本發(fā)明屬于基因工程領(lǐng)域,具體涉及一種干擾基因及其應(yīng)用。尤其是涉及一種干擾基因,含有干擾基因的表達(dá)載體、宿主細(xì)胞,以及生產(chǎn)生物柴油的方法。
背景技術(shù):
生物柴油備受關(guān)注,它可以作為一個化石替代品,具有可持續(xù)生產(chǎn)和環(huán)保等特性。生物能源應(yīng)用歷史已經(jīng)超過了50年,生物柴油主要來源于植物,例如菜籽,大豆,向日葵等,其原理是由三酰甘油通過酯交換反應(yīng)制成,1mol三酰甘油和3mol乙醇反應(yīng),可以產(chǎn)生1mol的甘油和甲酯。但是,這種生產(chǎn)效率普遍不高,而且占地面積大。
與傳統(tǒng)的生物柴油相比,微藻具有以下優(yōu)點:第一,微藻的生長速度快,其生物量可以在24小時增加一倍;第二,含油量高,某些微藻的含油量可以達(dá)到干重的50%-60%;第三,微藻的產(chǎn)油效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)快于動物和植物;第四,微藻能夠進(jìn)行光合作用,參與到生態(tài)系統(tǒng)的循環(huán);最后,微藻種類多,適應(yīng)性非常強(qiáng),某些微藻可以在極其惡劣的環(huán)境下面進(jìn)行生存,培養(yǎng)條件簡單。
作為產(chǎn)油微藻的代表藻種之一,微擬球藻屬于產(chǎn)油藻,相對其他微藻來說,其產(chǎn)油量相對較高,生長速度快。然而,微擬球藻的產(chǎn)油性能仍不能滿足工業(yè)需求。而且,植物的細(xì)胞壁很厚,提取微藻內(nèi)的油脂前需要去除其細(xì)胞壁,這個環(huán)節(jié)會大大提高生產(chǎn)成本,同時也會造成細(xì)胞的死亡,因此對于工業(yè)應(yīng)用來說,是很不利的。雖然某些非細(xì)胞破壞的油脂獲取方法已經(jīng)成功,但是,這還是不能滿足微藻的工業(yè)產(chǎn)油需求。因此,研發(fā)出一種既能高產(chǎn)油又能胞外分泌油脂的工業(yè)型微藻,用于解決現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)缺陷,成為了本領(lǐng)域技術(shù)人員亟待解決的問題。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
有鑒于此,本發(fā)明提供了一種干擾基因及其應(yīng)用,用于解決現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)缺陷。
本發(fā)明發(fā)現(xiàn)對微擬球藻的udp-glucosedehydrogenase基因(以下簡稱ugdh)進(jìn)行rna干擾,能使其細(xì)胞壁中聚多糖顯著減少,導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,同時使得更多的碳流向三酰甘油合成途徑。
本發(fā)明發(fā)現(xiàn)ugdh基因表達(dá)的蛋白含有471個氨基酸,使用smart網(wǎng)站和ncbi網(wǎng)站對假定的ugdh基因的蛋白序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其ugdh蛋白含有3個結(jié)構(gòu)域:udpg_mgdp_dh_n結(jié)構(gòu)域,udpg_mgdp_dh結(jié)構(gòu)域和udpg_mgdp_dh_c結(jié)構(gòu)域(http://smart.embl-heidelberg.de/),在udpg_mgdp_dh_n結(jié)構(gòu)域和udpg_mgdp_dh結(jié)構(gòu)域之間存在一個蘋果酸酶和nad的綁定位點(圖1a)。
利用mega6軟件對微擬球藻ugdh蛋白進(jìn)行系統(tǒng)樹構(gòu)建,發(fā)現(xiàn)n.oceanica和n.gaditana具有非常高的同源性。
本發(fā)明提供了一種ugdh基因的干擾基因,依次包括外顯子1、內(nèi)含子及外顯子2;
所述外顯子1具有
(i)如seqidno.1所示的核苷酸序列;或
(ii)seqidno.1所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.1所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。
作為優(yōu)選,所述外顯子2與外顯子1的部分序列為反向互補(bǔ)序列。
作為優(yōu)選,所述外顯子2具有如seqidno.3所示的核苷酸序列;或seqidno.3所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.3所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。
