專(zhuān)利名稱(chēng)：：用于將容器暴露于多個(gè)熱區(qū)的儀器和方法
技術(shù)領(lǐng)域：
：本發(fā)明涉及在執(zhí)行復(fù)雜處理中使用的多腔容器及相關(guān)儀器和檢測(cè)裝置。
背景技術(shù)：
：在此引用的所有文獻(xiàn)，或者指明的部分都通過(guò)參考的方式結(jié)合與此。然而，并非承認(rèn)任何一個(gè)文獻(xiàn)是所要求保護(hù)的主題內(nèi)容的先前技術(shù)。已經(jīng)研制了極度復(fù)雜的儀器，用于執(zhí)行需要同時(shí)且彼此獨(dú)立地執(zhí)行多個(gè)處理步驟的復(fù)雜分析。這些儀器可以用于執(zhí)行化學(xué)分析、免疫測(cè)定、基于分子的檢驗(yàn)等等。這些儀器中最先進(jìn)的可以執(zhí)行允許離開(kāi)檢驗(yàn)(walk-awaytest)的樣品到結(jié)果的、基于核酸的擴(kuò)增檢驗(yàn)(“NAAT”)。參見(jiàn)Friedenberg等人的“DevelopingaFullyAutomatedInstrumentforMolecularDiagnosticAssays”，IVDTechnology(2005)11(6):47-53；Hi11,“AutomatingNucleicAcidAmplificationTests”，IVDTechnology(2000)6(11):36_45。完全自動(dòng)化NAAT檢驗(yàn)減小了污染或者用戶錯(cuò)誤的幾率，并且由于被培訓(xùn)成能進(jìn)行諸如NAAT檢驗(yàn)這樣的很復(fù)雜的分析的醫(yī)療專(zhuān)家的國(guó)家性短缺，其變得日益重要。利用完全自動(dòng)化，儀器僅利用極少的人工介入就能夠執(zhí)行分析的所有必要步驟。對(duì)于NAAT分析而言，這些步驟包括:處理原始樣品以抽取一個(gè)或者多個(gè)目的核酸(nucleicacidofinterest),并且將核酸從潛在干涉物質(zhì)中分離；執(zhí)行擴(kuò)增反應(yīng)(amplificationreaction),諸如基于聚合酶的擴(kuò)鏈反應(yīng)(extensionreaction),以增加分析的靈敏度(例如，TMA,SDA或PCR);以及目的核酸的檢測(cè)。然而，總的來(lái)說(shuō)，用于執(zhí)行NAAT分析的儀器不易攜帶，并且其用處典型地局限于可控環(huán)境中的大規(guī)模檢驗(yàn)。因此，當(dāng)前對(duì)于能夠在使用地檢驗(yàn)中，例如，現(xiàn)場(chǎng)檢驗(yàn)或者臨床醫(yī)療應(yīng)用中，執(zhí)行樣品到結(jié)果的NAAT分析的緊湊系統(tǒng)存在需求。
發(fā)明內(nèi)容本發(fā)明提供用于執(zhí)行諸如樣品到結(jié)果的NAAT分析的復(fù)雜程序的緊湊的儀器、檢測(cè)器及相關(guān)的容器和處理，其容許以比傳統(tǒng)的大型儀器系統(tǒng)大大節(jié)約的成本的使用地點(diǎn)檢驗(yàn)。所述容器包括相互連接的腔室，該腔室能夠以單位計(jì)量的形式預(yù)先包裝有執(zhí)行分析所需要的所有試劑。該容器是使得污染機(jī)會(huì)最小的封閉系統(tǒng)。在第一實(shí)施例中，多腔容器設(shè)置為允許獨(dú)立地和/或同時(shí)地執(zhí)行多個(gè)處理步驟或者處理。在一個(gè)實(shí)施例中，所述容器包括:(I)腔室的第一線性路徑(linearpath)，所述腔室通過(guò)多個(gè)可開(kāi)連接而相互連接，該第一線性路徑包括:通過(guò)第一可開(kāi)連接而連接的第一和第二腔室，其中將第一和第二腔室以及第一可開(kāi)連接構(gòu)造成，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第一腔室中的物質(zhì)并且第一可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許該物質(zhì)從第一腔室移動(dòng)到第二腔室；通過(guò)第二可開(kāi)連接而連接的第三和第四腔室，其中將第三和第四腔室以及第二可開(kāi)連接構(gòu)造成，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第三腔室中的物質(zhì)并且第二可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許該物質(zhì)從第三腔室移動(dòng)到第四腔室；以及在第二與第四腔室之間的中間腔室；和(2)用于將樣品容納至樣品容納室中的樣品入口，假設(shè)如果該樣品容納室是第一線性路徑的腔室，那么該樣品容納室在第二與第四腔室之間。例如，該樣品入口可以用Luer連接(Luerconnection)閉合。所述中間腔室通過(guò)第三可開(kāi)連接直接或間接地連接于第二腔室，并且將該第二和中間腔室以及第三可開(kāi)連接構(gòu)造成當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第二腔室中的物質(zhì)并且第三可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許該物質(zhì)從第二腔室移動(dòng)到中間腔室或者朝著該中間腔室移動(dòng)。所述中間腔室還通過(guò)第四可開(kāi)連接直接或者間接地連接于第四腔室，并且將該第四和中間腔室以及第四可開(kāi)連接構(gòu)造成當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第四腔室中的物質(zhì)并且第四可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許物質(zhì)從第四腔室移動(dòng)到中間腔室或者朝著該中間腔室移動(dòng)。將腔室的第一線性路徑構(gòu)造成，如果物質(zhì)移動(dòng)力被施加到第一腔室中的物質(zhì)，那么第三可開(kāi)連接不從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)。還將腔室的第一線性路徑構(gòu)造成，如果物質(zhì)移動(dòng)力被施加到第三腔室中的物質(zhì)，那么第四可開(kāi)連接不從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)。第二和第四腔室沒(méi)有通過(guò)不包括中間腔室的各腔室的任何布置而相互連接。在優(yōu)選的方面，多個(gè)相互連接的腔室中的每一個(gè)都是至少與容器的另一個(gè)腔室相鄰(僅封閉分離的各腔室)。此外，容器的各腔室可以具有放射狀的排列，其中末端的腔室(即，腔室的線性路徑的最外部的腔室)具有非圓形的排列。在一個(gè)方面，所述容器包括腔室的第二和第三線性路徑，其中該第二和第三線性路徑中的每一個(gè)的腔室都通過(guò)多個(gè)可開(kāi)連接而相互連接，并且包括通過(guò)第五可開(kāi)連接連接于第一處理室的第六腔室，其中第一處理室是第一線性路徑中的位于第一與第三腔室之間的任意腔室，并且其中將第六腔室和第一處理室以及第五可開(kāi)連接構(gòu)造成當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第六腔室中的物質(zhì)并且第五可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許該物質(zhì)從第六腔室移動(dòng)到第一處理室。該方面的第二線性路徑包括第一腔室而不包括所述第一線性路徑的第三腔室，而第三線性路徑包括第三腔室而不包括所述第一線性路徑的第一腔室。中間腔室可以是第一處理室或者樣品容納室?？蛇x地，第六腔室可以是樣品容納室。在另一方面，該所述器包括通過(guò)第六可開(kāi)連接而連接于第六腔室的第七腔室，其中將第六和第七腔室以及第六可開(kāi)連接構(gòu)造成當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第七腔室中的物質(zhì)并且第六可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許物質(zhì)從第七腔室移動(dòng)到第六腔室。對(duì)于這個(gè)方面來(lái)說(shuō)，第六腔室可以是樣品容納室。第二和第三線性路徑的一個(gè)或更多個(gè)腔室可以包括用于固定樣品中的分析物的固相載體(solidsupport)。該固相載體可以是任何材料,天然或者改良的形式,其能夠固定目標(biāo)分析物。優(yōu)選的固相載體是能夠被所施加的磁場(chǎng)操控的磁響應(yīng)性顆粒或者小珠。例如，可以將該固相載體設(shè)置到第六腔室、第七腔室和第一處理室中的任何一個(gè)。為了將固相載體集中在一個(gè)腔體內(nèi)(即，增加在一個(gè)腔室的區(qū)域內(nèi)的固相載體材料的密度，而不增加設(shè)置到該腔室的固相載體的總量)，可以將該固相載體設(shè)置到具有不混溶流體的腔室，該不混溶流體不與該腔室(即，入口)中的其他組分反應(yīng)。該不混溶流體可以是油，優(yōu)選為礦物油。在另一方面，所述容器包括由多個(gè)可開(kāi)連接而相互連接的腔室的第四線性路徑，并且該第四線性路徑包括:通過(guò)第七可開(kāi)連接而連接于第二和第三線性路徑中的至少一個(gè)的第二處理室的第八腔室，其中將第八腔室和第二處理室以及第七可開(kāi)連接構(gòu)造成，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第八腔室中的物質(zhì)并且第七可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許物該質(zhì)從第八腔室移動(dòng)到第二處理室；以及通過(guò)第八可開(kāi)連接而連接于第二處理室的第九腔室，其中將該第九腔室和第二處理室以及第八可開(kāi)連接構(gòu)造成，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第二處理室中的物質(zhì)并且第八可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許該物質(zhì)從第二處理室移動(dòng)到第九腔室，并且其中該第四線性路徑不包括除了第二處理室之外的第二或者第三線性路徑的腔室。第二處理室可以與樣品容納室相鄰，或者該第二處理室可以作為樣品容納室。為了凈化樣品中的一個(gè)或者多個(gè)分析物，第八腔室可以包含用于從樣品中移除不想要的材料的洗滌液，而第九腔室可以是完全空的，因此其可以用作為用于廢洗滌液的廢物室。再一方面，所述容器包括通過(guò)第九可開(kāi)連接而連接于中間腔室的第十腔室，其中將第十腔室和中間腔室以及第九可開(kāi)連接構(gòu)造成，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第十腔室中的物質(zhì)并且第九可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，允許該物質(zhì)從第十腔室移動(dòng)到中間腔室。該方面中的第一線性路徑不包括第十腔室。通過(guò)具有屈服于適當(dāng)外力(即，不破壞腔室限定元件，或者出于預(yù)期目的，以使其變?yōu)椴黄鹱饔玫姆绞綋p壞容器的力)的柔性部分的腔室，可以促進(jìn)在各腔室之間的物質(zhì)移動(dòng)。因此，所述容器可以包括頂和底或者對(duì)置的元件，同時(shí)該元件中的至少一個(gè)是柔性片。柔性片可以具有多個(gè)層(包括被挑選為具有希望的連接特性的一個(gè)或者多個(gè)塑料層)，該多個(gè)層呈現(xiàn)出可接收的光、水和/或氧氣傳輸性能。每個(gè)對(duì)置的元件都可以由柔性片制成。該柔性片中的至少一個(gè)可以包括箔層?；诒徽辰拥牟牧系姆N類(lèi)，相互連接的腔室的邊界可以由任意密封方法限定，包括粘接劑或熱封、超聲波焊接或者射頻(“RF”)焊接。當(dāng)所述容器的元件之一是具有露出的塑料層的柔性片的時(shí)候，可以使用熱封來(lái)限定相互連接的腔室的邊界。當(dāng)所述可開(kāi)連接處于關(guān)閉狀態(tài)以防止物質(zhì)在各腔室之間運(yùn)動(dòng)的時(shí)候，每個(gè)可開(kāi)連接都可以用包括密封、閥門(mén)、或者施加于該連接的外力(例如，致動(dòng)器(actuator))的障礙(barrier)中的一個(gè)或者組合而阻斷。所述密封可以是可破裂的密封(例如，可剝的熱封，諸如人字形或者V形密封)。優(yōu)選在不同的條件下形成阻斷各腔室之間的連接的密封以及腔室限定密封，以便當(dāng)力施加于該可開(kāi)連接以將他它們從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)時(shí)，該腔室限定密封經(jīng)得住剝離或者破裂。在這個(gè)方面，腔室限定密封被稱(chēng)作為“永久密封”?？梢詫⑷萜鞯目砷_(kāi)連接中的至少一個(gè)構(gòu)造成使其能夠通過(guò)施加于相鄰腔室的物質(zhì)移動(dòng)力而從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)。所述物質(zhì)移動(dòng)力可以例如為緊壓著相鄰腔室的柔性的、至少部分可壓縮部分的內(nèi)部壓縮器，真空吸塵器，或者滾子或致動(dòng)器的形式。外部致動(dòng)器的實(shí)例是氣動(dòng)裝置或者具有壓縮式防震墊的致動(dòng)器組，這些壓縮式防震墊形成為與腔室或其柔性部分的形狀大體一致的形狀?；蛘撸撐镔|(zhì)移動(dòng)力可以是手動(dòng)的指力。為了處理大的樣品，樣品容納室的容量可以大于直接連接于樣品容納室的除了末端腔室之外的任何腔室的容量。通過(guò)順序處地理樣品的各部分，可以將不想要的樣品和處理材料移除到廢物室，或者移除到已經(jīng)將處理材料清空的腔室，并且樣品中的分析物可以被集中成用于分析的更易控制的尺寸。能夠集中(concentrate)分析物將限制容器所需要的尺寸，這對(duì)于現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)用來(lái)說(shuō)是尤其有益的，因?yàn)槿萜髟酱?，所需要的用于處理樣品的儀器就越大越重?？梢允褂镁哂腥嵝栽娜萜饕约耙幌盗袇f(xié)同操作的致動(dòng)器來(lái)實(shí)施分析物集中，這使得等分樣品能夠逐步移動(dòng)或者處理。對(duì)于具有檢測(cè)組分的處理，將各腔室中的至少一個(gè)構(gòu)造成能夠檢測(cè)樣品的特性。需檢測(cè)的是，例如，分析物的存在、化學(xué)反應(yīng)，或者樣品性質(zhì)或者樣品組分的變化。在一個(gè)方面，檢測(cè)可以包括確定指示樣品特性的信號(hào)的存在或者數(shù)量。這種信號(hào)的實(shí)例包括光(例如，冷光或熒光)、渾濁度、放射性以及電流。對(duì)于光檢測(cè)，檢測(cè)室的至少一部分需要由透光材料(例如，透明的或者半透明的)形成。在制備樣品或者樣品的組分、改良樣品或者樣品的組分、與樣品或者樣品的組分反應(yīng)，或者影響樣品或者樣品的組分中所使用的處理材料可以被設(shè)置到容器的任意腔室?？梢詫⑾嗤蛘卟煌奶幚聿牧显O(shè)置到第一和第二腔室，例如干燥的試劑(例如，凍干的或者成片的試劑)設(shè)置到第二腔室，而將用于恢復(fù)該干燥的試劑的恢復(fù)試劑設(shè)置到第一腔室。利用處理材料的這種特定的組合，希望第一腔室可以進(jìn)一步包括足以促進(jìn)干燥的試劑的恢復(fù)的數(shù)量的不混溶流體(例如，諸如礦物質(zhì)有的油)。(恢復(fù)試劑和不混溶流體可以從第二腔室一起設(shè)置，或者它們可以從不同的腔室提供到第一腔室。)在這方面，不混溶流體與恢復(fù)試劑的比率優(yōu)選從大約1:10到大約10:1，并且更優(yōu)選從大約1:3到大約10:I。不混溶流體不應(yīng)該與干燥的試劑或者恢復(fù)試劑起反應(yīng)。類(lèi)似地，第三和第四腔室可以分別設(shè)置有恢復(fù)試劑和干燥的試劑，其中可以合并干燥的試劑的恢復(fù)形式，以實(shí)現(xiàn)并用效果。例如，第二和第四腔室的干燥的試劑可以分別是擴(kuò)增試劑和酶試劑，具有基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)所需要的各組分。不混溶流體還可以與第三腔室的恢復(fù)試劑相結(jié)合，以促進(jìn)第四腔室中含有的干燥的試劑的恢復(fù)。第二和第四腔室中存在的干燥的試劑中的一個(gè)可以包括接合劑，諸如用于使用基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物而形成探針:靶復(fù)合物的探針。該探針可以具有寡核苷酸組分，該寡核苷酸組分可以具有與該基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物具有特異性地雜交(即，不會(huì)可檢測(cè)地雜交到樣品中的非目標(biāo)核酸)。為了檢測(cè)，探針可以貼有諸如熒光的、冷光的或者放射性部分的標(biāo)簽。或者，該反應(yīng)可以包括能夠識(shí)別探針:靶復(fù)合物的形成的諸如嵌入染料(例如，溴化乙錠或者SYBRGreen)的標(biāo)簽,或者可以諸如通過(guò)檢測(cè)電信號(hào)或者與探針:革巴復(fù)合物的形成相關(guān)的質(zhì)量變化，無(wú)需標(biāo)簽的協(xié)助就能進(jìn)行檢測(cè)。為了實(shí)現(xiàn)在所述基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)中的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)，與在非雜交狀態(tài)時(shí)相比，當(dāng)該探針在雜交狀態(tài)時(shí)，該探針采用不同且可檢測(cè)的形態(tài)。這些探針可以包括相互作用的標(biāo)簽，當(dāng)探針與擴(kuò)增產(chǎn)物相復(fù)合的時(shí)候，這些標(biāo)簽經(jīng)歷可檢測(cè)信號(hào)的變化。對(duì)于容納干燥的試劑的腔室，與用于構(gòu)造容器的至少另一個(gè)腔室，尤其是容納流體的直接連接的腔室的材料相比，用于構(gòu)造各腔室的所有或者部分材料可以呈現(xiàn)出較大的水蒸氣傳輸率("WVTR”)。示例性地，可以用一個(gè)或者多個(gè)柔性塑料層形成該直接連接的腔室，并且流體容納室可以進(jìn)一步包括箔層或者具有比用于形成每個(gè)直接連接的腔室的塑料層低的水蒸氣傳輸率的層。在一方面，容納干燥的試劑的腔室的至少一部分由透光材料構(gòu)成，以便可以用光學(xué)傳感器(例如，熒光計(jì)或者光度計(jì))查詢(xún)腔室中的物質(zhì)。為了進(jìn)一步控制容納干燥的試劑的各腔室的濕度，所述容器可以放置在密封的器皿中，直到使用時(shí)為止。該密封的器皿可以包括用于從容器中吸取水分并且使得干燥的試劑的穩(wěn)定性最強(qiáng)的干燥劑。在本文所描述的任何其他各實(shí)施例中使用或者應(yīng)用本實(shí)施例的各容器可以。在另一個(gè)實(shí)施例中，提供了處理在容器中的樣品的第一方法，該容器具有多個(gè)相互連接的腔室，其中該方法包括下列步驟:將樣品提供給所述容器的第一腔室；獨(dú)立地合并在容器的分離的各腔室中的下述物質(zhì):(I)至少一部分容納在第一腔室中的樣品以及至少一部分容納在容器的第二腔室中的樣品處理試劑；(2)至少一部分容納在第三腔室中的物質(zhì)以及至少一部分容納在第四腔室中的物質(zhì)；以及(3)至少一部分容納在第五腔室中的物質(zhì)以及至少一部分容納在第六腔室中的物質(zhì)；并且在執(zhí)行子步驟(I)至(3)之后，將在容器的腔室中將樣品的組分與子步驟(2)和(3)所得的每個(gè)結(jié)合物中的至少一部分合并。在優(yōu)選的方面，該多個(gè)相互連接的腔室中的每一個(gè)都與容器的至少另一個(gè)腔室相鄰(沿分離的腔室密封)。此外，容器的各腔室可以具有放射狀的排列，其中末端腔室(即，腔室的線性路徑的最外部的腔室)具有非圓形的排列。在一個(gè)方面，第一和第二腔室彼此直接連接，第三和第四腔室彼此直接連接，第五和第六腔室彼此直接連接。在另一方面，該方法進(jìn)一步包括通過(guò)在容器中的一對(duì)直接連接的腔室之間交替地移動(dòng)結(jié)合物，來(lái)混合子步驟(I)至(3)中的至少一個(gè)所得到的結(jié)合物的步驟。在另一方面，第一腔室在第四和第六腔室之間，并且容器包括樣品入口，用于將樣品容納至第一腔室中。在另一方面，在將樣品的組分與子步驟(2)和(3)所得到的每個(gè)結(jié)合物中的至少一部分相結(jié)合(combining)之前,子步驟(I)得到的結(jié)合物(combination)被移動(dòng)到第七腔室，該第七腔室在第一腔室與第四和第六腔室中的至少一個(gè)之間的。在又一方面，第四和第六腔室的每一個(gè)都直接連接于第一腔室，而不是彼此連接。在又一方面，在該方法期間，沒(méi)有樣品的組分被移動(dòng)到第三或者第四腔室中，或者或者，第五或者第六腔室中。樣品處理室可以是第一腔室或者直接連接于第一腔室。在用于固定樣品中存在的分析物的樣品處理試劑中，可以包括固相載體。當(dāng)固定在固相載體上并且容納在樣品處理室中的時(shí)候，可以將樣品的一個(gè)或者多個(gè)非分析物組分移除到容器的廢物室中，該廢物室可以是直接連接于樣品處理室的第八腔室。優(yōu)選的固相載體是可以分散在流體介質(zhì)中，諸如在非分析物組分的移除期間暴露于磁力的磁響應(yīng)性顆?；蛘咝≈?。在另一方面，該方法進(jìn)一步包括以下步驟:將清洗劑供給到樣品處理室中；在樣品處理室中混合固相載體和清洗劑；以及當(dāng)通過(guò)樣品處理室中的固相載體固定分析殘留物的時(shí)候，將清洗劑從樣品處理室移除到第八腔室中。該清洗劑可以是從直接連接于樣品處理室的第九腔室所提供的緩沖的、不反應(yīng)的溶液。此外，當(dāng)需要或益于移除樣品處理室中的殘留清洗劑的時(shí)候，諸如當(dāng)清洗劑含有已知對(duì)容器中的希望反應(yīng)有抑制作用的一種或者多種組分(例如，抑制基于核算的擴(kuò)增反應(yīng)的洗滌劑)時(shí)，可以從直接連接于樣品處理室的第十腔室提供沖洗液。可以在子步驟(2)和(3)中的至少一個(gè)中恢復(fù)干燥的試劑，其中這兩個(gè)子步驟中的至少一個(gè)腔室包括用于恢復(fù)相應(yīng)的干燥的試劑的而制備的溶液。該干燥的試劑可以例如為凍干的或者成片的形式。在另一方面，本實(shí)施例的方法進(jìn)一步包括，在將樣品的組分與子步驟(2)和(3)所獲得的結(jié)合物的至少一部分相結(jié)合之后，檢測(cè)所述容器的檢測(cè)室的物質(zhì)的特性的步驟。該檢測(cè)步驟可以包括，確定表示樣品的組分的存在或者數(shù)量的信號(hào)的存在或者數(shù)量。檢測(cè)室的至少一部分可以由透光材料構(gòu)造，從而允許由位于或者移動(dòng)到靠近檢測(cè)室的位置的光學(xué)傳感器查詢(xún)檢測(cè)室中的物質(zhì)。該檢測(cè)室可以是第三、第四、第五或者第六腔室。在檢測(cè)室中所檢測(cè)的物質(zhì)可以是擴(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物。擴(kuò)增反應(yīng)可以是基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)(例如，目標(biāo)或者信號(hào)擴(kuò)增)。出于這個(gè)目的，可以在子步驟(2)中恢復(fù)(reconstituted)干燥的酶試劑。除了在子步驟(2)中恢復(fù)干燥的酶試劑,也可以在子步驟(3)中恢復(fù)干燥的擴(kuò)增試劑。擴(kuò)增或者酶試劑中的至少一個(gè)可以包括能夠與基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物形成可檢測(cè)的探針:靶復(fù)合物的探針(例如，雜交探針)。探針可以包括一個(gè)或多個(gè)標(biāo)簽以促進(jìn)檢測(cè)?；诤怂岬臄U(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物可以在擴(kuò)增反應(yīng)完成時(shí)檢測(cè)，或者例如使用探針實(shí)時(shí)檢測(cè)，當(dāng)該探針與該反應(yīng)的產(chǎn)物雜交時(shí)，探針顯示出不同的可檢測(cè)形態(tài)。本實(shí)施例的容器可以包括屈服于壓縮力的柔性部分，從而有利于各腔室之間的物質(zhì)移動(dòng)。該容器可以包括相對(duì)的部件，其中該部件中的至少一個(gè)包括柔性片。腔室，以及任何相關(guān)的互連，都可以通過(guò)在所述相對(duì)的部件之間的密封接合來(lái)限定；根據(jù)所結(jié)合的材料，該密封接合可以通過(guò)任何密封方法來(lái)形成，包括如上所述的粘接劑或者熱封、超聲波焊接或者RF焊接。所述相對(duì)的部件中的每一個(gè)都可以包括柔性片。柔性片可以具有多個(gè)層(包括被挑選為具有期望的粘接性能的一個(gè)或者多個(gè)塑料層)，這些層具有可以接受的透光、透水和/或透氧特性。柔性片中的至少一個(gè)包括箔層。容器的各腔室可以通過(guò)多個(gè)可開(kāi)連接而連接，并且每個(gè)可開(kāi)連接都構(gòu)造成，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加于直接連接的各腔室中的至少一個(gè)中的物質(zhì)并且可開(kāi)連接已經(jīng)從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)的時(shí)候，允許物質(zhì)在直接連接的各腔室之間移動(dòng)。在關(guān)閉狀態(tài)下的連接可以被包括密封、閥、或者施加到該連接的外力(例如，致動(dòng)器)的妨礙物中一個(gè)或者組合所阻斷。該密封可以是可破裂的密封(例如，可剝的熱封，諸如人字形或者V形的密封)。在另一方面，本實(shí)施例的方法還包括將物質(zhì)移動(dòng)力施加到多個(gè)腔室中的每一個(gè)的步驟，其中所述物質(zhì)移動(dòng)力包括一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器，并且其中該多個(gè)腔室中的每一個(gè)都適于在該多個(gè)腔室之間的物質(zhì)移動(dòng)中與致動(dòng)器相協(xié)作。該致動(dòng)器可以包括壓縮式防震墊，該壓縮式防震墊形成為與腔室的柔性部分的形狀大體一致。該一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器可以是氣動(dòng)致動(dòng)器。或者，物質(zhì)移動(dòng)力可以包括外部軋制力或者施加于容器之中的正向力或者反向力。在另一實(shí)施例中，提供了用于處理在具有多個(gè)互相連接的腔室的容器中的樣品的第二方法，其中該方法包括以下步驟:將樣品提供到所述容器的第一腔室；在容器的分離的各腔室中獨(dú)立地結(jié)合下述物質(zhì):(1)容納在第一腔室中的樣品的至少一部分，以及容納在容器的第二腔室中的樣品處理試劑的至少一部分；以及(2)容納在第三腔室中的物質(zhì)的至少一部分，以及容納在第四腔室中的物質(zhì)的至少一部分；并且在執(zhí)行了子步驟(I)和(2)之后，在容器的一個(gè)腔室中，將樣品的組分與子步驟(2)所得到的結(jié)合物的至少一部分以及容納在第五腔室中的物質(zhì)或者結(jié)合物的至少一部分結(jié)合，假設(shè)在該方法期間，如果第五腔室直接連接于第四腔室，那么樣品中的組分沒(méi)有被移動(dòng)到第三和第五腔室中的至少一個(gè)中，還假設(shè)在該方法期間，如果第五腔室直接連接于第三腔室或者第四腔室，那么樣品中的組分沒(méi)有被移動(dòng)到第三和第五腔室中的至少一個(gè)中，還假設(shè)在該方法期間，如果第五腔室直接連接于第三腔室而不是第四腔室，那么樣品中的組分沒(méi)有被移動(dòng)到第五腔室中。容器的各腔室可以具有放射狀的排列，其中容器的末端腔室具有非圓形的排列。在一個(gè)方面，第一和第二腔室彼此直接連接，并且第三和第四腔室彼此直接連接。在另一方面，本實(shí)施例的方法進(jìn)一步包括通過(guò)在所述容器的一對(duì)直接連接的腔室之間交替地移動(dòng)結(jié)合物，將子步驟(I)和(2)中的至少一個(gè)所得到的結(jié)合物相結(jié)合的步驟。在另一方面，第一腔室在第四和第五腔室之間，并且所述容器包括用于將樣品容納至第一腔室中的樣品入口。在另一方面，第四和第五腔室中的每一個(gè)都直接連接于第一腔室。在又一方面，子步驟(I)得到的結(jié)合物(combination)被移動(dòng)到第一腔室與第四腔室之間的第六腔室。在又一方面，第四和第五腔室中直接連接于第七腔室。在另一方面，第五腔室直接連接于第三腔室而不是第四腔室。在另一方面，第三和第五腔室中的每個(gè)都直接連接于第四腔室。樣品處理室可以是第一腔室或者直接連接于該第一腔室。在另一方面，該實(shí)施例的方法進(jìn)一步包括，當(dāng)通過(guò)所述容器的樣品處理室中的固相載體來(lái)固定樣品殘留物中存在的分析物時(shí)，將樣品的一個(gè)或者多個(gè)非分析物組分移除到容器的廢物室中的步驟。所述固相載體能夠以樣品處理試劑提供到容器中。固相載體優(yōu)選地可以分散在流體介質(zhì)中，諸如在非分析物組分的移除期間暴露于磁場(chǎng)的磁響應(yīng)性顆?；蛘咝≈?。該廢物室可以是直接連接于樣品處理室的第七腔室。還另一方面，本實(shí)施例的方法進(jìn)一步包括下列步驟:將清洗劑供給到樣品容納室中；在樣品處理室中混合固相載體和清洗劑；以及當(dāng)分析殘留物被樣品處理室中的固相載體固定的時(shí)候，將清洗劑從樣品處理室移除到第七腔室中。該清洗劑可以是從直接連接于樣品處理室的第八腔室提供的。可以在子步驟(2)中恢復(fù)第一干燥的試劑，第五腔室可以容納第二干燥的試劑的恢復(fù)形式(reconstitutedform)。第一干燥的試劑可以包含能夠與基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物形成可檢測(cè)探針的探針:靶復(fù)合物。第一干燥的試劑可以是酶試劑，而第五腔室可以容納擴(kuò)增試劑。干燥的試劑可以是凍干的形式。在上述的處理在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中的樣品的方法的第一實(shí)施例的描述中，提出了在本實(shí)施例的方法中可以使用其他處理步驟或者容器的詳細(xì)情況。在另一方面，提供了一種被編程為根據(jù)這里描述的任何一種方法來(lái)處理樣品的儀器。該儀器適于在與該儀器相關(guān)的穩(wěn)定的容器接收(receptacle-receiving)區(qū)中接收并且對(duì)齊具有非直線排列的相互連接的腔室的容器。該儀器包括相對(duì)于所述容器接收區(qū)適當(dāng)定位的致動(dòng)器系統(tǒng)，該致動(dòng)器系統(tǒng)包括多個(gè)致動(dòng)器，這些致動(dòng)器排列成與各腔室的至少一部分的排列相一致并且選擇地對(duì)各腔室的柔性部分施加壓力，從而迫使流體物質(zhì)在直接連接的腔室之間移動(dòng)。該儀器還包括檢測(cè)器，該檢測(cè)器合適地定位在所述容器接收區(qū)附近，以便在設(shè)置到該儀器的容器中所容納的檢測(cè)室附近，其中該檢測(cè)器能夠檢測(cè)所述檢測(cè)室中的物質(zhì)的特性。該儀器進(jìn)一步包括控制器，其被設(shè)計(jì)為控制該儀器的操作，包括致動(dòng)器系統(tǒng)、檢測(cè)器以及熱敏元件。在又一實(shí)施例中，提供一種系統(tǒng)，其包括上述用于處理樣品的儀器以及位于在容器接收區(qū)中的容器。在優(yōu)選的方面，容器由彼此連接的第一和第二相對(duì)部件形成，以便限定多個(gè)相互連接的腔室。對(duì)于某些應(yīng)用，容器包括具有最少五個(gè)腔室的線性路徑。該相對(duì)部件中的至少一個(gè)包括柔性部分，并且通道的至少一部分包括流體屏障。在再一方面，用于檢測(cè)光學(xué)信號(hào)的檢測(cè)器包括一個(gè)或者多個(gè)激發(fā)通道，每一個(gè)該激發(fā)通道都適于將具有規(guī)定的激發(fā)光學(xué)特性的激發(fā)信號(hào)朝著樣品指引，所述光學(xué)信號(hào)可以表示樣品中的一個(gè)或者多個(gè)分析物的存在、數(shù)量或者狀態(tài)。每個(gè)所述激發(fā)通道都包括適于發(fā)射激發(fā)光的光發(fā)射元件以及限定具有激發(fā)光軸的激發(fā)光徑的激發(fā)光學(xué)元件。將激發(fā)光學(xué)元件構(gòu)造并且布置成朝著樣品發(fā)送由具有規(guī)定的光學(xué)特性的光發(fā)射元件所發(fā)射的光的至少一部分。檢測(cè)器進(jìn)一步包括一個(gè)或者多個(gè)發(fā)射通道，每個(gè)該發(fā)射通道都適于接收來(lái)自樣品的發(fā)射信號(hào)。每個(gè)發(fā)射通道都包括發(fā)射光學(xué)元件，該發(fā)射光學(xué)元件限定具有發(fā)射光軸的發(fā)射光徑，并且該發(fā)射光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成發(fā)送由樣品所發(fā)射的、具有規(guī)定的發(fā)射光學(xué)特性的任何光的至少一部分。每個(gè)所述發(fā)射通道進(jìn)一步包括光檢測(cè)元件和相關(guān)電路，該相關(guān)電路適于檢測(cè)由所述發(fā)射光學(xué)元件發(fā)送的光并且將所檢測(cè)到的光轉(zhuǎn)換為電信號(hào)，該電信號(hào)表示檢測(cè)到的光的存在和強(qiáng)度的至少其中之一。所述光發(fā)射元件和光檢測(cè)元件可操作地連接于單個(gè)電路板。檢測(cè)器還包括一個(gè)或者多個(gè)光學(xué)元件，該光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成接收來(lái)自每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)信號(hào)，并且在該規(guī)定位置處指引每個(gè)激發(fā)信號(hào)的至少一部分，以及在該規(guī)定位置處接收從樣品發(fā)射的發(fā)射信號(hào)，并且將所接收的發(fā)射信號(hào)的至少一部分引導(dǎo)至每個(gè)發(fā)射通道中。檢測(cè)器不包括反射元件，該反射元件用于在與入射光的入射方向不同的方向上重新定向入射到該反射元件的所有光，并且該檢測(cè)器不包括光特性分離元件，該光特性分離元件用于在與入射光的入射方向不同的方向上重新定向入射到具有第一光特性的分離元件上的光的一部分，以及用于發(fā)送入射到具有第二光特性的分離元件上的光的一部分。在另一方面，每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)光軸和每個(gè)發(fā)射通道的發(fā)射光軸在它們的整個(gè)范圍內(nèi)是彼此平行的。在又一方面，將一個(gè)或者多個(gè)光學(xué)元件構(gòu)造且布置成:(I)接收來(lái)自每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)信號(hào)，并且在處理樣品的器皿上的規(guī)定位置處指引每個(gè)激發(fā)信號(hào)的至少一部分，以及(2)接收從器皿中的樣品發(fā)射的發(fā)射信號(hào)，并且將接所收的發(fā)射信號(hào)的至少一部分引導(dǎo)至每個(gè)發(fā)射通道中。在又一方面，檢測(cè)器包括兩個(gè)或者更多個(gè)激發(fā)通道以及兩個(gè)或者更多個(gè)發(fā)射通道。在又一方面，一個(gè)或者多個(gè)光學(xué)元件包括單個(gè)的、未分割的透鏡。在又一實(shí)施例中，用于檢測(cè)來(lái)自樣品的光學(xué)信號(hào)的檢測(cè)器包括一個(gè)或者更多個(gè)激發(fā)通道以及一個(gè)或者更多個(gè)發(fā)射通道，該光學(xué)信號(hào)表示在樣品中的一個(gè)或者多個(gè)分析物的存在、數(shù)量或者狀態(tài)，每一個(gè)該激發(fā)通道都適于將具有規(guī)定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的激發(fā)信號(hào)朝著所述樣品指引，并且每一個(gè)該發(fā)射通道都適于接收來(lái)自樣品的發(fā)射信號(hào)并且檢測(cè)具有規(guī)定發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的發(fā)射信號(hào)。每一個(gè)激發(fā)通道都包括適于發(fā)射激發(fā)光的光發(fā)射元件以及限定具有激發(fā)光軸的激發(fā)光徑的激發(fā)光學(xué)元件。將該激發(fā)光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成朝著所述樣品發(fā)送由光發(fā)射元件所發(fā)射的、具有規(guī)定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光的至少一部分。每個(gè)發(fā)射通道都包括限定具有發(fā)射光軸的發(fā)射光徑的發(fā)射光學(xué)元件。將該發(fā)射光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成發(fā)送由樣品所發(fā)射的、具有規(guī)定發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的任何光的至少一部分。每個(gè)發(fā)射通道還包括光檢測(cè)元件，其適于檢測(cè)由發(fā)射光學(xué)元件所發(fā)送的光，并且將檢測(cè)到的光轉(zhuǎn)換為電信號(hào)，該電信號(hào)表示該檢測(cè)到的光的存在和長(zhǎng)度中的至少其中之一。激發(fā)光軸和發(fā)射光軸在它們的整個(gè)范圍內(nèi)是彼此平行的。并且檢測(cè)器還包括光學(xué)透鏡，該光學(xué)透鏡被構(gòu)造且布置成相對(duì)于激發(fā)通道和發(fā)射通道:(I)在規(guī)定位置處引導(dǎo)由每個(gè)激發(fā)通道發(fā)送并且入射到光學(xué)透鏡的不同部分的激發(fā)光，以及(2)接收由在規(guī)定位置處的樣品所發(fā)射的發(fā)射信號(hào)，并將接收到的發(fā)射信號(hào)的至少一部分引導(dǎo)至每個(gè)發(fā)射通道中。在另一方面，光發(fā)射兀件包括發(fā)光二極管。在又一方面，每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)光學(xué)元件都包括透鏡和激發(fā)濾波片，它們被構(gòu)造且布置成只發(fā)送具有規(guī)定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光。在又一方面，光檢測(cè)元件包括光電二極管。在又一方面，每個(gè)發(fā)射通道的發(fā)射光學(xué)元件都包括透鏡和激發(fā)濾波片，它們被構(gòu)造且布置成只發(fā)送具有規(guī)定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光。在又一方面，激發(fā)通道的光發(fā)射元件和發(fā)射通道的光檢測(cè)元件安裝在同一平面上。在又一方面，檢測(cè)器還包括殼體，其中每個(gè)激發(fā)通道和發(fā)射通道都設(shè)置在限定于該殼體內(nèi)的不同的管道內(nèi)。在又一方面，檢測(cè)器包括兩個(gè)激發(fā)通道和兩個(gè)發(fā)射通道，并且該激發(fā)通道和發(fā)射通道的管道都設(shè)置成圓形圖形，同時(shí)這些管道分隔了大約90°。在又一方面，檢測(cè)器還包括基座，該基座包括至少一個(gè)印刷電路板，所述殼體安裝于該基座，并且激發(fā)通道的光發(fā)射元件和發(fā)射通道的光檢測(cè)元件可操作地連接于該印刷電路。在又一方面，檢測(cè)器還包括環(huán)境光濾波電路和檢測(cè)電路，該環(huán)境光濾波電路包括激發(fā)調(diào)制電路。該激發(fā)調(diào)制電路被構(gòu)造且布置成以預(yù)定的激發(fā)頻率調(diào)制每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)信號(hào)，并且該檢測(cè)電路被構(gòu)造且布置成識(shí)別所檢測(cè)到的光的大致在激發(fā)頻率的那部分。在又一方面，檢測(cè)器包括兩個(gè)或者更多個(gè)激發(fā)通道，并且每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)信號(hào)的激發(fā)頻率是不同的。在又一方面，檢測(cè)器包括兩個(gè)或者更多個(gè)激發(fā)通道，并且每個(gè)激發(fā)通道的激發(fā)信號(hào)的激發(fā)頻率是相同的。在又一方面，激發(fā)光學(xué)元件和發(fā)射光學(xué)元件不包括光纖。在又一實(shí)施例中，提供一種檢測(cè)器，其檢測(cè)來(lái)自樣品的兩個(gè)或者更多個(gè)不同波長(zhǎng)或者波長(zhǎng)范圍的光學(xué)發(fā)射，其中所述兩個(gè)或者多個(gè)不同波長(zhǎng)的光學(xué)發(fā)射可以表示樣品中的兩個(gè)或者多個(gè)目標(biāo)分析物的存在、數(shù)量或者狀態(tài)，并且其中無(wú)需相對(duì)于樣品移動(dòng)檢測(cè)器的各部件就能夠檢測(cè)所述光學(xué)發(fā)射。該檢測(cè)器包括相對(duì)于樣品并且相對(duì)于彼此都固定的兩個(gè)或者更多個(gè)激發(fā)通道，以及相對(duì)于樣品、相對(duì)于激發(fā)通道并且相對(duì)于彼此都固定的兩個(gè)或者多個(gè)發(fā)射通道。每個(gè)激發(fā)通道都適于將具有不同的規(guī)定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的激發(fā)信號(hào)引向樣品，并且每個(gè)激發(fā)通道都包括光發(fā)射元件和激發(fā)光學(xué)元件，該光發(fā)射元件適于發(fā)射激發(fā)光，而該激發(fā)光學(xué)元件限定具有激發(fā)光軸的激發(fā)光徑。激發(fā)光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成朝著樣品發(fā)送由光發(fā)射元件所發(fā)射的、具有規(guī)定的激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光的至少一部分。每個(gè)發(fā)射通道都適于從樣品接收并檢測(cè)具有不同的規(guī)定發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的發(fā)信號(hào)，并且每個(gè)發(fā)射通道都包括限定具有發(fā)射光軸的發(fā)射光徑的發(fā)射光學(xué)元件，并且該發(fā)射光學(xué)元件被構(gòu)造并布置成發(fā)送由樣品所發(fā)射的、具有規(guī)定的發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的任何光的至少一部分。每個(gè)發(fā)射通道還包括光檢測(cè)元件，該光檢測(cè)元件適于檢測(cè)由發(fā)射光學(xué)元件所發(fā)送的光，并且將檢測(cè)到的光轉(zhuǎn)換成電信號(hào)，該電信號(hào)表示該檢測(cè)的光的存在和長(zhǎng)度的至少其中之一。所述檢測(cè)器適于利用每個(gè)激發(fā)通道來(lái)將具有特定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光對(duì)準(zhǔn)樣品，并且利用每個(gè)發(fā)射通道來(lái)檢測(cè)從樣品發(fā)射的、具有特定發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光，而無(wú)需相對(duì)于樣品或者彼此來(lái)移動(dòng)激發(fā)通道或者發(fā)射通道。在另一方面，激發(fā)光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成朝著器皿發(fā)送由光發(fā)射元件所發(fā)射的、具有規(guī)定的激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光的至少一部分，在該器皿中處理所述樣品。發(fā)射光學(xué)元件被構(gòu)造且布置成發(fā)送由器皿中的樣品所發(fā)射的、具有規(guī)定的發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的任何光的至少一部分。