紅鏈霉菌木質(zhì)素過氧化物酶信號肽預(yù)測圖。
[0024] 圖2為重組木質(zhì)素過氧化酶(GST · Tag)體外過表達(dá)SDS - PAGE驗(yàn)證圖。
[0025] 圖3為重組木質(zhì)素過氧化酶(GST · Tag)體外過表達(dá)Western Bolt驗(yàn)證圖。
【具體實(shí)施方式】
[0026] 下面對本發(fā)明的實(shí)施例作詳細(xì)說明,本實(shí)施例在以本發(fā)明技術(shù)方案為前提下進(jìn)行 實(shí)施,給出了詳細(xì)的實(shí)施方式和具體的操作過程,但本發(fā)明的保護(hù)范圍不限于下述的實(shí)施 例。 實(shí)施例1
[0027] 本實(shí)施例包括以下步驟:
[0028] 步驟1)灰略紅鏈霉菌的分離及培養(yǎng)
[0029] 灰略紅鏈霉菌分離自上海市浦江鎮(zhèn)收集的腐爛秸桿,保藏編號為CGMCC No. 5706。 將該菌種接種于LB液體培養(yǎng)基,32 °C培養(yǎng)48h。
[0030] 上述LB液體培養(yǎng)基組分為:蛋白胨10. Og/L,酵母提取物5. Og/L,NaCllO. Og/L, pH6. 8 - 7. 2。在液體培養(yǎng)基中加入15. 0 - 20. 0g/L瓊脂即得LB固體培養(yǎng)基。
[0031] 步驟2)灰略紅鏈霉菌基因組DNA提取
[0032] 灰略紅鏈霉菌基因組DNA提取
[0033] 收集2. OmL菌液,12000rpm離心2min。棄上清,收集菌體沉淀,加入180 μ L溶 菌酶(20mg/mL)和 20 μ L EDTA 溶液(0· 5Μ, ρΗ8· 0),37 °C 處理 45min,加入 4 μ L RNase A (100mg/mL),震蕩混勻15s,室溫放置5min,隨后按照細(xì)菌DNA提取試劑盒(TIANGEN)操作 說明完成剩余操作,得到高純度基因組DNA。通過0. 8%瓊脂糖凝膠電泳確定基因組DNA質(zhì) 量,確保無明顯RNA條帶,基因組條帶清洗、完整、無降解、無污染。
[0034] 步驟3)灰略紅鏈霉菌基因組測序
[0035] 確定全基因組鳥槍法(WGS)策略,采用第二代測序技術(shù),構(gòu)建不同插入片段長度 的文庫,采用Illumina Miseq(2X250bp)平臺進(jìn)行測序。收集測序的原始數(shù)據(jù),對帶接頭、 低質(zhì)量的數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾,隨后采用Newbler v2. 8對去除接頭的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行從頭拼接,構(gòu) 建contig及scaffold,最后使用GapCloser程序進(jìn)行缺口填補(bǔ)得到鏈霉菌基因組草圖。
[0036] 步驟4)蛋白編碼基因功能預(yù)測
[0037] 采用Glimmerf. 0軟件對全基因組序列進(jìn)行基因預(yù)測?;蝾A(yù)測模型選取自我訓(xùn) 練基因預(yù)測模型,即提取拼裝序列中最長的序列,以該序列作為基因預(yù)測模型訓(xùn)練的序列。 然后以該序列構(gòu)建的基因預(yù)測模型,對所有序列進(jìn)行基因預(yù)測,設(shè)定開放閱讀框的長度為 llObp,其余參數(shù)為Glimmer3. 0的默認(rèn)設(shè)置。
[0038] 步驟5)木質(zhì)素過氧化物酶膜定位預(yù)測
[0039] 采用SignalP4. 1分別對木質(zhì)素過氧化物酶氨基酸序列進(jìn)行信號肽模擬預(yù)測,如 圖1所示。結(jié)果表明木質(zhì)素過氧化物酶不存在明顯的信號肽序列,推測該酶為胞內(nèi)酶。
[0040] 步驟6)木質(zhì)素過氧化物酶表達(dá)載體構(gòu)建
[0041] 根據(jù)木質(zhì)素過氧化物酶基因序列,設(shè)計(jì)含有酶切位點(diǎn)的引物,序列如下:
