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      一種干擾基因及其應(yīng)用的制作方法

      文檔序號:11428769閱讀:309來源:國知局
      一種干擾基因及其應(yīng)用的制造方法與工藝

      本發(fā)明屬于基因工程領(lǐng)域,具體涉及一種干擾基因及其應(yīng)用。尤其是涉及一種干擾基因,含有干擾基因的表達(dá)載體、宿主細(xì)胞,以及生產(chǎn)生物柴油的方法。



      背景技術(shù):

      生物柴油備受關(guān)注,它可以作為一個化石替代品,具有可持續(xù)生產(chǎn)和環(huán)保等特性。生物能源應(yīng)用歷史已經(jīng)超過了50年,生物柴油主要來源于植物,例如菜籽,大豆,向日葵等,其原理是由三酰甘油通過酯交換反應(yīng)制成,1mol三酰甘油和3mol乙醇反應(yīng),可以產(chǎn)生1mol的甘油和甲酯。但是,這種生產(chǎn)效率普遍不高,而且占地面積大。

      與傳統(tǒng)的生物柴油相比,微藻具有以下優(yōu)點:第一,微藻的生長速度快,其生物量可以在24小時增加一倍;第二,含油量高,某些微藻的含油量可以達(dá)到干重的50%-60%;第三,微藻的產(chǎn)油效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)快于動物和植物;第四,微藻能夠進(jìn)行光合作用,參與到生態(tài)系統(tǒng)的循環(huán);最后,微藻種類多,適應(yīng)性非常強(qiáng),某些微藻可以在極其惡劣的環(huán)境下面進(jìn)行生存,培養(yǎng)條件簡單。

      作為產(chǎn)油微藻的代表藻種之一,微擬球藻屬于產(chǎn)油藻,相對其他微藻來說,其產(chǎn)油量相對較高,生長速度快。然而,微擬球藻的產(chǎn)油性能仍不能滿足工業(yè)需求。而且,植物的細(xì)胞壁很厚,提取微藻內(nèi)的油脂前需要去除其細(xì)胞壁,這個環(huán)節(jié)會大大提高生產(chǎn)成本,同時也會造成細(xì)胞的死亡,因此對于工業(yè)應(yīng)用來說,是很不利的。雖然某些非細(xì)胞破壞的油脂獲取方法已經(jīng)成功,但是,這還是不能滿足微藻的工業(yè)產(chǎn)油需求。因此,研發(fā)出一種既能高產(chǎn)油又能胞外分泌油脂的工業(yè)型微藻,用于解決現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)缺陷,成為了本領(lǐng)域技術(shù)人員亟待解決的問題。



      技術(shù)實現(xiàn)要素:

      有鑒于此,本發(fā)明提供了一種干擾基因及其應(yīng)用,用于解決現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)缺陷。

      本發(fā)明發(fā)現(xiàn)對微擬球藻的udp-glucosedehydrogenase基因(以下簡稱ugdh)進(jìn)行rna干擾,能使其細(xì)胞壁中聚多糖顯著減少,導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,同時使得更多的碳流向三酰甘油合成途徑。

      本發(fā)明發(fā)現(xiàn)ugdh基因表達(dá)的蛋白含有471個氨基酸,使用smart網(wǎng)站和ncbi網(wǎng)站對假定的ugdh基因的蛋白序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其ugdh蛋白含有3個結(jié)構(gòu)域:udpg_mgdp_dh_n結(jié)構(gòu)域,udpg_mgdp_dh結(jié)構(gòu)域和udpg_mgdp_dh_c結(jié)構(gòu)域(http://smart.embl-heidelberg.de/),在udpg_mgdp_dh_n結(jié)構(gòu)域和udpg_mgdp_dh結(jié)構(gòu)域之間存在一個蘋果酸酶和nad的綁定位點(圖1a)。

      利用mega6軟件對微擬球藻ugdh蛋白進(jìn)行系統(tǒng)樹構(gòu)建,發(fā)現(xiàn)n.oceanica和n.gaditana具有非常高的同源性。

