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      花色苷及調(diào)控ywhag基因的表達(dá)在防治動(dòng)脈粥樣硬化中的應(yīng)用的制作方法

      文檔序號:1230718閱讀:337來源:國知局

      專利名稱::花色苷及調(diào)控ywhag基因的表達(dá)在防治動(dòng)脈粥樣硬化中的應(yīng)用的制作方法
      技術(shù)領(lǐng)域
      :本發(fā)明涉及一種花色苷的單體,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷改善氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)致小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系損傷的作用,并探討其作用機(jī)制。因此,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷可在制備治療或預(yù)防動(dòng)脈粥樣硬化發(fā)生發(fā)展的藥物中應(yīng)用。為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)措施本發(fā)明采用小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞(小鼠單核巨噬細(xì)胞白血病細(xì)胞,來源于上海中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會(huì)細(xì)胞庫,目錄號TCM13)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),通過噻唑藍(lán)(MTT)法測定矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷(購于美國Sigma公司,目錄號74397)對ox-LDL處理的RAW264.7巨噬細(xì)胞活性的影響。并提取細(xì)胞總RNA,用AffymetrixMouseU4302.0基因表達(dá)譜芯片(來源于美國Affymetrix公司)進(jìn)行標(biāo)記雜交實(shí)驗(yàn),RMA(Robustmultiarrayanalysis)法對Affyemtrix基因芯片的掃描結(jié)果進(jìn)行差異基因分析,篩選出差異基因,隨后采用實(shí)時(shí)定量PCR法對表達(dá)的差異基因進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證,具體探討矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷的作用機(jī)制。具體
      發(fā)明內(nèi)容如下A.矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷為花色苷單體(購買于美國Sigma公司,目錄號74397),可人工合成,研究證實(shí)無任何毒副作用。B.矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞的作用將培養(yǎng)的小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞(來源于上海中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會(huì)細(xì)胞庫,目錄號TCM13)接種于96孔板,待細(xì)胞長成80~90%融合的單層后,隨機(jī)分為6組,即空白對照組、30、60、90、120、150pmol/L花色苷組,每組重復(fù)8孔,分別加以0、30、60、90、120、150pmol/L矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷處理,置于37。C、5%C02培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24小時(shí)后,以3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴鹽(噻唑藍(lán),MTT)法檢測細(xì)胞的存活率,倒置相差顯微鏡觀察細(xì)胞的形態(tài)。C.矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)致小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系損傷的改善作用將培養(yǎng)的小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞接種于96孔板,待細(xì)胞長成80~90%融合的單層后,隨機(jī)分為6組,即空白對照組、0、30、60、90、120pmol/L花色苷組,每組重復(fù)8孔,實(shí)驗(yàn)中先以0、30、60、90、120pmol/L濃度的矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷預(yù)處理細(xì)胞1小時(shí),然后加入ox-LDL(終濃度40mg/L),空白對照組用無血清常規(guī)RPMI1640培養(yǎng)基代替ox-LDL和花色苷,置于37。C、5y。C02培養(yǎng)箱中共同孵育24小時(shí)后,以倒置相差顯微鏡觀察細(xì)胞的形態(tài),MTT法檢測細(xì)胞的存活率。