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      一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針及試劑盒的制作方法

      文檔序號:10589217閱讀:686來源:國知局
      一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針及試劑盒的制作方法
      【專利摘要】本發(fā)明公開了一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針及試劑盒。所述引物和探針的序列如SEQ ID NO:1?4,和SEQ ID NO:5?8,和SEQ ID NO:9?12,和SEQ ID NO:13?16,和SEQ ID NO:17?20,和SEQ ID NO:21?24,和SEQ ID NO:25?28,和SEQ ID NO:29?32,和SEQ ID NO:33?36;其中SEQ ID NO:3?4,7?8,11?12,15?16,19?20,23?24,27?28,31?32,35?36的5’端和3’端分別連接不同熒光標記。還公開了利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法。了解客戶皮膚過敏的內(nèi)因和外因,為其提供個性化美容健康解決方案,使抗過敏美容產(chǎn)品效果最大化。
      【專利說明】
      一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針及試劑盒
      技術(shù)領(lǐng)域
      [0001] 本發(fā)明涉及美容領(lǐng)域,尤其涉及一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針及試 劑盒。
      【背景技術(shù)】
      [0002] SNP(單核苷酸多態(tài)性)是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換、顛換、缺失 和插入,是一種最常見的遺傳標記,在人群中的攜帶頻率大于1%,廣泛應用于人類疾病診 斷、藥物個體化使用、生物學基礎(chǔ)研究等領(lǐng)域。隨著對不同SNP位點研究的深入,通過多個 SNP位點的組合檢測以及后續(xù)的數(shù)據(jù)分析,可以針對不同人群的基因信息制定個性化健康 解決方案。
      [0003] 人體的皮膚外觀受到內(nèi)因和外因的影響,外因包括紫外線、環(huán)境污染、不當美容產(chǎn) 品使用等,內(nèi)因則體現(xiàn)在與皮膚相關(guān)的生化變化,包括蛋白活性、荷爾蒙水平等,這些變化 大多是由遺傳基因決定的?,F(xiàn)階段的皮膚保養(yǎng)方法多是根據(jù)外因采取的,如使用防曬霜、保 濕劑等,然而這些無針對性的保養(yǎng)方法大多效果甚微,治標不治本。隨著生活水平的提高, 對于提高皮膚光滑和緊固度的需求越來越大,結(jié)合內(nèi)外因進行針對性美容護膚將比傳統(tǒng)方 法更具優(yōu)勢,因此準確了解內(nèi)因顯得至關(guān)重要。
      [0004] 皮膚的過敏反應受到多個基因影響,每個基因又存在多個SNP位點,這些位點會影 響相關(guān)基因的酶活性。通過相關(guān)基因的SNP位點檢測可以評測不同個體的皮膚抗過敏能力, 還可以評估相關(guān)美容產(chǎn)品是否適用于檢測者,使產(chǎn)品效果達到最大化,在此基礎(chǔ)上結(jié)合日 常生活習慣調(diào)整,使美容效果進一步提升。對于這種檢測方法,選取準確的位點組合以及后 續(xù)數(shù)據(jù)分析尤為重要。國內(nèi)外已有專利報道利用SNP位點基因型判斷美容產(chǎn)品適用皮膚類 型,但仍存在著易感SNP位點選取不準確、檢測結(jié)果未能量化綜合分析問題。此外,當前未見 結(jié)合不同基因 SNP位點組合檢測和量化算法評估皮膚抗過敏能力的報道。