所述外顯子1及外顯子2之間含有內(nèi)含子。
作為優(yōu)選,所述內(nèi)含子具有如seqidno.2所示的核苷酸序列,或seqidno.2所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.2所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。
本領(lǐng)域技術(shù)人員可以理解所述取代、缺失或添加一個或多個核苷酸中的多個包括但不限于2個、3個或4個。
本發(fā)明還提供了上述干擾基因在干擾udp-glucosedehydrogenase基因的表達(dá)中的應(yīng)用。
進(jìn)一步,本發(fā)明還提供了一種表達(dá)載體,含有上述的干擾基因。
本發(fā)明還提供了一種宿主細(xì)胞,含有本發(fā)明所述的表達(dá)載體。
作為優(yōu)選,所述宿主細(xì)胞為微藻,如微擬球藻、小球藻等。在一些具體實施方案中,所述宿主細(xì)胞為微擬球藻。
本發(fā)明還提供了所述宿主細(xì)胞在提高脂質(zhì)含量和促進(jìn)脂質(zhì)分泌中的應(yīng)用。
進(jìn)一步,本發(fā)明還提供了一種生產(chǎn)生物柴油的方法,將所述宿主細(xì)胞在光生物反應(yīng)器大量繁殖,在宿主細(xì)胞達(dá)到平臺期時收集脂質(zhì),分離純化獲得生物柴油。
作為優(yōu)選,所述宿主細(xì)胞為微藻。更優(yōu)選為微擬球藻。
微藻通過光合作用固定碳元素,再通過誘導(dǎo)將所述碳元素轉(zhuǎn)化為脂質(zhì)
本發(fā)明提供了一種干擾基因及其應(yīng)用,所述干擾基因沒有在任何文獻(xiàn)報道,在genbank等公開數(shù)據(jù)庫也沒有任何注釋。本發(fā)明從微擬球藻中克隆并構(gòu)建了一種干擾基因,所述基因包括外顯子1、內(nèi)含子及外顯子2;所述外顯子1具有(i)如seqidno.1所示的核苷酸序列;或(ii)seqidno.1所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.1所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。該干擾基因能干擾udp-glucosedehydrogenase基因的表達(dá)。將該干擾基因構(gòu)建到表達(dá)載體中轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞。在藻細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄后,外顯子1和內(nèi)含子作為發(fā)夾前臂和莖環(huán),外顯子2為發(fā)夾的后臂,會形成莖環(huán)發(fā)夾結(jié)構(gòu)(圖1b),在dicer酶的作用下,切割形成sirna,sirna會與靶基因互補(bǔ),干擾udp-glucosedehydrogenase基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)通過所述基因干擾udp-glucosedehydrogenase表達(dá)后,微擬球藻能高效產(chǎn)油且能胞外分泌脂質(zhì),得到高產(chǎn)油脂并能進(jìn)行胞外分泌油的藻株,解決了現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)問題。
附圖說明
為了更清楚地說明本發(fā)明實施例或現(xiàn)有技術(shù)中的技術(shù)方案,下面將對實施例或現(xiàn)有技術(shù)描述中所需要使用的附圖作簡單地介紹。
圖1是ugdh的分子預(yù)測分析(a)ugdh蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測分析,(b)ugdh發(fā)夾結(jié)構(gòu)示意圖;
圖2是ugdh轉(zhuǎn)化藻的測序比對結(jié)果圖;
圖3是ugdh轉(zhuǎn)化藻分子驗證膠圖,m為marker,右欄為轉(zhuǎn)化藻;