D.矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對ox-LDL處理小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系基因表達(dá)譜的作用將培養(yǎng)的小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞接種于60ml培養(yǎng)瓶中,待細(xì)胞長成80~90%融合的單層后,隨機(jī)分為3組,g口①對照組RPMI1640培養(yǎng)基常規(guī)培養(yǎng)細(xì)胞;②ox-LDL組ox-LDL終濃度為40mg/L;③花色苷+ox-LDL組先用60pmol/L的花色苷培養(yǎng)細(xì)胞1小時(shí),然后加入終濃度為40mg/L的ox-LDL。每組重復(fù)3次,各組細(xì)胞繼續(xù)培養(yǎng)24小時(shí)后收獲細(xì)胞,分別提取純化各組細(xì)胞總RNA,利用AffymetrixMouseU4302.0基因表達(dá)譜芯片(來源于美國Affymetrix公司)進(jìn)行標(biāo)記雜交實(shí)驗(yàn),RMA(Robustmultiarrayanalysis)法對Affyemtrix基因芯片的掃描結(jié)果進(jìn)行差異基因分析,篩選出差異基因。E.矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對ox-LDL處理小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系YWHAG(酪氨酸3-單加氧酶/色氨酸5-單加氧酶激活蛋白,Y多肽)基因表達(dá)的作用將培養(yǎng)的小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞接種于60ml培養(yǎng)瓶中,待細(xì)胞長成80~90%融合的單層后,隨機(jī)分為3組,即①對照組RPMI1640培養(yǎng)基常規(guī)培養(yǎng)細(xì)胞;②ox-LDL組ox-LDL終濃度為40mg/L;③花色苷+ox-LDL組先用60pmol/L的花色苷培養(yǎng)細(xì)胞1小時(shí),然后加入終濃度為40mg/L的ox-LDL。每組重復(fù)3次,各組細(xì)胞繼續(xù)培養(yǎng)24小時(shí)后收獲細(xì)胞,分別提取純化各組細(xì)胞總RNA,用實(shí)時(shí)定量PCR法對基因芯片篩選出的差異基因YWHAG的表達(dá)進(jìn)行檢測。本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比,具有以下優(yōu)點(diǎn)和效果1、矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷為一種花色苷的單體,化學(xué)結(jié)構(gòu)清楚,可人工合成,研究證實(shí)無任何毒副作用。2、本發(fā)明表明,當(dāng)矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度為30、60、90、120pmol/L時(shí),小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞呈橢圓形,細(xì)胞生長狀態(tài)良好,MTT結(jié)果顯示細(xì)胞活力與正常對照組沒有顯著差異。說明矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度在30120pmol/L范圍內(nèi)為安全濃度。3、本發(fā)明表明,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度在30~120pmol/L范圍內(nèi)均可改善ox-LDL對RAW264.7細(xì)胞的損傷作用,且其改善作用沒有劑量依賴性。4、本發(fā)明表明,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷主要保護(hù)了ox-LDL對脂質(zhì)內(nèi)膜的破壞,增強(qiáng)了細(xì)胞增殖能力和組織結(jié)構(gòu)的再形成能力。5、本發(fā)明表明,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷能上調(diào)ox-LDL導(dǎo)致的YWHAG蛋白基因的低表達(dá),從而發(fā)揮其抗動(dòng)脈粥樣硬化作用。圖1.不同濃度花色苷作用于RAW264.7巨噬細(xì)胞24小時(shí)后細(xì)胞活力比較。*與對照組比較,p<0.05。圖2.不同濃度花色苷對氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)處理的RAW264.7巨噬細(xì)胞活力的影響。*與對照組比較,P<0.05;#與ox-LDL組比較,P〈0.05。圖3.顯微鏡下觀察120pmol/L花色苷對氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)處理RAW264.7巨噬細(xì)胞的形態(tài)(x200)。圖4.定量PCR中Ct值(Cyclethreshold,循環(huán)閾值)設(shè)定示意圖。圖5.定量PCR法檢測各組細(xì)胞中YWHAG基因的表達(dá)水平。