專利名稱:一種快速檢測水環(huán)境中腸道病毒主要基因型的方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種水環(huán)境中腸道病毒主要基因型的快速檢測方法,該方法根據(jù)腸道病毒RNA保守序列的通用引物,通過給引物添加GC夾板,利用半巢式PCR-DGGE技術(shù)檢測腸道病毒主要基因型,適用于水環(huán)境中分析腸道病毒主要基因型的快速檢測。
背景技術(shù):
逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)技術(shù)是以RNA為模板進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,得到互補(bǔ)DNA (cDNA)的第一條鏈,再以該cDNA鏈為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),由此可將極微量的RNA在數(shù)小時(shí)內(nèi)以幾何倍數(shù)進(jìn)行特異性擴(kuò)増。半巢式PCR (semi-nested PCR)技術(shù)是ー種變異的PCR技術(shù),其通過使用ー對半PCR引物完成核酸片段的擴(kuò)增。第一對PCR引物擴(kuò)增片段和普通PCR相似。第二對引物稱為半巢式引物(因其一條引物與第一對PCR引物中的一條 完全相同,但另外一條弓I物在第一次PCR擴(kuò)增片段的內(nèi)部)結(jié)合在第一次PCR產(chǎn)物內(nèi)部,使得第二次PCR擴(kuò)增片段短于第一次擴(kuò)增。半巢式PCR的好處在于,如果第一次擴(kuò)增產(chǎn)生了錯(cuò)誤片斷,則第二次能在錯(cuò)誤片段上進(jìn)行引物配對并擴(kuò)增的概率極低;且通過兩次PCR擴(kuò)增后,其檢測靈敏度大大提高。因此,半巢式PCR的擴(kuò)增非常特異,且靈敏度很好。DGGE即變性梯度凝膠電泳,是根據(jù)DNA在不同濃度的變性劑中解鏈行為的不同而導(dǎo)致電泳遷移率發(fā)生變化,從而將片段大小相同而堿基組成不同的DNA片段分開。即將特定的雙鏈DNA片段在含有從低到高的線性變性劑梯度的聚丙烯酰胺凝膠中電泳,隨著電泳的進(jìn)行,DNA片段向高濃度變性劑方向遷移,當(dāng)它到達(dá)其變性要求的最低濃度變性劑處,雙鏈DNA形成部分解鏈狀態(tài),這就導(dǎo)致其遷移速率變慢,由于這種變性具有序列特異性,因此DGGE能根據(jù)核酸序列的差異將同樣大小的DNA片段很理想地分開,是ー種很有用分子標(biāo)記方法。現(xiàn)有的關(guān)于水環(huán)境中腸道病毒基因型分型方法并不多見,且在分析主要基因型時(shí)多采用大通量焦磷酸測序的方法,其費(fèi)用十分昂貴。雖然PCR-DGGE技術(shù)已應(yīng)用于環(huán)境微生物的細(xì)菌群落多祥性檢測及親緣關(guān)系鑒定等方面,但目前還沒有一套適用于水環(huán)境中腸道病毒基因分型的有效方法。
發(fā)明內(nèi)容
針對上述現(xiàn)有技術(shù)存在的缺陷或不足,本發(fā)明的目的在于,提供一種水環(huán)境中腸道病毒主要基因型的檢測方法,以快速分析水環(huán)境中主要腸道病毒的基因型,并提高檢測的靈敏度和特異性。為了實(shí)現(xiàn)上述任務(wù),本發(fā)明采取如下的技術(shù)方案ー種快速檢測水環(huán)境中腸道病毒主要基因型的方法,其特征在于,包括下列步驟步驟一,樣品采集用預(yù)先滅菌的采樣瓶在水面下O. 3m處采集水樣,水樣采集后放入4 °C冰箱內(nèi)保存;