圖4是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻qpcr分析,**表示(p<0.01),wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖5是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的光合作用和生長曲線(a)ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的光合作用,(b)ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的生長曲線,其中,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖6是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻激光掃描共聚焦熒光顯微鏡結(jié)果圖,其中,(a)野生型藻,(b)ugdh轉(zhuǎn)化藻,bar=5μm;
圖7是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻透射電鏡圖,其中,(a)野生型藻,(b)ugdh轉(zhuǎn)化藻.bar=5μm;
圖8是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻總糖含量測定,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖9是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻中性脂含量測定,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖10是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻胞內(nèi)胞外甘油總酯測定,其中,(a)細(xì)胞外甘油總酯產(chǎn)量測定分析,(b)細(xì)胞內(nèi)甘油總酯產(chǎn)量測定分析,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖11是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻胞內(nèi)胞外脂肪酸總成分測定,其中,(a)細(xì)胞外脂肪酸總成分測定分析,(b)細(xì)胞內(nèi)脂肪酸總成分測定分析,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖12是ugdh轉(zhuǎn)化藻和野生型藻胞內(nèi)胞外脂肪酸成分測定,其中,(a)細(xì)胞外脂肪酸總成分測定分析,(b)細(xì)胞內(nèi)脂肪酸總成分測定分析,wt是對照藻,ugdh1和ugdh2是轉(zhuǎn)化藻;
圖13是ugdh轉(zhuǎn)化藻全局通路圖。
具體實施方式
本發(fā)明提供了一種干擾基因及其應(yīng)用,用于解決現(xiàn)有技術(shù)中,微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)缺陷。
下面將對本發(fā)明實施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述,顯然,所描述的實施例僅僅是本發(fā)明一部分實施例,而不是全部的實施例?;诒景l(fā)明中的實施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒有做出創(chuàng)造性勞動前提下所獲得的所有其他實施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。
為了更詳細(xì)說明本發(fā)明,下面結(jié)合實施例對本發(fā)明提供的一種,進(jìn)行具體地描述。
實施例1ugdh干擾基因的構(gòu)建
提取微擬球藻的基因組dna,采用美基公司的植物dna提取試劑盒進(jìn)行。引物由上海生工生物工程有限公司合成,經(jīng)page方法純化,使用時稀釋到20μm。采用引物對seqidno.4,seqidno.5和引物對seqidno.6,seqidno.7(表1),反應(yīng)體系如表2和表3,以微擬球藻的基因組為模板,分別擴(kuò)增得到發(fā)夾片段1(外顯子1和內(nèi)含子片段)和發(fā)夾片段2(外顯子2)(圖1b)。
把上述克隆發(fā)夾片段1和發(fā)夾片段2通過采用clonexpressmultisonestepcloning試劑盒(vazymebiotechco.,ltd,nanjing)同源重組的方法連接到含有博來霉素抗性表達(dá)盒的載體,含有博來霉素抗性表達(dá)盒的載體,得到含有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的重組干擾載體,標(biāo)記為pna03-udghi。
表1pcr引物
表2發(fā)夾片段1的pcr反應(yīng)體系(20μl)
表3發(fā)夾片段2的pcr反應(yīng)體系(20μl)
實施例2微擬球藻轉(zhuǎn)化及轉(zhuǎn)化藻的篩選