[0042] Lip - Spe I - F:GACTAGTATGGCTGACCCTTCCCTGTCGCA
[0043] Lip - EcoR I - R:GGAATTCTCACCCCTCCAGCAGCGCCTGAC
[0044] 以灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens)基因組DNA為模板,用含有 Spe I和EcoR I酶切位點(diǎn)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得木質(zhì)素過氧化物酶基因序列,使用DNA A-Tailing Kit 加 A 后連接到 T-Vector ?]\?11119-1'〇^1^1^),并將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入0!15〇 大腸桿菌內(nèi)。挑選陽性克隆,搖菌提取質(zhì)粒測序。Spe I和EcoR I進(jìn)行雙酶切(37°C),回 收木質(zhì)素過氧化物酶DNA片段Lip。用相同內(nèi)切酶酶切表達(dá)載體pET-41a(+)并回收載體 DNA片段。將Lip與載體片段混合,T4DNA Ligase(TaKaRa)過夜連接(16°C),將連接產(chǎn)物 轉(zhuǎn)入DH5 α大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞內(nèi),通過抗性平板及菌落PCR篩選含有重組表達(dá)質(zhì)粒的陽 性克隆。挑取陽性克隆接種于含有卡那霉素(50yg/mL)的LB液體培養(yǎng)基中,180rpm、37°C 培養(yǎng)16小時(shí)后提取質(zhì)粒。
[0045] 上述PCR擴(kuò)增條件為:98°C預(yù)變性3min ;98°C變性10s,68°C延伸45s ;30個(gè)循環(huán) 后68°C終延伸3min。
[0046] 步驟7)木質(zhì)素過氧化物酶過表達(dá)轉(zhuǎn)基因菌株的構(gòu)建
[0047] 將上述重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)入Transetta(DE3)大腸桿菌,并在含有卡那霉素(50 μ g/ mL)和氯霉素(34 μ g/mL)的LB固體培養(yǎng)基上篩選,獲得木質(zhì)素過氧化物酶過表達(dá)菌株。
[0048] 上述的Transetta(DE3)具有以下特征:該菌株具有氯霉素(Canf),且含有大腸桿 菌缺乏的6種稀有密碼子(AGA、AGG、AGA、CUA、CCC、GGA)對應(yīng)的tRNA,可有效提高外源基 因,尤其是真核生物及鏈霉菌等高GC含量生物基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)水平。
[0049] 步驟8)重組木質(zhì)素過氧化物酶體外過表達(dá)及純化
[0050] 挑取陽性克隆于含有卡那霉素(50 μ g/mL)和氯霉素(34 μ g/mL)的LB液體培養(yǎng) 基中,在32°C震蕩培養(yǎng),當(dāng)0D6(?達(dá)到0. 8 - 1. 0時(shí),28°C加入IPTG溶液使培養(yǎng)液IPTG濃度 達(dá)到100 μ M,繼續(xù)培養(yǎng)12小時(shí)進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。誘導(dǎo)表達(dá)培養(yǎng)好的發(fā)酵液離心收集菌體,利 用破胞緩沖液洗滌菌體一次,再利用1/10發(fā)酵液體積的磷酸鹽緩沖液緩沖液重懸菌體后 在冰浴條件下利用超聲波破胞至菌液澄清,13000rpm/min離心15min收集上清,上清液即 為木質(zhì)素過氧化物酶的粗酶液。通過0. 45 μ m濾膜過濾掉粗酶液中的雜質(zhì),隨后通過GST 蛋白純化試劑盒的操作要求完成融合蛋白的純化。