檢測(cè)器適于利用每個(gè)激發(fā)通道來(lái)將具有特定激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的光對(duì)準(zhǔn)器皿，以及利用每個(gè)發(fā)射通道來(lái)檢測(cè)從器皿發(fā)射的、具有特定發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光，而無(wú)需相對(duì)于器皿或者彼此來(lái)移動(dòng)激發(fā)通道或者發(fā)射通道。在又一實(shí)施例中，一種用于檢測(cè)表示樣品中的一個(gè)或者多個(gè)分析物的存在、數(shù)量或者狀態(tài)的光學(xué)信號(hào)的方法包括:生成第一激發(fā)信號(hào)并且沿著第一激發(fā)路徑發(fā)送具有第一激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的第一激發(fā)信號(hào)的一部分；利用光學(xué)透鏡的第一部分將第一激發(fā)信號(hào)集中(focus)在樣品處，并且如果存在的話，利用光學(xué)透鏡的第二部分將由樣品發(fā)射的信號(hào)的一部分引導(dǎo)至第一發(fā)射路徑中；沿著第一發(fā)射路徑發(fā)送具有第一發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光；以及檢測(cè)具有第一發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光。所述第一激發(fā)路徑與第一發(fā)射路徑在它們的整個(gè)范圍內(nèi)是彼此平行的。在另一方面，該方法還包括:生成第二激發(fā)信號(hào)，并且沿著第二激發(fā)路徑發(fā)送具有第二激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的第二激發(fā)信號(hào)的一部分；利用光學(xué)透鏡的第三部分，將該第二激發(fā)信號(hào)集中在樣品處，并且如果存在的話，利用光學(xué)透鏡的第四部分將由樣品發(fā)射的信號(hào)的一部分引導(dǎo)至第二發(fā)射路徑中；沿著第二發(fā)射路徑發(fā)送具有第二發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光；以及檢測(cè)具有第二發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光。所述第一和第二激發(fā)路徑與第一和第二發(fā)射路徑在它們的整個(gè)范圍內(nèi)是彼此平行的。在又一方面，將第一激發(fā)信號(hào)集中到樣品處包括將第一激發(fā)信號(hào)集中到器皿內(nèi)的物質(zhì)處，在該器皿中處理樣品。在又一方面，將由樣品發(fā)射的信號(hào)的一部分引導(dǎo)至第一發(fā)射路徑包括將由樣品發(fā)射的信號(hào)引導(dǎo)至器皿中。在又一方面，光學(xué)透鏡包括實(shí)心的、未分割的透鏡。在又一方面，該方法包括沿著第一激發(fā)路徑發(fā)送第一激發(fā)信號(hào)以及沿著第一發(fā)射路徑發(fā)送光，而無(wú)需使用:(I)反射元件，其用于在與入射光的入射方向不同的方向上重定向入設(shè)到該反射元件的所有光，或者(2)光特性分離元件，其用于在與入射光的入射方向不同的方向上重定向入射到該分離元件的、具有第一光特性的光的一部分，以及用于發(fā)送入射到該分離元件的、具有第二光特性的光的一部分。在又一方面，無(wú)需在第一激發(fā)路徑和第一發(fā)射路徑外部使用任何除了單個(gè)透鏡之外的光學(xué)元件就能實(shí)現(xiàn)上述集中步驟和引導(dǎo)步驟。在又一方面，生成步驟由發(fā)光二極管執(zhí)行。在又一方面，上述沿著第一激發(fā)路徑發(fā)送第一激發(fā)信號(hào)的、具有第一激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍的那一部分，包括:過(guò)濾該第一激發(fā)信號(hào)以移除第一激發(fā)信號(hào)的除了第一激發(fā)波長(zhǎng)或者激發(fā)波長(zhǎng)范圍以外的波長(zhǎng)；并且，上述沿著第一發(fā)射路徑發(fā)送具有第一發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍的光，包括:過(guò)濾被引導(dǎo)至第一發(fā)射通道中的那部分發(fā)射信號(hào)以移除第一發(fā)射信號(hào)的除了第一發(fā)射波長(zhǎng)或者發(fā)射波長(zhǎng)范圍以外的波長(zhǎng)。在又一方面，該方法還包括以預(yù)定的激發(fā)頻率調(diào)制所述激發(fā)信號(hào)，以及識(shí)別檢測(cè)到的光中的大致在激發(fā)頻率的那部分。上述沿著第一發(fā)送路徑發(fā)送第一激發(fā)信號(hào)的具有第一激發(fā)波長(zhǎng)的部分、以及發(fā)送具有第一發(fā)射波長(zhǎng)的光，不包括沿著光纖發(fā)送光?，F(xiàn)在，將描述根據(jù)本發(fā)明的容器的制造和具體使用。對(duì)于所描述的實(shí)施例來(lái)說(shuō)，容器可以包括對(duì)置的元件，該對(duì)置的元件被構(gòu)造成限定多個(gè)相互連接的腔室，其中在相鄰的各腔室之間，各腔室通過(guò)通路或者開(kāi)口而連接；而在分離的各腔室之間，通過(guò)通道或者通路(passageway)而連接。多個(gè)相互連接的腔室可以通過(guò)由任何密封方法而形成在對(duì)置的元件之間的密封來(lái)限定，該密封方法諸如是粘接劑或者熱密封、超聲波焊接或者RF焊接。所述對(duì)置的元件中的至少一個(gè)包括柔性片，該柔性片包括腔室的柔性的、至少部分可壓縮的部分。該柔性片可以具有多個(gè)層，包括被選用為具有期望的粘接特性以及可以接受的透光、透水或者透氧特性的一個(gè)或者多個(gè)塑料層。對(duì)置的兩個(gè)元件都用柔性片構(gòu)成，該柔性片中的至少一個(gè)包括箔層。當(dāng)物質(zhì)移動(dòng)力施加到腔室中的物質(zhì)時(shí)，可以從關(guān)閉狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)的可開(kāi)連接可能阻擋在這些容器的直接連接的腔室之間的連接。例如，每個(gè)物質(zhì)移動(dòng)力可以包括外部施加的擠壓在腔室上的力，諸如一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器(例如，氣動(dòng)致動(dòng)器)或者滾子，或者該物質(zhì)移動(dòng)力可以包括在容器內(nèi)部施加的正向或者負(fù)向力。如果物質(zhì)移動(dòng)力是一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器，那么該致動(dòng)器包括與腔室的柔性部分的形狀大體一致的壓縮式防震墊，所述腔室的柔性部分諸如腔室壁。在閉合狀態(tài)下，所述連接通過(guò)包括密封、閥門(mén)、或者施加于該連接的外力(例如，致動(dòng)器)的障礙中的一個(gè)或者組合而阻隔。密封可以是可破裂的密封，例如，可剝離的熱封(諸如人字形或者V形密封)。在另一實(shí)施例中，提供了一種方法，用于將流體物質(zhì)加載到具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中，其中該方法包括以下步驟:將不混溶(immiscible)流體和流體物質(zhì)(跟隨不混溶流體的流體物質(zhì))依次供給到容器的開(kāi)口腔室中，其中該不混溶流體的密度比流體物質(zhì)的密度低，并且其中以足以控制開(kāi)口腔室中的液體物質(zhì)的芯吸(wicking)的量，將所述不混溶流體提供到開(kāi)口腔室中；以及關(guān)閉該開(kāi)口腔室以提供實(shí)質(zhì)上的液封密封。所述開(kāi)口腔室是多個(gè)腔室中向容器的一側(cè)開(kāi)口、并且適于容納在執(zhí)行分析中使用的物質(zhì)的一個(gè)腔室。較低密度的不不混溶體在流體物質(zhì)上浮動(dòng)，該不不混溶體控制在開(kāi)口腔室中的芯吸，該芯吸能夠?qū)е挛廴鞠噜徢皇液械奈镔|(zhì)或者影響在反應(yīng)或其他處理中使用的處理材料的濃度。該不不混溶體優(yōu)選地不與流體物質(zhì)起反應(yīng)，并且提供到開(kāi)口腔室的該不不混溶體的量至少部分地依賴(lài)于腔室的容量和供給到開(kāi)口腔室的流體物質(zhì)的體積。盡管如此，不不混溶體與流體物質(zhì)的比率優(yōu)選為達(dá)到大約10:I。任何不混溶流體都在考慮范圍內(nèi)，但是油(例如，礦物油)是尤其適合的。所述容器包括對(duì)置的元件，該對(duì)置的元件中的至少一個(gè)包括柔性片。該柔性片包括開(kāi)口腔室的柔性部分，當(dāng)不混溶流體和流體物質(zhì)被輸送到開(kāi)口腔室時(shí)，該柔性部分在所述供給步驟期間從對(duì)置的元件拉開(kāi)。所述對(duì)置的元件包括對(duì)置的柔性片，其中該對(duì)置的柔性片包括開(kāi)口腔室的對(duì)置的柔性部分，該對(duì)置的柔性部分在所述供給步驟期間彼此分離。在將不混溶流體和流體物質(zhì)輸送到開(kāi)口腔室之后，開(kāi)口腔室通過(guò)足以提供液封密封的任何方法而關(guān)閉，例如形成在開(kāi)口腔室的對(duì)置的元件之間的熱密封。優(yōu)選地，該方法的步驟是自動(dòng)化的。在另一實(shí)施例中，提供了一種制造具有多個(gè)相互連接的腔室的容器，以分別地地容納流體和干燥的物質(zhì)的方法，其中該方法包括以下步驟:將至少一種流體物質(zhì)供給到向該容器的第一側(cè)開(kāi)口的一個(gè)或者多個(gè)第一腔室；關(guān)閉第一腔室，以提供足夠的液封密封；將至少一種干燥的物質(zhì)供給到向該容器的第二側(cè)開(kāi)口的一個(gè)或者多個(gè)第二腔室；以及關(guān)閉第二腔室以提供足夠的液封密封，其中所述容器的腔室通過(guò)流體屏障而彼此分離，并且其中沒(méi)有將干燥的物質(zhì)提供到向所述第一側(cè)開(kāi)口的各腔室，而且沒(méi)有將流體物質(zhì)提供到向所述第二側(cè)開(kāi)口的各腔室?？梢栽谒龈稍锏奈镔|(zhì)被提供到一個(gè)或者多個(gè)腔室之前，將所述流體物質(zhì)提供到所述容器的一個(gè)或者多個(gè)腔室，然后這些腔室就隨后關(guān)閉，反之亦然。優(yōu)選地，所述容器的第一側(cè)和第二側(cè)彼此鄰近或者彼此相對(duì)?？梢栽诠┙o流體物質(zhì)之前，將不混溶流體提供到所述容器的一個(gè)或者多個(gè)第一腔室，其中該不混溶流體的密度比供給到所述容器的任何流體物質(zhì)的密度低。該不混溶流體優(yōu)選不與任何流體物質(zhì)起反應(yīng)，并且例如可以是油(例如，礦物油)。該不混溶流體與任何流體物質(zhì)的比率優(yōu)選達(dá)到大約10:I。所述流體物質(zhì)和干燥的物質(zhì)用于執(zhí)行分析。至少一部分流體物質(zhì)用于恢復(fù)、溶解或者再水合所述干燥的物質(zhì)。在特別優(yōu)選的實(shí)施例中，該干燥的物質(zhì)包括用于執(zhí)行基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)的擴(kuò)增試劑或者酶試劑，并且流體物質(zhì)包括相應(yīng)的恢復(fù)試劑。所述容器包括對(duì)置的元件，該對(duì)置的元件中的至少一個(gè)包括柔性片。所述柔性片包括開(kāi)口腔室的柔性部分，該柔性部分在所述供給步驟期間被從對(duì)置的元件拉開(kāi)。所述對(duì)置的元件包括對(duì)置的柔性片，其中所述對(duì)置的柔性片包括開(kāi)口腔室的對(duì)置的柔性部分，諸如腔室壁，該柔性部分在所述供給步驟期間彼此分離。在每個(gè)供給步驟之后，通過(guò)足以提供例如形成在開(kāi)口腔室的對(duì)置的元件之間的熱密封的液封密封的任何方法來(lái)關(guān)閉第一腔室和/或第二腔室。優(yōu)選地，該方法的步驟是自動(dòng)化的。在又一實(shí)施例中，提供了一種方法，用于集中被輸送到具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中的樣品中所含有的分析物。該方法包括以下步驟:在所述容器的第一腔室中形成第一用量，其中所述第一用量包括樣品和固相載體；將分析物固定在固相載體上，從該分析物中除去非分析物組分；以及將包括分析物的第二用量移動(dòng)移動(dòng)到第一腔室的分割部分，或者移動(dòng)到所述容器的第二腔室，其中第二用量和第一腔室的分割部分或者第二腔室的容量都比第一腔室小。第一腔室可以是具有樣品添加口的樣品容納室。所述第一用量的固相載體可以在開(kāi)始本實(shí)施例的方法時(shí)就存在于第一腔室中，或者是在所述形成步驟之前或期間被從第三腔室移動(dòng)到第一腔室。在分析物被固定在第一腔室或者除了第一腔室以外的其他腔室中的固相載體上的同時(shí)，從分析物中移除樣品中的非分析物組分。為了促進(jìn)第二用量在各腔室之間的移動(dòng)，或者為了防止固相載體妨礙各腔室之間的連接，所述第一用量還包括不反應(yīng)的、不混溶的流體。例如，該不混溶流體可以是油(例如，礦物油)。第一腔室中的該不混溶流體與第一用量的剩余部分的比例優(yōu)選是大約I:10到10:1，并且更優(yōu)選為大約1:3到大約10:I?？梢酝ㄟ^(guò)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到第一腔室的柔性部分，諸如可壓縮的腔室壁，來(lái)完成將第二用量移動(dòng)到第二腔室，從而迫使第二用量通過(guò)一連接而移動(dòng)到第二腔室。所述連接是諸如密封的可開(kāi)連接，當(dāng)物質(zhì)移動(dòng)力施加于第一腔室的柔性部分的時(shí)候，其能夠從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)?；蛘?，或者與密封相結(jié)合地，在所述移動(dòng)步驟之前，所述第一和第二腔室通過(guò)施加于所述連接的外部的且可伸縮(retractable)的力而彼此隔離。外部的關(guān)閉力單獨(dú)地或者與密封相結(jié)合地提供了實(shí)質(zhì)上的液封密封，并且包括具有跨過(guò)所述連接而延伸的壓縮式防震墊的一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器，諸如氣動(dòng)致動(dòng)器。本實(shí)施例的固相載體可以是顆?；蛘咝≈榈男问?。該固相載體可以是當(dāng)樣品的非分析物組分被從分析物移除的時(shí)候，暴露于磁場(chǎng)的磁響應(yīng)材料。所述固定步驟可以是專(zhuān)用于所述分析物、部分專(zhuān)用于所述分析物、或者非專(zhuān)用于所述分析物。例如，如果分析物是目標(biāo)核酸，那么所述固相載體可以實(shí)質(zhì)上用于固定樣品中存在的任何核酸、諸如從有機(jī)物的系統(tǒng)組獲得的核酸組、或者樣品中存在的目標(biāo)核酸而不是其他核酸，目標(biāo)核酸屬于所述有機(jī)物的系統(tǒng)組。在所述移動(dòng)期間，分析物可以由固相載體而保持固定，或者其可以首先被洗脫然后被移動(dòng)，而與固相載體無(wú)關(guān)。在后一種情況中，在將分析物移動(dòng)到第二腔室的同時(shí)，固相載體可以保持在第一腔室中。在另一實(shí)施例中，提供了一種方法，用于將輸送到具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中的樣品中所有含有的分析物集中。該方法包括下列步驟:在容器的第一腔室中形成第一用量，其中第該一用量包括樣品和固相載體；將所述樣品固定在固相載體上；將所述第一用量(volume)的等分試樣(aliquot)從第一腔室移動(dòng)到容器的直接連接于所述第一腔室的第二腔室，其中第二腔室的容量小于所述第一用量；在第二腔室中分離固相載體；將樣品中的非分析物組分移除到容器的廢物室中，其中該廢物室直接連接于第二腔室；以及一次或者多次地重復(fù)所述移動(dòng)、分離以及移除步驟。通過(guò)將物質(zhì)移動(dòng)力施加于諸如是可壓縮的腔室壁的第一腔室的柔性部分，而將第一用量的等分試樣移動(dòng)到第二腔室中，使得該等分試樣通過(guò)一連接而移動(dòng)到第二腔室。上述的在集中樣品中的分析物中所使用的容器適合于在本實(shí)施例的方法中使用。在另一實(shí)施例中，提供了一種具有多個(gè)相互連接的腔室的容器，其中該容器的各腔室包括直接連接于第二腔室并且容納樣品處理試劑的第一腔室，該樣品處理試劑包括在流體介質(zhì)中的分散的固相載體。同樣容納在第一腔室中的還有不混溶流體，其數(shù)量足以使得所述固相載體不妨礙所述連接。所述不混溶流體優(yōu)選為不與樣品處理試劑的其他組分起反應(yīng)，并且例如可以是油(例如，礦物油)。所述固相載體可以是顆粒或者小珠，諸如在存在磁力時(shí)能夠被分離的磁感應(yīng)顆?；蛘咝≈?。當(dāng)樣品處理試劑在第一腔室中與流體樣品接觸的時(shí)候，所述不混溶流體與流體介質(zhì)/流體樣品結(jié)合物的比率優(yōu)選是大約1:10到大約10:1，并且尤其地優(yōu)選為大約1:3到大約10:I。其中，所述容器包括對(duì)置的元件，通過(guò)連接該對(duì)置的元件而形成該容器的側(cè)邊。由于其在使用期間的方向而表示為上端的所述側(cè)邊之一具有樣品容納室，該樣品容納室具有用于將樣品容納至樣品容納室中的樣品添加口。第二腔室的至少一部分設(shè)置成比第一腔室更靠近容器的底端。利用這種構(gòu)造，從第一腔室到第二腔室的所述連接優(yōu)選地具有相對(duì)于所述上端向下的定向(即，該連接將第一腔室的下半部分連接于第二腔室的上半部分)。所述樣品容納室可以是第一腔室。本實(shí)施例中的固相載體相對(duì)于對(duì)應(yīng)的保持腔室的容量來(lái)說(shuō)是小的。這樣，固相載體分散在各腔室中的流體物質(zhì)中，使得它們對(duì)容器中的處理很敏感，如受磁力影響的帶電的固相載體。該固相載體優(yōu)選地適于固定懷疑在樣品中存在的一個(gè)或者多個(gè)目標(biāo)分析物，以便可以將分析物隔離，并且將非分析物組分，尤其是能影響處理的結(jié)果或者性能的干擾材料從樣品中移除。所述固相載體可以與諸如捕捉探針的捕捉試劑結(jié)合使用，以固定分析物。在再一實(shí)施例中，提供一種使用上述容器的方法，以實(shí)現(xiàn)流體物質(zhì)在容器的各腔室之間的移動(dòng)。在本方法的第一步驟中，流體樣品與容器的第一處理室中的樣品處理試劑和不混溶流體相結(jié)合，該不混溶流體以足以集中第一處理室中的固相載體的量來(lái)提供。集中所述固體載體限制了它們?cè)谇皇覂?nèi)的散布，使得它們與缺少不混溶流體的情況相比，分散得更少。相應(yīng)地，這使得在腔室的外周部分處，尤其是在與各腔室之間的連接相鄰的部分處，所述固相載體的存在最少。在第二步驟中，通過(guò)一連接，流體物質(zhì)從容器的第一處理室移動(dòng)到第二處理室，該連接諸如是在各腔室之間的通路或者通道。如果在樣品中存在的話，流體物質(zhì)可以是第一步驟所得到的結(jié)合物，或者其例如是包含純化形式的分析物的緩沖劑。第一步驟中的不混溶流體的存在使得固相載體不能妨礙流體物質(zhì)通過(guò)所述連接的移動(dòng)。在再一實(shí)施例中，提供一種容器，用于提升存儲(chǔ)在與流體物質(zhì)相同的容器中的干燥的物質(zhì)的穩(wěn)定性。所述容器具有多個(gè)相互連接的腔室，包括直接連接于彼此的第一和第二腔室。第一腔室容納干燥的物質(zhì)，而第二腔室容納能夠改變?cè)摳稍锏奈镔|(zhì)的狀態(tài)或者性質(zhì)的流體物質(zhì)。所述流體物質(zhì)可以被規(guī)定為在接觸的時(shí)候恢復(fù)、溶解或者再水合所述干燥的物質(zhì)。例如，該干燥的物質(zhì)可以是凍干的或者成片的試劑。為了防止干燥的物質(zhì)和流體物質(zhì)過(guò)早地彼此接觸，第一與第二腔室之間的連接通常用例如密封、閥門(mén)或者包括外力的其他障礙而阻隔。該連接可以通過(guò)可開(kāi)連接而阻隔，當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加于第二腔室中含有的物質(zhì)時(shí)，該可開(kāi)連接能夠從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)。所述物質(zhì)移動(dòng)力可以是施加到第二腔室的柔性部分上的一個(gè)或多個(gè)壓縮力，例如一個(gè)或多個(gè)氣動(dòng)致動(dòng)器。第一和第二腔室被構(gòu)造成使得水蒸汽從第一腔室通過(guò)的速度比從第二腔室通過(guò)的速度更快。通過(guò)這種方式，認(rèn)為水蒸汽是從第二腔室抽出、通過(guò)第一腔室并且進(jìn)入到周?chē)h(huán)境中的，而基本上無(wú)需水合所述干燥的物質(zhì)，所述水合該干燥的物質(zhì)可能影響其在分析物中的穩(wěn)定性和性能。在多個(gè)腔室直接連接于第一腔室的地方，水蒸汽從第一腔室通過(guò)的速度比從任何直接連接的、保持流體的腔室通過(guò)的速度快，并且優(yōu)選地比從任何直接連接的腔室通過(guò)的速度快。為了實(shí)現(xiàn)這個(gè)效果，第一腔室優(yōu)選包括至少一個(gè)這樣的腔室壁，其具有比容器的直接連接的、保持流體的任何腔室壁都更大的水蒸汽傳輸速率。在一方面，所述第一和第二腔室中的每一個(gè)都包括柔性腔室壁。該柔性腔室壁可以包括多個(gè)層，其中一層或者多層可以是塑料層。為了限制光、蒸汽和/或氧氣透過(guò)腔室壁，所述層的至少一層包括箔層。在另一方面，第二腔室的柔性壁完全包括箔層，并且第一腔室的柔性壁不完全包括箔層。第一腔室的柔性壁可以包括一層或者多層，但是小于第二腔室的柔性壁的所有層。為了促進(jìn)檢測(cè)來(lái)自第一腔室中含有的物質(zhì)的光信號(hào)，第一腔室的腔室壁可以包括光學(xué)透射區(qū)域。在又一方面，將第二腔室構(gòu)造成使其不包括具有光學(xué)透射區(qū)域的腔室壁，該光學(xué)透射區(qū)域會(huì)影響腔室壁的水蒸汽傳輸率和干燥的物質(zhì)的穩(wěn)定性。為了限制暴露于可能影響所述干燥的物質(zhì)的穩(wěn)定性的外界環(huán)境(例如，光、水和/氧氣)，可以將容器容納在密封的器皿中。優(yōu)選地，將干燥劑容置在該密封的器皿中。在再一實(shí)施例中，提供一種方法，用于混合在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器的第一和第二腔室中含有的物質(zhì)，其依賴(lài)重力來(lái)移動(dòng)其中一個(gè)腔室所含有的物質(zhì)。在本方法中，首先在分析器中定向該容器，以便第一腔室基本上位于第二腔室的上方，從而當(dāng)在第一和第二腔室之間建立液體連接(fluidcommunication)的時(shí)候,允許第一腔室所含有的物質(zhì)通過(guò)重力(或者負(fù)壓)而抽出到第二腔室中。在優(yōu)選的實(shí)施例中，當(dāng)在第一和第二腔室之間的可開(kāi)連接被施加于第二腔室所含有的物質(zhì)上的物質(zhì)移動(dòng)力而從關(guān)閉狀態(tài)改變到打開(kāi)狀態(tài)的時(shí)候，建立所述液體連接，該物質(zhì)移動(dòng)力諸如是施加于第二腔室的柔性部分的一種或者多種壓縮力。用于在第一和第二腔室之間建立所述流體串槽的相同的力還可以用來(lái)將第二腔室所含有的物質(zhì)移動(dòng)到第一腔室中。在將第二腔室所含有的物質(zhì)移動(dòng)到第一腔室中之后，移除所述物質(zhì)移動(dòng)力，以便能夠?qū)⒌谝磺皇宜械奈镔|(zhì)抽出到第二腔室中?？梢灾貜?fù)該處理一次或者更多次，以實(shí)現(xiàn)在所述過(guò)程開(kāi)始之前實(shí)現(xiàn)存儲(chǔ)在第一和第二腔室中的物質(zhì)的完全混合。第一和第二腔室可以每個(gè)都容納流體，或者第一腔室容納干燥的物質(zhì)，諸如凍干的或者成片的試劑。如果在第一腔室中容納干燥的物質(zhì)，那么第二腔室的流體物質(zhì)被提供來(lái)恢復(fù)、溶解或者再水合干燥的物質(zhì)。已發(fā)現(xiàn)，包括與第二腔室的流體物質(zhì)不反應(yīng)、不混溶的流體促進(jìn)了將要結(jié)合的物質(zhì)的更加完全的混合，尤其是當(dāng)干燥的物質(zhì)被水合的時(shí)候。不混溶流體可以是油，諸如礦物油，并且不混溶流體與流體物質(zhì)的比率優(yōu)選是大約1:10到大約10:1，并且更優(yōu)選是大約1:3到大約10:I。在又一實(shí)施例中，提供一種系統(tǒng)，用于執(zhí)行容納在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器的第一和第二腔室中的物質(zhì)的重力輔助混合。該系統(tǒng)包括上述容器中的一個(gè)，以及將容器支撐在工作位置上的分析器。該分析器包括一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器，用于將壓縮力施加于第二腔室，以從而將該第二腔室所含有的物質(zhì)的至少一部分移置到第一腔室中。將所述壓縮力從第二腔室移除，使得第一腔室所含有的物質(zhì)能夠通過(guò)重力而流入到第二腔室中，而無(wú)需將壓縮力施加于第一腔室所含有的物質(zhì)上。將分析器設(shè)計(jì)為控制致動(dòng)器的操作，并且使得第二腔室所含有的物質(zhì)在第一腔室與第二腔室之間多次移動(dòng)，由此混合第一和第二腔室所含有的結(jié)合物質(zhì)。所述致動(dòng)器可以是氣動(dòng)致動(dòng)器，并且優(yōu)選地具有與第二腔室的形狀大體一致的壓縮式防震墊，或者至少具有第二腔室的柔性部分。在優(yōu)選的方面，所述容器的每個(gè)腔室都是至少局部可壓縮的腔室，以促進(jìn)物質(zhì)在各腔室之間移動(dòng)。根據(jù)這個(gè)方面，分析器包括多個(gè)致動(dòng)器，每個(gè)致動(dòng)器都與容器的至少一個(gè)腔室相關(guān)聯(lián)，并且控制器被設(shè)計(jì)成為控制致動(dòng)器的操作，并且使得致動(dòng)器通過(guò)選擇性地施加致動(dòng)器的外力，而將物質(zhì)在各個(gè)腔室之間移動(dòng)。該控制器被設(shè)計(jì)成為使得分析器不將壓縮力施加到第一腔室所含有的物質(zhì)，或者或者，該分析器不包括與第一腔室相關(guān)聯(lián)的致動(dòng)器。在某些方面，被設(shè)置成安置所述致動(dòng)器的致動(dòng)板(actuatorplate)包括與第一腔室相鄰的開(kāi)口，以允許檢測(cè)器檢測(cè)第一腔室所含有的物質(zhì)的特性，諸如光信號(hào)。在又一實(shí)施例中，設(shè)置具有多個(gè)相互連接的腔室的容器，該容器包括被處理成限制所容納的流體物質(zhì)的蒸發(fā)的至少一個(gè)腔室。該腔室具有柔性部分，諸如可壓縮的腔室壁，并且除了容納流體物質(zhì)之，外還容納不混溶流體。該不混溶流體覆蓋腔室的內(nèi)表面，從而限制了流體物質(zhì)從腔室蒸發(fā)。該不混溶流體優(yōu)選不與腔室所含有的其他物質(zhì)起反應(yīng)，并且例如可以是油(例如，礦物油)。不混溶流體與腔室所含有的其他流體物質(zhì)的比率優(yōu)選是大約I:10到大約10:1，并且更優(yōu)選為大約1:3到大約10:I。在還一實(shí)施例中，提供了一種混合容納在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中的物質(zhì)的方法。在本實(shí)施例的第一方面，該方法包括以下步驟:在容器的第一腔室中形成一用量，其中該用量包括第一和第二物質(zhì)以及優(yōu)選地不與該第一物質(zhì)和第二物質(zhì)起反應(yīng)的不混溶流體；以及通過(guò)容器的第一腔室與第二腔室之間的連接而移動(dòng)該用量一次或者多次，以在存在有不混溶流體的情況下，促進(jìn)第一和第二物質(zhì)的混合。該第一方面的第一和第二腔室包括屈服于物質(zhì)移動(dòng)力的柔性部分。在本實(shí)施例的第二方面，本方法包括下列步驟:在容器的閉合的腔室中形成一用量，其中該用量包括第一和第二物質(zhì)以及優(yōu)選地不反應(yīng)、不混溶的流體，并且其中該閉合的腔室包括屈服于物質(zhì)移動(dòng)力的柔性部分；關(guān)閉該腔室，以提供足夠的液封密封；以及以交替的方式將物質(zhì)移動(dòng)力施加到該柔性部分的不同部分，以在存在有不混溶流體的情況下，在該閉合的腔室內(nèi)混合所述第一和第二物質(zhì)。在優(yōu)選的方面，發(fā)現(xiàn)了不混溶流體通過(guò)大致地朝著腔室的中心集中將要被混合的物質(zhì)，能夠改進(jìn)混合。不混溶物質(zhì)與腔室中的其他流體物質(zhì)的比率優(yōu)選是大約1:10到大約10:1，更優(yōu)選為大約I:3到大約10:I。為了實(shí)現(xiàn)本實(shí)施例的第一方面中的混合，優(yōu)選地，在所述移動(dòng)步驟期間將物質(zhì)移動(dòng)力交替地施加于第一和第二腔室的柔性部分。(該連接和/或第二腔室可以被構(gòu)造成，當(dāng)被從第一腔室移動(dòng)的時(shí)候，促進(jìn)湍流以及物質(zhì)的混合。)在本方面，所述物質(zhì)移動(dòng)力是壓縮力，通過(guò)具有壓縮式防震墊的一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器來(lái)施加該壓縮力，該壓縮式防震墊與第一和第二腔室的每一個(gè)的柔性部分的形狀大體一致，所述柔性部分諸如腔室壁。在該實(shí)施例的第二方面，所述物質(zhì)移動(dòng)力是壓縮力，該壓縮力包括兩個(gè)或更多個(gè)具有壓縮式防震墊的致動(dòng)器，該壓縮式防震墊與閉合腔室的柔性部分的形狀大體一致。所述致動(dòng)器優(yōu)選地是氣動(dòng)致動(dòng)器?；蛘撸蛘吲c內(nèi)部阻隔(例如，密封)相結(jié)合，所述移動(dòng)步驟之前，第一和第二腔室在通過(guò)施加于所述連接的外部的且可伸縮的壓縮力而彼此分離。外部關(guān)閉力，單獨(dú)地或者與內(nèi)部阻礙一起，提供了實(shí)質(zhì)的液封密封，并且包括具有跨過(guò)所述連接而延伸的壓縮式防震墊的一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器。氣動(dòng)致動(dòng)器是尤為優(yōu)選的。用于形成本混合方法的所述用量的物質(zhì)典型地是流體，并且所述不混溶流體例如可以是油(例如，礦物油)。在還一實(shí)施例中，設(shè)置具有多個(gè)相互連接的腔室的容器，其中各腔室中的一個(gè)腔室是第一腔室，該第一腔室容納處理材料和足以基本覆蓋第一腔室的內(nèi)表面的量的優(yōu)選為不反應(yīng)的、不混溶的流體，從而抑制了處理材料粘到所述內(nèi)表面。該處理材料優(yōu)選是流體，諸如恢復(fù)試劑；而該不混溶流體優(yōu)選是油(例如，礦物油)。該不混溶流體與處理材料的比率優(yōu)選是大約1:10到大約10:1，并且更優(yōu)選是大約1:3到大約10:I。容器的第一腔室直接連接于第二腔室，并且包括屈服于物質(zhì)移動(dòng)力的柔性部分，諸如可壓縮的腔室壁。在還一實(shí)施例中，提供了一種移動(dòng)在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中的處理材料的方法，其中該方法包括以下步驟:在容器的第一腔室中形成一用量，其中該用量包括處理材料和足以基本覆蓋第一腔室的內(nèi)表面的量的不混溶流體，從而抑制處理材料粘到第一腔室的內(nèi)表面；以及通過(guò)第一腔室與第二腔室之間的連接，而將該用量第一腔室移動(dòng)到第二腔室中。在在本方法中，可以使用在覆蓋腔室的內(nèi)表面中所使用的上述容器。在另一實(shí)施例中，提供了一種將流體物質(zhì)從容器的第一腔室移動(dòng)到第二腔室的方法，其中第一和第二腔室通過(guò)可開(kāi)連接而直接相互連接。該方法包括以下步驟:在第一腔室中形成一用量，其包括流體物質(zhì)和優(yōu)選為不反應(yīng)的不混溶的流體；以及將物質(zhì)移動(dòng)力施加于第一腔室的該用量，該物質(zhì)移動(dòng)力足以將所述可開(kāi)連接從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)，并且將第一腔室的該用量移動(dòng)到第二腔室，其中，在缺少不混溶流體的情況下，第一腔室中的該用量不足以將可開(kāi)連接從關(guān)閉狀態(tài)改變到打開(kāi)狀態(tài)。該不混溶流體例如是油(例如，礦物油)。還是在另一實(shí)施例中，提供了一種改變?nèi)萜鞯那皇抑兴菁{的流體物質(zhì)的溫度的方法。該方法包括第一步驟，在該第一步驟中，在容器的第一腔室中形成一用量，以便第一腔室壁的柔性部分延伸到與位于第一腔室附近的固定的熱敏元件相接觸。第一腔室中的該用量包括流體物質(zhì)和相應(yīng)的不混溶流體，其中，與如果第一腔室不存在不混溶流體的情況相比，該不混溶流體的存在使得第一腔室的柔性部分更大程度地接觸熱敏元件。在第二步驟中，通過(guò)在熱敏元件與該用量之間傳送熱能，而改變第一腔室中的流體物質(zhì)的溫度。該方法的流體物質(zhì)可以是用于執(zhí)行分析的試劑，而不混溶流體優(yōu)選是惰性的，以便其不與分析物的任何組分起反應(yīng)。第一腔室中的不混溶流體與剩余用量的比率優(yōu)選達(dá)到10:I。適合的不混溶流體例如包括油(例如，礦物油)。可以包括一個(gè)或者多個(gè)連接，用于將第一腔室連接到容器的一個(gè)或者多個(gè)其他腔室，其中在所述改變步驟期間，連接保持被阻隔狀態(tài)，至少直到達(dá)到流體用量的預(yù)定溫度為止。至少一個(gè)所述連接是當(dāng)將物質(zhì)移動(dòng)力施加到處理室所含有的物質(zhì)時(shí)，能夠從關(guān)閉狀態(tài)改變?yōu)榇蜷_(kāi)狀態(tài)的可開(kāi)連接。在關(guān)閉的狀態(tài)下，至少一個(gè)所述連接被內(nèi)部屏障和/或外部施加的關(guān)閉力而阻隔，該外部施加的關(guān)閉力諸如是致動(dòng)器。第一腔室包括屈服于物質(zhì)移動(dòng)力的第二腔室的柔性部分。第二柔性部分可以位于物質(zhì)移動(dòng)力附近，其與熱敏元件相對(duì)。物質(zhì)移動(dòng)力包括具有與第二柔性部分的形狀大體一致的壓縮式防震墊的一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器。該一個(gè)或者多個(gè)致動(dòng)器可以是氣動(dòng)致動(dòng)器。在這方面，物質(zhì)移動(dòng)力在所述方法期間與第二柔性部分相接觸。第二柔性部分可以在所述流體用量形成步驟期間延伸，但不是必須的。熱敏元件可以單獨(dú)作用，或者與物質(zhì)移動(dòng)力協(xié)同，以在所述改變步驟期間改變流體用量的溫度(例如，物質(zhì)移動(dòng)力也可以用作導(dǎo)熱介質(zhì))。參見(jiàn)。例如，Devaney等人的“Temperaturecontroldeviceandreactionvessel，，，美國(guó)專(zhuān)利N0.5，460，780。熱敏兀件包括形成在導(dǎo)熱材料上的熱傳遞元件，諸如是鋁或者其他金屬或者金屬的組合。導(dǎo)熱元件被放置成與熱電設(shè)備相接觸，以實(shí)現(xiàn)溫度變化。為了提高或者降低熱傳遞元件的溫度，熱電設(shè)備產(chǎn)生佩爾捷效應(yīng)(Peltiereffect)。通常在所述溫度改變步驟升高所述流體用量的溫度，并且對(duì)于某些應(yīng)用，可以在不同的溫度之間循環(huán)(例如，實(shí)現(xiàn)在存在單鏈核酸板時(shí)的引物的粘合與擴(kuò)展，以及雙鏈延伸產(chǎn)物的熔化的PCR熱循環(huán))。在又一方面，將用于在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中處理樣品的儀器構(gòu)造且布置成:在該處理期間將該容器支撐在工作位置。該儀器包括限定一個(gè)或者多個(gè)多腔溫度帶的一個(gè)或多個(gè)熱敏元件。該多腔溫度帶與所述容器熱連通，并且被構(gòu)造且布置成在每個(gè)所述多腔溫度帶與容器的相關(guān)區(qū)域之間傳送熱能，其中，所述容器的相關(guān)區(qū)域包圍容器的兩個(gè)或者大于兩個(gè)、而又少于所有腔室的每一個(gè)腔室的所有部分或者一部分。該儀器還包括控制器，該控制器被設(shè)計(jì)成控制限定所述多腔溫度帶的一個(gè)或者多個(gè)熱敏元件的操作，以選擇性地加熱或者冷卻包圍在與所述多腔溫度帶相關(guān)的區(qū)域內(nèi)的腔室。在另一方面，該儀器進(jìn)一步包括限定一個(gè)或者多個(gè)單腔溫度帶的一個(gè)或者多個(gè)熱敏元件，該熱敏元件設(shè)置成與容器熱連通，并且構(gòu)造并布置成在容器的每個(gè)單腔溫度帶與相關(guān)區(qū)域之間傳送熱能，該相關(guān)區(qū)域包圍了容器的一個(gè)腔室的所有部分或者一部分?？刂破鬟€被設(shè)計(jì)為控制限定所述單腔溫度帶的熱敏元件的操作，以選擇性地加熱或者冷卻包圍在與所述單腔溫度帶相關(guān)的區(qū)域內(nèi)的腔室。該儀器在任何地方可以具有一個(gè)至五個(gè)溫度帶，該溫度帶包括全部的所述多腔溫度帶或者多腔溫度帶與單腔溫度帶的結(jié)合。在另一方面，熱敏元件包括由控制器控制的佩爾捷裝置(Peltierdevice)，以選擇性地加熱或者冷卻與該佩爾捷裝置熱接觸的主體(body)。在另一方面，熱敏元件包括熱傳遞元件，該熱傳遞元件由導(dǎo)熱材料制成并且具有與由該熱傳遞元件限定的多腔溫度帶的預(yù)定形狀相對(duì)應(yīng)的外周形狀。該熱傳遞元件可以由招制成。在另一方面，該儀器進(jìn)一步包括與熱傳遞元件熱連通的溫度傳感器。該傳感器適于感測(cè)所述熱傳遞元件的溫度并且將所感測(cè)到的溫度傳送到控制器。該熱傳遞元件相對(duì)于容器以固定的位置保持在所述容器中。在另一方面，熱敏元件包括由控制器控制的一個(gè)或多個(gè)佩爾捷設(shè)備，以選擇性地加熱或者冷卻與該佩爾捷設(shè)備熱接觸的主體，以及與每個(gè)所述多腔溫度帶相關(guān)聯(lián)的熱傳遞元件。該熱傳遞元件由導(dǎo)熱材料形成，并且具有大致的平坦表面和與由該熱傳遞元件所限定的多腔溫度帶的預(yù)定形狀相對(duì)應(yīng)的外周形狀，并且佩爾捷設(shè)備與該熱傳遞元件熱接觸。在另一方面，每個(gè)多腔溫度帶都通過(guò)隔離結(jié)構(gòu)與其他的多腔溫度帶分離，該隔離結(jié)構(gòu)包括不導(dǎo)熱材料。熱傳遞元件和隔離結(jié)構(gòu)相對(duì)于容器在固定的位置保持在儀器內(nèi)。所述儀器進(jìn)一步包括散熱元件，該散熱元件被構(gòu)造且布置成散發(fā)來(lái)自佩爾捷設(shè)備的熱量。并且該散熱元件包括由導(dǎo)熱材料構(gòu)成并且包括塊狀物(block)的熱沉，該塊狀物的一側(cè)與至少一個(gè)佩爾捷設(shè)備熱連通，并且散熱鰭片從該塊狀物的另一側(cè)延伸。在一個(gè)實(shí)施例中，熱沉可以由鋁制成。在另一方面，散熱元件進(jìn)一步包括風(fēng)扇，該風(fēng)扇與熱沉臨近并且在熱沉的散熱鰭片上方產(chǎn)生氣流。通過(guò)所述控制器控制該風(fēng)扇的操作。在另一方面，該儀器包括一個(gè)或者多個(gè)溫度傳感器，用于感測(cè)每個(gè)溫度帶的溫度并且將所感測(cè)到的溫度傳送到控制器。在另一方面，將所述控制器構(gòu)造成控制熱敏元件的操作，以將環(huán)境溫度設(shè)定在預(yù)定的溫度范圍內(nèi)。該預(yù)定的溫度范圍是大約20°C到40°C或者大約25°C到37°C。在另一方面，將所述控制器構(gòu)造成控制熱敏元件的操作，以將一個(gè)或者多個(gè)腔室的加熱到預(yù)定溫度范圍內(nèi)的溫度。腔室的預(yù)定溫度范圍包括執(zhí)行熱循環(huán)所需的處理所需要的溫度。該預(yù)定溫度范圍可以是大約5°C到95°C。在另一方面，所述處理可以是PCR擴(kuò)增反應(yīng)。在另一方面，將所述控制器構(gòu)造成控制熱敏元件的操作，以在預(yù)定時(shí)間段內(nèi)將包圍在與多腔溫度帶相關(guān)的區(qū)域內(nèi)的各腔室所含有的物質(zhì)加熱或者冷卻到預(yù)定溫度。在又一方面，當(dāng)所述容器被支撐在儀器內(nèi)的工作位置時(shí)，用流體填充包圍在與多腔溫度帶相關(guān)的區(qū)域內(nèi)的腔室的操作將增加在該腔室與該多腔溫度帶之間的熱流通。在又一方面，用于加熱在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器內(nèi)的物質(zhì)的方法包括步驟:定位與容納在分析器中的一個(gè)或者多個(gè)多腔溫度帶熱連通的容器。每個(gè)多該腔溫度帶都與容器的包圍容器的兩個(gè)或者更多腔室而少于所有腔室中的每個(gè)腔室的所有部分或者一部分的區(qū)域相關(guān)聯(lián)。該方法還包括:在每個(gè)所述多腔溫度帶和由與該多腔溫度帶相關(guān)的區(qū)域所包圍的腔室之間傳送熱能，以選擇性地將容納在該包圍的腔室中的物質(zhì)加熱或者冷卻到與由至少一個(gè)其他區(qū)域所包圍的腔室的溫度不同的溫度。在還一方面，該方法還包括:定位與容納在分析器中的一個(gè)或者多個(gè)單腔溫度帶熱連通的容器，每個(gè)該單腔溫度帶都與容器的包圍該容器的一個(gè)腔室的所有部分或者一部分的區(qū)域相關(guān)聯(lián)。在還一方面，所述發(fā)送步驟包括:用一個(gè)或者多個(gè)佩爾捷設(shè)備加熱或者冷卻溫度帶。在還一方面，在該方法期間，分析器的環(huán)境溫度與由容器的與每個(gè)溫度帶相關(guān)聯(lián)的區(qū)域所包圍的腔室內(nèi)容納的物質(zhì)的溫度不同。在還一方面，所述發(fā)送步驟包括:交替地加熱和冷卻所述多腔溫度帶中的至少一個(gè)。在還一方面，該方法還包括:將每個(gè)溫度帶與其他溫度帶熱分離。在還一方面，該方法還包括散發(fā)來(lái)自溫度帶的熱量。在還一方面，該方法還包括感測(cè)每個(gè)溫度帶的溫度。在還一方面，該方法還包括:延伸由容器的與多腔溫度帶相關(guān)聯(lián)的區(qū)域所包圍的腔室，以增加在該延伸的腔室與相關(guān)的多腔溫度帶之間的熱流通。在還一方面，所述分析器容納至少三個(gè)多腔溫度帶。在還一方面，多個(gè)相互連接的腔室中的每一個(gè)都與該容器的至少一個(gè)其他的腔室相鄰。在考慮下述詳細(xì)的說(shuō)明、權(quán)利要求以及附圖之后，本領(lǐng)域技術(shù)人員將更容易理解本發(fā)明的上述以及其他的特征、方面以及優(yōu)點(diǎn)。圖1A至圖1C是示出體現(xiàn)本發(fā)明的各方面的多腔容器的平面圖。圖2是體現(xiàn)本發(fā)明的各方面的系統(tǒng)的功能架構(gòu)的示意性方框圖。圖3是體現(xiàn)本發(fā)明的各方面的自動(dòng)化儀器的分解透視圖。圖4是儀器的加壓機(jī)構(gòu)組的壓縮式防震墊的布置的示意圖。圖5是該儀器的門(mén)組件的前側(cè)的平面圖。圖6是體現(xiàn)本發(fā)明的各方面的熒光計(jì)的分解透視圖。圖7是熒光計(jì)的后殼體的透視圖。圖8A是熒光計(jì)的后殼體的端面圖。圖8B是沿著圖8A的線8B-8B截取的后殼體的剖視圖。圖8C是沿著圖8B的線8C-8C截取的后殼體的剖視圖。圖9A是熒光計(jì)的端面圖。圖9B是沿著圖9A的線9B-9B截取的熒光計(jì)的剖視圖。圖9C是沿著圖9B的線9C-9C截取的熒光計(jì)的剖視圖。圖1OA和圖1OB分別是集成有信號(hào)檢測(cè)器的壓縮式防震墊的實(shí)施例的側(cè)視圖和頂視圖。圖11是集成有信號(hào)檢測(cè)器的壓縮式防震墊的替換實(shí)施例的透視圖。圖12A是體現(xiàn)本發(fā)明的各方面的多腔容器的替換實(shí)施例的平面圖。圖12B是圖12A的容器的分解透視圖。圖13是體現(xiàn)本發(fā)明的各方面的自動(dòng)化儀器的替換實(shí)施例的正面透視圖。圖14是圖13的儀器的背面透視圖，其外殼的頂部被移除以示出殼體的內(nèi)部。圖15是圖13的儀器的正面透視圖，其外殼的頂部被移除。圖16是圖13的儀器的加壓機(jī)構(gòu)組的壓縮式防震墊的布置的前視圖。圖17A是圖13的儀器的空氣歧管和附加部件的背面透視圖。圖17B是儀器的氣動(dòng)系統(tǒng)的電路圖。圖18是集成有信號(hào)檢測(cè)器的壓縮式防震墊的替換實(shí)施例的剖視圖。圖19是集成有永磁致動(dòng)器的壓縮式防震墊的剖視圖。圖20是圖13的儀器的溫度控制系統(tǒng)的分解透視圖。圖21是圖6至圖9C的熒光計(jì)的互聯(lián)電路和電源的示意圖。