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      新的g蛋白偶聯(lián)受體蛋白及其用途

      文檔序號(hào):1316053閱讀:875來(lái)源:國(guó)知局
      新的g蛋白偶聯(lián)受體蛋白及其用途
      【專利摘要】本發(fā)明涉及新的GPCR(G蛋白偶聯(lián)受體)蛋白和編碼該蛋白的基因,以及所述蛋白和基因的新用途。具體而言,本發(fā)明涉及新的GPCR多肽、編碼所述多肽的多核苷酸、攜帶所述多核苷酸或者其片段的重組載體、用所述載體轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞及轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。此外,本發(fā)明涉及:用于檢測(cè)癌癥標(biāo)志物的組合物,其包含能測(cè)量所述新的GPCR基因的mRNA或者蛋白水平的試劑;包含所述組合物的、用于診斷癌癥的試劑盒;以及檢測(cè)新的GPCR多肽及編碼該新的GPCR多肽的基因的方法。并且,本發(fā)明涉及用于治療及預(yù)防癌癥的組合物以及篩選新的GPCR調(diào)節(jié)劑或者癌癥治療劑的方法,所述組合物包含,抑制GPCR的表達(dá)或者活性的試劑。
      【專利說(shuō)明】新的G蛋白偶聯(lián)受體蛋白及其用途

      【技術(shù)領(lǐng)域】
      [0001] 本發(fā)明涉及新的G蛋白偶聯(lián)受體(G protein-coupled receptor, GPCR)蛋白和編 碼該蛋白的基因,以及所述蛋白和基因的新用途。具體而言,本發(fā)明涉及新的GPCR多肽、編 碼所述多肽的多核苷酸、攜帶所述多核苷酸或者其片段的重組載體、用所述載體轉(zhuǎn)化的宿 主細(xì)胞及轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。本發(fā)明還涉及用于檢測(cè)癌癥標(biāo)志物的組合物,所述組合物包含,能測(cè) 量本發(fā)明GPCR多核苷酸的mRNA或者蛋白表達(dá)水平的試劑;包含所述組合物的、用于診斷癌 癥的試劑盒;以及檢測(cè)本發(fā)明的GPCR多肽及編碼所述GPCR多肽的基因的方法。此外,本發(fā) 明涉及用于治療及預(yù)防癌癥的組合物,其包含抑制編碼本發(fā)明的GPCR多肽的基因表達(dá)的 寡核苷酸或抗本發(fā)明GPCR蛋白的抗體;以及篩選本發(fā)明的GPCR的調(diào)節(jié)劑或者癌癥治療劑 的方法。

      【背景技術(shù)】
      [0002] 人類細(xì)胞在其表面存在多種受體。特別是,G-蛋白偶聯(lián)受體(G-protein coupled rec印tor,下文簡(jiǎn)稱為"GPCR"或者"GPCRs")是最大的跨膜受體蛋白家族之一。人類基 因組內(nèi)存在約30, 000個(gè)人類基因,發(fā)現(xiàn)其中多達(dá)1,000個(gè)基因編碼GPCRs。最近,基于對(duì) 脊椎動(dòng)物基因組所進(jìn)行的研究,已將GPCR分為5類。第一類包含視紫紅質(zhì)受體家族,其包 含670種受體蛋白。視紫紅質(zhì)受體家族可以與各種配體反應(yīng),包括胺(α基團(tuán))、肽(β基 團(tuán))、脂類樣物質(zhì)(Y類)、核苷酸和糖蛋白(S基團(tuán)),并且包含多個(gè)藥物靶受體。第二類 為胰泌素受體家族,并具有肽激素的結(jié)合結(jié)構(gòu)域。該家族的受體與穩(wěn)態(tài)有關(guān),從而成為藥 物開(kāi)發(fā)的重要靶標(biāo)。第三類稱為粘著受體家族,其特征在于具有GPCR蛋白水解位點(diǎn)(GPCR Proteolytic site,GPS)。該家族的GPCR成員的N-末端部分有很多種,人們對(duì)其配體的了 解非常少,因此還沒(méi)開(kāi)發(fā)靶向該家族GPCR成員的藥物。第四類為谷氨酸(Glutamate)受體 家族,其中已經(jīng)鑒定了 22個(gè)GPCR成員。關(guān)于各個(gè)蛋白特異性,了解的相對(duì)很少。最后一類 為Frizzled/Taste2家族,其包括:將Wnt糖蛋白作為配體的10個(gè)Frizzled ;不需要配體 的5個(gè)SM0(光滑的);以及感知各種味道所需的25個(gè)Taste2受體。還基于內(nèi)源配體的鑒 定,對(duì)包括GPCRs在內(nèi)的受體進(jìn)行分類。受體與已知的內(nèi)源化合物結(jié)合,或者被分類為內(nèi)源 配體還未得到鑒定的孤兒受體(orphan receptor)。
      [0003] 多種組織及細(xì)胞類型中發(fā)現(xiàn)了 GPCRs,并且其與多種不同的生理機(jī)制有聯(lián)系。它們 被多種配體激活,例如,諸如促甲狀腺刺激激素(PTH)、促腎上腺皮質(zhì)激素、胰高血糖素以及 后葉加壓素等的激素;諸如5-HT、乙酰膽堿(毒蕈堿性AchR)、組織胺等的胺;諸如LPA和 SlP等的脂質(zhì);以及諸如氨基酸、Ca2+、核酸、肽和光等的信號(hào)遞質(zhì)。GPCRs所發(fā)揮作用的廣 泛分布與多樣性,是GPCRs在多種病理學(xué)疾病中發(fā)揮重要的作用證據(jù)。實(shí)際上,已知GPCRs 與多種疾病有關(guān),包括支氣管收縮、高血壓、糖尿病、炎癥、激素失調(diào)、細(xì)胞死亡、癌癥、神經(jīng) 傳遞障礙以及行為障礙等。從而,對(duì)于目前而言,GPCRs屬于研發(fā)藥物產(chǎn)品的重要領(lǐng)域。目 前可用于藥物研發(fā)的GPCR大約有360多種,其中46種已用于藥物開(kāi)發(fā),而可探討剩余的約 320種基因的藥物開(kāi)發(fā)。推測(cè)有約150種孤兒GPCRs (orphan GPCRs,oGPCRs)。在新藥開(kāi)發(fā) 領(lǐng)域中,細(xì)胞膜受體充當(dāng)藥物的選擇性位點(diǎn),并且占所有藥物祀標(biāo)的50% (Nature Reviews Drug Discovery,2004. 2008),尤其是GPCR活性調(diào)控藥物在最頻繁使用的前100名藥物中 占30% (400億美元,總藥物市場(chǎng)的9%)。因此GPCR為新藥開(kāi)發(fā)的最重要的目標(biāo)(Nature Reviews Drug Discovery, 2004, 2008)。
      [0004] GPCRs具有共同的結(jié)構(gòu)特征。所有的這些受體都具有七個(gè)疏水跨膜結(jié)構(gòu)域,每個(gè) 結(jié)構(gòu)域的長(zhǎng)度為20?30個(gè)氨基酸,并且所述7個(gè)疏水跨膜結(jié)構(gòu)域通過(guò)多種長(zhǎng)度的氨基酸 序列連接。受體具有細(xì)胞外N末端,而C末端則位于細(xì)胞質(zhì)中。GTP-結(jié)合蛋白(G蛋白) 起到下述的媒介作用:將通過(guò)結(jié)合激素和刺激GPCR的其他化學(xué)配體所生成的信號(hào)向細(xì)胞 內(nèi)效應(yīng)子傳遞。配體與GPCR結(jié)合之后,受體的分子內(nèi)結(jié)構(gòu)域經(jīng)歷能夠使受體與G蛋白相互 作用的構(gòu)象變化,這反過(guò)來(lái)激活細(xì)胞內(nèi)信號(hào)遞質(zhì),如腺苷酸環(huán)化酶(adenylate cyclase)、 磷脂酶C(phospholipase C)或者離子通道(ion channel)。這種系統(tǒng)對(duì)于一個(gè)配體結(jié)合 于GPCR的情況做出反應(yīng),使得原來(lái)的信號(hào)放大至能夠產(chǎn)生較多的次級(jí)遞質(zhì)。細(xì)胞能夠通過(guò) 該機(jī)制探測(cè)它們的外部環(huán)境的變化,并對(duì)此做出適當(dāng)反應(yīng)。通常,受體被內(nèi)源配體激活,同 時(shí)伴隨構(gòu)像變化,并且能夠?qū)崿F(xiàn)受體和G-蛋白之間的結(jié)合。最近幾年通過(guò)研究蛋白之間的 相互作用,了解了下述的事實(shí),即,GPCR與各種蛋白相關(guān),如含有GRK或者SH2結(jié)構(gòu)域(src homology 2 domain,src同源性2結(jié)構(gòu)域)的蛋白、連接子Grb2(adaptor Grb2)以及參與 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的G蛋白。