[0051] 重組菌誘導(dǎo)表達(dá)木質(zhì)素過氧化物酶的SDS - PAGE驗(yàn)證
[0052] 制備 12% SDS -PAGE 膠,將粗酶液與 5XSDS -PAGE Loading Buffer 比例混合,與 沸水浴5min,每個(gè)點(diǎn)樣孔上樣20 μ L,在160V電壓下電泳60 - 70min,直至溴酚藍(lán)指示條帶 完全跑出膠。停止電泳,用考馬斯亮藍(lán)R - 250溶液染色20min,然后用脫色液進(jìn)行洗滌,直 至背景色完全脫去,條帶清晰可見(如圖2)。
[0053] 所述的12% SDS - PAGE是由濃縮膠與分離膠構(gòu)成的,其組分分別為:
[0054] 分離膠:蒸餾水 1. 6mL,30%丙烯酰胺溶液 2. OmL,1· 5M Tris - HC1 (ρΗ8· 8) 1. 3mL, 10% 過硫酸銨(APS)O. 05mL,10% SDS 溶液 0· 05mL,TEMEDO. 002mL ;
[0055] 濃縮膠:蒸餾水0.68mL,30 %丙烯酰胺溶液0. 17mL,1.0M Tris-HCl(pH6.8)0.13mL,10 % 過硫酸銨(APS)0.01mL,10 % SDS 溶液 O.OlmL, TEMEDO. OOlmL ;
[0056] 所述的 5X SDS - PAGE Loading Buffer 組分為:1M Tris - HC1 (pH6. 8) 1. 25mL, SDSO. 5g,溴酚藍(lán)25mg,甘油2. 5mL,去離子水定容至5mL。小份分裝(500 μ L)后與室溫保 存,使用前每小份加入β -巰基乙醇25 μ L。
[0057] 所述的考馬斯亮藍(lán)R - 250溶液組分為:考馬斯亮藍(lán)R - 250 lg,異丙醇250mL,冰 醋酸100mL,去離子水650mL ;所述的脫色液組分為:冰醋酸100mL,無水乙醇50mL,去離子 水 850mL。
[0058] 重組菌誘導(dǎo)表達(dá)木質(zhì)素過氧化物酶的Western Blot驗(yàn)證
[0059] Western Blot詳細(xì)步驟如下:
[0060] 按順序組裝轉(zhuǎn)膜裝置:正電極、海綿、三張濾紙、PVDF膜、SDS - PAGE膠、三張濾紙、 海綿和負(fù)電極。其中PVDF膜使用前先用甲醇泡10min,濾紙用電轉(zhuǎn)液浸泡。將裝好的轉(zhuǎn)膜 裝置放入電轉(zhuǎn)槽,4°C 100V轉(zhuǎn)60 - 70min。
[0061] 所述的SDS - PAGE膠是指:實(shí)施例9中已完成電泳、未染色的膠塊;所述電轉(zhuǎn)液的 組分為:甘氨酸2. 9g/L,Tris5. 8g/L,SDS0. 37g,甲醇200mL,去離子水800mL,配好之后4°C 預(yù)冷。
[0062] 封閉:將轉(zhuǎn)好的PVDF膜置于封閉液中,并置于水平振蕩器上室溫封閉lh。
[0063] 所述封閉液組分為:5. 0g脫脂奶粉溶解于100mL TBST緩沖液;所述的TBST緩沖 液組分為:NaC18. 8g,1M Tris - HC1 (ρΗ8· 0) 20mL,吐溫-20 0· 5mL,去離子水 980mL。
[0064] 一抗雜交:將封閉完的PVDF膜轉(zhuǎn)入一抗溶液中,置于滾動(dòng)搖床37°C、150rpm孵育 lh〇
[0065] 所述的一抗溶液組分為:將抗His -兔多克隆抗體以1 :5000溶在封閉液中。
[0066] 洗膜:將一抗孵育完的PVDF膜轉(zhuǎn)入TBST緩沖液中,在搖床上震蕩清洗3次,每次 l〇min ;之后再在TBS緩沖液中清洗1次,10min。
[0067] 所述TBS緩沖液是指不含吐溫-20組分的TBST緩沖液。
[0068] 二抗雜交:將沖洗干凈的PVDF膜放入二抗溶液中,置于滾動(dòng)搖床37°C、150rpm孵 育lh。
[0069] 所述的二抗溶液組分為:將羊抗兔IgG - HRP以1 :5000溶在封閉液中。
[0070] 洗膜:同前。
