專利名稱::治療中的逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子抑制的制作方法治療中的逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子抑制
技術(shù)領(lǐng)域:
本申請涉及逆轉(zhuǎn)錄酶表達(dá)抑制劑在治療中的用途。技術(shù)背景Spadafora在其論文(CytogenetGenomeRes105:346350(2004))中討論內(nèi)源的、非端粒逆轉(zhuǎn)錄酶及其在胚胎發(fā)生和轉(zhuǎn)化中的意義。更特別地,逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)由兩類重復(fù)基因組元件編碼,即逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子和內(nèi)源逆轉(zhuǎn)錄病毒。它們都需要RT作為其系統(tǒng)的基本組成??赡孓D(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子元件(retrotransposableelements),如長散布元件(LINEs),長期以來認(rèn)為是"垃圾DNA",除了作為不再需要的剩余DNA以外只有很少的用途,并沒有將其基因組中刪除。早在1971年(Temin,JNatlCancerInst46:5660),這一部分已經(jīng)受到挑戰(zhàn),但是,本領(lǐng)域繼續(xù)簡單地將這種序列認(rèn)為是"垃圾DNA"。Spadafora在其論文(同上)中回顧了該技術(shù),并證明了RT編碼基因的表達(dá)通常在非病理、末期分化的細(xì)胞中被抑制,但是,在非常早期的胚胎、生殖細(xì)胞、胚胎和腫瘤組織中是活性的,所有這些都具有高的增殖潛能。在鼠科胚胎中阻斷RT停滯了其發(fā)育,并且去除阻斷影響都沒有重新啟動(dòng)胚胎發(fā)生。在癌細(xì)胞中,增殖得到顯著減少,在48和72小時(shí)之間觀察到區(qū)別。Kuo等人(BiochemandBiophysResCom253:566570(1998))從人類小細(xì)胞肺癌的cDNA文庫中確定出一個(gè)1.7kb的LINE-I(LI)轉(zhuǎn)錄本。他們發(fā)現(xiàn),這種重復(fù)元件在人類組織中無處不在地表達(dá),包括正常的(纖維原細(xì)胞和肝臟)和轉(zhuǎn)化的。此外,他們表明衍生自此轉(zhuǎn)錄本的正義寡核苷酸,與人類肝細(xì)胞瘤細(xì)胞孵育,降低了細(xì)胞增殖的速率。該元件在正常和癌組織中的存在顯示出這種重復(fù)元件與細(xì)胞增殖的常規(guī)功能有關(guān)。作者將細(xì)胞增殖的降低解釋為由于突變而對參與控制細(xì)胞生長的基因的沉默或功能性變更。作者并不認(rèn)為這種轉(zhuǎn)化是可逆事件。相反,我們現(xiàn)在確定,逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的LINE-1族的抑制對于抑制或阻礙癌組織的增殖及剌激其分化是有效的。
發(fā)明內(nèi)容因此,本發(fā)明第一方面是提供RNA干擾抑制癌組織非特異性增殖的用途,其中RNA識別至少一個(gè)LINE-1重復(fù)元件的一部分。另一方面,本發(fā)明提供RNA干擾(RNAi)在治療癌損傷中的用途,其中RNA識別至少一個(gè)LINE-1重復(fù)元件的一部分。使用本發(fā)明RNAi的RT表達(dá)減少導(dǎo)致癌組織增殖的降低,常常大于50%,且至少在受治療的細(xì)胞中隨后的增殖主要為分化生長。因此,本發(fā)明的RNAi起到減少癌組織增殖,同時(shí)激勵(lì)分化的作用。應(yīng)當(dāng)理解,本發(fā)明的RNAi特別指LINE-l,其用途避免使用一般的非核苷酸RT抑制劑(NNRTI),其封閉所有的RTs。事實(shí)上,令人驚訝的是,本發(fā)明的RNAi,直接抗(against)LINE-1,起封閉或抑制癌組織增殖的作用,假定LINE-1只是RT編碼元件下的亞群。目前,LINE-1家族中只有少數(shù)成員(大約68個(gè))被識別為具有特別高的活性,本發(fā)明給出抗這些中任一個(gè)的RNAi。使用RNAi的聯(lián)合治療,其中設(shè)計(jì)每個(gè)rna對于單個(gè)line-1逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(retrotransposon)來說都是特定的,但是優(yōu)選使用抗共有序列的RNA。這種共有序列可以用于兩個(gè)或多個(gè)LINE-1家族成員,但是優(yōu)選用于活性成員,如果多個(gè)都是同一的(identified),則可以用于多個(gè)。優(yōu)選地,RNAi為短千擾RNA(siRNA)或雙鏈RNA(dsRNA)。還優(yōu)選,RNA為短發(fā)夾RNA,優(yōu)選適于且優(yōu)選通過siRNA表達(dá)載體方法來給藥。合適的載體包括本領(lǐng)域公知并在此仍要討論的逆轉(zhuǎn)錄酶病毒質(zhì)粒。通常優(yōu)選,本發(fā)明中使用的RNA具有10或更大的片段,如15、20、30、40或更多核苷酸,其相當(dāng)于轉(zhuǎn)錄LINE-1DNA區(qū)域的正鏈意義(directsense)。然而,特別優(yōu)選為21個(gè)核苷酸。轉(zhuǎn)錄的LINE-1DNA優(yōu)選選自共有區(qū)域。然而,并不必須要求核苷酸的片段與轉(zhuǎn)錄LINE-1DNA的所選區(qū)域完全一致,只要本發(fā)明的干擾RNA起到結(jié)合來自LINE-1DNA的轉(zhuǎn)錄RNA即可。然而,特別優(yōu)選的是,來自RNAi的RNA核苷酸片段與相應(yīng)來自LINE-1序列的轉(zhuǎn)錄DNA片段一致。RNAi優(yōu)選包括與相應(yīng)來自LINE-1序列的轉(zhuǎn)錄DNA片段一致的21個(gè)核苷酸序列,更優(yōu)選由相應(yīng)來自LINE-1序列的轉(zhuǎn)錄DNA片段一致的21個(gè)核苷酸序列組成。本發(fā)明的RNAi可以形成環(huán)形結(jié)構(gòu),其中,環(huán)可以位于上述核苷酸片段范圍內(nèi),在這種情況下,片段可以被環(huán)中斷。該環(huán)可以采取dsRNA形式作為其結(jié)構(gòu)的一部分,可以在RNA片段中提供1、2或3個(gè)核苷酸缺口。通常優(yōu)選,沒有導(dǎo)致RNA片段省略的環(huán),使得目標(biāo)mRNA沿著選定序列結(jié)合。本發(fā)明的RNAi可以簡單地為能夠連接來自LINE-1元件的對應(yīng)轉(zhuǎn)錄序列的短序列,或可以另外包括一個(gè)或兩個(gè)末端序列和/或內(nèi)部環(huán)序列。應(yīng)當(dāng)理解,選自LINE-1內(nèi)的序列應(yīng)當(dāng)是開放閱讀框架,例如可以選自RT的ORFl和ORF2。因此,優(yōu)選開放閱讀框架編碼逆轉(zhuǎn)錄酶。這包括具有逆轉(zhuǎn)錄活性的任何蛋白質(zhì)。RNAi治療可以以任何方便的方式給藥。通常,重要的是必須確保RNAi到達(dá)目標(biāo)細(xì)胞。雖然本發(fā)明的RNAi可以以任何合適的載體直接注射到目標(biāo)位置,但是其還可以綁定至例如組織工程細(xì)胞支架(scaffolds)或納米顆粒(nanoparticles)而給藥。更優(yōu)選地,RNAi可以例如作為質(zhì)?;蛲ㄟ^逆轉(zhuǎn)錄酶病毒來給藥。腺病毒和腺相關(guān)病毒的載體可以得到使用以來分配RNAi的編碼序列,優(yōu)選以質(zhì)粒形式。其他類似的病毒和逆轉(zhuǎn)錄酶病毒以及其他這種載體也可以使用。特別地,己經(jīng)確定,將編碼序列如質(zhì)粒傳遞至目標(biāo)位置的功效可以在循環(huán)中增加,如果使用滲透因子,如血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)c傳遞的其他合適方法為pSUPERRNAi系統(tǒng)kit(www.oligogengine.com)。圖l:通過抗RT藥物的增殖抑制作用。(A)用DMSO(對照)、奈韋拉平(nevirapine)(NEV)和依法韋侖(efavirenz)(EFV)處理培養(yǎng)基中生長的細(xì)胞。每96小時(shí)對細(xì)胞計(jì)數(shù)并重新裝盤,進(jìn)行5個(gè)周期。然后,在沒有抑制劑的培養(yǎng)基中培養(yǎng)細(xì)胞(2個(gè)周期)。然后,再將RT抑制劑加入進(jìn)行2個(gè)周期。細(xì)胞計(jì)數(shù)用對照數(shù)的%來表示,其確定為100%。數(shù)值代表了三個(gè)實(shí)驗(yàn)的合并數(shù)據(jù)。(B)RT抑制劑存在的4個(gè)96小時(shí)周期和去除藥物后的細(xì)胞周期圖。圖2:RT抑制劑導(dǎo)致黑素瘤細(xì)胞的形態(tài)分化。(A)在DMSO-(a、b、c)、奈韋拉平-(d、e、f)或依法韋侖-(g、h、i)處理培養(yǎng)的A-375細(xì)胞系。在姬姆薩(WrightGiemsa)染色后(左欄)、SEM(中欄)和oc微管蛋白(綠色)與細(xì)胞核PI著色(紅色)之后的共焦顯微鏡(右欄)后的相差顯微鏡觀察的培養(yǎng)物。(B)黑素瘤衍生的TVM-A12原代細(xì)胞。DMSO-(a、b、c)和奈韋拉平處理(d、e、f)的細(xì)胞在相差顯微鏡(左欄)、SEM(中欄)和共焦顯微鏡(右欄)下的情況,標(biāo)尺,20prn。圖3:RT抑制劑調(diào)節(jié)A-375(板A)和PC3(板B)細(xì)胞系中的基因表達(dá)。從用DMSO(ctr)、奈韋拉平(nev)或依法韋侖(efv)處理和去除奈韋拉平(neWr)或依法韋侖(efV/r)之后的細(xì)胞中提取的RNA,通過RT-PCR擴(kuò)增,用內(nèi)部寡核苷酸來印跡和雜交。GAPDH用作內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)。圖4:RNAi對LINE-1誘導(dǎo)A-375細(xì)胞的形態(tài)分化,減少A-375細(xì)胞的增殖并調(diào)節(jié)A-375細(xì)胞的中的基因表達(dá)。(A)完全長度LINE-1元件的結(jié)構(gòu)。給出了siRNA寡核苷酸的位置。