      本發(fā)明提供了一種ugdh基因的干擾基因,依次包括外顯子1、內(nèi)含子及外顯子2;

      所述外顯子1具有

      (i)如seqidno.1所示的核苷酸序列;或

      (ii)seqidno.1所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.1所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。

      作為優(yōu)選,所述外顯子2與外顯子1的部分序列為反向互補(bǔ)序列。

      作為優(yōu)選,所述外顯子2具有如seqidno.3所示的核苷酸序列;或seqidno.3所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.3所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。

      所述外顯子1及外顯子2之間含有內(nèi)含子。

      作為優(yōu)選,所述內(nèi)含子具有如seqidno.2所示的核苷酸序列,或seqidno.2所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.2所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。

      本領(lǐng)域技術(shù)人員可以理解所述取代、缺失或添加一個或多個核苷酸中的多個包括但不限于2個、3個或4個。

      本發(fā)明還提供了上述干擾基因在干擾udp-glucosedehydrogenase基因的表達(dá)中的應(yīng)用。

      進(jìn)一步,本發(fā)明還提供了一種表達(dá)載體,含有上述的干擾基因。

      本發(fā)明還提供了一種宿主細(xì)胞,含有本發(fā)明所述的表達(dá)載體。

      作為優(yōu)選,所述宿主細(xì)胞為微藻,如微擬球藻、小球藻等。在一些具體實施方案中,所述宿主細(xì)胞為微擬球藻。

      本發(fā)明還提供了所述宿主細(xì)胞在提高脂質(zhì)含量和促進(jìn)脂質(zhì)分泌中的應(yīng)用。

      進(jìn)一步,本發(fā)明還提供了一種生產(chǎn)生物柴油的方法,將所述宿主細(xì)胞在光生物反應(yīng)器大量繁殖,在宿主細(xì)胞達(dá)到平臺期時收集脂質(zhì),分離純化獲得生物柴油。

      作為優(yōu)選,所述宿主細(xì)胞為微藻。更優(yōu)選為微擬球藻。

      微藻通過光合作用固定碳元素,再通過誘導(dǎo)將所述碳元素轉(zhuǎn)化為脂質(zhì)

      本發(fā)明提供了一種干擾基因及其應(yīng)用,所述干擾基因沒有在任何文獻(xiàn)報道,在genbank等公開數(shù)據(jù)庫也沒有任何注釋。本發(fā)明從微擬球藻中克隆并構(gòu)建了一種干擾基因,所述基因包括外顯子1、內(nèi)含子及外顯子2;所述外顯子1具有(i)如seqidno.1所示的核苷酸序列;或(ii)seqidno.1所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.1所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。該干擾基因能干擾udp-glucosedehydrogenase基因的表達(dá)。將該干擾基因構(gòu)建到表達(dá)載體中轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞。在藻細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄后,外顯子1和內(nèi)含子作為發(fā)夾前臂和莖環(huán),外顯子2為發(fā)夾的后臂,會形成莖環(huán)發(fā)夾結(jié)構(gòu)(圖1b),在dicer酶的作用下,切割形成sirna,sirna會與靶基因互補(bǔ),干擾udp-glucosedehydrogenase基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)通過所述基因干擾udp-glucosedehydrogenase表達(dá)后,微擬球藻能高效產(chǎn)油且能胞外分泌脂質(zhì),得到高產(chǎn)油脂并能進(jìn)行胞外分泌油的藻株,解決了現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)問題。

      附圖說明

      為了更清楚地說明本發(fā)明實施例或現(xiàn)有技術(shù)中的技術(shù)方案,下面將對實施例或現(xiàn)有技術(shù)描述中所需要使用的附圖作簡單地介紹。

      圖1是ugdh的分子預(yù)測分析(a)ugdh蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測分析,(b)ugdh發(fā)夾結(jié)構(gòu)示意圖;

      圖2是ugdh轉(zhuǎn)化藻的測序比對結(jié)果圖;

