本發(fā)明屬于生物工程領域,具體涉及一種檢測牛副流感病毒3型抗體的間接競爭酶聯(lián)適配體方法。
背景技術:
牛副流感病毒3型(BPIV-3)是副黏病毒科、呼吸道病毒屬的成員,能引起牛和其他反芻動物的呼吸道疾病綜合征(BRDC)。牛在運輸及處于其他應激環(huán)境時容易發(fā)生感染,表現(xiàn)出發(fā)熱和嚴重的鼻腔分泌物,甚至引發(fā)肺炎,是引起舍飼牛發(fā)病和死亡的主要原因,給養(yǎng)牛業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟損失。該病在世界范圍內(nèi)廣泛流行,我國多數(shù)省份也嚴重流行。據(jù)王海勇對臨床千余份牛血清樣品的檢測結(jié)果顯示我國牛群BPIV-3抗體總體陽性率為77.6%,說明我國牛群已經(jīng)普遍感染BPIV。目前尚無治療BPIV3感染的有效藥物。隨著集約化飼養(yǎng)模式的迅速發(fā)展,牛呼吸道疾病綜合征的發(fā)病率也在不斷升高,控制BPIV-3感染、及時診斷,降低發(fā)病率成為目前亟待解決的問題。目前,該病的初步診斷依賴于血清學方法,確診需要進行病原分離和鑒定。常用的血清學方法主要基于病毒中和試驗、熒光抗體試驗、血凝抑制試驗等。病毒中和試驗和熒光抗體試驗操作復雜、耗時,不適于大規(guī)范樣品快速診斷;血凝抑制試驗雖然操作簡單,但需要在對病毒進行增殖的前提下,以BPIV-3病毒粒子為抗原進行檢測,不但耗時而且要求實驗室條件較高。因此,尋找快速、靈敏、可靠的診斷方法,對BPIV-3感染的控制及治療至關重要。
核酸適配體可與靶物質(zhì)以類似抗原-抗體的方式特異性結(jié)合,發(fā)揮生物學效應,是一種新興的具有識別功能的分子。適配體與抗體均具有結(jié)合靶物質(zhì)的功能,相比下來適配體具有分子量小、易于合成、篩選簡便、修飾多樣、親和力高、穩(wěn)定性強等優(yōu)點。適配體的大部分應用也是從抗體應用衍生而來,如光學適配體生物傳感器、質(zhì)量靈敏傳感器、電化學適配生傳感器、酶聯(lián)適配體學說、納米材料傳感器等。目前,核酸適配體已廣泛應用于化學分析與檢測、臨床診斷與治療及藥學等研究領域。最近幾年來,各種新型適配體檢測平臺和適配體治療藥物層出不窮。核酸適配體抗腫瘤藥物AS1411、具有凝血作用的核酸適配體ARC183、針對金黃色葡萄球菌外毒素B(SEB)的適配體等已經(jīng)到臨床應用階段。在獸醫(yī)學研究領域,結(jié)果顯示以核酸適配體建立的酶聯(lián)適配體方法具有很高的特異性和敏感性。為了獲得優(yōu)良的牛副流感病毒3型抗體檢測方法,我們應用前期研究篩選獲得的HN蛋白核酸適配體,優(yōu)化各步驟反應條件,建立了間接競爭酶聯(lián)適配體方法。
技術實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是為了解決現(xiàn)有技術的不足,而提供一種檢測牛副流感病毒3型抗體的間接競爭酶聯(lián)適配體方法,該方法具有良好的特異性,與商品化ELISA試劑盒相比,Ic-ELAA具有更高的陽性檢出率,更適合進行臨床牛副流感疾病的血清學調(diào)查。
本發(fā)明采用如下技術方案:
檢測牛副流感病毒3型抗體的間接競爭酶聯(lián)適配體方法,包括如下步驟:
步驟一,包被:確定HN蛋白包被濃度,吸取HN蛋白溶液包被于ELISA微孔板中,過夜;
步驟二,洗板:甩去包被液,用HEPEST洗滌微孔板三次,甩干;
步驟三,封閉:確定封閉液,向微孔中加入封閉液,37℃孵育2h;
步驟四,加核酸適配體和牛血清:確定核酸適配體Bio-WC-2濃度,并確定牛血清的稀釋倍數(shù);甩去封閉液,用HEPEST洗滌三次,甩干,同時將Bio-WC-2和牛血清加入到封閉好的微孔中,孵育;
步驟五,洗板:甩去核酸適配體和牛血清,用HEPEST洗滌微孔板三次,甩干;
步驟六,加二抗:確定二抗的稀釋度,向微孔中加入稀釋的HRP-SA,孵育;