箭頭表明用于RT-PCR分析的引物對的位置。(B)用對照(CTR)和LINE-1siRNA寡核苷酸(Ll-i)轉(zhuǎn)染A-375培養(yǎng)物的相差顯微鏡分析。(C)用CTR和Ll-i寡核苷酸轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞生長。(D)來自用CTR或Ll-i寡核苷酸轉(zhuǎn)染的A-375細(xì)胞的RNA在半定量RT-PCR之后的示例性基因表達(dá)模式。定量變化(表示為Ll-i轉(zhuǎn)染的培養(yǎng)物的%信號比上CTR轉(zhuǎn)染的培養(yǎng)物的信號)代表三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的平均值;擴(kuò)增的產(chǎn)品由條帶的光密度計(jì)量和對相同實(shí)驗(yàn)中GAPDH信號的標(biāo)準(zhǔn)化來測定。圖5:依法韋侖減少了裸鼠中人類瘤的生長。監(jiān)控由指定細(xì)胞系所形成的瘤在未受處理動(dòng)物(紅色)和接種后用依法韋侖處理1天(紫色)或處理1周(黃色)的動(dòng)物中的生長。PC3和HT29中從上往下第二條開始的兩條曲線顯示了接種后開始1天處理但在14天后進(jìn)行不連續(xù)處理的動(dòng)物中PC3-和HT69-衍生瘤的生長。曲線顯示出一組五個(gè)動(dòng)物的瘤尺寸的平均值。圖6:用依法韋侖預(yù)處理的PC3細(xì)胞的降低的致腫瘤性。(A)未處理或依法韋侖預(yù)處理細(xì)胞形成的瘤的生長,這些細(xì)胞注射到?jīng)]有進(jìn)行處理或在活體內(nèi)依法韋侖后處理的老鼠體內(nèi)。(B)指定的處理30天之后PC3衍生的異種移植物的結(jié)果(n二20個(gè)動(dòng)物/組)。圖7:用pS-Ll感染的細(xì)胞表現(xiàn)出增殖的顯著減少。pS-Ll感染的細(xì)胞顯示為A-375pS-ll。增殖保持恒定至少39天。未感染細(xì)胞(A-375,圖7A)保持高增殖速率,pS感染的細(xì)胞(A-375pS,圖7B)顯示出增殖在感染后的最初幾天中緩和降低,但隨后快速恢復(fù)到與未感染細(xì)胞相當(dāng)?shù)母咴鲋乘俾?。圖8:與對照相比,瘤生長在接種LINE-1干擾(LINE1-interfered)細(xì)胞的老鼠中得到顯著降低。板A示出了接種A375pS和A375pS-Lli細(xì)胞的老鼠體內(nèi)瘤生長的進(jìn)程。板B的例子中示出了與那些接種對照細(xì)胞的老鼠相比,在接種UNE-1干擾細(xì)胞的老鼠體內(nèi)瘤生長得到顯著降低。具體實(shí)施方式本發(fā)明RNAi耙向的LlNE-l元件(Us)優(yōu)選根據(jù)Brouha等(2003)的教導(dǎo)來選擇,其全文作為參考合并于此。優(yōu)選為活性Lls,因?yàn)槿绻鼈兪腔钚缘?,則他們易于能夠表達(dá)RT。因此,本發(fā)明的RNAi優(yōu)選識別或靶向至少一個(gè)活性Ll的一部分。優(yōu)選,RT的表達(dá)受RNAi的抑制。應(yīng)當(dāng)理解,所使用RNAi序列將識別,并能夠結(jié)合通過從目標(biāo)L1內(nèi)包括的特殊ORF轉(zhuǎn)錄可獲得的RNA,Ll元件的特征在于其也包括在此討論的優(yōu)選序列。因此,Ll序列由本發(fā)明優(yōu)選序列來確定,例如SEQIDNo.27,其對應(yīng)的DNA序列或其同源,這將在其它地方說明,但是L1序列也優(yōu)選能夠表達(dá)蛋白質(zhì),優(yōu)選為RT,其表達(dá)受RNAi抑制。優(yōu)選在嚴(yán)格的條件下將RNAi序列結(jié)合LINE-lRNA,如在含有50%甲酰胺和6xSSC的緩沖劑中。優(yōu)選用于表征Ll元件特征的序列其本身為ORF、ORF的一部分或包括ORF的至少一部分。優(yōu)選用于由RNAi靶向的Ll序列包括在所述Ll元件的ORF范圍內(nèi)。因此,那些制造特定DNA序列的參考可以優(yōu)選,應(yīng)當(dāng)理解,用于具有確定的序列,其可能包含在L1元件的較大序列中。這樣,確定L1元件的序列不必含有ORF,假設(shè)Ll元件本身含有可表達(dá)ORF,從ORF轉(zhuǎn)錄的RNA能夠由耙向特定Ll元件的RNAi來結(jié)合。這樣,RNAi優(yōu)選耙向包括該優(yōu)選DNA序列或其對應(yīng)序列或其同源序列的L1元件。優(yōu)選Ll元件內(nèi)的ORFs例子為對應(yīng)于引物序列SEQIDNos.2025的序列。因此,RNAi優(yōu)選識別這些SEQIDNOS或其對應(yīng)的序列。更特別地,對于ORFi為5,-AGAAATGAGCAAAGCCTCCA-3'(SEQIDNo.20)5,-GCCTGGTGGTGACAAAATCT-3'(SEQIDNo.21)5,-TAAGGGCAGCCAGAGAGAAA-3,(SEQIDNo.24)對于ORF2為5'-TCCAGCAGCACATCAAAAAG-3,(SEQIDNo.22)5,-CCAGTTTTTGCCCATTCAGT畫3'(SEQIDNo.23)5,-TGACAAACCCACAGCCAATA-3,(SEQIDNo.25)因此,這些序列的R^A等同物為,對于ORFl為5,-AGAAAUGAGCAAAGCCUCCA-3,(SEQIDNo.39)5,-GCCUGGUGGUGACAAAAUCU-3,(SEQIDNo.40)5,-UAAGGGCAGCCAGAGAGAAA-3,(SEQIDNo.41)對于ORF2為5'曙UCCAGCAGCACAUCAAAAAG-3,(SEQIDNo.42)5'-CCAGUUUUUGCCCAUUCAGU曙3,(SEQIDNo.43)5,-UGACAAACCCACAGCCAAUA-3,(SEQIDNo.44)。因此,特別優(yōu)選RNAi包括至少一個(gè)片段,優(yōu)選來自SEQIDNos.3944中任何一個(gè)的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸,更優(yōu)選15個(gè)連續(xù)核苷酸,最優(yōu)選20個(gè)連續(xù)核苷酸。如上所述,也優(yōu)選使用所述序列較短的片段,由如發(fā)夾環(huán)這樣的特征散開。対于L1rp,對于ORFi的CDS存在于SEQIDNo.27的9071923位置上,編碼在SEQIDNo.45中給出的蛋白質(zhì)序列。存在于SEQIDNo.27的19875814的位置上的CDS,編碼ORF2,蛋白質(zhì)序列在SEQIDNo.46中給出。ORF2編碼的蛋白質(zhì)被認(rèn)為具有RT活性。因此,優(yōu)選RNAi靶向包括在SEQIDNo.27中9071923位置上和/或SEQIDNo.27中19875814位置上的DNA,優(yōu)選能抑制根據(jù)SEQIDNo.45的蛋白質(zhì)的表達(dá),最優(yōu)選SEQIDNo.46。類似地,CDSs存在于SEQIDNo.32中1771718697和115033116161的位置上,但是這些描述為假基因,因此不優(yōu)選。因此,優(yōu)選RNAi包括對應(yīng)于編碼根據(jù)SEQIDNo.45的蛋白質(zhì)的RNA序列的RNA片段,最優(yōu)選為SEQIDNo.46。該片段可以包括發(fā)夾或別處討論的其他特征。優(yōu)選地,RNAi由對應(yīng)于編碼根據(jù)SEQIDNo.45的蛋白質(zhì)的RNA序列的20或21bp的RNA片段組成,最優(yōu)選SEQIDNo.46。優(yōu)選地,RNAi具有SEQIDNo.l9的序列,或其RNA等同物,耙向熱Lls中共有序列的SEQIDNo.47。另一方面,本發(fā)明提供了這種RNAi。如Brouha等人(2003)描述那樣,活性Lls優(yōu)選多形態(tài),并優(yōu)選"年輕"或最近形成,由于U元件或序列的年齡確定其可能的轉(zhuǎn)換。如Brouha等人(2003)描述那樣,具有很少序列轉(zhuǎn)換的Lls通常在種群上具有多形態(tài)性,在培養(yǎng)的細(xì)胞種具有活性。相反,高度轉(zhuǎn)換的L1序列是最通常的固定和無活性,活性Ll通常長度為6kbp,表明沒有5'截?cái)唷R虼?,LINE-1元件優(yōu)選長度至少為6kbp。優(yōu)選在Brouha等人(2003)預(yù)測的在平均人類中為活性的80100個(gè)有逆轉(zhuǎn)錄能力(retrotransposition-competent)的Lls。這些有逆轉(zhuǎn)錄能力的Lls中的6個(gè)被發(fā)現(xiàn)是高度活性Lls(熱Lls(hotLls))。熱Lls優(yōu)選顯示至少l/3的LlRP活性。因此,特別優(yōu)選L1序列為"熱Lls",其具有在人體中的高生物活性,并優(yōu)選顯示至少l/3的LlRp活性。LlRP為熱Ll,在Brouha等人(2003)和Hum.Mol.Genet8(8),15571560(1990)中得到說明,上述可以從http://hmg.oxfordjoumals.Org/cgi/reprint/8/8/l557獲得,NCBI登陸號為AF148856,SEQIDNo.27。正如優(yōu)選耙向ORFs那樣,SEQIDNo.27的9071923(ORF1)和19875814(ORF2)核苷酸位置為RNAi特別優(yōu)選的靶標(biāo)。相對于LlRP的活性可以通過合適的化驗(yàn)來測量,例如通過將LINE-l元件連接用于表達(dá)的易于由熟練技術(shù)人員選擇的可探測標(biāo)記。優(yōu)選地,這可以包括用于Brouha等人(2003)中所使用的方法和EGFP檢測。EGFP表達(dá)盒的構(gòu)建和如何使用其來評價(jià)活性進(jìn)一步在參考號為23的Brouha等人(2003)、HaigH.KazazianJr等人在NucleicAcidsResearch,2000,Vol.28,No.6,14181423中進(jìn)一步說明。包括EGFP的Ll的合適實(shí)施例在SEQIDNo,26中給出,將在下面討論。無需理論上的界定,認(rèn)為,轉(zhuǎn)錄從位于其5引物UTR的內(nèi)部啟動(dòng)區(qū)起始,RNA轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)。Ll編碼的蛋白質(zhì)、ORFlp和ORF2p然后作用于編碼它們的mRNA,這種現(xiàn)象公知為順式優(yōu)選(cispreference)。