      [0005] 在正常條件下,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)最終帶來(lái)細(xì)胞激活或者細(xì)胞抑制的結(jié)果。在生理環(huán)境下, GPCRs以非活性和活性狀態(tài)的平衡狀態(tài)存在于細(xì)胞膜中。非活性狀態(tài)的受體不能聯(lián)合細(xì)胞 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,發(fā)揮生物反應(yīng)。只有當(dāng)受體的結(jié)構(gòu)變?yōu)榛钚孕问綍r(shí),受體才能通過(guò)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo) 途徑(通過(guò)G-蛋白),顯示生物反應(yīng)。通過(guò)諸如內(nèi)源配體或者藥物等化合物,受體可以穩(wěn)定 為活性形式。從而,關(guān)于克隆這類基因家族以及鑒定它們的新的配體等的功能研究,具有與 開(kāi)發(fā)新的候選藥物相同的意義,其中,新的候選藥物是指如siRNA、抗體、多肽、效應(yīng)子、激動(dòng) 劑以及拮抗劑等物質(zhì)。
      [0006] 對(duì)于生命體而言,生長(zhǎng)、分化、穩(wěn)態(tài)、對(duì)刺激的反應(yīng)、細(xì)胞周期調(diào)控、老化以及凋亡 等,主要是細(xì)胞內(nèi)選擇特定基因并表達(dá)的結(jié)果,這對(duì)于與疾病相關(guān)的細(xì)胞機(jī)制而言是真實(shí) 的。尤其,如腫瘤發(fā)生等病理學(xué)現(xiàn)象,是由最終導(dǎo)致基因表達(dá)發(fā)生變化的基因突變誘導(dǎo)的。
      [0007] 根據(jù)腫瘤發(fā)生的多種研究,得出下述現(xiàn)象,S卩,諸如染色體雜合性缺失(loss of chromosomal heterozygosity)、癌基因的激活以及包括p53基因在內(nèi)的腫瘤抑 制基因的失活等多種基因變化的積累,其結(jié)果就是產(chǎn)生腫瘤(Bishop,J.M.,Cell,64 : 249-270(1991))。進(jìn)而,報(bào)告指出,10-30%的癌癥是因下述原因發(fā)生的,即癌基因的擴(kuò)增導(dǎo) 致癌基因激活,從而發(fā)生癌癥。從而,癌基因的激活對(duì)于多種癌癥的病理學(xué)研究而言都是重 要的。由此亟需鑒定癌基因并研發(fā)調(diào)控癌基因的方法。


      【發(fā)明內(nèi)容】

      [0008] 本發(fā)明人為鑒定癌基因而付出了努力,結(jié)果導(dǎo)致下述內(nèi)容,從而完成本發(fā)明:克隆 推斷的孤兒GPCR基因,并且發(fā)現(xiàn)所述基因的超表達(dá)誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生。
      [0009] 本發(fā)明的目的在于提供由SEQ ID N0:1或者2的氨基酸序列構(gòu)成的GPCR(G Protein Coupled Receptor,G 蛋白偶聯(lián)受體)多膚。
      [0010] 本發(fā)明的另一目的在于提供編碼所述多肽的多核苷酸。
      [0011] 本發(fā)明的再一目的在于提供攜帶所述多核苷酸或者其片段的重組載體。
      [0012] 本發(fā)明的再一目的在于提供用所述載體轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞。
      [0013] 本發(fā)明的再一目的在于提供代孕母體分娩的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,在所述代孕母體的子宮 中,植入了所述載體。
      [0014] 本發(fā)明的再一目的在于提供用于檢測(cè)癌癥標(biāo)志物的組合物,所述組合物包含能測(cè) 量本發(fā)明GPCR多核苷酸的mRNA或者蛋白表達(dá)水平的試劑。
      [0015] 本發(fā)明的再一目的在于提供包含所述組合物的、用于診斷癌癥的試劑盒。
      [0016] 本發(fā)明的再一目的在于提供檢測(cè)本發(fā)明的GPCR多肽及編碼該GPCR多肽的基因的 方法。
      [0017] 本發(fā)明的再一目的在于提供用于治療及預(yù)防癌癥的組合物,所述組合物包含:抑 制編碼本發(fā)明的GPCR多肽的基因表達(dá)的寡核苷酸或者抗本發(fā)明的GPCR蛋白的抗體。
      [0018] 本發(fā)明的再一目的在于提供篩選本發(fā)明的GPCR蛋白調(diào)控劑或者癌癥治療劑的方 法,所述方法包括:用候選化合物處理表達(dá)本發(fā)明的GPCR蛋白的細(xì)胞,并測(cè)定GPCR介導(dǎo)的 所述蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性的增加或者減少。
      [0019] 本發(fā)明的新的GPCR基因和GPCR蛋白的功能最初是由本發(fā)明人鑒定的,其可用作 抑制癌癥轉(zhuǎn)移或者癌癥自身的靶標(biāo)。并且,通過(guò)檢測(cè)所述基因或者所述基因編碼的多肽,從 而可以診斷是否發(fā)生癌癥疾病。因此,通過(guò)使用反義、SiRNA或者shRNA來(lái)抑制本發(fā)明的新 的GPCR基因,從而可望治療或者預(yù)防癌癥的發(fā)作或者轉(zhuǎn)移。進(jìn)而,通過(guò)使用攜帶所述基因 的載體和容納所述載體的轉(zhuǎn)化的細(xì)胞、具有所述基因的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物,從而可以更加具體地 確認(rèn)GPCR基因的功能,同時(shí)還可以用作癌癥模型。

      【專利附圖】

      【附圖說(shuō)明】
      [0020] 在圖1顯示新的GPCR基因(人的hstml基因)同種型I (isoform 1)和2的可選 的轉(zhuǎn)錄變體(A);通過(guò)RT-PCR所測(cè)量的新的GPCR基因(hstml基因)在各種人類組織中的 表達(dá)水平(B);新的GPCR基因(hstml基因)在各種人類組織中的相對(duì)表達(dá)水平(C)。
      [0021] 圖2表示通過(guò)RT-PCR (A)和實(shí)時(shí)PCR⑶所測(cè)量的GPCR基因(hstml基因)在代表 性消化器官和相關(guān)器官的細(xì)胞系中的相對(duì)表達(dá)水平;圖2C是通過(guò)實(shí)時(shí)PCR所測(cè)量的GPCR 基因(hstml基因)在胃癌患者的非腫瘤和腫瘤組織中的表達(dá)水平。
      [0022] 在圖3A表示超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞的聚集體的形成以及所述 細(xì)胞對(duì)接觸抑制(contact inhibition)不敏感性;圖3B表示顯示與對(duì)照相比,不同細(xì)胞濃 度下,超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞的生長(zhǎng)和聚集體形成;圖3C表示與對(duì)照 相比,超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞的生長(zhǎng)速度更快;圖3D表示超表達(dá)GPCR 基因(hstml基因)的正常細(xì)胞的細(xì)胞周期;圖3E表示超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的 正常細(xì)胞的錨定非依賴性生長(zhǎng)(anchorage-independent growth)的圖片和圖表;圖3F表 示在免疫缺陷小鼠的皮下注射超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞或?qū)φ占?xì)胞后, 所述免疫缺陷小鼠中的腫瘤形成。
      [0023] 圖4是參與以下途徑的蛋白的蛋白印跡:與細(xì)胞生長(zhǎng)和腫瘤形成有關(guān)的MP激酶 途徑(A);和超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞中的抗凋亡途徑(B)。
      [0024] 在圖5A表示根據(jù)cAMP激活劑即毛喉素(forskolin)的濃度,超表達(dá)本GPCR基因 (hstml基因)的正常細(xì)胞中cAMP濃度的變化;圖5B是顯示在存在或不存在毛喉素的情況 下,在具有或不具有超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的細(xì)胞中的相對(duì)CRE (cAMP反應(yīng)元件, cAMP response element)-Luc報(bào)告基因分析結(jié)果;圖5C表不p-rafl基因在瞬時(shí)超表達(dá) GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞中的磷酸化;圖表示p-rafl基因在穩(wěn)定地超表達(dá) GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞中的磷酸化。
