專利名稱：分子時(shí)刻表生成裝置和體內(nèi)生物鐘推算裝置的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及分子時(shí)刻表生成裝置、體內(nèi)時(shí)刻推算裝置、分子時(shí)刻表生成方法、體內(nèi)時(shí)刻推算方法、分子時(shí)刻表生成程序、體內(nèi)時(shí)刻推算程序和體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)，特別是涉及根據(jù)一次采集所得的檢體的檢查結(jié)果，使用計(jì)算機(jī)能簡(jiǎn)易推算體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表生成裝置、體內(nèi)時(shí)刻推算裝置、分子時(shí)刻表生成方法、體內(nèi)時(shí)刻推算方法、分子時(shí)刻表生成程序、體內(nèi)時(shí)刻推算程序和體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
背景技術(shù)：
許多生物都有體內(nèi)生物鐘，控制睡眠覺醒節(jié)律、血壓節(jié)律、體溫節(jié)律、和一部分激素分泌節(jié)律等各種生物節(jié)律。
體內(nèi)生物鐘的振蕩周期約24小時(shí)，但根據(jù)生物種類的不同多少有些差異，人的周期約25小時(shí)。在無(wú)環(huán)境周期的穩(wěn)定環(huán)境下的約24小時(shí)節(jié)律稱為概日節(jié)律，在日常生活中，太陽(yáng)光是作為每天調(diào)諧概日節(jié)律周期為24小時(shí)的最強(qiáng)力調(diào)諧因子發(fā)揮功能的。
眾所周知，概日節(jié)律異常是睡眠覺醒節(jié)律障礙(睡眠相倒退癥候群、睡眠相前進(jìn)癥候群、非24小時(shí)睡眠一覺醒癥候群等)、季節(jié)性抑郁癥、時(shí)差癥候群(JET-LAG)、晝夜倒班勞動(dòng)者的睡眠障礙、癡呆老人的夜間徘徊和譫妄等疾病的原因，及不上學(xué)、不上班的原因之一。
而且，眾所周知用藥時(shí)刻會(huì)影響藥效、副反應(yīng)出現(xiàn)的強(qiáng)弱以及藥物動(dòng)態(tài)。深夜工作者、倒班制工作者等的體內(nèi)時(shí)刻，有時(shí)和一般人不同，即使與一般的人的用藥時(shí)刻一致，當(dāng)該患者的體內(nèi)時(shí)刻并非適合用藥的時(shí)間時(shí)，也不能預(yù)期出現(xiàn)充分療效。
因此，為了診斷概日節(jié)律障礙患者、確定每個(gè)人的用藥時(shí)刻，防止癡呆老人的夜間徘徊等，希望開發(fā)出一種系統(tǒng)，即能夠分別測(cè)定個(gè)人的體內(nèi)時(shí)刻并能把個(gè)人的體內(nèi)時(shí)刻信息提供給醫(yī)療機(jī)關(guān)的神經(jīng)科、記錄用藥病歷的醫(yī)生、老人醫(yī)院、老人保健設(shè)施的系統(tǒng)，并且目前也正在研究推算體內(nèi)時(shí)刻的方法。
作為體內(nèi)時(shí)刻推算方法，考慮有經(jīng)時(shí)采血測(cè)定血液中的抗黑變激素(松果體激素)量并根據(jù)顯示峰值的時(shí)刻和量來(lái)推算個(gè)人體內(nèi)時(shí)刻的方法，同樣經(jīng)時(shí)地測(cè)定活動(dòng)量和睡眠、觀察睡眠覺醒節(jié)律、推算個(gè)人體內(nèi)時(shí)刻的方法，通過測(cè)定體溫、觀察體溫節(jié)律推算體內(nèi)時(shí)刻的方法等。
但問題是，這些方法需要24小時(shí)以上經(jīng)時(shí)地采血或體溫測(cè)定等，給患者和醫(yī)療工作者很大的負(fù)擔(dān)，不能說(shuō)它們是用于醫(yī)療現(xiàn)場(chǎng)的現(xiàn)實(shí)的方法。
另一方面，通過使用低聚物DNA陣列的果蠅頭部經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量的測(cè)定(McDonald，M.and Rosbash，M.，Cell，107，567-578.(2001)，Claridge-Chang，A.等、Neuron，32，657-671(2001))和采用差異顯示法的小鼠肝臟內(nèi)的概日振動(dòng)基因的探索(Kommann，B.等、Nucleic AcidsRes.，29(11)，e51(2001))，在該組織中發(fā)現(xiàn)許多概日振動(dòng)基因，并報(bào)告顯示各概日振動(dòng)基因最大表達(dá)值的時(shí)刻。
但是，并不知道使用這些測(cè)定數(shù)據(jù)測(cè)定體內(nèi)時(shí)刻的方法，期待確立測(cè)定體內(nèi)時(shí)刻的方法。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的就是解決上述問題，提供一種不需多次采集檢體，僅需一次檢體采集步驟就能推算個(gè)人體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表生成裝置、體內(nèi)時(shí)刻推算裝置、分子時(shí)刻表生成方法、體內(nèi)時(shí)刻推算方法、分子時(shí)刻表生成程序、體內(nèi)時(shí)刻推算程序和體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
本發(fā)明的其他目的是提供一種能把個(gè)人體內(nèi)時(shí)刻的推算結(jié)果提供給醫(yī)療機(jī)構(gòu)、老人保健設(shè)施、運(yùn)動(dòng)俱樂部等的顧客的分子時(shí)刻表生成裝置、體內(nèi)時(shí)刻推算裝置、分子時(shí)刻表生成方法、體內(nèi)時(shí)刻推算方法、分子時(shí)刻表生成程序、體內(nèi)時(shí)刻推算程序和體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
本發(fā)明之一的分子時(shí)刻表生成裝置，是生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表的裝置，具備輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，上述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在上述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇機(jī)構(gòu)，上述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇機(jī)構(gòu)，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于上述被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；以及登記信息的登記機(jī)構(gòu)，上述信息是對(duì)選擇的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息。根據(jù)本發(fā)明的分子時(shí)刻表生成裝置可以解決所述問題。
本發(fā)明的分子時(shí)刻表生成方法，是一種生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表的方法，包括以下步驟輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，上述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在上述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇步驟，上述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇步驟，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于上述被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；以及登記信息的登記步驟，上述信息是對(duì)選擇的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息。根據(jù)上述本發(fā)明的分子時(shí)刻表生成方法，可以解決所述問題。
本發(fā)明的分子時(shí)刻表生成程序，是一種在使在信息處理裝置中進(jìn)行以下步驟的程序，所述信息處理裝置是生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表的信息處理裝置，所述步驟包括輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，上述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在上述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇步驟，上述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇步驟，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于上述被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；以及登記信息的登記步驟，上述信息是對(duì)選擇的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息。根據(jù)本發(fā)明的分子時(shí)刻表生成程序可以解決所述問題。
本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)，是一種生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表的同時(shí)，還根據(jù)從上述生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)推算上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻的系統(tǒng)，其具備設(shè)置在提供上述體內(nèi)時(shí)刻信息的信息中心的服務(wù)器計(jì)算機(jī)、和連接在上述服務(wù)器計(jì)算機(jī)上并可收發(fā)信息的終端計(jì)算機(jī)，上述服務(wù)器計(jì)算機(jī)具備輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，上述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在上述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇機(jī)構(gòu)，上述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇機(jī)構(gòu)，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于上述被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；以及登記機(jī)構(gòu)，上述登記機(jī)構(gòu)把上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的數(shù)值達(dá)到最大的時(shí)刻作為上述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)分子時(shí)刻，登記在用于上述體內(nèi)時(shí)刻推算的分子時(shí)刻表上，同時(shí)還把上述表達(dá)產(chǎn)物量對(duì)每個(gè)上述概日振動(dòng)基因的平均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差作為上述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量和標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量，登記在上述分子時(shí)刻表上；輸入檢體含有的上述概日振動(dòng)基因的上述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的測(cè)定數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，上述檢體采集自上述生物個(gè)體的上述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出機(jī)構(gòu)，上述體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的上述測(cè)定數(shù)據(jù)和用上述分子時(shí)刻表特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的上述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果；以及把上述導(dǎo)出的體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送到上述終端計(jì)算機(jī)的體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送機(jī)構(gòu)。根據(jù)本發(fā)明的分子時(shí)刻推算系統(tǒng)可以解決上述問題。
這樣，由于具備在上述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇機(jī)構(gòu)，上述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇機(jī)構(gòu)，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于上述被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；登記信息的登記機(jī)構(gòu)，上述信息是對(duì)選擇的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息，因此能夠生成對(duì)規(guī)定物種的規(guī)定部位所含的概日振動(dòng)基因的概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的時(shí)刻表。即，能夠得到關(guān)于該物種的個(gè)體的時(shí)刻表，該時(shí)刻表是判斷是否有概日節(jié)律障礙和推算沒有概日節(jié)律障礙時(shí)的體內(nèi)時(shí)刻的基礎(chǔ)。
此時(shí)，關(guān)于上述登記機(jī)構(gòu)，優(yōu)選把上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的值達(dá)到最大時(shí)刻作為上述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)分子時(shí)刻并登記在用于推算上述體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表上，同時(shí)把上述表達(dá)產(chǎn)物量的上述每個(gè)概日振動(dòng)基因的平均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差作為上述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量和標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量登記在上述分子時(shí)刻表上。