圖22是熒光計(jì)的控制、處理和通信電路的示意圖。圖23是熒光計(jì)的用于電壓測(cè)量和LED控制的電路示意圖。圖24是熒光計(jì)的LED、RF屏蔽以及電源濾波電路的示意圖。圖25A是熒光計(jì)的第一前端放大器電路的示意圖。圖25B是熒光計(jì)的第二前端放大器電路的示意圖。圖26是熒光計(jì)的解調(diào)電路的示意圖。圖27是示出對(duì)于一系列人工執(zhí)行的實(shí)時(shí)擴(kuò)增反應(yīng)，檢測(cè)的相應(yīng)熒光計(jì)單元與時(shí)間之間的關(guān)系的曲線圖。圖28是示出對(duì)于使用流體試劑以及體現(xiàn)本發(fā)明各方面的容器和儀器所實(shí)施的一系列實(shí)時(shí)擴(kuò)增反應(yīng)，檢測(cè)到的相應(yīng)熒光計(jì)單元與時(shí)間之間的關(guān)系的曲線圖。圖29是示出對(duì)于使用尿樣和流體試劑以及體現(xiàn)本發(fā)明各方面的容器和儀器所實(shí)施的一系列實(shí)時(shí)擴(kuò)增反應(yīng)，檢測(cè)到的相應(yīng)熒光計(jì)單元與時(shí)間之間的關(guān)系的曲線圖。圖30是示出對(duì)于使用干燥的試劑以及體現(xiàn)本發(fā)明各方面的容器和儀器所實(shí)施的一系列實(shí)時(shí)擴(kuò)增反應(yīng)，檢測(cè)到的相應(yīng)熒光計(jì)單元與時(shí)間之間的關(guān)系的曲線圖。圖31是示出對(duì)于在擴(kuò)增試劑和/或酶試劑中有油和沒(méi)有油的情況下所實(shí)施的一系列實(shí)時(shí)擴(kuò)增反應(yīng)，檢測(cè)到的相應(yīng)熒光計(jì)單元與時(shí)間之間的關(guān)系的曲線圖。本發(fā)明的整體情況本發(fā)明涉及一種多腔容器，其能夠用于與目標(biāo)樣品執(zhí)行一個(gè)或者多個(gè)人工或者自動(dòng)的處理，諸如確定物質(zhì)的化學(xué)組成、測(cè)量代謝酶組的活性、或者檢驗(yàn)樣品中是否存在一個(gè)或者多個(gè)分析物。利用封閉的或者密封的通路來(lái)互相連接該容器的一些或者所有腔室，所述通路可以永久地或者臨時(shí)地打開(kāi)，以允許物質(zhì)在各腔室之間移動(dòng)。腔室在所述容器中的布置使得可以通過(guò)非順序地和/或同時(shí)地執(zhí)行一個(gè)或多個(gè)處理的不同步驟，從而執(zhí)行復(fù)雜的處理。本發(fā)明的容器可以由柔性材料或者剛性材料及其組合來(lái)構(gòu)造，只要容器使得物質(zhì)能夠在各腔室之間受力或者抽出。能夠用處理材料(例如，試劑)預(yù)載至少一些腔室，并且然后在加載樣品材料之前，將該至少一些腔室與環(huán)境封閉或者密封。所述處理材料和樣品材料可以包括流體、固體、氣體或其組合。一旦樣品材料被裝載到一個(gè)腔室或者多個(gè)腔室中，就將所述容器密封或者關(guān)閉，以在操作期間將所有的材料保持在容器中?；蛘撸诓僮饕呀?jīng)開(kāi)始啟動(dòng)后，樣品室可保持打開(kāi)，以便在已經(jīng)開(kāi)始該呆作之后，將一些或者所有樣品材料添加到所述容器中。確定相互連接各腔室的通路的尺寸并且這樣布置所述通路以允許物質(zhì)在相鄰的腔室之間通過(guò)。所述物質(zhì)優(yōu)選為流體或者流化物質(zhì)，并且例如包括凝膠、乳膠、懸浮液以及固體，其中所述固體可以單獨(dú)地通過(guò)通路運(yùn)輸，或者例如使用諸如惰性油的流體載體而運(yùn)輸。設(shè)置屏障(barrier)，以阻礙物質(zhì)通過(guò)所述通路的運(yùn)動(dòng)，直到需要這種運(yùn)動(dòng)為止。容器，或者與自動(dòng)化儀器協(xié)作的容器，可以包括一種或者多種類(lèi)型的所述屏障。這些屏障可以由容器的材料(例如，可開(kāi)密封)構(gòu)造，或者它們可以是固定的、可移動(dòng)或者可變的部件或者位于通路附近或插入到通路中的物質(zhì)(例如，閥門(mén)、磁響應(yīng)顆?；驘崦襞D塞)，或者，它們可以是自動(dòng)化儀器的將可逆的壓縮力施加到通路的部件(例如，致動(dòng)器)。改變或者移除相鄰腔室之間的屏障使得一個(gè)腔室中的物質(zhì)能夠被強(qiáng)迫或者抽出至相鄰的腔室中。這種運(yùn)動(dòng)例如可以通過(guò)諸如致動(dòng)器或者致動(dòng)器組的壓力源的作用來(lái)實(shí)現(xiàn)，該致動(dòng)器或者致動(dòng)器組適于將壓力施加到腔體的外部，從而壓縮(collapse)或者局部壓縮該腔室以在腔室之間推動(dòng)所有或者部分材料。該材料可以在例如希望混合化合材料的腔室之間單向或者雙向地移動(dòng)。各腔室布置在容器中，使得至少有兩個(gè)非線性路徑，該非線性路徑允許彼此獨(dú)立地執(zhí)行處理的各步驟。其巨大的優(yōu)勢(shì)在于:能夠在所得到的混合物或結(jié)合物或者各個(gè)組腔室的基礎(chǔ)物質(zhì)(underlyingsubstance)彼此接觸之前,混合或者結(jié)合兩組或者多組腔室的物質(zhì)。通過(guò)允許彼此獨(dú)立地執(zhí)行處理步驟，可以利用本發(fā)明的容器來(lái)執(zhí)行這樣的復(fù)雜操作，所述操作包括一系列不能或者優(yōu)選不線性(即，依次執(zhí)行的步驟)執(zhí)行的步驟。本發(fā)明的容器和系統(tǒng)的緊湊設(shè)計(jì)使其尤其適用于現(xiàn)場(chǎng)護(hù)理和現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)用。通過(guò)密封預(yù)載有進(jìn)行處理所需要的處理材料的腔室，大大降低了污染和用戶錯(cuò)誤問(wèn)題。本發(fā)明的容器對(duì)于單位劑量檢驗(yàn)來(lái)說(shuō)也是理想的，其中在容器的腔室內(nèi)預(yù)載精確量的進(jìn)行檢驗(yàn)所需的處理材料。本發(fā)明的詳細(xì)說(shuō)明盡管能夠以各種形式實(shí)施本發(fā)明，但是下面的說(shuō)明和附圖僅僅用于公開(kāi)上述形式中的某一些，來(lái)作為本發(fā)明的具體實(shí)施例。因此，本發(fā)明并不意欲限于所描述和示出的各實(shí)施例的形式。定義除非明確地指出具有相反的意思以外，以下術(shù)語(yǔ)具有下列含義。需要注意的是，術(shù)語(yǔ)“一”(a)或“一”(an)實(shí)體指的是一種或者多種該實(shí)體；例如，“一分析物”應(yīng)當(dāng)理解為表示一種或者多種分析物。同樣地，術(shù)語(yǔ)“一”(a)或“一”(an)、“一個(gè)或者多個(gè)”以及“至少一個(gè)”在這里可以互換地使用。相鄰的/相鄰地:關(guān)于各腔室，術(shù)語(yǔ)“相鄰的”或者“相鄰地”指的是所指的各腔室彼此鄰近(即，各腔室在容器中的位置彼此直接緊鄰)。當(dāng)開(kāi)始操作的時(shí)候，將容器的相鄰的各腔室分開(kāi)的唯一結(jié)構(gòu)是密封(seal)。因此，相鄰設(shè)置的各腔室沒(méi)有通過(guò)通道或者通路而彼此連接。擴(kuò)增/擴(kuò)增反應(yīng):“擴(kuò)增”或者“擴(kuò)增反應(yīng)”是指用于增加表示樣品中一種分析物的存在的物質(zhì)的數(shù)量、濃度或者可檢測(cè)性的操作。擴(kuò)增條件:“擴(kuò)增條件”是指適合于實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增反應(yīng)的溫度條件。擴(kuò)增寡核苷酸:“擴(kuò)增寡核苷酸”是指結(jié)合到目標(biāo)核酸、或其互補(bǔ)核酸的寡核苷酸，并參與到基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)中。擴(kuò)增產(chǎn)物:“擴(kuò)增產(chǎn)物”是指在基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)中生成的包含用于檢測(cè)的目標(biāo)序列的核酸。擴(kuò)增試劑:“擴(kuò)增試劑”是指包含擴(kuò)增反應(yīng)所需要的一種或者多種組分的材料。在基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)中，這些組分可以包括擴(kuò)增寡核苷酸(例如，引物和/或助劑引物)、核苷三磷酸、和/或目標(biāo)核酸序列的擴(kuò)增所需要的輔助因子(諸如Mg++的二價(jià)陽(yáng)離子)。分析物:“分析物”是指被分析的樣品或者樣品的組分。分析:“分析”是指一種或者多種分析物的定量或者定量分析。屏障:“屏障”是指阻礙或者防止物質(zhì)在各空間之間移動(dòng)的結(jié)構(gòu)或材料。封閉:“封閉”是指靠近物質(zhì)的運(yùn)動(dòng)(closedtothemovementofasubstance)。結(jié)合劑:“結(jié)合劑”是指能夠粘合到樣品或者反應(yīng)混合物的組分的分子或者分子聚合體。該結(jié)合劑例如可以是抗體、抗原、肽、蛋白質(zhì)、核酸及其類(lèi)似物、有機(jī)分子、或者任意前述的聚合體(例如，抗體:核酸聚合體)可破裂的密封:“可破裂的密封”是指當(dāng)將足夠的壓力施加到密封時(shí)，該密封破壞或者剝落的密封。捕捉劑:“捕捉劑”是指能夠粘合到分析物并且能夠直接或者間接地粘合到固相載體的結(jié)合劑。捕捉探針:“捕捉探針”是指能夠粘合到核酸分析物的結(jié)合劑。腔室:“腔室”是指在容器內(nèi)的分開(kāi)的區(qū)域或者空間。腔室限定元件:“腔室限定元件”是指確定腔室體積的整體(例如，囊狀物)或者一部分(例如，壁)。腔室限定元件可以由單組分(例如，一層)或多組分(例如，粘合在一起的多層)組成。閉合/關(guān)閉:關(guān)于腔室，“閉合”或者“關(guān)閉”是指容器的腔室沒(méi)有處于與容器的其他腔室流體互通的狀態(tài)，或者腔室處于不與容器的其他腔室流體互通的狀態(tài)。關(guān)于樣品保持容器，“閉合”是指容器的所有腔室被保持在相對(duì)于周?chē)h(huán)境基本上氣密的環(huán)境中。關(guān)于在樣品添加之前的容器，“閉合”是指除了樣品容納室之外的容器的所有腔室都保持在相對(duì)于周?chē)h(huán)境基本上氣密的環(huán)境中。集中:“集中”是指限制一種或者多種組分在腔室中的分散。腔室的鄰接路徑:“腔室的鄰接路徑”是指一系列相鄰連接的腔室。直接連接:“直接連接”是指在兩個(gè)所指的腔室之間的連接中沒(méi)有中間腔室。分開(kāi)的連接:“分開(kāi)的連接”是指與這樣一種連接，該連接與容器的其他連接分開(kāi)，并且不與容器的其他連接交疊。端室:“端室”是指腔室的線性路徑的最外端腔室。酶試劑:術(shù)語(yǔ)“酶試劑”是指含有至少一種參與處理的酶的材料。在基于核酸的擴(kuò)增反應(yīng)中，酶試劑可以包含一種或者多種利用一段現(xiàn)有的DNA或RNA作為模板來(lái)催化DNA和/或RNA多核苷酸的合成的酶。該酶的實(shí)例包括依賴(lài)DNA的DNA聚合酶(例如，來(lái)自大腸桿菌和噬菌體T7DNA聚合酶的DNA聚合酶I)，依賴(lài)DNA的RNA聚合酶或轉(zhuǎn)錄酶(例如，來(lái)自大腸桿菌和噬菌體T7、T3和SP6的依賴(lài)DNA的RNA聚合酶)，依賴(lài)RNA的DNA聚合酶或者逆轉(zhuǎn)錄酶，以及依賴(lài)RNA的RNA聚合酶(例如，RNA復(fù)制酶)。柔性的:“柔性的”是指材料的性質(zhì)，其使得該材料能夠屈服于適當(dāng)?shù)牧Χ粫?huì)撕裂或者破裂。流體:“流體”是指易于流動(dòng)或者與其容器的形狀一致的物質(zhì)(例如，液體或者氣體)。流體可以是流態(tài)化的物質(zhì)，或者液體與氣體的混合物，諸如乳劑。這里使用的術(shù)語(yǔ)“流體”也指通過(guò)改變其形狀而屈服于壓力的物質(zhì)，諸如糊劑。流態(tài)化的:“流態(tài)化的”是指這樣一種物質(zhì)，該物質(zhì)已經(jīng)被改變?yōu)榫哂辛黧w特性的形式或者介質(zhì)。不混溶流體:“不混溶流體”是指不與容器中含有的一種或者多種液體相混合的流體。免疫測(cè)定:“免疫測(cè)定”是指涉及抗體-抗原的相互反應(yīng)的分析。獨(dú)立結(jié)合:術(shù)語(yǔ)“獨(dú)立結(jié)合”是指單獨(dú)地結(jié)合容器的不同腔室中的兩組或者多組物質(zhì)，其中物質(zhì)的分離結(jié)合彼此不接觸。間接連接:“間接連接”是指在兩個(gè)所指的腔室之間的連接中，存在有一個(gè)或者多個(gè)中間腔室?；ハ噙B接的:術(shù)語(yǔ)“互相連接的”是指流體地連接或者可連接的腔室，如可開(kāi)連接的情況。在...中間的:詞語(yǔ)“在...中間的”是指所指的腔室位于兩個(gè)其他標(biāo)識(shí)的腔室之間，并且在它們的同一線性路徑上；或者是所指的腔室在兩個(gè)各自其他標(biāo)識(shí)的腔室之間，而在它們的不同的線性路徑上。中間腔室:“中間腔室”是指這樣一種腔室，該腔室通過(guò)可開(kāi)連接而連接到至少兩個(gè)其他腔室。隔離的:“隔離的”是指樣品的一種或者多種組分與該樣品的一種或者多種其他組分相隔離。標(biāo)簽:“標(biāo)簽”是指具有可檢測(cè)的性質(zhì)的任何物質(zhì)。線性路徑:“線性路徑”是指連續(xù)排序的腔室的鄰接路徑，該連續(xù)排序的腔室通過(guò)多個(gè)可開(kāi)連接而相互連接，并且由首端室、末端室、以及位于首端室與末端室之間的一個(gè)或者多個(gè)中間腔室所限定。非圓形布置:術(shù)語(yǔ)“非圓形布置”是指這樣一種相互連接的腔室的布置，其包括兩個(gè)或者兩個(gè)以上的線性路徑，其中，線性路徑的端室相對(duì)于中間腔室不是圓形地布置。非線性:“非線性”是指這樣一種連續(xù)排序的腔室的至少兩個(gè)鄰接路徑，它們并非共用所有的腔室。非順序的:“非順序的”是指處理的某些步驟彼此獨(dú)立地執(zhí)行，而不是按順序執(zhí)行?；诤怂岬臄U(kuò)增:“基于核酸的擴(kuò)增”是指依賴(lài)于核酸的存在的擴(kuò)增反應(yīng)。寡核苷酸:“寡核苷酸”是指至少兩個(gè)化學(xué)亞基(通常在大約5個(gè)到大約100個(gè)之間)的聚合鏈，該每個(gè)化學(xué)亞基都包括核苷酸基部分、糖部分以及以線性立體構(gòu)型連接各亞基的鏈接部分。盡管本領(lǐng)域技術(shù)人員已知能夠氫鍵結(jié)合的其他罕見(jiàn)的或者改良的核苷酸基，但是常見(jiàn)的核苷酸基部分是鳥(niǎo)嘌呤(G)、腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)。寡核苷酸可以選擇性地包括任何糖部分、堿基部分和骨架成分的類(lèi)似物。本發(fā)明的寡核苷酸的尺寸范圍優(yōu)選從大約10到大約100殘基。寡核苷酸可以從天然存在源中純化，但是優(yōu)選是利用已知的不同酶法或者化學(xué)方法中的任何方法來(lái)合成?？砷_(kāi)連接:“可開(kāi)連接”是指能夠被臨時(shí)地或者永久地從“關(guān)閉”狀態(tài)改變到“打開(kāi)”狀態(tài)的通路，在該“關(guān)閉”狀態(tài)下，連接被屏障所封閉，而在該“打開(kāi)”狀態(tài)下，屏障被改變或者移動(dòng)，以便物質(zhì)能夠通過(guò)通道中的開(kāi)口。透光的:詞語(yǔ)“透光的”是指材料允許光通過(guò)，使得能夠通過(guò)位于材料的相對(duì)側(cè)上的光學(xué)設(shè)備檢測(cè)到在材料的一側(cè)上發(fā)出的光。引物:“引物”是指能夠以模板依賴(lài)的方式在存在聚合酶時(shí)在其3’-端被延伸的擴(kuò)增寡核苷酸。探針:“探針”是指一種結(jié)合劑，其粘合到分析物或者反應(yīng)混合物中的其他物質(zhì)以形成表示在處理的條件下樣品中的分析物的存在的可檢測(cè)的探針:靶復(fù)合物。對(duì)于基于核酸的反應(yīng)，該探針包括寡核苷酸，該寡核苷酸具有足以互補(bǔ)到表示目標(biāo)核酸的存在的核酸序列的堿基序列，以形成可檢測(cè)的探針:與其結(jié)合的靶。探針還可以包括非互補(bǔ)序列，諸如用于將探針固定在固相載體上的序列、啟動(dòng)子序列、用于RNA轉(zhuǎn)錄的結(jié)合位、限制性核酸內(nèi)切酶認(rèn)知位、或者授予希望的二級(jí)結(jié)構(gòu)或者三級(jí)結(jié)構(gòu)(諸如催化活性位或者發(fā)夾結(jié)構(gòu))的序列，其可以用于促進(jìn)檢測(cè)和/或擴(kuò)增。確定序列的探針可以通過(guò)本領(lǐng)域普通技術(shù)人員知曉的技術(shù)(例如化學(xué)合成)，以及通過(guò)來(lái)自重組體核酸分子的體外或者體內(nèi)表達(dá)來(lái)生產(chǎn)。處理:“處理”是指在物質(zhì)上或者利用該物質(zhì)執(zhí)行一系列的作用、變化或者運(yùn)行以產(chǎn)生結(jié)果。凈化:“凈化”是指將樣品的一種或者多中組分從樣品的一種或者多中其他組分中移除。試劑:“試劑”是指在處理中使用的任何非樣品物質(zhì)，包括化學(xué)反應(yīng)、生物化學(xué)反應(yīng)或者生物反應(yīng)中的反應(yīng)物、稀釋劑、溶劑、洗滌材料、漂洗材料、緩沖液等。實(shí)時(shí):詞語(yǔ)“實(shí)時(shí)”是指反應(yīng)被檢測(cè)為為正發(fā)生的反應(yīng)，或者是該反應(yīng)能夠被檢測(cè)為正發(fā)生的反應(yīng)的特性。容器:“容器”是指具有多個(gè)能夠容納和/或存儲(chǔ)物質(zhì)的相互連接的腔室的設(shè)備。恢復(fù)試劑(reconstitutionreagent)恢復(fù)試劑”是指用于將非流體處理材料改變?yōu)榱黧w或者流態(tài)的試劑。樣品:“樣品”是指能夠全部或者部分地進(jìn)行處理的物質(zhì)。樣品處理試劑:“樣品處理試劑”是指改變樣品的原始狀態(tài)或者可用于改變樣品的原始狀態(tài)的試劑。樣品容納室:“樣品容納室”是這樣一種容器的腔室，其是開(kāi)口的或者可以開(kāi)口以容納將要處理的樣品。密封:“密封”是指形成在相鄰腔室之間的屏障。所述密封例如是形成在對(duì)置的熱塑片之間的熱密封。目標(biāo)核酸:“目標(biāo)核酸”是指核酸分析物。目標(biāo)序列:“目標(biāo)序列”是指目標(biāo)核酸中含有的核酸序列或者在檢測(cè)分析中被擴(kuò)增和/或檢測(cè)到的其互補(bǔ)序列。水蒸氣傳輸率:“水蒸氣傳輸率”或“WVTR”是指在特定的溫度和相對(duì)濕度條件下，水蒸汽穿過(guò)材料的穩(wěn)態(tài)速率。水蒸氣傳輸率值以g/m2/24時(shí)來(lái)表達(dá)。明尼蘇達(dá)州的明尼阿波利斯的MOCON公司生產(chǎn)的一種PERMATRAN-WG)水蒸汽滲透儀(型號(hào)3/33)可以用于根據(jù)ASTMF1249來(lái)測(cè)量水蒸氣傳輸率。多腔容器根據(jù)本發(fā)明的容器包括多個(gè)相互連接的、非線性布置的腔室，排列以執(zhí)行一個(gè)或者多個(gè)處理。容器的精確尺寸將取決于腔室的數(shù)目和排列，以及要加載到或者移動(dòng)到腔室中的物質(zhì)的體積。優(yōu)選容器相對(duì)于其厚度具有相對(duì)較寬的表面尺寸，但這不是必須的。優(yōu)選容器由各自都是用剛性和/或柔性材料制成的頂部和底部部分形成。在優(yōu)選的方面，優(yōu)選的容器的頂部和底部的至少其中之一是至少部分柔性的。腔室的非線性布置允許容器中的樣品的非順序處理。腔室的精確數(shù)目、構(gòu)造、尺寸以及布置都依賴(lài)于要進(jìn)行的特定處理。與周?chē)娜萜鞯牟牧喜煌?，腔室可以用剛性或柔性材料或其組合來(lái)構(gòu)造。材料的選擇部分依賴(lài)于腔室是否必須屈服于外部壓力以使物質(zhì)在腔室之間運(yùn)動(dòng)。腔室可以是不與物質(zhì)在腔室之間的運(yùn)動(dòng)相干涉的任何形狀，其包括大致平的或者類(lèi)似泡狀的形狀，包括半球體或者球體的形狀。在優(yōu)選實(shí)施例中，各腔室是大體平的并且具有淚滴形狀，其通過(guò)打開(kāi)的連接通路將物質(zhì)經(jīng)漏斗注入相鄰腔室。淚滴狀的腔室還有益地將壓力集中在連接通路上，從而更容易的將諸如用于臨時(shí)封閉到相鄰腔室的入口的密封和閥門(mén)打開(kāi)。各腔室可以具有相同或者不同的形狀和/或尺寸。用于連接容器的各腔室通路例如可以是入口或者通道，該入口或者通道的尺寸設(shè)計(jì)為使得處理中使用的物質(zhì)能夠在腔室之間運(yùn)動(dòng)。在入口的情況下，密封或者其他屏障基本上可以是將相鄰的腔室隔開(kāi)的所有物體。另一方面，通道包括在腔室之間延伸的導(dǎo)管。優(yōu)選入口，因?yàn)樗鼈冊(cè)试S更小巧的容器設(shè)計(jì)并且要求材料在不同的腔室之間行進(jìn)更短的距離。一些通路可以在整個(gè)處理中都保持打開(kāi)，諸如引導(dǎo)至廢物室的通路，而其他的通路又被屏障封閉，直到希望物質(zhì)在各腔室之間運(yùn)動(dòng)為止。屏障可以選擇性地從“閉合”狀態(tài)改變到“打開(kāi)”狀態(tài)，以生成物質(zhì)轉(zhuǎn)移連接，該連接優(yōu)選是用于移動(dòng)流體或者流態(tài)化的物質(zhì)的流體轉(zhuǎn)移連接。屏障可以是外力，諸如通過(guò)夾持設(shè)備(例如，具有夾持墊的氣動(dòng)致動(dòng)器)提供的壓縮力；或者其可以是屈服于壓力的、機(jī)械操作的或者是例如通過(guò)熱、激光消融或者化學(xué)反應(yīng)或生化反應(yīng)而改變以在腔室之間提供開(kāi)口的密封或者閥門(mén)；或者其可以是外力/密封組合。在優(yōu)選的實(shí)施方式中，通路用諸如V形或者人字形密封的熱密封封閉，其在使用期間用壓縮力加固。盡管一些屏障的封閉特性被設(shè)計(jì)成受到諸如熱(例如，蠟塞)的條件影響，或者受到移動(dòng)到或者形成在腔室中的化學(xué)試劑影響，但是形成在或者定位在容器中的屏障不應(yīng)受到環(huán)境條件或者容納在腔室中的物質(zhì)的影響。一旦將相鄰腔室分離的屏障已經(jīng)移除或者改變?yōu)楫a(chǎn)生開(kāi)口，那么物質(zhì)可以通過(guò)諸如重力而推入、壓入、抽入或者移動(dòng)至相鄰腔室中。如果腔室通過(guò)例如滾子或者致動(dòng)器驅(qū)動(dòng)壓縮式防震墊的壓縮力來(lái)作用，以使物質(zhì)在腔室之間運(yùn)動(dòng)，那么腔室形成為具有至少一個(gè)屈服于壓縮力的壓力的柔性表面。否則，腔室可以由剛性材料構(gòu)造，如在用于將物質(zhì)推入或者拉入相鄰腔室中的襯墊或者真空情況下。重力將物質(zhì)從位于接受室之上的腔室抽出也是正確的，盡管在一些應(yīng)用中，希望兩個(gè)腔室都具有至少一個(gè)柔性表面，以便物質(zhì)能夠在腔室之間前后運(yùn)動(dòng)以混合該兩種物質(zhì)。各腔室設(shè)置在容器中，使得具有至少兩個(gè)不同的線性路徑。每個(gè)路徑都包括至少三個(gè)相鄰接的腔室，同時(shí)至少一個(gè)路徑優(yōu)選包括5個(gè)或者更多個(gè)相鄰接的腔室。在此，詞語(yǔ)“相鄰接的腔室”是指各腔室連續(xù)布置，同時(shí)一個(gè)腔室緊隨另一個(gè)腔的一系列直接連接的腔室。每個(gè)路徑可以與容器中的任何其他路徑公用至少一個(gè)但小于全部的腔室。腔室的這種布置使得能夠獨(dú)立地且/或同時(shí)地執(zhí)行處理的某些步驟。通過(guò)這種方式，可以將復(fù)雜處理中使用的物質(zhì)制備并且保持為互相分離，直到需要將它們組合為止。這種獨(dú)立的行為可以例如包括:溶解、稀釋、混合、組合或者反應(yīng)各物質(zhì)。僅為舉例的方式，一組相鄰腔室可以含有用于擴(kuò)增樣品中存在的目標(biāo)核酸序列的干燥的、含有引物的擴(kuò)增試劑，以及用于恢復(fù)擴(kuò)增試劑的試劑，而另一組相鄰腔室可以含有干燥的酶/探針試劑，用于擴(kuò)增并檢測(cè)目標(biāo)核酸序列以及用于恢復(fù)酶試劑的試劑。在這個(gè)具體實(shí)例中，如果擴(kuò)增和酶/探針試劑過(guò)早以其恢復(fù)形式結(jié)合，那么存在目標(biāo)獨(dú)立擴(kuò)增反應(yīng)可能與擴(kuò)增反應(yīng)用的目標(biāo)試劑或者消耗稀有試劑(consumescarcereagent)的擴(kuò)增反應(yīng)相干涉的風(fēng)險(xiǎn)。例如,參見(jiàn)Adams等人的“引導(dǎo)探針”(DecoyProbes)，美國(guó)專(zhuān)利N0.6，297，365。因此，在存在目標(biāo)核酸時(shí)需要分別恢復(fù)這些試劑，并且然后將它們組合。僅僅出于說(shuō)明的目的，圖1C示出了具有定義了多個(gè)不同線性路徑的非線性排列的腔室的容器10。該容器的一些可能的線性路徑用字母標(biāo)識(shí)區(qū)別，線性路徑的每個(gè)腔室都具有相同的字母標(biāo)識(shí)(即，A，B,C或D)，并且線性路徑的每個(gè)腔室都賦予不同的數(shù)字。路徑的布置使得能夠非順序地執(zhí)行處理的各步驟。例如，在隔離和凈化腔室A3中的分析物之前，樣品材料可以添加到腔室A2中并且與腔室Al提供的結(jié)合劑混合。同時(shí)或者不同時(shí)地，腔室B2中的第一干燥的或者固體的處理材料可以用腔室BI提供的第一恢復(fù)試劑(例如，第一溶劑)恢復(fù)。而且，同時(shí)或者不同時(shí)地，腔室B4中的第二干燥的或者固體的處理材料可以用腔室B5提供的第二恢復(fù)試劑(例如，第二溶劑)恢復(fù)。最后，凈化的分析物和恢復(fù)的第一和第二處理材料可以在腔室B3或者B4中結(jié)合，用于檢測(cè)該分析物。盡管在圖1C中僅僅示出了4個(gè)不同的線性路徑，但是很明顯也可以利用其它可能的線性路徑或者線性路徑的組合。容器中的非線性排列的各腔室有利于它們?cè)谔幚硗?lèi)或者不同類(lèi)的多處理中的應(yīng)用。這是因?yàn)樵撉皇夷軌虿贾贸墒沟迷诟魈幚碇g不是共用的物質(zhì)和/或腔室在處理期間保持被隔離。因此，本發(fā)明還涉及用于多種應(yīng)用的“萬(wàn)能”容器，其中可以設(shè)計(jì)并制造單個(gè)容器，包括處理材料的預(yù)載。通過(guò)這種方式，終端用戶無(wú)需具有對(duì)于每個(gè)要執(zhí)行的處理來(lái)說(shuō)不同的容器或者提前預(yù)測(cè)任何具體處理的體積要求。應(yīng)該選擇用于形成本發(fā)明的腔室和屏障的材料，以保持用于執(zhí)行處理的各種物質(zhì)的可接受的穩(wěn)定性以及反應(yīng)性水平。例如，該材料可以對(duì)改變的、變質(zhì)的或者或受濕氣影響的物質(zhì)提供濕氣屏障。在替換的或者補(bǔ)充的方法中，可用干燥的處理材料裝載諸如鈣氧化物的干燥劑，以使腔室中的濕氣的影響最小。當(dāng)在容器中執(zhí)行處理時(shí)，希望將干燥劑隔離，以防止其與涉及干燥處理材料的反應(yīng)相干涉，或者改變?cè)撋婕案稍锾幚聿牧系姆磻?yīng)。例如，可以通過(guò)將干燥劑放置于容納干燥處理材料的腔室的一部分中，或者將該干燥劑放置于具有與容納干燥處理材料的容器的開(kāi)口連接的相鄰腔室中，來(lái)隔離該干燥劑。希望在恢復(fù)干燥處理材料之后封閉該開(kāi)口連接，以防止不希望的與恢復(fù)的處理材料的反應(yīng)。然而另一種方法是將容器存儲(chǔ)在由提供濕氣屏障或者包括干燥劑的一種材料或者多種材料形成的器皿中。常用的干燥劑包括粘土、硅膠、鈣氧化物以及合成的分子篩。分子篩的一個(gè)實(shí)例是具有0.45”直徑以及0.125”高度的4A型分子篩多樣片劑，其中“4A型”是指孔徑是4埃(紐約，布法羅，Multisorb技術(shù)公司，產(chǎn)品N0.02-00674AH01)。類(lèi)似地，可以選擇容器材料以保護(hù)物質(zhì)免受暴露于氧氣或者電磁輻射的環(huán)境影響。或者，通過(guò)選擇提供抵御容器中欲使用的任何流體、固體或者氣體的傳輸?shù)钠琳系牟牧?，用于形成容器的材料可以選擇為保護(hù)存儲(chǔ)的物質(zhì)不會(huì)彼此發(fā)生不利的反應(yīng)。還希望在構(gòu)造容器時(shí)使用防止物質(zhì)蒸發(fā)的材料，以防止這些物質(zhì)的活性被改變。此外，選用的材料不應(yīng)該顯著的改變存儲(chǔ)的物質(zhì)的預(yù)期作用，也不應(yīng)該以顯著地影響其參與一種處理或者多種處理的能力的方式而附著于反應(yīng)物或者結(jié)合反應(yīng)物。在處理涉及的樣品操作需要在腔室中或者腔室之間集中或者移動(dòng)磁性顆粒時(shí)，至少一部分容器需要由基本不干擾由相鄰設(shè)置的磁體產(chǎn)生的磁場(chǎng)的影響的材料構(gòu)成。對(duì)于需要加熱和/或冷卻所有或者一些腔室的處理，或者連續(xù)地或者在精確的一段時(shí)期，容器必須能夠?qū)⒛芰哭D(zhuǎn)移到容器的至少一側(cè)上，所述容器能夠影響需要加熱和/或冷卻的腔室的內(nèi)含物的熱條件。此外，容器包括能夠傳送可見(jiàn)光、紅外光和/或紫外光譜的透光部分，以檢測(cè)樣品的諸如顏色或渾濁度的物理特征的變化，或者能夠檢測(cè)表示目標(biāo)分析物的存在的己O本發(fā)明的容器可以由諸如聚合物、玻璃、硅、金屬、陶瓷及其組合這樣的材料構(gòu)成。所選用的材料部分依賴(lài)于所選用的用于使物質(zhì)在腔室之間移動(dòng)的裝置，必須要觀察到樣品中是否存在物理變化或檢測(cè)到的光信號(hào)，以及控制容器中存在的物質(zhì)，諸如磁性顆粒。用于構(gòu)造容器的材料在期望的運(yùn)輸、儲(chǔ)存以及使用條件下應(yīng)該是穩(wěn)定的。這種條件包括溫度、壓力、濕度和存儲(chǔ)周期。而且用于形成容器的柔性腔室的材料應(yīng)該屈服于用于使物質(zhì)在腔室之間移動(dòng)的選定壓力，而不會(huì)撕裂、刺穿或者破裂。在優(yōu)選的實(shí)施例中，容器由相同或不同材料以及可以是多層的柔性頂板和底板形成。優(yōu)選每個(gè)板都具有至少一個(gè)防水層，并且優(yōu)選各板都具有相對(duì)一致的厚度，該厚度可以是大約0.05mm到2.0mm之間。而且，所述多層之一的選擇區(qū)域優(yōu)選是透光或者半透光的。各板可以例如由箔層和/或熱塑性材料形成，該箔層中具有一個(gè)或者多個(gè)孔以在需要時(shí)提供檢測(cè)窗，該熱塑性材料諸如聚丙烯(例如可從德克薩斯，達(dá)拉斯的Rexene公司買(mǎi)到的Reflex聚烯烴)、聚酯、聚乙烯(例如，聚對(duì)苯二甲酸乙二酯(“PET”)和聚萘二甲酸乙二醇酯“PAN”))、聚氯乙烯、聚偏二氯乙烯、聚碳酸酯樹(shù)脂(例如，聚氟乙烯膜)以及聚氨酯。在特別優(yōu)選的實(shí)施例中，頂板和底板都是多層的，其實(shí)例可以是粘合到Perflex箔層(Perfeceseal,Oshkosh,威斯康辛州，產(chǎn)品N0.35786上的ScotchpakE)薄膜層(3M公司，圣保羅，明尼蘇達(dá)州，分類(lèi)N0.ES-48)。用于形成本實(shí)施例的柔性板的其他適合的材料可以是本領(lǐng)域技術(shù)人員希望的材料。參見(jiàn)，例如，Burke(1992)WAAC簡(jiǎn)報(bào)14(2):13_17。示例性的層壓材料包括:用Surlyn混合剝離層涂覆PET的箔層(4.5mils);用復(fù)合擠出剝離層在低密度聚乙烯(“LPDE”)上涂覆PET的清晰(clear)雙AIOx(4.5mils)；用復(fù)合擠出剝離層涂覆LDPE的箔層(4.5mils);涂覆LDPE密封層的箔層(3.5mils);用剝離層在BiaxialOrientedPolyamide上涂覆PET的清晰單AIOx(4mils);用限定易碎密封的區(qū)域涂布在LDPE密封層上涂覆PET的清晰A10x(2.5mils);帶有剝離密封劑箔屏障(3.5mils);在LDPE密封層上涂覆PET的清晰AIOx(2.5mils);在LDPE密封層上涂覆PET的清晰AIOx(4mils);用HDPE密封層涂覆箔層的PET;用基于EVA的剝離層涂覆PET的清晰A10x(3mils);和用Surlyn混合剝離層涂覆PET的箔層(4.5mils);以及渾濁的聚乙烯對(duì)苯二酸鹽(“0PET”)、墨色、白色LDPE、鋁箔、聚乙烯(“PE”)、線性低密度聚乙烯(“LLDPE”)，以及尼龍和0ΡΕΤ、白PE、鋁箔、粘接劑和EZPeel密封劑的層壓材料。將在優(yōu)選容器中的頂部薄片和底部薄片的相對(duì)的內(nèi)部熱密封層粘合，以形成腔室的壁和利用本領(lǐng)域已知的熱密封技術(shù)將相鄰的各腔室隔開(kāi)的可開(kāi)密封(例如，人字形密封)。限定各腔室的壁的粘合的強(qiáng)度比隔開(kāi)各腔室的可開(kāi)密封的強(qiáng)度更大，以便當(dāng)壓力施加到各腔室的時(shí)候，迫使材料在各腔室之間而不是將各腔室的壁剝開(kāi)。用于腔室密封的目標(biāo)密封強(qiáng)度可以是大約9-10磅/英寸的級(jí)別，而用于可剝離密封的目標(biāo)密封強(qiáng)度是2.2-2.3磅/英寸的級(jí)別。更具體地說(shuō)，柔性的或者半剛性的容器，或者具有諸如腔室、通道的容器特征的袋狀物，永久和半永久(例如，可破裂的、可爆裂的、可撕裂的、易碎的等等)密封可以通過(guò)利用加熱絲、熱封模具、脈沖焊機(jī)或者超聲焊機(jī)或其他已知的技術(shù)而將兩個(gè)薄膜焊接在一起而形成?；蛘撸梢允褂媚軌蛐纬刹煌拿芊鈴?qiáng)度的結(jié)合的粘接劑或者其他粘合技術(shù)。為在本發(fā)明中執(zhí)行而構(gòu)造的容器優(yōu)選包括由永久內(nèi)膜結(jié)合所限定的腔室，該永久內(nèi)膜結(jié)合形成在腔室的外圍以避免撕裂該粘合或者該粘合的蠕變。將用于最初封閉使相鄰腔室互相連接的通道或者入口的半永久密封構(gòu)造且布置成，當(dāng)受到預(yù)定的、優(yōu)選是恒力以使得流體在相鄰各腔室之間互通的時(shí)候，其破裂或者爆裂。對(duì)腔室施加壓縮力使得腔室中含有的流體或者其他物質(zhì)在與所述力橫切的方向上水平擴(kuò)充。限定腔室的永久或者半永久內(nèi)膜結(jié)合優(yōu)選具有爆裂壓力或者密封強(qiáng)度，使得膨脹流體產(chǎn)生足以液動(dòng)撕裂或者破裂半永久密封的力，而不產(chǎn)生足以撕裂限定腔室的外周的剩余部分的永久粘合的力。已知在現(xiàn)有技術(shù)中，通過(guò)已知技術(shù)形成的密封或者粘合的爆裂壓力或者密封強(qiáng)度是多種因素的函數(shù)，包括:粘合在一起的材料的自然屬性、材料內(nèi)表面的溫度、施加到材料的壓力，以及在裝配的薄膜暴露在高溫和高壓下過(guò)程中的停頓時(shí)間或者時(shí)間段。在現(xiàn)有技術(shù)中已知用于形成這種具有不同密封強(qiáng)度的粘合的容器的方法?？梢栽贘ohson等人的“AnalyticalTestPackandProcessforAnalysis”中、美國(guó)專(zhuān)利No,3.476,515的第3欄第36行到第56行中、以及Freshour等人的“FlexiblePackagesContainingNonfusibleHighPeelStrengthHeatSeals”中、美國(guó)專(zhuān)利N0.3，496，061的第2欄第6行到第52行和第7欄第50行到第59行中、Farmer的“PackagingDevice”中、美國(guó)專(zhuān)利N0.5,131,760的第4欄第25行到第34行中、Robinson等人的“DiagnosticsInstrument”中、美國(guó)專(zhuān)利N0.5，374，395的第31欄第27行到第58行中，以及Rees等人的“MethodandApparatusforFormingHeatSealswithFilms，，中和美國(guó)專(zhuān)利N0.6，342，123中(公開(kāi)涉及用單個(gè)模具形成不同的密封)可以找到示例性的公開(kāi)。意想不到的是，發(fā)現(xiàn)了將設(shè)計(jì)成用于保存諸如干燥的處理材料的濕敏材料的腔室構(gòu)造成包括使得濕氣傳輸程度比容器的周?chē)糠指蟮膮^(qū)域是有利的。例如，上述的柔性容器的各薄板可以包括熱塑性材料和箔層，其中至少一個(gè)上述薄板包括在含有濕敏材料的各腔室周?chē)牟瓕又械那懈顖D案(cut-out)。(出于檢測(cè)或者其他目的，對(duì)于要求透光的腔室來(lái)說(shuō)也需要切割圖案)。為了保持濕敏材料干燥，將容器放置在密封的、含有干燥劑的器皿中，其中從保存濕敏材料的腔室中抽出濕氣并進(jìn)入到器皿中，在該器皿中濕氣被干燥劑吸收。含有干燥劑的器皿應(yīng)該由具有低的濕氣透氣率的材料構(gòu)造，諸如可以從特拉華州威爾明頓市的DupontPackagingandIndustrialPolymers獲得的Mylar0B12聚酯包裝薄膜。為了將容器放置儀器中，所述容器可以設(shè)有與儀器中的相應(yīng)安裝桿對(duì)齊的連接孔。或者，所述容器也可以使用鉤狀物、環(huán)狀物、粘接劑以及其他類(lèi)似的連接材料而精確定位在儀器中。其中所述儀器包括用于容納并且放置容器的狹槽，那些由柔性材料構(gòu)造的容器優(yōu)選通過(guò)剛性的框架在它們的外周附近支撐，以將這些容器精確地放置于儀器中。同樣預(yù)期在一些實(shí)施例中將不需要定位結(jié)構(gòu)。提供人和/或機(jī)器可以讀取或者可以識(shí)別的信息的一個(gè)或多個(gè)標(biāo)記或裝置可以被固定至或者連接于在不干涉樣品的處理的區(qū)域中的容器上。該標(biāo)記和/或裝置可以提供與樣品類(lèi)型或者來(lái)源和/或檢測(cè)方案或者要進(jìn)行的其他處理有關(guān)的信息。標(biāo)記上的標(biāo)注優(yōu)選包括可掃描的條形碼。這些標(biāo)記例如可以是能夠轉(zhuǎn)移到相關(guān)的表格或者文件上的可撕落的標(biāo)記?；蛘?，所述信息也可以印制在或者形成在用于構(gòu)造所述容器的材料上。容器中使用的材料所述腔室可以裝載有反試劑、化合物、組合物或者其他物質(zhì)，以用于單一處理、相同處理的多應(yīng)用、或者同類(lèi)或不同類(lèi)的多處理(例如，基于核酸的檢驗(yàn)和/或免疫測(cè)定)?？梢匝b載到腔室中的物質(zhì)的類(lèi)型包括液體、固體、氣體及其各種組合。對(duì)于一些處理，還希望使得容器內(nèi)的一個(gè)或者多個(gè)腔室在初始時(shí)是空的，以便它們可以用作例如樣品腔室、垃圾腔室、排泄腔室、混合腔室或者檢測(cè)腔室。具有能夠用于執(zhí)行任何多種不同過(guò)程的腔室的布置的容器，可以根據(jù)被裝載以執(zhí)行任何具體過(guò)程的處理材料的數(shù)目而具有額外的空的腔室。將被裝載并且在各腔室之間運(yùn)動(dòng)的液體包括水的或者非水的物質(zhì)、液體物質(zhì)的組合，諸如液體物質(zhì)和乳劑(具有或者沒(méi)有一種乳化劑或者多種乳化劑)的混合物，和液化物質(zhì)，諸如通過(guò)加熱而熔化的固體或者通過(guò)冷卻而冷凝的氣體。將被裝載并且在腔室之間運(yùn)動(dòng)的固體包括蠟劑、固體的混合物以及液體中的固體，諸如懸浮液(例如，膠體，包括凝膠)和漿液。固體可以是多種不同形式，包括其天然元素或者分子形式。液體、部分液體和/或固體物質(zhì)能夠被制備成使其被裝載到腔室中的時(shí)候處于干燥的或者改變的固體的形式。這種物質(zhì)可以是例如下述的產(chǎn)物，即，封裝；凍干；造粒；粉末化；片狀化；干燥；點(diǎn)樣，包括腔室內(nèi)相同或者不同物質(zhì)的點(diǎn)樣(spotting)(包括數(shù)組圖案中相同和/或不同物質(zhì)的多種斑點(diǎn))；顆粒、纖維、網(wǎng)或者網(wǎng)眼的形成，以及到載體上的吸收和/或干燥，包括腔室的內(nèi)表面。這些物質(zhì)可以提供這些優(yōu)點(diǎn)，例如提高穩(wěn)定性或耐用性；提高有效性；方便制造和處理；物質(zhì)的準(zhǔn)確量；保護(hù)免受環(huán)境或者其他壓力的影響，包括溫度、濕度、氧氣和電磁輻射；裝載到腔室的空間分離區(qū)；以及保護(hù)免于與容器內(nèi)的不同物質(zhì)過(guò)早或者不利地相互作用，包括在樣品與處理材料之間的非預(yù)期的相互作用。裝載到腔室中的固體可用于諸如過(guò)濾、固定、收集、干燥、檢測(cè)(例如探針試劑、層析、電泳等等)，以及擴(kuò)增(例如，擴(kuò)增寡核苷酸和酶試劑)的作用。固體在處理期間可以保持不被改變，或者其在初始處理之前或者之后被改變。改變的類(lèi)型可以包括溶解；形成懸浮液、漿液或膠體；熔融或者化學(xué)、生物化學(xué)或生物反應(yīng)?？梢岳缤ㄟ^(guò)與相鄰腔室中形成或者裝載的液體的相互作用、加熱、冷卻、輻射、聲處理和/或使腔室的固體經(jīng)受電流或者磁場(chǎng)作用而引起這些改變?？梢允褂萌斯さ?、半自動(dòng)化或者自動(dòng)化的方法將物質(zhì)裝載到容器中?？梢匝b載到容器中的具體處理材料包括:例如，干燥的和/或液體的試劑，包括粘結(jié)試劑(例如，核酸、抗體、抗原、受體和/或配體)和信號(hào)發(fā)生器、溶劑、稀釋液、懸浮液、溶液；包括清洗劑和漂洗劑，以及固體載體；包括顆粒、小珠，和過(guò)濾器。裝載可以通過(guò)諸如傾倒、移液、注入、點(diǎn)樣、抽取(例如，應(yīng)用真空或者注射器)、排空、交換空氣等等的方法來(lái)實(shí)現(xiàn)。將腔室中存在的空氣量保持為最小值是通常優(yōu)選的，并且為了再現(xiàn)性，在涉及為了相同的使用所準(zhǔn)備的容器中，在類(lèi)似的各腔室中的空氣/材料比率應(yīng)該保持為基本一致。當(dāng)將物質(zhì)裝載到柔性容器中的時(shí)候，該物質(zhì)優(yōu)選從容器的一個(gè)或者多個(gè)邊緣延伸的入孔裝載到將要裝載的腔室中。圖1B示出了將在下面更詳細(xì)描述的示例性容器10中的入口19、21、23、25、31、33、35。容器的相對(duì)側(cè)優(yōu)選通過(guò)抽吸而分離，以利于物質(zhì)的裝載并且控制液體物質(zhì)的芯吸在部分密封腔室的側(cè)邊上。優(yōu)選首先裝載干燥的或者固體的物質(zhì)，并且這樣裝載的腔室用黏性密封(tackseal)來(lái)臨時(shí)密封，這提供了足夠的液密密封以保護(hù)對(duì)濕氣的存在敏感或者由于濕氣的存在而改變的物質(zhì)。然后加載液體物質(zhì)，并且用熱密封來(lái)密封導(dǎo)向具有裝載物質(zhì)的腔室的所有開(kāi)口。在裝載期間，一些處理材料呈現(xiàn)出了芯吸到各腔室的側(cè)邊上端的強(qiáng)烈趨勢(shì)，在一些情況下，這些處理材料移動(dòng)到能夠改變這些材料的自然特性、濃度和/或其他處理材料的性質(zhì)的相鄰的各腔室中。通過(guò)舉例的方式，如果擴(kuò)增試劑和酶試劑過(guò)早地共混，那么將發(fā)生在將這些試劑與目標(biāo)核酸接觸之間就消耗一部分這些試劑的非故意的反應(yīng)。為了解決這個(gè)問(wèn)題，發(fā)現(xiàn)在裝載處理材料之前將油(例如，輕礦物油)供給到腔室可以大大減少芯吸效應(yīng)，并且改善了處理性能。而且，當(dāng)輕礦物油填充在各腔室中接近該各腔室的容積的時(shí)候，在密封或者封閉處理期間的任何材料損失都典型地局限于惰性的、不反應(yīng)的油，而不是活性的處理材料。此外，位于不耐熱處理材料(例如，酶試劑)之上的油層將使得處理材料與密閉容器所使用的高溫隔離。還發(fā)現(xiàn)了該油的使用具有其他的優(yōu)點(diǎn)。例如，如果處理材料含有易于沿著腔室的側(cè)邊或者各腔室之間的相鄰?fù)ǖ劳Ａ舻念w粒或者小珠(例如，磁響應(yīng)性顆粒)，那么該油的使用幫助了該顆?；蛘咝≈槌皇业闹行募小７駝t，將很難使該顆?；蛘咝≈槿繎腋?，或者該顆粒或者小珠可能會(huì)堵塞通道，從而防止或者干涉物質(zhì)在各腔室之間的運(yùn)動(dòng)。此夕卜，油可以用于增加腔室的液體量，否則當(dāng)對(duì)腔室施加壓力的時(shí)候，處理材料的量不足以完全地或者充分地打開(kāi)在相鄰?fù)ǖ乐械钠琳?。并且，由于油是惰性的，所以它不?huì)影響組合的處理材料的相對(duì)濃度。油的另一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是它妨礙了液體物質(zhì)從各腔室的蒸發(fā)。對(duì)于包括剛性部分的容器，可以通過(guò)諸如噴射、點(diǎn)樣，或?qū)⑽镔|(zhì)結(jié)合或者附著到腔的表面，或者通過(guò)傾倒或者移液的方式，將物質(zhì)提供到形成在該剛性部分中的槽洞中?；蛘撸梢酝ㄟ^(guò)諸如Luer連接、隔膜或者閥門(mén)的可再封開(kāi)口，將處理材料全部或者部分地提供到容器中。在后面的實(shí)施例中，可以在過(guò)程進(jìn)行的同時(shí)將物質(zhì)添加到容器中。除了樣品材料之外的所有物質(zhì)都優(yōu)選在為了使用而運(yùn)輸之前就提供到容器中，并且與環(huán)境隔絕。