線粒體融合基因2的-2786位點(diǎn)變異及其檢測(cè)方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。更具體地說(shuō),涉及人線粒體融合基因2 (Mitofusin 2,Mfn2 gene) 5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(Singlenucleotide polymorphism, SNP)及其與原發(fā)性高血壓相關(guān)性的檢測(cè)。本發(fā)明還涉及檢測(cè)這個(gè)SNP位點(diǎn)的試劑盒。
【背景技術(shù)】
[0002]原發(fā)性高血壓(Essential hypertens1n, EH)是一種常見(jiàn)而多發(fā)的、由環(huán)境與遺傳因素共同致病的多因素、多基因疾,對(duì)人類健康造成了極大的影響。隨著分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的高血壓相關(guān)基因已經(jīng)有150余種,但是的發(fā)病機(jī)制仍然不完全清楚,高血壓的早期診斷和預(yù)防問(wèn)題仍然未能完全解決。EH是遺傳因子和環(huán)境共同作用的結(jié)果,血壓的變化30%-60%歸因于遺傳。由于環(huán)境因素是可以控制和確認(rèn)的,而對(duì)高血壓遺傳學(xué)因素卻是固定不變的。因此,對(duì)可變因素的控制,如對(duì)高血壓危險(xiǎn)因素的預(yù)防,可以在一定程度上延緩和防止高血壓的發(fā)病,但是對(duì)固定不變的遺傳因素的認(rèn)識(shí)不足卻在一定程度上嚴(yán)重影響著對(duì)高血壓發(fā)病、診斷和治療。因此對(duì)高血壓遺傳學(xué)的研究十分必要(王佐廣,溫紹君,吳兆蘇.高血壓、易感基因與單核苷酸多態(tài)性[J].高血壓雜志,2001,9:259-264)。
[0003]近二十余年來(lái),有關(guān)高血壓治療的研究更多地集中在對(duì)血壓的控制和對(duì)靶器官的保護(hù),并已取得突飛猛進(jìn)的發(fā)展。但是,這些手段并不能從根本上控制血壓,目前對(duì)人類內(nèi)源性抗高血壓基因的研究還很少,因此,研究?jī)?nèi)源性抗高血壓機(jī)制是今后高血壓防治研究的主要方向之一,具有重要的研究?jī)r(jià)值和應(yīng)用前景,如果通過(guò)調(diào)節(jié)內(nèi)源性抗高血壓機(jī)制治療高血壓病,將會(huì)促進(jìn)我國(guó)生物醫(yī)療技術(shù)的發(fā)展,并為我國(guó)每年節(jié)省巨大的醫(yī)療費(fèi)用。
[0004]目前所發(fā)現(xiàn)的高血壓相關(guān)基因,歸結(jié)起來(lái)可以概括為促高血壓基因和抗高血壓基因,Mfn2屬于后者。Mfn2的前身是我國(guó)學(xué)者陳光慧等[Chen GH, Zhang CH, Zhu YQ, et al.Express1n of a novel gene related to hypertens1n[J].Natl Med J China, 1997,77: 823-828.]于1997年對(duì)培養(yǎng)的自發(fā)性高血壓大鼠(SHR)和正常Wistar Kyoto (WKY)大鼠的血管平滑肌細(xì)胞進(jìn)行差異顯示,克隆出一個(gè)新基因一一增殖抑制基因(hyperplasiasuppressor gene,HSG)。它包含有4160bp的喊基對(duì),共編碼661個(gè)氨基酸(NM_014874,GeneBank Access U41803)。后經(jīng)一系列體內(nèi)、體外實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)[Chen KH, Guo XM, DalongMa, et al.Dysregulat1n of HSG triggers vascular proliferative disorders[J].Nature Cell B1l, 2004, 6,872-883.],HSG 可以明顯地抑制 Ras-Raf 蛋白-絲裂素活化蛋白激酶基因表達(dá),并且可以激活抗癌基因的表達(dá),有效地阻遏細(xì)胞周期和抑制多種細(xì)胞的增殖,且這種抑制作用是通過(guò)細(xì)胞凋亡的方式實(shí)現(xiàn)的。因此,HSG基因是原發(fā)性高血壓的候選基因之一,后經(jīng)基因功能研究表明,HSG基因參與線粒體融合,因此正式命名為線粒體融合基因 2 (Mitofusin 2,Mfn2)。
[0005]由于Mfn2基因在原發(fā)性高血壓患者和自發(fā)性高血壓大鼠血管和白細(xì)胞中主要的特點(diǎn)是出現(xiàn)表達(dá)下降,這應(yīng)該是其表達(dá)調(diào)控出現(xiàn)了異常,但是目前對(duì)Mfn2基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面的研究較少。5’端非編碼區(qū)是處于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游,是啟動(dòng)子和主要轉(zhuǎn)錄因子存在部位,5’端非編碼區(qū)-2786bp (從起始密碼子的“A”起向上第2786位的位置,在SEQ IDNO:1中為第32位核苷酸)變異正好處于這個(gè)位置。我們?cè)谶M(jìn)行序列的生物信息學(xué)分析時(shí)發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)位于Mfn2基因5’端非編碼區(qū)內(nèi),且處于相對(duì)保守的區(qū)域。另外,該變異位點(diǎn)是一些非常重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子Bed、Ik-2和Dfd等的潛在結(jié)合部位,從轉(zhuǎn)錄調(diào)控角度而言,具有非常重要的價(jià)值,因而可能具有非常重要的意義。