然后,得到的核蛋白微粒再次進(jìn)入被認(rèn)為通過靶向處理(target-primed)逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的L1整合的細(xì)胞核中。在這個(gè)過程中,Ll核酸內(nèi)切酶在基因組DNA中松散的共有序列5'-TTTTT/A-3'處產(chǎn)生單鏈缺口(nick),暴露一個(gè)3,OH,其作為用于通過L1RT(逆轉(zhuǎn)錄)來逆轉(zhuǎn)錄L1RNA的引物。優(yōu)選地,LINE-1序列包括21個(gè)堿基對共有序列,SEQIDNo.19,其對應(yīng)的(反義)DNA序列或其RNA等同物。因此,也優(yōu)選本發(fā)明的RNAi包括該21個(gè)堿基對序列的RNA等同物,或?qū)?yīng)于SEQIDNo.l9的DNA的RNA等同物,或能夠在嚴(yán)謹(jǐn)條件下如6xSSC下雜交的序列。也優(yōu)選,RNAi靶向的序列為SEQIDNos.35-38中的任一個(gè),更優(yōu)選為SEQIDNo.37,最優(yōu)選為SEQIDNo.35。包括其中的是對應(yīng)的DNA序列或其RNA等同物。SEQIDNo.35為實(shí)施例2中耙向的60bp序列,同時(shí),SEQIDNos.36-38為較長的共有序列,將在下面討論。被用于耙向的L1序列也可以與在此描述的任何一種序列享有一定程度的同源性,優(yōu)選至少70%,更優(yōu)選至少85%,更優(yōu)選至少95%,更優(yōu)選至少99%,更優(yōu)選至少99.5%,更優(yōu)選至少99.9%,更優(yōu)選至少99.95%,最優(yōu)選至少99.99%的同源性。因此,RNAi優(yōu)選靶向包括這些優(yōu)選序列或其對應(yīng)序列或其同源序列的L1元件。在對特定序列作出的參考中,應(yīng)當(dāng)理解,當(dāng)該序列為DNA序列、其包括對應(yīng)的DNA序列(如雜交成前述序列的序列,特別是在高度嚴(yán)謹(jǐn)條件下,如6xSSC)或其RNA等同物,即通過轉(zhuǎn)錄所述DNA序列獲得的RNA序列。LINE-1元件(Lis)可以選自可逆轉(zhuǎn)錄元件的大的群組中,假設(shè)該元件編碼RT。優(yōu)選Lls從Ll元件的"轉(zhuǎn)錄的組A"(Ta)子集或pre-Ta子集衍生得到。然而,特別優(yōu)選為Ta子集,特別是Ta-ld家族。然而,特別優(yōu)選Lls選自LRE3、L1RP(NCBI登陸號為AF148856)和登陸號分別為ac004200、ac002980、a1356438、a1512428、ac021017和al137845,SEQIDNos.2633。這些序列和其相關(guān)的特征數(shù)據(jù)可以從NCBI網(wǎng)址http:〃www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi獲f導(dǎo)。關(guān)于SEQIDNo.26,給出的完整序列為LRE3-EGFP的合成構(gòu)建,即用EGFP(增強(qiáng)型綠色熒光蛋白)和中斷的Dlgh2基因(部分序列)標(biāo)記LRE3。然而,本領(lǐng)域技術(shù)人員容易理解,不必包括位于1155位置處的EGFP編碼區(qū)域或處于510910位置處的Dlgh2基因部分,這些可以用ORFl和ORF2代替,正如存在于提供的其他Lls中的那樣。其和進(jìn)一步信息可以從NCBI網(wǎng)站上獲得,SEQIDNo.26的登陸號為AY995186。本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠基因工程化L1,使其包括可探測標(biāo)記如EGFP,可以使用SEQIDNo,26作為起始點(diǎn)或模板。對于L1元件群體的共有序列提供在SEQIDNos.3638中。SEQID討0.36為丁&-1(1共有序列,SEQIDNo,37為熱元件共有序列,SEQIDNo.38為對于90活性Lls更大的共有序列。這些可以從Brouha等人(2003)的在線論文的"輔助信息(supportinginformation)"中獲得,該論文可以在www.pnas.org獲得。因此,優(yōu)選Ll序列選自SEQIDNos.36、37和38或其對應(yīng)序列或同源序列中的任一。同源序列優(yōu)選與所述SEQIDNo.或其對應(yīng)序列具有至少70%的同源性,更優(yōu)選至少85%,更優(yōu)選至少95%,更優(yōu)選至少99%,更優(yōu)選至少99.5%,更優(yōu)選至少99.95%,最優(yōu)選至少99.99%。由于其提高的活性,特別優(yōu)選為熱Ll共有序列SEQIDNo.37或其對應(yīng)序列或同源序列。與熱11共有序列的同源或相似性程度是對逆轉(zhuǎn)錄活性良好的預(yù)測因子。Brouha等人(2003)分析了L1活性和核苷酸序列之間的關(guān)系,構(gòu)造了具有8個(gè)熱Lls的共有序列(LRE3、L1RP、ac004200、ac002980、a1356438、a1512428、ac021027和a1137845)SEQIDNo.37。該序列除了在1033位置上的沉默ORF1改變夕卜,與Ta-ld共有序列(SEQIDNo.36)相同,除了12個(gè)多形態(tài)位置外與90個(gè)完整的Lls的共有序列(SEQIDNo.38)相同。Brouha等人(2003)比較了Lls,首先作為活性和非活性群組,然后與熱元件的共有序列配對。他們分析了整個(gè)中的Lls,然后按區(qū)域分析,最后按是否導(dǎo)致氨基酸改變的不同。結(jié)果發(fā)現(xiàn),沒有單獨(dú)與活性或非活性Lls有關(guān)的核苷酸改變。正如預(yù)期的那樣,有一些例外,Ll越接近熱L1共有序列,其越容易變成活性??紤]上述結(jié)果,他們的數(shù)據(jù)表明逆轉(zhuǎn)錄活性的降低作為時(shí)間函數(shù)產(chǎn)生的。Ll與"熱"共有序列越遠(yuǎn),其越不容易變成活性。特別優(yōu)選LINE-l元件包括與上述給出序列特別是熱Lls具有非常高程度序列同源性。其原因是,如Brouha等人討論的那樣,Ll序列越接近熱L1序列,其越容易變得活性,盡管有一些例外。如上所述,優(yōu)選LINE-1元件或序列為熱L1,優(yōu)選具有LlRp活性的至少1/3,優(yōu)選至少2/3,更優(yōu)選100%,最優(yōu)選大于100%,優(yōu)選為150%或更大。在特別優(yōu)選的熱Lls中,所有的都是多形態(tài)的,且3個(gè)(ac002980、ac004200和a1356438)來自最年輕的Ta-ld群組。此外,一個(gè)在Ta-lnd群組(al512428),另一個(gè)是較年輕的Ta-0亞群(al137845)的成員。這5個(gè)規(guī)范的熱Lls的序列與其各自的群組或亞群的共有序列非常相似,顯示出在人類中的進(jìn)化中,他們相對較近的逆轉(zhuǎn)錄。最后,一個(gè)熱L1(ac021017)為非規(guī)范的。21個(gè)核苷酸的序列,SEQIDNo.19,與90個(gè)左右(約80至100)活性L1逆轉(zhuǎn)錄因子內(nèi)存在的對應(yīng)序列是互補(bǔ)的,這些活性L1逆轉(zhuǎn)錄因子是本發(fā)明的優(yōu)選目標(biāo)。因此,RNAi優(yōu)選耙向包括此序列或?qū)?yīng)序列或其同源序列的L1元件。同時(shí),LINE-1和逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)之間的鏈己經(jīng)公知約30年,當(dāng)在清楚RT是由LINE-l編碼的基因之一時(shí),LINE-1逆轉(zhuǎn)錄因子已經(jīng)傳統(tǒng)上地歸類為沒有用處的DNA,通常被稱為"垃圾DNA"。同樣,這種垃圾DNA被普遍認(rèn)為沒有生物功能。盡管如此,本發(fā)明人還是驚奇地發(fā)現(xiàn),RT抑制可以拮抗瘤生長。本發(fā)明人是首先認(rèn)識到特定耙向LINE-1序列的RNAi抑制了培養(yǎng)中的細(xì)胞增殖和動(dòng)物模型中瘤的生長。Mangiacasale等人的Oncogene2003,Vol.22,,PP27502761,關(guān)注于藥理學(xué)上的RT抑制劑.根本沒有注意到RNAi。本發(fā)明人之一的C.Spadafora的Cytogenet.GenomeRes.2004,Vol.105,PP346360,是將現(xiàn)有技術(shù)中的各種線索(strands)結(jié)合在一起的綜述性論文,但是并沒有披露有關(guān)RNAi的內(nèi)容。RNAi優(yōu)選為雙鏈。優(yōu)選地,雙鏈核寡核苷酸并不以自由形式用于細(xì)胞轉(zhuǎn)染,但是優(yōu)選由編碼該特定siRNA的DNA結(jié)構(gòu)來攜帶。優(yōu)選地,轉(zhuǎn)錄的RNA形成雙鏈回文(palindromic)結(jié)構(gòu),其由細(xì)胞"dicer"系統(tǒng)進(jìn)一步自發(fā)地進(jìn)行,由此形成siRNA分子,例如在Brummelkamp等人2002教導(dǎo)的那樣(注意DMI,將這篇參考文獻(xiàn)插入?yún)⒖剂斜淼哪┪蔡?。另一方面,優(yōu)選用于傳送RNAi的標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞轉(zhuǎn)染程序由適當(dāng)?shù)哪孓D(zhuǎn)錄病毒或腺病毒起源的適當(dāng)傳送系統(tǒng)來替代。這種病毒系統(tǒng)是本領(lǐng)域公知的。優(yōu)選地,表達(dá)Ll靶向的RNAi的病毒載體或衣殼,優(yōu)選siRNA,能夠特定地靶向瘤細(xì)胞,且通過轉(zhuǎn)染瘤細(xì)胞導(dǎo)致RNAi表達(dá),例如通過轉(zhuǎn)錄以提供siRNA,借此導(dǎo)致拮抗瘤生長及剌激瘤細(xì)胞的分化。盡管設(shè)想了任何瘤細(xì)胞的靶向或處理,但瘤細(xì)胞優(yōu)選地選自由乳腺癌腫瘤、肺癌腫瘤、黑素瘤和前列腺癌。事實(shí)上,特別優(yōu)選為黑素瘤和前列腺癌。因此,特別優(yōu)選RNAi直接傳送至癌組織,例如通過在合適位置上注射或由植入物釋放。如上所述,特別優(yōu)選使用病毒載體或衣殼,優(yōu)選包括編碼特定siRNA的DNA結(jié)構(gòu)。在本例中,優(yōu)選能夠在目標(biāo)組織即癌或瘤組織中表達(dá)DNA結(jié)構(gòu)的病毒載體或衣殼。