(10-12小時(shí))至菌體濃 度為 1. 5-2. 0 ;
[0140] 2、離心收集菌體(4000rpm,5min)后,用冰預(yù)冷雙蒸水洗三次,重懸至0D600為2 ;
[0141] 3、等梯度稀釋菌夜(10°,KT1,1(T 2, 1(T3, 1(T4, 1(T5);
[0142] 4、將等梯度稀釋的酵母點(diǎn)在以2%麥芽糖為碳源的SC-URA平板中(配方:無(wú)氨基 酵母氮源6. 7g/L,酵母合成缺失培養(yǎng)基補(bǔ)充物1. 4g/L,麥芽糖20g/L,亮氨酸,組氨酸和色 氨酸各20mg/L,2%瓊脂),置于30°C培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
[0143] 結(jié)果如圖4所示,相比對(duì)照菌株(E426),重組酵母(EGLT)快速利用葡萄糖的能 力。說(shuō)明GLT-1的導(dǎo)入,釀酒酵母恢復(fù)了以葡萄糖為碳源進(jìn)行生長(zhǎng)的能力。
[0144] 綜合所述,GLT-1對(duì)葡萄糖具有較高的轉(zhuǎn)運(yùn)能力(30. 75± 1. 34mmol/h/gram DCW) 和親和性(Km為18. 42 ±3. 38mM),并且GLT-1導(dǎo)入釀酒酵母后,可使其恢復(fù)利用葡萄糖為碳 源的能力。
[0145] 實(shí)施例2. XYT-1是木糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,使微生物獲得轉(zhuǎn)運(yùn)木糖能力
[0146] 一、XYT-1基因表達(dá)載體的構(gòu)建
[0147]利用引物 XYT-F(序列:5' -GGACTAGTATGGITCTGGGGAAAAAGTCAATC-3')(SEQ ID NO. :13)和 XYT-R(序列:5' -CCCAAGCTTCTAAACCCTATGGITAATAACCTT-3')(SEQ ID NO. :14) 從粗糙脈孢菌的cDNA中PCR擴(kuò)增XYT-1基因的編碼閱讀框,PCR反應(yīng)體系為:5Xphusion HF buffer 10 y L,lOmM dNTPs 1y L, XYT-F 2. 5 y L, XYT-R 2. 5 y L, cDNA 1y L, Phusion DNA polymerase 0? 5 y L,水 32. 5 y L。PCR 反應(yīng)條件為:先 98 °C 30s ;然后 98 °C 10s, 60°C 30s,72°C 1.5min,35 個(gè)循環(huán);最后 72°C 10min,4°C 10min。PCR 反應(yīng)結(jié)束后,使用 限制性?xún)?nèi)切酶Spel和Hindlll將PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒pRS426-PGKl [該質(zhì)粒構(gòu)建根據(jù)參考 文獻(xiàn)(Galazka, J. M.,et al.,2010. Cellodextrin transport in yeast for improved biofuel production. Science. 330, 84-86.)],進(jìn)行雙酶切,并將兩種雙酶切產(chǎn)物進(jìn)行連 接,將連接產(chǎn)物用限制性?xún)?nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定,再進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果表明XYT-1基因的核 苷酸序列如序列表中序列3所示,表明獲得了序列及插入位置正確的攜帶XYT-1基因的重 組表達(dá)質(zhì)粒,命名為PRS426-XYT。將質(zhì)粒pRS426-XYT和pRS426-PGKl轉(zhuǎn)入釀酒酵母已8丫. VW4000(ffieczorke, R.,et al.,1999. Concurrent knock-out of at least20 transporter genes is required to block uptake of hexoses in Saccharomyces cerevisiae. FEBS Lett.464, 123-128.)中,分別命名為 EXYT 和 E426。
[0148] 二、XYT-1對(duì)木糖的轉(zhuǎn)運(yùn)的測(cè)定
[0149] XYT-1對(duì)木糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力的測(cè)定參見(jiàn)實(shí)施例1,其結(jié)果如圖5所示。由于XYT-1的 導(dǎo)入,重組酵母EXYT具有木糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力,XYT-1對(duì)木糖的親和力Km為7. 58±0. 60mM,最 大轉(zhuǎn)運(yùn)速率為 49. 61 ± 1. 20 y mol/h/gram DCW。