      [0025] 在圖6A表示當(dāng)用或不用PTX處理穩(wěn)定地超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常 細(xì)胞后,所述細(xì)胞的血清反應(yīng);圖6B表示在存在或不存在PTX的情況下,超表達(dá)GPCR基因 (hstml基因)的正常細(xì)胞對(duì)各種生長(zhǎng)因子和已知的GPCR配體的反應(yīng)。
      [0026] 在圖7A表示IGFI和IGFII的轉(zhuǎn)錄水平以及下游因子即細(xì)胞周期蛋白Dl的表達(dá)水 平,IGFI和IGFII在超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞中比在對(duì)照中誘導(dǎo)更高的 細(xì)胞生長(zhǎng)反應(yīng);圖7B表示在確定細(xì)胞生長(zhǎng)的免疫保護(hù)分析之后的蛋白印跡,其中用抗IGFI 和/或抗IGFII抗體處理超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞,以抑制生長(zhǎng)因子IFG 所誘導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo);圖7C表示用抗IGFI和/或抗IGFII抗體處理后的細(xì)胞生長(zhǎng)的圖片;圖 7D表示用抗IGFI和/或抗IGFII抗體處理之后的細(xì)胞生長(zhǎng)的定量WST分析(WST assay) 結(jié)果。
      [0027] 在圖8A表示體外結(jié)合分析結(jié)果,其中利用在E. coli中超表達(dá)的His標(biāo)記的GPCR 蛋白(His標(biāo)記的hstml蛋白),鑒定與GPCR蛋白偶聯(lián)的G蛋白;圖8B表不在瞬時(shí)超表達(dá) GPCR基因(hstml基因)的細(xì)胞中,利用flag標(biāo)記的GPCR(flag-標(biāo)記的hstml)的免疫共 沉淀分析(co-immunoprecipitation assay);圖 8C 和 8D 表不通過(guò) RNA 干擾(Gail、2、3) 所測(cè)量的細(xì)胞周期蛋白Dl和Ga il、2、3 mRNAs量的變化。
      [0028] 圖9是顯示GPCR SiRNAOistml siRNA)對(duì)胃癌細(xì)胞(A)和肝癌細(xì)胞⑶細(xì)胞細(xì)胞 生長(zhǎng)的抑制作用;圖9C變示GPCR SiRNAQiStml siRNA)對(duì)胃癌細(xì)胞和肝癌細(xì)胞細(xì)胞生長(zhǎng)的 抑制作用的圖表;
      [0029] 在圖IOA表示穩(wěn)定地超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)性;圖IOB 表示超表達(dá)GPCR基因(hstml基因)的正常細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力的圖表,是顯示其定量結(jié)果的 圖表。

      【具體實(shí)施方式】
      [0030] 由此,作為實(shí)現(xiàn)上述目的的一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及由SEQ ID NO: 1或2的氨基酸 序列構(gòu)成的GPCR(G Protein Coupled Receptor, G蛋白偶聯(lián)受體)多肽。
      [0031] 本發(fā)明的新的GPCR多肽(下文稱為"本發(fā)明的GPCR多肽"或者"本發(fā)明的GPCR蛋 白")由SEQ ID NO: 1或者2的氨基酸序列構(gòu)成,所述氨基酸序列可以由具有SEQ ID NO:3、 4或者5的核苷酸序列的轉(zhuǎn)錄物翻譯。本發(fā)明人研究出了下述內(nèi)容,S卩,所述多肽為GPCR,并 且存在兩個(gè)同種型(isoform),由其三個(gè)轉(zhuǎn)錄變體翻譯而來(lái)。并且還觀察到,本發(fā)明的GPCR 多肽的異常超表達(dá)誘導(dǎo)癌癥,從而本發(fā)明的多肽能夠用作治療癌癥或者抑制癌癥轉(zhuǎn)移的靶 標(biāo)。
      [0032] 優(yōu)選地,本發(fā)明的GPCR蛋白包含所述多肽整體或者一部分片段。優(yōu)選地,所述片 段包含至少10個(gè)、20個(gè)、30個(gè)或者40個(gè)氨基酸殘基,優(yōu)選至少50個(gè)氨基酸殘基,更優(yōu)選至 少75個(gè)氨基酸殘基,甚至更優(yōu)選至少100個(gè)氨基酸殘基,最優(yōu)選至少150個(gè)氨基酸殘基,并 且所述片段與SEQ ID ΝΟ:1或2的氨基酸序列具有至少50%、優(yōu)選至少60%、70%、80%、 更優(yōu)選至少90 %、甚至更優(yōu)選至少95 %、最優(yōu)選至少98 %的同源性。并且,優(yōu)選地,本發(fā)明 的GPCR蛋白由SEQ ID NO: 1或者2的氨基酸序列構(gòu)成的蛋白。這些蛋白在人正常組織內(nèi) 的表達(dá)水平相當(dāng)不同。同種型1大量存在于睪丸和肺,而在胸腺、骨髓、胰腺等中減少,而與 其他組織相比在小腸、心臟、前列腺等中則更少??梢钥闯觯c其他組織相比,同種型2的表 達(dá)水平在睪丸、胰臟、小腸、前列腺中較高(圖1B、1C)。
      [0033] 另一方面,本發(fā)明涉及編碼GPCR多肽的多核苷酸。
      [0034] 編碼本發(fā)明的GPCR蛋白的多核苷酸(下文稱為"本發(fā)明的GPCR多核苷酸"、"本 發(fā)明GPCR基因")是在人類基因組中存在的基因,其功能最初是由本發(fā)明人鑒定的。所 述多核苷酸位于人的一號(hào)染色體的1ρ36. 13中,并且具有多個(gè)可變轉(zhuǎn)錄物(alternative transcript)。轉(zhuǎn)錄物的序列公開(kāi)于SEQ ID NO :3、4以及5中。SEQ ID NO :3、4或者5的 多核苷酸是具有非翻譯區(qū)的cDNA,且最長(zhǎng)的轉(zhuǎn)錄物具有約2279個(gè)核苷酸構(gòu)成,同種型1和 2由三種轉(zhuǎn)錄物翻譯而來(lái),在翻譯后修飾之前為分別約30kDa和約23kDa的蛋白。同種型2 缺少同種型1的65個(gè)N-末端氨基酸。所述多核苷酸是編碼發(fā)揮GPCR(G-protein coupled receptor)功能的這兩種蛋白同種型的新基因。所述蛋白不屬于目前所知的任何GPCR類 另IJ,換而言之,是孤兒GPCRs。這些受體含有PQ基序(對(duì)于將胱氨酸病蛋白(cystinosin) 定位于溶酶體非常關(guān)鍵)。
      [0035] 本發(fā)明的GPCR多核苷酸包括能夠編碼本發(fā)明的新的GPCR多肽的所有多核苷酸序 列。所屬【技術(shù)領(lǐng)域】的技術(shù)人員能夠明白下述內(nèi)容:考慮到在遺傳密碼的簡(jiǎn)并性或者考慮到 想要表達(dá)所述多核苷酸的生物中優(yōu)選的密碼子,可以在本發(fā)明多核苷酸的序列內(nèi)進(jìn)行各種 修飾,只要所述修飾不改變由編碼區(qū)翻譯的多肽的氨基酸序列。并且,甚至可以在處理編碼 區(qū)以外的區(qū)域中,引入各種修飾或改變,至少它們不影響基因的表達(dá)即可。換而言之,可以 修飾本發(fā)明的多核苷酸,至少所得多核苷酸具有相同的或功能等同的生物活性,并且它們 也在本發(fā)明的范圍內(nèi)。因此,本發(fā)明所包括的本發(fā)明GPCR多核苷酸的變體,與SEQ ID NO: 3、 4或5的核苷酸序列具有至少70 %、優(yōu)選至少80 %、更優(yōu)選至少90 %、最優(yōu)選至少95 %的核 苷酸序列同源性。
      [0036] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及攜帶所述多核苷酸或者其片段的重組載體。
      [0037] 就本發(fā)明而言,術(shù)語(yǔ)"載體"是指在適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞中能夠表達(dá)目的蛋白的表達(dá)載 體,是包含可操作地連接的基本調(diào)控元件的基因構(gòu)建體,其中,可操作地連接的基本調(diào)控元 件使插入的基因得以表達(dá)。優(yōu)選地,將重組載體構(gòu)造為,攜帶編碼本發(fā)明的GPCR蛋白的多 核苷酸或者其片段??梢詫⑺鲋亟M載體轉(zhuǎn)化或者轉(zhuǎn)染進(jìn)宿主細(xì)胞。
