一種金針菇f3菌種的ssr標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用，該指紋圖譜由6對基于金針菇基因組序列開發(fā)的SSR標(biāo)記的特異等位片段組合而成。應(yīng)用包括：對金針菇菌種進(jìn)行SSR標(biāo)記擴(kuò)增，將得到的帶型與指紋圖譜對照，與該指紋圖譜一致即為F3菌種。本發(fā)明與常規(guī)形態(tài)學(xué)檢測、拮抗試驗(yàn)、出菇試驗(yàn)相比，具有檢測時(shí)間短、準(zhǔn)確性高、可重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn)，在收集的我國24個(gè)主栽金針菇菌種中具有F3菌種的專一性。
【專利說明】—種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于金針菇菌種的檢測領(lǐng)域，特別涉及一種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用。

【背景技術(shù)】
[0002]金針燕[Flammulina velutipes (Fr.) Sing.]又名金燕、樸燕、構(gòu)菌、青杠菌、毛柄金錢菌，在分類上屬于傘菌目白蘑科小火焰菌屬。金針菇分布廣泛，營養(yǎng)豐富，是一種經(jīng)濟(jì)價(jià)值很高的食用菌和藥用菌，也是市場上十分走俏的天然保健食品之一。金針菇是中國主要栽培食用菌和現(xiàn)代工廠化生產(chǎn)主要食用菌之一，2013年國內(nèi)工廠化日生產(chǎn)量達(dá)到2700噸。
[0003]優(yōu)質(zhì)菌種在金針菇單產(chǎn)和質(zhì)量中的貢獻(xiàn)率舉足輕重，這決定了金針菇菌種在金針菇產(chǎn)業(yè)中的重要地位。1999年我國簽署了《國際植物新品種保護(hù)法》，這不僅要求我們尊重其它國家的品種知識(shí)產(chǎn)權(quán)，同時(shí)也要加強(qiáng)保護(hù)我們國家自己的品種知識(shí)產(chǎn)權(quán)，為了建立食用菌新品種登記制度來真正保護(hù)我國的品種產(chǎn)權(quán)，必須首先建立成熟的品種鑒定技術(shù)，為新品種登記奠定基礎(chǔ)。尤其日本2004年4月I日開始實(shí)行《種苗法修正案》，對我國食用菌尤其是金針菇的生產(chǎn)構(gòu)成了極大的威脅。就國內(nèi)而言，金針菇栽培菌種“同種異名，異種同名”的現(xiàn)象，不僅給菇農(nóng)帶來了極大的損失，影響了他們的栽培積極性，也極大地影響了中國金針菇產(chǎn)業(yè)的發(fā)展；而且，隨著大規(guī)模的工廠化栽培方式的出現(xiàn)，對金針菇栽培菌株質(zhì)量的要求越來越高，需要發(fā)展更為簡便、快速、準(zhǔn)確的菌株鑒定技術(shù)，以保證每批次的用種都準(zhǔn)確無誤。
[0004]面對這種局勢，就需要我們進(jìn)一步加快菌種鑒定技術(shù)的研究，在金針菇的研究中建立更為有效的菌種鑒定體系。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0005]本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜及其構(gòu)建方法與應(yīng)用，該指紋圖譜與常規(guī)形態(tài)學(xué)檢測、拮抗試驗(yàn)、出菇試驗(yàn)相比，具有檢測時(shí)間短，準(zhǔn)確性高，重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn)。
[0006]本發(fā)明的一種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜，該指紋圖譜由6對SSR標(biāo)記組成，是基于金針菇基因組簡單重復(fù)序列片段開發(fā)SSR引物，擴(kuò)增帶型好，重復(fù)性高的SSR引物，標(biāo)記詳細(xì)信息如表1。
[0007]表1 SSR標(biāo)記詳細(xì)信息列表
[0008]

【權(quán)利要求】
1.一種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜，其特征在于:該指紋圖譜由6對基于金針菇基因組序列開發(fā)的SSR標(biāo)記的特異等位片段組合而成，6對SSR標(biāo)記在金針菇F3菌種上擴(kuò)增的等位片段信息具體為: Fv_fp0001的等位片段的數(shù)量為2，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為700bp ;等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為680bp ； Fv_fp0002的等位片段的數(shù)量1，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為1300bp, Fv_fp0003的等位片段的數(shù)量為1，等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為680bp ； Fv_fp0004的等位片段的數(shù)量2，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為1250bp ;等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為1200bp ； Fv_fp0005的等位片段的數(shù)量4，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為IlOObp,等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為800bp ;等位片段3相對于50bpDNA ladder的分子量為530bp ;等位片段4相對于50bp DNA ladder的分子量為500bp ； Fv_fp0006的等位片段的數(shù)量為2，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為400bp ;等位片段3相對于50bp DNA ladder的分子量為360bp。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜，其特征在于:所述6對SSR標(biāo)記等位片段的特異編號(hào)組合為:(1+2) 12 (1+2) (1+2+3+4) (1+3)。
3.—種如權(quán)利要 求1所述的金針菇F3菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜的應(yīng)用，其特征在于:應(yīng)用于鑒定金針菇F3菌種的特異等位變異組合以及鑒定金針菇F3菌種相對于其他國審金針菇品種的特異性。
【文檔編號(hào)】C12Q1/04GK104131086SQ201410318267
【公開日】2014年11月5日 申請日期:2014年7月4日 優(yōu)先權(quán)日:2014年7月4日
【發(fā)明者】尚曉冬, 陸歡, 王瑞娟, 章爐軍, 徐珍, 張丹, 譚琦 申請人:上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院