具體實(shí)施例方式下面用矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷進(jìn)行關(guān)于對氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)處理的小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系保護(hù)作用的實(shí)驗(yàn)研究及機(jī)制探討,說明其在制藥領(lǐng)域的新用途。實(shí)施例1:矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞的作用1實(shí)驗(yàn)材料1.1實(shí)驗(yàn)藥物矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷為花色苷的一種單體,購于美國Sigma公司,目錄號74397,英文名Cyaninchloride,也稱為Cyanidin-3,5-di-0-glucoside,分子式C27H31C10I6,分子量646.98,化學(xué)結(jié)構(gòu)如下所示。一OH1.2實(shí)驗(yàn)對象小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞即小鼠單核巨噬細(xì)胞白血病細(xì)胞,來源于上海中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會(huì)細(xì)胞庫,目錄號TCM13。1.3試劑3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴鹽(噻唑藍(lán),MTT)購自美國Fluka公司;二甲基亞砜(DMSO)購自美國Sigma公司;RPMI-1640培養(yǎng)基及胎牛血清購自美國GibC0公司;胰蛋白酶購自武漢生命科學(xué)技術(shù)公司。1.4儀器二氧化碳培養(yǎng)箱購自美國SHEL-LAB公司;超凈工作臺(YJ-1450型)購自蘇州凈化設(shè)備公司;倒置相差顯微鏡購自德國LEICA公司;熒光酶標(biāo)儀購自瑞士TECAN公司。2實(shí)驗(yàn)方法2.1RAW264.7細(xì)胞的培養(yǎng)正常生長的RAW264.7細(xì)胞培養(yǎng)于含10%胎牛血清、20%mmol/L4-羥乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)及125mg/L谷氨酸鹽的RPMI-1640培養(yǎng)基中,培養(yǎng)條件為37°C、5%C02,接種密度為1x107個(gè)/L,倍增時(shí)間為4S72h。2.2分組及給藥方法采用不含血清的RPMI-1640培養(yǎng)基依次稀釋矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷。常規(guī)培養(yǎng)RAW264.7細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為1x107個(gè)/L,然后均勻接種于無菌96孔培養(yǎng)板中,37°C、5%(302培養(yǎng)24小時(shí),使細(xì)胞生長成良好單層。實(shí)驗(yàn)開始前用等體積無血清培養(yǎng)基靜止培養(yǎng)24小時(shí)使細(xì)胞同步化,隨后隨機(jī)分為①空白對照組無血清培養(yǎng)基培養(yǎng);②花色苷組矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷終濃度分別為30、60、90、120、150nmol/L。每組重復(fù)8孔,置于37。C、5%(302培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24小時(shí)后進(jìn)行檢測。2.3MTT法培養(yǎng)于96孔板中的細(xì)胞處理結(jié)束后,吸出細(xì)胞孔中的殘余液體,用預(yù)熱至37'C的PBS溶液漂洗2次;然后每孔加20^的MTT(5mg/ml溶于磷酸鹽緩沖液)溶液及180^的不含血清的RPM-I1640培養(yǎng)基,于37。C繼續(xù)培養(yǎng)4小時(shí);隨后每孔加入100^DMSO,在水平搖床上緩慢振蕩IO分鐘,以溶解細(xì)胞中的紫色結(jié)晶物;最后在酶標(biāo)儀上570nm處測定其光吸收值。細(xì)胞對照空OD值-實(shí)驗(yàn)孔OD值細(xì)胞增殖抑制率(%)=-,一—"~^-X100%細(xì)胞對照空OD值2.4觀測的指標(biāo)(1)倒置相差顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)改變(2)MTT法檢測細(xì)胞活力2.5數(shù)據(jù)處理數(shù)據(jù)以5is表示,多組均數(shù)進(jìn)行方差齊性檢驗(yàn)和單因素方差分析,各組間的比較采用Tukey法。3實(shí)驗(yàn)結(jié)果倒置相差顯微鏡觀察顯示,正常的RAW264.7細(xì)胞呈橢圓形或多邊形,貼壁生長。當(dāng)矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度為30、60、90、120pmol/L時(shí),細(xì)胞仍呈橢圓形,細(xì)胞生長狀態(tài)良好。當(dāng)矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度達(dá)150pmol/L時(shí),.出現(xiàn)部分細(xì)胞脫落、漂浮。