[0150] 實(shí)施例3. XAT-1是木糖和阿拉伯糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,使微生物獲得轉(zhuǎn)運(yùn)木糖和阿拉伯糖 能力
[0151] 一、XAT-1基因表達(dá)載體的構(gòu)建
[0152] 利用引物 XAT-F(序列:5' -CGCGGATCCATGAAGCCAITTCTGGGGCTC-3')(SEQ ID NO. :15)和 XAT-R(序列:5' -CCCAAGCTTCTACGACTCCCGATTACCTCCAT-3')(SEQ ID NO. :16) 從粗糙脈孢菌的cDNA中PCR擴(kuò)增XAT-1基因的編碼閱讀框,PCR反應(yīng)體系為:5Xphusion HF buffer 10 y L,lOmM dNTPs 1 y L, XAT-F 2.5 y L, XAT-R2. 5 y L, cDNA 1y L, Phusion DNA polymerase 0? 5 y L,水 32. 5 y L。PCR 反應(yīng)條件為:先 98 °C 30s ;然后 98 °C 10s, 65°C 30s,72°C 1.5min,35 個(gè)循環(huán);最后 72°C 10min,4°C lOmin。PCR 反應(yīng)結(jié)束后,使用 限制性?xún)?nèi)切酶BamHI和Hindlll將PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒pRS426-PGKl [該質(zhì)粒構(gòu)建根據(jù)參考 文獻(xiàn)(Galazka, J. M. , et al. , 2010. Cellodextrin transport in yeast for improved biofuel production. Science. 330, 84-86.)],進(jìn)行雙酶切,并將兩種雙酶切產(chǎn)物進(jìn)行連 接,將連接產(chǎn)物用限制性?xún)?nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定,再進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果表明XAT-1基因的核 苷酸序列如序列表中序列5所示,表明獲得了序列及插入位置正確的攜帶XAT-1基因的重 組表達(dá)質(zhì)粒,命名為PRS426-XAT。將質(zhì)粒pRS426-XAT和pRS426-PGKl轉(zhuǎn)入釀酒酵母已8丫. VW4000(ffieczorke, R. , et al. , 1999. Concurrent knock-out of at least20 transporter genes is required to block uptake of hexoses in Saccharomyces cerevisiae. FEBS Lett.464, 123-128.)中,分別命名為 EXAT 和 E426。
[0153] 二、XAT-1對(duì)木糖和阿拉伯糖轉(zhuǎn)運(yùn)的測(cè)定
[0154] XAT-1對(duì)木糖和阿拉伯糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力的測(cè)定參見(jiàn)實(shí)施例1,其結(jié)果如圖6所示。由 于XAT-1的導(dǎo)入,重組酵母EXAT具有木糖和阿拉伯糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力,其中,XAT-1對(duì)木糖的 親和力1(111為18.17±3.231111,最大轉(zhuǎn)運(yùn)速率為54.11±3.83 11111〇1/11/^四111〇(^(圖6八); XAT-1對(duì)阿拉伯糖的親和力Km為61. 93±17. 68mM,大轉(zhuǎn)運(yùn)速率為65. 84±11. 76ymol/h/ gram DCW (圖 6B)。
[0155] 實(shí)施例4. LAT-1是阿拉伯糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,使微生物獲得轉(zhuǎn)運(yùn)阿拉伯糖轉(zhuǎn)運(yùn)能力
[0156] 一、LAT-1基因表達(dá)載體的構(gòu)建