這可以借助包括在DNA結(jié)構(gòu)中的適當(dāng)?shù)慕M織特定啟動(dòng)子和/或借助于特定用于特定組織的病毒衣殼或載體。上述還應(yīng)用于包括編碼特定siRNA的多核苷酸優(yōu)選為DNA的質(zhì)粒。特別地,優(yōu)選這種質(zhì)粒包括合適的組織特定啟動(dòng)子或其他用于siRNA組織特定表達(dá)的方式。在質(zhì)粒和載體或衣殼的兩個(gè)例子中,優(yōu)選質(zhì)粒、載體或衣殼僅耙向癌組織,優(yōu)選以組織特定的方式。進(jìn)一步,本發(fā)明還提供了治療患有癌癥或腫瘤的患者的方法,該方法優(yōu)選包括上述RNA干擾法。優(yōu)選該方法包括選擇具有癌組織的個(gè)體,如上所述使用RNA干擾法對抗至少一個(gè)L1元件。優(yōu)選,該方法包括對逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)在治療學(xué)上有效的抑制作用,足以導(dǎo)致對癌組織增殖的抑制或阻礙,及優(yōu)選剌激所述組織的分化。同時(shí)設(shè)想了僅靶向一個(gè)L1元件,也優(yōu)選靶向多個(gè)L1元件,或者在相同時(shí)間或者先后,作為計(jì)劃的療法的一部分。另一方面,本發(fā)明還提供了多核苷酸序列的用途,優(yōu)選為DNA序列,該多核苷酸序列編碼能夠靶向或識別至少一個(gè)LINE-1元件中一部分的siRNA,用于制造治療癌癥的藥物。優(yōu)選,這種藥物包括病毒衣殼或載體,其依次包括多核苷酸。本發(fā)明將通過下面非限制性的實(shí)施例得到進(jìn)一步闡述。實(shí)施例l方法細(xì)胞培養(yǎng)人類A-375黑素瘤細(xì)胞系(ATCC-CRL-1619),TVM-A12原發(fā)性黑素瘤衍生的細(xì)胞系(TVM-A12primarymelanoma-derived)(20),HT29腺癌細(xì)胞系(ATCCHTB-38),H69小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系(SCLC)(ATCCHTB119)和PC3前列腺癌(ATCCCRL-1435)細(xì)胞系接種在六孔板中,密度為l(^5xl(^細(xì)胞/孔,在具有10X的胎牛血清的DMEM或RPMI1640培養(yǎng)基中培養(yǎng)。從商業(yè)上可獲得的Viramune(Boehringer-Ingelheim)禾卩的Sustiva(Bristol-MyersSquibb),如(18)描述的,純化奈韋拉平和依法韋侖。藥物分別在二甲亞砜(dimethylsulfoxide)(DMSO,Sigma-Aldrich)中制備350和15(iM,在接種5小時(shí)之后加入細(xì)胞;向?qū)φ罩屑尤胂嗤w積的DMSO(最終濃度的0.2。/0。每48小時(shí)更換新鮮的含有RT抑制劑的培養(yǎng)基。每96小時(shí)收集細(xì)胞,在Burker室(兩個(gè)計(jì)數(shù)/樣品)中計(jì)數(shù)并以相同密度再鋪盤。細(xì)胞周期和細(xì)胞死亡分析在收集前的最后30分鐘期間,向培養(yǎng)物中加入BrdU(20|iM)。然后,對收集的細(xì)胞進(jìn)行抗BrdU抗體和碘化丙啶(PI)處理,在FACStarPlus流式細(xì)胞測定器(Beckton-Dickinson)上進(jìn)行DNA含量和BrdU的雙參數(shù)分析。在用DAPI(細(xì)胞核形態(tài)學(xué));PI(細(xì)胞滲透性)和3,3己二基-氧雜羰花青(oxacarbocyanine)[DiOC6(3)],線粒體跨膜電位的熒光探針,聯(lián)合染色后,通過使用顯微鏡檢測細(xì)胞的死亡。間接熒光免疫檢驗(yàn)法和激光共聚焦掃描顯微鏡用4X的對-多聚甲醛固定A-375和TVM-A12IO分鐘,用以PBS為溶劑的0.2%Tritcm-X滲透5分鐘。小鼠單克隆抗牛a-微管蛋白抗體(MolecularProbes,A-11126)由AlexaFluor488耦聯(lián)的第二抗體(MolecularProbes,目錄號為A-11001)來顯示;細(xì)胞核在0.1mg/mi核糖核酸酶A存在的情況下用2iug/ml的PI染色。在LeicaTCS4D的激光共聚焦掃描顯微鏡下對樣品成像,該顯微鏡裝配有氬/氪激光(激發(fā)波長和發(fā)射波長為對于Alexa488為488nm和510nm,對于PI為568nm和590nm)。以0.5lpm的間隔截取激光共聚焦掃描的部分。掃描電子顯微鏡(SEM)在以0.1MMillonig的磷酸緩沖液為溶劑的2.5X的戊二醛溶液固定A-375和TVM-A12細(xì)胞。清洗之后,用以MPB為溶劑的1%的0804(lh,4°C)將細(xì)胞再次固定,使用增加的丙酮濃度進(jìn)行脫水。使用液態(tài)C02對樣品進(jìn)行臨界點(diǎn)干燥,并在Stereoscan240掃描電子顯微鏡(CambridgeInstr.,Cambridge,UK)檢測之前用金噴涂樣品。半定量RT-PCR如(18)中所描述的,提取RNA并用無RNase的DNaseI進(jìn)行處理。使用300ngRNA、oligo(dT)和Thermoscript系統(tǒng)(Invitrogen)合成cDNAs。使用PlatinumTaqDNA聚合酶試劑盒(Invitrogen)和30pmol寡核苷酸(MWG-Biotech,Ebersberg,Germany)對l/25的反應(yīng)混合物進(jìn)行擴(kuò)增。使用的條件是在94。C:!分鐘的起始步驟,接著以94i:30秒、5862°C30秒及在72t:i分鐘,循環(huán)30次。在具有增加的循環(huán)數(shù)(2540)的連續(xù)的擴(kuò)增系列中,使用每個(gè)oligo對。PCR產(chǎn)品進(jìn)行電泳,轉(zhuǎn)膜,并在42X:用I^P]y-ATP末端標(biāo)記的內(nèi)部寡核苷酸雜交16小時(shí)。擴(kuò)增信號的強(qiáng)度由光密度法在對每個(gè)基因的至少三個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行測量。賴7^定蘆尸Ci分祈'游寡拔芽麼d廚,F(xiàn);^瓶"鄉(xiāng)力微,"。C-mycPCR產(chǎn)品大小.633bp;F,5,-gtcacacccttctcccttcg-3,(SEQIDNO.1)R,5,-t魄ctgatgtgtggagacg-3,(SEQIDN0.2)INT,5,-agagaagctggcctcctacc-3,(SEQIDNO.3)Bcl2PCR產(chǎn)品大小,459bp:F,5,-ggtgccacctgtggtccacctg-3,(SEQIDN0.4)R,5,-cttcacttgtggcccagatagg-3,(SEQIDN0.5)INT,5,-ctgaagagctcctccaccac-3,(SEQIDN0.6)E-cadherinPCR產(chǎn)品大小,732bp:F,5,-ctcctctcctggcctcagaa-3,(SEQIDNO.7)R,5,-tactgctgcttggcctcaaa-3,(SEQIDNO.8)INT,5,-gaacgcattgccacatacac-3,(SEQIDN0.9)PSAPCR產(chǎn)品大小,584bp:F,5,-ttgtcttcctcaccctgtce-3,(SEQIDNO.10)R,5,-agcacacagcatgaacttgg-3,(SEQIDNO.11)INT,5,-ccacacccgctctacgatat-3'(SEQIDNO.12)CcndlPCR產(chǎn)品大小690bp:F,5,-ccctcggtgtcctacttcaa-3,(S£QIDNO.13)R,5,-tcctcctcttcctcctcctc-3,(SEQIDNO.14)INT,5,-cgcacgatttcattgaacac-3,(SEQIDNO.15)GapdhPCR產(chǎn)品大小,590bp:F,5,-aggggtctacatggcaactg-3,(SEQIDNO.16)R,5,畫acccagaagactgtggatgg-3'(SEQIDNO.17)INT,5,國gtcagtggtggacctgacct-3,(SEQIDNO.18)對LINE-l的RNA干擾一個(gè)21-nt的雙鏈siRNA寡核苷酸(Ll-I)設(shè)計(jì)(5,-AAGAGCAACTCCAAGACACAT-3,,SEQIDNO.19)來靶向Bruha等人(21)描述的高活性LINE-l元件的共有序列。具體地,靶向以下的序列i)八個(gè)熱Lls(LRE3(SEQIDNO.26)、L1RP(SEQIDNO.27)、ac004200(SEQIDN0.28)、ac002980(SEQIDN0.29)、al356438(SEQIDNO.30)、al512428(SEQIDNO.31)、ac021017(SEQIDNO.32)、all378459(SEQIDNO.33));ii)Ta-ld家族;iii)90個(gè)全長L1元件。對于對照,細(xì)胞用非特異性siRNA(SEQIDN0.34)轉(zhuǎn)染,其是3'-熒光素修飾以監(jiān)測轉(zhuǎn)染效率。siRNA寡核苷酸用QIAGENUSA合成。轉(zhuǎn)染是在A-375細(xì)胞中使用RNAiFect轉(zhuǎn)染試劑(QIAGEN目錄號為301605)在24孔(well)的板中加入每孔1.5pg的siRNA來實(shí)施。轉(zhuǎn)染后48小時(shí)和72小時(shí)計(jì)數(shù)細(xì)胞,在裝配有01ympusCAMEDIA數(shù)碼相機(jī)的01ympusCK30倒置顯微鏡下記錄細(xì)胞形態(tài)。約80%的細(xì)胞在24小時(shí)后被轉(zhuǎn)染,正如由熒光素顯微鏡確定的那樣。在使用了用于LINE-1ORF-l和ORF-2的特定引物對進(jìn)行轉(zhuǎn)染之后48小時(shí),用RT-PCR來分析LINE-1表達(dá)。ORF-l:F,5,-AGAAATGAGCAAAGCCTCCA-3,(SEQIDNO.20)R,5,-GCCTGGTGGTGACAAAATCT-3,(SEQIDNO.21)ORF-2:F,5,-TCCAGCAGCACATCAAAAAG-3,(SEQIDNO.22)R,5,-CCAGTTTTTGCCCATTCAGT-3,(SEQIDN0.23)RNA提取物和RT-PCR條件如在此說明的那樣,除了退火溫度為54°C以及經(jīng)過23個(gè)循環(huán)執(zhí)行擴(kuò)增以外。