      圖3是ugdh轉(zhuǎn)化藻分子驗證膠圖,m為marker,右欄為轉(zhuǎn)化藻;

      圖4是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻qpcr分析,**表示(p<0.01),wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖5是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的光合作用和生長曲線(a)ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的光合作用,(b)ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的生長曲線,其中,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖6是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻激光掃描共聚焦熒光顯微鏡結(jié)果圖,其中,(a)野生型藻,(b)ugdh轉(zhuǎn)化藻,bar=5μm;

      圖7是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻透射電鏡圖,其中,(a)野生型藻,(b)ugdh轉(zhuǎn)化藻.bar=5μm;

      圖8是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻總糖含量測定,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖9是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻中性脂含量測定,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖10是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻胞內(nèi)胞外甘油總酯測定,其中,(a)細(xì)胞外甘油總酯產(chǎn)量測定分析,(b)細(xì)胞內(nèi)甘油總酯產(chǎn)量測定分析,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖11是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻胞內(nèi)胞外脂肪酸總成分測定,其中,(a)細(xì)胞外脂肪酸總成分測定分析,(b)細(xì)胞內(nèi)脂肪酸總成分測定分析,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖12是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻胞內(nèi)胞外脂肪酸成分測定,其中,(a)細(xì)胞外脂肪酸總成分測定分析,(b)細(xì)胞內(nèi)脂肪酸總成分測定分析,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;

      圖13是ugdh轉(zhuǎn)化藻全局通路圖。

      具體實施方式

      本發(fā)明提供了一種干擾基因及其應(yīng)用,用于解決現(xiàn)有技術(shù)中,微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)缺陷。

      下面將對本發(fā)明實施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述,顯然,所描述的實施例僅僅是本發(fā)明一部分實施例,而不是全部的實施例?;诒景l(fā)明中的實施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒有做出創(chuàng)造性勞動前提下所獲得的所有其他實施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。

      為了更詳細(xì)說明本發(fā)明,下面結(jié)合實施例對本發(fā)明提供的一種,進(jìn)行具體地描述。

      實施例1ugdh干擾基因的構(gòu)建

      提取微擬球藻的基因組dna,采用美基公司的植物dna提取試劑盒進(jìn)行。引物由上海生工生物工程有限公司合成,經(jīng)page方法純化,使用時稀釋到20μm。采用引物對seqidno.4,seqidno.5和引物對seqidno.6,seqidno.7(表1),反應(yīng)體系如表2和表3,以微擬球藻的基因組為模板,分別擴(kuò)增得到發(fā)夾片段1(外顯子1和內(nèi)含子片段)和發(fā)夾片段2(外顯子2)(圖1b)。

      把上述克隆發(fā)夾片段1和發(fā)夾片段2通過采用clonexpressmultisonestepcloning試劑盒(vazymebiotechco.,ltd,nanjing)同源重組的方法連接到含有博來霉素抗性表達(dá)盒的載體,含有博來霉素抗性表達(dá)盒的載體,得到含有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的重組干擾載體,標(biāo)記為pna03-udghi。

      表1pcr引物

      表2發(fā)夾片段1的pcr反應(yīng)體系(20μl)

      表3發(fā)夾片段2的pcr反應(yīng)體系(20μl)

      實施例2微擬球藻轉(zhuǎn)化及轉(zhuǎn)化藻的篩選

      參考li等(2016)的電擊方法把重組載體整合到微擬球藻基因組中,電擊完成后,將藻細(xì)胞轉(zhuǎn)移到5ml的f/2無硅培養(yǎng)基,黑暗培養(yǎng)24h,隨后,將5ml藻細(xì)胞離心10min(4400rpm)收集,并均勻涂到含有5μg/ml博來霉素的平板內(nèi)。通過4-5次博來霉素的篩選獲得具有抗性的轉(zhuǎn)化藻,篩選出兩株具有抗性的ugdh轉(zhuǎn)化藻,命名為ugdh1和ugdh2轉(zhuǎn)化藻。