      [0005] 中國實用新型專利201320009798.7公開了一種基因芯片,利用該基因芯片檢測美 白和老化相關(guān)基因 SNP位點,美白基因的SNP位點包括SLC45A2(re35391 )、KITLG (rs642742)、ASIP(rsl015362)、TYR(rsl042602)、0CA2(rsl800414)、DCT(rs2031526)、MClR (rs885479),老化基因的SNP包括MMPl(rsl799750)、TIMPl(rs4898)、SIRT6(rsl07251)、 S0D2(rs4880)、NQ01(rsl800566)、TNFA(rsl800629)、EPHX(rsl051740),但該專利采用的基 因芯片方法較繁瑣,難以適用大量檢測。中國發(fā)明專利申請201180056031.3篩選到了一組 與皮膚老化相關(guān)的基因(LPL、ADIP0Q、PLN等),并根據(jù)該組基因篩選到一種抗老化新材料, 該專利申請中未提及基因相關(guān)SNP位點。中國專利申請201080044917.1提供了一種利用天 然反義多核苷酸或化合物調(diào)控FLG基因表達,從而達到預防或治療與FLG相關(guān)的疾病。
      [0006] 美國專利US200812286033通過單萜類物質(zhì)誘導相關(guān)基因表達以達到改善皺紋的 效果。美國專利US200912512368通過含有異戊烯異黃酮的化妝品誘導ELN和C0L3A1基因的 表達,達到了改善皮膚外觀的效果。美國專利US201514618080和US201313932565通過在皮 膚過敏位置使用朝鮮薊提取物和橄欖油提取物,使包括ELN和C0L3A1在內(nèi)的相關(guān)基因受到 調(diào)控上調(diào)表達,從而達到改善過敏皮膚的功效。
      [0007] 以上專利/專利申請均利用外來物質(zhì)調(diào)控體內(nèi)基因的表達,但每個個體的基因中 卻存在差異SNP位點,這種方法難以達到個性化保養(yǎng)或治療。英國專利GB20110021917檢測 了與美容產(chǎn)品成分生物學途徑相關(guān)的靶基因 SNP位點,進而判斷該產(chǎn)品是否適用于使用者, 該專利涉及的 SNP 位點有 MMP-l(rsl799750)、NQ01(rsl800566)、GSTPl(rsl695)、hGPXl (rsl0504)〇

      【發(fā)明內(nèi)容】

      [0008] 本發(fā)明的目的在于提供一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針。
      [0009] 為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針,其特 征在于,所述序列如SEQIDN0:1-4,和SEQIDN0:5-8,和SEQIDN0:9-12,和SEQIDN0: 13-16jPSEQIDN0:17-20jPSEQIDN0:21-24jPSEQIDN0:25-28jPSEQIDN0:29-32,和SEQ ID N0:33-36;其中SEQ ID , 35-36的5 ' 端和 3 ' 端分別 連接不同熒光標記。
      [0010] 本發(fā)明提供一種用于評估皮膚抗過敏情況的試劑盒,其特征在于,含有所述的引 物和探針。
      [0011] 本發(fā)明還提供一種利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法,其特征在 于,使用所述引物和探針,或所述的試劑盒。
      [0012] 進一步,步驟為:
      [0013] 1)使用所述引物和探針或所述試劑盒對客戶進行SNP位點檢測;
      [0014] 2)根據(jù)易感SNP位點組合計算出客戶的皮膚抗過敏能力值;所述易感SNP位點組合 為ΤΜΕΜ232 rs7701890、TMEM232 rs100 67777、RTELl-TNFRSF6B rs6010620、FLG-ASl rs3126085、IL-13 rsl800925、IL-13 rs20541、IL-13 rs848、TNFA rsl800629、TNFAIP3 rs2230926;
      [0015] 3)結(jié)合1)的SNP位點檢測結(jié)果及2)的皮膚抗過敏能力值,進行結(jié)果判斷。
      [0016]進一步,所述步驟1)為,
      [0017] 提取客戶的DNA樣本;
      [0018] 采用所述引物和探針或所述試劑盒進行PCR擴增;優(yōu)選的,PCR擴增的反應程序為 50Γ2π?η,95Γ?0π?η,95Γ?58、60-(:1π?η 循環(huán) 40 次。
      [0019]進一步,所述步驟2)為,
      [0020] 根據(jù)已知易感SNP位點組合的各個位點基因型的致病風險比值比計算出個體綜合 風險比值比〇R(C),計算方程式為:
      [0021] 通過已知中國人群不同年齡段皮膚過敏產(chǎn)生平均風險比值odds(D),計算出檢測 個體的皮膚過敏產(chǎn)生風險值比值〇dds(X),計算式為odds(X) =0R(C) Xodds(D);