步驟ニ,水樣的濃縮將含有腸道病毒的水樣加入聚こニ醇(PEG)6000和NaCl,使水樣中的聚こニ醇(PEG)6000濃度為8% (vol/vol),NaCl的濃度為2. 3% (wt/vol),于4°C過夜,80rpm攪拌混勻,12h后,于9,000X g,4°C離心30min,收集沉淀,將沉淀用ImL的超純水吹打混勻;步驟三,RNA提取利用RNA提取試劑盒提取病毒RNA ; 步驟四,去除基因組DNA :將5 μ L的RNA和2 μ L的5X g DNA Eraser Buffer混勻,加入I μ L的g DNA Eraser,并用無核酸酶超純水補(bǔ)足至10 μし42で水浴2min,以去除體系內(nèi)DNA對RNA的干擾;步驟五,逆轉(zhuǎn)錄向反應(yīng)液加入4μ L的5 X PrimeScript buffer, I μ L的PrimeScpript RT Enzyme Mix I, I μ L 的RT Primer Mix,用無核酸酶超純水補(bǔ)足至20 μ L,37°C水浴15min獲得逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,85°C,5s滅活反轉(zhuǎn)錄酶,用此反應(yīng)液作為PCR模板;·步驟六,腸道病毒通用引物及其半巢式PCR擴(kuò)增
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腸道病毒通用引物包括,第一輪PCR上游引物EVl的核苷酸序列為5’ -CGG CCCCTG AAT GCG GC-3’ ;第二輪 PCR 上游引物 EVU1-GC 的核苷酸序列為:5,-CGC CCG CCG CGCCCC GCG CCC GTC CCG CCG CCCCCG CCC G-CCC CTG AAT GCG GCT AAT-3’(其中 GC 夾板為5,-CGCCCG CCG CGC CCC GCG CCC GTC CCG CCG CCC CCG CCC G-3');下游引物 EV2 的序列為:5,-CAC CGG ATG GCC AAT CCA-3’ ;半巢式PCR擴(kuò)增包括第一輪PCR:取 2· 5μ L 的 IOXEx Taq Buffer,2 μ L 的 dNTP Mixture, 10 μ mol/L上游引物EVl和10μmol/L下游引物EV2各lμL,Ex Taq酶2U,加入模板cDNA2 μ L,用無菌超純水補(bǔ)足至25 μ L,以無菌超純水作模板為陰性對照,在定性PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增;第二輪PCR:取 2· 5μ L 的 IOXEx Taq Buffer,2 μ L 的 dNTP Mixture, 10 μ mol/L的上游引物EVUl-GC和10 μ mol/L的下游引物EV2各O. 75 μ L,Ex Taq酶2U,加入1000倍稀釋的第一輪PCR產(chǎn)物2 μ L,用無菌超純水補(bǔ)足至25 μ L,以無菌超純水作模板為陰性對照,在定性PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增;兩輪PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件為①95°C 預(yù)變性 5min ;②擴(kuò)增循環(huán)30 次95V,30s ;52°C,30s ;72°C, 30s ;③72°C 延伸 5min,4°C 冷卻;步驟七,瓊脂糖凝膠電泳檢測配制I. 5%的瓊脂糖凝膠,100V電泳30min,在凝膠成像儀下進(jìn)行成像檢測,確定陽性樣本;步驟八,配制濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠,變性梯度為09Γ100%,將陽性樣品進(jìn)行變性梯度凝膠電泳垂直膠檢測,60°C 250V電泳6h,以優(yōu)化變性梯度;步驟九,配制濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠,選擇合適的變性梯度,將陽性樣品進(jìn)行變性梯度凝膠電泳平行膠檢測,60°C 80V電泳15h,以分離不通腸道病毒的擴(kuò)增條帶,在凝膠成像儀下進(jìn)行成像檢測,將亮帶進(jìn)行割膠純化;步驟十,利用載體連接試劑盒將純化后產(chǎn)品進(jìn)行載體連接,運(yùn)用TSS轉(zhuǎn)化法將連接產(chǎn)品轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞內(nèi),37°C 200rpm培養(yǎng)14 16h,篩選出陽性菌落,在含有Amp的LB
液體培養(yǎng)基中培養(yǎng);
