專利名稱:一種核苷酸切除修復交叉互補組1基因表達檢測試劑盒的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本實用新型涉及一種檢測試劑盒,尤其是涉及一種核苷酸切除修復交叉互補組I基因表達檢測試劑盒。
背景技術(shù):
核苷酸切除修復交叉互補組I (excision repair cross complementing 1,ERCC1)是核苷酸剪切修復家族中的一個重要成員,定位于19號染色體上,基因全長
15X 103bp,含10個外顯子,編碼297個氨基酸的蛋白,ERCCl基因的表達產(chǎn)物與DNA修復酶缺乏互補基因F(XPF)形成緊密的異二聚體(ERCC1-XPF),該二聚體是一個特異性的連結(jié)5'端的核酸內(nèi)切酶,具有損傷識別和切除5'端的雙重作用,ERCCl在NER中起到限速或調(diào) 節(jié)作用。核苷酸切除修復(nucleotide excision repair, NER)是細胞內(nèi)最重要的修復方式,能修復外因?qū)е碌腄NA損傷,在維持基因組功能完整性、抗癌過程中起到極為重要的作用。NER的修復通過切除藥物或者紫外線等損傷的DNA而形成的DNA加合物,以互補鏈為模板復制并修復損傷DNA來維護基因組的完整性。而DNA損傷修復能力增強有時是引起腫瘤細胞耐藥的一個重要因素。ERCCl修復作用呈現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism, SNP)指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性,ERCCl基因在118位密碼子有一個C — T的突變,從而影響ERCCl蛋白的表達水平。許多研究指出118C/T單核苷酸多態(tài)可能與鉬類化療藥耐藥相關(guān),抑制ERCCl的表達可克服鉬類耐藥性,提高治療效果。鉬類藥物是最常用的腫瘤化療藥物之一,包括順鉬、卡鉬和奧沙利鉬等。其藥理學機制主要是通過引起腫瘤細胞內(nèi)DNA的交聯(lián),阻礙DNA合成與復制,從而抑制腫瘤細胞的生長。DNA修復是鉬類藥物耐藥性產(chǎn)生的主要原因。ERCCl在所有的腫瘤細胞中都存在表達,而且表達水平差異很大。臨床研究已證實ERCCl參與鉬類藥物耐藥的發(fā)生,其表達水平與多種腫瘤鉬類藥物化療的療效和生存期呈負相關(guān),即表達水平低的患者對鉬類藥物敏感,反之表達水平高的患者則耐藥。美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)(第二版,2010)中明確指出在接受鉬類藥物化療前進行ERCCl基因水平的表達檢測。因此,化學致癌物代謝酶,即藥物代謝酶基因表達檢測尤其是ERCCl基因表達的檢測對于腫瘤病人的個體化用藥及腫瘤發(fā)病機制研究至關(guān)重要。但目前臨床檢測ERCCl基因表達的檢測試劑原料需多方配備,實驗過程分布進行,耗時較長,容易污染,所以探索一種檢測ERCCl基因表達快速可靠的方法已經(jīng)成為臨床試驗研究的熱點問題。
實用新型內(nèi)容為了解決上述技術(shù)問題,本實用新型提供一種核苷酸切除修復交叉互補組I基因表達檢測試劑盒,包括盒體I、盒蓋2、固定座3、引物試劑瓶4、SYBR premix Ex Taq(含ROX)試劑瓶5、去離子水試劑瓶6、固定座3上設(shè)置有Eppendorf管7、加樣器吸頭8。進一步地,所述固定座3還設(shè)置有孔9和空格10。孔9設(shè)置用來分別將Eppendorf管7、加樣器吸頭8固定,以防止遺撒???的形狀依據(jù)不同Eppendorf管7、加樣器吸頭8的形狀和大小而設(shè)置。空格10設(shè)置用來將引物試劑瓶4、SYBR premix Ex Taq試劑瓶5、去離子水試劑瓶6固定。所述引物包括擴增引物和白蛋白內(nèi)參。其中,擴增引物為特異性擴增 ERCCl 的引物,上游引物序列為 5 ' -GAAGTCAGTCAACAAAACGGACAGT-3 ';下游引物序列為5 ' -TGGGCATAAGGCCAGATCTT-3 ',白蛋白內(nèi)參上游引物序列為5' -TTCTACAATGAGCTGCGTGTG-3,下游引物序列為5' -CAGCCTGGATAGCAACGTACA-3。