因?yàn)槭沁@樣的結(jié)構(gòu)，因此能夠生成對(duì)規(guī)定物種的規(guī)定部位含有的概日振動(dòng)基因的概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的時(shí)刻表。即，能夠得到有關(guān)該物種個(gè)體的分子時(shí)刻表，該時(shí)刻表用于判斷是否有概日節(jié)律障礙和推算沒有概日節(jié)律障礙時(shí)的體內(nèi)時(shí)刻。另外，能夠僅用標(biāo)準(zhǔn)分子時(shí)刻、標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量、標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量的數(shù)據(jù)登記概日表達(dá)變動(dòng)曲線，可用較少的數(shù)據(jù)管理概日表達(dá)變動(dòng)曲線。
本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算裝置，是根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的裝置，具備以下機(jī)構(gòu)存儲(chǔ)對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的分子時(shí)刻表的分子時(shí)刻表存儲(chǔ)機(jī)構(gòu)，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線表示規(guī)定物種的規(guī)定部位的概日振動(dòng)基因的表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；輸入檢體含有的上述概日振動(dòng)基因的上述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，上述檢體采集自上述生物個(gè)體的上述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出機(jī)構(gòu)，上述體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的上述測(cè)定數(shù)據(jù)和用上述分子時(shí)刻表特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的上述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果。根據(jù)本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算裝置可以解決所述問題。
本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算方法，是使用信息處理裝置，根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的方法，包括以下步驟存儲(chǔ)對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的分子時(shí)刻表的分子時(shí)刻表存儲(chǔ)步驟，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線表示規(guī)定物種的規(guī)定部位的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；輸入檢體含有的上述概日振動(dòng)基因的上述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，上述檢體采集自上述生物個(gè)體的上述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出步驟，上述體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的上述測(cè)定數(shù)據(jù)和用上述分子時(shí)刻表特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的上述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果。根據(jù)本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算方法可以解決所述問題。
本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算程序，是一種使信息處理裝置進(jìn)行以下步驟的程序，所述信息處理裝置是根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算上述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的信息處理裝置，所述步驟包括存儲(chǔ)對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的分子時(shí)刻表的分子時(shí)刻表存儲(chǔ)步驟，上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線表示規(guī)定物種的規(guī)定部位的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；輸入檢體含有的上述概日振動(dòng)基因的上述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，上述檢體采集自上述生物個(gè)體的上述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出步驟，上述體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的上述測(cè)定數(shù)據(jù)和用上述分子時(shí)刻表特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的上述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果。根據(jù)本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算程序可以解決所述問題。
如此，由于具備導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出機(jī)構(gòu)，并且上述體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的上述測(cè)定數(shù)據(jù)和用上述分子時(shí)刻表特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的上述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果，因此可以通過對(duì)照采集一次得到的檢體的測(cè)定數(shù)據(jù)和規(guī)定物種的規(guī)定部位的分子時(shí)刻表所特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，不需多次采集檢體，以采集一次得到的檢體為基礎(chǔ)就能簡(jiǎn)易判斷是否有概日節(jié)律障礙和推算體內(nèi)時(shí)刻。


圖1是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)總體構(gòu)成的說(shuō)明圖。
圖2是表示總括本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的體內(nèi)時(shí)刻推算裝置的硬件構(gòu)成說(shuō)明圖。
圖3是表示經(jīng)時(shí)的基因表達(dá)產(chǎn)物量表格構(gòu)成的說(shuō)明圖。
圖4是表示分子時(shí)刻表表格構(gòu)成的說(shuō)明圖。
圖5是表示體內(nèi)時(shí)刻信息表格構(gòu)成的說(shuō)明圖。
圖6是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的處理流程的框圖。
圖7是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的概日振動(dòng)基因選擇處理的流程圖。
圖8是表示用于選擇基因的余弦波的說(shuō)明圖。
圖9是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的概日表達(dá)變動(dòng)曲線-分子時(shí)刻表生成處理的流程圖。
圖10是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算和信息提供處理的流程圖。
圖11是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算和信息提供處理中初期設(shè)定的處理的流程圖。
圖12是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算和信息提供處理中樣品的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的標(biāo)準(zhǔn)化處理的流程圖。
圖13是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算和信息提供處理中標(biāo)準(zhǔn)化了的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量和時(shí)刻t時(shí)的各概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的推算表達(dá)量之間皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)c的計(jì)算處理的流程圖。
圖14是表示本發(fā)明的一實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告畫面的說(shuō)明圖。
圖15是表示檢查對(duì)象的特征表格的說(shuō)明圖。
圖16是表示一例數(shù)據(jù)解析結(jié)果的說(shuō)明圖。
具體實(shí)施例方式
下面，參照附圖，說(shuō)明本發(fā)明的實(shí)施例。其中，下面說(shuō)明的部件、配置等并不限定本發(fā)明，在本發(fā)明宗旨的范圍內(nèi)能夠進(jìn)行各種改變。
所謂本發(fā)明的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)，是指使用由信息中心內(nèi)的服務(wù)器計(jì)算機(jī)輸入、接收的人體檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)，在導(dǎo)出含有是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果的體內(nèi)時(shí)刻信息的同時(shí)，把該體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送到判斷委托人即客戶的終端計(jì)算機(jī)上的系統(tǒng)。
在本實(shí)施方式中，說(shuō)明了有關(guān)進(jìn)行人體體內(nèi)時(shí)刻推算的例子，只要是小鼠、大鼠、狗等哺乳動(dòng)物等具有概日節(jié)律的生物，則本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)可以用于任何生物的體內(nèi)時(shí)刻推算。
另外，在本實(shí)施方式中使用人的血樣，說(shuō)明有關(guān)進(jìn)行每個(gè)人的體內(nèi)時(shí)刻推算的例子，只要是小鼠的視交叉上核、肝臟、果蠅頭部、人的皮膚、末梢血中的白細(xì)胞、口腔粘膜、其他各臟器等具有概日節(jié)律的檢體，則可以用于對(duì)任何檢體的體內(nèi)時(shí)刻推算。
而且，在本實(shí)施方式中，作為基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)，使用基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物信使RNA(以下稱為mRNA)量的測(cè)定數(shù)據(jù)，但只要是由基因編碼的蛋白質(zhì)量的測(cè)定數(shù)據(jù)，由基因編碼的蛋白質(zhì)的修飾量的測(cè)定數(shù)據(jù)，由基因編碼的酶的活性的測(cè)定數(shù)據(jù)，在酶的作用下代謝的化合物量的測(cè)定數(shù)據(jù)，由基因表達(dá)產(chǎn)物控制的體溫、血壓、心率、血流量、呼吸數(shù)、腦電波、活動(dòng)量、體液pH等物理量的測(cè)定數(shù)據(jù)等有概日節(jié)律的測(cè)定數(shù)據(jù)，可以把任何測(cè)定數(shù)據(jù)作為基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)使用。
所謂“概日振動(dòng)基因”，是指在明亮期和黑暗期交替重復(fù)的周期為24小時(shí)的明暗條件下或恒暗條件下，基因表達(dá)以周期約24小時(shí)(20～28小時(shí))出現(xiàn)振動(dòng)。
“標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量”是指基因的經(jīng)時(shí)表達(dá)量測(cè)定數(shù)據(jù)的均值，“標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量”是指基因的經(jīng)時(shí)表達(dá)量測(cè)定數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差，“相對(duì)表達(dá)量”是指從基因的基因表達(dá)產(chǎn)物測(cè)定值減去標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量，進(jìn)而用標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量去除的標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)量。
所謂“標(biāo)準(zhǔn)化”，是指用同一標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)各基因的表達(dá)變動(dòng)的方法，是從各基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量的測(cè)定值或各概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的值減去標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量，進(jìn)而用標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量去除。由此，能夠把各概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量作為1，把標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量作為0進(jìn)行統(tǒng)一處理。