步驟十一,利用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,利用連接載體其自身所具有引物進(jìn)行測序,確定完整的擴(kuò)增核酸序列,在NCBI的BLAST中進(jìn)行基因比對,確定基因型及核酸所在正負(fù)鏈;步驟十二,利用clustal X I. 83進(jìn)行序列比對分析,建立系統(tǒng)發(fā)育樹。本發(fā)明的檢測方法由于采用了半巢式PCR,大幅度提高了水環(huán)境中腸道病毒檢測技術(shù)的靈敏度,并具有良好的特異性,同時(shí)結(jié)合DGGE方法能分離出不通基因型腸道病毒的
PCR擴(kuò)增片段,縮短了確定水環(huán)境中腸道病毒主要基因型分析鑒定的時(shí)間,避免了大通量測序所產(chǎn)生的昂貴費(fèi)用,且與環(huán)境中常見的其他病原微生物沒有交叉反應(yīng),適用于地表水、污水等多種水樣的檢測。
圖I是該方法應(yīng)用于某校園污水處理系統(tǒng)中化糞池上清液、污水廠進(jìn)水及雜排水的半巢式PCR檢測結(jié)果;其中的標(biāo)記表示M、marker,l、某校園污水處理系統(tǒng)化糞池上清液(用于垂直膠優(yōu)化DGGE條件),2、某校園污水處理系統(tǒng)化糞池上清液(用于平行膠分離腸道病毒),3、污水廠進(jìn)水,4、雜排水,N、NTC。圖2是DGGE平行膠優(yōu)化變性梯度的電泳檢測圖;圖3是該方法應(yīng)用于某校園污水處理系統(tǒng)中化糞池上清液、污水廠進(jìn)水及雜排水的DGGE垂直膠檢測結(jié)果;其中的標(biāo)記表示A、某校園污水處理系統(tǒng)化糞池上清液(用于平行膠分離腸道病毒),B、污水廠進(jìn)水,C、雜排水;圖4是依據(jù)測序結(jié)果建立的系統(tǒng)發(fā)育樹;以下結(jié)合附圖和實(shí)施例對本發(fā)明作進(jìn)ー步的詳細(xì)說明。
具體實(shí)施例方式按照本發(fā)明的技術(shù)方案,首先根據(jù)腸道病毒在5’非編碼區(qū)這一區(qū)域核酸的保守性,采用腸道病毒通用引物進(jìn)行半巢式PCR。所述的腸道病毒通用引物包括,第一輪PCR上游引物EVl的核苷酸序列為5’-CGG CCC CTGAAT GCG GC-3’ ;第二輪PCR上游引物EVU1-GC的核苷酸序列為:5,-CGCCCG CCG CGC CCC GCG CCC GTC CCG CCG CCC CCG CCC G-CCCCTGAAT GCG GCT AAT-3,(其中 GC 夾板為 5,-CGC CCG CCG CGC CCCGCG CCC GTC CCG CCG CCCCCG CCC G-3’);下游引物EV2 的序列為:5,-CAC CGG ATG GCC AAT CCA-3’。經(jīng)過在GenBank數(shù)據(jù)庫上比對分析,與該通用引物具有高度相似性的序列都來源于腸道病毒,并未發(fā)現(xiàn)相似性較高的其他微生物序列。以下是發(fā)明人給出的具體實(shí)施例I、設(shè)備和試劑( I)高速冷凍離心機(jī);(2)離心管;(3)4で冰箱;(4)磁力攪拌器;(5)金屬浴;(6)定性 PCR 儀;
(7)紫外凝膠成像儀;(8) Dcode基因突變檢測系統(tǒng);(9)聚こニ醇(PEG),分子量 6000 ;(10) NaCl ;(11)病毒RNA提取試劑盒;(12)去除基因組DNA試劑盒;(13)逆轉(zhuǎn)錄試劑盒;(14)定性PCR試劑盒;( 15)載體連接轉(zhuǎn)化試劑盒;(16)質(zhì)粒提取試劑盒;(17) LB液體培養(yǎng)基;(18)腸道病毒通用引物包括,第一輪PCR上游引物EVl的核苷酸序列為5’-CGGCCC CTG AAT GCG GC-3’ ;第二輪 PCR 上游引物 EVU1-GC 的核苷酸序列為:5,-CGC CCG CCGCGC CCC GCG CCC GTC CCG CCGCCC CCG CCC G-CCC CTG AAT GCG GCT AAT-3,(其中 GC 夾板為 5,-CGC CCG CCG CGC CCC GCG CCC GTC CCG CCG CCC CCG CCC G-3’ );下游引物 EV2的序列為5’-CAC CGG ATG GCC AAT CCA-3'。引物均由專業(yè)生物工程公司合成。2.測定程序(I)樣品采集用預(yù)先滅菌的采樣瓶采集水樣,在水面下O. 