      實施例3轉(zhuǎn)化藻的驗證

      驗證步驟如下:把100ml轉(zhuǎn)化藻和100ml野生型微擬球藻4400rpm離心10min收集,用美基公司的植物dna提取試劑盒提取基因組dna,用引物seqidno.8和引物seqidno.9進(jìn)行pcr,并進(jìn)行切膠回收測序,如圖2所示,測序結(jié)果證明轉(zhuǎn)化藻基因組內(nèi)含有所述干擾基因。

      如圖3所示,電泳膠圖顯示轉(zhuǎn)化藻在大概473bp處有條帶。

      實施例4驗證發(fā)夾結(jié)構(gòu)干擾效率

      本發(fā)明對轉(zhuǎn)化藻的ugdh基因的轉(zhuǎn)錄進(jìn)行熒光實時定量分析。

      real-timeqpcr就是在pcr擴(kuò)增過程中,通過熒光信號,對pcr進(jìn)程進(jìn)行實時檢測。由于在pcr擴(kuò)增的指數(shù)時期,模板的ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。real-timeqpcr由于其操作簡便,靈敏度高,重復(fù)性好等優(yōu)點發(fā)展非常迅速。對rt-pcr產(chǎn)生的結(jié)果,分析時采用2-ct法,即按照如下公式進(jìn)行計算:

      1.δct(目的基因ct—內(nèi)參ct)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差;

      2.δδct(待測樣品中目的基因δct—參照樣品中目的基因δct)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差;

      3.相對表達(dá)量(2-δδct)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差。

      熒光實時定量分析實驗步驟如下:野生型藻和轉(zhuǎn)化藻放置新的培養(yǎng)基中且藻密度控制在1×106個/ml,取第十天的微藻,微藻的數(shù)量控制在3×108個,4400rpm離心10min。采用rnaisolationkit(takara)對微藻的總rna進(jìn)行提取,并使用theprimescripttmrtreagentkitwithgdnaeraser(takara)試劑盒進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,逆轉(zhuǎn)錄所用的引物為隨機(jī)引物。針對ugdh基因的特異引物對seqidno.10和seqidno.11;內(nèi)參為β-tublin,其引物為seqidno.12和seqidno.13。用于實時定量擴(kuò)增,所用pcrsupermix(invitrogen,usa),實驗所用的檢測設(shè)備為abiprism7500sequencedetectionsystem(appliedbiosystems,美國)。結(jié)果如圖4所示。

      由此可見,該啟動子在微擬球藻中能夠顯著地抑制ugdh基因表達(dá),與野生型藻相比,ugdh1轉(zhuǎn)化藻和ugdh2的轉(zhuǎn)錄水平都降低80%,表明pna03-ugdh的發(fā)夾結(jié)構(gòu)成功干擾了ugdh基因的表達(dá)。

      實施例5轉(zhuǎn)化藻株的生長特征和光合作用分析

      光合作用測定的步驟如下:采用fv/fm(可變/最大熒光之比)的比值來測定光合作用效率,轉(zhuǎn)化藻和野生型藻黑暗處理40min后,使用td-700fluorometer(turnerdesign,美國)測定。

      如圖5a所示,ugdh的兩株轉(zhuǎn)化藻和野生型的fv/fm基本一樣,說明了對ugdh基因的rna干擾,并不影響其光合效率。

      生長曲線的測定步驟如下,對微擬球藻進(jìn)行取樣。利用倒置的顯微鏡和血球計數(shù)板進(jìn)行計算。微擬球藻的計算公式如下:celldensity=(n/80)×400×104,其中celldensity表示微擬球藻的藻細(xì)胞密度,n表示細(xì)胞總數(shù)(80個方格)。測定了生長曲線,評估轉(zhuǎn)基因藻的生物量和生長速度。

      結(jié)果如圖5b所示,ugdh1轉(zhuǎn)化藻,ugdh2轉(zhuǎn)化藻和野生型藻生長規(guī)律基本一致,因此,對ugdh基因的干擾,并不會抑制微藻的生長。此外,我們對轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的光合效率進(jìn)行分析,來評估光合作用。