用于Southem分析的內(nèi)部寡核苷酸為5'匿TAAGGGCAGCCAGAGAGAAA-3,(ORF-l,SEQIDN0.24)和5,-TGACAAACCCACAGCCAATA-3,(ORF-2,SEQIDNO.25)。瘤異種移植物和動(dòng)物的治療五周大的無胸腺裸鼠(Harlan,Italy),根據(jù)歐洲聯(lián)盟指南進(jìn)行保存,用在100)ilPBS中含有A-375黑素瘤細(xì)胞(4xl06)、H69細(xì)胞(107)、PC3細(xì)胞(2xl06)和HT-29(106)細(xì)胞進(jìn)行皮下接種。小鼠每周五天地每天接受依法韋侖(20mg/kg)皮下注射,依法韋侖使用以DMSO為溶劑的4mg/ml的儲存液(stock),用生理溶液以l:l稀釋,而新鮮配置。對照用50X的DMSO注射。在瘤植入后一天或一周開始治療,在一些實(shí)驗(yàn)中,在14天后停止。每隔一天用測徑器測量裝置監(jiān)測瘤生長;使用以下公式計(jì)算體積長度x寬度x高度x0.52(22)結(jié)果針對RT-編碼LINE-1家族靶向的RNA干擾(RNAi)降低了黑素瘤細(xì)胞的增殖,并促進(jìn)黑素瘤細(xì)胞的分化我們希望毫不含糊地確定,如下討論的、對藥用RT抑制劑響應(yīng)所觀察到的生長速率降低和對分化的誘導(dǎo)是否在事實(shí)上可歸于細(xì)胞RTs的特定抑制作用。為了證實(shí)這一點(diǎn),設(shè)計(jì)RNAi實(shí)驗(yàn)來特異性地靶向LINE-1元件亞家族(subfamilies),其公知在人體細(xì)胞中最大豐富度的表達(dá)(21,上述在方法的對應(yīng)部分中描述了耙向的序列)。與LINE-10RF1(圖4,板A)同源的雙鏈RNA寡核苷酸在A-375細(xì)胞中得到轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染4872小時(shí)后誘導(dǎo)了典型的分化形態(tài)(板B)。伴隨地,與用非特異性寡核苷酸轉(zhuǎn)染的細(xì)胞相比,降低了約70X(板C)的增殖。這些結(jié)果與那些用藥用RT抑制作用獲得結(jié)果相當(dāng)。通過半量RT-PCR分析,ORFl和ORF2的表達(dá)與用非特異性寡核苷酸轉(zhuǎn)染的細(xì)胞相比都降低了幾乎80%:板D)。此外,對LINE-l元件的RNAi誘導(dǎo)了^^和^£^>7-07基因的表達(dá)下調(diào),但是并不誘導(dǎo)G4戶Z)/7基因的表達(dá)下調(diào),如對RT抑制劑藥物響應(yīng)中所見。RT抑制劑可逆地(reversibly)降低細(xì)胞增殖我們已經(jīng)調(diào)查了人類轉(zhuǎn)化細(xì)胞系對于向兩個(gè)廣泛使用的RT抑制劑即奈韋拉平和依法韋侖延長暴露(prolongedexposure)的反應(yīng)。來自A-375黑素瘤細(xì)胞、PC3前列腺癌細(xì)胞和TVM-A12原發(fā)性黑素瘤衍生的細(xì)胞系培養(yǎng)物每96小時(shí)進(jìn)行傳代、計(jì)數(shù)和再鋪盤,同時(shí)連續(xù)添加藥物至少20天(五個(gè)96小時(shí)的循環(huán))。如圖1所示,兩種抑制劑都有效地降低了所有細(xì)胞系中的細(xì)胞生長,并在延長的暴露時(shí)期具有穩(wěn)定的抑制效果。生長抑制作用是可逆的當(dāng)去除RT抑制劑,所有細(xì)胞系在一個(gè)或兩個(gè)96小時(shí)循環(huán)內(nèi)以與對照相當(dāng)?shù)乃俾驶謴?fù)增殖。藥物的再次添加再次抑制了所有細(xì)胞系中的增殖。因此,與RT抑制作用有關(guān)的細(xì)胞生長的減少并沒有作為整個(gè)細(xì)胞分裂中固定改變得到遺傳。為了說明降低增殖的基礎(chǔ),我們調(diào)査了是否任一RT抑制劑都誘導(dǎo)了A-375或PC3細(xì)胞系中的細(xì)胞死亡。用PI的聯(lián)合染色顯示出可滲透的壞死細(xì)胞,用DAPI可視化凋亡(apoptotic)細(xì)胞核,用DiOC6(3)監(jiān)測線粒體跨膜電位的損失,說明通過任一RT抑制劑都沒有顯著誘導(dǎo)細(xì)胞死亡;所記錄的低速率(暴露給任一藥物后72小時(shí)最大為15%)很大程度上由凋亡來說明(未顯示數(shù)據(jù))。因此,沒有藥物有顯著的非特異性毒性,顯示降低的細(xì)胞生長,更確切為反映了細(xì)胞周期延遲的誘發(fā)。為了證實(shí)這一點(diǎn),我們使用了雙參數(shù)的FACS分析來測量暴露給RT抑制劑4個(gè)96小時(shí)循環(huán)之后的DNA含量(通過PI顯示)和DNA復(fù)制(通過BrdU滲入顯示)。細(xì)胞周期方式(profile)在抗RT治療的培養(yǎng)物中有了顯著改變,顯示了具有GO/Gl含量的BrdU陰性細(xì)胞的比例的增加,其在A-375細(xì)胞培養(yǎng)物中特別顯著(圖1B)。藥物的去除再次建立了初始的細(xì)胞周期方式并停止了G1延遲。在轉(zhuǎn)化的細(xì)胞系中奈韋拉平誘導(dǎo)細(xì)胞形態(tài)上的分化、分化和增殖基因的表達(dá)因?yàn)楹谒亓瞿痛蠖鄶?shù)治療,因此,這與確定是否RT抑制劑誘導(dǎo)伴隨著細(xì)胞生長降低的分化有關(guān)。我們首先檢査了A-37黑素瘤細(xì)胞,其能獲得對特定分化誘導(dǎo)劑(23)響應(yīng)的典型的樹突表現(xiàn)型。如圖2A所示,由細(xì)胞形狀顯示的形態(tài)學(xué)上的分化的呈樹突延伸,并具有增加的附著,與DMSO處理的對照(a)相比,在暴露給奈韋拉平(d)或依法韋侖(g)的45天中變得很明顯。通過掃描電子顯微鏡(SEM),使用奈韋拉平(e)和依法韋侖(h)的A-375細(xì)胞培養(yǎng)物與未處理的對照(b)相比變平(flattened),并顯示出伸長的樹突延伸,其緊密地依附于基底。在a-微管蛋白免疫染色后的激光共聚焦顯微鏡進(jìn)一步顯示出微管列(array)在受RT抑制的細(xì)胞(f-i)的向外生長樹突(dendrites)中的整個(gè)長度上重新排列,其與對照(c)不同,其中短的微管集中在成核中心的周圍。在由奈韋拉平處理后的黑素瘤衍生的原發(fā)性TVM-A12細(xì)胞中觀察到類似的反應(yīng)(圖2B):通過相差(phasecontrast)(a)和SEM(b),未經(jīng)處理的細(xì)胞具有紡錘狀的形態(tài);與未經(jīng)處理的細(xì)胞(c)相比,奈韋拉平處理的TVM-A12細(xì)胞形成了替代的典型分支樹突(d-e),并顯示了良好的組織、伸長的微管列(f)。形態(tài)上分化的誘導(dǎo)表明關(guān)鍵性調(diào)控基因在對RT抑制處理做出響應(yīng)時(shí)被調(diào)節(jié)。這在僅用DMSO處理、或奈韋拉平或依法韋侖處理4個(gè)循環(huán)的培養(yǎng)物的半量RT-PCR分析中研究過。在A-375黑素瘤細(xì)胞中,我們關(guān)注一套4個(gè)基因五《a^^n'w基因,涉及細(xì)胞-細(xì)胞附著和在分化但非瘤細(xì)胞中的表達(dá)(24):c-wyc,6c/-2(25)和cydf"Z)/(26)基因,它們直接涉及黑素瘤細(xì)胞增殖和瘤生長。如圖3A所示,我們發(fā)現(xiàn),五-a^e^基因與對照相比在受RT抑制的A-375培養(yǎng)物中得到顯著上調(diào);相反,&/-2和^^//"^基因下調(diào)。記錄的一個(gè)例外是在依法韋侖中,其沒有使得cyd&D/表達(dá)下調(diào)。我們也分析了PC3前列腺癌細(xì)胞,并從分化的前列腺癌上皮細(xì)胞中選取兩個(gè)標(biāo)記基因,即前列腺特定抗原PSA(27)和雄激素受體(AR)(28)基因。這些基因沒有一個(gè)表達(dá)在未經(jīng)處理的培養(yǎng)物中,但都在對RT抑制劑的響應(yīng)中被誘導(dǎo)(圖3B)。當(dāng)抑制劑去除時(shí),所有基因的表達(dá)再次返回初始水平。因此,RT抑制藥物導(dǎo)致轉(zhuǎn)化細(xì)胞中關(guān)鍵性基因表達(dá)的重新編排,與分化誘導(dǎo)相一致,然而這種重新編排是可逆的,當(dāng)RT抑制作用消除就停止了。RT抑制劑降低了無胸腺裸鼠中人類瘤異種移植體的生長因?yàn)檗D(zhuǎn)化細(xì)胞的關(guān)鍵性特征,包括增殖和分化,通過RT抑制作用得到調(diào)節(jié),我們在活體中測試了RT抑制劑拮抗瘤生長的能力。選擇用于這些實(shí)驗(yàn)的致瘤細(xì)胞系包括A-375細(xì)胞系和PC3細(xì)胞系、以及HT29結(jié)腸細(xì)胞系和H69小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系,它們都顯示出響應(yīng)RT抑制劑降低的細(xì)胞生長(19,數(shù)據(jù)未示出)。細(xì)胞皮下接種到無胸腺裸鼠的肢中。然后,對這些動(dòng)物進(jìn)行依法韋侖處理,因?yàn)樵诔跫墝?shí)驗(yàn)中與奈韋拉平相比,該藥物在活體中具有較高效率。最佳劑量(20mg/體重kg)在測試藥物440mg/kg的劑量響應(yīng)實(shí)驗(yàn)中確定。依法韋侖處理證實(shí)在所有動(dòng)物界中是安全的,沒有動(dòng)物死亡或任一群中有明顯的中毒現(xiàn)象,盡管用40mg/kg處理的群中顯示出在超過60%的動(dòng)物中體重顯著降低。圖5顯示了在接種瘤后未經(jīng)依法韋侖處理(紅色)或經(jīng)過依法韋侖處理開始l天(紫色)或l周(黃色)的小鼠體內(nèi)瘤生長的記錄曲線。對所有異種移植體類型而言,與未經(jīng)處理的動(dòng)物相比,瘤生長在得到處理的動(dòng)物體內(nèi)得到顯著降低,不管處理開始的時(shí)間如何,不管初始瘤大小的差異,進(jìn)行性腫瘤得到相當(dāng)有效的拮抗。接種l天開始處理但在15天后停止處理的動(dòng)物體內(nèi)PC3和HT29衍生的瘤生長曲線(綠色)說明活體中瘤生長的RT依賴的(RT"dependent)抑制作用是可逆的。依法韋侖處理的PC3細(xì)胞顯示活體中致腫瘤性的降低我們己經(jīng)研究了是否用依法韋侖預(yù)先處理轉(zhuǎn)化細(xì)胞將緩和衍生異種移植體的致腫瘤性潛能。PC3前列腺癌細(xì)胞用20^iM的依法韋侖培養(yǎng)2個(gè)96小時(shí)循環(huán),其時(shí)間足夠戶SJ和^及基因的響應(yīng)(圖3B),隨后在裸鼠中接種。