專利名稱:環(huán)二鳥苷酸及其類似物和制備方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及環(huán)二核苷酸類化合物,尤其涉及環(huán)二鳥苷酸(c-di-GMP)及其類似物, 還涉及該類化合物的制備方法,具體涉及應(yīng)用一釜亞磷酰胺法合成環(huán)二鳥苷酸及其類似物。環(huán)二鳥苷酸(c-di-GMP)是細(xì)菌中普遍存在,參與調(diào)節(jié)多種生理功能的新型第二信使分子,不僅具有重要生理活性,還參與許多重要的生物反應(yīng)。近年來的研究表明, c-di-GMP及其環(huán)二核苷酸類似物可以抑制細(xì)菌生物膜的形成和真核細(xì)胞的增殖,因此具有良好的藥物開發(fā)前景。然而到目前為止c-di-GMP的信號傳導(dǎo)機(jī)制依然未知,這主要是因?yàn)樗淖饔冒袠?biāo)是未知的,而得到足夠量的c-di-GMP便成為進(jìn)一步研究c-di-GMP生物學(xué)作用的必要條件之一。由于c-di-GMP在自然界中的含量極少,很難通過天然方式得到可供研究用的足量 c-di-GMP,因此發(fā)展高效的c-di-GMP及其類似物的化學(xué)合成方法是十分重要的。目前已經(jīng)報(bào)道的合成方法主要是以保護(hù)的鳥苷為起始的磷酸三酯法或氫磷酸酯法,也有以較為簡單的保護(hù)糖為起始的方法。但是這些方法大多存在明顯的缺陷有的環(huán)合產(chǎn)率較低、有的條件劇烈產(chǎn)物不穩(wěn)定、有的路線較長、有的脫保護(hù)不能很好地進(jìn)行,這些問題都限制了化學(xué)合成大量c-di-GMP。
發(fā)明內(nèi)容
為了克服上述已報(bào)道方法的缺陷,本發(fā)明的目的是提供一類環(huán)二鳥苷酸及其類似物,以及大規(guī)模、高產(chǎn)率、低成本、條件溫和、快速簡便的制備環(huán)二鳥苷酸及其類似物的方法。為達(dá)到上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案—類環(huán)二鳥苷酸及其類似物,即兩個核糖單元通過兩個分子內(nèi)3’ -5’磷酸二酯鍵相連,并構(gòu)成一個十二元環(huán)狀糖-磷酸骨架,具有如通式I表示的結(jié)構(gòu)
權(quán)利要求
1.一類環(huán)二鳥苷酸及其類似物,具有如通式I表示的結(jié)構(gòu)
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的環(huán)二鳥苷酸及其類似物,其中B1,B2為天然堿基A,C,G,T或 U, 二者中至少一個為G ;X1, X2分別為0H, H,OR或鹵素;Y1, Y2分別為0 ;Z1, Z2分別為OH ;其中,所述R為C1-C4烷基,優(yōu)選甲基;所述鹵素為F、Cl、Br或I,優(yōu)選F。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的環(huán)二鳥苷酸及其類似物,為如下化合物之一環(huán)二鳥苷酸(通式 I 中 B1, B2 = G,X1,X2 = OH, Y1,Y2 = 0,Z1,Z2 = 0H);環(huán) 2,-氟胞苷酸 _(3,-5,)_ 鳥苷酸(通式 I 中 B1 = C,B2 = G,X1 = F,X2 = OH, Y1, Y2 = 0,Z1, Z2 = 0H);環(huán)2,-甲氧基鳥苷酸_(3,-5,)_鳥苷酸(通式I中B\B2 = GjX1 = OMe,X2 = OH, Y1, Y2 = 0,Z1, Z2 = OH);環(huán) 2,-氟尿苷酸 _(3,-5,)_ 鳥苷酸(通式 I 中 B1 = U,B2 = G,X1 = F,X2 = OH, Y1, Y2 = 0,Z1, Z2 = 0H);環(huán) 2,-脫氧胸苷酸-(3,-5,)-鳥苷酸(通式 I 中 B1 = T,B2 = GjX1 =H,X2 = OH,Y1, Y2 = 0,Z1, Z2 = 0H)。