      [0022] 計算出綜合風險值:
      [0023]根據(jù)已知正?;蛐腿巳猴L險值F(N),計算出個體皮膚抗過敏能力值^
      [0024]進一步,所述步驟3)的結(jié)果判斷為,
      [0025] 1)若個體皮膚抗過敏能力值低于100%,則表示該個體的皮膚抗過敏能力低于該 年齡段人群的正常值,抗過敏能力差,屬于易過敏的體質(zhì);值越低,抗過敏能力越差;
      [0026] 2)若個體皮膚抗過敏能力值等于100%,則表示該個體的皮膚抗過敏能力與該年 齡段人群的正常值一樣,抗過敏能力一般;
      [0027] 3)若個體皮膚抗過敏能力值高于100%,則表示該個體的皮膚抗過敏能力高于該 年齡段人群的正常值,抗過敏能力較好,屬于不易過敏的體質(zhì);值越高,抗過敏能力越好;
      [0028]同時;
      [0029] 若基因 TMEM232的SNP位點rs7701890為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性皮 炎;若為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正?;蛐?;
      [0030] 若基因 TMEM232的SNP位點rs100 67777為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性皮 炎;若為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正常基因型;
      [0031] 若基因 RTEL1-TNFRSF6B的SNP位點rs6010620為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過 敏性皮炎;若為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正?;蛐?; [0032] 若基因 FLG-AS1的SNP位點rs3126085為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性皮 炎;若為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正?;蛐停?br>[0033] 若基因 IL-13的SNP位點rsl800925為C/T,表明攜帶雜合突變,皮膚濕疹風險更高; 若為T/T,表明攜帶純合突變,皮膚濕疹風險更高;若為C/C,則為正?;蛐停?br>[0034] 若基因 IL-13的SNP位點rs20541為A/G,表明攜帶雜合突變,哮喘、牛皮蘚、過敏性 鼻炎風險更高;若為G/G,表明攜帶純合突變,但風險正常;若為A/A,則為正常基因型,但由 于攜帶A,哮喘、牛皮蘚、過敏性鼻炎風險更高;
      [0035]若基因 IL-13的SNP位點rs848為A/C,表明攜帶雜合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更高; 若為C/C,表明攜帶純合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更高;若為A/A,則為正?;蛐?;
      [0036] 若基因 TNFA的SNP位點rsl800629為A/A,表明攜帶純合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎、哮喘 風險更高;若為A/G,表明攜帶雜合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎、哮喘風險更高;若為G/G,則為正常 基因型;
      [0037] 若基因 TNFAIP3的SNP位點rs2230926為G/T,表明攜帶雜合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風 險更高;若為G/G,表明攜帶純合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更高;若為T/T,則為正?;蛐?。 [0038] 本發(fā)明(1)篩選出一組可經(jīng)過多篇文獻驗證,且分子機制清晰,可用于全面準確評 估皮膚抗過敏能力的SNP位點組合;(2)采用特異性強、靈敏度高的TaqMan-MGB探針檢測方 法進行檢測,可同時檢測多個樣本;(3)通過算法精確量化過敏風險以評估皮膚抗過敏能 力,為檢測者提供個性化的皮膚抗過敏方案。