所謂“概日表達(dá)變動(dòng)曲線”，是指從有限的表達(dá)數(shù)據(jù)對(duì)概日振動(dòng)基因的經(jīng)時(shí)表達(dá)狀態(tài)進(jìn)行算式化的曲線，可通過多種方法并以經(jīng)時(shí)測(cè)定的表達(dá)量為基礎(chǔ)形成。所謂“相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線”，是指從各概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的值減去標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量，進(jìn)而用標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量去除而標(biāo)準(zhǔn)化了的概日表達(dá)變動(dòng)曲線。
所謂“ZT時(shí)刻”，是表示把明暗條件下亮燈時(shí)作為ZT0時(shí)的時(shí)刻。亮燈12小時(shí)后，在ZT12熄燈。因此，ZT0時(shí)至ZT12時(shí)為明亮期，隨后的ZT12時(shí)至ZT24時(shí)為黑暗期。
所謂“CT時(shí)刻”，是指在周期24小時(shí)的明亮期、黑暗期進(jìn)行節(jié)律調(diào)諧之后，原本相當(dāng)于ZT0時(shí)的時(shí)刻不亮燈而作為CT0時(shí)。把自CT0時(shí)的恒暗條件下的周期為24小時(shí)的時(shí)刻作為CT時(shí)刻而標(biāo)記。
所謂“分子時(shí)刻”，是指取概日振動(dòng)基因的概日表達(dá)變動(dòng)曲線最大值的CT時(shí)刻或ZT時(shí)刻。
所謂“類似性”，是指表示對(duì)象與對(duì)象之間相似程度的數(shù)值。類似性具有與相關(guān)系數(shù)一樣數(shù)值越大表示類似性越高的“類似度”、和與距離一樣數(shù)值越小表示類似性越高的“非類似度”。
關(guān)于表示非類似度指標(biāo)之一的“距離”，是表示對(duì)象與對(duì)象之間的間隔程度的指標(biāo)?！皻W幾里得的平方距離”是最常用的距離之一，當(dāng)用(x1，y1)、(x2，y2)、(x3，y3)……(Xn，yn)給予數(shù)據(jù)時(shí)，變量x和y之間的距離dxy用定義(文獻(xiàn)3)。
“相關(guān)系數(shù)”是表示類似度的指標(biāo)之一，是表示相關(guān)程度的指標(biāo)?！捌栠d積矩相關(guān)系數(shù)”是最常用的相關(guān)系數(shù)之一，用
γxy=Σi=1N(xi-x‾)(yi-y‾)nΣi=1N(xi-x‾)2nΣi=1N(y1-y‾)2n]]>定義(文獻(xiàn)4)。其中設(shè)為。
對(duì)余弦波的標(biāo)準(zhǔn)偏差s進(jìn)行說(shuō)明。根據(jù)下述能夠求出余弦波上對(duì)應(yīng)的時(shí)刻t時(shí)的值A(chǔ)(t)。
周期時(shí)間24(小時(shí))。
T余弦波的分子時(shí)刻(如，可以作為至0/60、10/60、20/60、30/60、……、1420/60、1430/60的每10分鐘間隔的144種時(shí)刻)t對(duì)應(yīng)的時(shí)刻根據(jù)下述能夠求出余弦波上經(jīng)時(shí)數(shù)據(jù)(取樣時(shí)數(shù)值的集合)的標(biāo)準(zhǔn)偏差s。
s=nΣi=1n(A(t)i)2-(Σi=1nA(t)i)2n(n-1)]]>如，當(dāng)每4小時(shí)刻隔取得余弦波上的經(jīng)時(shí)數(shù)據(jù)時(shí)，能夠把t作為下述的6點(diǎn)的時(shí)刻組(n＝6)標(biāo)記。(α+0)/60、(α+240)/60、(α+480)/60、(α+720)/60、(α+960)/60、(α+1200)/60、(其中，α是0分至240分之間的某一時(shí)刻(不包括240分鐘))。此時(shí)的標(biāo)準(zhǔn)偏差為0.7745967。
本說(shuō)明書中的所謂“計(jì)算機(jī)”，是指包括所有裝配演算裝置的信息終端。如，除了服務(wù)器計(jì)算機(jī)、通用計(jì)算機(jī)、辦公計(jì)算機(jī)、控制用計(jì)算機(jī)、工作站、個(gè)人計(jì)算機(jī)之外，也包括便攜式信息終端、裝有演算裝置的便攜式電話、佩戴式計(jì)算機(jī)等。
另外，本說(shuō)明書中的所謂“輸入”，是指向計(jì)算機(jī)中輸入指示或數(shù)據(jù)，除了通過鍵盤、鼠標(biāo)等輸入指示或數(shù)據(jù)之外，也包括從軟盤、微型光盤等的存儲(chǔ)介質(zhì)輸入指示或數(shù)據(jù)，介由通信線路接收來(lái)自外部裝置的指示或數(shù)據(jù)。
(第1實(shí)施方式)如圖1所示，本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)裝有把個(gè)人的體內(nèi)時(shí)刻信息提供給客戶的信息中心1、作為接收來(lái)自信息中心1的個(gè)人體內(nèi)時(shí)刻信息的客戶的醫(yī)療機(jī)構(gòu)2、運(yùn)動(dòng)中心3、個(gè)人會(huì)員4、老人保健設(shè)施5、法人會(huì)員6、教育機(jī)關(guān)7。
信息中心1設(shè)有服務(wù)器計(jì)算機(jī)11，介由網(wǎng)絡(luò)13連接客戶2～7的各終端計(jì)算機(jī)21～71。
信息中心1是總括管理本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的組織，也包括檢查公司、制藥公司、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、研究機(jī)關(guān)、分析中心、檢查中心、數(shù)據(jù)中心等。
在信息中心1設(shè)置有DNA芯片讀取裝置12和服務(wù)器計(jì)算機(jī)11，其中DNA芯片讀取裝置12，測(cè)定檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量，并把基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)輸入到服務(wù)器計(jì)算機(jī)11，而服務(wù)器計(jì)算機(jī)11，在使用接收自DNA芯片讀取裝置12的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)進(jìn)行概日節(jié)律障礙的判斷處理、體內(nèi)時(shí)刻的推算處理的同時(shí)，還作為把這些處理導(dǎo)出的體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送到終端計(jì)算機(jī)21～71的體內(nèi)時(shí)刻信息提供裝置。
其中，在本實(shí)施方式中，接收了來(lái)自DNA芯片讀取裝置12的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)，也可在客戶2～7上設(shè)置基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定裝置，接收來(lái)自終端計(jì)算機(jī)21～71的數(shù)據(jù)。
信息中心1通過送交或拿進(jìn)而接收來(lái)自客戶2～7的檢查對(duì)象的血樣19。通過公知的方法，處理血樣19使基因的表達(dá)mRNA量在可測(cè)定的狀態(tài)下。作為公知的方法，例如，使用來(lái)自血樣19的市售RNA提取試劑盒，如RNAqueous-Blood Module、RNAqueous Phenol-free Toatal RNA試劑盒(フナコシ社)，按照添加的協(xié)議對(duì)mRNA進(jìn)行分離、精制。其中，作為血樣19的處理，也可采用胍-硫氰酸酯-氯化銫法、胍-硫氰酸酯-熱-苯酚法、胍-硫氰酸酯-胍鹽酸法等提取mRNA，由低聚物(dT)纖維素柱吸附、洗脫mRNA，并精制mRNA。
隨后，關(guān)于處理后的血樣19，用DNA芯片讀取裝置12測(cè)定表達(dá)mRNA量。測(cè)定的mRNA量的原始數(shù)據(jù)積存在DNA芯片讀取裝置12中。
DNA芯片讀取裝置12中積存的原始數(shù)據(jù)，被發(fā)送到服務(wù)器計(jì)算機(jī)11。在服務(wù)器計(jì)算機(jī)11上加工該原始數(shù)據(jù)，判斷檢查對(duì)象是否有概日節(jié)律障礙，當(dāng)沒有概日節(jié)律障礙時(shí)導(dǎo)出該檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻。
導(dǎo)出的檢查對(duì)象的概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)的體內(nèi)時(shí)刻信息，作為該檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送、報(bào)告給委托的客戶終端計(jì)算機(jī)21～71。
客戶2～7是信息中心1的客戶，從信息中心1接收基于本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的體內(nèi)時(shí)刻信息的提供。
在客戶2～7中分別設(shè)置能夠?yàn)g覽信息中心1的服務(wù)器計(jì)算機(jī)11提供的體內(nèi)時(shí)刻信息顯示畫面的終端計(jì)算機(jī)21～71。
其中，也可以在客戶2～7上設(shè)置用于測(cè)定基因表達(dá)產(chǎn)物量的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定裝置。此時(shí)，在客戶2～7處測(cè)定檢查對(duì)象的血樣19的表達(dá)mRNA量，該測(cè)定數(shù)據(jù)自終端計(jì)算機(jī)21～71發(fā)送到服務(wù)器計(jì)算機(jī)11，則針對(duì)該測(cè)定數(shù)據(jù)的概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果、體內(nèi)時(shí)刻信息自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11發(fā)送到終端計(jì)算機(jī)21～71。
醫(yī)療機(jī)構(gòu)2為進(jìn)行睡眠覺醒節(jié)律障礙、季節(jié)性抑郁癥、時(shí)差癥候群、晝夜倒班勞動(dòng)者中睡眠障礙等患者的概日節(jié)律障礙判斷和患者用藥時(shí)見的確定等，利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
醫(yī)療機(jī)構(gòu)2上還設(shè)置把診療記錄、處方箋、各檢查結(jié)果等作為電子數(shù)據(jù)對(duì)每個(gè)患者進(jìn)行登記的電子病歷服務(wù)器計(jì)算機(jī)22。電子病歷服務(wù)器計(jì)算機(jī)22的構(gòu)成是，以院內(nèi)LAN與終端計(jì)算機(jī)21連接，并能把自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)21上的體內(nèi)時(shí)刻信息輸入到電子病歷服務(wù)器計(jì)算機(jī)22上。
如果存儲(chǔ)下述讀取程序則能把體內(nèi)時(shí)刻信息直接自動(dòng)地?cái)z入到電子病歷中，即所述程序在使后述的檢查對(duì)象編號(hào)和登記在電子病歷服務(wù)器計(jì)算機(jī)22上的患者編號(hào)是同一編號(hào)的同時(shí)，自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)21的每個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息被自動(dòng)讀取到電子病歷服務(wù)器計(jì)算機(jī)22的未圖示的病歷數(shù)據(jù)庫(kù)中。
另外，客戶除了醫(yī)療機(jī)構(gòu)2，也可是心理咨詢中心、保健所等保健福利設(shè)施、診所、兒童咨詢處、藥局等。
運(yùn)動(dòng)中心3是對(duì)運(yùn)動(dòng)選手進(jìn)行指導(dǎo)、訓(xùn)練、培育等的組織，且不拘運(yùn)動(dòng)的種類。運(yùn)動(dòng)中心3為制成運(yùn)動(dòng)選手參加國(guó)際大賽前的練習(xí)計(jì)劃等，利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
除了終端計(jì)算機(jī)31之外，運(yùn)動(dòng)中心3還設(shè)置把運(yùn)動(dòng)選手的健康狀況、練習(xí)項(xiàng)目、飲食菜單、大賽參加記錄等作為電子數(shù)據(jù)登記每個(gè)選手的選手管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)32。選手管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)32的構(gòu)成是，以中心內(nèi)LAN與終端計(jì)算機(jī)31連接，并能把自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)31上的體內(nèi)時(shí)刻信息輸入到選手管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)32上。
如果存儲(chǔ)下述讀取程序則能把體內(nèi)時(shí)刻信息直接自動(dòng)地?cái)z入到數(shù)據(jù)庫(kù)中，即所述程序在使后述的檢查對(duì)象編號(hào)和登記在選手管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)32上的選手編號(hào)是同一編號(hào)的同時(shí)，自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)31的每個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息被自動(dòng)讀取到選手管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)32的未圖示的數(shù)據(jù)庫(kù)中。
另外，客戶除了運(yùn)動(dòng)中心3，也可是管理體育館、運(yùn)動(dòng)俱樂部、俱樂部活動(dòng)的法人和管轄俱樂部活動(dòng)的教育機(jī)關(guān)等。
個(gè)人會(huì)員4是以改善自己的生活為目的，個(gè)人利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的客戶。
如，有高健康意向的個(gè)人，高齡者，既往有睡眠覺醒節(jié)律障礙、季節(jié)性抑郁癥、時(shí)差癥候群等的人、晝夜倒班勞動(dòng)者等。另外，這些人的家人和看護(hù)者在能夠從本人采集檢體時(shí)，也可以代替采集檢體并進(jìn)行本人體內(nèi)時(shí)刻信息的閱覽、管理。
老人保健設(shè)施5為對(duì)滯留在設(shè)施中的老人進(jìn)行健康管理、生活管理，利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
如作為確定房間分配的信息，可以使用體內(nèi)時(shí)刻信息。
根據(jù)入所時(shí)自信息中心1得到的體內(nèi)時(shí)刻信息，可以讓體內(nèi)時(shí)刻相近的人住在同一個(gè)房間里。由此，相同房間的人因體內(nèi)時(shí)刻相近，生活步調(diào)類似，能夠?qū)粽咻p松進(jìn)行起床時(shí)和就寢時(shí)的巡視等管理。
另外，如果入所時(shí)得到體內(nèi)時(shí)刻信息，則保健設(shè)施方就能在入所后早期適應(yīng)該滯留者的生活節(jié)奏，能使新入所者早期適應(yīng)整個(gè)設(shè)施的步調(diào)。