      [0038] 并且,本發(fā)明的重組載體還可以通過(guò)將本發(fā)明的基因連接(插入)于適當(dāng)?shù)妮d體 而獲得。只要能夠在宿主內(nèi)復(fù)制,則對(duì)將會(huì)插入本發(fā)明的基因的載體并無(wú)特別的限制。例 如,可以使用質(zhì)粒DNA、噬菌體DNA等。具體地,可以用于本發(fā)明的質(zhì)粒DNA的實(shí)例包括如 pcDNA3. 1+(Invitrogen)等商業(yè)質(zhì)粒,除此之外可以使用 pYG601BR322、pBR325、pUCl 18、 pUC119、pUBllO、pTP5、YEpl3、YEp24、YCp50、Charon4A、Charon21A、EMBL3、EMBL4、gtlO、 gtll、ZAP等,另外可以使用如逆轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒和痘苗病毒等動(dòng)物病毒和如桿狀病毒等 昆蟲(chóng)病毒,但是能夠用于本發(fā)明的質(zhì)粒并不限于所述實(shí)例。
      [0039] 另外,為了將本發(fā)明的基因?qū)胼d體,可以使用適當(dāng)?shù)南拗泼赶兓腄NA,并 插入載體DNA的限制位點(diǎn)或者克隆位點(diǎn)。為了將本發(fā)明的基因可操作地連接于載體,本發(fā) 明的載體除了啟動(dòng)子以及本發(fā)明的基因之外,還可以包含順式元件,如增強(qiáng)子、剪接信號(hào)、 Poly A(聚A)添加信號(hào)(poly A addition signal)、選擇標(biāo)記,和核糖體結(jié)合序列。
      [0040] 作為另一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及用所述載體轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞。
      [0041] 可將構(gòu)造的載體通過(guò)轉(zhuǎn)化(或者轉(zhuǎn)染)導(dǎo)入宿主細(xì)胞??梢允褂萌魏畏椒ㄟM(jìn)行 轉(zhuǎn)化。通常,轉(zhuǎn)化方法有以下幾種:CaCljX淀法;Hanahan方法,其中聯(lián)合DMS0(dimethyl sulfoxide,二甲基亞砜),提高CaCljX淀法的效率;電穿孔法;磷酸I丐沉淀法;原生質(zhì)融合 法;碳化娃纖維介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化法;土壤桿菌(Agrobacterium)介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化法;PEG介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化 法;硫酸葡聚糖、陽(yáng)離子脂質(zhì)體(Iipofectamine)和干燥/抑制的轉(zhuǎn)化法等。
      [0042] 通過(guò)如上所述的載體以及采用該載體的轉(zhuǎn)染,能夠?qū)⒕幋a本發(fā)明的GPCR蛋白的 基因?qū)胨拗骷?xì)胞內(nèi)。
      [0043] 只要能夠表達(dá)本發(fā)明的基因,則對(duì)于在本發(fā)明中使用的宿主細(xì)胞沒(méi)有特別的限 制。并且,對(duì)于所屬【技術(shù)領(lǐng)域】的技術(shù)人員而言,利用本發(fā)明的癌基因能夠建立可持續(xù)增殖的 癌細(xì)胞系是顯而易見(jiàn)的。在本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案中,將攜帶本發(fā)明的新GPCR基因的載體 轉(zhuǎn)染到NIH3T3細(xì)胞中,從而建立瞬間或者穩(wěn)定地超表達(dá)本發(fā)明的GPCR蛋白的細(xì)胞系。
      [0044] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及通過(guò)將轉(zhuǎn)化有所述載體的宿主細(xì)胞植入代孕母體 的子宮所得到的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。
      [0045] 本發(fā)明的"轉(zhuǎn)基因動(dòng)物"是指,通過(guò)重組將編碼新的GPCR多肽的外源多核苷酸序 列以人工方式插入動(dòng)物的基因組,從而其至少一部分特征發(fā)生變化的動(dòng)物。可用于產(chǎn)生轉(zhuǎn) 基因動(dòng)物的動(dòng)物的實(shí)例,包括例如有小鼠、大鼠、兔子、豬等哺乳類以及鳥(niǎo)類等,但并不限于 所述實(shí)例。優(yōu)選地,可以在受精卵到達(dá)至少8細(xì)胞胚胎之前階段,將編碼本發(fā)明的GPCR蛋 白的多肽導(dǎo)入所述受精卵。所得的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物可用作表達(dá)所述基因的動(dòng)物模型,例如,可以 有效地用作用于篩選調(diào)控、促進(jìn)或者抑制癌基因表達(dá)的試劑或者抗癌劑的疾病模型。
      [0046] 只要在所屬【技術(shù)領(lǐng)域】中是已知的,任何方法都可以用于制備可用于產(chǎn)生轉(zhuǎn)基因動(dòng) 物的受精卵。所述方法的實(shí)例包括,顯微注射技術(shù)(microinjection technique)、干細(xì)胞插 入技術(shù)(Stem cell insertion technique)、逆轉(zhuǎn)錄病毒插入技術(shù)(retrovirus insertion technique)以及精子介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移技術(shù)(sperm-mediated gene tranfer technique) 等,但并不限于所述實(shí)例。
      [0047] 隨后,將轉(zhuǎn)化的受精卵植入代孕母體的子宮,從而可以得到轉(zhuǎn)基因動(dòng)物。
      [0048] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及用于檢測(cè)癌癥標(biāo)志物的組合物,其包含能測(cè)量本 發(fā)明的GPCR基因在mRNA水平或者蛋白水平上的表達(dá)的試劑。
      [0049] 在本發(fā)明中,術(shù)語(yǔ)"標(biāo)志物或者診斷標(biāo)志物"是指,能通過(guò)區(qū)分癌細(xì)胞或者患有癌 癥疾病的個(gè)體與正常細(xì)胞或者正常個(gè)體而診斷癌癥的物質(zhì),包括與正常細(xì)胞相比在癌細(xì)胞 或者個(gè)體內(nèi)量顯示增加或者減少的有機(jī)生物分子,如多肽、蛋白或者核酸(例如,mRNA等)、 脂質(zhì)、糖脂、糖蛋白或者糖(單糖、二糖、寡糖等)等。就本發(fā)明的目的而言,本發(fā)明的癌癥 診斷標(biāo)志物是指如下所述的物質(zhì),即,與正常細(xì)胞或者組織細(xì)胞相比,在癌細(xì)胞內(nèi)以高水平 特異性表達(dá)的新的GPCR多肽或者編碼該新的GPCR多肽的多核苷酸。
      [0050] 在本發(fā)明中"測(cè)量mRNA表達(dá)水平"活性相應(yīng)的措詞是指,為了診斷癌癥而評(píng)估生 物樣品中癌癥標(biāo)志物基因 mRNA的存成和表達(dá)水平的過(guò)程,其可以通過(guò)測(cè)量mRNA的量來(lái)評(píng) 估。對(duì)此的分析方法有:逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)、競(jìng)爭(zhēng)性RT-PCR(Competitive RT-PCR)、實(shí)時(shí) RT-PCR (Real-time RT-PCR)、RNA 酶保護(hù)分析(RNase protection assay,簡(jiǎn) 稱為RPA)、Northern印跡(Northern blotting)、DNA芯片分析等,但是并不限于此。
      [0051] 在本發(fā)明中"測(cè)量蛋白表達(dá)水平"是指,為了診斷癌癥而評(píng)估生物樣品中癌癥標(biāo) 志物基因所表達(dá)的蛋白的存在和表達(dá)水平的過(guò)程,通過(guò)利用與所述蛋白特異性結(jié)合的抗體 來(lái)測(cè)量標(biāo)志物基因的蛋白產(chǎn)物的量。對(duì)此的分析方法有:蛋白印跡、ELISA (enzyme linked immunosorbent asay,酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定)、放射免疫分析(Radioimmunoassay,簡(jiǎn)稱為 RIA)、放射免疫擴(kuò)散法(radioimmunodiffusion)、奧克特洛尼免疫擴(kuò)散法(Ouchterlony immunodiffusion)、火箭免疫電泳(rocket immunoelectrophoresis)、組織免疫染色、免疫 沉淀分析法、補(bǔ)足物固定分析法(Complement Fixation Assay)、FACS、蛋白芯片等,但是并 不限于此。