3m處取水樣,水樣采集后放入4°C冰箱內(nèi)保存,6h內(nèi)進(jìn)行檢測;(2)水樣的濃縮將含有腸道病毒的水樣加入聚こニ醇(PEG)6000和NaCl,使水樣中的聚こニ醇(PEG) 6000濃度為8% (vol/vol),NaCl的濃度為2. 3% (wt/vol),于4°C過夜,80rpm攪拌混勻,12h 14h后,于9,000X g,4°C離心30min,收集沉淀,將沉淀用ImL超純水吹打混勻;(3) RNA提取利用RNA提取試劑盒提取病毒RNA ;(4)去除基因組 DNA :將 5μ L RNA 和 2 μ L 5Xg DNA Eraser Buffer 混勻,加入I μ L g DNA Eraser,并用無核酸酶超純水補(bǔ)足至10 μ L,42°C水浴2min,以去除體系內(nèi)DNA對RNA的干擾;(5)逆轉(zhuǎn)錄向上述反應(yīng)液加入4 μ L 5XPrimeScript buffer, I μ LPrimeScpriptRT Enzyme Mix I, I μ L RT Primer Mix,用無核酸酶超純水補(bǔ)足至 20 μ L, 37°C水浴 15min獲得逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,85°C,5s滅活反轉(zhuǎn)錄酶,用此反應(yīng)液作為PCR模板;(6)腸道病毒通用引物及其半巢式PCR擴(kuò)增腸道病毒通用引物包括,第一輪PCR上游引物EVl的核苷酸序列為5’ -CGG CCCCTG AAT GCG GC-3';第二輪PCR上游引物EVU1-GC 的核苷酸序列為:5,-CGC CCG CCG CGCCCC GCG CCC GTC CCG CCG CCC CCGCCC G-CCC CTG AAT GCG GCT AAT-3’(其中 GC 夾板為5,-CGC CCGCCG CGC CCC GCG CCC GTC CCG CCG CCC CCG CCC G-3');下游引物 EV2 的序 列為5,-CAC CGG ATG GCC AAT CCA-3;;半巢式PCR擴(kuò)增包括第一輪PCR :取 2· 5μ L IOXEx Taq Buffer,2y L dNTP Mixture,10 μ mol/L 上游引物EVl和10μmol/L下游引物EV2各lμL,Ex Taq酶2U,加入模板cDNA2 μ L,用無菌超純水補(bǔ)足至25 μ L,以無菌超純水作模板為陰性對照,在定性PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增;第二輪PCR :取 2· 5μ L IOXEx Taq Buffer,2y L dNTP Mixture,10 μ mol/L 上游引物EVUl-GC和10μmol/L下游引物EV2各0·75μL,Ex Taq酶2U,加入1000倍稀釋的第ー輪PCR產(chǎn)物2 μ L,用無菌超純水補(bǔ)足至25 μ L,以無菌超純水作模板為陰性對照,在定性PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增;兩輪PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件為①95°C 預(yù)變性 5min ;②擴(kuò)增循環(huán)30 次95V,30s ;52°C,30s ;72°C, 30s ;③72で延伸5min,4°C冷卻; (7)瓊脂糖凝膠電泳檢測配置I. 5%的瓊脂糖凝膠,100V電泳30min,在凝膠成像儀下進(jìn)行成像檢測,確定陽性樣本;(8) DGGE條件優(yōu)化配制濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠,變性梯度為0°/Γ 00%,將陽性樣品進(jìn)行變性梯度凝膠電泳垂直膠檢測,60°C 250V電泳6h,以優(yōu)化變性梯度;(9)DGGE檢測配制濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠,其合適的變性梯度為10°/Γ40%,將陽性樣品進(jìn)行變性梯度凝膠電泳平行膠檢測,60°C 80V電泳15h,以分離不通腸道病毒的擴(kuò)增條帶,在凝膠成像儀下進(jìn)行成像檢測,將亮帶進(jìn)行割膠純化;( 