除了終端計(jì)算機(jī)51之外，老人保健設(shè)施5還設(shè)置了把滯留者的健康狀況、飲食菜單、家庭構(gòu)成、康復(fù)項(xiàng)目等作為電子數(shù)據(jù)登記每個(gè)滯留者的管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)52。管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)52的構(gòu)成是，以設(shè)施內(nèi)LAN和終端計(jì)算機(jī)51連接，并能把自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)51上的體內(nèi)時(shí)刻信息輸入到管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)52上。
如果存儲(chǔ)下述讀取程序則能把體內(nèi)時(shí)刻信息直接自動(dòng)地?cái)z入到數(shù)據(jù)庫(kù)中，即所述程序在使后述的檢查對(duì)象編號(hào)和登記在管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)52上的滯留者編號(hào)是同一編號(hào)的同時(shí)，自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)51的每個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息被自動(dòng)讀取到管理服務(wù)器計(jì)算機(jī)52的未圖示的數(shù)據(jù)庫(kù)中。
另外，客戶除了老人保健設(shè)施5，也可是老人醫(yī)院、老人福利設(shè)施、老人之家、居家老人看護(hù)的支援者等。
法人會(huì)員6是為了從業(yè)人員的健康管理和業(yè)務(wù)效率的提高等，利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
除了終端計(jì)算機(jī)61之外，法人會(huì)員6還設(shè)置了把工作時(shí)刻、工作時(shí)段、作業(yè)時(shí)刻、健康狀態(tài)、年齡等作為電子數(shù)據(jù)登記每個(gè)從業(yè)人員的信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)62。從業(yè)人員信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)62的構(gòu)成是，以LAN和終端計(jì)算機(jī)61連接，并能把自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)61上的體內(nèi)時(shí)刻信息輸入到從業(yè)人員信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)62上。
如果存儲(chǔ)下述讀取程序則能把體內(nèi)時(shí)刻信息直接自動(dòng)地?cái)z入到從業(yè)人員信息中，即所述程序在使后述的檢查對(duì)象編號(hào)和登記在從業(yè)人員信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)62上的從業(yè)人員編號(hào)是同一編號(hào)的同時(shí)，自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)61的每個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息被自動(dòng)讀取到從業(yè)人員信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)62的未圖示的病歷數(shù)據(jù)庫(kù)中。
另外，客戶除了法人會(huì)員6，也可是行政機(jī)關(guān)和其國(guó)內(nèi)外的駐外機(jī)構(gòu)等。
教育機(jī)關(guān)7是為了兒童、中學(xué)生、大學(xué)生的健康管理、精神衛(wèi)生和教育效率的提高等，利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)。
除了終端計(jì)算機(jī)71之外，教育機(jī)關(guān)7還設(shè)置了把成績(jī)、家庭環(huán)境、健康狀況、年齡等作為電子數(shù)據(jù)進(jìn)行登記的兒童、中學(xué)生、大學(xué)生信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)72。兒童、中學(xué)生、大學(xué)生信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)72的構(gòu)成是，以LAN與終端計(jì)算機(jī)71連接，并能把自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)71上的每個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息輸入到兒童、中學(xué)生、大學(xué)生信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)72上。
如果存儲(chǔ)下述讀取程序則能把體內(nèi)時(shí)刻信息直接自動(dòng)地?cái)z入到兒童、中學(xué)生、大學(xué)生信息中，即所述程序在使后述的檢查對(duì)象編號(hào)和登記在兒童、中學(xué)生、大學(xué)生信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)72上的兒童、中學(xué)生、大學(xué)生編號(hào)是同一編號(hào)的同時(shí)，自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11下載到終端計(jì)算機(jī)71的每個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息被自動(dòng)讀取到兒童、中學(xué)生、大學(xué)生信息服務(wù)器計(jì)算機(jī)72的未圖示的病歷數(shù)據(jù)庫(kù)中。
另外，客戶除了教育機(jī)關(guān)7，也可是大學(xué)、研究所等研究機(jī)關(guān)等。
客戶2～7采集檢查對(duì)象的血液，放置到由信息中心1分配的試管中，作為血樣19。在向該試管中放置樣本階段，要寫入客戶固有的客戶編號(hào)、檢查對(duì)象的編號(hào)、采集年月日-時(shí)刻?？蛻?～7通過送交或拿進(jìn)而把血樣19提交給信息中心1。
提交血樣19后1～2天，客戶2～7能在終端計(jì)算機(jī)21～71上閱覽檢查對(duì)象是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)的體內(nèi)時(shí)刻。
另一方面，當(dāng)在客戶2～7側(cè)設(shè)置基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定裝置時(shí)，在客戶2～7側(cè)測(cè)定血樣19的表達(dá)mRNA量，把該測(cè)定數(shù)據(jù)和事先附加的客戶編號(hào)、檢查對(duì)象的編號(hào)、采集年月日-時(shí)刻等信息一起自終端計(jì)算機(jī)21～71發(fā)送到服務(wù)器計(jì)算機(jī)11。
在發(fā)送測(cè)定數(shù)據(jù)后數(shù)小時(shí)之內(nèi)，客戶2～7在終端計(jì)算機(jī)21～71上可閱覽到檢查對(duì)象是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和體內(nèi)時(shí)刻信息。
接著，說(shuō)明各裝置、計(jì)算機(jī)。
DNA芯片讀取裝置12是由公知的DNA芯片讀取裝置構(gòu)成，裝有未圖示的DNA芯片掃描器、對(duì)掃描器讀取的數(shù)據(jù)進(jìn)行加工的未圖示的CPU和存儲(chǔ)被加工的數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)裝置。
DNA芯片讀取裝置12測(cè)定檢體中所含的全部RNA中的各個(gè)mRNA的量，測(cè)定數(shù)據(jù)登記在未圖示的存儲(chǔ)裝置中。
在本實(shí)施方式中，把DNA芯片讀取裝置12用于基因表達(dá)產(chǎn)物量的測(cè)定上，也可使用定量PCR裝置、實(shí)時(shí)PCR裝置、DNA微陣列裝置、核糖核酸酶保護(hù)分析裝置、諾思(ノザン)雜交裝置。
另外，作為基因表達(dá)產(chǎn)物量利用蛋白質(zhì)量的測(cè)定數(shù)據(jù)時(shí)，使用公知的二維電泳裝置、質(zhì)譜裝置、蛋白質(zhì)芯片裝置、抗體芯片裝置、免疫印跡裝置等。
服務(wù)器計(jì)算機(jī)11是使用基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)，進(jìn)行檢體是否有概日節(jié)律障礙的判斷和有關(guān)檢體的檢查對(duì)象體內(nèi)時(shí)刻推算的裝置。
如圖2所示，服務(wù)器計(jì)算機(jī)11裝有中央演算處理裝置CPU70，作為存儲(chǔ)裝置的RAM73、ROM74、HDD75、存儲(chǔ)介質(zhì)裝置76，通信裝置77，鍵盤78，鼠標(biāo)79，顯示裝置80，打印機(jī)81。
CPU70的任務(wù)是使用自存儲(chǔ)裝置、通信裝置或輸入裝置攝取的信息進(jìn)行演算，并把演算結(jié)果交付給存儲(chǔ)裝置、通信裝置或輸出裝置。
存儲(chǔ)裝置存儲(chǔ)實(shí)行各種處理的程序等。在存儲(chǔ)裝置當(dāng)中，存儲(chǔ)介質(zhì)裝置76是由另外附加的HDD、CD、DVD等介質(zhì)裝置構(gòu)成的，可適當(dāng)存儲(chǔ)、讀取介由通信裝置77接收的數(shù)據(jù)、從鍵盤78或鼠標(biāo)79輸入的數(shù)據(jù)。
在RAM73中，存儲(chǔ)CPU70為實(shí)行處理所必需的數(shù)據(jù)等。顯示裝置80顯示CPU70根據(jù)ROM74、HDD75等所存儲(chǔ)的程序制成的圖像等。打印機(jī)81把來(lái)自各計(jì)算機(jī)的規(guī)定信息輸出到紙上。通信裝置77進(jìn)行和DNA芯片讀取裝置12、終端計(jì)算機(jī)21～71等其他計(jì)算機(jī)之間的數(shù)據(jù)收發(fā)。
HDD75存儲(chǔ)圖3的經(jīng)時(shí)的基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14、含有從標(biāo)準(zhǔn)檢體的經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)中選出的候補(bǔ)概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)數(shù)據(jù)的未圖示的概日振動(dòng)基因表格、圖4的分子時(shí)刻表表格15、圖5的體內(nèi)時(shí)刻信息表格16、未圖示的選擇基因用余弦波信息、未圖示的生成時(shí)刻表用余弦波信息。
所謂圖3的經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14，是在每個(gè)基因上登記標(biāo)準(zhǔn)檢體所含的基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)數(shù)據(jù)的表格。
所謂圖4的分子時(shí)刻表表格15，是用于樣本的概日節(jié)律障礙判斷、體內(nèi)時(shí)刻推算處理的表格，登記賦予從標(biāo)準(zhǔn)檢體中選擇的各概日振動(dòng)基因的概日表達(dá)變動(dòng)曲線特征的數(shù)值，即LD條件(12小時(shí)明亮期，12小時(shí)黑暗期的周期為24小時(shí)的明暗條件)下的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量153、標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量154、分子時(shí)刻155，和DD條件(恒暗條件)下的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量156、標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量157、分子時(shí)刻158。
所謂圖5的體內(nèi)時(shí)刻信息表格16，是登記檢查對(duì)象的樣本的概日節(jié)律障礙判斷結(jié)果和體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果的表格，通過實(shí)行圖10的體內(nèi)時(shí)刻推算和信息提供流程，登記各記錄。
在體內(nèi)時(shí)刻信息表格16上，登記接收血樣19時(shí)在信息中心1給每份檢體附加的受理編號(hào)161、客戶進(jìn)行會(huì)員登記時(shí)給每個(gè)客戶附加的客戶編號(hào)162、客戶負(fù)責(zé)人的用戶ID163、客戶負(fù)責(zé)人的用戶密碼164、在客戶側(cè)給每個(gè)檢查對(duì)象附加的檢查對(duì)象編號(hào)165、在客戶側(cè)采集血樣19時(shí)記載于血樣19的試管等上并在信息中心1側(cè)輸入的采血時(shí)刻166、通過服務(wù)器計(jì)算機(jī)11判斷有無(wú)概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果167、通過服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果168、在信息中心1側(cè)必要時(shí)對(duì)每份檢體輸入的注釋169。
所謂選擇基因用余弦波信息，是指從標(biāo)準(zhǔn)檢體所含的基因中選擇概日振動(dòng)基因所使用的余弦波信息。
所謂選擇基因用余弦波，是指周期為20小時(shí)至28小時(shí)且每1小時(shí)都有差異，同時(shí)以60分鐘為一個(gè)間隔相移的共540種余弦波。即，關(guān)于各9種周期時(shí)間，生成不同相位的60種余弦波。該選擇基因用余弦波的一部分如圖8所示。
選擇基因用余弦波信息包括為求出選擇基因用余弦波上的數(shù)值z(mì)(t)而使用的公式A(t)
周期時(shí)間20、21、22、23、24、25、26、27、28共9種T60等份周期時(shí)間時(shí)的各時(shí)刻且是顯示余弦波最大值的時(shí)刻t某一時(shí)刻。
所謂生成時(shí)刻表用余弦波信息，是指為生成從標(biāo)準(zhǔn)檢體所含的基因中選擇的概日振動(dòng)基因的分子時(shí)刻表而使用的余弦波信息。
所謂生成時(shí)刻表余弦波，是指周期為24小時(shí)且以10分鐘間隔出現(xiàn)相移的144種余弦波。
生成時(shí)刻表用余弦波信息包括為求出生成時(shí)刻表用余弦波上的數(shù)值α(t)而使用的公式A(t) 周期時(shí)間24(小時(shí))T余弦波的分子時(shí)刻(如，可以作為至0/60、10/60、20/60、30/60、……、1420/60、1430/60的每10分鐘間隔的144種時(shí)刻)t某一時(shí)刻。
接著以圖6為基礎(chǔ)，說(shuō)明本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的處理流程。
信息中心1是用服務(wù)器計(jì)算機(jī)11介由網(wǎng)絡(luò)13提供面向客戶的體內(nèi)時(shí)刻信息閱覽服務(wù)。
關(guān)于體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的處理，大致可由圖6所示的基因選擇-時(shí)刻表生成階段100、概日節(jié)律障礙判斷-體內(nèi)時(shí)刻推算階段200和向客戶的報(bào)告階段300構(gòu)成。