      [0039] 本發(fā)明采用的技術(shù)方案為:結(jié)合分子機制研究、文獻檢索和臨床數(shù)據(jù)篩選,得到一 組皮膚抗過敏相關(guān)的易感SNP位點組合,所述組合位點分別為TMEM232(rs7701890、 rs100 67777)、RTEL卜TNFRSF6B(rs6010620)、FLG-ASl(rs3126085)、IL-13(rsl800925、 rs20541、rs848)、TNFA(rsl800629)、TNFAIP3(rs2230926),所述組合的位點信息見表1,該 組合位點可以準確評估不同個體的皮膚抗過敏能力。
      [0040] 表1易感SNP位點信息表
      [0043] 為了檢測所述位點,根據(jù)引物和熒光探針最優(yōu)原則設計檢測所需的引物和探針, 所述引物及熒光探針如下(下劃線為SNP位點):
      [0044] TMEM232(rs7701890)引物及熒光探針序列:

      [0089] 所述位點檢測方法具體步驟如下:
      [0090] 1、人體唾液樣本采集。采用無創(chuàng)唾液自動流出采集方式,在唾液采集前30min需用 飲用水清理口腔中雜物,采集2mL唾液存放于唾液保存液以供檢測。
      [0091] 2、人體全基因組DNA提取。采用碘化鉀法,參考具體步驟為:取0 . lmL唾液于1.5mL 離心管中,加入500yL 0.01mol/L PBS溶液反復吹打,lOOOOrpm離心5min;去上清,沉淀加入 50yL 5mol/LKI溶液,震蕩混勻,再加入 100yL 0.9%NaCl溶液、150yL酚/氯仿(25:24,V/V) 混合液,震蕩30s,lOOOOrpm離心5min;取200yL上清,加入200yL異丙醇,混勾,lOOOOrpm離心 5min;去上清,沉淀加入lmL無水乙醇洗滌,lOOOOrpm離心5min;棄無水乙醇,沉淀在超凈臺 中吹干,加50yL TE緩沖液溶解,-20°C保存?zhèn)溆谩?br>[0092] 3、PCR反應體系及反應程序。10yL反應體系含TaQMgin?Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems,美國應用生物技術(shù)有限公司)5yL、DNA模板lyL、熒光探針(每個SNP 位點的檢測對應探針混合在一起)(2.5μΜ)和引物混合液(每個SNP位點的檢測對應引物混 合在一起)1.5yL、ddH 20 2.5yL。反應程序為501€2111丨11,95°(:10111丨11,95°(:158、60°(:1111丨11循環(huán) 40次。檢測儀器為StepOnePlus實時焚光定量PCR儀(Applied Biosystems,美國應用生物技 術(shù)有限公司)。
      [0093] 4、實驗結(jié)果分析。米用StepOnePlus?Software v2.3(Applied Biosystems,美國 應用生物技術(shù)有限公司)進行分析,根據(jù)不同的熒光信號,得出對應SNP位點的基因型。
      [0094]皮膚抗過敏能力量化方法如下:
      [0095] 1、皮膚過敏風險比值比計算。已知檢測所得的各個位點基因型的過敏風險比值比 為分別為〇Ri、〇R2"_〇Rm(文獻查詢得知,結(jié)果見表3),可以計算出個體綜合風險比值比0R (C),計筧方稈式如下:
      [0097] 2、通過步驟1計算出的個體綜合風險比值比0R(C),通過文獻或其它統(tǒng)計途徑可以 獲得中國人群皮膚過敏風險平均風險比值odds(D)(已知中國人群不同年齡段皮膚過敏產(chǎn) 生平均風險比值〇dds(D)分別為:20-35歲:0.43,36-45歲:0.45,46-55歲:0.45),通過比值 比計算公式可以計算出檢測個體的過敏風險值比值〇dds(X),計算方程式如下:
      [0099] 3、通過步驟2計算出的個體的過敏風險值比值odds(X),即可以通過風險值推算公 式可以計算出綜合風險值F(X),計算方程式如下:
      [0101] 4、通過步驟3計算得到的綜合風險值可以評估不同個體的皮膚抗過敏能力,已知 正?;蛐腿巳猴L險值F(N)(已知正常基因型人群風險值F(N)分別為:20-35歲:30%,36_ 45歲:31%,46-55歲:31%),可以計算出個體皮膚抗過敏能力值V,計算方程式如下:
      [0103]檢測結(jié)果個性化分析及解決方案:
      [0104]根據(jù)抗過敏能力量化計算結(jié)果,結(jié)合相關(guān)位點的功能及分子機制,判斷皮膚過敏 風險,評估檢測者可以使用含有何種成分的美容產(chǎn)品,并為其調(diào)整有利于護膚的日常生活 飲食習慣。相關(guān)基因的分子機制如下:如果TMEM2 3 2、RTEL1-TNFRSF6B、FLG-AS1攜帶突變,則 皮膚容易發(fā)生過敏性皮炎;IL-13攜帶突變,容易造成濕疹、哮喘、牛皮蘚關(guān)節(jié)炎等癥狀; TNFA攜帶突變,會增加哮喘、牛皮蘚等風險;TNFAIP3攜帶突變,增加類風險關(guān)節(jié)炎、系統(tǒng)性 紅斑狼瘡風險。