MTT實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖l)顯示,當(dāng)矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度為30、60、90、120pmol/L時(shí),細(xì)胞活力與正常對照組無明顯差異。當(dāng)矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度達(dá)150]imol/L時(shí),細(xì)胞活力與正常對照組相比明顯下降。以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度在30120^mol/L范圍內(nèi)為安全濃度。實(shí)施例2:矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對ox-LDL致小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系損傷的改善作用1實(shí)驗(yàn)材料1.1實(shí)驗(yàn)藥物矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷同具體實(shí)施例l。1.2實(shí)驗(yàn)對象小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞同具體實(shí)施例1。1.3試劑ox-LDL購自北京協(xié)和生化室;MTT購自美國Fluka公司;DMSO購自美國Sigma公司;RPMI-1640培養(yǎng)基及胎牛血清購自美國Gibco公司;胰蛋白酶購自武漢生命科學(xué)技術(shù)公司。1.4儀器同具體實(shí)施例1。2實(shí)驗(yàn)方法-.2.1RAW264.7細(xì)胞的培養(yǎng)同具體實(shí)施例1。2.2分組及給藥方法采用不含血清的RPMI-1640培養(yǎng)基依次稀釋矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷。常規(guī)培養(yǎng)RAW264.7細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為1xl07個(gè)/L,然后均勻接種于無菌96孔培養(yǎng)板中,37°C、5XC02培養(yǎng)24小時(shí),使細(xì)胞生長成良好單層。實(shí)驗(yàn)開始前用等體積無血清培養(yǎng)基靜止培養(yǎng)24小時(shí)使之同步化,隨后隨機(jī)分為①空白對照組無血清培養(yǎng)基常規(guī)培養(yǎng);②ox-LDL組ox-LDL終濃度為40mg/L。③花色苷+ox-LDL組分別用安全濃度為30、60、90、120pmol/L的矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷培養(yǎng)細(xì)胞1小時(shí),然后加入終濃度為40mg/L的ox-LDL繼續(xù)培養(yǎng)。每組重復(fù)8孔,置于37°C、5%C02培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24小時(shí)后進(jìn)行檢測。2.3MTT法同具體實(shí)施例1。2.4觀測的指標(biāo)(1)倒置相差顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)改變。(2)MTT法檢測細(xì)胞活力2.5.數(shù)據(jù)處理數(shù)據(jù)以^±5表示,多組均數(shù)進(jìn)行方差齊性檢驗(yàn)和單因素方差分析,各組間的比較采用Tukey法。3實(shí)驗(yàn)結(jié)果MTT實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖2)顯示,40mg/L的ox-LDL能明顯降低細(xì)胞活力,而不同安全濃度的矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷(30、60、90、120nmol/L)均能明顯改善ox-LDL對細(xì)胞的損傷,提高細(xì)胞活力。圖3顯示的是倒置相差顯微鏡下觀察的正常對照、40mg/L的ox-LDL及矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷濃度為120pmol/L是細(xì)胞的生長狀況圖。以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷可改善ox-LDL對RAW264.7細(xì)胞的損傷,且濃度沒有劑量依賴性。實(shí)施例3:矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對ox-LDL處理小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系基因表達(dá)譜的作用1實(shí)驗(yàn)材料1.1實(shí)驗(yàn)藥物矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷同具體實(shí)施例l。1.2實(shí)驗(yàn)對象小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞同具體實(shí)施例l。