      [0052] 優(yōu)選地,測(cè)量所述mRNA水平的試劑為對(duì)應(yīng)于本發(fā)明的GPCR多核苷酸或者其片段 的引物對(duì)、探針或者反義核苷酸。根據(jù)本發(fā)明的多核苷酸序列,所屬【技術(shù)領(lǐng)域】的技術(shù)人員能 夠容易地設(shè)計(jì)引物、探針或者反義核苷酸序列。優(yōu)選地,引物序列公開(kāi)于SEQ ID N0:8和9 中。
      [0053] 在本發(fā)明中,術(shù)語(yǔ)"引物"表示具有游離的3'羥基的短核酸鏈,其與互補(bǔ)模板形成 堿基對(duì),從而充當(dāng)模板鏈復(fù)制的起點(diǎn)。除了引物,DNA的合成或復(fù)制還需要適當(dāng)?shù)木彌_溶液、 合適的溫度、聚合酶(即,DNA聚合酶或者逆轉(zhuǎn)錄酶)和四種不同的三磷酸核苷。在本發(fā)明 中,GPCR多核苷酸的特異性有義和反義引物,可用于PCR擴(kuò)增,從而可以用PCR產(chǎn)物來(lái)診斷 癌癥?;谒鶎佟炯夹g(shù)領(lǐng)域】的公知常識(shí),可適當(dāng)?shù)馗淖働CR條件、有義和反義引物的長(zhǎng)度。
      [0054] 在本發(fā)明中,術(shù)語(yǔ)"探針"表示能夠與mRAN特異性結(jié)合并且已被檢測(cè)目的mRNA的 標(biāo)記標(biāo)記、長(zhǎng)度短則小于10個(gè)堿基長(zhǎng)則數(shù)百個(gè)堿基的寡核苷酸,如RNA或者DNA。能夠以 下述形態(tài)構(gòu)造用于本發(fā)明的探針:寡核苷酸探針、單鏈DNA探針、雙鏈DNA探針或RNA探針。 在本發(fā)明的實(shí)施方案中,通過(guò)確定與本發(fā)明的GPCR多核苷酸互補(bǔ)的探針是否與目的核苷 酸雜交,從而實(shí)現(xiàn)癌癥的診斷?;谒鶎佟炯夹g(shù)領(lǐng)域】的公知常識(shí),可選擇適當(dāng)?shù)奶结槻⑶铱筛?變雜交條件。
      [0055] 采用亞磷酰胺固體支持體方法或者其他已公知的方法,能夠化學(xué)合成可用于 本發(fā)明的引物或者探針。它們的核苷酸序列亦可以使用本領(lǐng)域公知的多種手段來(lái)修 飾。這種修飾的非限制性實(shí)例有甲基化、加帽、用一個(gè)或多個(gè)同系物取代天然核苷酸以 及核苷酸之間的改變,例如未帶電的連接體(例如,甲基膦酸酯、磷酸三酯、磷酰胺酯 (phosphoroamidate)、氨基甲酸酯等),或者帶電的連接體(例如,硫代磷酸酯、二硫代磷酸 醋等)。
      [0056] 優(yōu)選地,所述引物或者探針包含八個(gè)或者更多個(gè)核苷酸,雜交方法可通過(guò)下述方 式實(shí)現(xiàn):使所述引物或者探針暴露于或者接觸本發(fā)明的GPCR多核苷酸。優(yōu)選地,這些序 列在已適當(dāng)調(diào)控以便使非特異性結(jié)合最小化的條件下雜交,例如,為了檢測(cè)與本發(fā)明的 GPCR多核苷酸具有約80% -90%同源性的序列,適當(dāng)?shù)碾s交條件包括:在含有0. 25M的 Na2HP04、pH7. 2、6. 5%的SDS、10%的硫酸葡聚糖的緩沖液內(nèi),在42°C下雜交過(guò)夜;最后在含 有0. lxSSC、0. 1% SDS的溶液內(nèi),在55°C下洗滌。另外,適合檢測(cè)與本發(fā)明的GPCR多核苷 酸具有約90%以上同源性的序列的適當(dāng)?shù)臈l件可以包括:在0. 25M的Na2HP04、pH7. 2、6. 5% 的SDS、10%的硫酸葡聚糖內(nèi),在65°C下雜交過(guò)夜;最后在含有0. IxSSC和0. I %的SDS的 溶液內(nèi),在60°C下洗滌。
      [0057] 優(yōu)選地,能測(cè)量本發(fā)明的GPCR蛋白水平的試劑為抗體。在本發(fā)明中,術(shù)語(yǔ)"抗體" 為本領(lǐng)域中公知的術(shù)語(yǔ),表示指向抗原區(qū)域的特異性蛋白分子。就本發(fā)明的目的而言,抗 體是指與本發(fā)明的標(biāo)志物即GPCR多肽特異性結(jié)合的抗體,這種抗體可通過(guò)下述方法產(chǎn)生, 艮P,根據(jù)常規(guī)方法將各個(gè)基因克隆至表達(dá)載體,從而得到被所述標(biāo)志物基因得以編碼的蛋 白,通過(guò)通常方法,由得到的蛋白產(chǎn)生這種抗體。由標(biāo)志物基因所編碼的擔(dān)保所產(chǎn)生的部分 肽,也落在抗體的范圍內(nèi)。為了發(fā)揮抗體功能,所述部分肽可以含有至少七個(gè)氨基酸殘基, 優(yōu)選地九個(gè)氨基酸殘基,更優(yōu)選地十二個(gè)或更多個(gè)氨基酸殘基。對(duì)于本發(fā)明的抗體形態(tài)并 沒(méi)有特別的限制,只要是多克隆抗體、單克隆抗體或者其具有抗原結(jié)合部位的片段,并且包 括所有免疫球蛋白抗體。此外,本發(fā)明的抗體還包含人化抗體等特殊抗體。這種本發(fā)明的 GPCR蛋白抗體包括能夠以所屬【技術(shù)領(lǐng)域】的公知方法制備的所有抗體。優(yōu)選地,抗體肽具有 SEQ ID NO:6或者7的序列。
      [0058] 本發(fā)明的用于檢測(cè)診斷癌癥的標(biāo)志物的抗體不僅包括具有兩個(gè)全長(zhǎng)輕鏈和兩個(gè) 全長(zhǎng)重鏈的完整形態(tài),還包括抗體分子的功能片段??贵w分子的功能片段是指至少保持抗 原結(jié)合功能的片段,有Fab、F (ab')、F (ab')2以及Fv等。
      [0059] 本發(fā)明的術(shù)語(yǔ)"癌癥(cancer) "是與細(xì)胞死亡調(diào)控相關(guān)的一類疾病,是指由正常的 凋亡平衡被破壞時(shí)細(xì)胞會(huì)并不受控地過(guò)度增長(zhǎng)而導(dǎo)致的疾病。這種非正常的過(guò)于增殖的細(xì) 胞根據(jù)情況浸潤(rùn)到周圍的組織和器官以形成腫瘤塊,從而破壞或者體內(nèi)的正常結(jié)構(gòu)或使之 變形,將這種狀態(tài)稱為癌癥。通常,腫瘤是細(xì)胞的異常過(guò)度生長(zhǎng)而形成的瘤或?qū)嵸|(zhì)性病變。 腫瘤可分為良性腫瘤和惡性腫瘤。與良性腫瘤相比,惡性腫瘤的生長(zhǎng)速度非常快,并且浸潤(rùn) 周圍組織且經(jīng)常發(fā)生轉(zhuǎn)移,從而威脅生命。將這種惡性腫瘤通常稱為"癌癥",可用本發(fā)明檢 測(cè)癌癥標(biāo)志物的組合物檢測(cè)的癌癥的實(shí)例包括:髓樣癌、頭頸癌、肺癌、乳腺癌、胸腺瘤、間 皮瘤、食道癌、胰腺癌、結(jié)腸癌、肝癌、胃癌、肝小膽管癌、腎癌、膀胱癌、前列腺癌、睪丸癌、精 原細(xì)胞瘤、卵巢癌、宮頸癌、子宮內(nèi)膜癌、結(jié)腸直腸癌、淋巴瘤、急性白血病、慢性白血病、多 發(fā)性骨髓瘤、肉瘤、惡性黑素瘤以及皮膚癌,但是癌癥的種類并不限于所述實(shí)例。本發(fā)明的 用于檢測(cè)癌癥標(biāo)志物的組合物可用作用于診斷所述癌癥。在本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案中,以 胃癌、結(jié)腸癌、肝癌細(xì)胞系以及患有這些癌癥的個(gè)體為對(duì)象觀察了本發(fā)明的新GPCR蛋白的 表達(dá)結(jié)果,確認(rèn)了其表達(dá)量與正常細(xì)胞和正常個(gè)體即對(duì)照相比顯著增加。
      [0060] "轉(zhuǎn)移性癌"意圖描述癌癥的性質(zhì),并表示從初次生長(zhǎng)的癌癥部位通過(guò)血管、淋巴 管向其他部位轉(zhuǎn)移所生成的癌癥。為了根治癌癥,不僅要治療原發(fā)性癌癥,還需要控制癌癥 的轉(zhuǎn)移部位。轉(zhuǎn)移性癌的實(shí)例有通過(guò)血流轉(zhuǎn)移的癌癥,如結(jié)腸直腸癌、前列腺癌、婦科癌、胃 癌、多發(fā)性骨髓瘤、肝癌、肺癌、胰腺癌、甲狀腺癌、腎癌、肝小膽管癌、膽囊癌、神經(jīng)母細(xì)胞瘤 以及霍杰金淋巴瘤等。并且,已知尤其是婦科癌之一的乳腺癌、前列腺癌、肺癌、結(jié)腸直腸癌 是易于向骨骼和肝等中轉(zhuǎn)移的癌癥。本發(fā)明的轉(zhuǎn)移性包括所述實(shí)例,并且,只要腫瘤是具有 轉(zhuǎn)移性質(zhì)的癌癥,則并不限于此。本發(fā)明的GPC蛋白的同種型2的表達(dá)在轉(zhuǎn)移性癌中尤其 增加。因此,同種型2可用作診斷轉(zhuǎn)移性癌的標(biāo)志物。當(dāng)抑制同種型2的表達(dá)時(shí),不僅可以 有效地預(yù)防或者治療原發(fā)性癌癥,還可以有效地預(yù)防或者治療轉(zhuǎn)移性癌。
      [0061] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及包含所述組合物的用于診斷癌癥的試劑盒。