基因選擇-時(shí)刻表生成階段100的步驟，是指應(yīng)稱之為概日節(jié)律障礙判斷-體內(nèi)時(shí)刻推算的準(zhǔn)備階段的步驟，是向客戶提供體內(nèi)時(shí)刻信息的服務(wù)開始前進(jìn)行的步驟。
選擇用于概日節(jié)律障礙判斷-體內(nèi)時(shí)刻推算的組織、細(xì)胞等部位和概日振動(dòng)基因，生成該概日振動(dòng)基因的分子時(shí)刻表。
在基因選擇-時(shí)刻表生成階段100，首先通過處理101獲得標(biāo)準(zhǔn)檢體的經(jīng)時(shí)基因表達(dá)數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)的取得是通過DNA芯片讀取裝置12進(jìn)行。
所謂標(biāo)準(zhǔn)檢體，是指從多個(gè)個(gè)體采集的生物組織。在本實(shí)施方式中，作為標(biāo)準(zhǔn)生物樣本使用從多個(gè)人采集的血液。
作為標(biāo)準(zhǔn)檢體，是從規(guī)定條件下的多個(gè)人體每隔固定的時(shí)刻間隔采集血液。具體地說(shuō)，讓多個(gè)被檢者滯留于房間內(nèi)2周后，其中該房間的明暗周期為24小時(shí)，其中12小時(shí)為明亮期，12小時(shí)為黑暗期，經(jīng)過2天在相同的12小時(shí)明亮期和12小時(shí)黑暗期的周期為24小時(shí)的明暗條件下(LD條件下)或恒暗條件下(DD條件下)，每隔4小時(shí)采血。
明暗條件下的采血時(shí)刻有即將亮燈時(shí)(ZT0)、亮燈4小時(shí)后(ZT4)、亮燈8小時(shí)后(ZT8)、即將熄燈時(shí)(ZT12)、熄燈4小時(shí)后(ZT16)、熄燈8小時(shí)后(ZT20)、第2天的即將亮燈時(shí)(ZT24)、第2天的亮燈4小時(shí)后(ZT28)、第2天的亮燈8小時(shí)后(ZT32)、第2天的即將熄燈時(shí)(ZT36)、第2天的熄燈4小時(shí)后(ZT40)和第2天的熄燈8小時(shí)后(ZT44)12個(gè)時(shí)刻點(diǎn)，恒暗條件下的采血時(shí)刻是恒暗條件即將開始時(shí)(CT0時(shí))、主觀上白晝開始4小時(shí)之后(CT4時(shí))、主觀上白晝開始8小時(shí)之后(CT8時(shí))、主觀上黑夜即將開始時(shí)(CT12時(shí))、主觀上黑夜開始4小時(shí)之后(CT16時(shí))、主觀上黑夜開始8小時(shí)之后(CT20時(shí))、第2天的主管上白晝即將開始時(shí)(CT24時(shí))、第2天的主觀上白晝開始4小時(shí)之后(CT28時(shí))、第2天的主觀上白晝開始8小時(shí)之后(CT32時(shí))、第2天的主觀上黑夜即將開始時(shí)(CT36時(shí))、第2天的主觀上黑夜開始4小時(shí)之后(CT40時(shí))和第2天的主觀上黑夜開始8小時(shí)之后(CT44時(shí))12個(gè)時(shí)刻點(diǎn)。
采用公知的方法在個(gè)體的每個(gè)條件每個(gè)采血時(shí)刻，把從多個(gè)人采集的血液調(diào)制成用于測(cè)定作為基因表達(dá)產(chǎn)物量的mRNA量的標(biāo)準(zhǔn)檢體。
使用DNA芯片讀取裝置12測(cè)定該個(gè)體的每個(gè)條件每個(gè)采血時(shí)刻點(diǎn)的標(biāo)準(zhǔn)檢體中的mRNA量，得到標(biāo)準(zhǔn)檢體的經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)。
在把該經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)存儲(chǔ)到DNA芯片讀取裝置12的未圖示的存儲(chǔ)裝置的同時(shí)，從DNA芯片讀取裝置12把數(shù)據(jù)發(fā)送到服務(wù)器計(jì)算機(jī)11。
接著，通過處理102，以在處理101接收的經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，服務(wù)器計(jì)算機(jī)11進(jìn)行概日振動(dòng)基因的選擇。
以圖7的概日振動(dòng)基因選擇流程圖為基礎(chǔ)說(shuō)明對(duì)該概日振動(dòng)基因的選擇。通過服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的CPU70控制圖7的處理。
服務(wù)器計(jì)算機(jī)11接收來(lái)自DNA芯片讀取裝置12的經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)，則把該數(shù)據(jù)作為經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14登記到HDD75上。經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14如圖3所示。
在經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14上，把作為各基因在各時(shí)刻點(diǎn)表達(dá)量的mRNA量登記到每個(gè)基因上。
如果把經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14登記到HDD75上，則開始圖7的流程。首先，在步驟S101，讀取一項(xiàng)經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14的基因記錄。
接著，在步驟S102，根據(jù)自HDD75獲得的選擇基因用余弦波信息的公式A(t)，導(dǎo)出適用于各基因的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量、標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量的公式z(t)，向z(t)中分別代入一項(xiàng)周期時(shí)間、T，則從540種余弦波中特定一種余弦波。z(t)公式為 周期時(shí)間20、21、22、23、24、25、26、27、28共9種A基因A的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量B根據(jù)上述數(shù)4和數(shù)5計(jì)算的余弦波的標(biāo)準(zhǔn)偏差C基因A的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量T60等份周期時(shí)間時(shí)的各時(shí)刻且是顯示余弦波最大值的時(shí)刻t某一時(shí)刻。
接著，在步驟S103，計(jì)算在步驟S101讀取的基因記錄的各時(shí)刻的數(shù)值、和把相對(duì)應(yīng)的4小時(shí)間隔時(shí)刻代入公式z(t)中的t中得到的數(shù)值之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)，并把計(jì)算結(jié)果保存到RAM73中。
即，計(jì)算基因記錄的時(shí)刻4n時(shí)的值xn(ZT4n的表達(dá)量或CT4n的表達(dá)量(n是0以上11以下的整數(shù)))、和時(shí)刻4n時(shí)的余弦波上的值yn(ZT4n的余弦波上的值或CT4n的余弦波上的值(n是0以上11以下的整數(shù)))之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)。
接著，在步驟S104，判斷是否存在尚未算出矩相關(guān)系數(shù)的周期時(shí)刻、T。
當(dāng)存在尚未算出矩相關(guān)系數(shù)的周期時(shí)刻、T時(shí)(步驟S104是)，在步驟S102向公式z(t)中分別代入一項(xiàng)的周期時(shí)間、T，從540種余弦波中特定一種余弦波。
當(dāng)不存在尚未算出矩相關(guān)系數(shù)的周期時(shí)間、T時(shí)(步驟S104否)，關(guān)于該基因記錄，把其作為完成所有選擇基因用余弦波的矩相關(guān)系數(shù)的計(jì)算、保存的記錄，在步驟S105，判斷在對(duì)于該基因記錄算出的所有矩相關(guān)系數(shù)中滿足系數(shù)＞0.75的記錄。
當(dāng)存在系數(shù)＞0.75的記錄時(shí)(步驟S105是)，其基因的表達(dá)量在20小時(shí)以上28小時(shí)以下的周期時(shí)間范圍內(nèi)振動(dòng)，且具有作為概日振動(dòng)基因的特征，在步驟S106，在其基因記錄中設(shè)置基因候補(bǔ)標(biāo)記。
接著，在步驟S107，判斷是否存在沒有進(jìn)行與選擇基因用余弦波之間的矩相關(guān)系數(shù)計(jì)算處理的基因記錄。進(jìn)行有關(guān)各基因，LD條件下和DD條件下基因記錄雙方的矩相關(guān)系數(shù)計(jì)算。
當(dāng)存在未進(jìn)行相關(guān)系數(shù)計(jì)算的基因記錄時(shí)(步驟S107是)，在步驟S101，讀取一項(xiàng)基因記錄。
當(dāng)不存在未進(jìn)行相關(guān)系數(shù)計(jì)算的基因記錄時(shí)(步驟S107否)，作為完成有關(guān)所有基因的候補(bǔ)概日振動(dòng)基因的判斷的記錄，在步驟S108，生成含有候補(bǔ)概日振動(dòng)基因的未圖示的概日振動(dòng)基因表格。在該步驟S108，參照經(jīng)時(shí)基因表達(dá)產(chǎn)物量表格14，只提取設(shè)置了有關(guān)LD條件下以及DD條件下的基因候補(bǔ)標(biāo)記的基因記錄，生成未圖示的概日振動(dòng)基因表格。隨后，結(jié)束處理。
根據(jù)上述處理完成圖6處理102的概日振動(dòng)基因選擇。
如果完成圖6處理102的概日振動(dòng)基因選擇，則在處理103，服務(wù)器計(jì)算機(jī)11進(jìn)行各基因產(chǎn)物的概日表達(dá)變動(dòng)曲線、分子時(shí)刻表的生成。
以圖9的概日表達(dá)變動(dòng)曲線、分子時(shí)刻表的生成流程圖為基礎(chǔ)說(shuō)明該處理。用服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的CPU70控制圖9的處理。
如果完成圖6處理102的概日振動(dòng)基因選擇，則開始圖9的流程。
首先，在步驟S201，從圖7的步驟S108生成的未圖示的概日振動(dòng)基因表格，分別在LD條件、DD條件下讀取一項(xiàng)概日振動(dòng)基因記錄。
接著，在步驟S202，根據(jù)從HDD75中取得的生成時(shí)刻表用余弦波信息的公式A(t)，導(dǎo)出適用于各基因的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量、標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量的公式α(t)，向α(t)中代入1項(xiàng)T，從144種余弦波中特定一種余弦波。公式α(t)為α(t)=ABCos(2π(t-T)24)+C]]>A概日振動(dòng)基因A的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量B根據(jù)上述數(shù)4和數(shù)5計(jì)算的余弦波的標(biāo)準(zhǔn)偏差C基因A的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量T余弦波的分子時(shí)刻(如，可以作為至0/60、10/60、20/60、30/60、……、1420/60、1430/60的每10分鐘間隔的144種時(shí)刻)t某一時(shí)刻。
接著，在步驟S203，計(jì)算在步驟S201讀取的概日振動(dòng)基因記錄的各時(shí)刻的數(shù)值、和把相對(duì)應(yīng)的4小時(shí)間隔的時(shí)刻代入公式α(t)中的t得到的數(shù)值之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)，并把計(jì)算結(jié)果保存到RAM73中。
即，計(jì)算概日振動(dòng)基因記錄的時(shí)刻4n時(shí)的值xn(ZT4n的表達(dá)量或CT4n的表達(dá)量(n是0以上11以下的整數(shù)))、和時(shí)刻4n時(shí)的余弦波上的值yn(ZT4n的余弦波上的值或CT4n的余弦波上的值(n是0以上11以下的整數(shù)))之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)。
接著，在步驟S204，判斷是否存在尚未算出矩相關(guān)系數(shù)的T。
當(dāng)存在尚未算出矩相關(guān)系數(shù)的T時(shí)(步驟S204是)，在步驟S202向公式α(t)中代入一項(xiàng)T，從144種余弦波中特定一種余弦波。
當(dāng)不存在尚未算出矩相關(guān)系數(shù)的T時(shí)(步驟S204否)，關(guān)于該條件下的該概日振動(dòng)基因記錄，把其作為完成所有的生成時(shí)刻表用余弦波的矩相關(guān)系數(shù)的計(jì)算、保存的記錄，在步驟S205，提取有關(guān)該條件下的該概日振動(dòng)基因記錄的計(jì)算出的所有矩相關(guān)系數(shù)中呈最大值的余弦波，并保存到RAM73中。該余弦波成為表示概日振動(dòng)基因的表達(dá)振動(dòng)的概日表達(dá)變動(dòng)曲線。
接著，在步驟206，把提取的余弦波即概日表達(dá)變動(dòng)曲線上值最大的時(shí)刻作為分子時(shí)刻，把概日振動(dòng)基因名稱和條件名、標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量、標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量登記在圖4的分子時(shí)刻表表格15中。
該標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量153、156，標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量154、157，分子時(shí)刻155、158確定概日表達(dá)變動(dòng)曲線特征。
接著，在步驟S207，判斷是否存在沒有進(jìn)行與生成時(shí)刻表用余弦波之間的矩相關(guān)系數(shù)的計(jì)算處理的概日振動(dòng)基因記錄的條件。
當(dāng)存在未進(jìn)行和生成時(shí)刻表用余弦波的相關(guān)系數(shù)計(jì)算處理的概日振動(dòng)基因記錄的條件時(shí)(步驟S207是)，在步驟S201，分別在LD條件下和DD條件下，從在圖7的步驟S108生成的未圖示的概日振動(dòng)基因表格讀取一項(xiàng)概日振動(dòng)基因記錄。
當(dāng)不存在未進(jìn)行和生成時(shí)刻表用余弦波的相關(guān)系數(shù)計(jì)算處理的概日振動(dòng)基因記錄的條件時(shí)(步驟S207否)，作為完成有關(guān)所有概日振動(dòng)基因的概日表達(dá)變動(dòng)曲線和分子時(shí)刻表的生成的條件，結(jié)束處理。
根據(jù)上述，完成圖6處理103的各基因產(chǎn)物的概日表達(dá)變動(dòng)曲線、分子時(shí)刻表的生成。
由此，完成基因選擇、時(shí)刻表生成階段100，達(dá)到可向客戶提供體內(nèi)時(shí)刻信息的服務(wù)狀態(tài)。
如果完成了基因選擇、時(shí)刻表生成階段100，信息中心1開始了提供體內(nèi)時(shí)刻信息的服務(wù)。
客戶2～7的用戶在利用本實(shí)施方式的體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)之前，事先要在信息中心1進(jìn)行會(huì)員登記。