      [0105] 有益效果:
      [0106] 可以充分了解皮膚過敏的內(nèi)因和外因,為用戶提供個性化美容健康解決方案,使 美容產(chǎn)品使用效果最大化。此外,還可以為檢測者調(diào)整有利于護膚的日常生活飲食習慣。
      【具體實施方式】
      [0107] 下面詳細描述本發(fā)明的實施例,所述實施例的示例在旨在用于解釋本發(fā)明,而不 能理解為對本發(fā)明的限制。實施例中未注明具體技術(shù)或條件者,按照本領(lǐng)域內(nèi)的文獻所描 述的技術(shù)或條件或者按照產(chǎn)品說明書進行。所用試劑或儀器未注明生產(chǎn)廠商者,均為可以 通過市購獲得的常規(guī)產(chǎn)品。
      [0108] 實施例1:引物和探針設計
      [0109] 1、設計并合成以下引物和探針,合成單位:Applied Biosystems,美國應用生物技 術(shù)有限公司。
      [0110] TMEM232(rs7701890)引物及熒光探針序列:
      [0111] 正向引物TGTTGGCTTTAATTGTTCAGA SEQ ID N0:1;
      [0112] 反向引物TGCCACAGAAATATAAGGATCA SEQ ID NO:2;
      [0113] 熒光探針FAM-ATTACTATAT4ATTTAGACTTG-MGB SEQ ID NO:3;
      [0114] 熒光探針VIC-ATTACTATATgATTTAGACTTG-MGB SEQ ID NO:4;
      [0115] TMEM232(rs100 67777)引物及熒光探針序列:
      [0116] 正向引物ACCTTTTCAAAACACAAGCCT SEQ ID NO:5;
      [0117] 反向引物GCCTCTATGCTTATGTCAGTCC SEQ ID NO:6;
      [0118] 熒光探針FAM-AGACTCTAC4CTTCTTTAAT-MGB SEQ ID NO:7;
      [0119] 熒光探針VIC-AGACTCTACgCTTCTTTAAT-MGB SEQ ID NO:8;
      [0120] RTELl-TNFRSF6B(rs6010620)引物及熒光探針序列:
      [0121] 正向引物CCAGCCTAGAGCTAGAAACGG SEQ ID NO:9;
      [0122] 反向引物GCTGCTCCTCTCAACATCTCA SEQ ID NO: 10;
      [0123] 熒光探針FAM-CCTGGGAGGAGC4CCTGCTT-MGB SEQ ID NO: 11;
      [0124] 熒光探針VIC-CCTGGGAGGAGCgCCTGCTT-MGB SEQ ID NO: 12;
      [0125] FLG-ASl(rs3126085)引物及熒光探針序列:
      [0126] 正向引物TCTGTCTTTGGCTATATGAGT SEQ ID NO: 13;
      [0127] 反向引物TAGTTGATGCCAAGATTCCA SEQ ID NO: 14;
      [0128] 熒光探針FAM-CTTTATGTAAGT4ACGACTT-MGB SEQ ID NO: 15;
      [0129] 熒光探針VIC-CTTTATGTAAGTgACGACTT-MGB SEQ ID NO: 16;
      [0130] IL-13(rsl800925)引物及熒光探針序列:
      [0131] 正向引物TGACATCAACACCCAACAGGC SEQ ID NO: 17;
      [0132] 反向引物AGTCTCTGCAGGATCAACCC SEQ ID NO: 18;
      [0133] 熒光探針FAM-CTTCTAGGAAAAgGAGGGAAGA-MGB SEQ ID NO: 19;
      [0134] 熒光探針VIC-CTTCTAGGAAAAIGAGGGAAGA-MGB SEQ ID NO:20;
      [0135] IL-13(rs20541)引物及熒光探針序列:
      [0136] 正向引物AATTTTACCCCTCCCTAACCC SEQ ID NO:21;
      [0137] 反向引物GAAGCTGGCTGAATATCCAT SEQ ID NO:22;