10)連接轉(zhuǎn)化利用載體連接試劑盒將純化后產(chǎn)品進(jìn)行載體連接,運(yùn)用TSS轉(zhuǎn)化法將連接產(chǎn)品轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞內(nèi),37°C 200rpm培養(yǎng)14 16h,篩選出陽性菌落,在含有Amp的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng);(11)質(zhì)粒提取利用質(zhì)粒提取試劑盒提取感受:態(tài)細(xì)胞內(nèi)的質(zhì)粒,利用連接載體上自身所具有引物進(jìn)行測序,確定完整的擴(kuò)增核酸序列,在NCBI的BLAST中進(jìn)行基因比對,確定基因型及核酸所在正負(fù)鏈;(12)系統(tǒng)發(fā)育樹的建立利用clustal X I. 83進(jìn)行序列比對分析,建立系統(tǒng)發(fā)育樹。參見圖1,該圖是將本發(fā)明的方法應(yīng)用于某校園污水處理系統(tǒng)中化糞池上清液、污水廠進(jìn)水及雜排水的半巢式PCR檢測結(jié)果;圖2給出了 DGGE平行膠優(yōu)化變性梯度的電泳檢測圖;圖3是采用本發(fā)明的方法應(yīng)用于某校園污水處理系統(tǒng)中化糞池上清液、污水廠進(jìn)水及雜排水的DGGE垂直膠檢測結(jié)果。圖4是依據(jù)條帶f 10的測序結(jié)果建立的系統(tǒng)發(fā)育樹。表I是經(jīng)DGGE分離條帶后所得基因序列。表I
權(quán)利要求
1.一種快速檢測水環(huán)境中腸道病毒主要基因型的方法,其特征在于,包括下列步驟 步驟一,樣品采集 用預(yù)先滅菌的 采樣瓶采集 水樣,在水面下O. 3m處取水樣,水樣采集后放入4°C冰箱內(nèi)保存; 步驟二,水樣的濃縮 將含有腸道病毒的水樣加入聚乙二醇(PEG) 6000和NaCl,使水樣中的聚乙二醇(PEG)·6000 濃度為 8% (vol/vol),NaCl 的濃度為 2. 3% (wt/vol),于 4°C,80rpm 攬拌混勻,12h 后,于9,000 X g,4°C離心30min,收集沉淀,將沉淀用ImL超純水吹打混勻; 步驟三,RNA提取 利用RNA提取試劑盒提取病毒RNA ; 步驟四,去除基因組DNA: 將 5 μ L RNA 和 2 μ L 5 X g DNA Eraser Buffer 混勻,加入 IyLg DNAEraser,并用無核酸酶超純水補(bǔ)足至10 μ L,42°C水浴2min,以去除體系內(nèi)DNA對RNA的干擾; 步驟五,逆轉(zhuǎn)錄 向上述反應(yīng)液力口入 4μ L 5XPrimeScript buffer, I μ L PrimeScpript RTEnzyme MixI,luL RT Primer Mix,用無核酸酶超純水補(bǔ)足至20 μ L,37°C水浴15min獲得逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,85°C,5s滅活反轉(zhuǎn)錄酶,用此反應(yīng)液作為PCR模板; 步驟六,腸道病毒通用引物及其半巢式PCR擴(kuò)增 腸道病毒通用引物包括,第一輪PCR上游引物EVl的核苷酸序列為5’-CGG CCC CTGAAT GCG GC-3,; 第二輪PCR上游引物EVUl-GC的核苷酸序列為5’-CGC CCG CCGCGC CCC GCG CCC GTCCCG CCG CCC CCG CCC G-CCC CTG AATGCG GCT AAT-3’,其中,GC 夾板為:5,-CGC CCG CCGCGC CCC GCGCCC GTC CCG CCG CCC CCG CCC G-3,; 下游引物 EV2 的序列為5’-CAC CGG ATG GCC AAT CCA-3’ ; 半巢式PCR擴(kuò)增包括 第一輪 PCR :取 2· 5μ L IOXEx Taq Buffer,2y L dNTP Mixture,10 μ mol/L 上游引物EVl和10 μ mol/L下游引物EV2各I μ L,Ex Taq酶2U,加入模板cDNA2 μ L,用無菌超純水補(bǔ)足至25 