      [0062] 在本發(fā)明中使用的術(shù)語(yǔ)"診斷"是指,通過(guò)確定生物樣品或者組織樣品中本發(fā)明的 GPCR多肽或編碼該GPCR多肽的多核苷酸的有無(wú)來(lái)確認(rèn)與所述基因的表達(dá)相關(guān)的疾病的存 在或者特征。
      [0063] 本發(fā)明的試劑盒可以通過(guò)測(cè)定癌癥診斷標(biāo)志物即新的GPCR多肽或者編碼該新的 GPCR多肽的多核苷酸的表達(dá)水平來(lái)檢測(cè)該標(biāo)志物。本發(fā)明的試劑盒不僅包含用于測(cè)量癌癥 診斷標(biāo)志物表達(dá)水平的引物或探針,選擇性地識(shí)別癌癥標(biāo)志物的抗體或者其保留抗原結(jié)合 功能的片段,而且可以包含適合分析所述多肽或者多核苷酸的一個(gè)或多個(gè)其他試劑、裝置 或組合物。例如,用于定量分析本發(fā)明的多核苷酸或者基因的診斷試劑盒可以包含與編碼 GPCR多肽的多核苷酸特異性結(jié)合的至少一種寡核苷酸。優(yōu)選地,用于定量檢測(cè)本發(fā)明的基 因的診斷試劑盒可以包含SEQ ID N0:3、4或者5的特異性引物對(duì)、逆轉(zhuǎn)錄酶、Taq聚合酶、 PCR引物以及dNTP。在"測(cè)量mRNA表達(dá)水平"的背景下,只要利用已知的分析方法,可以使 用任何試劑盒而無(wú)限制。
      [0064] 優(yōu)選地,測(cè)定本發(fā)明的新的GPCR蛋白水平的癌癥診斷試劑盒可以包含與本發(fā)明 的GPCR蛋白特異地結(jié)合的抗體。在"測(cè)量蛋白表達(dá)水平"的背景下,只要利用了已知的分 析方法,可以使用任何試劑盒而無(wú)限制。ELISA試劑盒或者蛋白芯片試劑盒是優(yōu)選的。 [0065] 利用抗體測(cè)量蛋白表達(dá),是通過(guò)在GPCR蛋白和其抗體之間形成抗原-抗體復(fù)合體 來(lái)實(shí)現(xiàn)的,并且通過(guò)多種方法測(cè)量所述復(fù)合體的量,從而可以實(shí)現(xiàn)蛋白表達(dá)水平的測(cè)定。 [0066] 本發(fā)明中術(shù)語(yǔ)"抗原-抗體復(fù)合體"是指癌癥標(biāo)志物蛋白與該癌癥標(biāo)志物蛋白的 特異性抗體結(jié)合所形成的產(chǎn)物,可通過(guò)測(cè)量檢測(cè)標(biāo)記的信號(hào)大小來(lái)定量測(cè)定抗原-抗體復(fù) 合體的形成。
      [0067] 例如,通過(guò)比較癌癥疑似個(gè)體和正常對(duì)照之間的抗原-抗體復(fù)合體的量來(lái)測(cè)定 GPCR蛋白表達(dá)水平的顯著增加,從而可以診斷癌癥。若對(duì)疑似患有癌癥的個(gè)體樣品用本發(fā) 明的GPCR蛋白的特異性抗體進(jìn)行處理,則GPCR蛋白和抗體形成抗原-抗體復(fù)合體,通過(guò)基 于下述方法的試劑盒可以定量分析所述復(fù)合體:ELISA、RIA、夾心分析、蛋白印跡、放射免疫 擴(kuò)散法、奧克特洛尼免疫擴(kuò)散法、火箭免疫電泳、組織免疫染色、免疫沉淀分析法、補(bǔ)體固定 分析、FACS、蛋白芯片以及蛋白印跡方法。另外,比較分析所述分析結(jié)果與正常個(gè)體的結(jié)果, 從而可以診斷是否發(fā)生由本發(fā)明的GPCR蛋白表達(dá)增加誘導(dǎo)的癌癥。
      [0068] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及檢測(cè)本發(fā)明的GPCR多肽和編碼該GPCR多肽的多 核苷酸的方法。
      [0069] 更具體而言,可以在mRNA水平或者蛋白水平檢測(cè)基因的表達(dá),并且可以采用公知 方法實(shí)現(xiàn)mRNA或者蛋白在生物樣品中的分離。
      [0070] 本發(fā)明中,術(shù)語(yǔ)"生物樣品"是指能夠測(cè)量GPCR基因或者蛋白表達(dá)水平的樣品,可 用于本發(fā)明的生物樣品的實(shí)例包括如組織、細(xì)胞、全血、血清、血漿、唾液、痰、腦脊髓液或者 尿等,但是并不限于此。
      [0071] 本發(fā)明的檢測(cè)方法可以通過(guò)比較正常對(duì)照中的基因表達(dá)水平與疑似患有癌癥的 個(gè)體中的基因表達(dá)水平,來(lái)確認(rèn)疑似患有癌癥的個(gè)體中是否實(shí)際發(fā)生癌癥疾病。更具體而 言,測(cè)量存在于來(lái)自疑似患有癌癥的個(gè)體的樣品中的本發(fā)明標(biāo)志物的表達(dá)水平。將所述水 平與來(lái)自正常對(duì)照的生物樣品中所測(cè)量的水平進(jìn)行比較。當(dāng)本發(fā)明標(biāo)志物的表達(dá)水平在所 述個(gè)體中比在所述正常對(duì)照中高時(shí),則確定所述個(gè)體受到癌癥的侵襲。
      [0072] 優(yōu)選地,當(dāng)將編碼本發(fā)明的GPCR多肽的多核苷酸用作標(biāo)志物時(shí),所述方法可以包 括:(a)制備生物樣品;(b)用測(cè)量GPCR的mRNA水平所用的試劑處理所述生物樣品;(c)檢 測(cè)所述試劑和與所述試劑互補(bǔ)的多核苷酸之間的復(fù)合體;以及(d)將檢測(cè)的量與正常對(duì)照 進(jìn)行比較。另外,當(dāng)使用本發(fā)明的GPCR多肽作為標(biāo)志物時(shí),所述方法可以包括:(a)制備生 物樣品;(b)用本發(fā)明的GPCR蛋白的特異性抗體處理所述生物樣品;(c)檢測(cè)所述抗體和 與其互補(bǔ)的蛋白之間的復(fù)合體;以及(d)將檢測(cè)的量與正常對(duì)照進(jìn)行比較;利用所述方法 可以檢測(cè)本發(fā)明的GPCR蛋白。
      [0073] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及用于治療及預(yù)防癌癥的組合物,其包含抑制本發(fā) 明的GPCR基因表達(dá)的寡核苷酸或抑制本發(fā)明的GPCR蛋白活性的抗體,作為活性成分。
      [0074] 為了確定本發(fā)明的新的GPCR基因或者蛋白的致癌性,本發(fā)明人觀察表達(dá)該基 因的細(xì)胞系NIH3T3中的接觸抑制(contact inhibition),和非停泊性生長(zhǎng)(anchorage independent growth),結(jié)果確認(rèn)了在穩(wěn)定地表達(dá)本發(fā)明GPCR基因的細(xì)胞系中接觸抑制不 敏感而非停泊性生長(zhǎng)增加的情況。并且向沒(méi)有免疫力的裸鼠注射攜帶本發(fā)明GPCR基因的 載體,誘導(dǎo)癌癥的形成。
      [0075] 優(yōu)選地,本發(fā)明的組合物可以包含抑制本發(fā)明的GPCR多核苷酸表達(dá)的物質(zhì),抑制 所述多核苷酸表達(dá)的物質(zhì)可選自siRNA、shRNA、適體以及反義寡核苷酸。優(yōu)選地,寡核苷酸 選自 SEQ ID NO: 20-23、SEQ ID NO:36-51 和其組合。
      [0076] 本發(fā)明的術(shù)語(yǔ)"siRNA(small interfering RNA,小干擾RNA) "是指能夠介導(dǎo)RNA 干擾或者基因沉默的約20個(gè)核苷酸大小的小核酸分子。當(dāng)將SiRNA導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)時(shí),則其被 Dicer蛋白識(shí)別,從而降解編碼所述GPCR多肽的基因,結(jié)果特異性抑制GPCR基因的表達(dá)。
      [0077] "shRNA (short hairpin RNA) " 是指短發(fā)夾 RNA (short hairpin RNA),其中 siRNA 靶序列的有義和反義序列被5-9個(gè)堿基的環(huán)狀結(jié)構(gòu)(loop structuce)隔開(kāi)。
      [0078] 最近,作為用于在基因水平上調(diào)控蛋白的表達(dá)的方法,研究了 RNA干擾 (RNAinterference, RNAi)現(xiàn)象。通常,siRNA特異性結(jié)合具有與祀基因互補(bǔ)的序列的mRNA, 從而抑制蛋白的表達(dá)。
      [0079] 按照基于這些RNA的基因療法所采用的典型方法,將包含本發(fā)明的siRNA或者 shRNA的組合物給予個(gè)體,從而可以抑制癌基因或者轉(zhuǎn)移基因的表達(dá)。例如,根據(jù)Filleur et al.,Cancer Res.,63(14) :3919-22, 2003所述方法,通過(guò)少量靜脈內(nèi)注射siRNA,能夠調(diào) 控基因表達(dá)。并且,為了增加 siRNA的細(xì)胞吸收和穩(wěn)定性,根據(jù)Chien et al.,Cancer Gene Ther.,12(3)321-8, 2005等文獻(xiàn),還可以注射綴合物形式的siRNA。