1.3試劑ox-LDL購自北京協(xié)和生化室;MTT購自美國Fluka公司;DMSO購自美國Sigma公司;RPMI-1640培養(yǎng)基及胎牛血清購自美國Gibco公司;胰蛋白酶購自武漢生命科學(xué)技術(shù)公司;TRIZOL試劑購自上海生物工程公司產(chǎn)品;RNA純化試劑盒(RNeasyTotalRNAIsolationkit)來源于美國QIAGEN公司;AffymetrixMouseU4302.0基因表達(dá)譜芯片來源于美國Affymetrix公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購自美國Promega公司;乙醇、異丙醇、正庚垸、正己垸、乙腈均為色譜級,購自上海國藥集團(tuán);三氯乙酸、氫氧化鈉、氫氧化鉀、氯仿均為化學(xué)純,購自上海國藥集團(tuán)。1.4儀器'二氧化碳培養(yǎng)箱購自美國SHEL-LAB公司;超凈工作臺(YJ-1450型)購自蘇州凈化設(shè)備公司;倒置相差顯微鏡購自德國LEICA公司。2實(shí)驗(yàn)方法2.1RAW264.7細(xì)胞的培養(yǎng)同具體實(shí)施例l。2.2分組及給藥方法常規(guī)培養(yǎng)RAW264.7細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為1xl(^個(gè)/L,然后均勻接種于無菌60ml培養(yǎng)瓶中,37°C、5XC02培養(yǎng)24小時(shí),使細(xì)胞生長成良好單層。實(shí)驗(yàn)開始前用等體積無血清培養(yǎng)基靜止培養(yǎng)24小時(shí)使之同步化,隨后隨機(jī)分為-①空白對照組無血清培養(yǎng)基常規(guī)培養(yǎng);②ox-LDL組ox-LDL終濃度為40mg/L。③花色苷+ox-LDL組先用60pmol/L的矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷培養(yǎng)細(xì)胞1小時(shí),然后加入終濃度為40mg/L的ox-LDL繼續(xù)培養(yǎng)。每組重復(fù)3次,置于37°C、5%C02培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24小時(shí)后收獲細(xì)胞供檢測。2.3RNA的提取及檢測2.3.1總RNA的提取(TRIZOL法).1)均質(zhì)化取2xl(/細(xì)胞加入lmlTRIZOL,用lml移液器反復(fù)吹打。2)均質(zhì)化的樣品在153(TC放置5分鐘,然后加入0.2倍體積的氯仿,蓋子蓋緊后劇烈振搖15秒使混勻,在1530。C放置23分鐘,4°C,7000rpm離心15分鐘,離心后形成下層紅色的酚氯仿相,中間相和上層無色水相。3)將上層水相轉(zhuǎn)移至一個(gè)新的離心管(水相的體積大約為均質(zhì)化時(shí)所用TRIZOLl體積的60。/。),加入0.8倍體積的異丙醇,劇烈振搖使混勻,4'C,7000rpm離心15分鐘,棄上清。4)加入70%(ml/ml)酒精,顛倒離心管數(shù)次以洗去沉淀所含鹽分。如沉淀較大可用移液器頭先將沉淀打散。然后4。C,7000rpm離心10分鐘,棄上清。5)重復(fù)以上步驟l次。6)153(TC晾干,然后加入適量的無RNA酶的水溶解。.7)用分光光度計(jì)分析RNA濃度,在260nm波長,10D約等于40叱/ml的RNA。8)1%(mg/ml)瓊脂糖電泳。2.3.2RNA的純化(QIAGENRNeasyTotal認(rèn)AIsolationkit)具體方法按QIAGEN公司隨試劑盒提供的操作手冊進(jìn)行。2.4基因芯片和分析方法基因芯片制作由上海生物芯片有限公司完成。使用AffymetrixMouseU4302.0基因表達(dá)譜芯片,該芯片含45000個(gè)探針集,34000個(gè)已知功能基因2.4.1樣本類型與基因芯片編號表l:樣本分組及意義<table>tableseeoriginaldocumentpage14</column></row><table>應(yīng)用RMA(Robustmultiarrayanalysis)對Affyemtrix基因芯片的eel格式文件進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理,該文件中包含了每個(gè)探針集的原始強(qiáng)度。RMA完全基于基因的PM探針信號值,在計(jì)算信號值的過程中,進(jìn)行五個(gè)步驟'①通過探針鄰近區(qū)域背景的加權(quán)平均對每個(gè)探針背景校正;②去除信號響應(yīng)值為P的基因占基因總數(shù)比例低于50%的樣本;③對校正后的PM對數(shù)轉(zhuǎn)換;估計(jì)PM對數(shù)轉(zhuǎn)換后的均值,而后對均值進(jìn)行指數(shù)化;⑤對指數(shù)化后的均值去除極大極小值后,進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。2.4.3差異基因顯著性分析經(jīng)過數(shù)據(jù)預(yù)處理后,分析花色苷+ox-LDL組、正常對照、ox-LDL組三組間的差異表達(dá)基因。尋找組間差異基因的方法是基于隨機(jī)方差模型的方差分析方法。由于每組中的樣本數(shù)量較少,無法判斷樣本分布是否符合正態(tài)分布,因此,不能簡單地使用基于正態(tài)分布進(jìn)行分組樣本的方差分析。在此,使用貝葉斯統(tǒng)計(jì)理論的共軛先驗(yàn)分布推斷基因標(biāo)化后信號值(之后簡稱信號值)在樣本中的均值和方差中的分布。若要保證兩者符合正態(tài)分布,則這兩者的聯(lián)合共軛先驗(yàn)分布則應(yīng)該為反伽馬分布。因此,問題將溯源至確定先驗(yàn)分布是否為反伽馬分布,而后在確定其超參數(shù)。在此,發(fā)明人使用極大似然法確定先驗(yàn)分布。