      [0138] 熒光探針FAM-CAGTTGAAC2GAGCCCAGATCC-MGB SEQ ID NO:23;
      [0139] 熒光探針VIC-CAGTTGAAq;GAGCCCAGATCC-MGB SEQ ID NO:24;
      [0140] IL-13(rs848)引物及熒光探針序列:
      [0141] 正向引物ACCCCAGTGAGGTAGCAGAA SEQ ID NO:25;
      [0142] 反向引物TGAGTGTGTTTGTCACCGTT SEQ ID NO:26;
      [0143] 熒光探針FAM-CCAGGGACTCCTGGgGTCCACTGC-MGB SEQ ID NO:27;
      [0144] 熒光探針VIC-CCAGGGACTCCTGGIGTCCACTGC-MGB SEQ ID NO:28;
      [0145] TNFA(rsl800629)引物及熒光探針序列:
      [0146] 正向引物CCCCAAAAGAAATGGAGGCAAT SEQ ID NO:29;
      [0147] 反向引物AAGGATACCCCTCACACTCCC SEQ ID NO:30;
      [0148] 熒光探針FAM-TTGAGGGGCATG4GGACGG-MGB SEQ ID NO:31;
      [0149] 熒光探針VIC-TTGAGGGGCATGgGGACGG-MGB SEQ ID NO:32;
      [0150] TNFAIP3(rs2230926)引物及熒光探針序列:
      [0151] 正向引物TTGCTGGGTCTTACATGCAGA SEQ ID NO:33;
      [0152] 反向引物GTATCATAGCAAAGCCCCGTT SEQ ID NO:34;
      [0153] 熒光探針FAM-AAGGCGCTGTgCAGCACGCTC-MGB SEQ ID NO:35;
      [0154] 熒光探針VIC-AAGGCGCTGTICAGCACGCTC-MGB SEQ ID NO:36;
      [0155] 2、SNP位點檢測
      [0156] 1、樣本采集。本實施例中的檢測樣本采用人體唾液,在唾液采集前30min需用飲用 水清理口腔中雜物,采集2mL唾液存放于唾液保存液以供檢測。
      [0157] 2、人體全基因組DNA提取。采用碘化鉀法,參考具體步驟為:取0 . lmL唾液于1.5mL 離心管中,加入500yL 0.01mol/L PBS溶液反復吹打,lOOOOrpm離心5min;去上清,沉淀加入 50yL5mol/L KI溶液,震蕩混勻,再加入 100yL 0.9%NaCl溶液、150yL酚/氯仿(25:24,V/V) 混合液,震蕩30s,lOOOOrpm離心5min;取200yL上清,加入200yL異丙醇,混勾,lOOOOrpm離心 5min;去上清,沉淀加入lmL無水乙醇洗滌,lOOOOrpm離心5min;棄無水乙醇,沉淀在超凈臺 中吹干,加50yL TE緩沖液溶解,-20°C保存?zhèn)溆谩?br>[0158] 3、反應體系及反應程序10yL反應體系含TaqMan?Universal PCR Master Mix (Applied Biosystems,美國應用生物技術(shù)有限公司)5yL、DNA模板lyL、熒光探針(每個SNP 位點的檢測對應探針混合在一起)(2.5μΜ)和引物混合液(每個SNP位點的檢測對應引物混 合在一起)1.5yL、ddH 20 2.5yL。反應程序為501€2111丨11,95°(:10111丨11,95°(:158、60°(:1111丨11循環(huán) 40次。檢測儀器為StepOnePlus實時焚光定量PCR儀(Applied Biosystems,美國應用生物技 術(shù)有限公司)。
      [0159] 4、檢測程序運行結(jié)束后,采用 StepOnePl us?Sof twar e v2 · 3 (App 1 i ed Biosystems,美國應用生物技術(shù)有限公司)對檢測結(jié)果進行分析,得出對應SNP的基因型(見 表2)。
      [0160] 表2SNP位點檢測結(jié)果表
      [0162] 3、抗過敏能力量化評估及個性化解決方案
      [0163] 1)、過敏綜合風險值計算。通過文獻查詢得知,不同位點的過敏風險比值比如表3 所示。
      [0164] 表3相關(guān)位點基因型的風險比值比(0R)表
      [0166] (1)個體過敏綜合風險比值比計算。不同位點的OR值如表3所示,則