步驟七,顯色:甩去二抗,用HEPEST洗滌微孔板四次,拍干孔中殘留的洗滌液,將顯色液A、顯色液B等體積混合,吸取顯色液加入到微孔中,顯色;
步驟八,終止:每孔加入終止液終止顯色;
步驟九,讀數(shù):使用自動酶標檢測儀讀取每孔在450nm波長處生物吸光度值(OD);
步驟十,陰陽性臨界值的確定;
步驟十一,Ic-ELAA方法特異性檢測;
步驟十二,臨床牛血清檢測。
更進一步地,所述的檢測牛副流感病毒3型抗體的間接競爭酶聯(lián)適配體方法,包括如下步驟:步驟一,包被:吸取濃度為80ug/mL的HN蛋白溶液包被于96孔ELISA微孔板中,4℃過夜;
步驟二,洗板:甩去包被液,用300μL HEPEST洗滌微孔板三次,甩干,其中所述HEPEST為含0.05%Tween 20的HEPES;
步驟三,封閉:向微孔中加入200μL含1%BSA的HEPES液,37℃孵育2h;
步驟四,加核酸適配體和牛血清:確定核酸適配體Bio-WC-2濃度,并確定牛血清的稀釋倍數(shù);甩去封閉液,用HEPEST洗滌三次,甩干,同時將50μL濃度為100nM的Bio-WC-2和50μL牛血清原液加入到封閉好的微孔中,37℃孵育1h;
步驟五,洗板:甩去核酸適配體和牛血清,用300μL HEPEST洗滌微孔板三次,甩干,其中所述HEPEST為含0.05%Tween 20的HEPES;
步驟六,加二抗:向微孔中加入100μL 1:6000稀釋的HRP-SA,37℃孵育1h;
步驟七,顯色:甩去二抗,用300μL HEPEST洗滌微孔板四次,拍干孔中殘留的洗滌液,將顯色液A、顯色液B等體積混合,吸取100μL顯色液加入到微孔中,37℃顯色10min;
步驟八,終止:每孔加入50μL終止液(2M H2SO4)終止顯色;
步驟九,讀數(shù):使用自動酶標檢測儀讀取每孔在450nm波長處生物吸光度值(OD);
步驟十,陰陽性臨界值的確定;
步驟十一,Ic-ELAA方法特異性檢測;
步驟十二,臨床牛血清檢測。
更進一步地,步驟一中所述HN蛋白包被濃度和步驟四中所述Bio-WC-2濃度的確定具體如下:將不同濃度的HN蛋白(10ug/mL、20ug/mL、40ug/mL、80ug/mL和160ug/mL)與不同適配體Bio-WC-2濃度(200nM、100nM、50nM)建立棋盤方陣進行I-ELAA試驗,用酶標儀檢測各孔OD450值,通過計算Positive/Negative值來確定HN蛋白包被濃度和核酸適配體Bio-WC-2濃度,確定標準為P/N比值最高且陽性OD450值在1.0左右,實驗程序同Ic-ELAA類似,區(qū)別是一抗為100μL Bio-WC-2,不加牛血清;HN蛋白包被條件為4℃過夜。
更進一步地,步驟三中所述封閉液的確定具體如下:將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜,洗滌,分別加入不同封閉液5%脫脂奶、10%脫脂奶、1%BSA、3%BSA或10%馬血清,進行I-ELAA試驗,用酶標儀檢測各孔OD450值,通過計算P/N值來確定封閉液。
更進一步地,步驟六中所述二抗稀釋度的確定具體如下:將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜,1%BSA封閉并洗滌,加入100μL濃度為50nM的適配體Bio-WC-2,二抗HRP-SA按1:2000、1:4000、1:6000、1:8000倍比稀釋進行I-ELAA試驗,用酶標儀檢測各孔OD450值,通過計算P/N值來確定封閉液。
更進一步地,步驟四中所述牛血清稀釋倍數(shù)的確定具體為:將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜后進行Ic-ELAA試驗,血清為已被證實的強陽性和陰性牛血清,分別做1:1、1:2、1:5、1:10倍稀釋,加入50μL濃度為100nM的Bio-WC-2和50μL不同稀釋倍數(shù)的牛血清,測定OD450值,通過公式:PI(%)=(1-樣本OD450/適配體對照OD450)×100%,計算PI值,由PI值的高低確定牛血清釋釋倍數(shù)。