由于隨機(jī)方差模型分析根據(jù)實(shí)際數(shù)據(jù)推斷先驗(yàn)分布,從而推斷出理論分布,因此,在應(yīng)用貝葉斯方法處理統(tǒng)計(jì)問題時(shí),不但完全利用有限的樣本信息,還利用7先驗(yàn)分布,從而推導(dǎo)出實(shí)際的后驗(yàn)分布狀況。因此,大大增加了對有限信息的利用效率,從而更為有效地提高差異表達(dá)基因鑒別的準(zhǔn)確性。2.4.4分析對象花色苷+ox-LDL組、正常對照、ox-LDL組三組的所有基因檢測值。2.4.5統(tǒng)計(jì)學(xué)方法在此,以任何兩個(gè)分組間之間都不存在差異作為零假設(shè),而后檢驗(yàn)零假設(shè)是否成立,從而發(fā)現(xiàn)分組間的顯著性差異基因。在此,t值為<formula>formulaseeoriginaldocumentpage16</formula>23實(shí)驗(yàn)結(jié)果基因芯片結(jié)果顯示在34000個(gè)已知功能基因中,有差異基因309條。其中,ox-LDL組和對照組比較上調(diào)基因24條,下調(diào)基因87條;花色苷+ox-LDL組和ox-LDL組比較上調(diào)基因16條,下調(diào)基因22條。經(jīng)共表達(dá)基因的顯著性分析后,篩選出兩個(gè)基因群構(gòu)建基因功能相似性網(wǎng)絡(luò),計(jì)算網(wǎng)絡(luò)中心點(diǎn),得出在花色苷+ox-LDL組禾Dox-LDL組比較中,YWHAG(酪氨酸3-單加氧酶/色氨酸5-單加氧酶激活蛋白,Y多肽)基因是矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷上調(diào)的主要調(diào)控基因。矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷主要保護(hù)了ox-LDL對脂質(zhì)內(nèi)膜的破壞,增強(qiáng)了細(xì)胞增殖能力和組織結(jié)構(gòu)的再形成能力。實(shí)施例4:矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對ox-LDL處理小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系YWHAG(酪氨酸3-單加氧酶/色氨酸5-單加氧酶激活蛋白,Y多肽)基因表達(dá)的作用1實(shí)驗(yàn)材料1.1實(shí)驗(yàn)藥物矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷同具體實(shí)施例l。1.2實(shí)驗(yàn)對象小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞同具體實(shí)施例1。1.3'試劑ox-LDL購自北京協(xié)和生化室;MTT購自美國Fluka公司;DMSO購自美國Sigma公司;RPMI-1640培養(yǎng)基及胎牛血清購自美國Gibco公司;胰蛋白酶購自武漢生命科學(xué)技術(shù)公司;TRIZOL試劑購自上海生物工程公司產(chǎn)品;RNA純化試劑盒(RNeasyTotalRNAIsolationkit)來源于美國QIAGEN公司;反轉(zhuǎn)錄試劑購于美國Invitrogen公司;定量PCR試劑(PowerSYBRGreenPCRMasterMix)購于美國ABI公司;引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;乙醇、異丙醇、正庚烷、正己烷、乙腈均為色譜級,購自上海國藥集團(tuán);三氯乙酸、氫氧化鈉、氫氧化鉀、氯仿均為化學(xué)純,購自上海國藥集團(tuán)。1.4儀器二氧化碳培養(yǎng)箱購自美國SHEL-LAB公司;超凈工作臺(YJ-1450型)購自蘇州凈化設(shè)備公司;倒置相差顯微鏡購自德國LEICA公司;定量PCR儀(7300SequenceDetectionSystem)購于美國ABI公司。2實(shí)驗(yàn)方法2.1RAW264.7細(xì)胞的培養(yǎng)同具體實(shí)施例1。2.2分組及給藥方法常規(guī)培養(yǎng)RAW264.7細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為1xlO7個(gè)/L,然后均勻接種于無菌60ml培養(yǎng)瓶中,37°C、5%<:02培養(yǎng)24小時(shí),使細(xì)胞生長成良好單層。實(shí)驗(yàn)開始前用等體積無血清培養(yǎng)基靜止培養(yǎng)24小時(shí)使之同步化,隨后隨機(jī)分為-①空白對照組無血清培養(yǎng)基常規(guī)培養(yǎng);②ox-LDL組ox-LDL終濃度為40mg/L。③花色苷+ox-LDL組先用60pmol/L的矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷培養(yǎng)細(xì)胞1小時(shí),然后加入終濃度為40mg/L的ox-LDL繼續(xù)培養(yǎng)。每組重復(fù)3次,置于37°C、5%C02培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24小時(shí)后收獲細(xì)胞供檢測。2.3RNA的提取及檢測2.3.1總RNA的提取(TRIZOL法)同具體實(shí)施例3。2.3.2RNA的純化(QIAGEN脂easyTotalRNAIsolationkit)同具體實(shí)施例3。