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      一種提取擬南芥種子中總rna的方法_2

      文檔序號(hào):9904636閱讀:來源:國知局
      [0036] 研鉢等工具用ImL無水乙醇燃燒滅菌。
      [0037] 提取Buffer:100mM Tris-HCl(P朋.5),10mM 抓TA(PH = 8.0),2%(W/V)十二烷基 硫酸裡,0.6M NaCl,0.4M巧樣酸Ξ鋼,高壓滅菌。
      [0038] β-琉基乙醇(Bio Basic Inc)、水飽和酪(北京鼎國)、0.1%DEPC(Biosha巧)水、異 丙醇、氯仿、均為普通分析純有機(jī)試劑。
      [0039] 8M LiCl,LiCl為分析純無機(jī)試劑,力郵EPC水溶解。
      [0040] 3M乙酸鋼(P冊(cè).2),分析純乙酸鋼粉末,力郵EPC水溶解,利用冰醋酸調(diào)PH至5.2。
      [0041 ] 75%乙醇用0.1%DEPC水配制。
      [0042] 實(shí)施例1
      [0043] 1、一種提取擬南芥種子中總RNA的方法,步驟如下:
      [0044] l)擬南芥成熟種子約100mg,液氮研磨,加入60°C提前預(yù)熱的提取Buffe;rlmL,β- 琉基乙醇 50uL,滿旋 Imin,13000巧m、20°C 離屯、lOmin;
      [0045] 2)吸取上清液(約1血),分裝在Ξ個(gè)1.5mL Eppendorf管,每管加入1倍體積氯仿,1 倍體積水飽和酪,滿旋15s,13000巧m、20 °C離屯、1 Omin;
      [0046] 3)每管吸取上清液(約300uL)于1個(gè)1.5mL EppendoW管內(nèi),加入1/3體積的8M LiCl,-80°C沉淀化,溶解,13000巧m,4°C 離屯、3min;
      [0047] 4)去上清,加入500uL DEPC水溶解,加入1/10體積3M乙酸鋼(PH=5.2)和等體積異 丙醇,室溫靜置3min,13000巧m、20 °C離屯、5min,獲得沉淀;
      [004引 5)沉淀經(jīng)75%乙醇洗涂,13000巧111、20°(:離屯、5111111,室溫干燥后加入30~40化 RNAase打ee水溶解,-80°C保存。
      [0049] 2、擬南芥種子總RNA質(zhì)量檢測(cè)
      [0050] 1)利用上述方法,對(duì)擬南芥成熟種子(6個(gè)樣品)進(jìn)行RNA提取,獲得RNA樣品。電泳 分析結(jié)果如圖1所示,5s、18s、28s條帶清晰、整齊,28s條帶亮度接近是18s條帶亮度的兩倍, 說明所提取的擬南芥種子總RNA具有完整性較好。
      [0051 ] 2)將上述制得的擬南芥種子總RNA樣品,W滅菌的0.1 %DEPC水為空白對(duì)照,利用 Nano化op測(cè)得A260/28日和A230/26日值,檢測(cè)結(jié)果表明,所提取的擬南芥種子RNA的A260/28日在1.9~ 2.1之間,A230/260> 1.8,說明RNA純度較好;(RNA integarity number)RIN > 7,說明RNA完整 性好;具體純度及產(chǎn)率參見表1。
      [0052]表1.擬南芥種子RNA純度及濃度檢測(cè)
      [0化3]
      [0化4]
      [0化5] 實(shí)施例2
      [0056] 提取流程參照實(shí)施例1,步驟(1)中提取緩沖液預(yù)熱溫度及步驟(3)中-80°C沉淀時(shí) 間見表2,其他參數(shù)同實(shí)施例1。
      [0057] 提取得到的擬南芥種子總RNA樣品進(jìn)行純度、產(chǎn)率檢測(cè),結(jié)果見表2。
      [0058] 表2.不同提取條件下RNA樣品純度及產(chǎn)率檢測(cè)
      [0化9]
      [0060] 對(duì)比例1
      [0061] 1、一種提取擬南芥種子中總RNA的方法,步驟如下:
      [0062] l)擬南芥成熟種子約100mg,液氮研磨,加入60°C提前預(yù)熱的提取Buffe;rlmL,β- 琉基乙醇50uL,滿旋Imin,13000巧m、4°C離屯、lOmin;
      [0063] 2)吸取上清液(約ImL),分裝在Ξ個(gè)1.5mL Eppendorf管,每管加入1倍體積CIA(氯 仿:異戊醇=24:1),1倍體積水飽和酪,上下顛倒混勻15次,13000巧m、4°C離屯、1 Omin;
      [0064] 3)吸取上清液,平均分裝在兩個(gè)化pendorpf管內(nèi),每管加入等體積的水飽和酪,顛 倒混勻;室溫靜置3111111,加入1/^2體積口4,劇烈搖晃混勻153,13000巧111,4°(:離屯、10111111;
      [00化]4)吸取上清液于1個(gè)1.5mL E卵endorf·管內(nèi),加入體積8M LiCl,-8(TC沉淀地, 溶解,13000巧m,4°C 離屯、5min;