更進一步地,步驟十中所述陰陽性臨界值的確定具體為:使用20份臨床采集的牛副流感陰性血清進行Ic-ELAA試驗,計算PI平均值,通過公式:PICut-off=PI平均值+2×方差(SD)計算陰、陽性臨界值,同時使用20份牛副流感陽性血清檢驗陰、陽性臨界值。
更進一步地,步驟十一中所述建立的Ic-ELAA方法特異性檢測具體為:用所述Ic-ELAA方法分別檢測牛呼吸道合胞體病毒、牛冠狀病毒、牛傳染性支氣管炎病毒感染牛的陽性血清。
更進一步地,步驟十二中所述臨床牛血清檢測具體為:選取50份臨床牛血清樣本,使用所述Ic-ELAA方法和商品化的BPIV3ELISA試劑盒進行檢測,并對檢測結(jié)果進行比較分析。
更進一步地,所述核酸適配體Bio-WC-2的序列如SEQ ID NO.1所示。
與現(xiàn)有技術相比,本發(fā)明的有益效果:
本發(fā)明應用前期研究篩選獲得的HN蛋白核酸適配體,優(yōu)化了蛋白包被濃度、適配體濃度、包被液、牛血清稀釋倍數(shù)及二抗稀釋度等各步驟反應條件,建立了檢測牛副流感病毒3型抗體的間接競爭酶聯(lián)適配體方法。該方法具有良好的特異性,與商品化ELISA試劑盒相比,Ic-ELAA方法具有更高的陽性檢出率,更適合進行臨床牛副流感疾病的血清學調(diào)查,及時診斷、隔離飼養(yǎng)陽性牛,減少由于呼吸道疾病的發(fā)生造成的經(jīng)濟損失。同時本發(fā)明建立的Ic-ELAA方法為進一步研發(fā)Ic-ELAA試劑盒和疫苗提供了物質(zhì)和技術保障。
附圖說明
圖1為40份陰性血清和陽性血清抑制率分布圖;
圖2為Ic-ELAA檢測不同病原抗血清,其中橫坐標1-5分別代表牛呼吸道合胞體病毒、牛冠狀病毒、牛傳染性支氣管炎病毒抗血清、牛副流感陰性血清和牛副流感陽性血清。
具體實施方式
下面結(jié)合實施例對本發(fā)明作進一步的詳細描述。
本領域技術人員將會理解,下列實施例僅用于說明本發(fā)明,而不應視為限定本發(fā)明的范圍。
實施例1
本申請中所述HN蛋白溶液,由本實驗室原核表達和保存;
核酸適配體序列WC-2:
5’-BIO-CGGCGCATGCGTCGACCTGCAGCTAGTTAAAGGATAAGCAAGTCGCCGAGGCAACCAATGTGGGATCCGTCGACGAATTCCCTA,由上海生工生物工程股份公司合成。合成方式:單管合成10OD,摩爾量為12nmol。使用時溶于200μL HEPES緩沖液,95℃孵育10min。迅速冰浴10min后備用。
1、檢測牛副流感病毒3型抗體的間接競爭酶聯(lián)適配體方法如下:
包被:吸取100μL HN蛋白溶液包被于96孔ELISA微孔板中,4℃過夜。
洗板:甩去包被液,用300μL HEPEST(含0.05%Tween 20的HEPES)洗滌微孔板三次,甩干。
封閉:向微孔中加入200μL含3%BSA的HEPES液,37℃孵育2h。
加核酸適配體和牛血清:甩去封閉液,用HEPEST洗滌三次,甩干。同時將50μL Bio-WC-2和牛血清加入到封閉好的微孔中,37℃孵育1h。
洗板:甩去核酸適配體和牛血清,用300μL HEPEST(含0.05%Tween 20的HEPES)洗滌微孔板三次,甩干。
加二抗:向孔中加入100μL稀釋的HRP-SA,37℃孵育1h。
顯色:甩去二抗,用300μL HEPEST洗滌微孔板四次,拍干孔中殘留的洗滌液,將顯色液A、顯色液B等體積混合,吸取100μL顯色液加入到微孔中,37℃顯色10min。
終止:每孔加入終止液2M H2SO450μL終止顯色。
讀數(shù):使用自動酶標檢測儀讀取每孔在450nm波長處生物吸光度值(OD)。
陰陽性臨界值的確定:使用20份臨床采集的牛副流感陰性血清進行Ic-ELAA試驗,計算PI平均值,通過公式:PICut-off=PI平均值+2×方差(SD)計算陰、陽性臨界值。同時使用20份牛副流感陽性血清檢驗陰、陽性臨界值。