      [0080] 制造本發(fā)明的組合物所包含的SiRNA的方法有直接化學(xué)合成(Sui G et al·,(2002)Proc Natl Acad Sci USA 99:5515-5520)、體外轉(zhuǎn)錄(Brummelkamp et al.,(2002) Science 296:550-553)等,但是并不限于此。另外,shRNA用于克服由siRNA的 高生物合成成本、低轉(zhuǎn)染效率所引起的、RNA干擾效果的保持時(shí)間短等缺點(diǎn),其可以由通過(guò) 腺病毒、慢病毒或質(zhì)粒表達(dá)載體系統(tǒng)所含的基于RNA聚合酶的啟動(dòng)子表達(dá),所述表達(dá)系統(tǒng) 已經(jīng)導(dǎo)入至細(xì)胞內(nèi)。利用細(xì)胞內(nèi)的siRNA加工酶(Dicer或RNA酶(Rnase)),將所述shRNA 加工成功能siRNA分子,從而誘導(dǎo)靶基因沉默。
      [0081] 術(shù)語(yǔ)"反義"是指,具有核苷酸堿基序列和亞基與亞基主鏈的寡聚體,所述主鏈允 許反義寡聚體與RNA中的靶序列、通常與mRNA通過(guò)沃森一克里克堿基配對(duì)雜交,在靶序列 中形成RNA:寡聚體異源雙鏈。寡聚體可具有對(duì)靶序列的準(zhǔn)確序列互補(bǔ)性或者近似互補(bǔ) 性。這些反義寡聚體可以使阻滯或者抑制mRNA的翻譯和/或修飾mRNA的加工以產(chǎn)生所 述mRNA的剪接變體。從而,本發(fā)明的反義寡聚體為與編碼GPCR多肽的多核苷酸互補(bǔ)的反 義寡聚體。對(duì)于基因療法,可以將本發(fā)明的反義寡核苷酸通過(guò)通常方法給予。組合物的 給藥,可以預(yù)防或抑制癌基因表達(dá)。例如,按照J(rèn).S.kim et al·,J controlled Release 53,175-182(1998)所述,通過(guò)靜電引力,將混合反義寡聚脫氧核苷酸裝載到基于聚-L-賴 氨酸的微粒上,并靜脈內(nèi)注射裝載了寡核苷酸的微粒,但是將本發(fā)明的反義基因給予個(gè)體 的方法并不限于所述實(shí)例。
      [0082] 優(yōu)選地,可將公知的治療劑直接或者間接地綴合于本發(fā)明的組合物中或者使其一 并包含于本發(fā)明的組合物中。能夠與抗體結(jié)合的治療劑包括放射性核素、藥物、淋巴因子、 毒素以及雙特異性抗體等,但是本發(fā)明的組合物所包含的治療劑并不限于此,只要是能夠 與抗體綴合后發(fā)揮癌癥治療效果或者可以與抗體、siRNA、shRNA以及反義寡核苷酸聯(lián)合給 藥,任何已知的治療劑都可以用于本發(fā)明中。
      [0083]上述放射性核素有 3H、14C、32P、35S、36Cl、 51Cr、57Co、58Co、59Fe、9〇Y、 125I、131I 以及 186Re 等,但是并不限于此。
      [0084] 可用于本發(fā)明的藥物以及毒素有依托泊苷、替尼泊苷、阿霉素、柔紅霉素、洋紅霉 素、氨蝶呤、放線菌素、絲裂霉素、順鉬以及順鉬類似物、博萊霉素、埃斯培拉霉素、5-氟尿嘧 啶、美法侖以及氮芥等,但是并不限于此。
      [0085] 另外,優(yōu)選地,本發(fā)明的組合物可以是包含抑制GPCR蛋白的活性或者表達(dá)的物質(zhì) 的、抑制癌癥的生長(zhǎng)或者轉(zhuǎn)移的組合物。優(yōu)選地,所述活性抑制物質(zhì)為特異性地識(shí)別GPCR 蛋白的抗體。這種抗體包括所有單克隆抗體和嵌合抗體、人源化抗體以及其人類抗體。并 且,只要所述抗體具有特異性地識(shí)別GPCR蛋白的結(jié)合特性,則其不僅包含具有兩個(gè)全長(zhǎng)重 鏈和兩個(gè)全長(zhǎng)輕鏈的完整形式,而且可以是抗體分子功能片段的形式??贵w分子的功能片 段是指至少具有抗原結(jié)合功能的片段,有Fab、F (ab')、F (ab')2以及Fv等。
      [0086] 優(yōu)選地,根據(jù)給藥方式,本發(fā)明的組合物可包含可接受的載體。
      [0087] 活性成分可以與藥學(xué)可接受的載體、賦形劑或者添加劑一并混合。可用于本發(fā)明 的藥學(xué)可接受的載體種類包括,生理鹽水、無(wú)菌水、林格氏溶液、緩沖鹽水、葡萄糖溶液、麥 芽糊精溶液、甘油、乙醇、脂質(zhì)體。它們可以單獨(dú)使用或組合使用。根據(jù)需求,組合物還可以 進(jìn)一步包含如抗氧化劑、緩沖液等通常使用的其他添加劑。另外,根據(jù)給藥模式,可以將組 合物與稀釋劑、分散劑、表面活性劑、結(jié)合劑以及潤(rùn)滑劑一起配制成注射劑量形式,如水溶 液、懸浮液、乳液等,或配制成口服劑量形式,如藥丸、膠囊、顆?;蛘咂瑒?。與所述載體綴合 后,靶器官、組織特異性抗體或者配體,可以將活性成分引導(dǎo)向所述器官或組織。本領(lǐng)域已 知的通常載體、賦形劑或者添加劑都可以用于本發(fā)明中,并且可使用的載體、賦形劑或者添 加劑的種類并不限于所述實(shí)例。
      [0088] 根據(jù)目的或者需求,按照所屬【技術(shù)領(lǐng)域】中所使用的通常方法、給藥途徑、治療有效 量可以將如上所述的組合物或者制劑適當(dāng)?shù)亟o予個(gè)體。給藥途徑例如可以有口服、非腸道、 皮下、腹膜內(nèi)、肺內(nèi)以及鼻腔內(nèi)給藥。對(duì)于局部免疫抑制治療,必要時(shí)通過(guò)包含病變內(nèi)給藥 的適當(dāng)?shù)姆椒ńo予所述組合物。非腸道注射包括肌肉內(nèi)、靜脈內(nèi)、動(dòng)脈內(nèi)、腹膜內(nèi)或者皮下 途徑。包含本發(fā)明的反義寡核苷酸、siRNA或者shRNA的組合物的治療有效量和給藥次數(shù), 可根據(jù)多種因素適當(dāng)?shù)貨Q定,如要預(yù)防或者治療的癥狀的種類、給藥途徑、性別、健康狀態(tài)、 食餌、個(gè)體年齡和體重以及疾病的嚴(yán)重程度等。
      [0089] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及篩選本發(fā)明GPCR蛋白的調(diào)控劑的方法,所述篩選 方法包括:用候選化合物處理表達(dá)本發(fā)明的GPCR蛋白的細(xì)胞,并測(cè)量細(xì)胞中GPCR介導(dǎo)的信 號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性。
      [0090] 根據(jù)需求,可采用上述的重組載體、用所述載體轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞或者容納所述基 因的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物來(lái)適當(dāng)?shù)剡x擇表達(dá)本發(fā)明的GPCR蛋白的細(xì)胞。將與GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo) 活性相關(guān)的候選化合物應(yīng)用于細(xì)胞,從而可以確定候選化合物是否發(fā)揮本發(fā)明的GPCR蛋 白調(diào)控劑的功能。更具體而言,如果候選化合物誘導(dǎo)GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性增加,則確 定其為本發(fā)明PGCR蛋白的激動(dòng)劑。相反,如果GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性因此減少,則確定 候選化合物為拮抗劑。
      [0091] 本發(fā)明的術(shù)語(yǔ)"激動(dòng)劑"是指,與受體結(jié)合從而能夠直接或者間接地誘導(dǎo)、改善或 者增強(qiáng)受體對(duì)配體的生物學(xué)活性或者激活的分子。就本發(fā)明的目的而言,激動(dòng)劑是指與本 發(fā)明的GPCR蛋白結(jié)合從而能夠誘導(dǎo)或者改善受體的生物學(xué)活性或者激活的物質(zhì)。本發(fā)明 的術(shù)語(yǔ)"拮抗劑"是指顯示拮抗作用的物質(zhì)。當(dāng)一起使用兩種以上的物質(zhì)時(shí),如果一種物質(zhì) 減少另一種物質(zhì)的效果則稱其為拮抗劑。就本發(fā)明的目的而言,拮抗劑是指與GPCR蛋白的 配體互相作用以減少配體的效果的物質(zhì)。