參考li等(2016)的電擊方法把重組載體整合到微擬球藻基因組中,電擊完成后,將藻細(xì)胞轉(zhuǎn)移到5ml的f/2無硅培養(yǎng)基,黑暗培養(yǎng)24h,隨后,將5ml藻細(xì)胞離心10min(4400rpm)收集,并均勻涂到含有5μg/ml博來霉素的平板內(nèi)。通過4-5次博來霉素的篩選獲得具有抗性的轉(zhuǎn)化藻,篩選出兩株具有抗性的ugdh轉(zhuǎn)化藻,命名為ugdh1和ugdh2轉(zhuǎn)化藻。
實施例3轉(zhuǎn)化藻的驗證
驗證步驟如下:把100ml轉(zhuǎn)化藻和100ml野生型微擬球藻4400rpm離心10min收集,用美基公司的植物dna提取試劑盒提取基因組dna,用引物seqidno.8和引物seqidno.9進(jìn)行pcr,并進(jìn)行切膠回收測序,如圖2所示,測序結(jié)果證明轉(zhuǎn)化藻基因組內(nèi)含有所述干擾基因。
如圖3所示,電泳膠圖顯示轉(zhuǎn)化藻在大概473bp處有條帶。
實施例4驗證發(fā)夾結(jié)構(gòu)干擾效率
本發(fā)明對轉(zhuǎn)化藻的ugdh基因的轉(zhuǎn)錄進(jìn)行熒光實時定量分析。
real-timeqpcr就是在pcr擴(kuò)增過程中,通過熒光信號,對pcr進(jìn)程進(jìn)行實時檢測。由于在pcr擴(kuò)增的指數(shù)時期,模板的ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。real-timeqpcr由于其操作簡便,靈敏度高,重復(fù)性好等優(yōu)點發(fā)展非常迅速。對rt-pcr產(chǎn)生的結(jié)果,分析時采用2-ct法,即按照如下公式進(jìn)行計算:
1.δct(目的基因ct—內(nèi)參ct)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差;
2.δδct(待測樣品中目的基因δct—參照樣品中目的基因δct)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差;
3.相對表達(dá)量(2-δδct)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差。
熒光實時定量分析實驗步驟如下:野生型藻和轉(zhuǎn)化藻放置新的培養(yǎng)基中且藻密度控制在1×106個/ml,取第十天的微藻,微藻的數(shù)量控制在3×108個,4400rpm離心10min。采用rnaisolationkit(takara)對微藻的總rna進(jìn)行提取,并使用theprimescripttmrtreagentkitwithgdnaeraser(takara)試劑盒進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,逆轉(zhuǎn)錄所用的引物為隨機(jī)引物。針對ugdh基因的特異引物對seqidno.10和seqidno.11;內(nèi)參為β-tublin,其引物為seqidno.12和seqidno.13。用于實時定量擴(kuò)增,所用pcrsupermix(invitrogen,usa),實驗所用的檢測設(shè)備為abiprism7500sequencedetectionsystem(appliedbiosystems,美國)。結(jié)果如圖4所示。
由此可見,該啟動子在微擬球藻中能夠顯著地抑制ugdh基因表達(dá),與野生型藻相比,ugdh1轉(zhuǎn)化藻和ugdh2的轉(zhuǎn)錄水平都降低80%,表明pna03-ugdh的發(fā)夾結(jié)構(gòu)成功干擾了ugdh基因的表達(dá)。
實施例5轉(zhuǎn)化藻株的生長特征和光合作用分析
光合作用測定的步驟如下:采用fv/fm(可變/最大熒光之比)的比值來測定光合作用效率,轉(zhuǎn)化藻和野生型藻黑暗處理40min后,使用td-700fluorometer(turnerdesign,美國)測定。
如圖5a所示,ugdh的兩株轉(zhuǎn)化藻和野生型的fv/fm基本一樣,說明了對ugdh基因的rna干擾,并不影響其光合效率。
生長曲線的測定步驟如下,對微擬球藻進(jìn)行取樣。利用倒置的顯微鏡和血球計數(shù)板進(jìn)行計算。微擬球藻的計算公式如下:celldensity=(n/80)×400×104,其中celldensity表示微擬球藻的藻細(xì)胞密度,n表示細(xì)胞總數(shù)(80個方格)。測定了生長曲線,評估轉(zhuǎn)基因藻的生物量和生長速度。
結(jié)果如圖5b所示,ugdh1轉(zhuǎn)化藻,ugdh2轉(zhuǎn)化藻和野生型藻生長規(guī)律基本一致,因此,對ugdh基因的干擾,并不會抑制微藻的生長。此外,我們對轉(zhuǎn)化藻和野生型藻的光合效率進(jìn)行分析,來評估光合作用。