2.4RT-PCR反應(yīng)2.4.1cDNA第一鏈合成(1)從-8(TC冰箱中取出RNA,在2025。C下解凍,然后在0.2mlPCR管中配制反應(yīng)溶液??俁NA3叱01igo-dT(15)(lpg/|il)0.5|aldNTPmix(10mM)ddH20CDEPC)_Xpi總體積12^1(2)將反應(yīng)管置于PCR儀中,65'C預(yù)變性5分鐘。(3)變性反應(yīng)結(jié)束后在PCR管中配制cDNA第一鏈合成反應(yīng)體系5Xfirst-strandbuffer4.0pi0.1MDTT2.0^1RNAinhibitor1.0^1SuperscriptII(200U/1.0ddH20(DEPC)_Xpl總體積20|al(4)將PCR管子置于PCR儀中進(jìn)行反應(yīng),42'C保溫50分鐘后,7(TC變性15分鐘,4'C保存。2.4.2SYBRGreenRT-PCR反應(yīng)體系2xSYBRGreenPCRbuffer12.5ulprimer(5pmo1)1Template(10ng)+ddH2011.5|al5(TC孵育2分鐘,然后95'C,IO分鐘;接著進(jìn)行40個(gè)循環(huán)95°C,15秒;60°C,l分鐘。儀器使用ABI公司的Prism7300系統(tǒng)。2.4.3YWHAG基因引物設(shè)計(jì)引物設(shè)計(jì)如下ForwardPrimer:GCGCGGACGTTCTCAGAReversePrimer:CCTTAGCGAAACACGGAGTTG2.5'統(tǒng)計(jì)、作圖方法(1)通過一系列的參數(shù)設(shè)定分析,得到不同樣本相對于不同基因的Ct值。Ct值,C代表Cycle(循環(huán)),t代表threshold(閾值),Ct值的含義是每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達(dá)設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)(如圖4所示)。.(2)研究表明,每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。因?yàn)楸容^的是轉(zhuǎn)錄水平的差異,所以通過檢測每個(gè)樣品的管家基因,將目的基因歸一化。PCR產(chǎn)物的增長形式為2n,如果各種試劑和外部所加條件均理想化,N就是循環(huán)數(shù)。所以先得到ACt:Ct待測基因一Ct管家基因,再轉(zhuǎn)換為原始模板濃度=2.ACt2.6重復(fù)性檢驗(yàn)每個(gè)樣品3個(gè)平行樣,計(jì)算同一樣品的3個(gè)平行樣Ct值的變異系數(shù),分析樣品目標(biāo)基因定量結(jié)果的批內(nèi)變異系數(shù)。3實(shí)驗(yàn)結(jié)果實(shí)時(shí)定量RT-PCR結(jié)果如圖5所示,其進(jìn)一步驗(yàn)證了基因芯片結(jié)果,證實(shí)矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷能上調(diào)ox-LDL導(dǎo)致的小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞中YWHAG基因的低表達(dá)。權(quán)利要求1、一種花色苷在制備治療或預(yù)防動(dòng)脈粥樣硬化的藥物中的應(yīng)用。2、一種調(diào)控YWHAG基因的表達(dá)在制備治療或預(yù)防動(dòng)脈粥樣硬化藥物中的應(yīng)用。3、根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種應(yīng)用,其特征在于所述的花色苷為矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷。全文摘要本發(fā)明公開了一種花色苷及調(diào)控YWHAG基因的表達(dá)在制備治療動(dòng)脈粥樣硬化藥物中的用途。涉及花色苷單體矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對氧化低密度脂蛋白致巨噬細(xì)胞損傷的改善作用,并探討其作用機(jī)制。本發(fā)明采用小鼠RAW264.7巨噬細(xì)胞系進(jìn)行實(shí)驗(yàn),通過MTT法測定矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷對氧化低密度脂蛋白處理的RAW264.7巨噬細(xì)胞活性的影響。并提取細(xì)胞總RNA,用AffymetrixMouseU4302.0基因表達(dá)譜芯片進(jìn)行標(biāo)記雜交實(shí)驗(yàn),RMA法對Affyemtrix基因芯片的掃描結(jié)果進(jìn)行差異基因分析,篩選出差異基因,隨后采用實(shí)時(shí)定量PCR法對表達(dá)的差異基因進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。結(jié)果證實(shí),矢車菊素-3,5-二葡萄糖苷能上調(diào)YWHAG基因表達(dá),對氧化低密度脂蛋白損傷的巨噬細(xì)胞具有明顯的保護(hù)作用。文檔編號A61K31/7042GK101347441SQ20081019685公開日2009年1月21日申請日期2008年9月3日優(yōu)先權(quán)日2008年9月3日發(fā)明者張葉敏,陽李,歐陽靜萍,畢勇毅,同沈,王保華申請人:武漢大學(xué)
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