未處理的細(xì)胞在動(dòng)物的平行對照(parallelbatches)中接種。依法韋侖預(yù)處理或未處理的PC3細(xì)胞異種移植體然后或者連續(xù)用依法韋侖在活體中連續(xù)處理,或者留下來并不處理。如圖6A所示,未處理的PC3細(xì)胞在所有動(dòng)物中生成急性發(fā)展(aggressive)瘤。相反,依法韋侖預(yù)處理的PC3細(xì)胞顯示了活體中形成瘤能力的降低,異種移植體生長更為緩慢。如圖6B總結(jié)的那樣,依法韋侖預(yù)處理的PC3細(xì)胞在65X的接種動(dòng)物中發(fā)展了生長緩慢的異種移植體,而未處理細(xì)胞中的異種移植體為100%。此外,活體接種了預(yù)處理細(xì)胞并用依法韋侖進(jìn)一步處理的動(dòng)物僅有40%完全發(fā)展了瘤,在這種情況下,生長曲線是平的。因此,依法韋侖削弱了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的致腫瘤性潛能。討論這項(xiàng)工作突出顯示了人類基因組涉及癌的三個(gè)特征第一,LINE-1元件被鑒定為涉及細(xì)胞分化和增殖控制的機(jī)制中的活性成分;第二,LINE-l元件的RNAi依賴失活,或其編碼的內(nèi)源RT活性的藥理學(xué)抑制作用能夠恢復(fù)這些特性在轉(zhuǎn)化的細(xì)胞中的控制;第三,RT的抑制劑降低了活體動(dòng)物模型中的瘤生長。用于這項(xiàng)工作的RT抑制劑藥物,奈韋拉平和依法韋侖,通過結(jié)合在RT酶的p66亞基中的疏水孔袋(hydrophobicpocket)而具有相同的活性機(jī)制(29,30)。盡管被設(shè)計(jì)成靶向HIV編碼的RT,兩者都在體外抑制了未傳染細(xì)胞中的內(nèi)源RT的酶活性(19)。我們已經(jīng)顯示出,兩種藥物都降低了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的增殖,很大程度上獨(dú)立于細(xì)胞死亡,但是與G1延遲或停止有關(guān)。與此相隨,RT抑制劑誘導(dǎo)了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的形態(tài)分化。分化誘導(dǎo)是快速的,這與由與端粒末端轉(zhuǎn)移酶相關(guān)RT抑制劑(TERT)引起的表型改變不同,其需要長的處理時(shí)間(120天)(31)。此外,我們沒有觀察衰老細(xì)胞典型的肌動(dòng)蛋白應(yīng)力纖維(stressfiber)或focaladhesionsites的重新組織。這種缺少衰老特定修飾、和分化的快速誘導(dǎo)表明用于此的RT抑制劑并沒有靶向TERT,并誘導(dǎo)表型的低增殖分化而不是衰老。特別令人驚奇的是,RT抑制作用的特異性在RNAi實(shí)驗(yàn)中得到證明,該實(shí)驗(yàn)中RT抑制作用靶向針對在人類細(xì)胞中高度表達(dá)的六個(gè)LINE-1逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的亞群,其占整個(gè)逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子能力的84X(21)。顯著地,我們發(fā)現(xiàn),RNAi降低了LINE-l衍生的ORFl和ORF2在A-375細(xì)胞中約80%的表達(dá),表明LINE-1亞群生物活性得到有效地下調(diào)。由RNAi向RT編碼LINE-l元件的誘導(dǎo)的改變與由藥理學(xué)RT抑制劑導(dǎo)致的無明顯差別,表明LINE-1在對照細(xì)胞中增殖和分化。使用獨(dú)立途徑觀察到的表型相似性指出,UNE-1表達(dá)的抑制、或RT活性的抑制足夠延遲增殖并促進(jìn)分化。這些觀察結(jié)果指出,藥物的任何未知副作用并不歸于以非特定方式觀察到的表型。與降低生長和分化形態(tài)的誘導(dǎo)相一致,我們發(fā)現(xiàn),所選基因小組(panel)在RT抑制作用的表達(dá)響應(yīng)中進(jìn)行重排。這顯示,RT活性能有效調(diào)控基因表達(dá),這些基因促使從高增殖、轉(zhuǎn)化的表型向低增殖、分化的表型轉(zhuǎn)化,表明基因組功能是藥物或RT依賴的RT活性的抑制作用的最終靶標(biāo)。然而,基因表達(dá)中的改變并不通過細(xì)胞分裂來遺傳,而是當(dāng)RT抑制作用削除后可逆。檢測特征的可逆性及其對抑制藥物存在的依附性與以下概念-一致,即LINE-1編碼的RT是調(diào)控基因表達(dá)的表觀遺傳學(xué)機(jī)制(epigeneticmechanism)的一部分,并對主要的細(xì)胞增殖和分化的分子機(jī)制起作用。該研究的一方面是,RT抑制藥物降低接種有四個(gè)人類異種移植物模型的活體裸鼠體內(nèi)瘤生長的能力。瘤生長得到抑制,只要向動(dòng)物供給RT抑制劑,然而,一旦停止治療就會恢復(fù),正如在細(xì)胞系中觀察的那樣。雖然這些數(shù)據(jù)說明了RT抑制劑在治療癌癥中有前途的細(xì)胞生長抑制的能力,其證實(shí)了內(nèi)源RT在瘤生長中的表觀遺傳學(xué)作用。此外,依法韋侖對PC3前列腺細(xì)胞的體外預(yù)處理削弱了其活體內(nèi)致腫瘤性。因此,分化標(biāo)記的活性和與RT抑制作用有關(guān)的降低增殖都是能削弱活體內(nèi)轉(zhuǎn)化細(xì)胞惡性表型的大范圍程序重排(reprogramming)的一部分。生長數(shù)據(jù)指出,表觀遺傳學(xué)改變能夠程序重排瘤細(xì)胞,將轉(zhuǎn)化表型轉(zhuǎn)化成"正常"非病態(tài)狀態(tài)(32,33)。表觀遺傳學(xué)程序重排能繞過在多種瘤中最初導(dǎo)致惡性轉(zhuǎn)化的基因變更(32)。因此,表觀遺傳學(xué)調(diào)節(jié)因素認(rèn)為是瘤治療中有價(jià)值的、值得挑戰(zhàn)的目標(biāo)(34)。然而,許多受試化合物通常被證明是毒性和/或化學(xué)性不穩(wěn)定。奈韋拉平和依法韋侖用于AIDS治療已經(jīng)多年;在癌癥治療中使用這些RT抑制劑的前景將具有明顯的優(yōu)勢,對于連續(xù)給藥通常具有好的耐藥性(tolerance)的流行病學(xué)記錄。此外,流行病學(xué)證據(jù)表明卡波濟(jì)(氏)肉瘤(35)和其他AIDS有關(guān)的癌(36)在用高活性抗逆轉(zhuǎn)錄酶病毒治療(HAART)處理的患者中具有降低的發(fā)生頻率雖然通常認(rèn)為是在受處理患者體內(nèi)提高了免疫反應(yīng)的一種反映,它也能表明對于瘤細(xì)胞中內(nèi)源RT活性的HAART的直接抑制效果。在這一階段,通過RT活性能指導(dǎo)細(xì)胞命運(yùn)的機(jī)制仍然不清楚。逆轉(zhuǎn)錄能在裂殖酵母中有助于異染色質(zhì)形成(37)。盡管這種機(jī)制沒有在較高級的真核細(xì)胞中得到驗(yàn)證,我們實(shí)驗(yàn)室的工作表明,LINE-1編碼的RT涉及DNA甲基化作用(methylation)的重新分配中,和基因表達(dá)的染色質(zhì)再塑依賴(remodeling-dependent)的調(diào)節(jié)。總的來說,內(nèi)源RT的形成作為高增殖和損失分化有關(guān)的細(xì)胞機(jī)制的"功能性"標(biāo)記,能被認(rèn)為是癌治療中的新型潛在靶標(biāo)。數(shù)據(jù)能特別地支持前列腺癌,其中AR表達(dá)的損失是激素治療失敗的主要原因。因?yàn)镽T抑制劑對AR和PSA進(jìn)行上調(diào),這些分化誘導(dǎo)化合物可能對于恢復(fù)前列腺癌細(xì)胞中雄性激素靈敏性有幫助。實(shí)施例2A)LINE-l耙向的siRNA表達(dá)DNA結(jié)構(gòu)的克隆siRNA靶向序列是由己知在人類細(xì)胞中高度活性的LINE-1元件衍生得到的(Brouha等,2003,supplementarymaterial)。該耙向序列為60bp長(從14921552),在SEQIDN0.35中列出,作為雙鏈DNA而人工合成。然后,將DNA寡核苷酸克隆入商業(yè)可獲得的載體pSuper.retro.neo+GFP中(OligoEngine,USA,目錄號K五C-i^r-0W6)。B)逆轉(zhuǎn)錄酶病毒載體的裝配然后,該結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)染入產(chǎn)生逆轉(zhuǎn)錄病毒的Phi-NX細(xì)胞(由ATCC獲得)中被,包裝在新近合成的逆轉(zhuǎn)錄病毒顆粒中,再自發(fā)地從細(xì)胞釋放到培養(yǎng)基中。轉(zhuǎn)染48小時(shí)后,利用離心法收集逆轉(zhuǎn)錄病毒顆粒(稱為pS-Lli),通過0.45微米的微孔過濾器過濾,再用于細(xì)胞轉(zhuǎn)染。該方法根據(jù)制造商的說明來執(zhí)行(OligoEngine)。C)人類瘤基因細(xì)胞系的轉(zhuǎn)染通過將被轉(zhuǎn)染細(xì)胞的上清液與細(xì)胞培養(yǎng)物簡單混合并培育24小時(shí),而用PS-Lli轉(zhuǎn)染A375(黑素瘤)和PC3(前列腺癌)的人類細(xì)胞系。然后,在新霉素存在的情況下選取被轉(zhuǎn)染的細(xì)胞7天。所有抗新霉素的細(xì)胞都是GFP報(bào)告基因表達(dá)為陽性。作為對照,來自相同細(xì)胞系的平行培養(yǎng)物用包含空DNA載體(pS)(沒有siRNA編碼序列)的逆轉(zhuǎn)錄病菌顆粒轉(zhuǎn)染。如圖7所示,受pS-Ll感染的細(xì)胞顯示了增殖的急劇降低,其保持恒定至少39天。未感染細(xì)胞維持高的增殖速率,受pS感染的細(xì)胞顯示出在轉(zhuǎn)染后最初幾天里增殖的溫和降低,但隨后快速恢復(fù)到與未轉(zhuǎn)染細(xì)胞相當(dāng)?shù)母咴鲋?。與這些數(shù)據(jù)良好相關(guān)的是,LINE-1(ORFl和ORF2)表達(dá)在感染pS-Ll的細(xì)胞中強(qiáng)烈下調(diào),但在pS轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中沒有下調(diào),在RNA和蛋白質(zhì)水平上都下調(diào),正如使用特定抗體的westemblot分析(數(shù)據(jù)未示出)所顯示的那樣。