μ L,以無菌超純水作模板為陰性對照,在定性PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增; 第二輪 PCR :取 2· 5μ L IOXEx Taq Buffer,2y L dNTP Mixture,10 μ mol/L 上游引物EVUl-GC和10 μ mol/L下游引物EV2各0.75 μ L,Ex Taq酶2U,加入1000倍稀釋的第一輪PCR產(chǎn)物2 μ L,用無菌超純水補(bǔ)足至25 μ L,以無菌超純水作模板為陰性對照,在定性PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增; 兩輪PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件為 ①95°C預(yù)變性5min;②擴(kuò)增循環(huán)30 次95°C,30s ; 52 °C, 30s ;72°C,30s ; ③72°C延伸5min,4°C冷卻; 步驟七,瓊脂糖凝膠電泳檢測配制I. 5%的瓊脂糖凝膠,100V電泳30min,在凝膠成像儀下進(jìn)行成像檢測,確定陽性樣本; 步驟八,配制濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠,變性梯度為09Γ100%,將陽性樣品進(jìn)行變性梯度凝膠電泳垂直膠檢測,60°C 250V電泳6h,以優(yōu)化變性梯度; 步驟九,配制濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠,其合適的變性梯度為109Γ40%,將陽性樣品進(jìn)行變性梯度凝膠電泳平行膠檢測,60°C 80V電泳15h,以分離不通腸道病毒的擴(kuò)增條帶,在凝膠成像儀下進(jìn)行成像檢測,將亮帶進(jìn)行割膠純化; 步驟十,利用載體連接試劑盒將純化后產(chǎn)品進(jìn)行載體連接,運(yùn)用TSS轉(zhuǎn)化法將連接產(chǎn)品轉(zhuǎn)化至感受態(tài)細(xì)胞內(nèi),370C 200rpm培養(yǎng)14 16h,篩選出陽性菌落,在含有Amp的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng); 步驟十一,利用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,利用連接載體上自身所具有引物進(jìn)行測序,確定完整的擴(kuò)增核酸序列,在NCBI的BLAST中進(jìn)行基因比對,確定基因型及核酸所屬正負(fù)鏈; 步驟十二,利用clustal X I. 83進(jìn)行序列比對分析,建立系統(tǒng)發(fā)育樹。
2.如權(quán)利要求I所述的定性檢測方法,其特征在于,對于腸道病毒通用引物通過附帶GC夾板后經(jīng)PCR擴(kuò)增,DGGE平行膠檢測,進(jìn)而快速分析水環(huán)境中的腸道病毒不同基因型。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種快速檢測水環(huán)境中腸道病毒主要基因型的方法,該方法根據(jù)道病毒RNA在5’非編碼區(qū)這一段核酸的保守性,利用腸道病毒通用引物進(jìn)行半巢式PCR擴(kuò)增,結(jié)合DGGE分析方法來鑒定水環(huán)境中主要腸道病毒的基因型。由于采用了半巢式PCR,大幅度提高了水環(huán)境中腸道病毒檢測技術(shù)的靈敏度,并具有良好的特異性,同時(shí)結(jié)合DGGE方法能分離出不通基因型腸道病毒的PCR擴(kuò)增片段,縮短了確定水環(huán)境中腸道病毒主要基因型分析鑒定的時(shí)間,避免了大通量測序所產(chǎn)生的昂貴費(fèi)用,且與環(huán)境中常見的其他病原微生物沒有交叉反應(yīng)。適用于地表水、污水等多種水樣的檢測。
文檔編號C12Q1/70GK102676699SQ201210157470
公開日2012年9月19日 申請日期2012年5月21日 優(yōu)先權(quán)日2012年5月21日
發(fā)明者三浦尚之, 佐野大輔, 吉錚, 徐麗梅, 王曉昌 申請人:西安建筑科技大學(xué)