      [0092] 另外,為了確定所述GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性是否增加或者減少,可以使用多種 方法,包括如測(cè)量參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的各種蛋白或者化合物中的一個(gè)多個(gè)的水平的方法。 優(yōu)選地,可通過(guò)監(jiān)測(cè)cAMP的水平來(lái)判斷GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性的增加或者減少。在本 發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案中,為了驗(yàn)證對(duì)新的GPCR蛋白產(chǎn)生影響的外部刺激因子,用一些已知 為GPCR配體的物質(zhì)檢查細(xì)胞生長(zhǎng)是否根據(jù)本發(fā)明的新的GPCR蛋白的超表達(dá)而得以促進(jìn)。 具體為,用EGF、PDGF、胰島素、IGF-1、HGF、VEGF、血管緊張肽II、緩激肽、LPA以及PTX處理 細(xì)胞,結(jié)果觀察到TOGF、胰島素、IGF-UVEGF、血管緊張肽II、緩激肽、LPA促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng),而 PTX抑制細(xì)胞生長(zhǎng)。
      [0093] 作為再一優(yōu)選形態(tài),本發(fā)明涉及篩選癌癥治療劑的方法,所述篩選方法包括:用候 選化合物處理表達(dá)本發(fā)明的GPCR蛋白的細(xì)胞,并測(cè)量細(xì)胞中GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性。 [0094] 可以以與上述調(diào)控劑的篩選方法類似的方法,進(jìn)行本發(fā)明的癌癥治療劑的篩選方 法。即,當(dāng)候選化合物誘導(dǎo)GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性增加時(shí),作為致癌蛋白和基因的本發(fā) 明的GPCR蛋白和基因的表達(dá)是增加的,因此可將所述候選化合物判斷為促進(jìn)腫瘤發(fā)生的 化合物。另外,若候選化合物減少GPCR介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性,則可通過(guò)該化合物抑制癌基 因和蛋白的表達(dá),確定候選化合物是癌癥的可能治療劑。對(duì)于這種篩選方法而言,可根據(jù) cAMP的表達(dá)水平而容易地判斷所述候選化合物的活性。
      [0095] 下面通過(guò)實(shí)施例更加詳細(xì)地說(shuō)明本發(fā)明。但是這些實(shí)施例僅用于示例性地說(shuō)明本 發(fā)明,本發(fā)明的范圍并不限于這些實(shí)施例。
      [0096] 實(shí)施例1 :新的GPCR的分析
      [0097] 將在胃、結(jié)腸直腸、肝癌細(xì)胞系中超表達(dá)的新的孤兒GPCR命名為hstml (human 互even ^ransniembrane protein 1,人類七次跨膜蛋白)(在下文中,將本發(fā)明的新的GPCR 基因命名為"hstml"、將本發(fā)明的新的GPCR蛋白命名為"hstml蛋白"或者"hSTMl",并且與 本發(fā)明的"新的GPCR"互換使用)。用表達(dá)量根據(jù)外部脅迫和氮或者糖的量而發(fā)生變化的裂 殖酵母粟酒裂殖酵母(S. pombe)基因 Stml+來(lái)檢測(cè)鑒定為新的孤兒GPCR并且命名為hstml 的人類同源基因。該新的受體基因位于一號(hào)染色體的1ρ36. 13位置處,并且具有多個(gè)可變 轉(zhuǎn)錄物。轉(zhuǎn)錄變體l(hstmla)(SEQ ID N0:3)是包含完整N末端的全長(zhǎng)基因,其編碼2種 hstml同種型中的一個(gè)。hstml的同種型1可由兩個(gè)不同的可變剪接變體(SEQ ID N0:3、4) 形成,所述剪接變體亦屬于本發(fā)明的一部分。hstml的同種型2來(lái)源于可變剪接變體3 (SEQ ID NO: 5),并且編碼缺少65個(gè)N末端氨基酸的蛋白。
      [0098] 實(shí)施例2.人類if常細(xì)朐纟目織中新的GPCR的mRNA水平
      [0099] 從Clontech. Co.購(gòu)買(mǎi)正??偧?xì)胞組織的總RNA。使用人類胃(目錄號(hào)(cat. No)636578)、睪丸(目錄號(hào)636533)、胸腺(目錄號(hào)6365的)、骨髓(目錄號(hào) 636548)、腦(目 錄號(hào)63653〇)、肝(目錄號(hào)63653D、大腸(目錄號(hào) 636553)、腎臟(目錄號(hào)636529)、肺(目錄 號(hào)636524)、乳腺(目錄號(hào)636570)、卵巢(目錄號(hào)636555)、心臟(目錄號(hào)636532)、甲狀腺 (目錄號(hào) 63653〇)、胰腺(目錄號(hào)636577)、小腸(目錄號(hào)636539)、前列腺(目錄號(hào) 636539) 總RNA。向1 μ g每一總RNA(total RNA)中添加1 μ I oligo (dT) 15。并且在65度下煮沸 十分鐘之后再冷卻。將混合物與Ιμ? RNA酶抑制劑、4μ1 5X RT緩沖液、2μ1 dNTP、2yl DTT、0. 5 μ I RT酶(逆轉(zhuǎn)錄酶)混合,并使用蒸餾水將總體積調(diào)整為20 μ 1,之后42°C下孵 育60分鐘,隨后70°C下孵育5分鐘,從而制備c_DNA(iNtR0N Biotech)。
      [0100] 接著混合2 μ 1制備的C-DNA和30pmole每一 GAPDH引物,并使用蒸饋水將最終體 積調(diào)整為 10 μ 1 之后添加 10 μ I 2X Taq premix (Hot start),進(jìn)行 RT-PCR。進(jìn)行 PCR,94°C 下30秒、在55°C下30秒、在72°C下一分鐘,22個(gè)循環(huán),并將制備的PCR產(chǎn)物裝載至瓊脂糖 凝膠上從而測(cè)量產(chǎn)物的量。進(jìn)行校準(zhǔn),從而使所有樣品中的GAPDH PCR產(chǎn)物的量相同。使 用校準(zhǔn)的c-DNA相同的量、采用hstml引物,以如上所述的條件進(jìn)行35個(gè)循環(huán),將由此獲得 的PCR產(chǎn)物裝載至瓊脂糖凝膠上,從而可視地測(cè)定在各個(gè)組織中的mRNA水平。通過(guò)實(shí)時(shí) PCR(Corbrtt Research公司的RG-6000)定量在各個(gè)組織中hstml的mRNA量。試劑使用 了 Qiagen公司的2X Quantitect SYBR Green PCR試劑盒。其結(jié)果可知下述內(nèi)容,即,以在 胃中的mRNA水平為基準(zhǔn),在心臟、胰腺、胸腺、前列腺、小腸觀察到了相對(duì)更小水平的mRNA, 而與對(duì)照相比在肺、睪丸中有更高水平的mRNA表達(dá)。尤其是與其他組織相比,在睪丸的表 達(dá)水平表現(xiàn)出顯著的差別。實(shí)時(shí)PCR中所用的引物如表1所示,用作對(duì)照所用的GAPDH的 引物購(gòu)自 Qiagen(QT00079247)。以 95°C下 5 秒、55°C下 15 秒、72°C下 20 秒,40 ?45 個(gè)循 環(huán),進(jìn)行實(shí)時(shí)PCR。
      [0101] 表 1
      [0102]

      【權(quán)利要求】
      1. 組合物在制備用于治療或預(yù)防癌癥的藥物中的用途,所述組合物包含抑制編碼 GPCR多肽的多核苷酸表達(dá)或抑制所述GPCR多肽活性的試劑,所述GPCR多肽由SEQ ID NO: 1 或2的氨基酸序列構(gòu)成。
      2. 如權(quán)利要求1所述的用途,其中所述抑制多核苷酸表達(dá)的試劑是針對(duì)編碼由SEQ ID NO: 1或2的氨基酸序列構(gòu)成的GPCR多肽的多核苷酸的反義寡核苷酸、siRNA或shRNA。
      3. 如權(quán)利要求2所述的用途,其中所述siRNA的核苷酸序列選自SEQ ID N0S:20-23、 SEQ ID NOS :36-51 和其組合。
      4. 如權(quán)利要求1所述的用途,其中所述抑制GPCR多肽活性的試劑是特異性結(jié)合由SEQ ID NO: 1或2的氨基酸序列構(gòu)成的GPCR多肽的抗體或其抗原結(jié)合片段。
      5. 如權(quán)利要求1-4中任一項(xiàng)所述的用途,其中所述癌癥是胃癌、結(jié)腸直腸癌或肝癌。
      6. 如權(quán)利要求1-5中任一項(xiàng)所述的用途,其中所述癌癥是轉(zhuǎn)移性癌。
      【文檔編號(hào)】A61K48/00GK104225623SQ201410379478
      【公開(kāi)日】2014年12月24日 申請(qǐng)日期:2009年9月7日 優(yōu)先權(quán)日:2009年5月25日
      【發(fā)明者】鄭璟淑, 元美善, 安智苑, 俞香淑, 廉榮一, 李熙龜 申請(qǐng)人:韓國(guó)生命工學(xué)研究院
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