      [0167] (2)通過步驟(1)計算出個體綜合風險比值比0R(C),綜合文獻和調(diào)查數(shù)據(jù)得知中 國人群過敏性膚質(zhì)的比值odds (D)約為0.43 (本實施例的檢測樣本屬于該年齡段,故選擇該 年齡段的數(shù)據(jù)),通過比值比計算公式可以計算出檢測個體的皮膚過敏風險值比值odds(X) = 0R(C) Xodds(D) =4.19X0.43 = 1.76。
      [0168] (3)通過步驟(2)計算出的檢測個體過敏風險比值odds(X),綜合風險值
      [0169] (4)已知正?;蛐腿巳猴L險值F(N)為30%,可以計算出皮膚抗過敏能力值
      [0170] 2)、檢測結(jié)果綜合分析。該檢測者的皮膚抗過敏能力值為47%,皮膚遺傳抗過敏能 力較差。同時結(jié)合相關(guān)基因的分子機制,由表2可知該檢測個體中的RTEL1-TNFRSF6B攜帶易 感位點純合突變,IL-13、TNFAIP3攜帶易感位點雜合突變,這些突變會影響相關(guān)蛋白活性, 受到外界因素刺激后容易發(fā)生過敏性皮炎、濕疹、哮喘等過敏反應。
      [0171] 3)、個性化解決方案:多個相關(guān)基因的突變,使得該個體皮膚抗過敏能力較正?;?因型弱,皮膚易過敏,應慎重注意化妝品的選擇。不宜使用磨砂膏、去死皮膏等,因為皮膚的 角質(zhì)層薄和角質(zhì)層損傷是造成敏感的主要原因,因而保養(yǎng)的首要原則就是維護角質(zhì)層不受 傷害。不建議選擇含有酒精和化學成分的化妝品,這些化妝品對于對于過敏性脆弱皮膚傷 害很大。日常生活中多吃含豐富維生素 C的蔬果,胡蘿卜中的β-胡蘿卜素能有效預防花粉過敏 癥、過敏性皮炎等過敏反應;紅棗中含有大量抗過敏物質(zhì)一環(huán)磷酸腺苷,可阻止過敏反應的 發(fā)生,凡有過敏癥狀的患者,可以經(jīng)常服用紅棗;忌海鮮、燒烤、油炸、辛辣食品。
      [0172] 盡管上面已經(jīng)示出和描述了本發(fā)明的實施例,可以理解的是,上述實施例是示例 性的,不能理解為對本發(fā)明的限制,本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員在不脫離本發(fā)明的原理和宗旨 的情況下在本發(fā)明的范圍內(nèi)可以對上述實施例進行變化、修改、替換和變型。
      【主權(quán)項】
      1. 一種用于評估皮膚抗過敏情況的引物和探針,其特征在于,所述序列如SEQ ID NO: lUPSEQIDN0:5UPSEQIDN0:9-12jPSEQIDN0:13-16jPSEQIDN0:17-20jP SEQ ID NO: 21-24,和SEQ ID NO: 25-28,和SEQ ID NO: 29-32,和SEQ ID NO: 33-36;其中SEQ ID NO: 3-4,7-8,11-12,15-16,19-20,23-24,27-28,31-32,35-36的5 ' 端和3 ' 端分別連接不 同焚光標記。2. -種用于評估皮膚抗過敏情況的試劑盒,其特征在于,含有權(quán)利要求1所述的引物和 探針。3. -種利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法,其特征在于,使用權(quán)利要求1 的引物和探針,或使用權(quán)利要求2的試劑盒。4. 權(quán)利要求3所述利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法,其特征在于,步驟 為: 1) 使用權(quán)利要求1的引物和探針或權(quán)利要求2的試劑盒對客戶進行SNP位點檢測; 2) 根據(jù)易感SNP位點組合計算出客戶的皮膚抗過敏能力值;所述易感SNP位點組合為 TMEM232 rs7701890、TMEM232 rs100 67777、RTEL卜TNFRSF6B rs6010620、FLG-ASl rs3126085、IL-13 rsl800925、IL-13 rs20541、IL-13 rs848、TNFA rsl800629、TNFAIP3 rs2230926; 3) 結(jié)合1)的SNP位點檢測結(jié)果及2)的皮膚抗過敏能力值,進行結(jié)果判斷。5. 權(quán)利要求4所述利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法,其特征在于,所述 步驟1)為, 提取客戶的DNA樣本; 采用權(quán)利要求1所述引物和探針或權(quán)利要求2所述試劑盒進行PCR擴增;優(yōu)選的,PCR擴 增的反應程序為 50°C2min,95°C10min,95°C15s、60°Clmin 循環(huán) 40 次。