D)受pS-Ll感染的A375細(xì)胞具有降低的致腫瘤性,正如通過在裸鼠中接種作出的活體內(nèi)檢測所確定的那樣。為了評價(jià)pS-Lli細(xì)胞的致瘤潛能是否受到影響,用pS載體或用LINE-l敲除的pS-Lli結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)染的5xl(fA375細(xì)胞,在兩組無胸腺裸鼠中皮內(nèi)接種(感染后15天).然后,監(jiān)測兩組小鼠體內(nèi)的瘤進(jìn)程圖8中板A示出了接種A375pS和A375pS-Ll逾胞的小鼠體內(nèi)瘤生長的進(jìn)程。板B中實(shí)施例顯示與接種對照細(xì)胞的小鼠相比,接種LINE1干擾的細(xì)胞的小鼠體內(nèi)瘤生長有顯著降低。這些結(jié)果一起支持以下結(jié)論LINE1基因活性有助于轉(zhuǎn)化細(xì)胞的增殖,并能認(rèn)為是基因癌治療中的新型潛在靶標(biāo)。因此,為了通過基因治療提高本發(fā)明的利用,將以下兩個(gè)改進(jìn)引入到所說明的方法中i)雙鏈ribo寡核苷酸并不以自由形式用于細(xì)胞轉(zhuǎn)染,而是由編碼特定siRNA的DNA結(jié)構(gòu)攜帶。轉(zhuǎn)錄的RNA形成雙鏈回文結(jié)構(gòu),其通過細(xì)胞"dicer"系統(tǒng)進(jìn)一步自發(fā)進(jìn)行,由此形成siRNA分子(Brummelkamp等,2002,參考文獻(xiàn)38)ii)標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞轉(zhuǎn)染程序必須通過逆轉(zhuǎn)錄病毒或腺病毒來源的適當(dāng)傳輸系統(tǒng)來替代。換句話說,本方法的改進(jìn)在于表達(dá)LINE-l耙向的siRNA的病毒載體的發(fā)展,siRNA將用于感染瘤。LINE-l靶向的siRNA表達(dá)結(jié)構(gòu)通過病毒載體在致瘤細(xì)胞中傳遞,由此,抑制內(nèi)源LINE-1表達(dá)。基于我們之前的實(shí)驗(yàn),用這種方式獲得的組成性功能敲除的LINE-1將強(qiáng)烈拮抗瘤進(jìn)程。參考文獻(xiàn)1.Deininger,P.-L.,Moran,J.-V.,Batzer,M.-A.&Kazazian,H.-H.(2003)CurrOpGenDev;〗3,651-8.2.Kiessling,A,A.,Crowell,R.&Fox,C.Proc.(1989)Acad.Natl.Sci.USA86,51009-51133.Giordano,R.,Magnano,A.-R.,Zaccagnini,G.,Pittoggi,C,Moscufo,N.,Lorenzini,R.&Spadafora,C.(2000)J.CellBiol.148,1107-11134.Poznanski,A,A,&Calarco,P.-G.(1991)DevBiol.143,271-81.5.Packer,A,L,Ma雨a,K.&Bacharova,R,F.(1993)DevBiol.157281-3.6.Mwenda,J,M.(1993)CellMolBiol.39,317-28.7.Deragon,J.-M.,Sinnett,D.&Labuda,D.(1990)EMBOJ.9,3363-8.8.Martin,S,L.(1991)MolCellBiol.11,4804-7.9.Martin,S,L.&Branciforte,D.(1993)MolCellBiol.13,5383-2.10.Hagan,C-R;,She伍eld,R,F.&Rudin,C-M.(2003)NatGenet.35219-20.11.U,T,H.&Schmid,C-W.(2001)Gene.276,135-41.12.Hagan,C-R.&Rudin,C-M.(2002)AmJPharmacogenomics.2,25-36.13.Khan,A,S.,Muller,J.&Sears,J.-F.(2001)VirusRes.79,39-45.14.Friedlander,A.&Patarca,R.(1999)CritRevOncogenesis.10,129-5915.Ostertag,E.-M.&ICazazian,H.-H.Jr.(2001)AnnuHevGenet.35,501-38.16.Kuo,K,W.,Sheu,H,M.,Huang,Y.-S.&Leung,W,C(1998)BiochemBiophysResComm.253,566-70.17.Crone,T,M.,Schalles,S,L,Benedict,C-M.,Pan,W.,Ren,L,Loy,S,E.,Isom,H.&Clawson,G.曙A.(1999)H印athology.29,1114-23.18.Pittoggi,C,Sciamanna,L,Mattei,E.,Beraldi,R.,Lobascio,A.醫(yī)M"Mai,A.,Quaglia,M,G.,Lorenzini,R.&Spadafora,C(2003)Mol.Reprod.Dev.66:,225-36.19.Mangiacasale,R.,Pittoggi,C,Sciamanna,I.,Careddu,A.,Mattei,E.,Lorenzini,R.,Travagiini,L.,Landriscina,M.,Barone,C,Nervi,C,Lavia,P.&Spadafora,C(2003)Oncogene.22,2750-61.20.Melino,G.,SinibaldiVallebona,P.,D'Atri,S.,Annichiarico-Petruzzelli,M"Rasi,G.,Catani,M.V.,Tartaglia,M.I.,Vemole,P.,Spagnoli,L.G-,Finazzi-Agr[omicron],A.&Garaci,E.(1993)ClinChemEnzymComms.6,105-19.21.Brouha,B.,Schustak,J.,Badge,R.-M.,Lutz-Prigge,S.,Farley,A,H.,Moran,J,V.&Kazazian,H,H.,Jr.(2003)ProcNatlAcadSclUSA100,5280-5285,availableat:http:〃www.pnas.Org/cgi/content/rull/100/9/5280.Supportinginformationisavailableat:http:〃www.pnas.org/cgi/content/fiill/0831042100/DC122.Umekita,Y.,Hiipakka,R.-A.,Koknotis,J.-M.&Shutsung,L.(1996)ProcNatlAcadScLUSA93,11802-7.23.Sauane,M.,Gopalkrishnan,R.-V.,Sarkar,D.,Su,Z,-Z.,Lebedeva,I,V.,Dent,P.,Pestka,S.,&Fisher,P,B.(2003)CytGrowthFacRev.14,35-51.24.Hsu,M,Y"Meier,F,E"Nesbit,M"Hsu,J,Y"VanBelle,P.,Elder,D,E.,&Herlyn,M.(2000)AmJPathol.156,1515-25.25.Utikal,J"Leiter,U"Udart,M.,Kaskel,P.,Peter,R.-U.&Krahn,G,M.(2002)CancerInvest.20,914-21.26.Sauter,E.-R.,Yeo,U.-C,VonSte腿,A.,Zhu,W.,Iitwin,S.,Tichansky,D,S.,Pistritto,G.,Nesbit,M.,Pinkel,D.,Heri,M.&Bastian,B.-C.(2002)CancerRes.62,3200-6.27.Lilja,H.(2003)Urology.62(5,Suppl1),27-33.28.Linja,M.-J.,Savmainem,K.-J.,Saramaki,0.-R.,Tammela,T.-L.,Vessella,R.-L.&Visakorpi,T.(2001)CancerRes.61,3550-5.29.DiMarzoVeronese,F.,Copeland,T.-D.,DeVico,A.-L,Rahman,R.,Oroszlan,S.,Gallo,R,C.&Samgadharan,M,G.(1986)Science.231,1289-91.30.Ren,J.,Nichols,C,Bird,L.,Chamberlain,P.,Weaver,K.,Short,S"Stuart,D,I.&Stammers,D,K.(2001)飾/Biol;312,795-805.31.Damm,K.,Hemmann,U.,Garin-Chesa,P.,Hauel,N.,Kaufftnann,L,Priepke,H.,Niestroj,C,Daiber,C,Enekel,B.,Guilliard,B.,一Lauritsch,L,Muller,E.,Pascolo,E.,Sauter,G.,Pantic,M.,Martens,U.M"Wenz,C5Lingner,J.,Kraut,N.,Rettig,W.-J.,&Schnapp,A.(2001)EMBOJ.20,6958-68.32.Lotem,J.&Sachs,L.(2002)CancerBiol.12,339-46.33.Li,L.,Connelly,M.-C,Wetmore,C,Curran,T.&Morgan,J.-I.(2003)CancerRes.63,2733-6.34.Egger,G.,Liang,G.,Aparicio,A.&Jones,P.A.(2004)Nature.429,457-63.35.Portsmouth,S.,Stebbing,J.,Gill,J.,Mandalia,S.,Bower,M.,Nelson,M.,Bower,M.,&Gazzard,B.(2003)AIDS.17,F17-F22.36.Tirelli,U.&Bernardi,D.(2001)EurJCancer.37,1320-4.37.Schramke,V.&Allshire,R.