      [0066] 5)去上清,加入500uL DEPC水溶解,加入1/10體積3M乙酸鋼(PH=5.2)和等體積異 丙醇,室溫靜置3min,13000巧m、4°C離屯、5min,獲得沉淀;
      [0067] 6)沉淀經(jīng)75%乙醇洗涂,13000巧111,4°(:離屯、5111111,室溫干燥后加入30~40化 RNAase打ee水溶解,-80°C保存。
      [006引 2、擬南芥種子總RNA質(zhì)量檢測(cè)
      [0069] 1)利用上述方法,對(duì)擬南芥成熟種子(6個(gè)樣品)進(jìn)行RNA提取,獲得RNA樣品。
      [0070] 2)將上述制得的擬南芥種子總RNA樣品,W滅菌的0.1 %DEPC水為空白對(duì)照,利用 Nano化op測(cè)得A260/28日和A230/26日值,結(jié)果如表3所示。
      [0071 ]表3.擬南芥種子RNA純度及產(chǎn)率檢測(cè)
      [0072]
      [0073] 由表3數(shù)據(jù)分析可知,對(duì)比例1的方法中在低溫條件下離屯、,其RNA的產(chǎn)率較室溫條 件離屯、的方法低。
      【主權(quán)項(xiàng)】
      1. 一種提取擬南芥種子中總RNA的方法,其特征在于,包括以下步驟: (1) 在液氮冷卻條件下研磨擬南芥種子,得擬南芥種子凍干粉; (2) 將擬南芥種子凍干粉加入到預(yù)熱的提取緩沖液中,再加入β-巰基乙醇,渦旋混合, 離心,吸取上清液,得第一離心上清液; (3) 第一離心上清液中加入氯仿和水飽和酚,渦旋混勻,18~25 °C條件下離心,吸取上 清液,得第二離心上清液; (4) 第二離心上清液中加入氯化鋰,靜置,離心,得第一離心沉淀; (5) 用DEPC水溶解第一離心沉淀,加乙酸鈉和異丙醇,靜置,離心,得第二離心沉淀; (6) 將第二離心沉淀經(jīng)醇洗,干燥,復(fù)溶即得所述擬南芥種子總RNA。2. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述提取緩沖液的成分為:lOOmM Tris-HCl, 10mM EDTA,2%十二烷基硫酸鋰,0.6M NaCl,0.4M梓檬酸三鈉。3. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(2)中,每百毫克擬南芥種子凍干粉中加 入提取緩沖液1~3mL,β-巰基乙醇50~150yL。4. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(2)中,提取緩沖液的預(yù)熱溫度為40~60 Γ。5. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(2)中,渦旋振蕩1~2min。6. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(3)中,氯仿添加量為1倍體積的第一離 心上清液,水飽和酚添加量為1倍體積的第一離心上清液。7. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(4)中,所述氯化鋰的終濃度為2~3M。8. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(4)中,-80°C條件下靜置15min~2h。9. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(5)中,所述乙酸鈉的終濃度為0.15~ 0.3M〇10. 如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(2)和(5)中,離心的條件為18~25°C。
      【專利摘要】本發(fā)明公開了一種提取擬南芥種子中總RNA的方法,包括:(1)在液氮冷卻條件下研磨擬南芥種子,得擬南芥種子凍干粉;(2)加入到預(yù)熱的提取緩沖液中,再加入β-巰基乙醇,渦旋混合,離心,吸取上清液;(3)加入氯仿和水飽和酚,渦旋混勻,18~25℃條件下離心,吸取上清液;(4)加入氯化鋰,靜置,離心,得第一離心沉淀;(5)用DEPC水溶解第一離心沉淀,加乙酸鈉和異丙醇,靜置,離心,得第二離心沉淀;(6)將第二離心沉淀經(jīng)醇洗,干燥,復(fù)溶即得所述擬南芥種子總RNA。本發(fā)明方法操作時(shí)間短,重復(fù)性好,提取的擬南芥種子的RNA純度好、質(zhì)量高,為其他高油、高脂、以及多糖多酚植物組織的提取提供技術(shù)參考。
      【IPC分類】C12N15/10
      【公開號(hào)】CN105671032
      【申請(qǐng)?zhí)枴緾N201610201835
      【發(fā)明人】甘銀波, 吳敏潔, 顏安, 盛喆承, 于濤
      【申請(qǐng)人】浙江大學(xué)
      【公開日】2016年6月15日
      【申請(qǐng)日】2016年3月31日
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