      實施例6轉(zhuǎn)化藻株中性脂在激光掃描共聚焦熒光顯微鏡觀察

      驗證的步驟:如下熒光共聚焦的分析過程如下:取300μl的藻液,加入0.5g/ml的甘油和3.75μl尼羅紅(0.3μg/ml),混勻后,常溫下黑暗孵育5min,進(jìn)行尼羅紅染色后,使用激光共聚焦分析儀zeisslsm510meta(zeiss,germany)進(jìn)行分析。激發(fā)波長為488nm,發(fā)射波長為505-550nm。

      為了進(jìn)一步更直觀地觀察中性脂的含量,對微擬球藻進(jìn)行激光掃描共聚焦熒光顯微鏡觀察,結(jié)果如圖6所示,在野生型藻中,并沒有發(fā)現(xiàn)有油體分泌出來,而在ugdh轉(zhuǎn)化藻中,可以看到非常多的油滴在細(xì)胞的周圍,其細(xì)胞所含的油也明顯比野生型多。因此,干擾udgh基因,可能會導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,致使油滴分泌到細(xì)胞外,同時可能也會促使更多的碳流向三酰甘油(tag)的合成途徑。

      實施例7透射電鏡的分析

      為了進(jìn)一步研究干擾ugdh對微擬球藻細(xì)胞壁的影響,我們進(jìn)行透射電鏡分析,驗證的步驟如下:在4℃,4400rpm條件下離心10分鐘,分別收集試驗組和對照組的藻細(xì)胞。取上清液后的藻細(xì)胞樣品用1×pbs緩沖液清洗3次,最后5000rpm離心3分鐘收集藻細(xì)胞。收集的藻細(xì)胞用溶于ph7.2的0.1m的nah2po4緩沖液中的2.5%(v/v)戊二醛及2%(w/v)多聚甲醛進(jìn)行固定,并用真空泵在4℃條件下抽真空30分鐘。之后將固定液離心并去掉上清液,重新用固定液在4℃條件下固定12h。固定完成后離心去除固定液并用0.1mnah2po4緩沖液(ph7.2)清洗4次(15分鐘和30分鐘各兩次)。之后樣品用1%(w/v)四氧化鋨在4℃下固定3h,完成后用0.1m的nah2po4緩沖液(ph7.2)清洗4次(15分鐘和30分鐘各兩次)。完成后用梯度濃度的乙醇(30%,50%,70%,80%,90%v/v)對樣品進(jìn)行脫水,每隔10分鐘更換一種濃度,最后用100%的乙醇沖洗兩次(每次30分鐘)。之后樣品分別重懸于環(huán)氧丙烷(2次,每次30分鐘)和1:1(v/v)環(huán)氧丙烷:環(huán)氧樹脂(1次,30分鐘)中進(jìn)行細(xì)胞滲透。完成后藻細(xì)胞固定于100%w/v環(huán)氧樹脂中反應(yīng)24h,且在70℃中包埋的時間不少于8h。藻細(xì)胞完成包埋后利用8800ultratomeiii進(jìn)行超微切片,并用乙酸雙氧鈾及檸檬酸鉛對切片進(jìn)行染色。處理后的切片利用tecnai-10透射電子顯微鏡進(jìn)行觀察。

      結(jié)果如圖7所示,在野生型微擬球藻中,細(xì)胞壁渾厚有序(圖7a),而在ugdh轉(zhuǎn)基因藻中,細(xì)胞壁變細(xì),形狀無規(guī)則。因此,在微擬球藻中,干擾ugdh基因的表達(dá),會干擾細(xì)胞壁的生成(圖7b)。

