專利名稱：一段白色念珠菌dna序列(5)特異性的確定及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一段白色念珠菌(Candida albicans)DNA序列(5)的特異性確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
本發(fā)明的技術(shù)方案為本發(fā)明利用現(xiàn)有的方法確定了長(zhǎng)度為192bp的一段白色念珠菌(Candida albicans)特異DNA序列(5)及其PCR引物，用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，其序列如下aatcaaacac cgttcgtcct aaacatcaaa cacgcggaaa tagggaataa aaagaattga 60gcatttttta tggtatttag agaccacaca aaattaactg aatgacctca ttacgattgt 120accataaaga aaagccatat tcaaaggttt cttttgaagg agtttgaaga tgcaatatgg 180aatatgacgg ga 192引物序列為1.5’-tcccgtcatattccatattgc-3’2.5’-aatcaaacaccgttcgtcct-3’上述的白色念珠菌特異DNA序列(5)用于診斷白色念珠菌的基因芯片的探針序列，并通過(guò)上述的引物序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)或直接用于PCR診斷。
用本發(fā)明建立的臨床檢測(cè)技術(shù)所使用的方法具有快速、準(zhǔn)確、操作簡(jiǎn)便、成本低等優(yōu)點(diǎn)。
圖2、圖2續(xù)是測(cè)序圖。其中圖2是測(cè)定的序列、圖2續(xù)是原始測(cè)序圖譜。
圖3是用Blast軟件對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序結(jié)果與預(yù)計(jì)序列的比較分析。
圖4、圖4續(xù)(1)、圖4續(xù)(2)是基因數(shù)據(jù)庫(kù)中Blast搜索結(jié)果。
圖5.基因芯片雜交結(jié)果。
本發(fā)明可用于PCR方法或基因芯片方法進(jìn)行白色念珠菌的臨床檢測(cè)。用本發(fā)明提供的序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，根據(jù)PCR方法獲得產(chǎn)物是否出現(xiàn)和大小判斷是否為白色念珠菌感染。也可用本序列為探針，作為基因芯片中的一個(gè)檢測(cè)位點(diǎn)，然后用本發(fā)明中的PCR引物序列擴(kuò)增臨床標(biāo)本，并標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)。<110>昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司<120>一段白色念珠菌DNA序列(5)特異性的確定及其應(yīng)用<140><141><160>1<210>1<211>192<212>DNA<213>白色念珠菌(Candida albicans)<220><221>gene<222>(1)…(192)<400>1aatcaaacac cgttcgtcct aaacatcaaa cacgcggaaa tagggaataa aaagaattga 60gcatttttta tggtatttag agaccacaca aaattaactg aatgacctca ttacgattgt 120accataaaga aaagccatat tcaaaggttt cttttgaagg agtttgaaga tgcaatatgg 180aatatgacgg ga 19權(quán)利要求
1.一段白色念珠菌DNA序列(5)特異性的確定，其特征在于該序列的長(zhǎng)度為192bp，序列及PCR引物如下aatcaaacac cgttcgtcct aaacatcaaa cacgcggaaa tagggaataa aaagaattga 60gcatttttta tggtatttag agaccacaca aaattaactg aatgacctca ttacgattgt 120accataaaga aaagccatat tcaaaggttt cttttgaagg agtttgaaga tgcaatatgg 180aatatgacgg ga 192引物序列為1.5’-tcccgtcatattccatattgc-3’2.5’-aatcaaacaccgttcgtcct-3’
2.一段白色念珠菌DNA序列(5)特異性的應(yīng)用，其特征在于該序列用于診斷白色念珠菌的基因芯片的探針序列，并通過(guò)上述的引物序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)或直接用于PCR診斷。
全文摘要
本發(fā)明涉及一段白色念珠菌DNA序列(5)的特異性確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明通過(guò)基因數(shù)據(jù)庫(kù)資料的搜尋和分析，確定了一段白色念珠菌DNA序列(5)的特異性及PCR擴(kuò)增引物，該序列長(zhǎng)度為192bp。通過(guò)對(duì)婦女生殖道白色念珠菌感染標(biāo)本的PCR擴(kuò)增，克隆，獲得該序列，測(cè)序證明與預(yù)計(jì)序列一致。再經(jīng)生物信息學(xué)方法分析，基因芯片雜交分析，結(jié)果證實(shí)了該序列對(duì)于白色念珠菌的特異性。用本發(fā)明建立的臨床檢測(cè)技術(shù)所使用的方法具有快速、準(zhǔn)確、操作簡(jiǎn)便、成本低等優(yōu)點(diǎn)。
文檔編號(hào)C07H21/00GK1465706SQ0211388
公開日2004年1月7日 申請(qǐng)日期2002年6月12日 優(yōu)先權(quán)日2002年6月12日
發(fā)明者譚德勇, 朱寶生 申請(qǐng)人:昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司