[0157]利用引物 ELAT-F(序列:5' -CGCGGATCCATGGGGCTCGGGCTTAAGCTAC-3')(SEQ ID NO. :17)和 ELAT-R(序列:5' -CGGAATTCCTAAACCTTCTCATGCTCATGCAC-3')(SEQ ID NO. :18) 從粗糙脈孢菌的cDNA中PCR擴(kuò)增LAT-1基因的編碼閱讀框,PCR反應(yīng)體系為:5Xphusion HF buffer 10 y L, 10mM dNTPs 1 y L, ELAT-F 2. 5 y L, ELAT-R 2. 5 y L, cDNA lyL,Phusion DNA polymerase 0? 5 y L,水 32. 5 y L。PCR 反應(yīng)條件為:先 98 °C 30s ;然后 98 °C 10s, 65°C 30s,72°C 1.5min,35 個(gè)循環(huán);最后 72°C 10min,4°C 10min。PCR 反應(yīng)結(jié)束后,使用 限制性?xún)?nèi)切酶BamHI和Hindlll將PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒pRS426-PGKl [該質(zhì)粒構(gòu)建根據(jù)參考 文獻(xiàn)(Galazka, J. M. , et al. , 2010. Cellodextrin transport in yeast for improved biofuel production. Science. 330, 84-86.)],進(jìn)行雙酶切,并將兩種雙酶切產(chǎn)物進(jìn)行連 接,將連接產(chǎn)物用限制性?xún)?nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定,再進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果表明LAT-1基因的核 苷酸序列如序列表中序列7所示,表明獲得了序列及插入位置正確的攜帶LAT-1基因的重 組表達(dá)質(zhì)粒,命名為PRS426-LAT。將質(zhì)粒pRS426-LAT和pRS426-PGKl轉(zhuǎn)入釀酒酵母已8丫. VW4000(ffieczorke, R. , et al. , 1999. Concurrent knock-out of at least20 transporter genes is required to block uptake of hexoses in Saccharomyces cerevisiae. FEBS Lett. 464, 123-128.)中,分別命名為 ELAT 和 E426。
[0158] 二、LAT-1對(duì)阿拉伯糖轉(zhuǎn)運(yùn)的測(cè)定
[0159] LAT-1對(duì)木糖和阿拉伯糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力的測(cè)定參見(jiàn)實(shí)施例1,其結(jié)果如圖7所示。由 于LAT-1的導(dǎo)入,重組酵母ELAT具有阿拉伯糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力,LAT-1對(duì)阿拉伯糖的親和力Km 為 25. 12±2. 98mM,最大轉(zhuǎn)運(yùn)速率為 116. 7±4. 06mmol/h/gram DCW。
[0160] 三、LAT-1轉(zhuǎn)運(yùn)類(lèi)型的測(cè)定
[0161] 真菌中的糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白主要是Uniporter和Symporter/H+類(lèi)型,Uniporter,依靠底 物濃度梯度驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn),轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白主要起著協(xié)助運(yùn)輸?shù)淖饔?。Symporter/H+,向同一個(gè)方向同 時(shí)轉(zhuǎn)運(yùn)糖類(lèi)及H+,并以H+的電化學(xué)梯度作為推動(dòng)力。為了鑒定LAT-1的轉(zhuǎn)運(yùn)類(lèi)型設(shè)計(jì)了如 下實(shí)驗(yàn):
[0162] 其中,CCCP(間苯腙氯羰氰)具有破壞細(xì)胞質(zhì)子梯度的作用,因此不同CCCP濃度 下,測(cè)定LAT-1對(duì)阿拉伯糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力,從而鑒定LAT-1的轉(zhuǎn)運(yùn)類(lèi)型。
[0163] 1、挑取ELAT單克隆,將其接種在10mL以2%麥芽糖為碳源的SC-URA培養(yǎng)基(配 方:無(wú)氨基酵母氮源6. 7g/L,酵母合成缺失培養(yǎng)基補(bǔ)充物1. 4g/L,麥芽糖20g/L,亮氨酸,組 氨酸和色氨酸各20mg/L)中30°C培養(yǎng)過(guò)夜(10-12小時(shí))至菌體濃度為1. 5-2. 0(0D600);