通過(guò)這樣做，用該容器執(zhí)行的處理更容易執(zhí)行，操作者錯(cuò)誤的機(jī)率最小并且容器或者相關(guān)處理材料被污染的風(fēng)險(xiǎn)更低。提前裝載的物質(zhì)必須以這樣的方式來(lái)提供并且保持在這種條件下，即，使得該物質(zhì)在使用之前保持穩(wěn)定。除此之外，這意味著用于構(gòu)造腔室的材料不能不利地影響裝載的物質(zhì)，從而改變其目的功能或者性能。類(lèi)似地，裝載的物質(zhì)不應(yīng)該實(shí)質(zhì)上影響存儲(chǔ)該裝載的物質(zhì)的腔室的功能或者性能?？梢杂帽景l(fā)明的容器檢驗(yàn)的樣品材料的類(lèi)型包括液體樣品和固體樣品二者?？梢杂萌萜鳈z驗(yàn)的液體樣品例如包括:尿液、血液、唾液、粘液、精液、羊水、腦脊髓液、滑液、培養(yǎng)液、液態(tài)化學(xué)品、壓縮氣體和水?？梢杂萌萜鳈z驗(yàn)的固體樣品例如包括:組織、糞便、土壤、植物、粉末、晶體、食物和濾紙。樣品材料能夠以原始的或者經(jīng)處理的形式提供到容器中。經(jīng)處理的樣品是已經(jīng)以任何方式改變，例如移除原始樣品的組分或者從材料的原始狀態(tài)來(lái)改變?cè)摬牧系囊环N樣品。例如，利用固體樣品，需要在將固體材料添加到樣品腔室之前或者之后來(lái)改變樣品，以便目標(biāo)分析物能夠自由地在容器的各腔室之間移動(dòng)。在改變的狀態(tài)下，固體樣品可以例如形成部分懸浮液、漿液或者勻漿，或者其可以是該固體樣品的液化或者溶解的形式。盡管可以在將樣品材料添加到容器之前開(kāi)始或者完成處理的一些步驟，但是樣品材料優(yōu)選在即將開(kāi)始處理之前通過(guò)入口引入到容器的一個(gè)或者多個(gè)樣品腔室。該入口可以是進(jìn)入開(kāi)口或者其可以例如包括=Luer連接的凹部，用于插入注射器或者具有凸Luer連接的其他物體。如果樣品材料在容器中是穩(wěn)定的，那么樣品材料可以不需要在即將使用前添加到容器中。對(duì)于容器的自動(dòng)化應(yīng)用，通常優(yōu)選手動(dòng)地或者用單獨(dú)的裝載設(shè)備來(lái)將樣品材料裝載到容器的樣品腔室或腔室中。如果樣品材料直接裝載到由相關(guān)儀器固定的容器中，那么將會(huì)增加攜帶在各容器之間的可能導(dǎo)致假陽(yáng)性或者變更結(jié)果的污染的機(jī)率。能夠使用或者適于使用本發(fā)明的柔性容器的一種這樣的裝載設(shè)備是FastPackSampleDispenser(Qualigen公司，卡爾斯巴德,加州)。對(duì)于一些應(yīng)用來(lái)說(shuō)，需要相對(duì)大量的樣品材料，以保證存在能夠檢測(cè)到的分析物的數(shù)量，如果該分析物在樣品中存在的話。本發(fā)明的容器可以設(shè)計(jì)成包括比隨后用于處理樣品的各腔室更大的樣品腔室。利用人工地或者自動(dòng)化地起動(dòng)壓力裝置，可以在臨近的一個(gè)腔室或者幾個(gè)腔室中順序處理樣品的等分試樣，以移除樣品的不希望的組分，以及減少在各腔室之間移動(dòng)的樣品的體積或者尺寸。所述不希望的組分可以轉(zhuǎn)移到容器中指定的廢物室中。將分析物從樣品的其他組分中分離通常涉及將分析物固定在腔室中；移除游離的材料；以及通過(guò)用清洗劑清洗該固定的分析物一次或者多次而進(jìn)一步凈化該固定的分析物。用于控制容器所含有的物質(zhì)的儀器本發(fā)明的容器優(yōu)選適于利用能夠?qū)θ萜鞯乃星皇一蛘卟糠智皇移鹱饔靡杂绊懭菁{其中的物質(zhì)的位置或者狀態(tài)的自動(dòng)化儀器來(lái)使用。上述作用可以包括在各腔室內(nèi)部或者之間移動(dòng)物質(zhì)；打開(kāi)和關(guān)閉各腔室之間的互連；加固各腔室之間的屏障；局部或者整體加熱或冷卻；以及篩選一個(gè)或者多個(gè)信號(hào)或者其他物理的、化學(xué)的、生化的或生物的事件，上述事件例如表示一種或者多種目標(biāo)分析物的存在、數(shù)量或狀態(tài)。這些作用的其他影響可以是混合、結(jié)合、溶解、恢復(fù)、懸浮、隔離、清洗或者漂洗處理的物質(zhì)，以控制干燥的或固體的物質(zhì)、移除廢物物質(zhì)、及/或減少諸如樣品物質(zhì)的物質(zhì)的用量、促進(jìn)容器中的處理?？梢允褂迷搩x器在單個(gè)容器中處理物質(zhì)，或者該儀器適于在多個(gè)容器中獨(dú)立地且以任何希望的順序(包括同時(shí)，即平行處理)來(lái)處理物質(zhì)。該容器，單獨(dú)地或者作為整個(gè)系統(tǒng)的一部分，優(yōu)選具有在執(zhí)行處理期間和/或已經(jīng)執(zhí)行處理之后收集數(shù)據(jù)、測(cè)定數(shù)據(jù)、和/或顯示數(shù)據(jù)的能力。該儀器的所有作用或者部分作用是通過(guò)控制器來(lái)操控的。將該儀器設(shè)計(jì)成與容器相協(xié)作，以使物質(zhì)在各腔室之中或者之間移動(dòng)。例如通過(guò)使用線性驅(qū)動(dòng)器或者滾子而將外部壓力或者外力施加到腔室的柔性表面或者表面，或者例如通過(guò)使用容納在活塞腔室中的活塞而施加內(nèi)部壓力，物質(zhì)可以在容器中移動(dòng)，該活塞腔室與所選腔室中含有的物質(zhì)空氣流通和/或液體流通?；蛘?，可以制造真空以抽取各腔室之間的物質(zhì)或者一個(gè)腔室的不同區(qū)域之間的物質(zhì)。磁場(chǎng)可以用來(lái)引導(dǎo)在各腔室之間或者之中的磁性物質(zhì)以及與其有關(guān)的物質(zhì)的移動(dòng)。用于使物質(zhì)在各腔室之間或者之中移動(dòng)的其他方法包括:離心力、重力、電力、毛細(xì)作用、對(duì)流、超聲處理、輻射等等。在具體的優(yōu)選實(shí)施例中，使用一個(gè)執(zhí)行器襯墊或者執(zhí)行器襯墊的組合來(lái)將物質(zhì)壓入到相鄰各腔室中或者將物質(zhì)在各腔室中移動(dòng)。利用執(zhí)行器的組合能夠促進(jìn)物質(zhì)到相鄰各腔室的連續(xù)運(yùn)動(dòng)或者物質(zhì)在一個(gè)腔室之中的混合。以?xún)?yōu)選的方式，可爆裂的熱密封中斷了容器的至少一部分相鄰各腔室之間的連接通道，并提供了阻礙物質(zhì)在腔室之間移動(dòng)的屏障。可以使用協(xié)作儀器的執(zhí)行器驅(qū)動(dòng)的壓縮式防震墊來(lái)將壓力施加到各腔室，從而將密封剝落(例如，爆裂)并且允許各腔室的一些或者所有物質(zhì)能夠進(jìn)入相鄰各腔室中。其中打開(kāi)的密封允許物質(zhì)雙向流動(dòng)，希望使用至少一個(gè)執(zhí)行器作為夾持設(shè)備來(lái)防止物質(zhì)的回流。該執(zhí)行器也可以用作防止密封過(guò)早打開(kāi)的夾子。作為一個(gè)實(shí)例，一個(gè)腔室可以直接連接到多個(gè)其他腔室。為了將物質(zhì)的流動(dòng)集中到一個(gè)希望的腔室中，通過(guò)使用作為夾子的執(zhí)行器將沒(méi)有使用的那些腔室密封，以加強(qiáng)與不希望的各腔室的互連的密封。當(dāng)沒(méi)有設(shè)置密封的時(shí)候，還可以使用執(zhí)行器控制物質(zhì)的流動(dòng)。在一個(gè)腔室或者多個(gè)腔室中的物質(zhì)可以通過(guò)各種主動(dòng)法和被動(dòng)法而在儀器中混合?；旌衔镔|(zhì)的“主動(dòng)”方法涉及施加諸如壓力的機(jī)械力，而混合物質(zhì)的“被動(dòng)”方法不涉及施加機(jī)械力，而是例如通過(guò)重力。在一種方法中，當(dāng)一個(gè)腔室的一種物質(zhì)移動(dòng)到第二腔室中并與第二腔室中的物質(zhì)接觸的時(shí)候，各物質(zhì)通過(guò)流動(dòng)力而混合。通過(guò)另一種方法，當(dāng)一種物質(zhì)被迫通過(guò)連接兩個(gè)腔室的通道的限制空間的時(shí)候，各物質(zhì)通過(guò)湍流而混合。或者，兩個(gè)腔室中的物質(zhì)可以通過(guò)迫使混合的物質(zhì)在該兩個(gè)腔室之間前后移動(dòng)而混合。還一種混合的方法涉及利用與一個(gè)腔室相鄰的多個(gè)執(zhí)行器來(lái)迫使混合的物質(zhì)在一個(gè)腔室的不同區(qū)域之間移動(dòng)。在本實(shí)施例的一個(gè)應(yīng)用中，執(zhí)行器是與相應(yīng)的環(huán)件滑動(dòng)接合的光檢測(cè)設(shè)備的可移動(dòng)光學(xué)元件(例如，熒光計(jì))，其中該光學(xué)元件和該環(huán)件與相關(guān)腔室的形狀大體一致并且以交替方式與該腔室接合，以實(shí)現(xiàn)混合。在另一種方法中，混合是通過(guò)迫使第一物質(zhì)從第一腔室向上進(jìn)入到第二腔室而執(zhí)行的，其中第一物質(zhì)與第二物質(zhì)混合，并且隨后在重力的協(xié)助下使得結(jié)合的物質(zhì)推回到第一腔室中。重復(fù)這個(gè)過(guò)程，直到達(dá)到了希望的混合程度。無(wú)論有沒(méi)有固體顆粒，混合的其他過(guò)程可以涉及例如，加熱和/或冷卻以產(chǎn)生對(duì)流混合或者超聲處理。該儀器和容器還可以協(xié)作以控制物質(zhì)的組分。例如，容器的一個(gè)或者多個(gè)腔室可以包括一個(gè)過(guò)濾器或者一系列過(guò)濾器，用于在該儀器主動(dòng)地或者被動(dòng)地使得物質(zhì)通過(guò)該過(guò)濾器時(shí)移除物質(zhì)的組分。從物質(zhì)移除的組分可以包括樣品材料的組分，該樣品材料能夠干涉用于處理樣品材料的處理或者固相載體，諸如小珠、顆粒、桿、纖維等等。這些固相載體例如可用于直接或者間接地結(jié)合分析物或者樣品的組分。在另一種方法中，該儀器可以適用于使得材料中的固相載體或者固體物質(zhì)通過(guò)在容器上施加離心力而集中在一個(gè)腔室中。在替換的方法中，腔室中存在的磁響應(yīng)性顆粒能夠由儀器的一個(gè)部件所施加的磁力來(lái)控制。通過(guò)將磁性顆粒隔離在特定的腔室中，結(jié)合到顆粒的物質(zhì)殘留在該腔室中，而未結(jié)合的物質(zhì)可以從該腔室移除。除了將希望的材料與不希望的材料分離之外，諸如小珠和顆粒的固相載體也可以使用在本發(fā)明的容器中，以利于減少樣品材料的體積。樣品材料的初始體積可以相對(duì)大一些，以確保具有足夠數(shù)量的用于檢測(cè)和/或量化的目標(biāo)分析物。然而，在一些情況下，這些初始體積對(duì)于容器中的樣品材料的實(shí)際處理來(lái)說(shuō)太大了。通過(guò)將分析物固定在例如在樣品容納室中的固相載體(例如，磁響應(yīng)性顆粒)上；隔離該腔室之中的固相載體(例如，將顆粒暴露于磁場(chǎng))；以及然后產(chǎn)生將樣品材料的殘余部分從樣品容納室移除并且在指定的廢物室中處理的力，根據(jù)本發(fā)明的儀器和容器能夠解決這個(gè)問(wèn)題?；蛘撸ㄟ^(guò)逐漸地移動(dòng)、隔離和分離地處理樣品材料的等分試樣，也可以在具有其容積比樣品容納室的容積小的容器的相鄰腔室中執(zhí)行該相同的過(guò)程。通過(guò)使得固相載體進(jìn)入更小的腔室中或者將固相載體移動(dòng)到更小的腔室中，樣品材料的處理可以更有效率，并且處理材料的消耗更低。為了凈化分析物，可以用清洗劑在指定的樣品處理室中一次或者多次清洗該固相載體。當(dāng)執(zhí)行清洗過(guò)程的時(shí)候，可以通過(guò)儀器施加一個(gè)力或者多個(gè)力，這使得固相載體保持隔離或者否則集中在樣品處理室中，或者這使的固相載體再次懸浮在清洗劑中。在清洗劑中再次懸浮固相載體可以由例如通過(guò)攪動(dòng)容器、清洗劑從清洗劑腔室到樣品處理室中的湍流運(yùn)動(dòng)這樣混合，或者利用壓力來(lái)混合樣品處理室所含有的物質(zhì)來(lái)完成。在合適的停留之間之后，可以將固相載體再一次隔離或者集中，并且將清洗劑從樣品處理室移動(dòng)到廢物室中?？梢愿鶕?jù)需要重復(fù)這個(gè)過(guò)程。該儀器可以包括用于控制一個(gè)或者多個(gè)腔室的熱狀態(tài)或者用于在該儀器內(nèi)提供均勻的溫度的元件。關(guān)于溫度控制能力，在選擇執(zhí)行具體處理中使用的熱控元件方面要考慮的因素包括:確定希望的溫度范圍；溫度變化率；溫度的準(zhǔn)確、精度和穩(wěn)定；是否需要分區(qū)加熱和/或冷卻或者均勻的溫度；以及外部條件的影響；還有儀器的生熱部件(例如，馬達(dá))。加熱和/或冷卻腔室或者腔室的子集可以利用熱控元件例如使用電的變化、輻射、微波、超聲、對(duì)流、傳導(dǎo)、強(qiáng)迫通風(fēng)、化學(xué)反應(yīng)(例如，放熱反應(yīng)和吸熱反應(yīng))、生物活性(例如，生熱生長(zhǎng))、循環(huán)液體(例如，加熱的水或者氟利昂)等等來(lái)完成，以改變一個(gè)腔室或者多個(gè)腔室的熱狀態(tài)?；蛘?，儀器可以放置于溫度可控的環(huán)境中，諸如保溫箱或冷凍箱，以保持均勻的溫度。優(yōu)選的儀器包括諸如銅或者鋁板的導(dǎo)熱板，當(dāng)將容器適當(dāng)?shù)匮b載列儀器中的時(shí)候，其與一批腔室或者一個(gè)特定腔室或者一個(gè)腔室的區(qū)域?qū)R。例如，能夠通過(guò)使用熱電設(shè)備來(lái)控制每個(gè)板的溫度。根據(jù)在熱電設(shè)備中的電流的方向，在該熱電設(shè)備中的不同導(dǎo)體的連接將或者吸熱或者放熱。因而，熱電設(shè)備能夠用于加熱和/或冷卻各腔室或者各腔室的區(qū)域。熱電設(shè)備的其他優(yōu)點(diǎn)包括它們的尺寸、沒(méi)有任何活動(dòng)部分或者振動(dòng)、快速溫度變化、精確的溫度控制以及沒(méi)有CFC或者運(yùn)動(dòng)液體。在實(shí)踐中，導(dǎo)熱板被定位在該儀器中，以使其大致臨近并且更優(yōu)選為接觸在適當(dāng)裝載的容器中的將要加熱或者冷卻的各腔室或者各腔室的區(qū)域。該板利用非導(dǎo)體材料而彼此分離，該非導(dǎo)體材料例如是Uletm聚酰亞胺熱塑樹(shù)脂或Delrin乙酰樹(shù)脂。利用熱電設(shè)備，通過(guò)傳導(dǎo)、對(duì)流或者輻射來(lái)傳熱。在替換的實(shí)施例中，所有或者部分熱控元件可以與對(duì)各腔室提供局部加熱或者冷卻的執(zhí)行器相聯(lián)。儀器優(yōu)選包括至少一個(gè)用于檢測(cè)信號(hào)或者其他物理、化學(xué)、生物化學(xué)或者生物事件的檢測(cè)器。該檢測(cè)器可以用于檢測(cè)一種或者多種分析物是否存在于樣品材料中，或者是否以改變的狀態(tài)存在。該檢測(cè)器與微處理器協(xié)作，還可以提供關(guān)于存在于樣品材料中的一種或者多種分析物的量的信息。本發(fā)明所考慮的檢測(cè)器包括熒光計(jì)、光度計(jì)、分光光度計(jì)、紅外檢測(cè)器以及電子耦合設(shè)備。上述類(lèi)型的檢測(cè)器中的每一個(gè)，或者與這些檢測(cè)器相關(guān)的信號(hào)接收部件都定位在用于檢測(cè)各種信號(hào)類(lèi)型的檢測(cè)腔室附近。檢測(cè)器可以安裝在可移動(dòng)的平臺(tái)上，以使得該檢測(cè)器能夠位于固定容器的不同腔室附近?；蛘撸梢詫⒍喾N檢測(cè)器可移動(dòng)地安裝在一平臺(tái)上，以有利于不同處理的不同檢測(cè)方法。該儀器還可以包括相同或者不同種類(lèi)的多個(gè)檢測(cè)器，用于檢測(cè)從不同腔室同時(shí)發(fā)出的信號(hào)。還可以使用光纖收集來(lái)自不同位置的信號(hào)，并且將該信息傳送到在從容器取出的固定位置處的一個(gè)或者多個(gè)檢測(cè)器。同樣可以預(yù)期的是將光纖設(shè)置與可移動(dòng)的檢測(cè)器結(jié)合。其他可能的檢測(cè)器可用于檢測(cè)，例如，放射性的、磁性的或者電子的標(biāo)記、拉曼散射、表面等離子共振、氣體、濁度，或者質(zhì)量、密度、溫度、電子的或者顏色變化。容器的使用本發(fā)明的容器可以單獨(dú)使用或者與協(xié)作的儀器相結(jié)合來(lái)使用，以執(zhí)行各種處理。該過(guò)程例如可以包括:將目標(biāo)分析物與樣品的其他組分分離或者隔離、將樣品或者樣品的組分暴露于需要分析樣品的試劑和條件，和/或進(jìn)行化學(xué)、生物化學(xué)或生物反應(yīng)，這些反應(yīng)引起可檢測(cè)到的變化，諸如在組成、序列、體積、數(shù)量、質(zhì)量、傳導(dǎo)性、濁度、顏色、溫度等方面的變化。如上所述，容器尤其適用于在需要或者得益于非順序執(zhí)行的反應(yīng)的應(yīng)用中。這些類(lèi)型的應(yīng)用包括但是不限于涉及可檢測(cè)到的結(jié)合相互作用的綜合檢驗(yàn)或分析，所述相互作用如抗原-抗體、核酸-核酸以及受體-配體相互作用。能夠在本發(fā)明的容器中執(zhí)行的基于分析物的核酸可以依賴(lài)于表示樣品中目標(biāo)核酸的存在的目標(biāo)核酸的直接檢測(cè)或者擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)。直接檢測(cè)需要樣品中的目標(biāo)核酸的數(shù)量足以靈敏地確定例如與基因表達(dá)、染色體異常或病原體有關(guān)的目標(biāo)序列的存在。由于在非病毒生物體中的核糖體RNA(rRNA)的細(xì)胞數(shù)量大，以及能夠系統(tǒng)地使得生物體的結(jié)合群彼此區(qū)分的序列保守性，所以rRNA是用于確定存在病原體(例如，細(xì)菌、真菌或酵母菌)的直接檢測(cè)測(cè)定的理想目標(biāo)。參見(jiàn)，例如，Kohne的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，288，611的“MethodforDetecting,Identifying,andQuantitatingOrganismsandViruses”；以及Hogan等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，840，488的“NucleicAcidProbesforDetectionand/orQuantitationofNon-ViralOrganisms”。無(wú)論目標(biāo)核酸是什么類(lèi)型,都能夠通過(guò)信號(hào)擴(kuò)增過(guò)程提高直接檢測(cè)分析的敏感度，在該信號(hào)擴(kuò)增過(guò)程中，結(jié)合到目標(biāo)核酸的探針或者復(fù)合探針具有多個(gè)用于檢測(cè)的標(biāo)記，從而增加了分析的信號(hào)，而不影響樣品中的目標(biāo)的數(shù)量。參見(jiàn)，例如，Hogan等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,424,413的“BranchedNucleicAcids”;Urdea等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，124，246的“NucleicAcidMultimersandAmplifiedNucleicAcidHybridizationAssaysUsingtheSame”。不需要增加目標(biāo)核酸序列的復(fù)制數(shù)量的擴(kuò)增的另一種形式是探針擴(kuò)增，其包括諸如連接酶鏈反應(yīng)(LCR)的過(guò)程。LCR取決于探針雜交和連接的重復(fù)循環(huán)來(lái)生成核酸序列的多個(gè)拷貝。例如，參見(jiàn)，Brikenmeyer等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，427，930的“AmplificationofTargetNucleicAcidUsingGapFillingLigaseChainReaction，，。其他考慮的信號(hào)擴(kuò)增過(guò)程包括利用ThirdWaveTechnology的Invader化學(xué)的那些過(guò)程。參見(jiàn)，例如，Kwiatkowski等人的“Clinical,Genetic,andPharmacogeneticApplicationsoftheInvaderAssay^Mo1.Diagn.(1999)4(4):353_64。目標(biāo)核酸擴(kuò)增涉及使用擴(kuò)增寡核苷酸(例如，引物)和聚合酶來(lái)酶促合成核酸擴(kuò)增產(chǎn)物(拷貝)，該核酸擴(kuò)增產(chǎn)物(拷貝)包含或者與要擴(kuò)增的模板核酸序列互補(bǔ)或者與要擴(kuò)增的模板核酸序列同源的序列。擴(kuò)增產(chǎn)物要么是延伸產(chǎn)物要么是在基于轉(zhuǎn)錄的擴(kuò)增過(guò)程中生成的轉(zhuǎn)錄。擴(kuò)增寡核苷酸可以提供在溶液中自由的反應(yīng)混合物，或者一種或者多種擴(kuò)增寡核苷酸可以固定在固相載體上，該固相載體包括容器中的一個(gè)或者多個(gè)腔室的內(nèi)表面。參見(jiàn)，例如，Adams等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，641，658的“AmplificationofNucleicAcidwithTwoPrimersBoundtoSingleSolidSupport”；以及Browne的美國(guó)專(zhuān)利N0.2005-0287591Al的“NucleicAcidAmplificationandDetectionMethod，，。本領(lǐng)域中實(shí)踐的核酸擴(kuò)增過(guò)程的實(shí)例包括聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)、鏈置換擴(kuò)增(SDA)、螺旋酶依賴(lài)擴(kuò)增(HAD)、循環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)，以及各種轉(zhuǎn)錄依賴(lài)的擴(kuò)增過(guò)程，包括:轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)擴(kuò)增(TMA)、核酸序列依賴(lài)的擴(kuò)增(NASBA)和自持序列復(fù)制(3SR)。參見(jiàn)，例如，Mullis的美國(guó)專(zhuān)^lJN0.4,683,195的“ProcessforAmplifying,Detecting,and/orCloningNucleicAcidSequences，，;Walker的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,455，166的“StrandDisplacementAmplification”；Kong等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.7，282，328的“HelicaseDependentAmplificationofNucleicAcids”,Notomi等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6,410,278的“ProcessforSynthesizingNucleicAcid”,Kacian等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,399,491的“NucleicAcidSequenceAmplificationMethod”；Becker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.7,374,885的“Single-PrimerNucleicAcidAmplificationMethod”;Malek等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，130，238的“EnhancedNucleicAcidAmplificationProcess，，;以及Lizaidi等人的(1988)BioTechnoIgy6:1197。利用一些過(guò)程，可檢測(cè)的擴(kuò)增產(chǎn)物的形成依賴(lài)于初始抗體/抗原相互作用。參見(jiàn)，例如，Cashman的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，849，478的“Blocked-PolymerasePolynucleotideImmunoassayMethodandKit”。當(dāng)樣品中存在的分析物(例如，目標(biāo)核酸、抗原、抗體)的量非常低的時(shí)候，核酸擴(kuò)增是尤其有益的。通過(guò)擴(kuò)增與分析物相關(guān)的目標(biāo)序列以及檢測(cè)合成的擴(kuò)增產(chǎn)物，可以大大地提高分析的靈敏度，因?yàn)樵诜治鲩_(kāi)始時(shí)要保證分析物的檢測(cè)所需要的分析物更少。目標(biāo)核酸擴(kuò)增反應(yīng)的條件可以是基本上等溫的，或者它們需要周期性的溫度變化，如同PCR熱循環(huán)那樣。前述的儀器可以提供恒定的溫度或者環(huán)境溫度，或者其可以被修正并調(diào)整為使儀器內(nèi)的總溫度波動(dòng)，或者，使儀器的影響容器的特定腔室的具體區(qū)域的總溫度波動(dòng)。目標(biāo)核酸擴(kuò)增反應(yīng)可以或者是“實(shí)時(shí)”測(cè)定或者是“端點(diǎn)”分析。下面將描述一種尤其適于在本發(fā)明的儀器中執(zhí)行實(shí)時(shí)分析所使用的緊湊的、輕量的、多通道的熒光計(jì)。實(shí)時(shí)擴(kuò)增分析涉及周期性的確定當(dāng)發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng)時(shí)目標(biāo)擴(kuò)增產(chǎn)物的量，從而使得更容易提供關(guān)于樣品中存在的分析物(例如，目標(biāo)核酸)的定量信息，然而端點(diǎn)擴(kuò)增在已經(jīng)發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng)之后才確定目標(biāo)擴(kuò)增產(chǎn)物的量，通常使得它們對(duì)于提供關(guān)于樣品中存在的分析物的定量信息是更有用處的。用于基于在擴(kuò)增反應(yīng)期間或者完成擴(kuò)增反應(yīng)時(shí)所收集的信號(hào)信息來(lái)計(jì)算樣品中初始存在的目標(biāo)核酸或者其他分析物的數(shù)量的算法包括這些公開(kāi)的方法:Witter等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6，232，079“PCRMethodforNucleicAcidQuantificationUtilizingSecondorThirdOrderRateConstants，，；Sanger等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6,691,041“MethodfortheEfficiency-CorrectedReal-TimeQuantificationofNucleicAcids”；McMillan等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6，911，327“MethodforQuantitativeAnalysisofaNucleicAcidAmplificationReaction”；Light等人的美國(guó)專(zhuān)利申請(qǐng)公開(kāi)N0.2006-0276972Al“MethodforDeterminingtheAmountofanAnalyteinaSample”;Chismar等人的美國(guó)專(zhuān)利申請(qǐng)公開(kāi)N0.2006-0292619A1“MethodandAlgorithmforQuantifyingPolynucleotides”；以及Ryder等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，710，029“MethodforDeterminingPre-AmplificationLevelsofaNucleicAcidTargetSequencefromPost-AmplificationLevelsofProduct”。而且為了確信擴(kuò)增條件和試劑對(duì)于擴(kuò)增是合適的，通常希望在開(kāi)始核酸擴(kuò)增反應(yīng)時(shí)提供內(nèi)部控制序列。參見(jiàn)，例如，Wang等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，476，774“QuantitationofNucleicAcidsUsingthePolymeraseChainReaction，，。目標(biāo)核酸的檢測(cè)可以在原位或者在體外。參見(jiàn)，例如，Gray等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，447，841“MethodforChromosome-SpecificStaining”。對(duì)于體外分析，需要溶解或者滲透細(xì)胞以首先釋放目標(biāo)核酸并且使其可以用于用檢測(cè)探針混合化。參見(jiàn)，例如，Clark等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,786,208“MethodforExtractingNucleicAcidsfromaWideRangeofOrganisms”。如果細(xì)胞被溶解,那么結(jié)果溶解產(chǎn)物所含有的物質(zhì)除了核酸之外還包括:細(xì)胞器、蛋白質(zhì)(包括諸如蛋白酶和核酸酶的酶)、碳水化合物，以及脂類(lèi)，這需要進(jìn)一步凈化核酸。此外，對(duì)于病原體來(lái)說(shuō)，生物體的化學(xué)失活或者熱失活是所希望的。可以在將樣品裝載到本發(fā)明的容器之前，或者在樣品或者容器的其他腔室用執(zhí)行該功能的化學(xué)劑預(yù)載之前，將這些細(xì)胞溶解或者滲透。細(xì)胞可以由通過(guò)本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的各種方法來(lái)溶解和滲透，包括化學(xué)方法、機(jī)械方法(例如，超聲)和/或熱方法。下面的實(shí)例部分描述了一種優(yōu)選的溶解劑。釋放的核酸可以在容器中與起到干擾目標(biāo)序列的檢測(cè)和/或擴(kuò)增的抑制劑的作用的其他樣品組分相隔離或者分離。潛在干擾組分的存在根據(jù)樣品種類(lèi)而變化，并且可以包括諸如能夠消化釋放的和目標(biāo)核酸的核酸酶的細(xì)胞溶解液的組分。通過(guò)將諸如濾器、小珠、纖維、膜、玻璃絲、濾紙、聚合物或凝膠的材料提供到腔室，一些不希望的樣品組分可以通過(guò)沉淀或者固相捕獲與目標(biāo)核酸分離。適合的濾器包括玻璃、玻璃纖維、尼龍、尼龍衍生物、纖維素、纖維素衍生物，和其他的聚合物?；蛘撸滔嗖牧峡梢杂糜诓东@用于溶解，例如，細(xì)胞、孢子或微生物的樣品組分，其中該組分可以通過(guò)物理保持(例如，尺寸排阻、親和保持或化學(xué)選擇)來(lái)捕獲?，F(xiàn)有技術(shù)中已知各種用于捕獲核酸的固相方法，并且可以便利地適于使用在本發(fā)明的容器中。上述方法對(duì)于目標(biāo)核酸可以是特異或者非特異性的。一種上述方法是固相可逆固定，其基于將核酸選擇性固定到具有涂布羧基的表面的磁性微粒子上。參見(jiàn)Hawkins的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,705,628“DNAPurificationandIsolationUsingMagneticParticles”。在另一種方法中，其上衍生有poly(dT)序列的磁性顆粒結(jié)合至具有5’poly(dA)尾和3’目標(biāo)粘合序列的捕獲探針。參見(jiàn),例如，Weisburg等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6,534,273^Two-StepHybridizationandCaptureofaPolynucleotide”。而另一個(gè)常用的方法是在存在胍鹽硫氰化物的情況下將核酸結(jié)合到二氧化硅或者玻璃顆粒，該胍鹽硫氰化物是一種已知的用于溶解細(xì)胞并失活核酸酶的化學(xué)劑。還有一種基于ChargeSwitch技術(shù)的方法，其是提供根據(jù)周?chē)彌_液的PH來(lái)充電的可切換的表面以促進(jìn)核酸凈化的磁性小珠依賴(lài)的技術(shù)(Invitrogen公司，卡爾斯班,加州；目錄序號(hào)CS12000)。在低PH的條件下，ChargeSwitch磁性小珠具有結(jié)合帶負(fù)電的核酸骨架的正電荷。沒(méi)有被結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他雜質(zhì)被沖走。通過(guò)將PH提升到8.5，表面上的電荷被中和，并且結(jié)合的核酸被洗脫。在另一種方法中，能夠結(jié)合到目標(biāo)核酸(或者結(jié)合到也結(jié)合于目標(biāo)核酸的中間寡核苷酸)的捕獲探針在容器的制造過(guò)程中共價(jià)地或者非共價(jià)地連接于指定的樣品處理室的內(nèi)表面。連接化學(xué)(attachmentchemistries)對(duì)本領(lǐng)域技術(shù)人員是已知的并且包括寡核苷酸和生物素標(biāo)記的寡核苷酸用于共價(jià)連接的胺和羧酸修飾表面，以及用于非共價(jià)連接的涂布抗生物素蛋白或抗生物素蛋白鏈菌素的表面。利用這種方法，引入到樣品處理室中的目標(biāo)核酸可以固定在腔室的表面上，并且能夠移除液體和其他未結(jié)合的材料而無(wú)需固定或者捕捉顆粒或者小珠。在與樣品中的其他材料分離之后，目標(biāo)核酸可以繼續(xù)固定在用于擴(kuò)增或檢測(cè)的表面上，或者該目標(biāo)核酸可以最先從捕捉探針洗脫?；蛘撸蹲教结樋梢怨潭ㄔ谖挥跇悠诽幚硎抑械闹T如海綿的多孔固相載體上。適于使用在本發(fā)明中的捕捉探針對(duì)于目標(biāo)核酸來(lái)說(shuō)可以是專(zhuān)門(mén)的或者非專(zhuān)門(mén)的。專(zhuān)門(mén)的捕捉探針包括目標(biāo)結(jié)合區(qū)，該目標(biāo)結(jié)合區(qū)被選擇為在一系列預(yù)定的條件下結(jié)合到目標(biāo)核酸上而不結(jié)合到樣品中存在的非目標(biāo)核酸上。非專(zhuān)門(mén)捕捉探針在使用的狀態(tài)下不會(huì)區(qū)分目標(biāo)核酸與非目標(biāo)核酸。擺動(dòng)捕捉探針是非專(zhuān)門(mén)捕捉探針的一個(gè)實(shí)例并且包括至少一個(gè)隨意的或者不隨意的聚乙烯⑷序列，其中“K”表示鳥(niǎo)嘌呤、胸腺嘧啶或者尿嘧啶堿基。參見(jiàn)Bechker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.11/832，367“MethodofNonspecificTargetCaptureofNucleicAcids”，其在此享有共同擁有權(quán)。除了與其嘧啶組分胞嘧啶氫結(jié)合之外，鳥(niǎo)嘌呤也與胸腺嘧啶和尿嘧啶氫結(jié)合。每個(gè)“K”還可以表示諸如肌苷或水粉蕈素的簡(jiǎn)并核苷、諸如3-硝基吡咯，5-硝基或4-甲茚酮的公共堿基，或者諸如dP或dK的嘧啶或嘌呤堿基同源物。擺動(dòng)捕捉探針的Poly(K)序列具有足夠的長(zhǎng)度以非專(zhuān)門(mén)地結(jié)合目標(biāo)核酸，并且堿基長(zhǎng)度優(yōu)選為6到25個(gè)堿基。用于檢測(cè)目標(biāo)核酸或者相關(guān)擴(kuò)增產(chǎn)物的形式可以分為為兩個(gè)基本范疇:異種的和同種的。這兩種范疇都適于使用在本發(fā)明的容器中。異種的分析包括將束縛的與未束縛的探針?lè)蛛x的步驟，而同種的分析中不使用這種物理分離步驟?，F(xiàn)有技術(shù)中已知很多的異種的和同種的分析。參見(jiàn)，例如，Jung,P等人1997年的“LabelsandDetectionFormatsinAmplificationAssays”，NucleicAcidAmplificationTechnologiesLEE,H等人，135-150,納提克馬，馬薩諸塞州:BioTechniqueBooks。利用物理分離步驟的分析方法包括在該分離處理中采用固相矩陣，諸如玻璃、礦物質(zhì)或者聚合材料。該分離可以?xún)?yōu)先地涉及將探針:分析物復(fù)合物結(jié)合到固相基質(zhì)，同時(shí)允許非伴生的探針?lè)肿颖３衷谝合?。這種結(jié)合可以是非專(zhuān)門(mén)的，例如，如羥磷灰石的那樣的情況，或者是專(zhuān)門(mén)的，例如，通過(guò)目標(biāo)核酸與直接或者間接固定在固相載體上的捕獲探針的序列特異的反應(yīng)。在任何上述的情況下，在清洗步驟之后仍舊結(jié)合到固相載體上的探針的數(shù)量與樣品中的分析物的數(shù)量成正比。或者，分析可以?xún)?yōu)先涉及結(jié)合非雜交探針，而探針:分析物復(fù)合物保留在液相中。在這種情況下，在清洗步驟之后在液相中的探針的數(shù)量與在初始樣品中的分析物的數(shù)量成正比。當(dāng)探針是核酸或者寡核苷酸的時(shí)候，固相載體可以包括但不限于:例如羥磷灰石的吸附劑、聚陽(yáng)離子部分、疏水的或者“反相”的材料、諸如DEAE的離子互換基質(zhì)、凝膠過(guò)濾基質(zhì)，或者一種或者多種上述固相材料的組合。固相載體可以包括一種或者多種寡核苷酸或者其他特定的結(jié)合部分，以直接或者間接地捕獲探針、目標(biāo)或者上述兩者。在諸如凝膠過(guò)濾、聚丙烯酰胺凝膠或者瓊脂糖凝膠的媒介的情況下，分離不是由于結(jié)合寡核苷酸引起的而是由不同尺寸或者形狀的分子的分子篩所引起的。在后兩種情況中，可以通過(guò)施加流經(jīng)凝膠的電流而使得通過(guò)不同尺寸或形狀的核酸的凝膠的遷徙不同來(lái)電泳驅(qū)動(dòng)分離，該不同尺寸或者形狀的核酸例如是雙鏈的或者單鏈的核酸。異質(zhì)的分析方法還可以涉及在添加可能含有目標(biāo)分析物的樣品之前將探針結(jié)合到固相基質(zhì)。在如果希望的核酸存在于樣品混合物中，則使得該希望的核酸被標(biāo)記的情況下，樣品可以與標(biāo)記相接觸?？梢匝苌蛘呒せ罟滔嗷|(zhì)，以便在探針和基質(zhì)之間形成共價(jià)鍵?；蛘撸结樋梢酝ㄟ^(guò)強(qiáng)共價(jià)反應(yīng)而結(jié)合到基質(zhì)，該強(qiáng)共價(jià)反應(yīng)包括但不限于下述反應(yīng):離子的、疏水的、反相的、免疫結(jié)合、螯合作用，以及酶作用物。在允許形成雜交的情況下，在基質(zhì)結(jié)合探針暴露于被標(biāo)記的核酸之后，通過(guò)清洗沒(méi)有任何結(jié)合、標(biāo)記的分析物的固相基質(zhì)來(lái)完成所述分離步驟。相反地，分析物可以結(jié)合到固相基質(zhì)并且與被標(biāo)記的探針接觸，同時(shí)在檢測(cè)到標(biāo)記之前將過(guò)剩自由探針從基質(zhì)清洗。如上所述，同質(zhì)分析發(fā)生在溶液中，而沒(méi)有固相分離步驟，并且通常利用在自由探針與探針:分析物復(fù)合物之間的化學(xué)差異。能夠用于同質(zhì)或者異質(zhì)形式的分析系統(tǒng)的一個(gè)實(shí)例是雜交保護(hù)分析(HPA)。參見(jiàn)Arnold等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,283,174的“HomogenousProtectionAssay”。在HPA中,探針鏈接到化學(xué)發(fā)光部分,與樣品接觸，然后在改變鏈接到雜交探針的化學(xué)發(fā)光劑而不改變鏈接到探針:分析復(fù)合物的化學(xué)發(fā)光劑的條件下，受到選擇性的化學(xué)降解或者可檢測(cè)到的穩(wěn)定性方面的變化作用?；瘜W(xué)發(fā)光劑反應(yīng)的后續(xù)引發(fā)使得雜交相關(guān)的標(biāo)記發(fā)光。其他的同質(zhì)分析依賴(lài)于檢測(cè)探針的物理變化或者擴(kuò)增引物，以提供表示目標(biāo)核酸的存在的可檢測(cè)到的信號(hào)變化。能夠經(jīng)受可檢測(cè)到的物理變化的探針和引物包括但不限于:自雜交探針，例如分子信標(biāo)或者分子噴燈；雙分子探針；可以從Applied生物實(shí)驗(yàn)室買(mǎi)到的TaqMan探針；可以從InveitiOgen公司買(mǎi)到的Lux引物；以及信號(hào)引物。參見(jiàn)，例如，Tyagi等人的1996年的NatureBiotechnology14(3):303-308;Becker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6，849，412的“MolecularTorches”；Morrison的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，928，862白勺“CompetitiveHomogeneousAssay,”；Tapp等人的2000年的BioTechniques28(4):732-738；Nazarenko的2006年的MethodsMol.Biol.335:95-114;以及Nazarenko的1997年的NucleicAcidsRes.25(12):2516_2521。當(dāng)與目標(biāo)核酸雜交時(shí)，上述探針和引物中的每一個(gè)都依賴(lài)于探針或者引物中的構(gòu)象變化，以將可檢測(cè)到的變化(例如，熒光分子)提供在相關(guān)報(bào)告部分中。在雜交之前，來(lái)自報(bào)告部分的信號(hào)可能由相關(guān)的猝滅部分(quenchermoiety)而改變，在Lux的情況下，該相關(guān)的熄滅部分是位于引物序列的3’端附近的基因(guinine)。在實(shí)時(shí)擴(kuò)增反應(yīng)中使用的尤為優(yōu)選的檢測(cè)探針是自雜交探針，其根據(jù)探針維持自雜交好事結(jié)合到擴(kuò)增產(chǎn)物來(lái)發(fā)射不同的檢測(cè)信號(hào)。探針可以提供到在溶液中游離的或者固定在固相載體上的反應(yīng)混合物。參見(jiàn)，例如，Cass等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6，312，906的“ImmobilizedNucleicAcidHybridizationReagentandMethod”。有益地，也可以在擴(kuò)增反應(yīng)已經(jīng)開(kāi)始之前、之后或者同時(shí)將它們提供到反應(yīng)混合物。如果將探針提供在固相載體上，那么固相載體可以附加地包括一種或者多種用于擴(kuò)增目標(biāo)核酸序列的固定的擴(kuò)增寡核苷酸。優(yōu)選的自雜交探針包括分子信標(biāo)和分子噴燈。分子信標(biāo)包括具有互補(bǔ)序列的核酸分子或其同源物、在沒(méi)有目標(biāo)核酸序列時(shí)將探針保持在封閉構(gòu)象的親和對(duì)(或者核酸或者核酸同源臂或者莖)，以及當(dāng)探針處于封閉構(gòu)象時(shí)互相作用的標(biāo)記對(duì)。參見(jiàn)，Tyagi等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，925，517的“DetectablyLabeledDuaIConformationOligonucleotideProbe,AssaysandKits，，。目標(biāo)核酸和目標(biāo)互補(bǔ)序列的雜交將親和對(duì)的成分分離，從而將探針移至開(kāi)放構(gòu)象。由于標(biāo)記對(duì)的還原反應(yīng)，該移至開(kāi)放構(gòu)象的移動(dòng)是可檢測(cè)到的，該標(biāo)記對(duì)例如可以是氟苯酚和熄滅劑(例如DABCYL和EDANS)。分子噴燈具有自互補(bǔ)的不同區(qū)域，描述為“目標(biāo)結(jié)合”和“目標(biāo)閉合”功能域。這些功能域由連接的區(qū)域相鏈接并且足以互補(bǔ)以在預(yù)定的雜交分析條件下彼此雜交。當(dāng)暴露于變性條件下的時(shí)候，互補(bǔ)區(qū)域熔化，使得當(dāng)預(yù)定的雜交分析條件復(fù)原的時(shí)候能夠利用目標(biāo)結(jié)合功能域來(lái)雜交到目標(biāo)序列。并且當(dāng)暴露于鏈置換條件時(shí)，一部分目標(biāo)序列結(jié)合到目標(biāo)結(jié)合功能域，從而從目標(biāo)結(jié)合功能域置換目標(biāo)閉合功能域。分子噴燈設(shè)計(jì)成使得目標(biāo)結(jié)合功能域喜歡在目標(biāo)閉合功能域上雜交到目標(biāo)序列。