4.一種制備環(huán)二鳥苷酸及其類似物的方法,包括如下步驟(1)將N2-乙?;?2,-叔丁基二甲基硅基鳥苷,5,_((4,4,-二甲氧基)-三苯甲基)-3’ - ((2-氰乙基-N,N- 二異丙基)-亞磷酰胺基)-核苷和IH-四氮唑在惰性氣體保護(hù)下在無水溶劑中室溫反應(yīng)4-6小時,有機(jī)溶劑萃取后蒸干,在溶劑中加過氧叔丁醇、三氟乙酸室溫反應(yīng)后柱分離得P-(2-氰乙基)_核苷_(3’ -5’)-N2-乙?;?2’ -叔丁基二甲基硅基鳥苷;(2)將P-(2-氰乙基)-核苷-(3 ’ -5 ’)-N2-乙?;?2,-叔丁基二甲基硅基鳥苷,IH-四氮唑在惰性氣體保護(hù)下置于無水溶劑中,滴加2-氰乙氧基-N,N, N’,N’ -四異丙胺基亞磷酰胺室溫反應(yīng)4-6小時,有機(jī)溶劑萃取后蒸干,在溶劑中加過氧叔丁醇攪拌反應(yīng)后得粗品環(huán)合產(chǎn)物;(3)將粗品環(huán)合產(chǎn)物溶于IM四丁基氟化銨的四氫呋喃溶液中,加濃氨水?dāng)嚢韬筝腿。?半制備液相分離,得到環(huán)二鳥苷酸及其類似物;其中所述核苷為乙?;Wo(hù)的或未保護(hù)的2’ -叔丁基二甲基硅基鳥苷、2’ -氟胞苷、2’ -甲氧基鳥苷、2’ -氟尿苷、2’ -脫氧胸苷等;所述溶劑選自乙腈、二氯甲烷、氯仿、四氫呋喃等。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的制備方法,其中步驟(1)所述柱分離條件為常壓柱層析,洗脫劑為15 1 二氯甲烷/甲醇。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的制備方法,其中步驟( 所述半制備液相分離的條件為流動相A = 0. 05M醋酸三乙胺緩沖液,B =乙腈;梯度0-60min,A 100%到A 80% /B 20% ; 檢測波長254nm,流速5ml/min。
7.根據(jù)權(quán)利要求4所述的制備方法,其中所述的N2-乙?;?2’-叔丁基二甲基硅基鳥苷按以下步驟制備5,_(4,4,- 二甲氧基)-三苯甲基-N2-乙酰基-2,-叔丁基二甲基硅基鳥苷中加入酸的有機(jī)溶液,室溫?cái)嚢?5分鐘,減壓柱快速分離,得到N2-乙?;?2’ -叔丁基二甲基硅基鳥苷;其中所述酸選自三氟醋酸、醋酸等,有機(jī)溶劑選自二氯甲烷、氯仿、四氫呋喃等。
8.根據(jù)權(quán)利要求4所述的制備方法,其中所述粗品環(huán)合產(chǎn)物按以下步驟制成環(huán)二鳥苷酸及其類似物將粗品環(huán)合產(chǎn)物溶于含氟脫硅保護(hù)試劑中,室溫?cái)嚢?2小時,加入堿,室溫?cái)嚢?0小時,蒸干堿,剩余物溶于水中,氯仿萃取三次,蒸干水相,半制備液相分離,得到環(huán)二鳥苷酸及其類似物;其中所述含氟脫硅保護(hù)試劑選自三乙胺三氫氟酸鹽、三乙胺氫氟酸鹽、氟化氫吡啶等,堿選自濃氨水、甲胺醇溶液等。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種環(huán)二鳥苷酸及其類似物,具有通式I的結(jié)構(gòu),還公開了新型制備方法——一釜亞磷酰胺法,提供大規(guī)模、高產(chǎn)率、低成本、條件溫和、快速簡便的制備環(huán)二核苷酸類化合物的方法。本發(fā)明的環(huán)二鳥苷酸(c-di-GMP)是細(xì)菌中普遍存在,參與調(diào)節(jié)多種生理功能的新型第二信使分子,研究表明c-di-GMP及其環(huán)二核苷酸類似物可以抑制細(xì)菌生物膜的形成和真核細(xì)胞的增殖,因此具有良好的藥物開發(fā)前景。
文檔編號C07H1/00GK102199183SQ20101013500
公開日2011年9月28日 申請日期2010年3月26日 優(yōu)先權(quán)日2010年3月26日
發(fā)明者張禮和, 楊振軍, 王萌, 邢磊, 陳卓 申請人:北京大學(xué)