[0164] 2、離心收集菌體(4000rpm, 5min)后,用冰預(yù)冷 assay buffer (100mM Tris-Citrate buffer pH 5. 0)洗三次,重懸至 0D600 為 20 ;
[0165] 3、將菌體分裝至1.5mL離心管(100ul/管)中,每管50yL,其中三個(gè)用于烘干稱(chēng) 其干重,其余置于冰上,以備使用。
[0166] 4、反應(yīng)前加入1 yL不同濃度的CCCP(終濃度分別為:0yM,0. 5yM,1.0yM, 25 1^,5〇1^),于30°〇培養(yǎng)箱中,放置1〇1^11。
[0167] 5、50ul細(xì)胞懸液加入50ul 50mM同位素標(biāo)記的阿拉伯糖溶液,于30°C下反應(yīng)120s 后,加入lmL冰水終止反應(yīng),
[0168] 6、10000rpm離心lmin來(lái)收集細(xì)胞,冰水洗滌兩次,離心,去上清。
[0169] 7、用 500mL0?ImM NaOH重選菌體,轉(zhuǎn)移至裝有3mL Ultima Gold scintillatioin fluid小瓶中,測(cè)定其放射量,并計(jì)算其單位干重單位時(shí)間的轉(zhuǎn)運(yùn)量。
[0170] 其實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖8所示,隨著CCCP濃度的增高,ELAT對(duì)阿拉伯糖的轉(zhuǎn)運(yùn)能力逐漸 下降,說(shuō)明LAT-1的轉(zhuǎn)運(yùn)類(lèi)型為Symp 〇rter/H+,當(dāng)CCCP濃度分別25 y M時(shí),其對(duì)阿拉伯糖的 轉(zhuǎn)運(yùn)速率降到了最低,此時(shí)LAT-1依靠細(xì)胞內(nèi)外的阿拉伯糖濃度梯度為動(dòng)力,轉(zhuǎn)運(yùn)阿拉伯 糖。有實(shí)驗(yàn)證明當(dāng)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)類(lèi)型為Symporter/H+時(shí),會(huì)有較大的轉(zhuǎn)運(yùn)速率,具有更 好的應(yīng)用前景。
[0171] 實(shí)施例5. MtLAT-1是阿拉伯糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,使微生物獲得轉(zhuǎn)運(yùn)阿拉伯糖能力
[0172] -、MtLAT-1基因表達(dá)載體的構(gòu)建
[0173]利用引物 MtLAT-F(序列:5'-CGCGGATCCATGAAGCTGCCCACGAITTAC-3')(SEQ ID NO. :19)和 MtLAT-R(序列:5' -CCGGAAITCTTAAACCTTCTCCTGCTCGCC-3')(SEQ ID NO. : 20)從嗜熱毀絲霉的cDNA中PCR擴(kuò)增MtLAT-1基因的編碼閱讀框,PCR反應(yīng)體系為: 5Xphusion HF buffer 10 y L, 10mM dNTPs 1 y L, MtLAT-F 2. 5 y L, MtLAT-R 2. 5 y L, cDNA lyL,Phusion DNA polymerase 0.5 yL,水 32.5 yL。PCR 反應(yīng)條件為:先 98°C 30s;然后 98°C 10s,67°C30s,72°C 1. 5min,35 個(gè)循環(huán);最后 72°C 10min,4°C lOmiruPCR反應(yīng)結(jié)束后,使 用限制性?xún)?nèi)切酶BamHI和EcoRI將PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒pRS426-PGKl [該質(zhì)粒構(gòu)建根據(jù)參考文獻(xiàn) (Galazka, J. M. , et al. , 2010. Cellodextrin transport in yeast for improved biofuel production. Science. 330, 84-86.)],進(jìn)行雙酶切,并將這兩種雙酶切產(chǎn)物進(jìn)行連接,將連 接產(chǎn)物用限制性?xún)?nèi)切酶進(jìn)行酶切鑒定,再進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果表明MtLAT-1基因的核苷酸 序列如序列表中序列9所示,表明獲得了序列及插入位置正確的攜帶MtLAT-1基因的重組 表達(dá)質(zhì)粒,命名為pRS426-MtLAT。將質(zhì)粒pRS426-MtLAT和pRS426-PGKl轉(zhuǎn)入釀酒酵母EBY. V