[0006]綜上所述,為了最終實(shí)現(xiàn)根治原發(fā)性高血壓,本領(lǐng)域迫切需要深入研究原發(fā)性高血壓的發(fā)病機(jī)制,尋找原發(fā)性高血壓易感基因,篩選出具有高風(fēng)險(xiǎn)的原發(fā)性高血壓患者,開(kāi)發(fā)檢測(cè)原發(fā)性高血壓易感基因的方法、試劑盒,以及相關(guān)的治療藥物等。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0007]本發(fā)明的目的是提供一種檢測(cè)高血壓易感基因Mfn2多態(tài)性位點(diǎn)的方法及檢測(cè)試劑盒。
[0008]本發(fā)明提供了一種可以通過(guò)高血壓易感性基因的檢測(cè)預(yù)測(cè)高血壓發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的方法,即檢測(cè)Mfn2基因5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn)的基因型。5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn)為C堿基的基因型的個(gè)體其高血壓的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)遠(yuǎn)高于普通人群。
[0009]所述的5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn),位于Mfn2的5’端非編碼區(qū)中(Chromosome 1-NC_000001.11區(qū)域的11977395位點(diǎn))。其中,脫氧核糖核酸(DNA)序列編號(hào):5’端非編碼區(qū)-2786位置基于SEQ ID NO:1 ;引物I基于SEQ ID NO:2 ;引物2基于SEQ ID NO:3 ;擴(kuò)增產(chǎn)物基于SEQ ID NO:4o
[0010]具體而言,該方法包括步驟:(a)抽提樣品的基因組DNA,擴(kuò)增獲得Mfn2基因5’端非編碼區(qū);(b)通過(guò)特異性的引物擴(kuò)增獲得Mfn2基因包含5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn)的區(qū)域,擴(kuò)增產(chǎn)物為SEQ ID NO:4 ; (c)檢測(cè)步驟(b)產(chǎn)物中單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)5’端非編碼區(qū)-2786的基因型。
[0011]所述的擴(kuò)增Mfn2基因5’端非編碼區(qū)的引物序列如SEQ ID NO 2和SEQ ID NO 3所示。
[0012]上述方法中涉及的測(cè)序、擴(kuò)增、抽提基因組DNA等技術(shù)均可采用本領(lǐng)域的常規(guī)操作方法。
[0013]本發(fā)明提供了一種檢測(cè)高血壓易感基因的試劑盒,它含有可以包括特異性擴(kuò)增Mfn2基因5’端非編碼區(qū)中包含-2786位點(diǎn)的區(qū)域的引物。
[0014]在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例中,與特異性擴(kuò)增Mfn2基因5’端非編碼區(qū)中包含5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn)的區(qū)域的引物的序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID N0:3所示。
[0015]
本發(fā)明經(jīng)研究顯示,首次證明了 Mfn2基因單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)5’端非編碼區(qū)-2786(位于Mfn2 5’端非編碼區(qū)中,Chromosome 1- NC_000001.11 區(qū)域的 11977395 C/T)與高血壓密切相關(guān),而且發(fā)現(xiàn)了它的新功能:Mfn2基因單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)5’端非編碼區(qū)-2786位點(diǎn)(Chromosome 1- NC_000001.11區(qū)域的11977395位點(diǎn))基因型的改變將導(dǎo)致高血壓的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)升高。其中關(guān)聯(lián)研究結(jié)果顯示,在Mfn2基因5