      實施例8總糖含量分析

      為了更進(jìn)一步說明ugdh對細(xì)胞壁影響,我們進(jìn)行總糖含量定量,總糖含量的測定過程如下:取藻液50ml,采用4400rpm,10min來收集藻。準(zhǔn)備1.5mlep管,并稱量重量,將藻轉(zhuǎn)移到1.5ml的ep管內(nèi)。將藻置于凍干儀器,凍干8h后,稱量其重量,通過計算得到藻的干重。將凍干好的藻粉,用10ml去離子水重新混勻懸浮,將5ml藻液轉(zhuǎn)移到新的離心管中,向新的離心管中加入3ml的5%的苯酚溶液(w/v),混勻后,加入15ml的濃硫酸,混勻,常溫靜置10min,隨后,置于30度孵育20min后,取100ul的轉(zhuǎn)移到96孔酶標(biāo)板,放到酶標(biāo)儀中讀數(shù),參數(shù)為483nm。

      如圖8所示,在ugdh1和ugdh2這兩株轉(zhuǎn)化藻中,其總糖都顯著下調(diào)了50%。因此,結(jié)果表明了對ugdh基因進(jìn)行干擾,會顯著下調(diào)糖的含量。

      實施例9轉(zhuǎn)化藻株中性脂分析

      利用尼羅紅染色的方法,采用流式細(xì)胞儀來確定中性脂含量。實驗步驟如下:取300ul的藻液,加入0.5g/ml的甘油和3.75μl尼羅紅(0.3μg/ml),混勻后,常溫下黑暗孵育5min,隨后使用流式細(xì)胞儀(beckmangallios)進(jìn)行測定。激發(fā)波長為530nm,發(fā)射波長為592nm。

      如圖9所示,ugdh兩株轉(zhuǎn)化藻的單細(xì)胞中性脂含量在各個生長周期都顯著大于野生型藻,在11天,在ugdh2轉(zhuǎn)化藻的單細(xì)胞中性脂含量比野生型藻增加100%。因此,干擾udgh基因,會導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,使油滴分泌到細(xì)胞外,同時也會促使更多的碳流向甘油總酯的合成。

      實施例10甘油總脂和脂肪酸成分分析

      采用gc-ms方法對微藻胞內(nèi)和胞外進(jìn)行脂肪酸定量和脂肪酸組分測定。胞外脂肪酸測定方法如下,取25ml藻液,4400rpm,10min,去掉沉淀,將上清轉(zhuǎn)移到新的50ml離心管,加入koh-ch3oh,超聲波破碎,上清和hcl-甲醇混勻后75度10min分層,用正己烷萃取,加入c19內(nèi)標(biāo),由氮吹儀吹干。用于脂肪酸干重和組分的分析。

      如圖10所示,ugdh轉(zhuǎn)化藻胞外的甘油總酯的產(chǎn)量比野生型增加了6倍,提高了600%。

      在圖11可知,ugdh轉(zhuǎn)化藻胞外的sfa(飽和脂肪酸)下調(diào),而pufa(多不飽和脂肪)上調(diào),mufa(單不飽和脂肪酸)基本沒有變化,在ugdh2轉(zhuǎn)化藻,sfa減少了51%,而pufa增加了6倍。ugdh轉(zhuǎn)化藻胞內(nèi)的sfa上調(diào)25%,而pufa下調(diào)(圖11)。因此,分泌到胞外的脂質(zhì)為pufa。

      如圖12所示,而ugdh2轉(zhuǎn)化藻的胞外二十碳五烯酸(epa,eicosapentaenoicacid,以下簡稱c20:5),c20:5增加了5.1倍,ugdh轉(zhuǎn)化藻的胞內(nèi)c20:5減少40%,說明了c20:5更容易分泌到細(xì)胞外。因此,干擾udgh基因,會導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,致使油滴分泌到細(xì)胞外,同時也會促使更多的碳流向甘油總酯的合成,而多不飽和脂肪酸更容易分泌到細(xì)胞外,c20:5的脂肪酸更容易分泌到細(xì)胞外。