會(huì)員登記是通過在服務(wù)器計(jì)算機(jī)11提供的會(huì)員登記界面上輸入會(huì)員團(tuán)體名稱、用戶名、用戶密碼、用戶的電子郵件地址、聯(lián)系地址、服務(wù)費(fèi)用的支付方法等信息而進(jìn)行的。
在本實(shí)施方式中，提供體內(nèi)時(shí)刻信息的服務(wù)雖是針對(duì)事先登記成會(huì)員者的服務(wù)，但可在一般的小賣店等，銷售放置血樣19的試管和有關(guān)連接在信息中心1的服務(wù)器計(jì)算機(jī)11上的成套試劑盒(包括說(shuō)明書)，購(gòu)買試劑盒的消費(fèi)者可以單機(jī)接受服務(wù)。
客戶2～7把患者的血液放置到從信息中心1領(lǐng)取的試管中，并把血樣19送交到信息中心1。信息中心1用DNA芯片讀取裝置12并采取公知的方法測(cè)定領(lǐng)到的血樣19的表達(dá)mRNA量。
如果信息中心1完成血樣19的表達(dá)量測(cè)定，就運(yùn)行服務(wù)器計(jì)算機(jī)11，開始進(jìn)行概日節(jié)律障礙、體內(nèi)時(shí)刻的推算和信息提供處理。
在概日節(jié)律障礙、體內(nèi)時(shí)刻的推算和信息提供方面，以圖10～圖13的流程圖為基礎(chǔ)說(shuō)明服務(wù)器計(jì)算機(jī)11實(shí)行的處理。
一旦處理開始，首先在步驟S301中進(jìn)行初期設(shè)定。根據(jù)圖11的流程圖說(shuō)明步驟S301的詳細(xì)處理。
在步驟S301進(jìn)行的初期設(shè)置的處理中，首先，由服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的用戶用鍵盤78等輸入被輸入的閾值D，登記在HDD75的未圖示閾值存儲(chǔ)器上。
在這里，所謂閾值D，是表示當(dāng)樣本中的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的波和概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的推算表達(dá)量的波之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)的最大值C不到某個(gè)值時(shí)判斷為概日節(jié)律障礙的閾值。
優(yōu)選該閾值D因樣本中的概日振動(dòng)基因的數(shù)量的不同而不同。如，越增加樣本中概日振動(dòng)基因數(shù)量則設(shè)置的閾值D越小。當(dāng)樣本中的概日振動(dòng)基因的數(shù)量是100～200左右時(shí)，閾值D為0.3以上，優(yōu)選0.5以上。
在本實(shí)施方式中，閾值D為0.5。
接著，在步驟S352，由服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的用戶用鍵盤78等輸入被輸入的閾值U，登記在HDD75的未圖示閾值存儲(chǔ)器上。
在這里，所謂閾值U，是表示當(dāng)有關(guān)樣本概日振動(dòng)基因的推算的體內(nèi)時(shí)刻和環(huán)境時(shí)刻之間有多大程度的時(shí)刻偏差時(shí)判斷為概日節(jié)律障礙的閾值，本實(shí)施方式中定為2小時(shí)。
接著，在步驟S353，輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體各基因產(chǎn)物的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量、標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量、分子時(shí)刻。在該步驟，在圖6的處理103即各基因產(chǎn)物的概日表達(dá)變動(dòng)曲線、分子時(shí)刻表生成處理階段生成的分子時(shí)刻表當(dāng)中，從分子時(shí)刻表表格15中抽取和此次測(cè)定的樣本部位相對(duì)應(yīng)的分子時(shí)刻表，登記在ROM74上。
接著，在步驟S354，從步驟S353所登記的、和此次測(cè)定的樣本部位相對(duì)的分子時(shí)刻表中抽取標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量、標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量、分子時(shí)刻的數(shù)值，導(dǎo)出標(biāo)準(zhǔn)檢體的概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式
α(t)=ABCos(2π(t-T)24)+C]]>A概日振動(dòng)基因A的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量B根據(jù)上述數(shù)4和數(shù)5計(jì)算的余弦波的標(biāo)準(zhǔn)偏差C基因A的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量T余弦波的分子時(shí)刻(如，可以作為至0/60、10/60、20/60、30/60、……、1420/60、1430/60的每10分鐘間隔的144種時(shí)刻)t某一時(shí)刻。
接著，在步驟S355，標(biāo)準(zhǔn)化該概日表達(dá)變動(dòng)曲線。即，從標(biāo)準(zhǔn)檢體的各概日振動(dòng)基因的概日表達(dá)變動(dòng)曲線減去標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量，接著再用標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量去除，則導(dǎo)出標(biāo)準(zhǔn)檢體的各概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式β(t)=IBCos(2π(t-T)24)+C]]>B根據(jù)上述數(shù)4和數(shù)5計(jì)算的余弦波的標(biāo)準(zhǔn)偏差T余弦波的分子時(shí)刻(如，可以作為至0/60、10/60、20/60、30/60、……、1420/60、1430/60的每10分鐘間隔的144種時(shí)刻)t某一時(shí)刻。并把該相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線登記在ROM74上。
根據(jù)上述，結(jié)束圖10的步驟S301的初期設(shè)定處理。
接著，在圖10的步驟S302，由服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的用戶把所輸入的此次測(cè)定樣本的取樣時(shí)刻S登記在RAM73上。該取樣時(shí)刻S就是環(huán)境時(shí)刻。
接著，在步驟S303，在HDD75上登記樣本的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)。該步驟是通過服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的用戶的操作，并通過接收來(lái)自DNA芯片讀取裝置12的樣本概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)而進(jìn)行的。
接著，在步驟S304，進(jìn)行樣本的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的標(biāo)準(zhǔn)化，求樣本的各概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的相對(duì)表達(dá)量。關(guān)于其步驟S304的處理，以圖12為基礎(chǔ)進(jìn)行詳細(xì)說(shuō)明。
首先，在步驟S361，從樣本概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量中減去標(biāo)準(zhǔn)檢體的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量。該標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量是通過對(duì)每個(gè)基因算出標(biāo)準(zhǔn)檢體中的概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的表達(dá)量平均值而求的數(shù)值。
接著，在步驟S362，用標(biāo)準(zhǔn)檢體的標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量去除步驟S361中得到的數(shù)值。該標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量是通過對(duì)每個(gè)基因算出標(biāo)準(zhǔn)檢體中的概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的表達(dá)量標(biāo)準(zhǔn)偏差而求的數(shù)值。
根據(jù)上述，完成對(duì)步驟S304的樣本概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的標(biāo)準(zhǔn)化處理，求出樣本的各概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的相對(duì)表達(dá)量。
接著，在步驟S305，把0代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式β(t)的t，算出各概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上時(shí)刻t＝0時(shí)的數(shù)值。
接著，在步驟S306，判斷代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式β(t)的t得到的數(shù)值是否大于24。
當(dāng)代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式β(t)的t得到的數(shù)值不大于24時(shí)(步驟S306否)，即，當(dāng)代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式β(t)的t得到的數(shù)值在0時(shí)以上24時(shí)以下時(shí)，在步驟S307，計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)化了的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量和時(shí)刻t時(shí)的各概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的推算相對(duì)表達(dá)量之間的皮爾遜相關(guān)系數(shù)c。
關(guān)于其步驟S307的處理，以圖13為基礎(chǔ)詳細(xì)說(shuō)明。
首先，在步驟S371，得到各概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的時(shí)刻t時(shí)的推算相對(duì)表達(dá)量。在該處理中，一項(xiàng)一項(xiàng)讀取分子時(shí)刻表上有關(guān)各概日振動(dòng)基因的記錄，求概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線。接著，得到相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上時(shí)刻t時(shí)的數(shù)值，作為推算相對(duì)表達(dá)量。對(duì)有關(guān)所有的概日振動(dòng)基因進(jìn)行該處理。
接著，在步驟S372，計(jì)算步驟S304中標(biāo)準(zhǔn)化得到的并在取樣時(shí)刻時(shí)的樣本概日振動(dòng)基因產(chǎn)物的相對(duì)表達(dá)量和各概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上時(shí)刻t時(shí)的推算相對(duì)表達(dá)量之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)，和時(shí)刻t時(shí)的數(shù)值發(fā)生關(guān)聯(lián)，并在RAM73上登記得到的數(shù)值，完成圖13的處理。
接著，前進(jìn)到圖10的步驟S308，把正前的t加上dt之后的t+dt代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線公式β(t)的t，算出各概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上時(shí)刻t＝t+dt時(shí)的數(shù)值。
其中，在本實(shí)施方式中，該dt作為10分，即10/60小時(shí)。
接著，在步驟S306、判斷代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線的公式β(t)的t得到的數(shù)值是否大于24。
當(dāng)代入標(biāo)準(zhǔn)檢體的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線公式β(t)的t得到的數(shù)值大于24時(shí)(步驟S306是)，把其作為完成樣本的各概日振動(dòng)基因的相對(duì)表達(dá)量和有關(guān)0時(shí)至24時(shí)之間所有時(shí)刻的各概日振動(dòng)基因的相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上推算相對(duì)表達(dá)量之間的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)c的計(jì)算，前進(jìn)到步驟S309，進(jìn)行皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)c的最大值C和給予最大值C的體內(nèi)時(shí)刻T的搜尋。
在該步驟，得到登記在RAM73上的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)c的數(shù)據(jù)組，從該數(shù)據(jù)組中抽取最大的皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)值，作為最大值C。接著，得到對(duì)應(yīng)于皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)最大值C的時(shí)刻t，作為給予最大值C的體內(nèi)時(shí)刻T。把該最大值C和體內(nèi)時(shí)刻T作為樣本的最大值C和體內(nèi)時(shí)刻T登記在RAM73上。
接著，在步驟S310，判斷登記在RAM73上的最大值C是否滿足C＜閾值D。在本實(shí)施方式中，是把閾值D作為0.5進(jìn)行登記的，所以在該步驟判斷最大值C是否不到0.5。
當(dāng)最大值C＜閾值D時(shí)(步驟S310是)，樣本的取樣時(shí)刻時(shí)的相對(duì)概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量與任何時(shí)刻的各概日振動(dòng)基因的推算相對(duì)表達(dá)量都不相類似，所以設(shè)定為該樣本所涉及的檢查對(duì)象的概日振動(dòng)基因并非進(jìn)行正常的日振動(dòng)，在步驟S311，判斷該樣本為概日節(jié)律障礙的同時(shí)，在體內(nèi)時(shí)刻信息表格16的該受理編號(hào)的有無(wú)概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果167處，登記表示有節(jié)律障礙的“1”。