6. 權(quán)利要求4所述利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法,其特征在于,所述 步驟2)為, 根據(jù)已知易感SNP位點組合的各個位點基因型的致病風險比值比計算出個體綜合風險 比值比〇R(C),計算方程式為:通過已知中國人群不同年齡段皮膚過敏嚴生平均風險比值〇dds(D),計算出檢測個體 的皮膚過敏產(chǎn)生風險值比值odds(X),計算式為odds(X) =0R(C) X odds(D);計算出綜合風 險值根據(jù)已知正?;蛐腿巳猴L險值F(N),計算出個體皮膚抗過敏能力.7. 權(quán)利要求4所述利用基因檢測輔助客戶選擇正確美容方法的方法,其特征在于,所述 步驟3)的結(jié)果判斷為, 1) 若個體皮膚抗過敏能力值低于100 %,則表示該個體的皮膚抗過敏能力低于該年齡 段人群的正常值,抗過敏能力差,屬于易過敏的體質(zhì);值越低,抗過敏能力越差; 2) 若個體皮膚抗過敏能力值等于100 %,則表示該個體的皮膚抗過敏能力與該年齡段 人群的正常值一樣,抗過敏能力一般; 3) 若個體皮膚抗過敏能力值高于100 %,則表示該個體的皮膚抗過敏能力高于該年齡 段人群的正常值,抗過敏能力較好,屬于不易過敏的體質(zhì);值越高,抗過敏能力越好; 同時; 若基因 TMEM232的SNP位點rs7701890為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性皮炎;若 為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正?;蛐?; 若基因 TMEM232的SNP位點rs100 67777為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性皮炎; 若為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正?;蛐?; 若基因 RTEL1-TNFRSF6B的SNP位點rs6010620為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性 皮炎;若為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正常基因型; 若基因 FLG-AS1的SNP位點rs3126085為A/G,表明攜帶雜合突變,容易得過敏性皮炎;若 為G/G,表明攜帶純合突變,容易得過敏性皮炎;若為A/A,則為正?;蛐?; 若基因 IL-13的SNP位點rsl800925為C/T,表明攜帶雜合突變,皮膚濕疹風險更高;若為 T/T,表明攜帶純合突變,皮膚濕疹風險更高;若為C/C,則為正?;蛐?; 若基因 IL-13的SNP位點rs20541為A/G,表明攜帶雜合突變,哮喘、牛皮蘚、過敏性鼻炎 風險更高;若為G/G,表明攜帶純合突變,但風險正常;若為A/A,則為正?;蛐停捎跀y 帶A,哮喘、牛皮蘚、過敏性鼻炎風險更高; 若基因 IL-13的SNP位點rs848為A/C,表明攜帶雜合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更高;若為 C/C,表明攜帶純合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更高;若為A/A,則為正?;蛐?; 若基因 TNFA的SNP位點rsl800629為A/A,表明攜帶純合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎、哮喘風險 更高;若為A/G,表明攜帶雜合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎、哮喘風險更高;若為G/G,則為正?;?型; 若基因 TNFAIP3的SNP位點rs2230926為G/T,表明攜帶雜合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更 高;若為G/G,表明攜帶純合突變,牛皮蘚關(guān)節(jié)炎風險更高;若為T/T,則為正?;蛐?。
      【文檔編號】C12N15/11GK105950738SQ201610367539
      【公開日】2016年9月21日
      【申請日】2016年5月27日
      【發(fā)明人】紀志梁, 王毛陽, 楊志云, 劉曉瑜
      【申請人】福建愛我健康生物科技有限公司
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