分子噴燈的目標(biāo)結(jié)合功能域和目標(biāo)閉合功能域包括互相作用的標(biāo)記，該標(biāo)記定位成使得當(dāng)分子噴燈自雜交的時(shí)候與雜交到目標(biāo)核酸的時(shí)候相比產(chǎn)生一差分信號(hào)，從而在存在具有與其相關(guān)的一種或多種存活標(biāo)記的未雜交探針的情況下，能夠檢驗(yàn)樣品中檢測(cè)探針:目標(biāo)復(fù)合物。不同類(lèi)型的相互作用分子可以用于判定探針是否已經(jīng)經(jīng)受構(gòu)象變化。例如，相互作用分子可以是發(fā)光/熄滅劑對(duì)、發(fā)光/加合對(duì)、F5rrester能量轉(zhuǎn)換對(duì)或者染料二聚體。在顆粒分子上存在一種以上的標(biāo)記。發(fā)光/熄滅劑對(duì)由一種或者多種發(fā)光部分以及一種或多種熄滅劑構(gòu)成，該發(fā)光部分例如是化學(xué)發(fā)光或者熒光部分。優(yōu)選地，熒光/熄滅劑對(duì)用于檢測(cè)已經(jīng)受到構(gòu)象變化的探針。熒光部分吸收特定波長(zhǎng)或者波長(zhǎng)范圍的光，并且發(fā)射具有特定發(fā)射波長(zhǎng)或者波長(zhǎng)范圍的光。熄滅劑部分部分地或者全部地抑制從激發(fā)的熒光分子發(fā)射的信號(hào)。熄滅劑部分可以抑制來(lái)自不同熒光團(tuán)的信號(hào)產(chǎn)物。例如，DABCLY([4-(4’-二甲基對(duì)胺基偶氮苯)苯甲酸])可以熄滅大約95%的從EDANS(5-(2’-氨乙基)aminoaphthaline-1-磺酸)，突光紅和熒光素得到的信號(hào)。可以使用不同數(shù)量和種類(lèi)的熒光劑和抑制劑部分。例如，可以使用多種熒光劑部分來(lái)增加來(lái)自打開(kāi)的分子信標(biāo)或噴燈的信號(hào)產(chǎn)物，并且在存在目標(biāo)序列時(shí)，可以使用多種抑制劑部分來(lái)幫助確保激發(fā)的熒光分子不產(chǎn)生信號(hào)或產(chǎn)生極少的信號(hào)。熒光團(tuán)的實(shí)例包括吖啶、熒光素、磺酰羅丹明101、熒光紅、EDANS、德克薩斯紅、曙紅、氟硼熒和熒光黃。例如，參見(jiàn)，Tyagi等人的(1998)NatureBiotechnologyl6:49_53。抑制劑的實(shí)例包括DABCYL、鉈、銫、以及P-二甲苯-二-溴化吡啶鎗。發(fā)光/加合對(duì)由一種或者多中發(fā)光部分和一種或者多種能夠與發(fā)光部分形成加合以從而減少來(lái)自發(fā)光分子的信號(hào)產(chǎn)物的分子所構(gòu)成。Becker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,731,148“AdductProtectionAssay”中公開(kāi)了利用加合形成以使用在溶液中游離的配位體來(lái)改變來(lái)自發(fā)光分子的信號(hào)。FSrrester能量轉(zhuǎn)換對(duì)由兩部分構(gòu)成，其中第一部分的發(fā)射頻譜與第二部分的激發(fā)頻譜重疊。第一部分能夠被激發(fā)，并且第二部分的發(fā)射特性能夠被測(cè)量以判定該兩部分是否互相反應(yīng)。FGrrester能量轉(zhuǎn)換對(duì)的實(shí)例包括涉及突光素和突光紅、硝基苯_2_氧雜-1，3-二唑和熒光紅、熒光素和四甲基羅丹明、熒光素和熒光素、IAEDANS和熒光素，以及B0DIPYFL和B10DPYFL的各對(duì)。染料二聚體包括兩種染料，與染料不處于二聚體構(gòu)象時(shí)相比，該兩種燃料在形成二聚體的時(shí)候互相反應(yīng)以產(chǎn)生一差分信號(hào)。參見(jiàn)，例如，Packard等人的(1996)ProcNatl.Acad.Sc1.美國(guó)93:11640_11645。盡管通常優(yōu)選同種分析，但是實(shí)際上可以結(jié)合本發(fā)明的容器使用任何能夠用于監(jiān)控特定核酸雜交的標(biāo)記和檢測(cè)系統(tǒng)。一系列有用的標(biāo)記包括順從電子檢測(cè)方法的放射性同位素示蹤、嵌入染料、酶、半抗原、鏈接寡核苷酸、化學(xué)發(fā)光分子和氧化還原部分。優(yōu)選的化學(xué)發(fā)光分子包括在Arnold等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,283,174的“HomogeneousProtectionAssay”中公開(kāi)的與雜交保護(hù)分析(HPA)聯(lián)合使用的那種吖唳酯，以及在Woodhead等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，656，207的“DetectingorQuantifyingMultipleAnalytesUsingLabelingTechniques”中公開(kāi)的與用于分析單一反應(yīng)中的多個(gè)目標(biāo)的數(shù)量的分析相結(jié)合使用的那種口丫唳酯。Meade等人的美國(guó)專(zhuān)利No5,591，578的“NucleicAcidMediatedElectronTransfer”和Meade的美國(guó)專(zhuān)利N0.6，013，170的“DetectionofAnalytesUsingReorganizationEnergy”公開(kāi)了優(yōu)選的電子標(biāo)記和檢測(cè)方法。用作標(biāo)記的氧化還原部分包括諸如Cd、Mg、Cu、Co、Pd、Zn、Fe和Ru的過(guò)渡金屬元素。將報(bào)告部分結(jié)合到核酸以及檢測(cè)報(bào)告部分的合成技術(shù)和方法在現(xiàn)有技術(shù)中是熟知的。參見(jiàn)，例如，J.SAMBR00L等人的M0LECULARCL0NING:ALAN0RAT0RYMANUAL第十章(第二輯1989)；Becker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6，361，945；Tyagi等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,925,517,Tyagi等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6,150,097的“NucleicAcidDetectionProbesHavingNon-FRETFluorescenceQuenchingandKitsandAssaysIncludingSuchProbes”;Nelson等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，658，737;Woodhead等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，656，207；Hogan等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，547，842的“NucleicAcidProbesforDetectionand/orQuantitationofNon-ViralOrganism”;Arnold等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,283,174；Kourilsky等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.4，581，333的“MethodofDetectingandCharacterizingaNucleicAcidorReactantfortheApplicationofthisMethod”；以及Meeker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，731，148。處理材料可以以干燥的或者液體的形式供給到容器的各腔室。在處理材料的液體形式是不穩(wěn)定的、生物或者化學(xué)活性的、溫度敏感或者彼此化學(xué)反應(yīng)的情況下，以干燥形式供給的處理材料可以尤其有益的。干燥抑制了微生物和酶的活性，并且能夠提升自身壽命和處理材料的存儲(chǔ)條件(與冷儲(chǔ)存相對(duì)的室溫)。除了其活性成分之外，多數(shù)干燥的處理材料包括冷凍保護(hù)劑(例如，諸如鹿糖、麥芽糖、乳糖或者海藻糖的二糖類(lèi))以幫助保護(hù)當(dāng)材料被冷凍、干燥和/或恢復(fù)時(shí)的生物活性；以及穩(wěn)定劑(例如，包括蔗糖和海藻糖的各種糖類(lèi)、糖乙醇和蛋白質(zhì))以防止或者延遲材料的生物活性隨著時(shí)間的推移而流失。任何給定的冷凍保護(hù)劑或者穩(wěn)定劑的穩(wěn)定性依賴(lài)于要干燥的材料的天然性質(zhì)。在干燥之后，應(yīng)該將處理材料密封以防止吸收潮氣。用于干燥處理材料的方法和裝置在現(xiàn)有技術(shù)中是熟知的，并且包括凍干法或冷凍干燥。參見(jiàn)，例如，Price等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.3，862，302的“PellletizedPregnancyTestReagents”；Temple等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.4，655，047的“ProcessforFreezingorChilling”；Milankov等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.4,982,577的“CryogenicApparatus”；Shen等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5,834,254的“StabilizedEnzymeCompositionsforNucleicAcidAmplification，，；Buhl等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.6,251,684的“DriedChemicalCompositions”；以及McMillan等人的美國(guó)專(zhuān)利申請(qǐng)公開(kāi)N0.US2006-0068398的“UniversalandTargetSpecificReagentBeadsforNucleicAcidAmplification，，。示例性實(shí)施例體現(xiàn)本發(fā)明各方面的多腔容器的示例性實(shí)施例通過(guò)圖1A中的附圖標(biāo)記10表示。在本實(shí)施例中，容器10是具有制成的柔性頂板和底板的大致平面器皿，該柔性頂板和底板由諸如箔和/或塑料的薄的柔性材料；以及上緣12和下緣14形成，其表示在使用時(shí)容器的優(yōu)選方向并且定義上方和下方。示例性容器10具有大約3.2英寸乘大約7.5英寸的尺寸，并且厚度不超過(guò)大約1/4英寸(當(dāng)用樣品和處理材料填滿的時(shí)候)，但是也可以是適于手動(dòng)操作或者適用于自動(dòng)系統(tǒng)的任何尺寸，例如其中所描述的一種。總的來(lái)說(shuō)，容器的尺寸必須能夠容納需要進(jìn)行一種處理或者進(jìn)行一系列處理的物質(zhì)。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該了解到多種尺寸、構(gòu)造、形狀等都與各種處理相兼容并且考慮使用。該容器可以包括一個(gè)或者多個(gè)與自動(dòng)化儀器的諸如鉤或銷(xiāo)的結(jié)構(gòu)相配合的連接孔或者對(duì)齊孔74，用于相對(duì)于該儀器安裝和/或?qū)ζ湓撊萜?。用于識(shí)別樣品、患者或者可選地包括檢驗(yàn)條件和參數(shù)的任何其他目標(biāo)信息的一個(gè)或者多個(gè)標(biāo)記可以設(shè)置在容器表面上或者陷入到用于構(gòu)造該容器的材料中。這些標(biāo)記可以包括人可讀、機(jī)器可讀(例如，條形碼)、光學(xué)字符標(biāo)識(shí)(OCR)、射頻標(biāo)識(shí)(RFID)，或者某些組合。參考圖1A，容器10包括形成整體系統(tǒng)的一部分的多個(gè)腔室，其中各腔室共同地限定了用選擇性的可開(kāi)連接區(qū)隔的多個(gè)非線性路徑。入口52和頸部51用作用于容納樣品材料或者用于處理、檢驗(yàn)或者經(jīng)受反應(yīng)的其他材料的通路，并且其還可以具有適于樣品材料或其他材料進(jìn)入的任何合適的結(jié)構(gòu)。樣品材料可以通過(guò)任何合適的裝置來(lái)運(yùn)送至容器10，例如，通過(guò)使用具有戳穿該入口52的針頭的注射器。入口52可選擇地包括Luer連接的凹部或者在容器的頂部的未密封的開(kāi)口，該凹部用于插入注射器或者具有凸Luer連接的其它貯存器，通過(guò)該開(kāi)口而倒入、移液或者插入樣品材料。入口52優(yōu)選位于容器10的上緣12處或位于該上緣附近，以減少樣品材料在轉(zhuǎn)移時(shí)或者在將容器移至自動(dòng)儀器之前溢出的風(fēng)險(xiǎn)。然而，入口52也可以位于容器10的任意邊緣處或者如果方便的話可以位于更中心的位置，例如作為隨意可逆密封的狹槽或者其他開(kāi)口，其任選可逆地被密封。例如，在容納樣品材料之后，入口可以通過(guò)熱封容器10的相對(duì)薄板而封閉。示出的容器10的一體的腔室系統(tǒng)包括七個(gè)腔室C16、C18、C20、C22、C24、C26、C28、C30、C32、C34和C36。各腔室通常是與一個(gè)或者多個(gè)相鄰腔室(可選地、臨時(shí)地或者永久地)連接以允許物質(zhì)在至少一部分相鄰腔室之間以及在該一體系統(tǒng)的各腔室之間流動(dòng)的封閉的零部件。每個(gè)腔室都包含用于在容器10中執(zhí)行處理的物質(zhì)，例如樣品材料、用于制備用于進(jìn)一步分析的樣品處理試劑、反應(yīng)物、溶劑、溶液、清洗劑等。此外，通過(guò)手動(dòng)操作或者與儀器的各元件相配合，各容器可以作用為用來(lái)執(zhí)行一種或者多種處理步驟，諸如分析凈化過(guò)程、混合、加熱/冷卻、信號(hào)或可視特征(例如，顏色變化)的檢測(cè)、廢物存儲(chǔ)和移除等等的場(chǎng)所。當(dāng)容器10放置于儀器內(nèi)的時(shí)候，一些腔室可以用例如樣品、反應(yīng)試劑、緩沖液等的物質(zhì)來(lái)預(yù)載，而其他腔室最初為空，但是，當(dāng)執(zhí)行處理的時(shí)候，一種或者多種物質(zhì)可以移動(dòng)進(jìn)入或者通過(guò)該最初為空的腔室。在容器10的示例性使用中，各腔室可以填滿需要執(zhí)行例如免疫分析或者核酸依賴(lài)的反應(yīng)的結(jié)合反應(yīng)所需要的物質(zhì)。在容器10的該應(yīng)用中，腔室C16可以用樣品材料裝載，腔室C18可以用用于將樣品材料中存在的分析物結(jié)合或者固定在固相載體上的樣品處理試劑裝載，腔室C26可以用作為用于將固定的分析物與樣品材料中的其他組分分離的樣品處理室，腔室C22可以用干燥的第一處理材料裝載，腔室C20可以用用于恢復(fù)該第一處理材料的試劑裝載，腔室C28可以用于燥的第二處理試劑裝載，腔室C30可以用用于恢復(fù)該第二處理試劑的試劑裝載，腔室C34可以用清洗劑裝載，并且腔室C36可以用作為當(dāng)執(zhí)行處理的時(shí)候廢棄物移入其中的廢物腔室，并且其中這些廢棄物與處理的其他方面相對(duì)隔離的存儲(chǔ)。除了包含第二處理材料之外，腔室C28還可以用作為檢測(cè)腔室，用于檢測(cè)反應(yīng)混合物中表示樣品材料中分析物的存在的信號(hào)或者變化。在容器10的替換的實(shí)施中，腔室C32可以含有用于恢復(fù)腔室C30中含有的干燥的第二處理材料，然后用于恢復(fù)腔室C28中含有的干燥的第三處理材料的試劑?；蛘?，干燥的第二處理材料可以裝載到腔室C30中，并且用于恢復(fù)第二處理材料的試劑可以裝載到腔室C32中，其中第一和第二處理材料的恢復(fù)形態(tài)可以與腔室C28中的分離的分析物相結(jié)合。容器10的其他非限制性使用將在本發(fā)明的實(shí)例部分描述。在示出的實(shí)施例中，腔室C34尤其設(shè)計(jì)成含有清洗劑并且包括上部38、下頸部40、豎直部分42和朝著腔室C26延伸的水平部分44。而且，在容器10的示出的實(shí)施例中，腔室C36有益地構(gòu)造成作為用于容納來(lái)自腔室C26的廢棄物的廢物腔室，并且包括從腔室C26延伸的初始水平入口48、上頸部46以及收集區(qū)域50。豎直部分48位于腔室C26上方并且通過(guò)位于腔室C26頂部處的入口70而連接于腔室C26。當(dāng)在腔室C26中執(zhí)行諸如磁分離過(guò)程的分析物分離過(guò)程時(shí)，通過(guò)例如反應(yīng)混合物中存在的洗滌劑(例如設(shè)置到樣品的洗滌依賴(lài)的溶解劑，或者樣品處理試劑中存在洗滌劑)氣泡可能形成在腔室C26中或者移入腔室C26中。如在圖1A中所示的，容器10的各腔室如下互相連接:腔室C18通過(guò)入口54連接于腔室C16;腔室C16通過(guò)入口62連接于腔室C26;腔室C20通過(guò)入口56連接于腔室C22；腔室C22通過(guò)入口58連接于腔室C26;腔室C24通過(guò)入口60連接于腔室C24;腔室C32通過(guò)入口68連接于腔室C30;腔室C30通過(guò)入口66連接于腔室C28;腔室C28通過(guò)入口64連接于腔室C26;腔室C34通過(guò)入口72分離地連接于腔室C26;并且，如上所述，腔室C26通過(guò)入口70連接于腔室C36。在一些實(shí)施例中，一個(gè)或者多個(gè)開(kāi)口54、56、58、60、62、64、66、68、70和72臨時(shí)封閉，以防止液體由于例如熱密封的可開(kāi)連接而在流經(jīng)該開(kāi)口，當(dāng)對(duì)連接的腔室施加壓力的時(shí)候該可開(kāi)連接的開(kāi)口剝落。在圖1A的實(shí)施例中，容器10的腔室C16構(gòu)造成保持合適的樣品用量。通常地，樣品可以是液體或者液體化的樣品，例如從人類(lèi)或者其他動(dòng)物體提取的液體樣品，可以包括血液或者血液產(chǎn)物(例如，血漿或血清)、腦脊髓液、結(jié)膜樣品、呼吸樣品、鼻咽樣品或者泌尿生殖道樣品，或者該樣品也可以是，例如，環(huán)境的、工業(yè)的、食物的、飲料或者水的樣品。固體或者黏性樣品材料(例如，食物、糞便物和痰)，在將該樣品材料添加到腔室C16之前，通常需要至少部分溶解(但是也可以直接在容器中溶解該樣品)。樣品材料可以是有機(jī)的或者無(wú)機(jī)的，并且其可以是很難關(guān)于處理或者分析的材料，或者是化學(xué)、生物化學(xué)或者生物反應(yīng)中的反應(yīng)物。腔室C16的容積優(yōu)選從大約IOyL到大約lmL，更優(yōu)選的達(dá)到850μL，最優(yōu)選的大約625μL。該容積傾向于容納希望放置到樣品C16中的物質(zhì)的總量，在此描述的示例性應(yīng)用中，其包括與來(lái)自腔室C18的樣品處理試劑相結(jié)合樣品材料的用量。在最優(yōu)選的用量，其可以是與125μL樣品處理試劑相結(jié)合的500μL樣品。在希望的用量范圍的下限處，需要在對(duì)腔室C16施加壓力的時(shí)候有足夠的液體在腔室C16中以迫使在入口62處的密封打開(kāi)。在希望的容積范圍的上限處，放置于腔室C16中的用量不能太大，而使得容器撐大或者使得腔室的壁剝落或者破裂。入口54將腔室C18連接到腔室C16，并且通過(guò)選擇性的可開(kāi)密封而臨時(shí)封閉。在通過(guò)壓力施加機(jī)構(gòu)對(duì)腔室C18施加足夠的壓縮力的時(shí)候，密封封閉開(kāi)口54打開(kāi)，并且樣品處理試劑從腔室C18移動(dòng)到腔室C16并且在此與設(shè)置到腔室C16的樣品材料相混合，壓力施加機(jī)構(gòu)的實(shí)例將在下面描述。樣品處理試劑優(yōu)選包括粘接劑和固相載體，諸如用于固定分析物的磁響應(yīng)顆粒。第一處理材料容納在腔室C22中，并且用于第一處理材料的恢復(fù)試劑容納在腔室C20中。在一個(gè)實(shí)施例中，第一處理試劑是擴(kuò)增試劑。干燥的或者固體的擴(kuò)增試劑是優(yōu)選的，因?yàn)樗鼈儽纫后w擴(kuò)增試劑更加穩(wěn)定。擴(kuò)增試劑的穩(wěn)定載體包括任何化學(xué)惰性的或者相容的材料，并且可選擇地包括，例如，溶劑、粘接劑、潤(rùn)滑劑、助溶劑、防腐劑等等。在一個(gè)實(shí)施例中，擴(kuò)增試劑被冷凍成液體，以形成大小一致的團(tuán)粒，該大小一致的團(tuán)粒隨后被凍干，用于以單位劑量應(yīng)用。固體形式的擴(kuò)增試劑也可以壓縮成團(tuán)粒或者片，但是也可以是粉末、細(xì)粒的形式或者其他方便且穩(wěn)定的固體形式。干燥的擴(kuò)增試劑也是優(yōu)選的，因?yàn)榕c用液體試劑相比，用干燥的試劑發(fā)生突然斷裂的幾率小，并且固體材料可以以非常精確的劑量來(lái)提供。如果第一處理材料是擴(kuò)增試劑，那么擴(kuò)增試劑可以包含至少一種擴(kuò)增低聚核酸，例如引物、啟動(dòng)子引物和/或不可延伸的啟動(dòng)子提供者寡核苷酸；三磷核苷酸；以及合適的緩沖劑中的輔助因子，例如鎂離子。擴(kuò)增試劑的具體組分依賴(lài)于將要操作的擴(kuò)增過(guò)程。用于執(zhí)行轉(zhuǎn)錄依賴(lài)的反應(yīng)的示例性擴(kuò)增試劑將在本發(fā)明的實(shí)例部分描述。在一些實(shí)施例中，使得腔室C20為空，或者如果第一處理材料被省略時(shí)一起省略，或者以液體形式提供在腔室C22中?；蛘撸梢允沟们皇褻22為空或者將液體裝載到腔室C20中。在通過(guò)將在下面描述的壓力施加機(jī)構(gòu)將足夠的壓縮力施加到腔室C20中的時(shí)候，密封閉合入口56打開(kāi)，并且腔室C20中含有的恢復(fù)試劑移至腔室C22中含有的第一處理材料。在其中沒(méi)有設(shè)置恢復(fù)試劑的各實(shí)施例中(例如，腔室C20為空或者在示出的容器10中被省略)，第一處理材料可以是在裝載到腔室C22中之前預(yù)溶解的液體或者固體。如果第一處理材料是擴(kuò)增試劑，那么擴(kuò)增寡核苷酸優(yōu)選以及其過(guò)剩的形式存在。這些和其他試劑的合適的數(shù)量可以通過(guò)有經(jīng)驗(yàn)的技術(shù)人員確定，并且將依賴(lài)于分析參數(shù)以及將檢測(cè)到的目標(biāo)的數(shù)量和類(lèi)型。在恢復(fù)試劑從腔室C20移至腔室C22之后，壓力施加機(jī)構(gòu)將外部壓力施加于腔室C22，將在腔室C22與腔室C26之間的密封閉合入口58打開(kāi)，從而使得恢復(fù)形式的第一處理材料從腔室C22流動(dòng)到腔室C26。在一些實(shí)施例中，例如通過(guò)在將恢復(fù)形式的第一處理材料移至腔室C26之前，將在腔室C20與腔室C22之間的結(jié)合材料移動(dòng)多次，將腔室C20和腔室C22含有的物質(zhì)相混合。如果使用漂洗的話，遵循清洗步驟，并且傾向于將清洗劑中存在的可能干涉分析物的處理的物質(zhì)移除。漂洗劑容納在腔室C24中，并且優(yōu)選包括含水的緩沖溶液，該緩沖溶解包含清潔劑或者類(lèi)似功能的材料。漂洗劑可以是第一處理材料的恢復(fù)形式(例如，沒(méi)有三磷核苷酸的擴(kuò)增試劑)。或者，漂洗劑可以是不含有清潔劑、負(fù)離子清潔劑、比清洗劑的濃度低的負(fù)離子清潔劑，或者與清洗劑中存在負(fù)離子清潔劑的作用相抵消的負(fù)離子清洗劑。在優(yōu)選的實(shí)施例中，腔室C24中含有的漂洗劑的用量從大約150μL到大約500μL。在適當(dāng)?shù)臅r(shí)刻，壓力施加機(jī)構(gòu)將壓力施加在腔室C24上，并且產(chǎn)生將封閉腔室C24與腔室C26之間的入口60的密封打開(kāi)的液體壓力，使得漂洗劑能夠在腔室C24與腔室C26之間流動(dòng)。腔室C30含有用于恢復(fù)第二處理材料的試劑。在優(yōu)選的實(shí)施例中，腔室C30中含有的恢復(fù)試劑的用量從大約20μL到大約125μL，并且更優(yōu)選的從25μL到100μLo如果容器用于核酸依賴(lài)的擴(kuò)增反應(yīng)，那么第二處理材料可能還有一種或者多種酶，諸如用于實(shí)現(xiàn)目標(biāo)序列的延伸和/或轉(zhuǎn)錄的聚合酶，以及可選地，具體地并且可檢測(cè)地結(jié)合到含有目標(biāo)序列或其目標(biāo)序列的補(bǔ)充物的探針。用于固體酶和/探針試劑的合適載體包括任何化學(xué)惰性的或者相容的材料，并且可選擇地包括，例如，溶劑、粘接劑、潤(rùn)滑劑、助溶劑、防腐劑等等。該酶和/或探針試劑可以被冷凍成低溫液體，以形成大小一致的團(tuán)粒，該大小一致的團(tuán)粒隨后被凍干，用于以單位劑量應(yīng)用。固體形式的酶和探針試劑也可以利用合適的載體而被壓縮成團(tuán)?；蛘咂?，以便于處理，但是也可以是粉末、細(xì)粒的形式或者其他方便且穩(wěn)定的固體形式。該兩種固體組合物也可以制成單獨(dú)的團(tuán)?；蚧蠟閱为?dú)的固體形式。此外，干燥的探針試劑可以例如以團(tuán)?；蛘呒?xì)粒的形式裝載到諸如腔室C28的腔室中，或者其可是噴濺、印染或者作用在腔室的壁上。在恢復(fù)干燥的處理材料中，發(fā)現(xiàn)恢復(fù)試劑具有沿著腔室(例如限定腔室壁的熱密封區(qū)域)的周界集中的趨勢(shì)，使得更集中地位于腔室局部的干燥處理材料不溶或不完全溶解。為克服該問(wèn)題，本發(fā)明發(fā)明人發(fā)現(xiàn)，通過(guò)提供含有恢復(fù)試劑的輕油，例如礦物油(如硅油)，它們能夠?qū)⒒謴?fù)試劑導(dǎo)向腔室的中心，從而改善了干燥處理材料的恢復(fù)。還發(fā)現(xiàn)所述油具有“刮板”效果，其中油基本上掠過(guò)腔室的壁，從而使得全部或基本上全部的待移除物質(zhì)均進(jìn)入相鄰的腔室。這一點(diǎn)在對(duì)處理材料的量或濃度變化敏感的單位劑量應(yīng)用中是特別關(guān)鍵的。還發(fā)現(xiàn)通過(guò)集中了腔室中心附近的水性物質(zhì)，這與刮板效果一起確保了更多被混合的物質(zhì)在腔室之間轉(zhuǎn)移，所述油有利于更好地混合物質(zhì)。油的一個(gè)另外的好處是其涂覆能力，這防止或干擾了物質(zhì)粘在腔室的表面上。作為油的替代物，可以使用具有類(lèi)似優(yōu)點(diǎn)的其他惰性不混溶的液體。這里需要注意的是，由于各腔室的非直線排列，體現(xiàn)本發(fā)明各方面的容器10的優(yōu)點(diǎn)在于以非序列性的方式來(lái)恢復(fù)處理材料的能力。也就是說(shuō)，在恢復(fù)第二處理材料之前，對(duì)于第一處理材料來(lái)說(shuō)不必完全恢復(fù)。第一處理材料可以在腔室C22中恢復(fù)，而第二處理材料可以在任何需要的時(shí)刻或者便于執(zhí)行處理的時(shí)刻，包括同時(shí)在地腔室C28中恢復(fù)。壓力施加機(jī)構(gòu)將壓力物理施加于腔室C30上，以產(chǎn)生將腔室C30與腔室C28之間的密封閉合入口66打開(kāi)的液體壓力，使得液體能夠在各腔室之間流動(dòng)，并且將來(lái)自腔室C30的恢復(fù)試劑移至腔室C28，以溶解腔室C28中含有的第二處理材料。如果腔室C28中含有的處理材料已經(jīng)是液體形式，例如，如果酶試劑和檢測(cè)探針以液體形式制備或者在將它們裝載到容器中之前被恢復(fù)，那么腔室C30是空的。對(duì)于某些液體處理材料來(lái)說(shuō)，希望包括諸如TRITONX-100(辛基苯酚聚(乙二醇醚)n)的清潔劑，以防止處理材料的各組分粘貼到腔室的壁上。此外，如果以液體或者恢復(fù)形式提供的處理材料對(duì)于電磁輻射敏感，那么保持這些處理材料的腔室(例如，腔室C28)可以利用光屏蔽材料構(gòu)造。通常希望并且需要實(shí)現(xiàn)從一個(gè)腔室移動(dòng)到相鄰腔室的各物質(zhì)之間的混合。例如，當(dāng)將恢復(fù)試劑從腔室C30移動(dòng)到腔室C28，以恢復(fù)腔室C28中含有的干燥的處理試劑的時(shí)候，希望混合該恢復(fù)試劑和該干燥的處理試劑。在示例的實(shí)施例中，腔室C30和腔室C28關(guān)于彼此定位和定向，以促進(jìn)這兩個(gè)腔室的結(jié)合物的重力協(xié)助的混合。利用重力協(xié)助的混合，壓力機(jī)械用于迫使物質(zhì)(例如，恢復(fù)試劑)從下面的腔室例如(例如，腔室C30)到上面的腔室(例如，腔室C28)。重力協(xié)助的混合通常依賴(lài)于至少一種下面的機(jī)構(gòu):(I)當(dāng)迫使物質(zhì)通過(guò)連接相鄰設(shè)置的上下腔室(或者通過(guò)限制區(qū)連接的一個(gè)腔室的上下區(qū)域)的相對(duì)較窄的通道時(shí)產(chǎn)生湍流，其中在上下腔室(或者一個(gè)腔室的上下區(qū)域)二者中的物質(zhì)包含液體；(2)結(jié)合的液體圍繞上面的腔室的外周的運(yùn)動(dòng)；(3)物質(zhì)通過(guò)連接上下腔室的通道的重力運(yùn)動(dòng)。重力協(xié)助的混合的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)在于，壓力機(jī)械不是必須與上面的腔室(或一個(gè)腔室的上面的區(qū)域)相關(guān)聯(lián)。腔室C34含有清洗劑，該清洗劑用于將不想要的材料從在腔室C26中執(zhí)行的樣品處理過(guò)程移除。在優(yōu)選實(shí)施例中的腔室C34中含有的清洗劑的用量是從大約400μL到大約5000μL，并且最優(yōu)選的是從大約700到大約2000μL。壓力施加機(jī)械對(duì)腔室C34的所選部分加壓，從而產(chǎn)生了能夠打開(kāi)密封閉合入口72的液體壓力，并且迫使清洗劑進(jìn)入樣品處理室的腔室C26中。如上所述，腔室C34包括上部38、下頸部40、豎直部分42以及朝著腔室C26延伸的水平部分C44。由于腔室C34的排列，認(rèn)為重力協(xié)助通過(guò)下頸部40從上部38移動(dòng)清洗劑。在一些實(shí)施例中，該儀器可以包括被動(dòng)裝置，諸如位于上部38附近的海綿或者其他可壓縮體，以將連續(xù)的且相對(duì)溫和的壓力施加于上部，以進(jìn)一步協(xié)助迫使物質(zhì)朝向下頸部40。從下頸部，壓力機(jī)械用于迫使清洗劑，通常一次一部分，通過(guò)豎直和水平部分42、44并且然后通過(guò)入口72進(jìn)入腔室C26，該壓力機(jī)械的實(shí)例將在下面描述。另一種壓力機(jī)械位于下頸部40處，以用作為用于選擇性地停止清洗劑的進(jìn)一步運(yùn)動(dòng)的夾具。當(dāng)用于廢物收集的時(shí)候，腔室C36在執(zhí)行過(guò)程之前是空的，并且設(shè)計(jì)成含有過(guò)程所需要的總的廢物材料用量，例如包括:含有樣品材料、清洗劑、洗滌劑和其他消耗的處理材料(例如，反應(yīng)物)的廢物材料?？偟膩?lái)說(shuō)，當(dāng)腔室C36用作為廢物室的時(shí)候，其優(yōu)選容量是大約2mL。如上所述，入口70連接腔室C26和腔室C26，并且具有相對(duì)于腔室C26在上部的定向。發(fā)現(xiàn)這種定向是有益的，因?yàn)樵诜蛛x過(guò)程期間可能由于存在清潔劑依賴(lài)的溶液而在腔室C26中可能形成的氣泡將自然地趨于上升，并且聚集在靠近腔室C26的頂部的入口70附近。于是，含有氣泡的廢物材料更容易且有效地移至腔室C36中，并且因此，幾乎不可能干擾隨后的信號(hào)檢測(cè)步驟。臨近腔室C26的頂部的入口70的位置也有助于當(dāng)廢物材料在樣品處理過(guò)程期間被移除時(shí)來(lái)留存腔室C26中的固相載體顆粒，尤其涉及使用磁響應(yīng)性顆粒的固相載體顆粒。如在下面更詳細(xì)的討論的，在優(yōu)選的樣品處理過(guò)程期間，當(dāng)將磁場(chǎng)施加到腔室C26所含有的物質(zhì)時(shí)，用于結(jié)合分析物的磁響應(yīng)性顆粒被固定。在樣品處理期間形成在腔室C26中的氣泡將趨于在腔室C26的頂部附近匯集，并且當(dāng)廢物材料從腔室C26移動(dòng)到腔室C36時(shí)，將通常不與位于更中心的磁響應(yīng)性顆粒相接觸。如果在樣品處理室與廢物室之間的連接不是在樣品處理室的頂部處，那么當(dāng)將廢物材料從樣品處理室移動(dòng)到廢物室中的時(shí)候，至少一些氣泡將殘留在樣品處理室中。此外，至少一些形成的氣泡將很可能經(jīng)過(guò)固定的顆粒，并且可能給予足夠強(qiáng)以移去一些顆粒的力，從而使得一些顆粒與廢物材料一起被移至廢物室中。從而通過(guò)在示例的容器10中的各腔室的設(shè)計(jì)而提升了處理的靈敏度和再現(xiàn)性，因?yàn)樵诜蛛x過(guò)程期間固相載體顆粒更可留存在指定的樣品處理室中。在采用容器10的示例性實(shí)施例中，腔室C26(樣品處理室)連接于六個(gè)腔室，包括腔室C16(樣品腔室)、腔室C22(第一樣品材料腔室)、腔室C24(洗滌劑腔室)、腔室C28(第二處理材料腔室)、腔室C34(清洗劑腔室)，以及腔室C36(廢物腔室)。在容器中執(zhí)行分析或者其他處理之前，腔室C26可以是空的。當(dāng)將腔室10放置于自動(dòng)化儀器(下面描述)中的時(shí)候，腔室C26定向成使得可移除的磁場(chǎng)能夠施加于腔室C26的區(qū)域。在一個(gè)實(shí)施例中，通過(guò)將永磁體移動(dòng)到臨近腔室C26的位置的致動(dòng)器來(lái)施加磁場(chǎng)。合適的磁體是那些每個(gè)具有大約4.0lbs的保持力的那些磁體，諸如那可可以從堪薩斯州，紐頓的BuntingMagnets公司買(mǎi)到的如分類(lèi)號(hào)為N50P250250的那些磁體。在本實(shí)施例的優(yōu)選方面，當(dāng)將容器放置到自動(dòng)化儀器中的時(shí)候，磁體通過(guò)磁激發(fā)機(jī)構(gòu)(將在下面詳細(xì)描述)移動(dòng)到沿著容器的平面中。磁體將磁場(chǎng)施加到腔室C26，并且當(dāng)施加該磁場(chǎng)時(shí)，腔室26含有的物質(zhì)具有足夠的強(qiáng)度將磁性顆粒留存在腔室C26中。如在本領(lǐng)域普通技術(shù)人員所理解的，當(dāng)使用永磁體的時(shí)候，磁體必須能夠移動(dòng)到離腔室C26足夠遠(yuǎn)的位置，以在希望的時(shí)候?qū)⒋艌?chǎng)的效應(yīng)從樣品處理室移除。因此，磁體位于可移動(dòng)的磁激發(fā)裝置上，該可移動(dòng)的磁激發(fā)裝置可以移動(dòng)到至少兩個(gè)位置:(I)“打開(kāi)”位置，其中磁體臨近腔室C26并且足夠靠近以將顆粒留存磁場(chǎng)施加于腔室和腔室所含物質(zhì)，以及(2)“閉合”位置，其中磁體定位成離腔室C26足夠遠(yuǎn)，以使得沒(méi)有足夠強(qiáng)度的磁場(chǎng)施加于該腔室C26或腔室C26所含物質(zhì)，并且因而該腔室中存在的任何磁性顆粒都不會(huì)受到強(qiáng)烈地影響。用于將磁場(chǎng)施加到希望的位置的可替換的裝置可以包括電磁體的選擇性地激活，其或者在分析或者處理期間通過(guò)自動(dòng)化儀器定位于臨近腔室C26，或者在激活之前移動(dòng)到該位置。用于選擇性地施加磁場(chǎng)的其他裝置包括安裝在壓板上的永磁體，該壓板可以相對(duì)于容器10的平面橫向移動(dòng)，以在腔室C26附近產(chǎn)生磁效應(yīng)和脫離磁效應(yīng)。任何合適的激發(fā)機(jī)構(gòu)都可以用于移動(dòng)該壓板，諸如操作地連接于合適的馬達(dá)的螺桿、電子直線致動(dòng)器，或者螺線管。該磁性分離裝置本身在本領(lǐng)域中是已知的，并且本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠容易地修改成容器腔室的任何構(gòu)造或者方向。如上所述，可以通過(guò)壓力施加機(jī)構(gòu)來(lái)實(shí)現(xiàn)將封閉各腔室之間的通道的密封打開(kāi)并然后將臨近的互聯(lián)腔室之間的物質(zhì)轉(zhuǎn)移。自動(dòng)化儀器的壓力施加機(jī)構(gòu)在選擇的位置處將物理力傳送到容器的外側(cè)，具體地，以由計(jì)算機(jī)控制器操控的預(yù)先定義的實(shí)例，傳送到容器的各個(gè)腔室的外側(cè)。在本發(fā)明的內(nèi)容中，術(shù)語(yǔ)“壓力施加機(jī)構(gòu)”指的是用于將物理壓力傳送至容器的外表面(多個(gè)外表面)上的任何裝置。每個(gè)壓力施加機(jī)構(gòu)優(yōu)選包括具有容器接觸表面的壓縮式防震墊。該壓縮式防震墊連接于致動(dòng)器，該致動(dòng)器相對(duì)于容器，通常關(guān)于容器的表面垂直地，將該防震墊選擇性地移動(dòng)到與容器壓力接觸和不與容器壓力接觸。或者，滾棒或者輪子可以提供物理力。壓力施加機(jī)構(gòu)還可以具有額外的功能，諸如將熱變化提供到靠近致動(dòng)器的區(qū)域。當(dāng)致動(dòng)器包括壓縮式防震墊的時(shí)候，該防震墊由適于將適當(dāng)?shù)牧κ┘拥饺萜鞯谋砻娑粨p壞該容器的任何材料所制成。典型地，該壓縮式防震墊將壓力施加到容器的任一側(cè)，而當(dāng)容器在自動(dòng)化儀器中時(shí)，容器的該相對(duì)一側(cè)緊靠一個(gè)壁。因此，通過(guò)壓力施加機(jī)構(gòu)的壓縮式防震墊的外力的施加在選擇的位置處捏壓該容器，以在該位置壓縮容器，并且迫使液體在腔室中流動(dòng)和/或通過(guò)，使得該容器的兩側(cè)進(jìn)入彼此液體密封接觸，從而實(shí)現(xiàn)將一個(gè)腔室與另一個(gè)腔室臨時(shí)地分離(或者單個(gè)腔室的一部分與另一部分分離)?；蛘?，放置在容器的相對(duì)兩側(cè)上并且都能夠朝向和遠(yuǎn)離容器移動(dòng)的一對(duì)壓縮式防震墊能夠捏壓該容器和在該對(duì)壓縮式防震墊之間含有的物質(zhì)。圖2概括地示出了體現(xiàn)本發(fā)明各方面的系統(tǒng)的功能體系結(jié)構(gòu)700。該系統(tǒng)在反應(yīng)容器或者器皿10(下面的描述中為300，見(jiàn)圖12A和12B)上操作，該反應(yīng)容器或者器皿10在圖2中概括地表示為好像該器皿以橫截面示出的一系列相互連接的矩形(S卩，腔室)。該系統(tǒng)的操作由計(jì)算機(jī)或者其他微處理器來(lái)控制，如2中表示為控制和處理計(jì)算機(jī)730，其設(shè)計(jì)成控制系統(tǒng)的操作和數(shù)據(jù)的處理。該系統(tǒng)是概括性地表示，整個(gè)系統(tǒng)操作可以由超過(guò)一臺(tái)計(jì)算機(jī)來(lái)控制?？刂坪吞幚碛?jì)算機(jī)730可以存在用于處理容器的儀器中，或其也可以是例如通過(guò)串行電纜、網(wǎng)絡(luò)連接或者無(wú)線而可操作地連接于儀器的單獨(dú)的、獨(dú)立的計(jì)算機(jī)。系統(tǒng)700的第一元件是物質(zhì)移動(dòng)控制系統(tǒng)701。該物質(zhì)移動(dòng)控制系統(tǒng)701引起和控制物質(zhì)在該系統(tǒng)內(nèi)從腔室到腔室的運(yùn)動(dòng)。更具體地說(shuō)，物質(zhì)移動(dòng)控制系統(tǒng)701可以包括物質(zhì)移動(dòng)構(gòu)件710、通道封閉構(gòu)件708和腔室分割構(gòu)件706;該物質(zhì)移動(dòng)構(gòu)件710將物質(zhì)移動(dòng)力施加到各個(gè)腔室或者施加到腔室含有的物質(zhì)，該通道封閉構(gòu)件708選擇性地封閉或者不封閉各個(gè)腔室之間的入口和通路，該腔室分割構(gòu)件706選擇性地將各個(gè)腔室劃分為兩個(gè)或者更多個(gè)子腔室，例如通過(guò)用窄邊的分割構(gòu)件緊壓柔性腔室，以使得該腔室的一個(gè)窄的部分塌陷，從而在該窄的塌陷部分的相對(duì)兩側(cè)上形成兩個(gè)子腔室。物質(zhì)移動(dòng)構(gòu)件710、通道封閉構(gòu)件708和腔室分割構(gòu)件706通過(guò)致動(dòng)器驅(qū)動(dòng)機(jī)構(gòu)704來(lái)移動(dòng)或者驅(qū)動(dòng)，該致動(dòng)器驅(qū)動(dòng)機(jī)構(gòu)704可以包括氣動(dòng)裝置、氣動(dòng)活塞裝置、液壓裝置、馬達(dá)、電磁裝置等等。致動(dòng)器驅(qū)動(dòng)機(jī)構(gòu)704由包括計(jì)算機(jī)或者其他微處理器設(shè)備的致動(dòng)器控制器702控制，該計(jì)算機(jī)或者其他微處理器設(shè)備設(shè)計(jì)成控制致動(dòng)器驅(qū)動(dòng)機(jī)構(gòu)704的操作以調(diào)節(jié)物質(zhì)移動(dòng)構(gòu)件710、通道封閉構(gòu)件708和腔室分割構(gòu)件706的運(yùn)動(dòng)、次序和定時(shí)。致動(dòng)器控制器702，與控制和處理計(jì)算機(jī)730相結(jié)合，以選擇的次序選擇性激發(fā)物質(zhì)移動(dòng)構(gòu)件710、通道封閉構(gòu)件708和腔室分割構(gòu)件706，以在容器中執(zhí)行分析或者其他處理的履行期間來(lái)控制整個(gè)容器中的液體的運(yùn)動(dòng)。在替換的構(gòu)造中，致動(dòng)器驅(qū)動(dòng)機(jī)構(gòu)704的控制可以留存在控制和處理計(jì)算機(jī)730中。該體系結(jié)構(gòu)700可以進(jìn)一步包括溫度控制系統(tǒng)720，其可以包括加熱器724和冷卻器726，用于選擇性地加熱和/或冷卻容器的靠近該加熱器或者冷卻器的一個(gè)或多個(gè)腔室所含的物質(zhì)。應(yīng)該了解的是，該加熱器724和冷卻器726可以包括單一的熱元件，諸如佩爾捷(Peltier)芯片。該加熱器724和冷卻器726的操作通過(guò)溫度控制器722來(lái)控制，該溫度控制器722包括設(shè)計(jì)成例如通過(guò)調(diào)節(jié)該加熱器724和冷卻器726的電力來(lái)控制該加熱器724和冷卻器726的操作(溫度、時(shí)刻和次序)的計(jì)算機(jī)和其他微處理器設(shè)備。溫度傳感器728檢測(cè)該加熱器724和冷卻器726的溫度，并且將溫度數(shù)據(jù)供給到溫度控制器722，以控制該加熱器724和冷卻器726的操作以達(dá)到希望的溫度。溫度控制器722，與控制和處理計(jì)算機(jī)730相結(jié)合，控制加熱器724和冷卻器726的操作，以提供希望的溫度和溫度變化的次序(例如，熱循環(huán))，以在容器內(nèi)執(zhí)行分析或者其他處理。在可選的構(gòu)造中，加熱器724和冷卻器726的控制可以歸于控制和處理計(jì)算機(jī)730中。檢測(cè)系統(tǒng)712設(shè)置成檢測(cè)來(lái)自一個(gè)或者多個(gè)腔室所含的物質(zhì)的輸出信號(hào)，該信號(hào)可以表示目標(biāo)分析物的存在和/或數(shù)量。包括用于產(chǎn)生激發(fā)信號(hào)的激發(fā)源714的該檢測(cè)系統(tǒng)712可以包括熒光檢測(cè)器、熒光計(jì)。激發(fā)信號(hào)通過(guò)光學(xué)器件和濾鏡718，并且所產(chǎn)生的具有預(yù)定波長(zhǎng)或者其他光學(xué)特性的激發(fā)信號(hào)指向一個(gè)或者多個(gè)腔室。來(lái)自該腔室所含的物質(zhì)的放射通過(guò)光學(xué)器件或?yàn)V鏡718(不必是激發(fā)信號(hào)所通過(guò)的相同的光學(xué)器件)到檢測(cè)元件716上，其中光學(xué)器件或?yàn)V鏡718可以?xún)H僅通過(guò)將由檢測(cè)器716檢測(cè)的預(yù)定波長(zhǎng)的放射信號(hào)。檢測(cè)系統(tǒng)712的操作的控制，以及由檢測(cè)系統(tǒng)收集的數(shù)據(jù)的處理可以通過(guò)控制和處理計(jì)算機(jī)730來(lái)執(zhí)行。用于與諸如容器10的、體現(xiàn)本發(fā)明各方面的多腔容器合作的用于在樣品上執(zhí)行一過(guò)程的自動(dòng)化儀器在圖3中用附圖標(biāo)記100表示。自動(dòng)化儀器100可以用于在單個(gè)、多腔容器中執(zhí)行處理的所有步驟或者部分步驟，而無(wú)需在該處理的操作期間或者在該處理的各步驟由技術(shù)人員的配合。圖3中所示的儀器包括處理單元102和門(mén)組件200。處理單元102中省略了某些零部件和表面面板，并且在示出的實(shí)施例中從門(mén)組件200省去了覆蓋罩，使得能夠更容易地觀察隱含的零部件和特征。處理單元102包括外殼104。需要注意的是，在該附圖中省去了外殼的頂面板。該外殼104包含用于操作儀器100的電子器件、電路和氣動(dòng)裝置。條形碼讀取器托架106和108保持條形碼讀取器(未示出)。