引物濃度為10uM。 所述SYBR premix Ex Taq(含 ROX) (2*Conc.)含有 0. 4mmol/L 的 dNTPs, 4mmol/L的 Mg2+,2xBuffer,lU/20ii I 的 Ex Taq HS, 1U/20 u I Tli RnaseH, lmmol/L SYBR Green 1,0. lmmol/L ROX Reference Dye。本實用新型與現(xiàn)有產(chǎn)品相比,具有如下積極有益的效果本試劑盒結(jié)構(gòu)簡單、設(shè)計合理、使用方便、制造容易、檢測過程不易受污染;本試劑盒在檢測核苷酸切除修復交叉互補組I基因表達時具有敏感性高、特異性強、耗時短等優(yōu)點。
圖I為本實用新型的整體結(jié)構(gòu)示意圖。
具體實施方式
以下結(jié)合附圖和實施例對本實用新型進行進一步說明。表I為本實用新型PCR反應體系。如圖I所示,本實用新型的一個實施例為核苷酸切除修復交叉互補組I基因表達檢測試劑盒,包括盒體I、盒蓋2、固定座3、引物試劑瓶4、SYBR premixEx Taq(含R0X)試劑瓶5、去離子水試劑瓶6、固定座3上設(shè)置有Eppendorf管7、加樣器吸頭8。固定座3還設(shè)置有孔9和空格10???設(shè)置用來分別將Eppendorf管7、加樣器吸頭8固定,以防止遺撒。孔9的形狀依據(jù)不同Eppendorf管7、加樣器吸頭8的形狀和大小而設(shè)置。空格10設(shè)置用來將引物試劑瓶4、SYBR premix Ex Taq試劑瓶5、去離子水試劑瓶6固定。所述引物包括擴增引物和白蛋白內(nèi)參。其中,擴增引物為特異性擴增 ERCCl 的引物,上游引物序列為 5 ' -GAAGTCAGTCAACAAAACGGACAGT-3 ';下游引物序列為5 ' -TGGGCATAAGGCCAGATCTT-3 ',白蛋白內(nèi)參上游引物序列為5 ' -TTCTACAATGAGCTGCGTGTG-3 ',下游引物序列為5 ' -CAGCCTGGATAGCAACGTACA-3 '。引物濃度為10uM。所述SYBR premix Ex Taq(含 ROX) (2*Conc.)含有 0. 4mmol/L 的 dNTPs, 4mmol/L的 Mg2+,2xBuffer,lU/20ii I 的 Ex Taq HS, 1U/20 u I Tli RnaseH, lmmol/L SYBR Green 1,0. lmmol/L ROX Reference Dye。[0020]操作方法I)制備模板新鮮組織或石蠟組織,常規(guī)提取RNA,并及時反轉(zhuǎn)錄成cDNA。2)反應體系將各反應物質(zhì)按照如下表I中反應體系進行配比表I
權(quán)利要求1.一種核苷酸切除修復交叉互補組I基因表達檢測試劑盒,其特征在于,包括盒體(I)、盒蓋⑵、固定座(3)、引物試劑瓶(4),SYBR premix Ex Taq(ROX)試劑瓶(5)、去離子水試劑瓶(6)、固定座(3)上設(shè)置有Eppendorf管(7)、加樣器吸頭(8)。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的一種核苷酸切除修復交叉互補組I基因表達檢測試劑盒,其特征在于,所述固定座(3)還設(shè)置有孔(9)和空格(10)。
專利摘要本實用新型公開一種核苷酸切除修復交叉互補組1基因表達檢測試劑盒,包括盒體1、盒蓋2、固定座3、引物試劑瓶4、SYBR premix Ex Taq(含ROX)試劑瓶5、去離子水試劑瓶6、Eppendorf管7、加樣器吸頭8、孔9、空格10。本試劑盒結(jié)構(gòu)簡單、設(shè)計合理、使用方便、制造容易、檢測過程不易受污染;本試劑盒在檢測核苷酸切除修復交叉互補組1基因表達時具有敏感性高、特異性強、耗時短等優(yōu)點。
文檔編號C12Q1/68GK202519262SQ201220162900
公開日2012年11月7日 申請日期2012年4月17日 優(yōu)先權(quán)日2012年4月17日
發(fā)明者馮繼鋒, 吳建中, 唐金海, 路平, 馬蓉 申請人:馮繼鋒, 吳建中, 唐金海, 路平, 馬蓉