當(dāng)最大值C不小于閾值D時(shí)(步驟S310否)，即當(dāng)最大值C等于或大于閾值D時(shí)，存在樣本的取樣時(shí)刻時(shí)的相對(duì)概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量和各概日振動(dòng)基因的推算相對(duì)表達(dá)量相類似的時(shí)刻T，所以設(shè)定為該樣本所涉及的檢查對(duì)象的概日振動(dòng)基因有可能進(jìn)行正常的日振動(dòng)，前進(jìn)到步驟S312，判斷體內(nèi)時(shí)刻T和取樣時(shí)刻S之間差的絕對(duì)值是否是|T-S|＞閾值U。在這里，因?yàn)榈怯浀拈撝礥為2小時(shí)，所以判斷體內(nèi)時(shí)刻T和取樣時(shí)刻S差的絕對(duì)值是否大于2小時(shí)。
當(dāng)體內(nèi)時(shí)刻T和取樣時(shí)刻S差的絕對(duì)值大于閾值U時(shí)(步驟S312是)，設(shè)定為即使考慮本發(fā)明所涉及的體內(nèi)時(shí)刻推算法的一般誤差，則和作為環(huán)境時(shí)刻的取樣時(shí)刻S之間的時(shí)間偏差仍太大，在步驟S313，在判斷該樣本為概日節(jié)律障礙的同時(shí)，在體內(nèi)時(shí)刻信息表格16的該受理編號(hào)的有無(wú)概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果167處，登記表示有節(jié)律障礙的“1”。
接著，在步驟S314，在信息表格16的該受理編號(hào)的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果168處，登記步驟S309中算出的體內(nèi)時(shí)刻T，結(jié)束處理。
當(dāng)體內(nèi)時(shí)刻T和取樣時(shí)刻S差的絕對(duì)值不大于閾值U時(shí)(步驟S312否)，即體內(nèi)時(shí)刻T和取樣時(shí)刻S差的絕對(duì)值在閾值U以下時(shí)，設(shè)定為與作為環(huán)境時(shí)刻的取樣時(shí)刻S的時(shí)間偏差在正常范圍內(nèi)，把T作為檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻是沒有問題的，在體內(nèi)時(shí)刻信息表格16的該受理編號(hào)的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果168處，登記體內(nèi)時(shí)刻T，結(jié)束處理。
根據(jù)上述，結(jié)束概日節(jié)律障礙判斷和體內(nèi)時(shí)刻推算。
接著，對(duì)從客戶2～7閱覽服務(wù)器計(jì)算機(jī)11上登記的有無(wú)概日節(jié)律障礙和體內(nèi)時(shí)刻信息的處理進(jìn)行說(shuō)明。
如果完成圖6的概日節(jié)律障礙判斷、體內(nèi)時(shí)刻推算階段200，把檢查對(duì)象的血樣19送交給信息中心1的客戶2～7的用戶，會(huì)收到來(lái)自服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的以完成概日節(jié)律障礙判定和體內(nèi)時(shí)刻推算處理為要點(diǎn)的電子郵件。
用戶根據(jù)該電子郵件知道完成概日節(jié)律障礙判斷和體內(nèi)時(shí)刻推算處理的要點(diǎn)，則在由服務(wù)器計(jì)算機(jī)11提供的體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91接收?qǐng)D6的體內(nèi)時(shí)刻信息的報(bào)告300。
用該體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91，對(duì)圖6的體內(nèi)時(shí)刻信息進(jìn)行報(bào)告的處理進(jìn)行說(shuō)明。
在終端計(jì)算機(jī)21上，通過網(wǎng)絡(luò)輸入信息中心1的提供體內(nèi)時(shí)刻信息的服務(wù)界面的地址，則顯示未圖示的提供體內(nèi)時(shí)刻信息服務(wù)的初期界面。
在該初期界面上，除了有關(guān)體內(nèi)時(shí)刻和用藥時(shí)間管理等的一般信息之外，還顯示ID、密碼輸入界面顯示按鈕，上述ID使界面移行至提供體內(nèi)時(shí)刻信息服務(wù)的會(huì)員專用界面。
點(diǎn)擊ID、密碼輸入界面顯示按鈕，顯示未圖示的ID、密碼輸入界面。在該界面輸入ID、密碼，則服務(wù)器計(jì)算機(jī)11會(huì)以該客戶的客戶編號(hào)162為關(guān)鍵詞檢索體內(nèi)時(shí)刻信息表格16，抽取該客戶的記錄，生成用于體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91的數(shù)據(jù)。
隨后，用于該體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91的數(shù)據(jù)被發(fā)送到終端計(jì)算機(jī)21側(cè)。
在終端計(jì)算機(jī)21上，在其ID的會(huì)員專用界面上進(jìn)行連接登錄，顯示如圖14所示的體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91。
在體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91上，顯示連接登錄后的會(huì)員委托進(jìn)行節(jié)律障礙判斷和體內(nèi)時(shí)刻推算的檢體的體內(nèi)時(shí)刻信息清單910、關(guān)閉體內(nèi)時(shí)刻信息報(bào)告界面91的關(guān)閉按鈕921、用于下載與在下載確認(rèn)欄919確認(rèn)后檢體有關(guān)的判斷及推算結(jié)果的下載按鈕922、取消連接按鈕923。
體內(nèi)時(shí)刻信息清單910是每個(gè)檢體的體內(nèi)時(shí)刻信息的清單，在每個(gè)檢體上顯示該檢體的受理編號(hào)911、該檢體的檢查對(duì)象編號(hào)912、該檢體的采集時(shí)間913、顯示信息中心1收領(lǐng)該檢體的日期的收領(lǐng)日期914、作為該檢體檢查結(jié)果的有無(wú)節(jié)律障礙915、作為該檢體檢查結(jié)果的體內(nèi)時(shí)刻信息916、該檢查對(duì)象編號(hào)的體內(nèi)時(shí)刻信息履歷界面顯示按鈕917、有關(guān)該檢體檢查結(jié)果的注釋顯示按鈕918、用于下載該檢體檢查結(jié)果的下載確認(rèn)欄919。
用戶通過點(diǎn)擊履歷界面顯示按鈕917，可以預(yù)覽清單上顯示的檢體的檢查對(duì)象以往的結(jié)果履歷。
其中，服務(wù)器計(jì)算機(jī)11可以存儲(chǔ)數(shù)據(jù)解析程序，該程序是對(duì)來(lái)自體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)的多個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息進(jìn)行數(shù)據(jù)解析的程序。
通過該程序，算出每一年代、每一性別、每一人種、每一罹患疾病、每一身高和體重等特征、每一工作形式等的體內(nèi)時(shí)刻信息，可以分析人體內(nèi)時(shí)刻和人的特征之間的相關(guān)。分析得到的人體內(nèi)時(shí)刻和人的特征之間的相關(guān)性分析結(jié)果，可用于促進(jìn)人類健康和對(duì)疾病的對(duì)策等。
下面對(duì)通過提供體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)，對(duì)得到的多個(gè)檢查對(duì)象的體內(nèi)時(shí)刻信息進(jìn)行數(shù)據(jù)解析的處理進(jìn)行說(shuō)明。
信息中心1在收領(lǐng)血樣19時(shí)，還收領(lǐng)檢查對(duì)象編號(hào)165和檢查對(duì)象的出生年月日、性別、人種、罹患疾病、身高和體重等的特征數(shù)據(jù)。
可以在收領(lǐng)血樣19時(shí)介由網(wǎng)絡(luò)13接收該數(shù)據(jù)，也可以收領(lǐng)記載了數(shù)據(jù)和血樣19的紙張。
信息中心1收領(lǐng)的各檢查對(duì)象的特征數(shù)據(jù)，都登記在服務(wù)器計(jì)算機(jī)11的圖15的檢查對(duì)象特征表格17上。
如果在體內(nèi)時(shí)刻信息表格16和檢查對(duì)象特征表格17上累積規(guī)定項(xiàng)數(shù)以上的記錄，則在服務(wù)器計(jì)算機(jī)11上進(jìn)行數(shù)據(jù)解析。
一例數(shù)據(jù)解析結(jié)果如圖16所示。
數(shù)據(jù)解析結(jié)果可以用于診斷以后的睡眠覺醒節(jié)律障礙(睡眠相倒退癥候群、睡眠相前進(jìn)癥候群、非24小時(shí)睡眠一覺醒癥候群等)、季節(jié)性抑郁癥、時(shí)差癥候群(JET-LAG)。
其中，關(guān)于概日表達(dá)變動(dòng)曲線，如果是根據(jù)有限的表達(dá)數(shù)據(jù)來(lái)公式化概日振動(dòng)基因的經(jīng)時(shí)表達(dá)狀態(tài)，并以經(jīng)時(shí)測(cè)定的表達(dá)量為基礎(chǔ)而生成的，則不作限定。
例如，概日表達(dá)變動(dòng)曲線，可以通過周期曲線生成法(文獻(xiàn)1)制成，而上述周期曲線生成法是利用各概日振動(dòng)基因的經(jīng)時(shí)表達(dá)量測(cè)定數(shù)據(jù)的傅里葉變換。所謂“傅里葉變換”，是用法國(guó)的數(shù)學(xué)家和物理學(xué)家傅里葉發(fā)表的原理(可用時(shí)間t的函數(shù)h(t)表達(dá)物理過程，也可用某一頻率數(shù)f的函數(shù)H(f)表達(dá)物理過程)為基礎(chǔ)的變換法，為在2個(gè)表達(dá)之間往返而使用的公式。若用數(shù)式表達(dá)則如下所示。
h(t)=∫-∞∞H(f)exp(-2πift)df]]>H(f)=∫-∞∞h(t)exp(2πift)df]]>針對(duì)有限個(gè)數(shù)樣本值(計(jì)測(cè)值)的傅里葉變換稱為離散傅里葉變換。假定有成為離散傅里葉變換的對(duì)象的N個(gè)一系列的測(cè)定值hk≡h(tk)、tk≡kΔ、k＝0，1，2，……，N-1。抽樣間隔為Δ。這里能夠?qū)﹄x散傅里葉變換做如下定義。
Hn≡Σk=0N-1hkexp(2πiknN)]]>n＝0，1，2，……，N-1使用該Hn可按下面所示推算時(shí)間的函數(shù)h(t)。
h(t)≈1NΣk=0N-1Hnexp(-2πinNΔt)]]>另外，根據(jù)使用樣條插補(bǔ)法等插補(bǔ)法的插補(bǔ)曲線生成法(文獻(xiàn)1)可以制成概日表達(dá)變動(dòng)曲線。所謂“樣條插補(bǔ)”，是指用于插補(bǔ)曲線的生成、有限單元法、函數(shù)近似、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的配合等的插補(bǔ)法(文獻(xiàn)，文獻(xiàn)2)。
因?yàn)橐舶迅鶕?jù)傅里葉變換或樣條插補(bǔ)的概日表達(dá)變動(dòng)曲線作為時(shí)間的函數(shù)標(biāo)記，所以通過代入某一時(shí)刻t得到該概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的值，并從該值減去對(duì)應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量，再用標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量去除，則能求相對(duì)表達(dá)變動(dòng)曲線上的值。
另外，關(guān)于體內(nèi)時(shí)刻的推算，可把顯示預(yù)先生成的有關(guān)6個(gè)以上(優(yōu)選30個(gè)以上，更優(yōu)選50個(gè)以上，特別優(yōu)選100個(gè)以上)的任意概日振動(dòng)基因組的上述相對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線上某一時(shí)刻的數(shù)值，和另外測(cè)定的概日振動(dòng)基因組表達(dá)產(chǎn)物的相對(duì)表達(dá)量之間最高類似性的時(shí)刻作為體內(nèi)時(shí)刻進(jìn)行推算。例如，當(dāng)用余弦波生成概日表達(dá)變動(dòng)曲線，且作為皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)算出類似性時(shí)，顯示最高相似性在0.5以上的的相關(guān)系數(shù)時(shí)，可在2小時(shí)的誤差范圍內(nèi)推算體內(nèi)時(shí)刻。
另一方面，當(dāng)所有的時(shí)刻過去后兩者之間仍沒有足夠的類似性時(shí)(如，作為皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)不到0.5)，作為概日節(jié)律障礙可以檢測(cè)出。類似性并不限定在表示對(duì)象與對(duì)象之間類似程度的數(shù)值范圍內(nèi)，但優(yōu)選皮爾遜積矩相關(guān)系數(shù)。
用于體內(nèi)時(shí)刻推算的概日振動(dòng)基因只要具有本說(shuō)明書中作為概日振動(dòng)基因的性質(zhì)，則可以是公知的概日振動(dòng)基因，也可以是用DNA芯片法等提取的基因(包含功能未知的基因)。
另外，如上所述，除了先驗(yàn)地定義類似性而推算體內(nèi)時(shí)刻的方法之外，可以通過使用如支持向量機(jī)、遺傳算法、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等那樣的學(xué)習(xí)算法等，學(xué)習(xí)類似性，推算體內(nèi)時(shí)刻。
關(guān)于在本說(shuō)明書中引用的文獻(xiàn)，文獻(xiàn)1是Numerical Recipe in C、William H.Press等、技術(shù)評(píng)論社；文獻(xiàn)2是基于C的樣條函數(shù)，-數(shù)據(jù)解析、CG、微分方程式-主編櫻井明、著者 菅野敬祐、吉村和美、高山文雄、東京電機(jī)大學(xué)出版社；文獻(xiàn)3是簇分析及其應(yīng)用，西田英朗編譯，內(nèi)田老鶴圃；文獻(xiàn)4是基礎(chǔ)統(tǒng)計(jì)學(xué)I、統(tǒng)計(jì)學(xué)入門，東京大學(xué)教育學(xué)院統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室編，東京大學(xué)出版社。
產(chǎn)業(yè)上的應(yīng)用性根據(jù)如上所述的本發(fā)明，由于備有通過對(duì)照測(cè)定數(shù)據(jù)和上述分子時(shí)間表上被特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，而導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出機(jī)構(gòu)，上述體內(nèi)時(shí)刻信息包括上述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)上述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果，所以通過對(duì)照采集一次得到的檢體的測(cè)定數(shù)據(jù)和根據(jù)規(guī)定物種的規(guī)定部位的分子時(shí)刻表特定的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，不必多次采集檢體，以采集一次得到的檢體為基礎(chǔ)，就能容易地進(jìn)行是否有概日節(jié)律障礙的判斷和體內(nèi)時(shí)刻的推算。