在一個(gè)實(shí)施例中，條形碼標(biāo)記放置在容器10上，并且位于該儀器上的條形碼讀取器將讀取該條形碼并且提供諸如處理指令、呼出信息(expirationinformation)、刻度信息和樣品識(shí)別的信息。托架106和108保持用于手提式讀取容器條形碼標(biāo)記的條形碼讀取器。顯示面板110從外殼104向上突出，并且定位且定向成允許用戶準(zhǔn)備訪問(wèn)安裝在該面板上的任何控制開(kāi)關(guān)，以及便利地瀏覽安裝在該面板上的任何顯像。外殼104進(jìn)一步包括前部120，其攜帶處理單元102的多個(gè)功能性零部件。該外殼104的前部120包括安裝有致動(dòng)器板124的壓力機(jī)械群(下面將更詳細(xì)地描述)，該致動(dòng)器板124可以由Delrin或者涂覆有Teflon(PTFE)的鋁形成(例如，機(jī)械加工)。形成在致動(dòng)器板124中的凹口130形成了用于在閉合門(mén)組件200之前容納和保持放置在儀器單元100中的容器10的開(kāi)口。該門(mén)組件相對(duì)于外殼的前部120鉸接或者安裝，以使得允許門(mén)組件200在容器容納打開(kāi)位置與容器容納閉合位置之間的運(yùn)動(dòng)?？梢蕴峁╅T(mén)閂或者其他類(lèi)似的機(jī)構(gòu)(未示出)，以可釋放地將門(mén)組件200保持在相對(duì)于外殼104的閉合位置。更確切地說(shuō)，可以提供門(mén)閂或者其他類(lèi)似的機(jī)構(gòu)，以將門(mén)組件200保持在閉合位置中，但是適于當(dāng)施加適量的門(mén)打開(kāi)力的時(shí)候釋放該門(mén)并且允許其移動(dòng)到打開(kāi)位置。為了開(kāi)始處理，將容器10放置在儀器100中，并且然后閉合門(mén)組件200。容器10可以包括一個(gè)或多個(gè)諸如對(duì)齊孔74和75的寄存特征，該寄存特征與在容器內(nèi)的配合特征相協(xié)作以相對(duì)于儀器的容器容納開(kāi)口合適地定位和定向該容器，該配合特征諸如設(shè)置在儀器100內(nèi)的鉤或者對(duì)齊銷(xiāo)(未示出)。作為示出的示例性實(shí)施例的替換，囊括本發(fā)明的各方面的儀器可以包括狹槽或者其他開(kāi)口，通過(guò)該狹槽或者其他開(kāi)口可操作地放置該容器，并且樞轉(zhuǎn)地門(mén)組件可以省略。樣品材料優(yōu)選在將容器放置到一起中之前被移至到該容器中。在將容器定位在儀器中之前將樣品材料添加到該容器使得儀器被溢出的樣品材料污染的可能性最低。圖3和圖5示出了門(mén)組件200的細(xì)節(jié)。在所述圖中，優(yōu)選覆蓋部分門(mén)組件的罩或者外殼沒(méi)有示出，以便允許可以看到該門(mén)組件的隱含的零部件。圖5示出了門(mén)組件的前側(cè)，即，門(mén)組件200的當(dāng)閉合該門(mén)組件時(shí)面向處理單元102和容器的那側(cè)。該門(mén)組件200可以包括一個(gè)或者多個(gè)熱區(qū)，用于加熱和/或冷卻容器的靠近該熱區(qū)的區(qū)域。圖4所示的示例性門(mén)組件200包括五個(gè)熱區(qū)260、262、264、266和268。熱區(qū)具體定位以對(duì)容器的一個(gè)或者多個(gè)特定腔室提供加熱和/或冷卻。在示例性的實(shí)施例中，熱區(qū)260覆蓋腔室C16和頸部51。熱區(qū)262覆蓋腔室C18和C20。熱區(qū)264覆蓋腔室C34、C32和C30。熱區(qū)266覆蓋腔室C28。熱區(qū)268定位在磁轉(zhuǎn)換機(jī)構(gòu)208(將在下面更詳細(xì)地描述)上并且覆蓋腔室C26以及部分腔室C22和C24。一個(gè)或多個(gè)熱區(qū)可以用于對(duì)容器的一個(gè)或者多個(gè)具體腔室提供局部的加熱和/或冷卻，或者用于在儀器內(nèi)提供控制的且穩(wěn)定的環(huán)境溫度。該環(huán)境溫度可以是對(duì)于處理的最優(yōu)性能或處理的具體步驟來(lái)說(shuō)的任何便利的溫度，如上所述。例如，該環(huán)境溫度可以在大約20°C到大約40°C的范圍內(nèi)或者在大約25°C到大約37°C的范圍內(nèi)。該熱區(qū)優(yōu)選設(shè)計(jì)成將容器的一個(gè)區(qū)域及其所含的物質(zhì)迅速加熱(和/或可選擇地迅速冷卻)到任何希望的溫度。對(duì)于要求熱循環(huán)的處理來(lái)說(shuō)，諸如PCR擴(kuò)增反應(yīng)，需要快速的溫度變化。理想地，該熱區(qū)將具有大的溫度范圍，以迎合要執(zhí)行的各處理之間的改變。因此，對(duì)于水依賴(lài)的液體來(lái)說(shuō)，該熱區(qū)的溫度范圍優(yōu)選在從大約5°C到大約90°C的范圍內(nèi)，并且對(duì)于非水液體，諸如含油的液體來(lái)說(shuō)，溫度范圍要更大。在圖5中可視的熱區(qū)260、262、264、266和268的部分是由諸如銅或鋁的導(dǎo)熱材料制成的導(dǎo)板，用于將熱源從諸如佩爾捷(Peltier)熱電設(shè)備的熱能源(加熱和/或冷卻)傳導(dǎo)至容器10。如圖5所示，每個(gè)導(dǎo)板的露出的表面都具有與容器的將要受到熱區(qū)影響的區(qū)域相一致的尺寸和形狀。每個(gè)導(dǎo)板都安裝在由多塊非導(dǎo)體材料所形成的相一致的開(kāi)口中，該多塊非導(dǎo)體材料在各導(dǎo)板之間提供熱分離。優(yōu)選地，用于熱區(qū)260、262、264、266和268的每個(gè)導(dǎo)板的露出的表面和分離塊的露出的表面是共平面的，同時(shí)形成了當(dāng)門(mén)組件200處于閉合位置時(shí)接觸容器10的側(cè)面的平面。每個(gè)熱區(qū)的導(dǎo)板都與熱能能量源熱接觸，用于將加熱能或冷卻能從該能量源傳導(dǎo)至該導(dǎo)熱板的露出的表面，然后再傳導(dǎo)至容器。在一個(gè)實(shí)施例中，該能量源是熱電模塊、否則是熟知的佩爾捷設(shè)備。在優(yōu)選的實(shí)施例中，熱電單元安裝在門(mén)組件200內(nèi)，與熱區(qū)熱接觸。合適的佩爾捷設(shè)備包括用于熱區(qū)264的TEC1-12708T125、用于熱區(qū)260和262的TEC1-12705T125,以及用于熱區(qū)266和268的TES1-12704T125，上述所有都可以從泰國(guó)，曼谷的PacificSupercool有限公司買(mǎi)到。諸如泡沫絕緣的熱絕緣可以設(shè)置在熱電模塊周?chē)约皩?dǎo)板的各部分之間。如本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的，可以在門(mén)組件200中設(shè)置用于將余熱從熱能能量源散發(fā)出去的裝置，諸如一個(gè)或者多個(gè)導(dǎo)熱熱沉，其可以與一個(gè)或者多個(gè)風(fēng)扇機(jī)構(gòu)相結(jié)合以相對(duì)于該熱沉產(chǎn)生空氣對(duì)流。熱區(qū)260、262、264、266和268受到微處理器的控制，用于控制熱狀態(tài)的幅值和持續(xù)時(shí)間，包括在表示熱區(qū)、受熱區(qū)影響的位置的熱循環(huán)。并且一個(gè)或者多個(gè)熱區(qū)可以在一種檢驗(yàn)期間被停用，其中不需要在不活動(dòng)的熱區(qū)的區(qū)域中的加熱和/或冷卻。因此，可以將熱區(qū)的控制構(gòu)造成迎合各種不同的處理要求。為了改善對(duì)具體腔室的熱傳送，發(fā)現(xiàn)使用油或者其他惰性物質(zhì)可以減少腔室中的空氣(非常差的熱導(dǎo)體)的用量，并且與此同時(shí)，增加了腔室壓力。增加的腔室壓力可以促進(jìn)在各腔室與對(duì)應(yīng)的導(dǎo)板之間的更好的接觸，使得能夠更完全和快速地加熱各腔室所含的物質(zhì)。移磁機(jī)構(gòu)(magnetictranslationmechanism)208構(gòu)造且布置成相對(duì)于在其中執(zhí)行磁分離過(guò)程的容器(例如，腔室C26)來(lái)移動(dòng)磁體，出于該說(shuō)明的目的，該容器可以稱(chēng)作為磁分離腔室，該磁體包括單個(gè)永磁體、永磁體群，和/或一個(gè)或者多個(gè)電磁體。更具體的說(shuō)，移磁機(jī)構(gòu)208構(gòu)造且布置成相對(duì)于磁分離腔室在(I)“打開(kāi)”位置與(2)“閉合”位置之間移動(dòng)磁體；在該(I)“打開(kāi)”位置，磁體足夠靠近該磁分離腔室，以使得由該磁體產(chǎn)生的磁場(chǎng)具對(duì)磁分離腔室所含有的物質(zhì)的作用足以基本固定在該磁分離腔室內(nèi)的任何磁響應(yīng)性材料；在該⑵“閉合”位置，磁體從磁分離腔室充分移除，以使得由該磁體產(chǎn)生的磁場(chǎng)具對(duì)磁分離腔室所含有的物質(zhì)的作用不足以基本固定在該磁分離腔室內(nèi)的任何磁響應(yīng)性材料。在圖5所示的實(shí)施例中,移磁機(jī)構(gòu)208包括支撐一個(gè)磁體或者磁體群的磁體載體和連接于該載體用于將在打開(kāi)和關(guān)閉位置之間相對(duì)于門(mén)組件200上下移動(dòng)該載體的致動(dòng)器。在不出的實(shí)施例中，移磁機(jī)構(gòu)208攜帶三磁體群210,同時(shí)一個(gè)磁體在該移磁機(jī)構(gòu)208上的頂部或者12點(diǎn)位置省去。該12點(diǎn)位置最靠近連接磁分離腔室210與廢物腔室C36的進(jìn)口48的入口70。通過(guò)從這個(gè)位置省去一個(gè)磁體，可以避免磁性顆粒在這個(gè)位置處累積。這有助于使得在磁分離過(guò)程的漂洗和清洗步驟期間不慎攜帶到廢物腔室C36中的磁性顆粒的數(shù)目最小。參考圖4，壓縮機(jī)構(gòu)群180的壓縮式防震墊以與如I所示的示例性容器10的各腔室和液體通路的位置相一致的方式來(lái)定位，并且形成為執(zhí)行在此描述各種處理相關(guān)的功能的形狀。當(dāng)由內(nèi)部微處理器控制器控制時(shí)，自動(dòng)化儀器以適當(dāng)?shù)捻樞蚱饎?dòng)適當(dāng)?shù)膲毫C(jī)械、磁體和/或熱區(qū)。壓力機(jī)械群180安裝在致動(dòng)板124內(nèi)并且由圖4概括地示出。該壓力機(jī)械群180包括多個(gè)獨(dú)立的壓縮式防震墊，該壓縮式防震墊構(gòu)造且布置成用于橫向地往復(fù)運(yùn)動(dòng)到致動(dòng)板124的外表面以將壓力選擇性地施加于容器10的所選部分。該壓力機(jī)械群180包括多個(gè)壓縮式防震墊，該壓縮式防震墊的大小設(shè)計(jì)且布置成與容器10各腔室和入口對(duì)齊。每個(gè)壓縮式防震墊都包括可操作地連接于往復(fù)式氣動(dòng)致動(dòng)器、磁致動(dòng)器、電磁體或其他合適的機(jī)構(gòu)的頭部、用于向外移動(dòng)襯墊以與容器10的相應(yīng)部分壓縮接合并且然后返回到其裝載位置的電子機(jī)構(gòu)或者其他致動(dòng)器(未示出)。定位壓縮式防震墊P51-1以便與容器10的頸部51的頂部對(duì)齊。定位壓縮式防震墊P51-2以便與容器10的頸部52的下部對(duì)齊，其中頸部51進(jìn)入腔室C16。壓縮式防震墊Ρ16-1、Ρ16-2、Ρ16-3和P16-4都定位成與容器10的腔室C16的不同部分對(duì)齊。壓縮式防震墊P16-1是用于腔室C16的底部壓縮式防震墊，壓縮式防震墊P16-2是用于腔室C16的頂部壓縮式防震墊，壓縮式防震墊P16-3是用于腔室C16的分割物，以及壓縮式防震墊P16-4是用于腔室C16的前部壓縮式防震墊。使得多個(gè)襯墊P16-1、P16-2、P16_3和P16-4與可以作為樣品腔室的大腔室C16相結(jié)合，允許了要分析的樣品在尺寸上的靈活性。分割物襯墊P16-3可以用于將腔室C16分割成兩個(gè)小的腔室。注意到，腔室C26和腔室C28比腔室C16小得多，并且因此，不證自明的是，腔室C16所含的所有物質(zhì)，如果基本填充到容積，將不適合在腔室C26和/或腔室C28中。對(duì)于一些應(yīng)用，需要樣品材料的相對(duì)大的用量，以確保如果在樣品中存在分析物，那么有能檢測(cè)到的分析物的量，但是用于處理樣品的隨后的腔室，諸如腔室C26和腔室C28，則不能容納這么大量的樣品材料。適于壓縮腔室C16的不同部分的多個(gè)襯墊使得樣品能夠一次一部分或一次一等分地從腔室C16移動(dòng)到腔室C26。壓縮式防震墊P18-1和P18-2定位成與腔室C18對(duì)齊。壓縮式防震墊P18-1是用于腔室C18的后部壓縮式防震墊，而壓縮式防震墊P18-2是用于腔室C18的前部壓縮式防震墊。壓縮式防震墊P20定位成與腔室C20對(duì)齊。壓縮式防震墊P22定位成與腔室C22對(duì)齊。壓縮式防震墊P24定位成與腔室C24對(duì)齊。壓縮式防震墊P30定位成與腔室C30對(duì)齊。壓縮式防震墊P32定位成與腔室C32對(duì)齊。在示出的實(shí)施例中需要注意的是，沒(méi)有壓縮式防震墊與腔室C28、或者與腔室C36的區(qū)域50或腔室C34的區(qū)域38關(guān)聯(lián)。然而，儀器可以包括用于將力施加在腔室上或其部分上的其他機(jī)構(gòu)，下面將更詳細(xì)地描述。此外，示出的實(shí)施例是示例，并且包含本發(fā)明的各方面的其他實(shí)施例也可以設(shè)置用于腔室C28以及區(qū)域50和/或38的壓縮式防震墊，或者可以省略用于其他腔室和/或其區(qū)域的壓縮式防震墊。壓縮式防震墊P34-1、P34-2和P34-3與腔室C34的水平部分44對(duì)齊。壓縮式防震墊P34-1是#1清洗壓縮式防震墊，壓縮式防震墊P34-2是#2清洗壓縮式防震墊，壓縮式防震墊P34-3是#3清洗壓縮式防震墊。壓縮式防震墊P34-4是M清洗壓縮式防震墊并且與清洗劑腔室C34的豎直部分42對(duì)齊。壓縮式防震墊P34-5是#5清洗壓縮式防震墊并且與清洗劑腔室C34的下頸部40對(duì)齊。該#5清洗襯墊頭P34-5進(jìn)一步包括橫跨壓縮防震墊延伸的平行上升的肋P34-5a。肋P34-5a提供緊的壓縮密封，用于關(guān)閉容器10的頸部40以防止液體從清洗劑腔室C34的上部38流動(dòng)到該腔室C34的豎直部分42和水平部分44。壓縮式防震墊P36-1、P36-2和P36-3與腔室C36的豎直進(jìn)口48對(duì)齊。需要注意的是，壓縮式防震墊P36-3比壓縮式防震墊P36-1和P36-2寬，使得壓縮式防震墊P36-3的一部分覆蓋腔室C36的頸部46。壓縮式防震墊P36-1是#1廢物壓縮式防震墊，壓縮式防震墊P36-2是#2廢物壓縮式防震墊，壓縮式防震墊P36-2是#2廢物壓縮式防震墊。壓縮式防震墊P72是與入口72對(duì)齊的夾具。類(lèi)似地，壓縮式防震墊P70是與入口70對(duì)齊的夾具，壓縮式防震墊P62是與入口62對(duì)齊的夾具，壓縮式防震墊P58是與入口58對(duì)齊的夾具，壓縮式防震墊P60是與入口60對(duì)齊的夾具，壓縮式防震墊P66是與入口66對(duì)齊的夾具，壓縮式防震墊P68是與入口68對(duì)齊的夾具，壓縮式防震墊P56是與入口56對(duì)齊的夾具，并且，壓縮式防震墊P54是與入口54對(duì)齊的夾具。壓縮式防震墊P64是與入口64對(duì)齊的夾具。壓縮式防震墊頭部可以由以特拉華州威爾明頓市的DuPont公司的Delrin的商標(biāo)名稱(chēng)出售的黑縮醛樹(shù)脂形成。壓縮式防震墊P26定位成與腔室C26對(duì)齊。在優(yōu)選的實(shí)施例中，襯墊P26連接到螺旋致動(dòng)器或其他的相對(duì)運(yùn)動(dòng)較慢的致動(dòng)器上。螺旋致動(dòng)器提供慢的和穩(wěn)固的壓縮，而不是由氣動(dòng)致動(dòng)的壓縮式防震墊產(chǎn)生的突然施加的壓縮力。這種控制的運(yùn)動(dòng)可以提供若干優(yōu)點(diǎn)。例如，螺旋致動(dòng)器使得用于能夠控制壓縮式防震墊P26運(yùn)動(dòng)的速率和程度，從而使得能夠限制或者防止了在被壓縮的腔室內(nèi)的湍流。例如，當(dāng)使用在湍流條件下易于產(chǎn)生氣泡的清潔器依賴(lài)的試劑時(shí)，或者當(dāng)在磁分離清洗過(guò)程期間從腔室移除清洗劑的時(shí)候，希望避免湍流。當(dāng)清洗劑從含有固定的、磁響應(yīng)性的顆粒的腔室移除時(shí)，在該腔室內(nèi)的湍流可以引起所述顆粒被移出，并且因而被沖洗到廢物室中?？刂频膲嚎s式防震墊P26的運(yùn)動(dòng)還可以防止過(guò)度壓縮腔室，其能夠?qū)е聞兟浠蛘咂茐那皇业谋?。圖12A和圖12B示出了根據(jù)本發(fā)明的另一個(gè)容器300。與前述的容器10相類(lèi)似，容器300包括一個(gè)大致在同一平面的器皿，該器皿具有由諸如箔和/或塑料的薄柔性材料制成的柔性頂板和底板，并且限定類(lèi)似囊的器皿。容器300具有上緣302和下緣304，該上緣和下緣表示容器在使用期間的優(yōu)選的方向并且定義上方和下方。示圖12A所示的那種例性容器10具有大約5.5英寸乘大約3.4-4.0英寸的尺寸，并且大約0.4英寸的厚度(當(dāng)用樣品和處理材料填滿的時(shí)候)，但是也可以是適于手動(dòng)操作或者適用于自動(dòng)系統(tǒng)的任何尺寸，與其中所描述的一種相類(lèi)似。優(yōu)選的用于構(gòu)造容器300的材料與上述的用于容器10的那些材料相同。容器300包括用于將樣品材料或者其他物質(zhì)裝載到容器300中的入口306。容器300包括九個(gè)腔室:C320、C322、C324、C328、C332、C334、C3360、C338和C340。如圖12A所示，容器300可以包括剛性框架380，該剛性框架380包括豎直部分381和383、頂部水平部分384以及底部水平部分385。面板382可以容納識(shí)別標(biāo)簽，該識(shí)別標(biāo)簽諸如條形碼或人類(lèi)或者機(jī)器可讀的其他標(biāo)記。該面板上承載的信息可以包括批號(hào)、序號(hào)、分析類(lèi)型、過(guò)期日期等等。突出部386在頂部384上方伸出，并且提供了用于抓緊囊300并將其插入到儀器中并且從儀器中將其移除的附加物。設(shè)置口蓋388(例如，單向閥)，用于將樣品通過(guò)進(jìn)口通道C328C而引入到樣品腔室C328A中。包括突出部386和樣品蓋388的框架380優(yōu)選由諸如塑料的合適的剛性材料制成。其為容器的展開(kāi)圖的圖12B示出了容器300的進(jìn)一步的細(xì)節(jié)。框架380包括后框架部件380a和前框架部件380b，柔性袋301夾在該后框架部件和前框架部件之間。后框架部件380a包括豎直部分381a、383a、頂部水平部分384a、底部水平部分385以及突出物386a。前框架部件380b包括豎直部分381b、383b、頂部水平部分384b和突出物386b，但是不包括底部水平部分。每個(gè)框架部件380a和380b都是注射成型，并且這兩個(gè)部件可以通過(guò)超聲焊接而彼此連接成框架組件。通過(guò)在框架部件380a、380b上的穿過(guò)形成在該囊的外周上的孔而延伸的銷(xiāo)，容器300的柔性袋部分301定位并且固定在框架380上。在容器300的示例性應(yīng)用中，各腔室可以填滿執(zhí)行結(jié)合反應(yīng)所需要的物質(zhì)。例如，樣品材料可以通過(guò)進(jìn)口306而裝載到腔室C328中。該腔室C328包括通過(guò)限制區(qū)域364連接上部區(qū)域C328A和下部區(qū)域C328B，該限制區(qū)域364可以通過(guò)壓力施加機(jī)構(gòu)而關(guān)閉，以便將下部區(qū)域與上部區(qū)域隔離。腔室C332可以裝載有用于將樣品材料中存在的分析物結(jié)合并固定在固相載體上的樣品處理試劑，腔室C328的下部區(qū)域C328B，除了容納樣品材料之外，還用作為腔室C328的樣品處理區(qū)域，用于將固定的分析物與樣品材料的其他組分分離；腔室C334可以裝載有干燥的第一處理材料；腔室C340可以裝載有用于恢復(fù)第一處理材料的試劑；腔室C322可以裝載有干燥的第二處理材料；腔室C324可以裝載有用于恢復(fù)第二處理材料的試劑；腔室C336可以裝載有清洗劑；腔室C338可以裝載有用于除去清洗劑的抑制組分的漂洗劑；而腔室C320可以用作為用于與反應(yīng)的其他方面相對(duì)隔離的容納和儲(chǔ)存廢物的廢物腔室。除了含有第二處理材料之外，腔室C322的下部區(qū)域C322B還用作為腔室C322的檢測(cè)區(qū)域，用于檢測(cè)在反應(yīng)混合物中的表示樣品材料中的至少一種目標(biāo)分析物的存在的信號(hào)或者變化。腔室C320構(gòu)造成容納來(lái)自腔室C328的廢棄材料，并且包括從腔室C328延伸的初始的、大致豎直的進(jìn)口370;上頸部372;和收集區(qū)域374。豎直的進(jìn)口370大致定位在腔室C328的下部區(qū)域C328B的上方，并且通過(guò)位于腔室C328的下部區(qū)域C328B的頂部附近的入口360而連接于腔室C328。腔室C320相對(duì)于腔室C328的布置使得當(dāng)廢棄材料從腔室C328移動(dòng)到腔室C320中的時(shí)候，腔室C328中含有的氣泡直接移至腔室C320。此外，因?yàn)樯项i部372定位在腔室C320的收集區(qū)域374的上方，所以廢棄材料可以通過(guò)重力而留存在收集區(qū)域374中，而無(wú)需應(yīng)用夾具或者用于密封該上頸部372的其他裝置。如圖12所示，在容器300的互相連接的腔室系統(tǒng)中，腔室C324通過(guò)入口350連接于腔室C322的下部區(qū)域C322B;腔室C322的下部區(qū)域C322B通過(guò)入口356連接于腔室C328;腔室C340通過(guò)入口344連接于腔室C334;腔室C334通過(guò)入口346連接于腔室C328的下部區(qū)域C328B;腔室C332通過(guò)入口348連接于腔室C328的下部區(qū)域C328B;腔室C338通過(guò)入口362連接于腔室C328的下部區(qū)域C328B;腔室C336通過(guò)入口342連接于腔室C328的下部區(qū)域C328B。壁376傾斜地伸入腔室C336中，用于防止已經(jīng)收集在腔室C336的上部的空氣氣泡在清洗過(guò)程期間通過(guò)入口342移動(dòng)并進(jìn)入腔室C328中。在另一個(gè)實(shí)施例中，每個(gè)入口342、344、346、348、350、356、360和362都通過(guò)可開(kāi)密封或者其他屏障而臨時(shí)關(guān)閉，以防止液體通過(guò)其流動(dòng)。與容器10類(lèi)似，容器300限定了腔室的非直線排列，對(duì)于執(zhí)行需要或者得益于樣品的非順序處理的復(fù)雜過(guò)程是有用處的。腔室C322包括通過(guò)限制部分358連接的上述的下部區(qū)域C322B和上部區(qū)域C322A。在示出的排列中，腔室C324和C322的組合的物質(zhì)(在與來(lái)自腔室C328的物質(zhì)相組合之前或者之后)可以通過(guò)在腔室C322的上部區(qū)域C322A與下部區(qū)域C322B之間前后移動(dòng)該結(jié)合物質(zhì)而在腔室C322混合，同時(shí)入口350和356的每一個(gè)都通過(guò)壓力施加機(jī)構(gòu)夾緊，以防止物質(zhì)移動(dòng)到腔室C324和C328中。由于腔室C322的上部區(qū)域C322A與下部區(qū)域C322B的相對(duì)定位，當(dāng)施加于下部區(qū)域C322B的壓力被移除時(shí)，重力協(xié)助將結(jié)合的物質(zhì)從上部區(qū)域C322A移動(dòng)到下部區(qū)域C322B。因此，在示出的實(shí)施例中，不需要將物質(zhì)從腔室C322的上部區(qū)域C322A移動(dòng)到下部區(qū)域C322B的外部壓力。容器300在設(shè)置有壓力施加機(jī)構(gòu)和熱區(qū)的儀器中(未示出)被處理，該壓力施加機(jī)構(gòu)例如是壓縮式防震墊，該熱區(qū)的大小、形狀和位置與腔室300的各腔室相一致，用于在各腔室之間選擇性地移動(dòng)物質(zhì)以及用于選擇性地加熱和/或冷卻一個(gè)或者多個(gè)所選的腔室。體現(xiàn)本發(fā)明各方面的并且構(gòu)造成處理如圖12A和12B所示的容器300的儀器的第二實(shí)施例，在圖13中用附圖標(biāo)記1000表示。儀器1000包括具有頂部1002和底部1002b的外殼1002。外殼1002還包括手柄1004。該手柄1004包括相對(duì)的狹槽1009，用于在制備期間保持容器300。儀器1000進(jìn)一步包括進(jìn)氣口1008和出氣口1010，該進(jìn)氣口1008優(yōu)選由合適的過(guò)濾材料覆蓋。狀態(tài)屏1012顯示狀態(tài)和對(duì)操作者有用的其他信息，并且操作按鈕可以在例如屏幕1012下方設(shè)置為可視的。在外殼的頂部1002a上的儀器插入狹槽1014構(gòu)造成容納容器300，如圖13所示。容器插入狹槽1014優(yōu)選是凸出的，以便溢出的液體將流出外殼1002，而不是進(jìn)入狹槽中?？梢栽趯⑷萜?00插入到狹槽1014之后手動(dòng)操作狹槽滑蓋1016，以封閉該狹槽1014，并且還可以再次打開(kāi)以將容器300取出。風(fēng)扇1011對(duì)外殼1002內(nèi)部的電子器件和其他零部件提供冷風(fēng)。觀察圖14和圖15中的外殼1002的內(nèi)部，儀器1000包括空氣壓縮器1020和儲(chǔ)汽缸1024。該儀器進(jìn)一步包括諸如熒光計(jì)(下面將更詳細(xì)地描述)的檢測(cè)器500，和用于相對(duì)于容器將磁體選擇性地移入和移出操作位置的磁致動(dòng)器1090。儀器1000進(jìn)一步包括空氣歧管1082和致動(dòng)板1080。儀器1000可以進(jìn)一步包括整合空氣濾清器1022。還示出了溫度控制系統(tǒng)的各方面，并且其包括隔熱框架1048和散熱系統(tǒng)，該散熱系統(tǒng)包括風(fēng)扇1070、罩1068以及熱沉1064。風(fēng)扇1070通過(guò)空氣進(jìn)口1008將空氣卷入到儀器中，并且加熱的空氣在流過(guò)熱沉1064之后通過(guò)出氣口1010離開(kāi)外殼1002。圖9和圖16示出了用于將選擇性的壓力施加于容器300的儀器1000的壓力機(jī)械群。該壓力機(jī)械群安裝在致動(dòng)板1080內(nèi)部，該致動(dòng)板可以由Delrin或者用Teflon(PETE)涂覆的鋁制成(例如，機(jī)械加工)。如前述的壓力機(jī)械群180，圖16的壓力機(jī)械群包括多個(gè)獨(dú)立的壓縮式防震墊，該壓縮式防震墊構(gòu)造且布置成用于橫向地往復(fù)運(yùn)動(dòng)到致動(dòng)板1080以將壓力選擇性地施加于容器300的所選部分。該壓力機(jī)械群包括多個(gè)壓縮式防震墊，該壓縮式防震墊的大小設(shè)計(jì)成且布置成與容器300各腔室和入口對(duì)齊。每個(gè)壓縮式防震墊都包括可操作地連接于往復(fù)式氣動(dòng)致動(dòng)器、磁致動(dòng)器、電磁體或其他合適的機(jī)構(gòu)的頭部、用于向外移動(dòng)襯墊以與容器300的相應(yīng)部分壓縮接合并且然后返回到其裝載位置的電子機(jī)構(gòu)或者其他致動(dòng)器(未示出)。在一個(gè)實(shí)施例中，每個(gè)壓縮式防震墊都連接到形成在歧管1082中的空氣導(dǎo)管，該歧管將受壓的空氣引導(dǎo)至該襯墊，以將該襯墊移動(dòng)到延伸的位置。更具體地說(shuō)，每個(gè)壓縮元件都由電磁閥來(lái)控制，當(dāng)該電磁閥被吸引時(shí)，其將受壓的系統(tǒng)空氣連接到一通路，該通路通向安裝壓力調(diào)節(jié)器(未示出)的入口，并且該調(diào)節(jié)器的輸出向后連接至歧管1082上的另一個(gè)入口，該歧管將正受調(diào)節(jié)和受壓的空氣供給到壓縮元件。壓力傳感器可以設(shè)置為監(jiān)控系統(tǒng)內(nèi)的壓力。壓縮式防震墊P328-1和P328-2分別與容器300的樣品腔室C328A的上部和下部對(duì)齊。壓縮式防震墊P328-3與上頸部C328C對(duì)齊。壓縮式防震墊P364與腔室C328A與腔室C238B之間的限制區(qū)域P364對(duì)齊，并且設(shè)置用于選擇性地打開(kāi)和關(guān)閉該限制364的裝置，以控制液體在腔室C328A與腔室C328B之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P338-2是與洗滌腔室C338的上部對(duì)齊的圓形襯墊，并且壓縮式防震墊P338-1與該腔室C338的下部對(duì)齊。壓縮式防震墊P362與連接洗滌腔室C338和磁分離腔室C328B的入口362對(duì)齊，并且設(shè)置用于選擇性地打開(kāi)和關(guān)閉該入口362(在已經(jīng)打開(kāi)了初始閉合的可破密封之后)的裝置，以控液體在制腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊Ρ320-1、Ρ320-2和P320-3與垃圾腔室C320的不同部分對(duì)齊。壓縮式防震墊P320-1和P320-2分別與將腔室C328B連接到廢物腔室C320的進(jìn)入通道的上部和下部對(duì)齊，并且適于在通道將液體向上移動(dòng)到腔室C320的上頸部372中。壓縮式防震墊P320-3控制液體通過(guò)上頸部372的運(yùn)動(dòng)，并且具體地，防止液體從廢物腔室C320流回到腔室C328B。壓縮式防震墊360與連接廢物腔室C320和腔室C328B的入口360對(duì)齊，并且設(shè)置用于選擇性地打開(kāi)和關(guān)閉該入口360的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P356與連接腔室C322B和腔室C328B的入口356對(duì)齊，并且設(shè)置用于打開(kāi)和關(guān)閉該入口的裝置，以控制腔室之間的液體流動(dòng)。壓縮式防震墊P322-1與腔室C322A對(duì)齊，并且壓縮式防震墊P358與連接腔室C322的區(qū)域C322A和C322B的限制部分358對(duì)齊。壓縮式防震墊P358設(shè)置了用于打開(kāi)和關(guān)閉該限制部分358的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P322-2與腔室C322B對(duì)齊。在一個(gè)實(shí)施例中，腔室C322的下部區(qū)域C322B用作為檢測(cè)腔室，用于檢測(cè)反應(yīng)混合物的信號(hào)或者變化，該信號(hào)或者變化表示樣品材料中的至少一種目標(biāo)分析物的存在。因此，在一些實(shí)施例中，壓縮式防震墊P322構(gòu)造成使得光可以通過(guò)該壓縮式防震墊傳輸，從而允許檢測(cè)由腔室區(qū)域C322B所含物質(zhì)發(fā)射的光信號(hào)。壓縮式防震墊P324-1和P324-2分別與腔室C324的上部和下部對(duì)齊。壓縮式防震墊P350與連接腔室C324和腔室C322B的入口350對(duì)齊，并且設(shè)置用于打開(kāi)和關(guān)閉該入口350的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P332-1和P332-2分別與腔室C332的上部和下部對(duì)齊。壓縮式防震墊P348與連接腔室C332和腔室C328B的入口348對(duì)齊，并且設(shè)置用于選擇性地打開(kāi)和關(guān)閉該入口348的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P340與腔室C340對(duì)齊，并且壓縮式防震墊P334與腔室C334對(duì)齊。該壓縮式防震墊P334與連接腔室C340和腔室C334的入口344對(duì)齊，并且設(shè)置用于選擇性地打開(kāi)和關(guān)閉該入口344的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P346與連接腔室C334和腔室C328B的入口346對(duì)齊，并且設(shè)置用于打開(kāi)和關(guān)閉該入口346的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P336-1與清洗腔室C336的一部分對(duì)齊，并且壓縮式防震墊P336-2與該清洗腔室C336的另一部分對(duì)齊。壓縮式防震墊P336-2與清洗腔室C336的從該腔室C336的傾斜壁376的一端以及周側(cè)壁延伸的那部分對(duì)齊，并且設(shè)置用于將該腔室C336劃分成兩個(gè)子腔室的裝置。壓縮式防震墊P342與連接腔室C336和腔室C328B的入口342對(duì)齊，并且設(shè)置用于選擇性地打開(kāi)和關(guān)閉該入口342的裝置，以控制液體在腔室之間的流動(dòng)。壓縮式防震墊P336-3與清洗腔室C336的一部分對(duì)齊，并且是由一片柔性的、相對(duì)無(wú)孔的材料形成的囊狀物，其邊緣被固定于在致動(dòng)板1080中形成的凹口上。該囊狀物P336-3與在歧管1082中形成的空氣導(dǎo)管相通，并且可以通過(guò)調(diào)節(jié)器控制。當(dāng)將該囊狀物P336-3填充空氣的時(shí)候，其膨脹(擴(kuò)張)以將壓力施加于腔室C336的一部分，以從該腔室排出清洗液。該囊狀物P336-3優(yōu)選在往復(fù)式壓縮防震墊的上方，因?yàn)樵谠撐恢?，能夠控制該囊狀物的膨脹以提供腔室C336的緩慢的、平穩(wěn)的排水量。該囊狀物P336-3的作用為輕柔地對(duì)清洗腔室C336施加足以將部分清洗緩沖劑移入到臨近入口342的通道區(qū)域中的壓力。壓縮式防震墊P336-2具有一個(gè)上升的薄面，以將清洗等分試樣保持在適當(dāng)?shù)奈恢茫钡狡湟苿?dòng)到腔室C328B中為止。與通過(guò)電磁閥來(lái)控制的任何其他壓縮元件一樣來(lái)致動(dòng)囊狀物P336-3，當(dāng)該電磁閥被吸引時(shí)，其將受壓的系統(tǒng)空氣連接到一通路，該通路通向安裝壓力調(diào)節(jié)器(未示出)的入口，并且該調(diào)節(jié)器的輸出向后連接至歧管1082上的另一個(gè)入口，該歧管將正受調(diào)節(jié)和受壓的空氣供給到壓縮元件。適合該囊狀物P336-3的工作壓力是大約lOpsi。壓力機(jī)械群可以由彈性護(hù)罩(參見(jiàn)圖18和圖19中的附圖標(biāo)記1081)覆蓋，該彈性護(hù)罩拉伸以允許壓縮式防震墊工作，并且該彈性護(hù)罩覆蓋且保護(hù)壓縮式防震墊例如不會(huì)溢出液體。該擴(kuò)罩可以包括一個(gè)開(kāi)口，通過(guò)該開(kāi)口，檢測(cè)器(例如，熒光計(jì)500)可以檢測(cè)從位于開(kāi)口附近的腔室所含的物質(zhì)所發(fā)射的光信號(hào)。該護(hù)罩可以具有防粘的性質(zhì)(例如，防粘涂層)，以便于將容器300插入到儀器1000以及在處理之后將容器300從儀器1000移出。如圖17A所示，空氣歧管1082連接于致動(dòng)板1080。儲(chǔ)汽缸1024連接于該空氣歧管1082，磁致動(dòng)器1090和檢測(cè)器500也連接于該歧管1082。窗口1086允許觀察在容器300的面板382上述設(shè)置的條形碼和其他標(biāo)記(見(jiàn)圖12A)，并且該條形碼閱讀機(jī)1088構(gòu)造且布置成讀取容器上的條形碼。閥1084(例如，電磁閥)控制到歧管的各導(dǎo)管的壓力分布，每個(gè)導(dǎo)管都連接于圖16所示的氣動(dòng)壓縮式防震墊中的一個(gè)上。更具體地說(shuō)，圖17B示出了儀器1000的氣動(dòng)系統(tǒng)的電路圖。圖17B中示出的該系統(tǒng)某種程度上與圖17A示出的結(jié)構(gòu)不同。例如，圖17B示出的系統(tǒng)沒(méi)有儲(chǔ)汽缸。該氣動(dòng)系統(tǒng)包括連接于止回閥1030的泵1020、脫水器1032和空氣干燥器1034(例如，用于從受壓的空氣移除水分的干燥劑)。閥1028(例如，電磁閥)構(gòu)造且布置成通過(guò)將該泵通至大氣“ATM”而選擇性地將泵與氣動(dòng)系統(tǒng)脫離。壓力傳感器1036檢測(cè)系統(tǒng)中的壓力，并且可以與控制和處理計(jì)算機(jī)730(見(jiàn)圖2)相連。該系統(tǒng)還可以包括蓄電池1038。系統(tǒng)還包括閥1084和壓縮元件(例如圖16所示)。在圖17B中，僅僅示出了三個(gè)閥1084a、1084b、1084c以及三個(gè)相關(guān)的壓縮元件P322-2、P322-1和P348。如圖中所示，每個(gè)閥1084a、1084b、1084c都將相關(guān)的壓縮式防震墊選擇性地連接于壓力源(泵1020或者蓄電池1038)、連接相關(guān)的壓縮式防震墊大氣“ATM”以對(duì)該壓縮式防震墊通風(fēng)(以移除可能抑制該壓縮式防震墊的完全縮回的壓力)，或者將壓縮元件分支與剩下的氣動(dòng)電路阻隔。如圖19的剖視圖所示，磁致動(dòng)器1090包括馬達(dá)1092，該馬達(dá)1092經(jīng)由連接到導(dǎo)螺桿1096的軸1094移動(dòng)保持磁體1132、1134的磁體保持架1136。磁致動(dòng)器1090進(jìn)一步包括汽缸1110、1112，該汽缸連接于致動(dòng)件1140，用于往復(fù)運(yùn)動(dòng)壓縮加油杯1130。馬達(dá)1092和汽缸1110、1112安裝在連接于歧管1082的安裝塊1120的頂上。更具體地說(shuō)，馬達(dá)1092包括通過(guò)聯(lián)接器1098連接于導(dǎo)螺桿1096的軸1094，該導(dǎo)螺桿1096可旋轉(zhuǎn)地安裝在軸承1100、1102中。導(dǎo)螺桿1096能夠在聯(lián)接器1098中軸向滑動(dòng)，并且螺合于磁體保持架1136,包括圖中所示的磁體1132、1134的大量磁體保持在該磁體保持架1136中。在優(yōu)選實(shí)施例中，磁體保持架1136保持三個(gè)這樣的磁體。該磁體保持架1136設(shè)置在壓縮加油杯1130的中空部分中，該壓縮加油杯1130設(shè)置在橫向穿過(guò)致動(dòng)板1080而形成的圓孔中。插入到聯(lián)接器1098中的導(dǎo)螺桿1096的一端具有能夠防止該導(dǎo)螺桿1096相對(duì)于聯(lián)接器1098旋轉(zhuǎn)的正方形或其其他形狀的橫截面。此外，磁體保持架1136具有凸脊或者具有與中空壓縮加油杯的內(nèi)壁相一致的非圓周形狀，以防止磁體保持架1136在該壓縮加油杯1130中旋轉(zhuǎn)。導(dǎo)螺桿1096通過(guò)馬達(dá)1092的這種旋轉(zhuǎn)引起了磁體保持架1136的相應(yīng)轉(zhuǎn)變。除了在打開(kāi)和關(guān)閉位置之間簡(jiǎn)單移動(dòng)磁體保持架1136之外，還可以控制馬達(dá)1092以改變磁體保持架1136從打開(kāi)位置運(yùn)動(dòng)到關(guān)閉位置所用的速度，反之亦然；此外還可以控制馬達(dá)1092以改變打開(kāi)和關(guān)閉之間的位置。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該可以想象得到如何利用速度和位置的結(jié)合來(lái)使得磁場(chǎng)強(qiáng)度的強(qiáng)度和變化率最優(yōu)，以使得磁性顆粒保留的最多。每個(gè)汽缸1110、1112都包括設(shè)置往復(fù)式活塞1116的汽缸殼1114。(注意:汽缸1110和1112是相同的；因此，僅僅汽缸1110的特征在附圖中標(biāo)號(hào))。設(shè)置氣動(dòng)端口1118，用于將汽缸1110連接于氣壓源。每個(gè)汽缸1110、1112的活塞都連接于致動(dòng)件1140。致動(dòng)件1140包括圓形的中部，其配合到與壓縮加油杯1130相配合的同一個(gè)孔的一部分中；以及兩個(gè)徑向突起1142，1144，所述突起分別配合到開(kāi)口1146、1148中，形成為靠近容納壓縮加油杯1130的圓形開(kāi)口的致動(dòng)板1080?；钊?116附著于該徑向突起1142、1144。如圖所示，由磁體保持架1136承載的磁體1132、1134處于“打開(kāi)”位置。也就是說(shuō)，磁體緊鄰覆蓋致動(dòng)板1080的彈性護(hù)罩1081，并且因而緊鄰將在其中進(jìn)行磁分離過(guò)程的容器的腔室。該磁體可以通過(guò)經(jīng)由馬達(dá)1092旋轉(zhuǎn)導(dǎo)螺桿1096而運(yùn)動(dòng)到“關(guān)閉”位置，以將磁體保持架1136遠(yuǎn)離護(hù)罩1081(S卩，到圖中的右側(cè))在壓縮加油杯1130的中空部分內(nèi)。反向旋轉(zhuǎn)馬達(dá)1092和導(dǎo)螺桿1096將磁體保持架1136延伸回到在壓縮加油杯1130的端部處的“打開(kāi)”位置。導(dǎo)螺桿1096的連續(xù)旋轉(zhuǎn)將會(huì)抵著彈性護(hù)罩1081推出磁體保持架1136和壓縮加油杯1130(到圖中的左側(cè))，以對(duì)臨近壓縮加油杯1130的腔室施加壓縮力。因此，該腔室被壓縮成液體從該腔室移出，同時(shí)磁體處于“打開(kāi)”位置，以?shī)A持和保持該腔室內(nèi)的磁性顆粒，例如在磁分離過(guò)程的漂洗步驟期間。當(dāng)壓縮加油杯1130通過(guò)導(dǎo)螺桿1096和磁體保持架1136延伸時(shí)，緊密連接于該壓縮加油杯的致動(dòng)件140(例如，螺合在一起的兩個(gè)部件)也移動(dòng)到延伸位置(附圖中的右側(cè))。汽缸1110、1112的活塞1116與致動(dòng)件1140—起被動(dòng)地運(yùn)動(dòng)。當(dāng)磁體保持架1136被導(dǎo)螺桿1096縮回的時(shí)候，在汽缸1110、1112中的彈簧(未示出)使得致動(dòng)件1140和壓縮加油杯1130返回到圖中所示的收縮位置。磁體致動(dòng)器1090還起壓縮式防震墊的作用，用于當(dāng)磁體處于“關(guān)閉”位置時(shí)將壓縮力施加于容器的一個(gè)腔室，以迫使該腔室所含有的液體物質(zhì)。這是通過(guò)將導(dǎo)螺桿1096轉(zhuǎn)換為將磁體保持架1136收回到“關(guān)閉”位置(圖中右側(cè))并且然后對(duì)汽缸1110、1112的活塞1116施加壓力以延伸活塞，并且因而抵著護(hù)罩1081延伸致動(dòng)器件1140和壓縮加油杯1130(圖中左側(cè))以壓縮臨近該壓縮加油杯1130的一腔室來(lái)完成的，該護(hù)罩1081針對(duì)壓縮加油杯1130的往復(fù)伸出而拉伸或者偏轉(zhuǎn)。由于致動(dòng)件1140被延伸，所以已經(jīng)收回到(右偵1J)與該致動(dòng)件1140相接觸的磁體保持架1136將也在延伸的方向上運(yùn)動(dòng)。為了適應(yīng)磁體保持架1136的運(yùn)動(dòng)，導(dǎo)螺桿1096的端部能夠與聯(lián)接器1098滑動(dòng)(S卩，導(dǎo)螺桿1096“浮動(dòng)”在連接器1098內(nèi))。當(dāng)從活塞1116移除壓力時(shí)，汽缸1110、1112中的彈簧縮回致動(dòng)件1140和壓縮加油杯1130。儀器1000的溫度控制系統(tǒng)在圖20中示出，并且包括設(shè)置在隔熱框架1048中的導(dǎo)熱元件1040、1042、1044。導(dǎo)熱元件優(yōu)選由諸如銅或鋁的導(dǎo)熱材料制成，而隔熱框架1048優(yōu)選由諸如UltemE)和Delrin的隔熱材料制成。在示出的實(shí)施例中，每個(gè)導(dǎo)熱元件1040、1042、1044的大小和形狀都設(shè)計(jì)成與包含超過(guò)一個(gè)腔室的容器300的一區(qū)域熱連通。此外，每個(gè)導(dǎo)熱元件1040、1042、1044的至少一部分都緊挨著相鄰導(dǎo)熱元件的至少一部分，以便由一個(gè)導(dǎo)熱元件包圍的腔室緊挨著由相鄰導(dǎo)熱元件包圍的腔室，并且這兩個(gè)腔室通過(guò)入口連接，同時(shí)沒(méi)有通路在這兩個(gè)腔室之間延伸。通過(guò)隔熱框架1048提供的絕緣而促進(jìn)了在該相鄰導(dǎo)熱元件之間的這種緊靠，而在該相鄰元件之間沒(méi)有熱串?dāng)_。容器300在儀器1000內(nèi)被保持在致動(dòng)板1080與隔熱框架1048之間的工作位置中(見(jiàn)圖14和圖15)。該致動(dòng)板1080與隔熱框架1048在儀器1000中的布置導(dǎo)致了在其之間存在容器容納間隙，并且使得該間隙相對(duì)于容器300的尺寸為當(dāng)容器的臨近導(dǎo)熱元件1040、1042和1044其中之一的腔室填充液體時(shí)，該腔室膨脹以增加在該腔室的表面與該臨近的導(dǎo)熱元件之間的熱接觸。佩爾捷設(shè)備1050、1052、1054定位成分別與導(dǎo)熱元件1040、1044、1042熱接觸。