建立的Ic-ELAA方法特異性檢測:用優(yōu)化的Ic-ELAA方法分別檢測牛呼吸道合胞體病毒、牛冠狀病毒、牛傳染性支氣管炎病毒感染牛的陽性血清,驗證本研究建立的Ic-ELAA方法與其他病毒陽性血清之間是否存在交叉反應。
臨床牛血清檢測:選取50份臨床牛血清樣本,使用建立的Ic-ELAA方法和商品化BPIV3ELISA試劑盒進行檢測,并對檢測結(jié)果進行比較分析。
商品化BPIV3ELISA試劑盒操作程序如下:
(1)加樣:吸取100μL 1:100倍稀釋的血清樣本、陽性對照和陰性對照至反應孔。
(2)孵育:21±3℃孵育30min。
(3)洗滌:吸取300μL wash solution洗板三次,拍干。
(4)二抗:吸取100μL 1:50倍稀釋的二抗至每個反應孔,21±3℃孵育30min。
(5)洗滌:重復步驟(3)。
(6)顯色:加入100μL底物至每孔,21±3℃避光反應10min。
(7)終止:加入50μL終止液。
(8)讀數(shù):15min內(nèi)在450nm處讀取各孔OD450值。
2、HN蛋白包被濃度和Bio-WC-2濃度的確定
將不同濃度的HN蛋白(10ug/mL、20ug/mL、40ug/mL、80ug/mL和160ug/mL)與不同適配體Bio-WC-2濃度(200nM、100nM、50nM)建立棋盤方陣進行I-ELAA試驗,用酶標儀檢測各孔OD450值,通過計算Positive/Negative值來確定最佳HN蛋白包被濃度和核酸適配體Bio-WC-2濃度。確定標準為P/N比值最高且陽性OD450值在1.0左右。實驗程序與Ic-ELAA類似,區(qū)別是一抗為100μL Bio-WC-2,不加牛血清;HN蛋白包被條件為4℃過夜。
3、封閉液的確定
將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜。洗滌,加入不同封閉液如5%脫脂奶、10%脫脂奶、1%BSA、3%BSA和10%馬血清,進行I-ELAA試驗,用酶標儀檢測各孔OD450值,通過計算P/N值來確定最佳封閉液。
4、二抗稀釋度的確定
將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜,1%BSA封閉并洗滌,加入最佳濃度的適配體Bio-WC-2和最優(yōu)稀釋度的牛血清,洗滌,二抗HRP-SA按1:2000、1:4000、1:6000、1:8000倍比稀釋進行I-ELAA試驗,用酶標儀檢測各孔OD450值,通過計算P/N值來確定最佳封閉液。
5、牛血清稀釋倍數(shù)的確定
將最佳濃度的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜后進行Ic-ELAA試驗,血清為已被證實強陽性和陰性牛血清,分別做1:1、1:2、1:5、1:10倍稀釋。加入最佳濃度Bio-WC-2和稀釋好的牛血清各50μL。測定OD450值,通過公式:PI(%)=(1-樣本OD450/適配體對照OD450)×100%,計算PI,PI值越高,陰陽性血清之間差異越大,則為最佳牛血清釋釋倍數(shù)。
實施例2
1、最佳HN包被濃度和Bio-WC-2濃度的確定
將不同濃度的HN蛋白4℃過夜包被酶標板,1%BSA為封閉液,以I-ELAA試驗優(yōu)化最佳HN蛋白包被濃度和核酸適配體Bio-WC-2最佳反應濃度。結(jié)果如表1所示,選擇OD450值接近1,且P/N值最大的條件為最佳條件,即HN蛋白包被濃度為80ug/mL,Bio-WC-2最佳濃度為50nM。在此實驗中,Bio-WC-2加入量為100μL,而在Ic-ELAA中Bio-WC-2加入量為50μL,則Bio-WC-2在后續(xù)的Ic-ELAA中濃度應為100nM。
表1最佳HN包被濃度和Bio-WC-2濃度的確定
2、封閉液的確定