[0071] 染色:將染色液均勻涂抹于PVDF膜上,靜置lmin。通保鮮膜包好PVDF膜,置于X -光片盒中,并用透明膠帶固定。
[0072] 所述的染色液組分是將EasySee Western Blot Kit(TRANSGEN)中 500μ L溶液A、 500 μ L溶液Β與1 μ L溶液C混合。于暗室中壓片洗膜顯影,結(jié)果如圖3所示。
【權(quán)利要求】
1. 一種木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌,其特征在于,該工程菌為外源表達(dá)木質(zhì)素過氧化 物酶的大腸桿菌; 所述的胞內(nèi)木質(zhì)素過氧化物酶具體為灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens) JSD - 1木質(zhì)素過氧化物酶基因 SG -LIP,其核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示,氨基酸序列如 SEQ ID No. 2所示,編碼該木質(zhì)素過氧化物酶核苷酸序列為1278bp,共編碼425個(gè)氨基酸。
2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的工程菌,其特征是,所述的灰略紅鏈霉菌(Streptomyces griseorubens) JSD - 1,現(xiàn)保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心 (CGMCC),保藏編號為CGMCC No. 5706,保藏日期為2012年1月9日。
3. -種根據(jù)權(quán)利要求1或2中所述的工程菌的實(shí)現(xiàn)方法,其特征在于,以灰略紅鏈霉菌 基因組DNA為模板,與含有酶切位點(diǎn)和谷胱甘肽標(biāo)簽的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到編碼木質(zhì)素 過氧化物酶的核苷酸序列;然后將擴(kuò)增得到的基因序列連接到表達(dá)載體PET -41a(+),再將 獲得的連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌表達(dá)菌株內(nèi),獲得木質(zhì)素過氧化物酶過表達(dá)重組菌株。
4. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征是,所述的含有酶切位點(diǎn)和谷胱甘肽標(biāo)簽的引 物,即含有Spe I和EcoR I酶切位點(diǎn)引物,具體包括: Lip - Spe I - F:GACTAGTATGGCTGACCCTTCCCTGTCGCA Lip - EcoR I - R:GGAATTCTCACCCCTCCAGCAGCGCCTGAC〇
5. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征是,所述的PCR擴(kuò)增的條件為:98°C預(yù)變性 3min ;98°C變性10s,68°C延伸45s ;30個(gè)循環(huán)后68°C終延伸3min。
6. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征是,所述的大腸桿菌表達(dá)菌株為 Transetta(DE3)大腸桿菌。
7. -種根據(jù)上述任一權(quán)利要求所述的木質(zhì)素過氧化物酶的工程菌的應(yīng)用,其特征在 于,將其用于木質(zhì)素過氧化物酶的體外高效表達(dá),并用于木質(zhì)素過氧化物酶的規(guī)?;l(fā)酵 生產(chǎn)。
【文檔編號】C12R1/19GK104232556SQ201410462409
【公開日】2014年12月24日 申請日期:2014年9月12日 優(yōu)先權(quán)日:2014年9月12日
【發(fā)明者】周培, 馮?,|, 支月娥, 孫玉靜 申請人:上海交通大學(xué)