溫度傳感器1056、1058、1060定位成分別與導(dǎo)熱元件1040、1042、1044熱接觸，用于感測(cè)各導(dǎo)熱元件的溫度。該溫度傳感器1056、1058、1060可以包括RTD傳感器，并且聯(lián)接到用于控制佩爾捷設(shè)備的操作的控制器(例如，溫度控制器722)。也可以使用除了佩爾捷設(shè)備之外的其他加熱元件，諸如電阻箔加熱器。該佩爾捷設(shè)備1050、1052、1054(或者其他的加熱或冷卻元件)優(yōu)選安裝到熱沉1062上，該熱沉1062可以包括具有第一部分1064的鋁塊，該第一部分具有佩爾捷設(shè)備安裝在其上的第一平面?zhèn)龋灰约皬南鄬?duì)側(cè)伸出的散熱風(fēng)扇1066。罩1068部分地覆蓋熱沉1062的散熱風(fēng)扇1066，并且安裝在風(fēng)扇外殼1070內(nèi)的冷卻風(fēng)扇定位成用于將空氣抽入到罩1068中并且通過(guò)散熱風(fēng)扇1066。佩爾捷設(shè)備1050、1052、1054可以選擇性地操作以加熱或者冷卻導(dǎo)熱元件1040、1044、1042，從而加熱或者冷卻任何腔室所含的物質(zhì)或者容器300的靠近各自導(dǎo)熱元件的腔室的部分所含的物質(zhì)。導(dǎo)熱元件1040、1044、1042，以及隔熱框架1048處于相對(duì)于囊300固定的位置。當(dāng)將該囊300插入到儀器1000的狹槽1014中時(shí)，該囊300設(shè)置為靠近導(dǎo)熱元件1040、1042和1044。當(dāng)用物質(zhì)填充腔室時(shí)，柔性囊的該腔室將擴(kuò)展到導(dǎo)熱元件中，從而提供與臨近該腔室的導(dǎo)熱元件的更完全的物理接觸以及熱接觸。用容器10或300以及儀器100或1000執(zhí)行的分析過(guò)程的結(jié)果通過(guò)測(cè)量樣品的光學(xué)輸出，例如熒光或冷光，來(lái)確定。因此，光學(xué)檢測(cè)器具有穿過(guò)形成在處理單元102的前部120中的開(kāi)口176而伸出的透鏡。在示出的實(shí)施例中，光學(xué)檢測(cè)器是熒光計(jì)500。替換的檢測(cè)器可以輕易地適用于示出的儀器，包括感測(cè)電變化或者諸如質(zhì)量、顏色或者濁度的物理性質(zhì)上的變化的檢測(cè)器。體現(xiàn)本發(fā)明各方面的熒光計(jì)的細(xì)節(jié)如圖6、圖7、圖8a_c以及圖9a_c所示。該熒光計(jì)500包括一起安裝到基板580上的前外殼502和后外殼520。前外殼502部分包圍內(nèi)部透鏡腔室506并且包括具有大致圓柱形狀的上部桶504。該上部桶504延伸到形成在儀器100內(nèi)的致動(dòng)板124的開(kāi)口176(見(jiàn)圖3)中，或者延伸到形成在儀器3000的歧管1082的開(kāi)口(見(jiàn)圖14和18)上。前外殼502進(jìn)一步包括三個(gè)安裝支腳510，用于將熒光計(jì)500固定到儀器內(nèi)的致動(dòng)板124上，或者固定到儀器1000的歧管1082上。后外殼520通過(guò)機(jī)械緊固件等在前外殼502下面安裝到基板580上。在示出的實(shí)施例中，后外殼520包括從其一端延伸到其相對(duì)端的四個(gè)光導(dǎo)管。具體地，后外殼包括第一發(fā)射導(dǎo)管522、第二發(fā)射導(dǎo)管524、第一激發(fā)導(dǎo)管526和第二激發(fā)導(dǎo)管528。后外殼520是示例性的；熒光計(jì)500可以包括一個(gè)或者多個(gè)發(fā)射導(dǎo)管和一個(gè)或者多個(gè)激發(fā)導(dǎo)管。后外殼520的進(jìn)一步細(xì)節(jié)如圖6和圖7a_c所示。在后外殼520中，兩個(gè)激發(fā)導(dǎo)管526和528是相同的并且兩個(gè)發(fā)射導(dǎo)管522和524是相同的。每個(gè)激發(fā)導(dǎo)管526、528都包括具有大致直角三角形形狀的橫截面的第一部分532，該直角三角形具有圓角和凸圓的斜邊。這種形狀的目的是為了限制后外殼520的重量。該形狀僅僅是優(yōu)選的；該激發(fā)導(dǎo)管也可以使用其他的橫截面形狀，包括圓形或者矩形，只要該導(dǎo)管的特征不干擾光的通過(guò)即可。激發(fā)導(dǎo)管526、528進(jìn)一步包括大致圓柱形形狀的第二部分534。圓形通道536連接第一部分532與第二部分534，并且該通道536的直徑小于第二部分534的直徑，從而在第二部分534中形成了環(huán)形透鏡架。最后，激發(fā)導(dǎo)管526、528包括形成在第二部分534的端部處的O形環(huán)座538。每個(gè)發(fā)射導(dǎo)管522、524都包括具有大致直角三角形形狀的橫截面的第一部分552，該直角三角形具有圓角和凸圓的斜邊。發(fā)射導(dǎo)管522、524還包括大致圓柱形形狀的第二部分554。圓形通道556連接第一部分552與第二部分554，并且該通道556的直徑小于第二部分554的直徑，從而在第二部分554中形成了環(huán)形透鏡架560。發(fā)射導(dǎo)管522、524還包括形成在第二部分554的端部處的O形環(huán)座558。最后，環(huán)形光電二極管座562層疊在每個(gè)發(fā)光導(dǎo)管522、524的第一部分的端部552內(nèi)。前外殼502和后外殼520優(yōu)選由6061T6鋁機(jī)械加工而成，并且具有黑色陽(yáng)極氧化精加工。或者，該前外殼和后外殼可以用能夠經(jīng)受儀器內(nèi)的溫度環(huán)境并且提供不間斷的光導(dǎo)管的任何材料而單獨(dú)地或者作為單一的集成單元來(lái)模制或者鑄造?；?80包括前印刷電路板(“PCB”)582和后印刷電路板(“PCB，，)586。前PCB582和后PCB586以固定的、間隔開(kāi)的關(guān)系由延伸通過(guò)圓柱形隔板元件584的機(jī)械緊固件(例如，螺栓、螺釘)固定在一起。用于PCB’s582、584的示例性電路的細(xì)節(jié)在下面描述。參考圖％，第一激發(fā)光學(xué)元件安裝在后外殼520的第一激發(fā)導(dǎo)管526中。第一激發(fā)光學(xué)元件包括第一光發(fā)射二極管(“LED”)616，其設(shè)置在第一激發(fā)導(dǎo)管526的第一部分532的一端處并且安裝到基板580的前PCB582上。可以是準(zhǔn)直透鏡的第一激發(fā)透鏡618坐落在第一激發(fā)導(dǎo)管526的第二部分534中的透鏡座540上。第一激發(fā)濾光片622定位在第一激發(fā)導(dǎo)管526的端部處并且與第一激發(fā)透鏡618串聯(lián)(即，沿著第一激發(fā)透鏡618的光軸)對(duì)齊。第一激發(fā)濾光片622和第一激發(fā)透鏡618通過(guò)墊圈620而彼此分離，該墊圈優(yōu)選由鋁制成，同時(shí)黑色陽(yáng)極氧化精加工。第一激發(fā)導(dǎo)管526與相關(guān)的光學(xué)元件一起，共同認(rèn)為是第一激發(fā)通道。類(lèi)似地，第二激發(fā)光學(xué)元件安裝在后外殼520的第二激發(fā)導(dǎo)管528中。第二激發(fā)光學(xué)元件包括第二LED632，其設(shè)置在第二激發(fā)導(dǎo)管528的第一部分532的一端處并且安裝到基板580的前PCB582上。可以是準(zhǔn)直透鏡的第二激發(fā)透鏡634坐落在第二激發(fā)導(dǎo)管528的第二部分534中的透鏡座540上。第二激發(fā)濾光片638定位在第二激發(fā)導(dǎo)管528的端部處并且與第二激發(fā)透鏡634串聯(lián)(即，沿著第二激發(fā)透鏡634的光軸)對(duì)齊。第二激發(fā)濾光片638和第二激發(fā)透鏡634通過(guò)墊圈636而彼此分離，該墊圈優(yōu)選由鋁制成，同時(shí)黑色陽(yáng)極氧化精加工。第二激發(fā)導(dǎo)管528與相關(guān)的光學(xué)元件一起，共同認(rèn)為是第二激發(fā)通道。參考圖9c，第一發(fā)射光學(xué)元件安裝在后外殼520的第一發(fā)射導(dǎo)管522中。第一發(fā)射光學(xué)兀件包括安裝在光電二極管支架648中的第一光電二極管660,該光電二極管支架648設(shè)置在第一發(fā)射導(dǎo)管522的第一部分552中的光電二極管座562內(nèi)，并且安裝到基板580的前PCB582上?？梢允菧?zhǔn)直透鏡的第一發(fā)射透鏡650坐落于第一發(fā)射導(dǎo)管522的第二部分554的透鏡座560上。第一發(fā)射濾光片654定位在第一發(fā)射導(dǎo)管522的端部附近并且與第一發(fā)射透鏡650串聯(lián)(即，沿著第一發(fā)射透鏡的軸線)對(duì)齊。第一發(fā)射濾光片654和第一發(fā)射透鏡650通過(guò)墊圈652而彼此分離，該墊圈優(yōu)選由鋁制成，同時(shí)黑色陽(yáng)極氧化精加工。此外，第一發(fā)射濾光片654通過(guò)附加的墊圈656而與第一發(fā)射導(dǎo)管522的端部分離，該附加的墊圈也優(yōu)選由鋁制成，同時(shí)黑色陽(yáng)極氧化精加工。第一發(fā)射導(dǎo)管522與相關(guān)的光學(xué)元件一起，共同認(rèn)為是第一發(fā)射通道。類(lèi)似地，第二發(fā)射光學(xué)元件安裝在后外殼520的第二發(fā)射導(dǎo)管524中。第二發(fā)射光學(xué)兀件包括安裝在光電二極管支架668中的第二光電二極管662,該光電二極管支架668設(shè)置在第二發(fā)射導(dǎo)管524的第一部分552中的光電二極管座562內(nèi)，并且安裝到基板580的前PCB582上。可以是準(zhǔn)直透鏡的第二發(fā)射透鏡670坐落于第二發(fā)射導(dǎo)管524的第二部分554的透鏡座560上。第二發(fā)射濾光片674定位在第二發(fā)射導(dǎo)管524的端部附近并且與第二發(fā)射透鏡670串聯(lián)(即，沿著第二發(fā)射透鏡的軸線)對(duì)齊。第二發(fā)射濾光片674和第二發(fā)射透鏡670通過(guò)墊圈672而彼此分離，該墊圈優(yōu)選由鋁制成，同時(shí)黑色陽(yáng)極氧化精加工。此外，第二發(fā)射濾光片674通過(guò)附加的墊圈676而與第二發(fā)射導(dǎo)管524的端部分離，該附加的墊圈也優(yōu)選由鋁制成，同時(shí)黑色陽(yáng)極氧化精加工。第二發(fā)射導(dǎo)管524與相關(guān)的光學(xué)元件一起，共同認(rèn)為是第二發(fā)射通道。前外殼圓盤(pán)蓋600設(shè)置在前外殼502與后外殼520之間(見(jiàn)圖6)。前外殼圓盤(pán)蓋600包括在上外殼502(見(jiàn)圖8b，8c)的透鏡腔室506中略微伸出的上升的圓形背脊602。前外殼圓盤(pán)蓋600還包括四個(gè)環(huán)形光口606，當(dāng)安裝該圓盤(pán)蓋600的時(shí)候，每個(gè)環(huán)形光口都與形成在后外殼520中的光導(dǎo)管522、524、526和528的其中之一對(duì)齊。普通透鏡680放置在前外殼502的透鏡腔室506內(nèi)。在一個(gè)實(shí)施例中，熒光計(jì)500僅僅包括單一的、未分割的普通透鏡680，該普通透鏡構(gòu)成在激發(fā)導(dǎo)管和發(fā)射導(dǎo)管外部的熒光計(jì)的唯一的光學(xué)元件。在本文中，“未分割的”是指該普通透鏡專(zhuān)門(mén)由透光材料(例如，玻璃)制成，并且不包括用于重定向或者妨礙光的結(jié)構(gòu)，例如嵌入在和/或應(yīng)用于透鏡的表面以將該透鏡物理地和光學(xué)地劃分為兩個(gè)或者多個(gè)子部分的不透光結(jié)構(gòu)。O形環(huán)682坐落在透鏡腔室506的一端處，并且前外殼圓盤(pán)蓋600的上升的圓形背脊602伸出到透鏡腔室506中，緊壓該O形環(huán)682，以保證在前外殼502與前外殼圓盤(pán)蓋600之間的不透光連接。O形環(huán)624設(shè)置在第一激發(fā)導(dǎo)管526的一端處的O形環(huán)座538中，并且抵著前外殼圓盤(pán)蓋600的后側(cè)壓縮，以提供不透光的連接。類(lèi)似地，O形環(huán)640設(shè)置在第二激發(fā)導(dǎo)管的O形環(huán)座538中，O形環(huán)658設(shè)置在第一發(fā)射導(dǎo)管522的O形環(huán)座558中，而O形環(huán)678設(shè)置在第二發(fā)射導(dǎo)管524的O形環(huán)座558中。O形環(huán)624、640、658、678防止光分別滲透到光導(dǎo)管526、528、522、524中。通過(guò)彌補(bǔ)加工零部件在具體公差內(nèi)的尺寸變化，以及通過(guò)彌補(bǔ)由熱因數(shù)引起的變形，O形環(huán)防止光滲入。在工作中，通過(guò)光發(fā)射二極管616和632發(fā)射激發(fā)光信號(hào)。該信號(hào)優(yōu)選具有與將要檢測(cè)的染料相對(duì)應(yīng)的規(guī)定波長(zhǎng)。來(lái)自二極管616的光透射過(guò)第一激發(fā)導(dǎo)管526,并且撞擊在透鏡618上,該透鏡618將至少一部分該光聚焦到第一激發(fā)濾光片622上。第一激發(fā)濾光片622僅僅通過(guò)具有規(guī)定波長(zhǎng)(或者規(guī)定范圍的波長(zhǎng))的光，并且將不希望的波長(zhǎng)從該透射的光移除。濾過(guò)光通過(guò)普通透鏡680前進(jìn)，該普通透鏡680通過(guò)前外殼502的上部桶504將至少部分該光散焦，其中激發(fā)光撞擊在儀器100中的容器10的腔室中(例如，腔室C28)。假設(shè)在上述腔室中存在第一分析物或者分析物組，那么與樣品混合并且適于檢測(cè)第一分析物(分析物組)的存在的第一粘接劑或者粘接劑組的染料將發(fā)熒光。一部分熒光發(fā)射進(jìn)入上部桶504，并且然后穿過(guò)普通透鏡680，該普通透鏡680將熒光發(fā)射的至少一部分引導(dǎo)至第一發(fā)射導(dǎo)管522中。進(jìn)入第一發(fā)射導(dǎo)管522的光通過(guò)第一發(fā)射濾光片654，第一發(fā)射濾光片654該將過(guò)濾不希望波長(zhǎng)的發(fā)射光。濾過(guò)的發(fā)射光然后穿過(guò)透鏡650并且最終到光電二極管660上，該光電二極管將以規(guī)定的波長(zhǎng)檢測(cè)光的存在。類(lèi)似地，由二極管632發(fā)射的激發(fā)光信號(hào)透射過(guò)第二激發(fā)導(dǎo)管528并且撞擊在透鏡634上,該透鏡634將至少一部分該光聚焦到第二激發(fā)濾光片638上。第二激發(fā)濾光片638僅僅通過(guò)具有規(guī)定波長(zhǎng)(或者規(guī)定范圍的波長(zhǎng))的光，并且將不希望的波長(zhǎng)從該透射的光移除。濾過(guò)光通過(guò)普通透鏡680前進(jìn)，該普通透鏡680通過(guò)前外殼502的上部桶504將至少部分該光聚焦，其中激發(fā)光撞擊在儀器100中的容器10的腔室中(例如，腔室C28)。假設(shè)在上述腔室中存在第二分析物或者分析物組，那么與樣品混合并且適于檢測(cè)第二分析物(分析物組)的存在的第二粘接劑或者粘接劑組的染料將發(fā)熒光。一部分熒光發(fā)射進(jìn)入上部桶504，并且然后穿過(guò)普通透鏡680，該普通透鏡680將熒光發(fā)射的至少一部分引導(dǎo)至第二發(fā)射導(dǎo)管524中。進(jìn)入第二發(fā)射導(dǎo)管524的光通過(guò)第二發(fā)射濾光片674，該第二發(fā)射濾光片將過(guò)濾不希望波長(zhǎng)的發(fā)射光。濾過(guò)的發(fā)射光然后穿過(guò)透鏡670并且最終到光電二極管662上，該光電二極管將以規(guī)定的波長(zhǎng)檢測(cè)光的存在。由光電二極管檢測(cè)的光發(fā)射利用已知的算法轉(zhuǎn)換成這樣的信號(hào)，該信號(hào)能夠提供關(guān)于樣品中的一種分析物或者多種分析物的存在或者數(shù)量的定性或者定量信息。定量算法的實(shí)例可以在上面的“使用”部分識(shí)別。在示出的實(shí)施例中，在后外殼520中，激發(fā)導(dǎo)管526、528定位成彼此相對(duì)，并且激發(fā)導(dǎo)管522、524定位成彼此相對(duì)，以使得通過(guò)發(fā)射濾光片的激發(fā)光的背景最小。然而，激發(fā)導(dǎo)管526、528和發(fā)射導(dǎo)管522、524可以定位成彼此靠近。熒光計(jì)500包括兩個(gè)激發(fā)通道和兩個(gè)發(fā)射通道，其允許該熒光計(jì)區(qū)別地檢測(cè)以不同的波長(zhǎng)激發(fā)的兩種染料或者報(bào)告部分。來(lái)自這些不同染料的光發(fā)射在不存在目標(biāo)(例如，表示存在分析物、控制或者擴(kuò)增產(chǎn)物的任何一種的分析物、控制或者擴(kuò)增產(chǎn)物)時(shí)通常被抑制。該染料可以包括，例如，N，N，N’N’_四甲基-6-羧基羅丹明(“TAMRA”)和6-羧基熒光素(“FAM”)或者6-羧基-X-羅丹明(“R0X”)和2’7’-二甲氧基-4’5-二氯-6-羧基熒光素(“JOE”)。DABCYL是有用的抑制劑部分，用于在不存在目標(biāo)時(shí)抑制來(lái)自任何這些染料的光發(fā)射。因此，該儀器能夠區(qū)分兩種不同分析物或者分析物組，或者能夠區(qū)分分析物或分析物組與內(nèi)部控制。然而，認(rèn)為體現(xiàn)本發(fā)明各方面的熒光計(jì)包括大約兩個(gè)激發(fā)通道或者發(fā)射通道，同時(shí)激發(fā)通道的數(shù)目和發(fā)射通道的數(shù)目是相同的。選用為激發(fā)通道和發(fā)射通道的具體光學(xué)部件依賴(lài)于將要檢測(cè)的染料熒光的波長(zhǎng)。對(duì)于染料FAM，例如，對(duì)激發(fā)通道適合的LED可以從加利福尼亞的貝瑞阿市的Kingbright公司作為零件N0.L7113PBCH買(mǎi)到，并且對(duì)該染料適合的激發(fā)濾波片可以從紐約的羅徹斯特市的Semrock買(mǎi)到，作為零件N0.FFO1-485/20-9.0-D。對(duì)于該染料，對(duì)發(fā)射通道適合的光電檢測(cè)器可以從加利福尼亞州的Hawthorne市的OSIOptoeletronics公司買(mǎi)到，作為模型N0.PIN-44DI,并且適合的發(fā)射濾波片可以從Semrock買(mǎi)到，作為零件N0.FF01-531/20-9.0-D。對(duì)于染料TAMRA來(lái)說(shuō)，例如，對(duì)激發(fā)通道適合的LED可以從加利福尼亞的Torrance市的NichiaAmerica公司買(mǎi)到,作為模型N0.NSPG500S,并且適合的激發(fā)濾波片可以從Semrock買(mǎi)到，作為零件N0.FFO1-543/22-9.0-D0對(duì)于該染料，對(duì)發(fā)射通道適合的光電檢測(cè)器可以從OSIOptoeletronics公司買(mǎi)到，作為模型N0.PIN-44DI，并且適合的發(fā)射濾波片可以從Semrock買(mǎi)到，作為零件N0.FF01-587/11-9.0-D。因此，體現(xiàn)本發(fā)明各方面的熒光計(jì)能夠激發(fā)并且檢測(cè)多種不同的信號(hào)(例如不同波長(zhǎng))，而不相對(duì)于樣品運(yùn)動(dòng)或者不同的激發(fā)通道和發(fā)射通道不相對(duì)于彼此運(yùn)動(dòng)。此外，熒光計(jì)相對(duì)于致動(dòng)板和儀器中攜帶的腔室的檢測(cè)腔室的布置使得該熒光計(jì)能夠?qū)⒓ぐl(fā)信號(hào)導(dǎo)向至檢測(cè)腔室，并且檢測(cè)從該檢測(cè)腔室的發(fā)射，而不使用光纖。此外，由熒光計(jì)限定的光學(xué)通道(激發(fā)通道和發(fā)射通道)在其整個(gè)范圍內(nèi)都是平行的，因而激發(fā)光可以朝著樣品發(fā)送，并且可以檢測(cè)到來(lái)自樣品的發(fā)射，而無(wú)需使用基本重定向所有撞擊在該反射元件上的光的反射元件(例如，鏡子)或者諸如二色分光鏡的光特性分離元件，該光特性分離元件重定向具有第一光特性(例如，波長(zhǎng))的一部分光信號(hào)并且發(fā)送具有第二光特性的另一部分光信號(hào)。圖21-26示出了合適的電路的一個(gè)實(shí)施例。該電路設(shè)置為用針對(duì)經(jīng)由串行接口遠(yuǎn)程通信的宏命令所選的工作模式、做出的測(cè)量以及報(bào)告的結(jié)果來(lái)局部控制熒光計(jì)500。圖21表示包括互聯(lián)裝置和若干供電電路的電路。圖22表示包括控制、處理和通訊裝置的電路，包括編程和調(diào)試處理器裝置的電路，和提供穩(wěn)定的基準(zhǔn)電壓的電路。圖23表示包括電壓測(cè)量電路和提供LED強(qiáng)度和調(diào)制的處理器控制的裝置的電路。圖24表示包括激發(fā)裝置(LED)、RF罩和用于敏感的前置放大器電路的補(bǔ)充電源濾波器(在下面的圖中描述)。圖25A和圖25B代表兩種類(lèi)似的前端放大器電路的實(shí)施例(在下文解釋其區(qū)別)，所述前端放大器電路將來(lái)自腔室內(nèi)容物的調(diào)制光學(xué)信號(hào)轉(zhuǎn)化成為調(diào)制電壓。圖26表示將調(diào)制和放大的信號(hào)轉(zhuǎn)化成為與調(diào)制光學(xué)信號(hào)的振幅成正比的類(lèi)似電壓的解調(diào)電路。該實(shí)施例包含了調(diào)制/解調(diào)方案，其使得該電路能夠?qū)⒉ㄩL(zhǎng)落在濾光片的帶通范圍內(nèi)的變化的背景環(huán)境光的效應(yīng)除去，該濾光片物理放置在光電二極管Dl(660)(圖25A)和光電二極管D2(662)(圖25B)與被查詢(xún)的腔室之間。微處理器U4(圖22)產(chǎn)生時(shí)鐘(在本實(shí)施例中設(shè)定為275Hz)，該時(shí)鐘用于交替地調(diào)制LEDl(616)和LED2￠32)同時(shí)控制模擬開(kāi)關(guān)U7(圖26)的極性。通過(guò)以相同的頻率和與LED(LED1(616)或LED2(632))的調(diào)制同相地交替模擬開(kāi)關(guān)U7的極性，創(chuàng)建配合的發(fā)射器/接收器對(duì)。只有以相同頻率并且與時(shí)鐘同相地到達(dá)的這些光信號(hào)才會(huì)以完全增益放大，而所有背景光和以不同的頻率調(diào)制的其他光信號(hào)被抑制。在圖21中，Jl將主要的互連裝置提供到電路。器件Dl和D6通過(guò)吸收經(jīng)由與外部電路的該連接而施加到該電路的瞬變電壓來(lái)保護(hù)該電路。集成電路Ul和相關(guān)的元件(Cl、C3-C5以及R4-R7)形成了提供用于該電路的正模擬電源的可調(diào)節(jié)的電壓調(diào)節(jié)器。集成電路U16和相關(guān)元件(C2、C51-C52以及R58-R59)形成了提供用于該電路的負(fù)模擬電源的可調(diào)節(jié)的電壓調(diào)節(jié)器。獨(dú)立的+5V電源(U2和相關(guān)部件C7和C10-C11)形成了數(shù)字電源。最后，設(shè)置若干分阻器對(duì)(R4/R5，R8/R9，R10/R11,以及R56/R57)，以將每個(gè)電源的電壓電平轉(zhuǎn)換成在A/D轉(zhuǎn)換器的轉(zhuǎn)換范圍內(nèi)的電壓，該轉(zhuǎn)換器設(shè)置在微處理器(U4)中。在圖22中，微處理器U4對(duì)該電路提供主要的控制和處理裝置。多個(gè)電容器(C15-C19)對(duì)所述器件提供電源旁路。該電路的上電復(fù)位通過(guò)結(jié)合在微處理器中的電路來(lái)實(shí)現(xiàn)，然而，該微處理器可以通過(guò)使用按鈕開(kāi)關(guān)SWl(與上拉電阻R15相結(jié)合)而手動(dòng)復(fù)位。二極管D3設(shè)置成保護(hù)電路以免遭與復(fù)位開(kāi)關(guān)的不接地接觸相關(guān)的潛在的靜電放電。晶體Yl和相關(guān)元件(C20和C21)對(duì)該電路提供穩(wěn)定的時(shí)基和時(shí)鐘。微處理器(U4)與外部電路之間的通信通過(guò)使用集成電路U5和相關(guān)元件(C23-C25)來(lái)實(shí)現(xiàn)，將微處理器內(nèi)外的TTL電平串行信號(hào)轉(zhuǎn)換成遵照RS-232標(biāo)準(zhǔn)的信號(hào)。該電路的編程和調(diào)試通過(guò)使用編程接口(元件J2，C22和D4-D5)來(lái)實(shí)現(xiàn)?？梢曋甘酒髟O(shè)置為指示“上電”(元件LEDl和R13)和“狀態(tài)”(利用微處理器U4提供的打開(kāi)/關(guān)閉控制的元件LED2和R14)。最后，設(shè)置精密電壓基準(zhǔn)電路(元件U3，C9，以及C12-C13)，以建立用于A/D轉(zhuǎn)換器(并入在微處理器U4中)的穩(wěn)定基準(zhǔn)，以及對(duì)外部A/D轉(zhuǎn)換器Ull和D/A轉(zhuǎn)換器U12的穩(wěn)定基準(zhǔn)。在圖23中，集成電路Ull和U12在該器件的模擬電路與微處理器U4提供一接口。這兩個(gè)器件都是通過(guò)經(jīng)由其串行外圍接口(SPI)與微處理器U4通信來(lái)控制的。A/D轉(zhuǎn)換器Ull將來(lái)自解調(diào)濾波器(圖26)的微分模擬信號(hào)轉(zhuǎn)換成具有24位分別率(帶符號(hào)的，具有每位大約0.5μA的分辨率)的數(shù)字結(jié)果。D/A轉(zhuǎn)換器U12接收來(lái)自微處理器的數(shù)字設(shè)定，并且關(guān)于其輸出設(shè)定對(duì)應(yīng)的模擬電壓，該模擬電壓是隨后用于調(diào)節(jié)LED電流的電壓。DAC輸出電壓用低通濾波器(元件C45和R37-R38)連接到降低該輸出控制電壓的分阻器，導(dǎo)致該電路能夠以20μA/位的分辨率控制在O到80mA的范圍內(nèi)的電流。下面是兩個(gè)相同的電路，一個(gè)用于FAMLED驅(qū)動(dòng)，另一個(gè)用于TAMLED驅(qū)動(dòng)。在圖23和圖24中，電路設(shè)置成直接調(diào)節(jié)和調(diào)制通過(guò)激勵(lì)LED(LED1(616)和LED2(632))的電流。該激勵(lì)LED的能量源于+12V的電源。LED電流首先流經(jīng)減小電源的電勢(shì)的電阻R3及電容C3，將開(kāi)關(guān)電流載荷的濾波提供到已調(diào)制的LED。電流然后流經(jīng)LED(LEDI(616)或LED2(632))，并且之后流經(jīng)FET晶體管(Q3或Q4)的漏極通道。最后，該LED電流通過(guò)反饋電阻(R53或R54)，該反饋電阻產(chǎn)生與通過(guò)該LED的電流成比例的電壓。參考圖23，通過(guò)使用由運(yùn)算放大器(U13或U14)、FET晶體管(Q3或Q4)、反饋電阻(R53或R54)組成的傳統(tǒng)反饋電路來(lái)完成經(jīng)過(guò)LED的電流的控制。當(dāng)在運(yùn)算放大器的兩個(gè)輸出端的電勢(shì)相等時(shí)，完成控制。如果在運(yùn)算放大器的反相輸出端的電壓下降到同相輸出端的電壓以下，那么在該運(yùn)算放大器的輸出端的電壓增加。輸出電壓的這種增加入射在FET晶體管的柵極上，這于是開(kāi)始引導(dǎo)更多的電流。經(jīng)過(guò)反饋電阻的電流的增加導(dǎo)致了該電阻兩端的電壓增加以及運(yùn)算放大器的反相輸入的電壓的相應(yīng)增加，完成了反饋循環(huán)。此外，為了控制LED的開(kāi)關(guān)(調(diào)制或者上電/斷電)，設(shè)置迫使運(yùn)算放大器飽和或者不飽和的電路(Ql或Q2以及相關(guān)的元件)，從而分別控制FET晶體管的(Q3或Q4)的打開(kāi)和斷開(kāi)。為了“抑制”LED電流，在FET晶體管(Ql或Q2)的柵極處的電勢(shì)比該FET晶體管的源端處的電壓低若干伏特。這相應(yīng)地使得電流能夠流經(jīng)該FET并且進(jìn)入到在運(yùn)算放大器的反相輸入端處形成的電路節(jié)點(diǎn)，從而使得在該節(jié)點(diǎn)處的電壓上升到大約2.5V。該運(yùn)算放大器的輸出電壓隨后下降到O伏特，并且FET晶體管(Q3或Q4)與各自的LED—起斷開(kāi)。為了“保證”LED電流，在FET晶體管(Ql或Q2)的柵極處的電勢(shì)保持為等于或者略低于該晶體管的源極處的電壓的電壓。這保持了該晶體管“斷開(kāi)”，同時(shí)沒(méi)有電流流經(jīng)該FET而進(jìn)入到在運(yùn)算放大器的反相輸入端處的電路節(jié)點(diǎn)。此時(shí)，運(yùn)算放大器的反相輸入端處的電壓等于反饋電阻(R53或R54)兩端的電壓，并且，該電壓此時(shí)追蹤由DAC電路施加到該運(yùn)算放大器的同向輸入端的電壓。LED電流控制為與上述施加的電壓成比例。在圖23中，通過(guò)使用電路探測(cè)LED兩端的電壓和流經(jīng)該LED的電流來(lái)監(jiān)測(cè)LED狀態(tài)。電阻R51和R52在微處理器U4的A/D轉(zhuǎn)換器(見(jiàn)，圖22)與各自的反饋電阻(R53和R54)之間提供低阻抗路徑；由A/D電路測(cè)量的這些電阻兩端的電壓與LED電流成比例。此夕卜，LED電壓可以通過(guò)使用由運(yùn)算放大器U15和相關(guān)元件組成的電壓緩沖電路來(lái)確定。分阻器電路(R47/R49或R48/R50)依照緩沖放大器使得電壓下降到在A/D轉(zhuǎn)換器的轉(zhuǎn)換范圍之內(nèi)的電平。通過(guò)將從該緩沖放大器減小的電壓加上在各自的反饋電阻兩端所測(cè)量的電壓(等于降壓電阻R3兩端的電壓)，然后從+12V電源的測(cè)量值中減去上述相加的結(jié)果(對(duì)于每個(gè)測(cè)量有具體的權(quán)重)，計(jì)算出LED電壓。在圖23中，示出了改善瞬態(tài)刺激(內(nèi)部產(chǎn)生和外部產(chǎn)生的)的電路排斥的附加特征。設(shè)置RF屏蔽E1，以保護(hù)圖25A和圖25B示出的電路免受電磁的或者無(wú)線頻率的干擾。設(shè)置兩個(gè)保護(hù)電路(E8和E9)，以防止在載流導(dǎo)體之間的電流泄漏到LED(LEDU616)和LED2(632))和圖25A和圖25B示出的敏感電路。這些保護(hù)電路是由露出的地面軌跡構(gòu)成，該露出的地面軌跡在電路板的外側(cè)層上、臨近并且環(huán)繞露出的襯墊和連接于LED的軌跡。最后，利用四個(gè)低通濾波器(Rl/Cl，R2/C2，R26/C20和R27/C21)以提供關(guān)于用于前置放大器(圖24A和25B的Ul和U2)的電源的電源噪聲的附加衰減?，F(xiàn)在參考圖25A和圖25B，光電二極管(Dl(660)或D2^62))將入射光(背景照明和來(lái)自被查詢(xún)的腔室所含物質(zhì)的調(diào)制熒光信號(hào))轉(zhuǎn)換為供給到連接于運(yùn)算放大器(Ul或U2)的反相輸入的電路節(jié)點(diǎn)的電流。元件D3和R4-R6(圖25A;以及圖25B中的D4和R7-R9)在該光電二極管的節(jié)點(diǎn)上產(chǎn)生了偏壓；較高的偏壓增加了通過(guò)二極管的暗電流，同時(shí)減小了光電二極管噪聲。接下來(lái)，設(shè)置補(bǔ)償電路(U3A和U4A和相關(guān)元件)，其產(chǎn)生與由環(huán)境光引起的來(lái)自光電二極管的電流相等的偏置電流。當(dāng)環(huán)境光可以從光電二極管產(chǎn)生比由調(diào)制熒光信號(hào)引起的電流的幅值大多個(gè)數(shù)量級(jí)的電流時(shí)，這種補(bǔ)償是尤其重要的。在沒(méi)有校正的情況下，環(huán)境光的電平上的任何變化都可以導(dǎo)致測(cè)量的偏置。此外，在沒(méi)有補(bǔ)償?shù)那闆r下，光電二極管的與環(huán)境光有關(guān)的電流很可能使得前置放大器電路的輸出飽和。最后，設(shè)置跨阻放大器電路(Ul或U2以及相關(guān)元件)，其產(chǎn)生足以獲得/匯集任何來(lái)自光電二極管的附加電流的電壓。來(lái)自該放大器(Ul或U2)的電壓與來(lái)自光電二極管的電流成比例，該來(lái)自光電二極管的電流是由于來(lái)自被查詢(xún)的腔室所含物質(zhì)的調(diào)制光信號(hào)引起的。此外，有很少量的信號(hào)與環(huán)境背景光(其由隨后的解調(diào)電路濾除)的變化有關(guān)。由于跨阻放大器的高增益和被測(cè)量的小信號(hào)，前述段落中所述的電路會(huì)受到由于溫度和濕度引起的偏移的嚴(yán)重影響。為了使得上述作用最小，在制備電路板582、586時(shí)考慮了大量的設(shè)計(jì)和處理方法。首先，所有的電路路徑和元件都定位成距離其他的電路盡可能遠(yuǎn)。第二，已經(jīng)將印刷電路阻焊劑從底部元件R12-R15和C16-C17清除。這在電路板與各元件之間提供了更大的間隙，使得在樣品處理過(guò)程期間清洗劑和漂洗劑能夠通過(guò)。第三，R12-R15選擇使用圓柱形電阻(MELF型)(再一次使得各元件與電路板之間的間隙最大化)。最后，為了使得在組裝后殘留在電路板上的污點(diǎn)和剩余焊劑的量最小，電路板首先用對(duì)在焊接過(guò)程中使用的焊料/焊劑適合的皂化劑清洗，然后用去離子水漂洗。光電二極管Dl(660)和D2(662)優(yōu)選用“免洗”焊芯焊接到電路板上(在完成上述組裝過(guò)程之后)。在該最后的焊接過(guò)程之后殘留在電路板上的剩余焊劑提供了保護(hù)屏障，因此優(yōu)選不將其移除。再次參考圖25A和圖25B，放大器U3B和U4B(以及相關(guān)元件)提供了額外的信號(hào)放大。此外，反饋元件R22和C18形成了在放大器電路中的簡(jiǎn)單的低通濾波器(衰減34KHz以上的信號(hào))?？紤]補(bǔ)償反饋電路(在圖25A和25B中表示為“伺服反饋”)，運(yùn)算放大器U3A和U3B(以及相關(guān)元件)構(gòu)造成具有大約5Hz的截止頻率的集成放大器。這些放大器的輸出電壓在電路中產(chǎn)生了DC偏流和其他自然DC偏置，該DC偏流將來(lái)自光電二極管(Dl(660)或D2^62))的由于背景環(huán)境光引起的那部分電流求反。這產(chǎn)生了(在U3B或U4B處的)輸出信號(hào)具有ODC電壓元件的輸出信號(hào)，即，信號(hào)集中在OV左右。在圖25A中，當(dāng)使用TAM電路(圖25B)時(shí)，元件R28和C22(與來(lái)自微處理器的數(shù)字控制信號(hào)“伺服使能”相結(jié)合)用于禁止補(bǔ)償放大器(僅僅U3A)集成。這是因?yàn)長(zhǎng)ED2的(632)(TAM)的輸出頻譜與光電二極管DU660)前面的濾光片的帶通重疊。如果沒(méi)有上述禁止特征，F(xiàn)AM檢測(cè)器/放大器電路(圖25A)將集成用于TAM電路(圖25B)的激勵(lì)信號(hào)，導(dǎo)致了當(dāng)將電路切換回測(cè)量FAM響應(yīng)時(shí)的過(guò)渡(circuitsettling)時(shí)間更長(zhǎng)。在FAM補(bǔ)償電路(U3A和相關(guān)元件)中禁止集成的功能是通過(guò)設(shè)定從微處理器U4輸出到源地(activeground)的“伺服使能”來(lái)實(shí)現(xiàn)的。在其他時(shí)刻，來(lái)自微處理器的數(shù)字信號(hào)是三態(tài)的，并且元件R28和C22不影響電路的工作。參考圖26，整個(gè)電路采用以與各自的LED相同的頻率調(diào)制的輸入AC信號(hào)，并且將該信號(hào)轉(zhuǎn)換為振幅為峰至峰AC電壓的振幅的六倍的DC電壓(參考接地線路)。這兩個(gè)信號(hào)“PREAMP-A”和“PREAMP-B”(從圖25A和圖25B中各自的電路的輸出)連接到固態(tài)的、單電極的、雙向活動(dòng)模擬開(kāi)關(guān)(U6)的兩個(gè)觸點(diǎn)。“FE-SEL”是判定信號(hào)“PREAMP-A”或“PREAMP-B”是否將通過(guò)開(kāi)關(guān)U6而連接到后面的模擬開(kāi)關(guān)U7的邏輯信號(hào)。模擬開(kāi)關(guān)U7作用為一種緩沖器/轉(zhuǎn)換器，交替地將其兩個(gè)輸入(所選的前置放大器輸出和接地線路)切換到解調(diào)濾波器(運(yùn)算放大器U8，U9和相關(guān)元件)的正極輸入和負(fù)極輸入中的任何一個(gè)。在上述實(shí)施過(guò)程中，解調(diào)開(kāi)關(guān)(U7)與LEC同相切換，使得當(dāng)LED通電的時(shí)候，更多的來(lái)自前置放大器的正信號(hào)被切換成解調(diào)濾波器(通過(guò)電阻R20)的正輸入，并且更多的負(fù)信號(hào)被切換成解調(diào)濾波器(通過(guò)電阻R21)的負(fù)輸入。當(dāng)LED被切斷的時(shí)候，解調(diào)濾波器的連接反轉(zhuǎn)。通過(guò)這種方式，從解調(diào)器和濾波器電路獲得了最大的正增益。繼續(xù)參考圖26，模擬開(kāi)關(guān)U7的輸出連接到具有大約9Hz的截止頻率的低通濾波器(由元件R20、R21和C30組成)。該濾波器的電容器C30對(duì)DC電壓充電，由于前置放大器信號(hào)通過(guò)模擬開(kāi)關(guān)U7的切換，該DC電壓的振幅大約是從前置放大器輸出的解調(diào)信號(hào)的峰至峰振幅的二分之一。后面的有源濾波器(運(yùn)算放大器U8A/B和U9A/B以及相關(guān)元件)包括多極的、具有大約12的增益的低通濾波器。在該濾波器的第一部分中，運(yùn)算放大器U8A/B(和相關(guān)元件)構(gòu)成了具有4的DC增益的差分放大器。該濾波器的輸出通過(guò)具有大約3Hz的截止頻率的低通濾波器(元件R24、R25和C35)。該濾波器的第二有效極包括形成了具有3的DC增益的差分放大器的運(yùn)算放大器U9A/B(和相關(guān)元件)。元件R32和C36形成了用于該濾波器的正極側(cè)的前饋補(bǔ)償路徑，而元件R32和C37形成了用于該濾波器的負(fù)極側(cè)的前饋補(bǔ)償路徑。該濾波器用于衰減來(lái)自前置放大器的落在LED的工作頻率(本實(shí)施例中是275Hz)周?chē)鶬OHz范圍之外的任何和所有信號(hào)。最后，在圖26中，解調(diào)濾波器的輸出饋入到具有均勻增益的差分放大電路(UlO)中。其作用在于將來(lái)自差分濾波器的兩個(gè)信號(hào)之間的差分電壓轉(zhuǎn)換成參考接地線路的正電壓。兩個(gè)輸出信號(hào)“FLU0R0+”和“FLU0R0-”連接到上述的A/D轉(zhuǎn)換器。在某些情況下，需要或者希望將物質(zhì)移出容器的檢測(cè)腔室。在這些情況下，需要將腔室壓縮元件與檢測(cè)器相合并，該檢測(cè)器例如前述的熒光計(jì)500。圖1OA和圖1OB中示出了與檢測(cè)器相合并的該壓縮元件的一個(gè)實(shí)施例。壓縮機(jī)構(gòu)，或者檢測(cè)器致動(dòng)器用附圖標(biāo)記1150表示，并且包括連接于致動(dòng)板124并且從該致動(dòng)板124伸出的支架1152。壓縮管1154位于檢測(cè)器500的透鏡的前面，并且穿過(guò)致動(dòng)板中的開(kāi)口而延伸。該壓縮管1154可以具有安裝在其相對(duì)于檢測(cè)器500的遠(yuǎn)端處的透明窗口1164。致動(dòng)桿1156在與壓縮管1154相對(duì)的方向上橫向延伸。致動(dòng)機(jī)構(gòu)，例如，由通過(guò)氣控管線1160連接于壓力源的桿1162所表不的氣動(dòng)活塞承載在支架1152上并且與致動(dòng)桿1156接合，以移動(dòng)壓縮管1154。導(dǎo)向桿1158穿過(guò)在致動(dòng)桿1156的底端中的開(kāi)口從致動(dòng)板124延伸。抵著致動(dòng)桿1156延伸致動(dòng)機(jī)構(gòu)1162使得壓縮管1154運(yùn)動(dòng)到延伸位置(圖1Ob中的左側(cè)所示)，以抵著門(mén)組件200來(lái)壓縮腔室C。在通過(guò)致動(dòng)機(jī)構(gòu)1162的管的運(yùn)動(dòng)期間，穿過(guò)致動(dòng)桿1156而延伸的導(dǎo)向桿1158有助于將壓縮管1154保持在直線方向，并且有助于防止壓縮管1154的偏移。如果不考慮壓縮管1154的偏移，可以忽略導(dǎo)向桿1158。圖11中示出了用于使壓縮元件與檢測(cè)器相合并的替換機(jī)構(gòu)。在圖11中，檢測(cè)器500安裝在具有基座1174的轉(zhuǎn)移安裝平臺(tái)上或者具有基座1174的滑車(chē)1172上，該基座1174具有分別通過(guò)縱向狹槽1184和1182延伸的導(dǎo)向銷(xiāo)1176和1178。活塞(例如，氣動(dòng)活塞)1180引起滑車(chē)1172和檢測(cè)器500的往復(fù)運(yùn)動(dòng)，并且因此提供了一種用于移動(dòng)整個(gè)檢測(cè)器以與容器腔室相接合或者脫離接合的裝置。圖18示出了與信號(hào)檢測(cè)器500集成的壓縮式防震墊1180的替換實(shí)施例的橫截面。該壓縮式防震墊1180包括設(shè)置在穿過(guò)致動(dòng)板1080而形成的開(kāi)口1083內(nèi)的致動(dòng)器杯(actuatorcup)1182。透明的窗口或檢測(cè)透鏡1184在致動(dòng)器杯1182的前面位于形成在彈性護(hù)罩1081的開(kāi)口內(nèi)。大致圓形的通孔1186通過(guò)致動(dòng)器杯1182而形成在相對(duì)于該致動(dòng)器杯1182的對(duì)稱(chēng)軸的偏心位置處，從而致動(dòng)器杯1182的上部1188形成為比該致動(dòng)器杯1182的下部1190更厚。偏心定位的原因在于在檢測(cè)處理期間檢測(cè)腔室中可以存在額外的空氣，以幫助確保該腔室與設(shè)置在該腔室附近的加熱元件之間的熱接觸，還幫助液體從液體體積小的腔室轉(zhuǎn)移。由于額外的空氣將使得液體朝著“致動(dòng)器區(qū)域”的底部向下流動(dòng)(氣體上升到頂部)，所以將熒光計(jì)500的偏心檢測(cè)透鏡和焦點(diǎn)構(gòu)造成讀取在具有更多液體(因此具有更多熒光)的檢測(cè)區(qū)域的下部中的熒光。在替換的實(shí)施方式中，例如，如果檢測(cè)腔室充滿了液體，那么孔1186穿過(guò)通過(guò)致動(dòng)器杯1182的中心而形成。致動(dòng)器杯1182進(jìn)一步包括從該致動(dòng)器杯1182上徑向相對(duì)的位置延伸的第一徑向凸緣1192和第二徑向凸緣1194。徑向凸緣1192位于從開(kāi)口1083延伸的徑向開(kāi)口1196中，徑向凸緣1194位于從該開(kāi)口1083延伸的徑向開(kāi)口1198中。圓形盲孔1200從徑向開(kāi)口1196延伸，而圓形盲孔1202從徑向開(kāi)口1198延伸。該盲孔1200和1202保持線圈壓縮彈簧(未示出)，該線圈壓縮彈簧緊壓徑向凸緣1192和1194以將致動(dòng)器杯1182偏移到示出的收縮位置。檢測(cè)器500在穿過(guò)歧管1082而形成的開(kāi)口1085的上方安裝到該歧管1082上。第一和第二圓柱突起1204和1206在開(kāi)口1085的相對(duì)兩側(cè)上從歧管1082延伸。O形環(huán)1208位于該圓柱突起1204上，而O形環(huán)1210位于圓柱突起1206上。圓柱突起1204延伸到形成在徑向凸緣1192中的杯狀盲孔中，而圓柱突起1206延伸到形成在徑向凸緣1194中的杯狀盲孔中?？諝鈮嚎s導(dǎo)管1212延伸到圓柱突起1204中并且在該突起1204的頂部處離開(kāi)。類(lèi)似地，空氣壓縮導(dǎo)管1214延伸到圓柱突起1206中并且從該突起的頂部離開(kāi)。通過(guò)在導(dǎo)管1212和1214處施加壓力，致動(dòng)器杯1182從圖18所示的收縮位置移動(dòng)到延伸位置(到圖中所示的左側(cè))，從而將徑向突起1192和1194分別向上推動(dòng)到徑向開(kāi)口1196和1198中，并且將致動(dòng)器1182移動(dòng)到左側(cè)。圓形盲孔1200和1202的深度可以容納壓縮彈簧(未示出)的長(zhǎng)度，所以使得徑向凸緣1192和1194能夠完全移動(dòng)到徑向開(kāi)口1196和1198的端部。實(shí)施例下面提供了說(shuō)明容各器以及在其中設(shè)置的系統(tǒng)的一些使用的實(shí)例。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該了解到這些實(shí)例并不是旨在將本發(fā)明限制到其中描述的具體使用。此外，本領(lǐng)域技術(shù)人員可以容易地將該容器以及其中設(shè)置的系統(tǒng)應(yīng)用于執(zhí)行其他類(lèi)型的反應(yīng)、處理或者檢驗(yàn)。