將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜。洗滌,加入不同封閉液進行I-ELAA試驗,測定適配體Bio-WC-2和陰性對照孔的OD450。測定結(jié)果如表2所示,當使用1%BSA為封閉液時,P/N值最高,且陽性值在1.0左右,因此,選擇1%BSA為封閉液。
表2最佳封閉液的確定
3、二抗稀釋度的確定
將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜,1%BSA封閉并洗滌,加入濃度為50nM的適配體Bio-WC-2,不同稀釋度二抗進行I-ELAA試驗。結(jié)果如表3所示,當二抗稀釋度為1:6000時,P/N值最高,且陽性值在1.0左右。因此,確定二抗稀釋度為1:6000。
表3 Ic-ELAA二抗稀釋度的確定
4、牛血清稀釋倍數(shù)的確定
將80ug/mL的HN蛋白包被酶標板,4℃包被過夜,1%BSA為封閉液,進行Ic-ELAA。其中適配體對照值平均值為1.050。根據(jù)公式PI(%)=(1-樣本OD450/適配體對照OD450)×100%,計算陽性血清和陰性血清在不同稀釋度下的PI值。計算結(jié)果如表4所示,當血清樣本稀釋倍數(shù)為1:1,即使用血清原液時,陽性血清PI較高,且陰、陽性血清間差別最大。基于此結(jié)果,判定牛血清最佳稀釋度為1:1,即使用血清原液進行測定。
表4 Ic-ELAA牛血清最佳稀釋度的確定
5、陰陽性臨界值的確定
使用20份臨床采集的牛副流感陰性血清,按照上述最優(yōu)反應程序進行Ic-ELAA試驗,計算PI平均值,20份陰性血清PI計算結(jié)果如表5所示,20份陰性牛血清PI平均值為20.75%,SD為5.11%。由此計算得出PICut-off值為30.97%。同時使用20份牛副流感陽性牛血清檢驗陰陽性臨界值,20份陽性血清PI計算結(jié)果如表5所示,所有陽性血清PI均大于31%,為更清楚準確的區(qū)分陰、陽性血清,如圖1所示,本方法設定35%為陰陽性臨界值。
表5 40份陰陽性血清PI值
6、Ic-ELAA方法特異性檢測
使用牛呼吸道合胞體病毒、牛冠狀病毒、牛傳染性支氣管炎病毒感染牛的陽性血清進行Ic-ELAA試驗,以檢驗Ic-ELAA特異性。檢測結(jié)果如圖2所示,僅有牛副流感陽性血清PI值大于35%,其余血清PI值均在臨界值以下,說明本研究建立的Ic-ELAA方法具有良好的特異性。
7、臨床牛血清的檢測
使用本研究建立的Ic-ELAA方法和商品化ELISA,對臨床采集的50份牛血清進行牛副流感病毒抗體檢測,并將檢測結(jié)果進行比較分析。檢測結(jié)果如表6所示,50份臨床血清樣本中,Ic-ELAA法檢測陽性數(shù)32,商品化ELISA為30個陽性,其中兩種方法檢測均為陽性的樣28個,Ic-ELAA方法與商品化試劑盒的符合率=44/50*100%=88%。建立的Ic-ELAA方法相對商品化ELISA試劑盒,陽性檢測率稍高。
表6建立的Ic-ELAA方法和商品化ELISA檢測臨床牛血清樣本
本申請利用前期研究篩選的牛副流感病毒3型HN蛋白核酸適配體Bio-WC-2,建立了間接競爭ELAA檢測方法。該方法的最優(yōu)反應條件為HN蛋白包被濃度為80ug/mL,Bio-WC-2最佳濃度為50nM,封閉液為1%BSA,牛血清稀釋倍數(shù)為血清原液,二抗稀釋度為1:6000,陰陽性臨界值為35%。該方法具有良好的特異性,與商品化ELISA試劑盒相比,Ic-ELAA具有更高的陽性檢出率,更適合進行臨床牛副流感疾病的血清學調(diào)查。
本申請中涉及的核苷酸序列如下表7所示:
表7序列表
本行業(yè)的技術人員應該了解,本發(fā)明不受上述實施例的限制,上述實施例和說明書中描述的只是說明本發(fā)明的原理,在不脫離本發(fā)明精神和范圍的前提下,本發(fā)明還會有各種變化和改進,這些變化和改進都落入要求保護的本發(fā)明范圍內(nèi)。本發(fā)明要求保護范圍由所附的權(quán)利要求書及其等效物界定。