      綜上所述,如圖13可知,本發(fā)明的干擾基因干擾ugdh的表達(dá),一方面提高胞內(nèi)脂質(zhì)合成,還促進(jìn)胞內(nèi)脂質(zhì)往胞外分泌。其中,所述干擾基因沒有在任何文獻(xiàn)報道,在genbank等公開數(shù)據(jù)庫也沒有任何注釋。本發(fā)明從微擬球藻中克隆并構(gòu)建了一種干擾基因,所述基因包括外顯子1、內(nèi)含子及外顯子2;所述外顯子1具有(i)如seqidno.1所示的核苷酸序列;或(ii)seqidno.1所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.1所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列;所述外顯子2有(i)如seqidno.3所示的核苷酸序列;或(ii)seqidno.3所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.3所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。將該干擾基因構(gòu)建到表達(dá)載體中轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞。在藻細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄后,外顯子1和內(nèi)含子作為發(fā)夾前臂和莖環(huán),外顯子2為發(fā)夾的后臂,會形成莖環(huán)發(fā)夾結(jié)構(gòu),在dicer酶的作用下,切割形成sirna,sirna會與靶基因互補(bǔ),干擾udp-glucosedehydrogenase基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)通過所述基因干擾udp-glucosedehydrogenase表達(dá)后,微擬球藻能高效產(chǎn)油且能胞外分泌脂質(zhì),得到高產(chǎn)油脂并能進(jìn)行胞外分泌油的藻株,解決了現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)問題。

      以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實施方式,應(yīng)當(dāng)指出,對于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在不脫離本發(fā)明原理的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤飾,這些改進(jìn)和潤飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。

      sequencelisting

      110暨南大學(xué)

      120一種干擾基因及其應(yīng)用

      130mp1620737

      16013

      170patentinversion3.3

      2101

      211251

      212dna

      213人工序列

      4001

      gctatgtgggcggacccaccatggcagtaatagccaagaactgtcctcgcatctgcgtga60

      cggtggtggacatctccgggccccagattgctgcctggaactcggccgatctccccatct120

      atgagccaggcctgcaggaggtggtggaggagacccgtggaaaaaatctctttttctcca180

      atgacattgacggggcgatcgctgcggcagacatcatctttgtttcggtcaatacgccca240

      ccaagctcacg251

      2102

      211249

      212dna

      213人工序列

      4002

      gtacgtgcgggtgggatgtagtgtgtagtgtgttaaaaggcagcataaattctatgcata60

      gtgcatgcggacccgttttagttgttaacctttgaccagatttacgctcatgctttcatg120

      tgatcaccatattggtgcattcttccagaagatataatgagcacagctaccctccacatc180

      atttctcattcctacccatgtcaaaactcactcccctctctaccccccccactctgctca240

      ccaccacag249

      2103

      211224

      212dna

      213人工序列

      4003

      aacaaagatgatgtctgccgcagcgatcgccccgtcaatgtcattggagaaaaagagatt60

      ttttccacgggtctcctccaccacctcctgcaggcctggctcatagatggggagatcggc120

      cgagttccaggcagcaatctggggcccggagatgtccaccaccgtcacgcagatgcgagg180

      acagttcttggctattactgccatggtgggtccgcccacatagc224

      2104

      21139

      212dna

      213人工序列

      4004

      acaattacaatccagtggtgctatgtgggcggacccacc39

      2105

      21123

      212dna

      213人工序列

      4005

      ctgtggtggtgagcagagtgggg23

      2106

      21143

      212dna

      213人工序列

      4006

      cactctgctcaccaccacagaacaaagatgatgtctgccgcag43

      2107

      21143

      212dna

      213人工序列

      4007

      gtccttgtagtccaggtgtgtgctatgtgggcggacccaccat43

      2108

      21120

      212dna

      213人工序列

      4008

      agcccgggcggatccgacta20

      2109

      21125

      212dna

      213人工序列

      4009

      aaggcaaaatgccgcaaaaaaggga25

      21010

      21120

      212dna

      213人工序列

      40010

      gcctggtcgagtattgattg20

      21011

      21120

      212dna

      213人工序列

      40011

      aaagctctcgcacaaataca20

      21012

      21119

      212dna

      213人工序列

      40012

      aagcttccatctgtgacat19

      21013

      21120

      212dna

      213人工序列

      40013

      cgtaaattgatccgaaacac20

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