實施例6轉(zhuǎn)化藻株中性脂在激光掃描共聚焦熒光顯微鏡觀察
驗證的步驟:如下熒光共聚焦的分析過程如下:取300μl的藻液,加入0.5g/ml的甘油和3.75μl尼羅紅(0.3μg/ml),混勻后,常溫下黑暗孵育5min,進(jìn)行尼羅紅染色后,使用激光共聚焦分析儀zeisslsm510meta(zeiss,germany)進(jìn)行分析。激發(fā)波長為488nm,發(fā)射波長為505-550nm。
為了進(jìn)一步更直觀地觀察中性脂的含量,對微擬球藻進(jìn)行激光掃描共聚焦熒光顯微鏡觀察,結(jié)果如圖6所示,在野生型藻中,并沒有發(fā)現(xiàn)有油體分泌出來,而在ugdh轉(zhuǎn)化藻中,可以看到非常多的油滴在細(xì)胞的周圍,其細(xì)胞所含的油也明顯比野生型多。因此,干擾udgh基因,可能會導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,致使油滴分泌到細(xì)胞外,同時可能也會促使更多的碳流向三酰甘油(tag)的合成途徑。
實施例7透射電鏡的分析
為了進(jìn)一步研究干擾ugdh對微擬球藻細(xì)胞壁的影響,我們進(jìn)行透射電鏡分析,驗證的步驟如下:在4℃,4400rpm條件下離心10分鐘,分別收集試驗組和對照組的藻細(xì)胞。取上清液后的藻細(xì)胞樣品用1×pbs緩沖液清洗3次,最后5000rpm離心3分鐘收集藻細(xì)胞。收集的藻細(xì)胞用溶于ph7.2的0.1m的nah2po4緩沖液中的2.5%(v/v)戊二醛及2%(w/v)多聚甲醛進(jìn)行固定,并用真空泵在4℃條件下抽真空30分鐘。之后將固定液離心并去掉上清液,重新用固定液在4℃條件下固定12h。固定完成后離心去除固定液并用0.1mnah2po4緩沖液(ph7.2)清洗4次(15分鐘和30分鐘各兩次)。之后樣品用1%(w/v)四氧化鋨在4℃下固定3h,完成后用0.1m的nah2po4緩沖液(ph7.2)清洗4次(15分鐘和30分鐘各兩次)。完成后用梯度濃度的乙醇(30%,50%,70%,80%,90%v/v)對樣品進(jìn)行脫水,每隔10分鐘更換一種濃度,最后用100%的乙醇沖洗兩次(每次30分鐘)。之后樣品分別重懸于環(huán)氧丙烷(2次,每次30分鐘)和1:1(v/v)環(huán)氧丙烷:環(huán)氧樹脂(1次,30分鐘)中進(jìn)行細(xì)胞滲透。完成后藻細(xì)胞固定于100%w/v環(huán)氧樹脂中反應(yīng)24h,且在70℃中包埋的時間不少于8h。藻細(xì)胞完成包埋后利用8800ultratomeiii進(jìn)行超微切片,并用乙酸雙氧鈾及檸檬酸鉛對切片進(jìn)行染色。處理后的切片利用tecnai-10透射電子顯微鏡進(jìn)行觀察。
結(jié)果如圖7所示,在野生型微擬球藻中,細(xì)胞壁渾厚有序(圖7a),而在ugdh轉(zhuǎn)基因藻中,細(xì)胞壁變細(xì),形狀無規(guī)則。因此,在微擬球藻中,干擾ugdh基因的表達(dá),會干擾細(xì)胞壁的生成(圖7b)。
實施例8總糖含量分析
為了更進(jìn)一步說明ugdh對細(xì)胞壁影響,我們進(jìn)行總糖含量定量,總糖含量的測定過程如下:取藻液50ml,采用4400rpm,10min來收集藻。準(zhǔn)備1.5mlep管,并稱量重量,將藻轉(zhuǎn)移到1.5ml的ep管內(nèi)。將藻置于凍干儀器,凍干8h后,稱量其重量,通過計算得到藻的干重。將凍干好的藻粉,用10ml去離子水重新混勻懸浮,將5ml藻液轉(zhuǎn)移到新的離心管中,向新的離心管中加入3ml的5%的苯酚溶液(w/v),混勻后,加入15ml的濃硫酸,混勻,常溫靜置10min,隨后,置于30度孵育20min后,取100ul的轉(zhuǎn)移到96孔酶標(biāo)板,放到酶標(biāo)儀中讀數(shù),參數(shù)為483nm。
如圖8所示,在ugdh1和ugdh2這兩株轉(zhuǎn)化藻中,其總糖都顯著下調(diào)了50%。因此,結(jié)果表明了對ugdh基因進(jìn)行干擾,會顯著下調(diào)糖的含量。
實施例9轉(zhuǎn)化藻株中性脂分析
利用尼羅紅染色的方法,采用流式細(xì)胞儀來確定中性脂含量。實驗步驟如下:取300ul的藻液,加入0.5g/ml的甘油和3.75μl尼羅紅(0.3μg/ml),混勻后,常溫下黑暗孵育5min,隨后使用流式細(xì)胞儀(beckmangallios)進(jìn)行測定。激發(fā)波長為530nm,發(fā)射波長為592nm。
如圖9所示,ugdh兩株轉(zhuǎn)化藻的單細(xì)胞中性脂含量在各個生長周期都顯著大于野生型藻,在11天,在ugdh2轉(zhuǎn)化藻的單細(xì)胞中性脂含量比野生型藻增加100%。因此,干擾udgh基因,會導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,使油滴分泌到細(xì)胞外,同時也會促使更多的碳流向甘油總酯的合成。