權(quán)利要求
1.一種分子時(shí)刻表生成裝置，生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算所述的生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表，其特征在于，具備輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，所述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在所述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇機(jī)構(gòu)，所述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化，類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇機(jī)構(gòu)，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于所述的被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；登記信息的登記機(jī)構(gòu)，所述的信息是對(duì)選擇的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息。
2.如權(quán)利要求1所述的分子時(shí)刻表生成裝置，其特征在于，所述的登記機(jī)構(gòu)把所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的數(shù)值達(dá)到最大的時(shí)刻作為上述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)分子時(shí)刻，登記在用于所述的體內(nèi)時(shí)刻推算的分子時(shí)刻表上，同時(shí)還把所述的表達(dá)產(chǎn)物量對(duì)每個(gè)所述概日振動(dòng)基因的平均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差作為所述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量和標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量，登記在所述的分子時(shí)刻表上。
3.一種體內(nèi)時(shí)刻推算裝置，根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算所述的生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻，其特征在于，具備存儲(chǔ)對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的分子時(shí)刻表的分子時(shí)刻表存儲(chǔ)機(jī)構(gòu)，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線表示規(guī)定物種的規(guī)定部位的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；輸入檢體含有的所述概日振動(dòng)基因的所述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，所述檢體采集自所述生物個(gè)體的所述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出機(jī)構(gòu)，所述的體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的所述測(cè)定數(shù)據(jù)和用所述分子時(shí)刻表特定的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的所述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)所述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果。
4.一種分子時(shí)刻表生成方法，使用信息處理裝置，生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算所述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表，其特征在于，包括輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，所述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在所述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇步驟，所述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇步驟，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于所述的被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；登記信息的登記步驟，所述的信息是對(duì)選擇的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息。
5.一種體內(nèi)時(shí)刻推算方法，使用信息處理裝置，根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算所述的生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻，其特征在于，包括存儲(chǔ)對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的分子時(shí)刻表的分子時(shí)刻表存儲(chǔ)步驟，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線表示規(guī)定物種的規(guī)定部位的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；輸入檢體含有的所述概日振動(dòng)基因的所述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，所述檢體采集自所述生物個(gè)體的所述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出步驟，所述的體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的所述測(cè)定數(shù)據(jù)和用所述分子時(shí)刻表特定的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的所述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)所述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果。
6.一種分子時(shí)刻表生成程序，其特征在于，在生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算所述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表的信息處理裝置上，所述程序用于實(shí)行輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，所述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在所述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇步驟，所述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇步驟，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于所述的被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；登記信息的登記步驟，所述的信息是對(duì)選擇的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的信息。
7.一種體內(nèi)時(shí)刻推算程序，其特征在于，在根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)、推算所述的生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的信息處理裝置上，所述的程序用于實(shí)行存儲(chǔ)對(duì)概日表達(dá)變動(dòng)曲線進(jìn)行特定的分子時(shí)刻表的分子時(shí)刻表存儲(chǔ)步驟，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線表示規(guī)定物種的規(guī)定部位的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；輸入檢體含有的所述概日振動(dòng)基因的所述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入步驟，所述檢體采集自所述生物個(gè)體的所述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出步驟，所述的體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的所述測(cè)定數(shù)據(jù)和用所述分子時(shí)刻表特定的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的所述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)所述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果。
8.一種體內(nèi)時(shí)刻推算系統(tǒng)，在生成用于根據(jù)從生物個(gè)體采集的標(biāo)準(zhǔn)檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)推算所述生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的分子時(shí)刻表的同時(shí)，還根據(jù)采集所述生物個(gè)體的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)推算所述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻，其特征在于，所述的系統(tǒng)具備設(shè)置在提供所述體內(nèi)時(shí)刻信息的信息中心的服務(wù)器計(jì)算機(jī)、和連接在所述服務(wù)器計(jì)算機(jī)上并可收發(fā)信息的終端計(jì)算機(jī)，所述的服務(wù)器計(jì)算機(jī)具備輸入標(biāo)準(zhǔn)檢體中的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，所述標(biāo)準(zhǔn)檢體采集自規(guī)定物種的多個(gè)個(gè)體的規(guī)定部位；在所述標(biāo)準(zhǔn)檢體中表達(dá)的基因中選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇機(jī)構(gòu)，所述概日振動(dòng)基因的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇機(jī)構(gòu)，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線類似于所述的被選擇的概日振動(dòng)基因表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化；登記機(jī)構(gòu)，所述的登記機(jī)構(gòu)把所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線上的數(shù)值達(dá)到最大的時(shí)刻作為上述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)分子時(shí)刻，登記在用于所述的體內(nèi)時(shí)刻推算的分子時(shí)刻表上，同時(shí)還把所述的表達(dá)產(chǎn)物量對(duì)每個(gè)所述概日振動(dòng)基因的平均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差作為所述概日振動(dòng)基因的標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)量和標(biāo)準(zhǔn)變動(dòng)量，登記在所述的分子時(shí)刻表上；輸入檢體含有的所述概日振動(dòng)基因的所述基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的測(cè)定數(shù)據(jù)輸入機(jī)構(gòu)，所述檢體采集自所述生物個(gè)體的所述規(guī)定部位；導(dǎo)出體內(nèi)時(shí)刻信息的體內(nèi)時(shí)刻信息導(dǎo)出機(jī)構(gòu)，所述的體內(nèi)時(shí)刻信息中含有通過對(duì)照輸入的所述測(cè)定數(shù)據(jù)和用所述分子時(shí)刻表特定的所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線，得出的所述生物個(gè)體是否有概日節(jié)律障礙的判斷結(jié)果和沒有概日節(jié)律障礙時(shí)所述生物個(gè)體的體內(nèi)時(shí)刻推算結(jié)果；把所述導(dǎo)出的體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送到所述終端計(jì)算機(jī)的體內(nèi)時(shí)刻信息發(fā)送機(jī)構(gòu)。
全文摘要
本發(fā)明提供一種根據(jù)從生物個(gè)體采集的檢體的基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)推算生物個(gè)體體內(nèi)時(shí)刻的裝置(11)，所述的裝置具備選擇概日振動(dòng)基因的概日振動(dòng)基因選擇機(jī)構(gòu)，所述概日振動(dòng)基因是標(biāo)準(zhǔn)檢體中基因表達(dá)產(chǎn)物量測(cè)定數(shù)據(jù)的經(jīng)時(shí)變化類似于以規(guī)定時(shí)間為周期的余弦波的基因；從以特定時(shí)間為周期且相位不同的多個(gè)余弦波中選擇概日表達(dá)變動(dòng)曲線的概日表達(dá)變動(dòng)曲線選擇機(jī)構(gòu)，所述概日表達(dá)變動(dòng)曲線和選擇的概日振動(dòng)基因的表達(dá)產(chǎn)物量的經(jīng)時(shí)變化相類似；以及登記信息的登記機(jī)構(gòu)，所述的信息是特定所選的上述概日表達(dá)變動(dòng)曲線的信息。
文檔編號(hào)G06F19/20GK1672162SQ0381814
公開日2005年9月21日 申請(qǐng)日期2003年7月29日 優(yōu)先權(quán)日2002年7月30日
發(fā)明者上田泰己, 橋本誠(chéng)一 申請(qǐng)人:山之內(nèi)制藥株式會(huì)社