(2003)Science.301,1069-74.38.BrummelkampTR,BernardsRandAgamiR(2002)asystemforstableexpressionofshortinterferingRNAsinmammaliancells.Sciente296,550-552LIRP上的附加信息NCBI接收號為AF148856,可以從以下網(wǎng)站獲得,http:〃www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgidb=nucleotide&val=5070620,且在下述內(nèi)容中描述參考文獻(xiàn)39(堿基從16019)作者Schwahn,U.,Lenzner,S.,Dong,J.,Feil,S.,Hinzmann,B.,vanDuijnhoven,G.,Kirschner,R.,Hemberger,M.,Bergen,A.A.,Rosenberg,T.,Pinckers,A丄,F(xiàn)undele,R.,Rosenthal,A.,Cremers,F.P,,Ropers,H.H.andBerger,W.標(biāo)題PositionalcloningofthegeneforX-linkedretinitispigmentosa2JOURNALNatGenet,19(4),327-332(1998)PUBMED9697692參考文獻(xiàn)40(堿基從16019)作者Kimberland,M丄.,Divoky,V.,Prchal,J.,Schwahn,U.,Berger,W.Kazazian,H.H.Jr.TITLEFull-lengthhumanLIinsertionsretainthecapacityforhighfrequencyretrotranspositioninculturedcellsJOURNALHum.MoLGenet.8(8),1557-1560(1999)PUBMED10401005參考文獻(xiàn)41(堿基從16019)作者Kimberland,M丄.,Kazazian,H.H.andSchwahn,U.標(biāo)題直接提交(DirectSubmission)JOURNAL提交(06-MAY-1999)Genetics,SchoolofMedicine,UniversityofPennsylvania,515CRB,415CurieBlvd.,Philadelphia,PA19104,USA重要序列SE(JIDNO.47:5,-AAGAGCAACUCCAAGACACAU-3'SEQIDNO.45:MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQTKGKEVENFfiKNLEECITRlTNTEKCLKELMELKTKARELREECRSLRSRCDQLEERVSAMEDEMNEMKREGKFREKRIKRNEQSLQEIWDYVKRPNLRLIGVPESDVENGTKLENTLQD11QENFPNLARQANVQIQEIQRTPQRYSSRRATPRHHVRFTKVEMKEKMLRAAREKGRVTLKGKPIRLTADLSAETLQARREWGPIFNILKEKNFQPRISYPAKLSFSEGEIKYFIDKQMLRDFVTTRPALKELLKELNMERNNRYQPLQNHAKM338SEQIDNO.46:MTGSTSHITILTLN1NGLNSAIKRHRLASWIKSQDPSVCCIQETHLTCRDTHRLKIKGWRKIYQANGKQKKAGVAILVSDKTDFKPTKIKRDKEGHYIMVKGSIQQEELTILNIYAPNTGAPRFIKQVLSDLQRDLDSHTLIMGDFNTPLSTLDRSTRQKVNKDTQELNSALHQADLIDIYRTLHPKSTEYTFFSAPHHTYSKIDHIVGSKALLSKCKRTE誦YLSDHSAIKLELRIKNLTQSRSTTWKLNNLLLNDYWVHNEMKAEIKMFFETNENKDTTYQNLWDAFKAVCRGKFIALNAYKRKQERSKIDTLTSQLKELEKQEQTHSKASRRQEITKIRAELKEIETQKTLQKINESRSWFFERIMKIDRPLARLIKKKREKNQIDTlKNDKGDnTDPTEIQTTlREYYKHLYANKLENLEEMDTFLDTYTLPRLNQEEVESLNRPITGSEIVAIINSLPTKKSPGPDGFTAEFYQRYKEELVPFLLKLFQSlEKEGlLPNSFYEASnLIPKPGRDTTKKENFRPISLMNIDAKILNKILANRIQQHIKKLIHHDQVGFIPGMQGWFNIRKSINVIQHINRAKDKNHMTISIDAEKAFDKIQQPFMLKTLNKLGIDGTYFKnRAIYDKPTANnLNGQKLEAFPLKTGTRQGCPLSPLLFNIVLEVLARAIRQEKEIKGIQLGKEEVKLSLFADDMIVYLENPIVSAQNLLKLISNFSKVSGYKINVQKSQAFLYTNNRQTESQIMGELPFTIASKRIKYLGIQLTRDVKDLFKENYKPLLKEIKEETNKWKNIPCSWVGRINIVKMAILPKVIYRFNAIPIKLPMTFFTELEKTTLKFIWNQKRARIAKSILSQKNKAGGITLPDFKLYYKATVTKTAWYWYQNRD!DQWNRTEPSElMPfflYNYLIFDKPEK>JKQWGKDSLFNKWCWENWLAICRKLKLDPFLTPYTKINSRWIKDLNVKPKTIKTLEENLGrnQDIGVGKDFMSKTPKAMATKDKIDKWDLIKLKSFCTAKETTIRVNRQPTTWEKIFATYSSDKGLISRIYNELKQ1YKKKTNNPIKKWAKDMNRHFSKEDIYAAKKHMKKCSSSLAIREMQIKTTMRYHLTPVRMAI1KKSGNNRCWRGCGEIGTLLHCWWDCKLVQPLWKSVWRFLRDLELE1PFDPA1PLLGIYPNEYKSCCYKDTCTRMFIAALFTIAKTWNQPKCPTMIDWTKKMWHIYTMEYYAA1KNDEF1SFVGTWMKLETIILSKLSQEQKTKHRIFSLIGGN1275SEQIDN036(a)Ta-ld共有6,021核苷酸5'-GGGGGAGGAGCCAAGATGGCCGAATAGGAACAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGTGATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGGGCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCACCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGACGCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCGAATATTGCGCTnTCAGACCGGCTTAAGAAACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCGGAGGGTCCTACGCCCACGGAATCTCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACTGCAAGGCGGCAACGAGGCTGGGGGAGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAACTGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGGGGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTCTGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGCAGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACTCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCACCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACGGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCTGAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACCCATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAAAACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAACGCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAGAAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACc^aaggcaaagaagttgaaaactttgaaaaaaatttagaagaatgtataactagaataaccaatacagagaagtgcttaaaggagctgatggagctgaaaaccaaggctcgagaactacgtgaagaatgcagaagcctcaggagccgatgtgatcaactggaagaaagggtatcagcaatggaagatgaaatgaatgaaatgaagcgagaagggaagtttagagaaaaaagaataaaaagaaatgagcaaagcctccaagaaatatgggactatgtgaaaagaccaaatctacgtctgattggtgtacctgaaagtgatgtggagaatggaaccaagttggaaaacactctgcaggatattatccaggagaacttccccaatctagcaaggcaggccaacgttcagattcaggaaatacagagaacgccacaaagatactcctcgagaagagcaactccaagacacataattgtcagattcaccaaagttgaaatgaaggaaaaaatgttaagqgcagccagagagaaaggtcgggttaccctcaaaggaaagcccatcagactaacagcggatctctcggcagaaaccctacaagccagaagagagtgggggccaatattcaacattcttaaagaaaagaattttcaac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部分。文檔編號A61P35/00GK101151371SQ200580048836公開日2008年3月26日申請日期2005年12月30日優(yōu)先權(quán)日2004年12月30日發(fā)明者C·斯帕達(dá)福拉,C·梅亞雷列,C·皮托吉,E·加拉奇,I·夏曼納,P·西尼巴爾迪申請人:高等健康研究院;E·加拉奇;P·西尼巴爾迪