實施例10甘油總脂和脂肪酸成分分析
采用gc-ms方法對微藻胞內(nèi)和胞外進(jìn)行脂肪酸定量和脂肪酸組分測定。胞外脂肪酸測定方法如下,取25ml藻液,4400rpm,10min,去掉沉淀,將上清轉(zhuǎn)移到新的50ml離心管,加入koh-ch3oh,超聲波破碎,上清和hcl-甲醇混勻后75度10min分層,用正己烷萃取,加入c19內(nèi)標(biāo),由氮吹儀吹干。用于脂肪酸干重和組分的分析。
如圖10所示,ugdh轉(zhuǎn)化藻胞外的甘油總酯的產(chǎn)量比野生型增加了6倍,提高了600%。
在圖11可知,ugdh轉(zhuǎn)化藻胞外的sfa(飽和脂肪酸)下調(diào),而pufa(多不飽和脂肪)上調(diào),mufa(單不飽和脂肪酸)基本沒有變化,在ugdh2轉(zhuǎn)化藻,sfa減少了51%,而pufa增加了6倍。ugdh轉(zhuǎn)化藻胞內(nèi)的sfa上調(diào)25%,而pufa下調(diào)(圖11)。因此,分泌到胞外的脂質(zhì)為pufa。
如圖12所示,而ugdh2轉(zhuǎn)化藻的胞外二十碳五烯酸(epa,eicosapentaenoicacid,以下簡稱c20:5),c20:5增加了5.1倍,ugdh轉(zhuǎn)化藻的胞內(nèi)c20:5減少40%,說明了c20:5更容易分泌到細(xì)胞外。因此,干擾udgh基因,會導(dǎo)致細(xì)胞壁變薄,致使油滴分泌到細(xì)胞外,同時也會促使更多的碳流向甘油總酯的合成,而多不飽和脂肪酸更容易分泌到細(xì)胞外,c20:5的脂肪酸更容易分泌到細(xì)胞外。
綜上所述,如圖13可知,本發(fā)明的干擾基因干擾ugdh的表達(dá),一方面提高胞內(nèi)脂質(zhì)合成,還促進(jìn)胞內(nèi)脂質(zhì)往胞外分泌。其中,所述干擾基因沒有在任何文獻(xiàn)報道,在genbank等公開數(shù)據(jù)庫也沒有任何注釋。本發(fā)明從微擬球藻中克隆并構(gòu)建了一種干擾基因,所述基因包括外顯子1、內(nèi)含子及外顯子2;所述外顯子1具有(i)如seqidno.1所示的核苷酸序列;或(ii)seqidno.1所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.1所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列;所述外顯子2有(i)如seqidno.3所示的核苷酸序列;或(ii)seqidno.3所示的核苷酸序列經(jīng)取代、缺失或添加一個或多個核苷酸序列獲得的核苷酸序列,且與seqidno.3所示的核苷酸序列至少有85%同源性的核苷酸序列。將該干擾基因構(gòu)建到表達(dá)載體中轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞。在藻細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄后,外顯子1和內(nèi)含子作為發(fā)夾前臂和莖環(huán),外顯子2為發(fā)夾的后臂,會形成莖環(huán)發(fā)夾結(jié)構(gòu),在dicer酶的作用下,切割形成sirna,sirna會與靶基因互補(bǔ),干擾udp-glucosedehydrogenase基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)通過所述基因干擾udp-glucosedehydrogenase表達(dá)后,微擬球藻能高效產(chǎn)油且能胞外分泌脂質(zhì),得到高產(chǎn)油脂并能進(jìn)行胞外分泌油的藻株,解決了現(xiàn)有技術(shù)中微藻產(chǎn)油效率低、成本高、工序繁多,不能滿足工業(yè)需求的技術(shù)問題。
以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實施方式,應(yīng)當(dāng)指出,對于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在不脫離本發(fā)明原理的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤飾,這些改進(jìn)和潤飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。
sequencelisting
110暨南大學(xué)
120一種干擾基因及其應(yīng)用
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