下面的實(shí)例提供了大量的實(shí)驗(yàn)，使用液體或者干燥的擴(kuò)增反應(yīng)和酶試劑來(lái)進(jìn)行這些實(shí)驗(yàn)，以將手動(dòng)的實(shí)時(shí)轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)擴(kuò)增(TMA)反應(yīng)的靈敏度與自動(dòng)的實(shí)時(shí)TMA的靈敏度相比較。TMA反應(yīng)是兩種依賴(lài)于逆轉(zhuǎn)錄酶的基于酶、轉(zhuǎn)錄的擴(kuò)增反應(yīng)，以提供用于在用抗轉(zhuǎn)錄的引物或者啟動(dòng)子引物制造互補(bǔ)DNA延伸產(chǎn)物之后消化RNA模板的核糖核酸酶H活性。在McDonough等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，766，849中、Kacian等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，824，518中、Becker等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.7，374，885中、公開(kāi)了TMA反應(yīng)的實(shí)例。該實(shí)驗(yàn)的目標(biāo)是沙眼衣原體23S核糖體RNA，下文中稱(chēng)為“目標(biāo)核酸”。在每個(gè)實(shí)驗(yàn)中，“擺動(dòng)”捕捉探針用于非特異性地結(jié)合檢驗(yàn)樣品中的目標(biāo)核酸。該擺動(dòng)捕捉探針由3’區(qū)組成，該3’區(qū)具有連接到具有30脫氧腺嘌呤殘基的5’尾(poly(dA)30的182’-甲氧基鳥(niǎo)嘌呤和2’-甲氧基鳥(niǎo)嘌呤殘基(poly(K)18的隨機(jī)排列。包括擺動(dòng)捕捉探針和結(jié)合的目標(biāo)核酸的復(fù)合物被固定在具有由在其上衍生的14脫氧胸苷激酶殘基(poly(dT)14)組成寡核苷酸的磁響應(yīng)顆粒上，并且然后受到清洗過(guò)程作用，以將干擾物質(zhì)從該檢驗(yàn)樣品移除。在清洗過(guò)程之后，目標(biāo)核酸置于TMA試劑和條件下，并且得到的擴(kuò)增產(chǎn)物利用熒光標(biāo)記的、分子信標(biāo)探針實(shí)時(shí)檢測(cè)。參見(jiàn)Kacian等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，824，518，以及參見(jiàn)Tyagi等人的美國(guó)專(zhuān)利N0.5，925，517。用于擴(kuò)增的引物包括具有3’目標(biāo)結(jié)合順序的引物和5’T7啟動(dòng)子測(cè)序儀和同義引物的抗原啟動(dòng)子引物。分子信標(biāo)探針由2’-O-甲基核糖核酸組成并且具有用于結(jié)合到目標(biāo)核酸序列的內(nèi)部序列。使用熒光素氨基磷酸酯(BioGenex，圣拉蒙，加州，目錄N0.BTX-3008)和3’-DABCYLCPG(PrimeSynthesis公司，阿斯頓，賓夕法尼亞州，目錄N0.CPG1002N12DABXS)將分子信標(biāo)探針合成為包括相互作用的FAM和DABCYL報(bào)告和抑制劑部分。使用標(biāo)準(zhǔn)亞磷酰胺化學(xué)劑、使用Expedite8909DNASynthesizer(PerSeptiveBiosystemsFramingham,MA)的本領(lǐng)域已知的各種方法來(lái)合成該實(shí)驗(yàn)的探針和引物。例如，參見(jiàn)Carruthers等人的154MethodsinEnzymology,287(1987)。實(shí)施例1:手動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)對(duì)于該實(shí)驗(yàn)，手動(dòng)TMA反應(yīng)建立在12X75mm的聚丙烯反應(yīng)管(Gen-Probe公司，圣地亞哥，加州，目錄N0.2440)中，并且每個(gè)反應(yīng)管都具有125μL的目標(biāo)捕捉試劑，該目標(biāo)捕捉試劑含有由poly(dT)14衍生的160μg/mL的I微米磁性顆粒Sera-MagTMMG-CMCarboxylateModified(Seradyn公司；印第安納波利斯，印第安納州；目錄N0.24152105-050450)，并且懸浮在含有調(diào)整為PH7.5的250mMHEPES,310mMLiOH,1.88MLiCI，IOOmMEDTA以及擺動(dòng)捕捉探針的IOpmol/反應(yīng)的溶液中。每個(gè)反應(yīng)管都隨后提供有500FL的含有比率為I比I的樣品轉(zhuǎn)錄介質(zhì)(150mMHEPES，294mM十二烷基硫酸鋰(LLS)和IOOmM硫酸銨，調(diào)節(jié)為PH7.5)和水的混合物。該混合物或者含有IO5份的目標(biāo)核酸(檢驗(yàn)樣品)或者沒(méi)有目標(biāo)核酸(負(fù)控制樣品)。反應(yīng)管用密封卡覆蓋，并且其內(nèi)容物通過(guò)攪拌15秒而混合，然后在25°C在水浴中孵化5分鐘，以促進(jìn)將擺動(dòng)捕捉探針結(jié)合到目標(biāo)核酸。(當(dāng)制備目標(biāo)捕捉試劑的時(shí)候，所述擺動(dòng)捕捉探針結(jié)合到衍生的poly(dT)14)。為了凈化結(jié)合的目標(biāo)核酸，DTS400目標(biāo)捕捉系統(tǒng)(Gen-Probe;目錄N0.5210)用于隔離并清洗磁性顆粒。該DTS400目標(biāo)捕捉系統(tǒng)具有用于定位反應(yīng)管并且對(duì)其施加磁場(chǎng)的檢驗(yàn)管架(testtubebay)。在存在磁場(chǎng)的時(shí)候反應(yīng)管放置在檢驗(yàn)管架大約3分鐘，以隔離反應(yīng)管中的磁性顆粒，其后上清液被吸出。每個(gè)反應(yīng)管都隨后提供有ImL的清洗緩沖液(IOmMHEPES,6.5mMNaOH，ImMEDTA,0.3%(v/v)乙醇，0.02%(w/v)對(duì)羥基苯甲酸甲酯，0.01%(w/v)對(duì)羥基苯甲酸丙酯，150mMNaCl，以及0.1%(w/v)十二烷基硫酸鈉，調(diào)節(jié)為PH7.5)，用密封卡封蓋并且攪拌15秒，以再次將磁性顆粒懸浮。反應(yīng)管返回到測(cè)試管架并且使其在清洗緩沖液被抽出之前在室溫存放3分鐘。重復(fù)該清洗步驟一次。在純化目標(biāo)核酸之后，含有11.9pmol/反應(yīng)的T7啟動(dòng)子引物、9.35pmol/反應(yīng)的非T7引物以及IOpmol/反應(yīng)的分子信標(biāo)探針的75FL的擴(kuò)增/檢測(cè)試劑(44.1mMHEPES,2.82%(w/v)海藻糖，33mMKCl，0.01%(v/v)TRITONX_100洗滌劑，30.6mMMgCl2,0.3%(v/v)乙醇,0.1%對(duì)輕基苯甲酸甲酯,0.02%(w/v)對(duì)輕基苯甲酸丙酯,0.47mM的每個(gè)dATP，dCTP，dGTP，dTTP，1.76mM的每個(gè)rCTP和UTP，9.41mMrATP和11.76mMrGTP，在23°C時(shí)調(diào)節(jié)PH為7.7)添加到每個(gè)反應(yīng)管中。該反應(yīng)管用密封卡覆蓋并且通過(guò)攪拌15秒而混合。在混合之后，反應(yīng)管所含內(nèi)容物移至白色的，96井微板的分離反應(yīng)井(ThermoElectron公司，麻省沃爾瑟姆；產(chǎn)品N0.9502887)，每個(gè)反應(yīng)井都含有75μL的油試劑(硅油(UnitedChemicalTechnologies公司，布里斯托,賓夕法尼亞州；目錄N0.PS038)。該微板用熱密封薄膜(Sigma-Aldrich公司，圣路易斯市，密蘇里州，目錄N0.Z369675)覆蓋，并且在60°C時(shí)在SoloHT微板孵化器中(ThermoElectron;目錄N0.5161580)孵化5分鐘，隨后在42°C時(shí)在Solo微板孵化器中(ThermoElectron;目錄N0.W1036)孵化5分鐘。當(dāng)在第二個(gè)孵化器中的時(shí)候，從微量滴定板移除密封卡，并且25μL的酶試劑(58mMHEPES,50mMN-乙?；?L-半胱氨酸，1.0mMEDTA,10%(v/v)TRITONX-100洗滌劑，3%(w/v)海藻糖，120mMKCl，20%(w/v)甘油，120RTU/μL，莫洛尼鼠白血病病毒反轉(zhuǎn)錄(”MMLV_RT”)，以及80U/μLΤ7RNA聚合酶，調(diào)節(jié)為pH7.0)被添加到每個(gè)反應(yīng)井中。(MMLV-RT的一個(gè)反轉(zhuǎn)錄單元(“RTU”)的活性被定義為在37°C時(shí)利用(poly(rA)-p(dT)12_18)作為基質(zhì)將InmoldTMP并入到DE81結(jié)合過(guò)濾器的產(chǎn)物中20分鐘);并且對(duì)于T7RNA聚合酶，一單元(“U”)的活性被定義為在37°C時(shí)將5.0fmolRNA轉(zhuǎn)錄20分鐘的產(chǎn)物)。緊接著添加酶試劑之后，反應(yīng)井所含的物質(zhì)通過(guò)用標(biāo)準(zhǔn)200μL吸管端攪拌，該吸管端通過(guò)8通道多吸移管管理器接合并且用于將酶試劑移液到微量滴定板上。該微量滴定板然后用干凈的密封卡重新密封。為了檢測(cè)在反應(yīng)井中是否存在擴(kuò)增產(chǎn)物，將密封板放置在預(yù)熱到42°C的FluoroskanAscent100微板突光計(jì)(ThermoElectron;產(chǎn)品編號(hào)5210480)中，并且在50分鐘的周期內(nèi)每隔30秒記錄一次熒光計(jì)讀數(shù)。檢測(cè)依賴(lài)于當(dāng)分子信標(biāo)探針雜交到擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí)的構(gòu)象變化，從而導(dǎo)致發(fā)射可檢測(cè)的熒光信號(hào)。只要分子信標(biāo)探針保持發(fā)夾結(jié)構(gòu)，即，分子信標(biāo)不雜交到目標(biāo)核酸的擴(kuò)增產(chǎn)物，那么從熒光報(bào)告部分發(fā)射的熒光通常被DABCYL抑制劑部分抑制。但是當(dāng)更多分子信標(biāo)探針雜交到反應(yīng)井中的擴(kuò)增子時(shí)，可檢測(cè)的應(yīng)光信號(hào)增加。因此，隨著時(shí)間增加的熒光發(fā)射提供了目標(biāo)核酸的目標(biāo)區(qū)域的活性擴(kuò)增的指示。該實(shí)驗(yàn)的結(jié)果如圖27所示，其中對(duì)于每個(gè)反應(yīng)井來(lái)說(shuō)來(lái)自熒光計(jì)的原始數(shù)據(jù)繪制成熒光單元(y軸)相對(duì)時(shí)間(以分鐘表示)(X軸)的圖。含有目標(biāo)核酸的樣品在本底進(jìn)入反應(yīng)大約15分鐘時(shí)產(chǎn)生從該本底出現(xiàn)的強(qiáng)突光信號(hào)，同時(shí)控制樣品在本底之上產(chǎn)生的不重要的信號(hào)。實(shí)例2:在使用液體試劑的多腔室、柔性容器中的自動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)在該實(shí)驗(yàn)中，該實(shí)例的部分I的TMA反應(yīng)利用圖1A和圖3中示出的容器10和儀器100來(lái)執(zhí)行。圖1B中示出的容器10以下面的方式預(yù)先裝載有試劑:(1)125μ的目標(biāo)捕捉試劑被添加到容器C18中；(2)3mL的清洗緩沖液被添加到腔室C34中；(3)25μL的油試劑，隨后85μL的擴(kuò)增/檢測(cè)試劑被添加到腔室C20中；(4)35μL的油試劑，隨后25μL的酶試劑被添加到腔室C32中。在試劑裝載之后，容器10除腔室C16之外的所有腔室都由熱密封封閉。如上面實(shí)例I所述，500μL具有IO5份的目標(biāo)核酸的檢驗(yàn)樣品然后被移液到腔室C16中，該腔室C16是隨后用熱密封封閉的樣品腔室。對(duì)于初始準(zhǔn)備來(lái)說(shuō)，密封的容器10安裝在外殼104的前部120并且門(mén)組件200被關(guān)閉，將容器10的腔室?jiàn)A在壓力機(jī)械夾具180與門(mén)組件200的熱區(qū)206、262、264、266和268之間。該熱區(qū)設(shè)定為在30°C加熱相鄰腔室。材料在容器10的各腔室之間的運(yùn)動(dòng)通過(guò)由下文描述的壓力機(jī)構(gòu)群180構(gòu)成的壓縮式防震墊來(lái)控制。在開(kāi)始檢驗(yàn)之前，所有壓縮式防震墊P72、P70、P62、P51-1、P56、P58、P60、P64、P66、P68都被激活，以分別夾緊和保護(hù)與入口(或頸部)72、70、62、51、56、58、60、64、66和68相關(guān)的相應(yīng)密封免于過(guò)早打開(kāi)和泄漏。清洗緩沖液和氣泡從其為清洗緩沖液腔室的腔室C34的豎直和水平部分42、44除去，并且其為廢物腔室的腔室C36的豎直進(jìn)口48通過(guò)與下面所示順序的壓縮式防震墊接合而同時(shí)關(guān)閉，該順序?yàn)?I)壓縮式防震墊P34-1和P36-1；(2)壓縮式防震墊P34-2和P36-2；(3)壓縮式防震墊P34-3和P36-6；(4)壓縮式防震墊P34-4；以及(5)壓縮式防震墊P34-5。在初始準(zhǔn)備之后，收回壓縮式防震墊P68，并且壓縮式防震墊P32和P68依次激活以按壓腔室C32和入口68，從而迫使打開(kāi)密封的入口68并且將酶試劑和油試劑從腔室C32移動(dòng)到腔室C30。與此同時(shí)，收回壓縮式防震墊P56，并且壓縮式防震墊P20和P56依次激活以按壓腔室C20和入口56，從而迫使打開(kāi)密封的入口56并且將擴(kuò)增/檢測(cè)試劑和油試劑從腔室C20移動(dòng)到腔室C22。壓縮式防震墊P68和P65繼續(xù)被激活以分別夾緊入口68和56，從而防止酶試劑和擴(kuò)增/檢測(cè)試劑回流到腔室C32和C20中。在移動(dòng)酶試劑和擴(kuò)增/檢測(cè)試劑之后，壓縮式防震墊P18-1、P18-2和P54依次被激活以按壓腔室C18和入口54，從而迫使打開(kāi)密封的入口54并且將目標(biāo)捕捉試劑(“TCR”)從腔室C18移動(dòng)到腔室C16。利用與腔室C16和腔室C18相關(guān)的壓縮式防震墊，通過(guò)在該腔室C16和C18之間前后移動(dòng)結(jié)合的物質(zhì)兩次而將TCR和樣品混合。一旦完成混合，那么壓縮式防震墊P54被激活以?shī)A緊入口54，從而將TCR/樣品混合物保持在腔室C16中，其中該混合物通過(guò)在30°C將熱區(qū)260加熱5分鐘而孵化。執(zhí)行該孵化步驟以促進(jìn)將目標(biāo)核酸非特定的結(jié)合到擺動(dòng)捕捉探針以及將擺動(dòng)捕捉探針固定在存在于TCR中的磁響應(yīng)性顆粒上。為了將目標(biāo)核酸與檢驗(yàn)樣品中的其他材料分離，將磁轉(zhuǎn)換機(jī)構(gòu)208激活，以將磁體移動(dòng)到腔室C26附近的位置中(這里指“打開(kāi)”位置)，該腔室C26在初始準(zhǔn)備期間是磁分離腔室120。收回壓縮式防震墊P62，并且壓縮式防震墊P16-3、P16-4和P62被依次激活以按壓部分腔室C16，從而迫使打開(kāi)密封的入口62并且將第一等份的TCR/樣品混合物從腔室C16移動(dòng)到腔室C26。在將該第一等份的TCR/樣品混合物移動(dòng)到腔室C26之后，繼續(xù)激活壓縮式防震墊P62以?shī)A緊入口62，從而防止材料在腔室C16和C26之間運(yùn)動(dòng)，并且依次收回壓縮式防震墊P16-3和P16-4。在腔室C26中，在熱區(qū)268提供的30°C的溫度下，磁響應(yīng)顆粒受到磁體的磁場(chǎng)的作用I分鐘。當(dāng)磁體保持在“打開(kāi)”位置的時(shí)候，壓縮式防震墊Ρ26、Ρ70、Ρ36-1、Ρ36-2和P36-3依次被激活以按壓腔室C26、腔室C36(廢物腔室)的入口70和豎直進(jìn)口48，并且將液體從腔室C26移動(dòng)到腔室C36。通過(guò)激活與腔室C16和C18有關(guān)的不同排列的壓縮式防震墊，三個(gè)額外等份的TCR/樣品混合物從腔室C16和C18移動(dòng)到腔室C26中，對(duì)于移動(dòng)到腔室C26的第二等份的TCR/樣品混合物，壓縮式防震墊的順序操作如下:P18-1(+)、P18-2(+)、P18-2(-)、P62(-)、P16-3(+)、P16-4(+)、P62(+)、P16-3(-)和P16-4(-)。對(duì)于移動(dòng)到腔室C26的第三等份的TCR/樣品混合物，壓縮式防震墊的順序操作如下:P51-2(+)、P18-1(-)、P16_4(+)、P16-3(+)、P16-2(+)、P16-1(+)、P16-1(-)、P16-2(-)、P16-3(-)、P16-4(-)、P18-1(+)、P18-2(+)、P54(+)、P62(_)、P16_3(+)、P16_4(+)、P62(+)、P16_3(_)和P16-4(-)。并且對(duì)于移動(dòng)到腔室C26的第四等份的TCR/樣品混合物，壓縮式防震墊的順序操作如下:P16-2(+)、Ρ16-1(+)、Ρ62(-)、Ρ16-3(+)、Ρ16-4(+)、Ρ16-3(_)和P16_4(_)。該(+)標(biāo)記表示所涉及的壓縮式防震墊被激活以按壓相應(yīng)入口或部分容器，而(_)標(biāo)記表示涉及的壓縮式防震墊從相應(yīng)入口或部分容器收回。對(duì)每個(gè)額外等份都重復(fù)固定步驟和液體垃圾除去步驟，直到已經(jīng)處理了所有的TCR/樣品混合物并且樣品減小到對(duì)于在容器10中的進(jìn)一步處理可以控制的尺寸。然后開(kāi)始清洗步驟，以將不希望的和潛在干擾的材料從固定的核酸中除去，在此期間，磁體保持在“打開(kāi)”位置。在清洗過(guò)程開(kāi)始時(shí)，壓縮式防震墊P34-5、P34-4、P34-3、P34-2和P34-1被操作成裝填(prime)腔室C34的豎直和水平部分42、44(“頸部區(qū)域”)，并且在收回壓縮式防震墊P72之后按壓在腔室C34的頸部區(qū)域上，從而打開(kāi)密封的入口72并且將大約200μL的清洗緩沖液從腔室C34移動(dòng)到腔室C26。壓縮式防震墊Ρ72然后夾緊入口72并且清洗緩沖液通過(guò)壓縮式防震墊Ρ62、Ρ16-4和Ρ26的作用在腔室C26與腔室C16的由壓縮式防震墊Ρ62和Ρ16-4覆蓋的區(qū)域之間前后移動(dòng)三次，以將居留在打開(kāi)的入口62中的任何殘余TCR/樣品混合物材料移除并且凈化結(jié)合的核酸。在該步驟中，Ρ62僅僅部分激活，以防止腔室C16的由壓縮式防震墊Ρ62和Ρ16-4覆蓋的區(qū)域超量裝填，以使得泡沫最少。所有的液體最后都收集在腔室C26中并且在大約30°C的溫度下置于磁體的磁場(chǎng)下I分鐘，以固定任何的磁響應(yīng)性顆粒。清洗緩沖液然后通過(guò)壓縮式防震墊P26、P70、P36-1和P36-2的作用從腔室C26移動(dòng)到腔室C36中。另一等份的大約200μL的清洗緩沖液然后通過(guò)與腔室C34的頸部區(qū)域相關(guān)的壓縮式防震墊的操作從該腔室C34移動(dòng)到腔室C26，壓縮式防震墊Ρ72被激活以?shī)A緊打開(kāi)的入口72，并且，除了清洗緩沖液僅僅移動(dòng)到腔室C16的由壓縮式防震墊Ρ62覆蓋的那部分，以及在腔室C26與腔室C16之間的運(yùn)動(dòng)僅僅執(zhí)行兩次之外，重復(fù)該清洗處理。最后，第三等份的大約200μL的清洗緩沖液通過(guò)與腔室C34的頸部區(qū)域相關(guān)的壓縮式防震墊的操作從該腔室C34移動(dòng)到腔室C26，壓縮式防震墊Ρ72被激活以?shī)A緊打開(kāi)的入口72，并且磁響應(yīng)性顆粒在大約30°C的溫度下置于磁體的磁場(chǎng)下I分鐘，以固定任何沒(méi)有居留的磁響應(yīng)性顆粒。在此之后，液體通過(guò)壓縮式防震墊Ρ70、Ρ36-1、Ρ36-2的作用從腔室C26移動(dòng)到腔室C34。在完成該清洗步驟之后，磁體移出，從而不與腔室C26對(duì)齊(“關(guān)閉”位置)并且熱區(qū)268移動(dòng)成與腔室C26對(duì)齊。在分離目標(biāo)核酸之后，壓縮式防震墊P22和P58被依次激活以按壓在腔室C22和入口58上，從而迫使打開(kāi)密封的入口58并且將擴(kuò)增/檢測(cè)試劑從腔室C22移動(dòng)到腔室C26。為了確保磁響應(yīng)性顆粒全部懸浮在擴(kuò)增/檢測(cè)試劑中，通過(guò)壓縮式防震墊P26、P58和P22的操作將該擴(kuò)增/檢測(cè)試劑在腔室C22與腔室C26之間移動(dòng)兩次。在腔室C26中，擴(kuò)增/檢測(cè)試劑在62°C(具有例如±1.5°C的容差)的溫度下用熱區(qū)268孵化5分鐘，以促進(jìn)啟動(dòng)子引物到目標(biāo)核酸的結(jié)合。與此同時(shí)，熱區(qū)264和266使得腔室C28和C30的溫度為420C(具有例如±0.450C的容差)，該溫度是對(duì)TMA的最佳溫度。在62°C的孵化之后，腔室C26所含的物質(zhì)在42°C下孵化另一個(gè)5分鐘，在此之后，壓縮式防震墊P26和P64被依次激活為按壓在腔室C26和入口64上，從而迫使打開(kāi)密封的入口64并且將加熱的擴(kuò)增/檢測(cè)試劑和磁性顆?；旌衔飶那皇褻26移動(dòng)到腔室C28。一旦在腔室C28中，壓縮式防震墊P30和P66被依次激活為按壓在腔室C30和入口66上，從而迫使打開(kāi)密封的入口66并且將加熱的酶試劑從腔室C30移動(dòng)到腔室C28。在酶試劑移動(dòng)到腔室C28之后，熱區(qū)266的溫度調(diào)整為38°C±1°C。為了混合擴(kuò)增/檢測(cè)試劑、酶試劑和磁性顆粒，重力協(xié)助將腔室C28含有的物質(zhì)通過(guò)打開(kāi)的入口66流入到腔室C30中，并且然后通過(guò)用壓縮式防震墊P30和P66依次按壓在腔室C30和入口66上而流回至腔室C28中。這個(gè)處理重復(fù)三次，以保證用于目標(biāo)序列的擴(kuò)增的試劑的充分混合，在該混合之后，壓縮式防震墊P66被激活成夾緊打開(kāi)的入口66并且將任何殘余的試劑從該打開(kāi)的入口66移動(dòng)到腔室C28中。為了檢測(cè)在上述混合物中生成的擴(kuò)增產(chǎn)物，在27分鐘的周期內(nèi)，位于腔室C28的透明窗口附近的熒光計(jì)500每隔5秒鐘記錄一次熒光讀數(shù)，每次讀取平均大約4秒鐘。圖28示出了本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果，圖28是示出了在y軸上的從腔室C28檢測(cè)到的熒光單元相對(duì)于在X軸上的時(shí)間(以分鐘表示)的曲線圖。這些結(jié)果顯示出了用在此描述的儀器100和容器10執(zhí)行的實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)的結(jié)果與上面實(shí)例I的手動(dòng)模式的實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)的結(jié)果相同。實(shí)例3:使用液體試劑和尿樣的在多腔室、柔性容器中的自動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)設(shè)計(jì)該實(shí)驗(yàn)以使用摻入IO5份的目標(biāo)核酸的尿樣評(píng)估實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)。本實(shí)驗(yàn)的材料和方法與實(shí)例2中描述的實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)的材料和方法相同，除了下述以外:⑴腔室C18裝載有150μL的目標(biāo)捕捉試劑，該目標(biāo)捕捉試劑含有與100μL水相結(jié)合的IOpmol的擺動(dòng)捕捉探針；(2)腔室C34裝載有2mL的清洗緩沖液；(3)在將擴(kuò)增/檢測(cè)試劑和酶試劑裝載到腔室C20或C32之前，油試劑沒(méi)有裝載到該腔室C20或C32中。(4)檢驗(yàn)樣品包括250μL的來(lái)自健康捐贈(zèng)者的尿液以及250μL的樣品轉(zhuǎn)移介質(zhì)；以及(5)僅僅重復(fù)兩次將TCR/樣品混合物從腔室C16移動(dòng)到腔室C26的步驟、使得腔室C26中含有的磁性顆粒受到磁體的磁場(chǎng)作用的步驟，以及當(dāng)磁性顆粒被固定時(shí)將液體從腔室C26移動(dòng)到腔室C36的步驟。本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果在圖29中示出，其是在y軸上的從腔室C28檢測(cè)到的熒光單元對(duì)在x軸上的時(shí)間(以分鐘計(jì))的曲線圖。本實(shí)驗(yàn)的這些結(jié)果表示用在此描述的儀器100和容器10檢測(cè)尿樣中提供的目標(biāo)核酸的實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)。實(shí)例4:在使用干燥的試劑的多腔室、柔性容器中的自動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)本實(shí)驗(yàn)的目的是評(píng)估利用干燥形式的擴(kuò)增試劑和酶/探針試劑的實(shí)例2的自動(dòng)的、實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)。容器10預(yù)先裝載有下列試劑:⑴125μL的目標(biāo)捕捉試劑被添加到腔室C18中；(2)3mL的清洗緩沖液被添加到腔室C34中；(3)25μL的油試劑，隨后85μL的擴(kuò)增恢復(fù)試劑(0.4%(v/v)乙醇(純的)，0.10%(w/v)對(duì)羥基苯甲酸甲酯，0.02%(w/v)對(duì)羥基苯甲酸丙酯，33mMKCl,30.6mMMgCl2，以及0.003%酚紅)，被添加到腔室C20中；(4)擴(kuò)增試劑團(tuán)粒(由14μL的調(diào)整為ρΗ7.0的含有250mMHEPES,16%(w/v)海藻糖、54.3mMATPUOmMCTP,66.6mMGTPUOmMUTP、2.66mM的各dATP、dCTP、dGTP和dTTP的滴液、0.6nmol/L的反義T7啟動(dòng)子引物和0.47nmol/L的感知非T7引物形成的，其中該滴液被分配到液氮中并且凍干所得的冰凍團(tuán)粒)被添加到腔室C22中；(5)35μL的油試劑、隨后25yL的酶/探針恢復(fù)試劑(50mMHEPES,ImMEDTA,10%(v/v)TRITONX-100洗滌劑以及120mMKC1，調(diào)節(jié)到pH7.0)被添加到腔室C32中；以及(6)酶/探針試劑團(tuán)粒(由7.28μL的含有20mMHEPES,125mMN-乙?；?L-半胱氨酸，0.1mMEDTA,0.01%(v/v)TRITONX-1OO洗滌劑，20%(w/v)Trehalose,412MR/LMMLV-RT(透析的)，687MU/LT7RNA聚合酶(透析的)的滴液以及2.20%nmol/L的分子信標(biāo)探針形成，其中“Μ”表示一百萬(wàn))被添加到腔室C30中。在試劑裝載之后，容器10的除了腔室C16之外的所有腔室都通過(guò)熱密封而封閉。具有IO5份的目標(biāo)核酸的500μL檢驗(yàn)樣品，如上文實(shí)例I中所示，隨后被移液到腔室C16中，該腔室C16然后通過(guò)熱密封而封閉。初始的設(shè)定與上述實(shí)例2相同。在初始設(shè)定之后，壓縮式防震墊Ρ32和Ρ68依次被激活成按壓在腔室C32和入口68上，從而迫使打開(kāi)密封的入口68并且將酶/探針恢復(fù)試劑和油試劑的結(jié)合物從腔室C32移動(dòng)到腔室C30中，其中使得酶/探針試劑團(tuán)粒在酶/探針恢復(fù)試劑中溶解2分鐘。壓縮式防震墊Ρ20和Ρ56然后依次被激活成按壓在腔室C20和入口56上，從而迫使打開(kāi)密封的入口56并且將擴(kuò)增恢復(fù)試劑和油試劑的結(jié)合物從腔室C20移動(dòng)到腔室C22中，并且壓縮式防震墊Ρ20和Ρ22被激活成使得腔室C22所含的物質(zhì)在腔室C20和腔室C22之間前后移動(dòng)四次，以完全恢復(fù)該擴(kuò)增試劑，其后壓縮式防震墊Ρ56激活成夾緊入口56。在腔室C30中的兩分鐘停留時(shí)間之后，壓縮式防震墊Ρ30和Ρ32被激活成使腔室C30所含的物質(zhì)在腔室C30和腔室C32之間前后移動(dòng)兩次，以完全恢復(fù)酶/探針試劑，此后壓縮式防震墊Ρ68被激活成夾緊入口68。剩下的步驟與實(shí)例2中的步驟相同。本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果在圖30中示出，其是示出了在y軸上的從腔室C28檢測(cè)到的熒光單元對(duì)在X軸上的分鐘時(shí)間的曲線圖。這些結(jié)果示出了利用在此描述的儀器100和容器10檢測(cè)目標(biāo)轉(zhuǎn)錄的使用在板恢復(fù)的團(tuán)粒擴(kuò)增試劑和酶/探針試劑的實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)。實(shí)例5:在存在或者不存在油試劑時(shí)使用液體試劑的自動(dòng)擴(kuò)增反應(yīng)本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)成評(píng)估在裝載液體試劑之前將不互溶液體提供到多腔室容器的打開(kāi)腔室用于執(zhí)行實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)的益處。對(duì)于本實(shí)驗(yàn)圖4所示類(lèi)型的容器如下重復(fù)制備兩次:(I)在控制方面，沒(méi)有油試劑添加到含有擴(kuò)增/檢測(cè)試劑(腔室C20)或酶試劑(腔室C32)的腔室中；(2)在添加酶試劑之前將25μL的油試劑添加到腔室C32中，并且沒(méi)有油試劑添加到腔室C20中；以及(3)在添加擴(kuò)增/檢測(cè)試劑和酶試劑之前將25μL油試劑添加到腔室C20和腔室C30中的每一個(gè)。腔室C18裝載有250μL的含有IOpmol擺動(dòng)捕捉探針和100μL水的目標(biāo)捕獲試劑。本實(shí)驗(yàn)的材料和方法與實(shí)例2中描述的反應(yīng)的材料和方法基本相同，除了擴(kuò)增反應(yīng)是在大約40°C是進(jìn)行40分鐘之外。圖31是示出了本實(shí)驗(yàn)的結(jié)果的去圖線圖，示出了在y軸上的從腔室C28檢測(cè)到的熒光單元對(duì)在X軸上的分鐘時(shí)間。這些結(jié)果示出了當(dāng)擴(kuò)增/檢測(cè)試劑和酶試劑中的至少其中之一與油試劑結(jié)合時(shí)，顯而易見(jiàn)的是本實(shí)驗(yàn)執(zhí)行的實(shí)時(shí)TMA反應(yīng)更優(yōu)。盡管已經(jīng)參考某些說(shuō)明實(shí)施例非常詳細(xì)地說(shuō)明和示出了本發(fā)明，但是本領(lǐng)域技術(shù)人員將容易想到本發(fā)明的其他實(shí)施例。因此，應(yīng)該認(rèn)為本發(fā)明包括在權(quán)利要求所限定的范圍內(nèi)的所有修改和變化。權(quán)利要求1.一種用于在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器中處理樣品的儀器，該儀器被構(gòu)造且布置成在所述處理期間將所述容器支撐在可操作位置，并且包括:分別限定一個(gè)多腔熱區(qū)的一個(gè)或多個(gè)多腔熱敏元件，該多腔熱區(qū)與所述容器熱連通，并且被構(gòu)造且布置成在每個(gè)所述多腔熱區(qū)與容器的相關(guān)多腔區(qū)域之間傳送熱能，其中，容器的所述相關(guān)區(qū)域包圍容器的兩個(gè)或者更多、而又少于所有腔室中的每一個(gè)腔室的所有部分或者一部分，以及控制器，該控制器被設(shè)計(jì)成控制所述一個(gè)或者多個(gè)多腔熱敏元件的操作，以選擇性地加熱或者冷卻包圍在與所述多腔熱區(qū)相關(guān)的多腔區(qū)域內(nèi)的腔室。2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的儀器，還包括限定一個(gè)或者多個(gè)單腔熱區(qū)的一個(gè)或者多個(gè)單腔熱敏元件，該單腔熱區(qū)設(shè)置成與所述容器熱連通，并且構(gòu)造并布置成在每個(gè)單腔熱區(qū)與容器的相關(guān)單腔區(qū)域之間傳送熱能，容器的該相關(guān)單腔區(qū)域包圍容器的一個(gè)腔室的全部或者部分，其中，所述控制器被設(shè)計(jì)為控制所述單腔熱敏元件的操作，以選擇性地加熱或者冷卻包圍在與所述單腔熱區(qū)相關(guān)的單腔區(qū)域內(nèi)的腔室。3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的儀器，其中，所述熱敏元件包括由所述控制器控制的一個(gè)或者多個(gè)佩爾捷裝置，以選擇性地加熱或者冷卻與該佩爾捷裝置熱接觸的主體。4.根據(jù)權(quán)利要求1到3中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，各熱敏元件包括熱傳遞元件，該熱傳遞元件由導(dǎo)熱材料制成并且具有與由該熱傳遞元件限定的多腔熱區(qū)的預(yù)定形狀相對(duì)應(yīng)的外周形狀。5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的儀器，其中所述熱傳遞元件相對(duì)于所述容器以固定的位置保持在該儀器中。6.根據(jù)權(quán)利要求4或5的任何一項(xiàng)所述的儀器，所述熱傳遞元件由鋁制成。7.根據(jù)權(quán)利要求1或2的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，所述熱敏元件包括:一個(gè)或多個(gè)佩爾捷設(shè)備，該一個(gè)或多個(gè)佩爾捷設(shè)備由控制器控制，以選擇性地加熱或者冷卻與該佩爾捷設(shè)備熱接觸的主體；以及與每個(gè)所述多腔熱區(qū)相關(guān)聯(lián)的熱傳遞元件，所述熱傳遞元件由導(dǎo)熱材料形成，并且具有大致的平坦表面和與由該熱傳遞元件所限定的一多腔熱區(qū)的預(yù)定形狀相對(duì)應(yīng)的外周形狀，其中，所述佩爾捷設(shè)備與所述熱傳遞元件熱接觸。8.根據(jù)權(quán)利要求1到7中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，所述儀器包括多個(gè)熱敏元件，每個(gè)所述熱敏元件通過(guò)隔離結(jié)構(gòu)而與其它的熱敏元件分離，該隔離結(jié)構(gòu)包括不導(dǎo)熱材料。9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的儀器，其中，所述熱傳遞元件和隔離結(jié)構(gòu)相對(duì)于所述容器在固定的位置保持在儀器內(nèi)。10.根據(jù)權(quán)利要求3或7的任何一項(xiàng)所述的儀器，還包括散熱元件，該散熱元件被構(gòu)造且布置成散發(fā)來(lái)自所述佩爾捷設(shè)備的熱量。11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的儀器，其中，所述散熱元件包括由導(dǎo)熱材料構(gòu)成并且包括塊狀物的熱沉，該塊狀物的一側(cè)與至少一個(gè)佩爾捷設(shè)備熱連通，并且散熱鰭片從該塊狀物的另一側(cè)延伸。12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的儀器，其中，所述散熱元件進(jìn)一步包括風(fēng)扇，該風(fēng)扇與所述熱沉鄰近設(shè)置，并且配置為在該熱沉的散熱鰭片上方產(chǎn)生氣流。13.根據(jù)權(quán)利要求12所述的儀器，其中，所述風(fēng)扇的操作由所述控制器控制。14.根據(jù)權(quán)利要求12或13的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，所述熱沉由鋁制成。15.根據(jù)權(quán)利要求1到14中的任何一項(xiàng)所述的儀器，還包括一個(gè)或者多個(gè)溫度傳感器，用于感測(cè)每個(gè)熱區(qū)的溫度并且將所感測(cè)到的溫度傳送到所述控制器。16.根據(jù)權(quán)利要求1到15中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，將所述控制器構(gòu)造成控制所述熱敏元件的操作，以將環(huán)境溫度設(shè)定在預(yù)定的溫度范圍內(nèi)。17.根據(jù)權(quán)利要求16所述的儀器，其中，所述預(yù)定的溫度范圍是大約20°C到40°C。18.根據(jù)權(quán)利要求，16所述的儀器，所述預(yù)定的溫度范圍是大約25°C到37°C。19.根據(jù)權(quán)利要求1到15中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，將所述控制器構(gòu)造成控制所述熱敏元件的操作，以將一個(gè)或者多個(gè)腔室加熱到預(yù)定的溫度范圍內(nèi)的溫度。20.根據(jù)權(quán)利要求19所述的儀器，其中，所述預(yù)定的溫度范圍包括執(zhí)行需要熱循環(huán)的處理所需要的溫度。21.根據(jù)權(quán)利要求19或20的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，所述預(yù)定的溫度范圍是大約5°C到95。。。22.根據(jù)權(quán)利要求20所述的儀器，其中，所述處理是PCR擴(kuò)增反應(yīng)。23.根據(jù)權(quán)利要求1到15中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，將所述控制器構(gòu)造成控制所述熱敏元件的操作，以在預(yù)定時(shí)間段內(nèi)將包圍在與多腔熱區(qū)相關(guān)的區(qū)域內(nèi)的各腔室中的物質(zhì)加熱或者冷卻到預(yù)定溫度。24.根據(jù)權(quán)利要求1到13中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，所述一個(gè)或者多個(gè)熱敏元件限定至少兩個(gè)多腔熱區(qū)。25.根據(jù)權(quán)利要求1到24中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，當(dāng)所述容器被支撐在儀器內(nèi)的可操作位置時(shí)，用流體填充包圍在與多腔熱區(qū)相關(guān)的區(qū)域內(nèi)的腔室的操作將增加在該腔室與該多腔熱區(qū)之間的熱連通。26.根據(jù)權(quán)利要求1到25中的任何一項(xiàng)所述的儀器，其中，所述一個(gè)或多個(gè)多腔熱敏元件每一者都具有下述尺寸和形狀:包圍容器的兩個(gè)以上而少于所有腔室的每個(gè)腔室的全部或者部分。27.一種用于加熱或冷卻在具有多個(gè)相互連接的腔室的容器內(nèi)的物質(zhì)的方法，該方法包括下列步驟:定位所述容器，該容器與容納在分析器中的一個(gè)或者多個(gè)多腔熱區(qū)熱連通，每個(gè)該多腔熱區(qū)都與容器的這樣的區(qū)域相關(guān)聯(lián)，該區(qū)域包圍容器的上個(gè)以上而少于所有腔室的每個(gè)腔室的全部或者部分；以及在每個(gè)多腔熱區(qū)和由與該多腔熱區(qū)相關(guān)的區(qū)域所包圍的腔室之間傳送熱能，以選擇性地將容納在該包圍的腔室中的物質(zhì)加熱或者冷卻到與由至少一個(gè)其它區(qū)域所包圍的腔室的溫度不同的溫度。28.根據(jù)權(quán)利要求27所述的方法，還包括:定位所述容器，該容器與容納在分析器中的一個(gè)或者多個(gè)單腔熱區(qū)熱連通，每個(gè)該單腔熱區(qū)都與所述容器的這樣一個(gè)區(qū)域相關(guān)聯(lián)，該區(qū)域包圍該容器的一個(gè)腔室的全部或者部分。29.根據(jù)權(quán)利要求27或28的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，所述傳送步驟包括:用一個(gè)或者多個(gè)佩爾捷設(shè)備加熱或者冷卻所述多腔熱區(qū)。30.根據(jù)權(quán)利要求29所述的方法，其中，利用一熱敏元件使熱量從所述佩爾捷設(shè)備傳遞到所述多腔熱區(qū)或者從所述多腔熱區(qū)傳遞到所述佩爾捷設(shè)備。31.根據(jù)權(quán)利要求30所述的方法，其中，所述熱敏元件包括具有下述尺寸和形狀的金屬板:包圍容器的兩個(gè)以上而少于所有腔室的每個(gè)腔室的全部或者部分。32.根據(jù)權(quán)利要求27到31中的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，在該方法期間，所述分析器的環(huán)境溫度與由容器的與每個(gè)多腔熱區(qū)相關(guān)聯(lián)的區(qū)域所包圍的腔室內(nèi)所容納的物質(zhì)的溫度不同。33.根據(jù)權(quán)利要求27到32中的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，所述傳送步驟包括:交替地加熱和冷卻所述多腔熱區(qū)中的至少一個(gè)。34.根據(jù)權(quán)利要求27到33中的任何一項(xiàng)所述的方法，還包括:將每個(gè)多腔熱區(qū)與其它多腔熱區(qū)熱分離。35.根據(jù)權(quán)利要求27到34中的任何一項(xiàng)所述的方法，還包括:散發(fā)來(lái)自多腔熱區(qū)的熱量。36.根據(jù)權(quán)利要求27到35中的任何一項(xiàng)所述的方法，還包括感測(cè)每個(gè)多腔熱區(qū)的溫度。37.根據(jù)權(quán)利要求27到36中的任何一項(xiàng)所述的方法，還包括:擴(kuò)大由容器的與多腔熱區(qū)相關(guān)聯(lián)的區(qū)域所包圍的腔室，以增加在該擴(kuò)大的腔室與相關(guān)的多腔熱區(qū)之間的熱連通。38.根據(jù)權(quán)利要求27到37中的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，所述分析器容納至少三個(gè)多腔熱區(qū)。39.根據(jù)權(quán)利要求27到38中的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，所述多個(gè)相互連接的腔室中的每一個(gè)都與該容器的至少一個(gè)其它的腔室相鄰。40.根據(jù)權(quán)利要求27到39的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，所述容器的每個(gè)腔室都包括柔性部分，以促進(jìn)在各腔室之間的物質(zhì)移動(dòng)。41.根據(jù)權(quán)利要求27至40的任何一項(xiàng)所述的方法，其中，所述容器包括對(duì)置的元件，該對(duì)置的元件中的至少一個(gè)包括一柔性片。42.根據(jù)權(quán)利要求41所述的容器，其中每個(gè)所述對(duì)置的元件都包括一柔性片。全文摘要本發(fā)明為用于將容器暴露與多個(gè)熱區(qū)的儀器和方法，涉及一種具有多個(gè)相互連接的腔室的容器，該多個(gè)相互連接的腔室布置為允許獨(dú)立地或者同時(shí)地執(zhí)行多個(gè)處理步驟或者處理。該容器被制造成使流體與干燥的試劑分離，并且保持該干燥的試劑的穩(wěn)定性。包括有諸如油的不混溶流體，以控制處理材料的裝載、促進(jìn)干燥的試劑的恢復(fù)以及混合、限制蒸發(fā)、控制反應(yīng)材料的加熱、集中固相載體以防止液體連接的堵塞、對(duì)流體轉(zhuǎn)移提供最小的用量以及防止處理材料粘接于腔室表面。該容器可以適用于具有處理儀器的系統(tǒng)中，該處理儀器包括用于在各腔室之間選擇性地移動(dòng)流體物質(zhì)的致動(dòng)器系統(tǒng)以及檢測(cè)器。該致動(dòng)器系統(tǒng)可以被設(shè)置成集中樣本中存在的分析物。該檢測(cè)器其可以用于檢測(cè)由容器所含的物質(zhì)發(fā)出的光學(xué)信號(hào)。文檔編號(hào)B01L7/00GK103157400SQ201110326149公開(kāi)日2013年6月19日申請(qǐng)日期2008年6月20日優(yōu)先權(quán)日2007年6月21日發(fā)明者斯克特·布賴(lài)登塔爾,沙拉·H·樊,理查德·利,諾爾曼·納爾遜,馬修·斯克特,賈森·泰勒申請(qǐng)人:簡(jiǎn)·探針公司,質(zhì)量基因國(guó)際公司